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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-07 |
FN1+ macrophages fuel aggressive sarcomatoid differentiation and immunotherapy refractory outcome in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jun-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03841-6
PMID:42249083
|
研究论文 | 本研究通过多队列整合分析、单细胞和空间转录组学等技术,揭示了FN1+肿瘤相关巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌肉瘤样分化中富集,驱动免疫治疗耐药,并发现靶向FN1可重塑肿瘤免疫微环境,增强免疫治疗效果 | 首次系统阐明FN1+巨噬细胞在ccRCC肉瘤样分化中的富集及其与免疫治疗耐药的关系,并证明FN1阻断联合PD-1阻断具有协同抗肿瘤效应 | 未提及具体局限性 | 表征FN1+肿瘤相关巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性、功能表型和治疗靶向性 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤样本,特别是具有肉瘤样分化的肿瘤 | 机器学习 | 肾细胞癌 | NA | NA | 转录组数据 | 五个队列的整合分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 122 | 2026-06-07 |
Multiscale learning of gene network-driven phenotypic dynamics of single cells
2026-Jun-05, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-026-00220-x
PMID:42249125
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研究论文 | 提出GRNvelo计算框架,整合基因调控网络与单细胞RNA-seq时序数据,重建多尺度细胞命运动态 | 构建了耦合GRN驱动的单细胞速度与非局部细胞生长介导的群体动力学的多尺度模型,并设计了基于物理信息神经网络的两阶段协同优化算法 | NA | 理解基因调控网络如何动态控制细胞命运的出现并预测遗传扰动下的细胞命运变化 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞命运动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 物理信息神经网络(PINN) | 基因表达数据 | 两个合成数据集和四个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-06-07 |
Upregulation of ADAM19 in dendritic cells is associated with immune features and lower C-peptide levels in type 1 diabetes mellitus
2026-Jun-05, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-026-02170-8
PMID:42249412
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研究论文 | 研究树突状细胞中ADAM19上调与1型糖尿病免疫特征及C肽水平降低的关联 | 首次在多个数据集和单细胞水平上揭示ADAM19在树突状细胞中的表达与1型糖尿病免疫微环境及β细胞功能障碍的关联,并评估其作为生物标志物的潜力 | 研究主要基于公开数据集和有限样本量的内部队列,ADAM19的因果机制和临床诊断应用需进一步验证 | 探究树突状细胞中ADAM19表达与1型糖尿病免疫特征及β细胞功能的关系 | 1型糖尿病患者的树突状细胞和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 实时定量聚合酶链反应 | 偏最小二乘判别分析 | 转录组数据 | 4个数据集的129份外周血单个核细胞样本、20份内部样本、117份单细胞RNA测序样本及44份验证队列样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-06-07 |
Identification MYD88 as a candidate molecule of sodium overload-induced cell death in myocardial ischemia-reperfusion injury
2026-Jun-05, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-04333-0
PMID:42249419
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研究论文 | 通过整合转录组数据、机器学习与单细胞RNA测序,鉴定出MYD88是心肌缺血再灌注损伤中钠超载诱导细胞死亡的关键候选分子 | 首次将钠超载与MYD88分子在心肌缺血再灌注损伤中的关联进行系统分析,结合WGCNA、多机器学习算法及单细胞RNA测序进行多层次筛选,发现MYD88在巨噬细胞中的特异性上调 | 仅通过小鼠模型进行体内验证,缺乏人体样本的直接证据,并且分子机制的具体调控通路尚未完全阐明 | 探索心肌缺血再灌注损伤中钠超载诱导细胞死亡的分子机制 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及GEO数据库转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, 随机森林, 支持向量机, WGCNA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | GEO数据库多个数据集及小鼠模型样本(数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-06-07 |
Jinhuang San alleviates plasma cell mastitis by restoring Th17/Treg balance through the HTR7/IL-6/JAK2/STAT3 axis
2026-Jun-03, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121965
PMID:42242601
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研究论文 | 金黄散通过调节HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴恢复Th17/Treg平衡缓解浆细胞性乳腺炎 | 首次通过化学表征、免疫微环境分析和实验验证揭示了金黄散治疗浆细胞性乳腺炎的分子机制,特别是通过HTR7/IL-6/JAK2/STAT3通路调控巨噬细胞中Th17/Treg平衡 | 未明确说明 | 研究金黄散治疗浆细胞性乳腺炎的治疗机制 | 浆细胞性乳腺炎小鼠模型、巨噬细胞-CD4+ T细胞共培养体系 | 数字病理学 | 浆细胞性乳腺炎 | UPLC-Q-Orbitrap-MS/MS技术、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-06-07 |
Single-cell identifies and validates human circulating Treg subtype/state Tregfci in non-small cell lung cancer
2026-Jun-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02677-6
PMID:42230551
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在非小细胞肺癌中鉴定并验证了一种新型循环Treg亚型/状态Tregfci | 首次鉴定出一种新型循环Treg亚型Tregfci,并开发了区域重叠表达率系统结合细胞身份标志基因面板来量化T细胞亚型特异性 | 未明确说明,但依赖小鼠模型和体外实验,可能需进一步临床验证 | 识别非小细胞肺癌中一种新型循环Treg亚型并揭示其在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 非小细胞肺癌患者术前/术后血液、31种疾病样本、17个器官组织的T细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫染色 | NA | 高通量测序数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 包含术前/术后血液样本、31种疾病和17个器官的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 127 | 2026-06-07 |
Modeling the role of urokinase-type plasminogen activator, uPA, and circulating cancer-associated fibroblasts (cCAFs) in breast cancer cell extravasation
2026-Jun-03, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10411-3
PMID:42234219
|
研究论文 | 研究尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)和循环肿瘤相关成纤维细胞(cCAFs)在乳腺癌细胞外渗中的作用 | 发现CAF与三阴性乳腺癌细胞共簇时通过上调纤维蛋白溶解途径基因PLAU/uPA促进肿瘤细胞外渗,揭示了CAF诱导因子在转移早期阶段的新角色 | 未明确说明,但摘要局限于小鼠尾静脉模型和体外实验,人类体内的直接证据有限 | 探究CAFs是否通过增强乳腺癌细胞外渗促进肺转移及其潜在分子机制 | 小鼠模型、三阴性乳腺癌MDA-MB231细胞、CAF23成纤维细胞、HUVEC内皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2026-06-07 |
Mechanistic Insights Into Recurrent Implantation Failure: The Lactate-H3K18la-SLC7A11 Axis Explored via Endometrial Organoid and Blastoid-Endometrial Cell Implantation Models
2026-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70147
PMID:41242872
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析和公开单细胞RNA测序数据,发现反复植入失败(RIF)中乳酸脱氢酶A表达下降,并利用子宫内膜类器官和类囊胚-子宫内膜细胞植入模型揭示了乳酸-H3K18la-SLC7A11轴调控子宫内膜上皮可塑性和容受性的机制 | 首次揭示乳酸-H3K18la-SLC7A11轴在反复植入失败中的作用,并利用多种类器官系统建立研究植入机制的稳健方法学框架 | 依赖体外模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;潜在样本量限制或机制验证的不足(未明确提及) | 探究反复植入失败的分子机制,特别是乳酸相关表观遗传调控在子宫内膜容受性中的作用 | 反复植入失败患者的子宫内膜样本及子宫内膜类器官、类囊胚-子宫内膜细胞植入模型 | 机器学习和生物信息学 | 不孕症 | 蛋白质组学,单细胞RNA测序,多组学分析 | 类器官模型 | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 129 | 2026-06-07 |
Image-Enhanced Multi-Modal Contrastive Transformer for Subcellular Spatial Transcriptomics
2026-Jun, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3630325
PMID:41247893
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研究论文 | 提出图像增强多模态对比变换器SIMMT,用于亚细胞空间转录组学分析 | 首次设计双变换器架构联合建模转录组与形态图像,引入对比学习模块在细胞层面对齐组织形态与基因表达 | NA | 开发融合图像特征与转录组谱的计算方法以实现亚细胞数据全面分析 | 人肺癌组织、小鼠脑组织、人结直肠癌组织、人卵巢癌组织及人细支气管腺瘤数据集 | 数字病理学 | 肺癌, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 变换器, 对比学习 | 图像, 基因表达数据 | 人类肺癌、小鼠脑、人类结直肠癌、人类卵巢癌组织及人细支气管腺瘤数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 130 | 2026-06-07 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2026-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
|
研究论文 | 利用高通量单核测序平台snHH-seq筛选抗肝细胞癌的药物组合,并揭示其作用机制 | 首次将高灵敏度单核测序平台snHH-seq应用于临床药物组合筛选,结合单细胞转录组分析揭示HHT与YM155联合疗法通过诱导铁死亡抑制肿瘤增殖 | 未具体说明实验样本数量及临床转化潜力验证的局限性 | 开发基于单细胞转录组的高通量药物筛选方法,加速靶向药物组合的发现 | 肝细胞癌肿瘤细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单核测序(snHH-seq) | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明示具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序(snHH-seq) | snHH-seq | 高吞吐量高灵敏度单核转录组测序平台snHH-seq |
| 131 | 2026-06-07 |
Club cell RhoA activation amplifies allergic airway inflammation by regulating epithelial integrity and C1qα+ interstitial macrophages
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.016
PMID:41633491
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research paper | 本研究探究Club细胞中RhoA激活通过调控上皮完整性和C1qα+间质巨噬细胞加重过敏性气道炎症的机制 | 首次揭示Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的关键作用,并阐明其通过破坏上皮屏障功能和改变巨噬细胞动态来调控炎症的全新机制 | NA | 确定Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的功能 | Club细胞特异性RhoA敲除小鼠模型 | machine learning | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-06-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics unveil myeloid-lymphoid cross talk and the dermal immune niche underlying palmoplantar pustulosis
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.028
PMID:41740929
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示掌跖脓疱病的髓系-淋巴样细胞互作及真皮免疫微环境 | 首次利用单细胞RNA测序与高分辨率空间转录组学联合分析,揭示掌跖脓疱病进展过程中角质形成细胞、成纤维细胞及免疫细胞(如树突状细胞和TH17细胞)的协同互作网络,并鉴定出CCL19+真皮上层中的淋巴样免疫微环境 | 未提及具体局限性 | 探究掌跖脓疱病发病过程中的免疫微环境动态变化及潜在治疗靶点 | 掌跖脓疱病患者的脓疱和非脓疱足底皮损组织 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 掌跖脓疱病患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 单细胞RNA测序采用10x Chromium平台,空间转录组学采用10x Visium平台 |
| 133 | 2026-06-07 |
Glycolytic-inflammatory crosstalk mediated by Glyco-PMF-Rux hub genes drives PMF progression and ruxolitinib resistance
2026-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-026-01756-w
PMID:41758310
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研究论文 | 该研究通过多组学数据整合分析,揭示了由糖酵解-炎症串扰介导的基因网络在原发性骨髓纤维化(PMF)进展及鲁索替尼耐药中的关键作用,并验证了STAT1和EGR1作为潜在诊断和治疗靶点的价值 | 首次系统性地识别并验证了Glyco-PMF-Rux枢纽基因(STAT1、EGR1、FOXO1、SMAD7)在PMF糖酵解-炎症串扰中的核心调控作用,并揭示了其与鲁索替尼耐药的关联机制 | 主要依赖公开数据库和体外实验验证,缺乏大规模临床队列和体内耐药模型的进一步确认,机制研究尚需更深入的功能实验支撑 | 鉴定参与PMF进展和鲁索替尼耐药的关键糖酵解-炎症串扰基因,评估其作为诊断和治疗靶点的潜力 | 原发性骨髓纤维化(PMF)患者样本、GEO数据集、鲁索替尼耐药HEL细胞系、PMF小鼠模型 | 机器学习和生物信息学 | 原发性骨髓纤维化 | 基因表达谱分析、蛋白-蛋白相互作用分析、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 逻辑回归分类器 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 75个重叠差异表达基因,涉及多个GEO数据集,具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-06-07 |
Integrating single-cell atlases and machine learning to construct 'in silico patients' for predicting individualized drug responses
2026-06, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117873
PMID:41796725
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综述 | 本文综述了通过整合单细胞图谱和机器学习构建“虚拟患者”框架,用于预测个体化药物反应的概念和方法 | 提出了‘虚拟患者’这一创新框架,将大规模单细胞图谱、药物基因组数据库和患者特异性单细胞数据相结合,并以深度学习等人工智能为核心驱动,形成‘预测-验证-优化’闭环 | 未提及具体局限性,但该类方法面临数据整合复杂性、计算资源需求高、验证困难等潜在挑战 | 系统阐述构建‘虚拟患者’以预测个体化药物反应的数据基础、计算策略和未来方向 | 肿瘤微环境中的肿瘤细胞及药物反应预测模型 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习、迁移学习 | 单细胞RNA测序数据、药物基因组学数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 135 | 2026-06-07 |
Expression of CD25 in human lung mast cells and its regulation by IL-33
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.003
PMID:41825599
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研究论文 | 研究了白细胞介素-33(IL-33)对人肺肥大细胞中CD25表达的调控作用 | 首次揭示了IL-33可诱导正常人肺肥大细胞中CD25表达,并发现CD25阳性肥大细胞为具有独特IL-33响应特征的亚群 | 未说明具体局限性 | 探究IL-33对人肺肥大细胞中CD25表达的影响及其调控机制 | 人肺肥大细胞 | NA | NA | RNA测序、实时定量PCR、流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 纯化的人肺肥大细胞及人肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 利用了公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 136 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and immune microenvironment in lymphatic metastasis of head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jun, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00392-4
PMID:41839993
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示头颈部鳞状细胞癌淋巴转移中的异质性和免疫微环境 | 首次利用单细胞RNA测序比较分析头颈部鳞状细胞癌的淋巴转移组织和正常淋巴结组织,鉴定了与肿瘤发生和转移相关的特定细胞亚群,并构建了基于INHBA、SFRP2、SPP1和IFI27表达的预后模型 | 样本量有限(7个转移组织与5个非转移组织),且研究仅聚焦于淋巴转移,可能未涵盖原发肿瘤的全部异质性 | 探究头颈部鳞状细胞癌淋巴转移中的细胞异质性和免疫微环境特征,并构建预后模型 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴转移组织和正常淋巴结组织 | 自然语言处理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个淋巴转移组织和5个非转移组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-06-07 |
Cancer-associated fibroblasts in bladder cancer: Immunosuppressive mechanisms and therapeutic targeting
2026-Jun, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2026.152483
PMID:41895066
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综述 | 探讨膀胱癌中癌相关成纤维细胞的免疫抑制机制及其治疗靶向策略 | 整合单细胞分析和空间转录组学技术,揭示CAFs的异质性、可塑性及其在肿瘤微环境中的空间组织,并探讨CAFs驱动免疫检查点抑制剂和化疗抵抗的机制 | NA(综述类型,固有局限性未在摘要中明确指出) | 总结膀胱癌中CAFs的空间组织、免疫抑制机制及靶向治疗策略,为开发更有效的治疗方法提供框架 | 膀胱癌中癌相关成纤维细胞(CAFs) | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞分析、空间转录组学 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 单细胞分析及空间转录组学平台 |
| 138 | 2026-06-07 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics analysis reveals MYCN-UBE2C-TFRC signaling endows ferroptosis resistance in neuroectodermal tumors
2026-Jun, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3233-3
PMID:41915328
|
研究论文 | 通过整合空间和单细胞转录组学分析,揭示了MYCN-UBE2C-TFRC信号轴赋予神经外胚层肿瘤铁死亡抗性 | 首次发现MYCN通过转录激活UBE2C,进而促进TFRC的泛素化降解,减少铁内流,赋予肿瘤细胞铁死亡抗性,并揭示MYCN-UBE2C-TFRC-铁死亡调控轴驱动神经外胚层肿瘤生长 | 未明确提及 | 探究MYCN扩增肿瘤中MYCN与铁死亡通路之间的机制联系 | 神经外胚层肿瘤 | 数字病理 | 神经外胚层肿瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CUT&Tag,深度覆盖质谱蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质组学数据 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2026-06-07 |
Chitin Derivative-Based Detachable Microneedles for Effective Treatment of Androgenic Alopecia
2026-Jun, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504691
PMID:41958248
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研究论文 | 利用甲壳素衍生物基可分离微针治疗雄激素性脱发,并验证其促毛发生长效果及机制 | 首次报道甲壳素衍生物的抗雄激素性脱发活性,并基于可分离微针递送系统实现高效、安全的治疗 | 未提及长期安全性及临床转化中的潜在挑战 | 开发安全、经济有效的雄激素性脱发新型疗法 | C57BL/6j小鼠雄激素性脱发模型及离体毛囊 | 数字病理学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(C57BL/6j雄激素性脱发模型)及离体毛囊样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 140 | 2026-06-07 |
Viral orchitis and male infertility: A comprehensive review of pathogenic mechanisms and outcomes
2026-Jun, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104910
PMID:42107396
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综述 | 系统性回顾病毒性睾丸炎及其导致男性不育的致病机制和临床结局 | 整合单细胞测序与多组学技术,探讨病毒-宿主相互作用及治疗新靶点,并引入睾丸类器官模型等前沿转化方法 | 现有治疗策略效果欠佳,缺乏有效靶向干预手段 | 总结病毒对睾丸功能的影响,为未来干预措施提供指导 | 病毒性睾丸炎患者及男性不育症相关病理机制 | 机器学习 | 男性不育 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |