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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-19 |
Single-cell and spatial transcriptomics integration reveals FAM49B promotes tumor-associated macrophages polarization in colorectal cancer via the MK pathway
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682637
PMID:41246334
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了FAM49B通过MDK-NCL信号轴促进结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FAM49B通过MDK-NCL信号轴调控肿瘤相关巨噬细胞极化，揭示了其在塑造免疫抑制肿瘤微环境中的新功能 | 样本量相对有限（16例患者），需要更大规模的研究验证 | 探究FAM49B在结直肠癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、恶性上皮细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学分析 | CellChat分析, 伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据, 批量RNA数据 | 16例结直肠癌患者的33个单细胞RNA-seq样本和2对配对空间转录组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2025-11-19 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
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研究论文 | 通过多组学整合、单细胞转录组学和体外验证，发现乳酰化相关基因AKR1A1通过代谢-免疫调控轴在骨质疏松症发病机制中发挥关键作用 | 首次系统识别骨质疏松中乳酰化相关差异表达基因，从代谢-免疫双重调控角度揭示AKR1A1通过SPP1-CD44信号通路介导免疫细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 | 系统识别骨质疏松中乳酰化相关关键基因并探索其在疾病发病机制中的作用 | 骨质疏松相关基因表达数据、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀、机器学习 | 多种机器学习模型组合（113种） | 基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序数据 | 5个骨质疏松相关基因表达数据集和1个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达微阵列 | NA | NA |
| 123 | 2025-11-19 |
Integrative multi-omics analysis of gastric cancer evolution from precancerous lesions to metastasis identifies a deep learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680517
PMID:41246350
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和深度学习技术，构建了胃癌从癌前病变到转移的演化图谱和预后模型 | 首次在胃癌中整合单细胞、空间转录组和计算分析，揭示肿瘤微环境动态重塑过程并开发深度学习预后模型 | 样本量相对有限，仅包含6种组织类型的252,399个细胞 | 解析胃癌进展过程中的细胞异质性、空间组织和细胞间通讯 | 胃炎、肠上皮化生、原发肿瘤、癌旁正常组织和转移病灶 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 252,399个细胞来自6种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2025-11-19 |
Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681989
PMID:41246346
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法，识别主动脉夹层中与脂质代谢相关的新型生物标志物 | 首次将单细胞RNA测序与机器学习相结合，系统识别主动脉夹层中脂质代谢相关的关键调控基因PLIN2和PLIN3 | 研究样本量有限，需要在更大规模人群中进一步验证生物标志物的诊断价值 | 探索主动脉夹层发病机制中脂质代谢失调的分子调控机制 | 主动脉夹层患者样本和Ang II诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 主动脉夹层和对照样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-19 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析，发现白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中识别出炎症-纤维化空间生态位，并证明靶向IL-1β可改善疾病表型 | 研究样本量有限，主要基于患者心肌样本和基因工程小鼠模型 | 探索致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照供者心肌样本，具体数量未明确说明 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-11-19 |
ELLA: Modeling Subcellular Spatial Variation of Gene Expression within Cells in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614515
PMID:39386706
|
研究论文 | 提出一种名为ELLA的计算方法，用于建模高分辨率空间转录组学中亚细胞水平的基因表达空间变异 | 创建统一细胞坐标系锚定不同细胞形态，利用非均匀泊松过程建模空间计数数据，采用表达梯度函数表征亚细胞表达模式 | NA | 开发计算工具分析高分辨率空间转录组数据中的亚细胞基因表达定位 | mRNA的亚细胞定位模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非均匀泊松过程 | 空间基因表达数据 | 四个不同技术的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-19 |
Craters on the melanoma surface facilitate tumor-immune interactions and demonstrate pathologic response to checkpoint blockade in humans
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613595
PMID:39345527
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼和人黑色素瘤模型发现，肿瘤表面的火山口状结构是CD8 T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域，可作为免疫检查点阻断治疗反应的预测指标 | 首次发现黑色素瘤表面火山口状结构在肿瘤-免疫相互作用中的关键作用，并证明其作为免疫治疗反应预测指标的价值优于传统T细胞浸润评估 | 研究主要基于斑马鱼模型，人类样本验证仍需扩大规模；机制研究主要集中于B2M依赖性 | 探索免疫治疗中促进免疫应答的肿瘤微环境结构特征 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像, 高分辨率空间转录组学, 多重成像 | 斑马鱼黑色素瘤模型 | 图像, 空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学, 多重成像 | NA | NA |
| 128 | 2025-11-19 |
Mapping single-cell developmental potential in health and disease with interpretable deep learning
2024-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585637
PMID:38562882
|
研究论文 | 开发了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，用于从单细胞RNA测序数据中表征细胞发育潜能和分化状态 | 首次在绝对尺度上量化细胞潜能，在31个数据集上优于现有方法，能够重建胚胎发育时间层次并发现与癌症预后相关的细胞表型 | 仅基于scRNA-seq数据，未整合其他组学数据验证 | 表征单细胞发育潜能和分化状态 | 人类和小鼠单细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 31个人类和小鼠scRNA-seq数据集，涵盖28种组织类型，62个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现茄子基因(eggpl)在果蝇生殖细胞发育中起关键调控作用 | 首次发现茄子基因(eggpl)在连接营养状态与生殖细胞增殖分化中的调控作用 | 研究仅限于果蝇模型，未在其他生物中进行验证 | 探索果蝇生殖细胞发育的调控机制 | 果蝇卵巢生殖系干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNAi筛选,生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-11-19 |
Defects in microvillus crosslinking sensitize to colitis and inflammatory bowel disease
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202357084
PMID:37691494
|
研究论文 | 本研究探讨微绒毛交联缺陷如何通过破坏肠道屏障功能增加结肠炎和炎症性肠病的易感性 | 首次揭示微绒毛交联在肠道屏障功能中的关键作用，并证明CDHR5缺陷与黏液层通透性增加共同导致炎症性肠病易感性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，需要进一步验证 | 探究微绒毛交联在结肠炎和炎症性肠病发病机制中的作用 | CDHR5基因敲除小鼠和溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞 | 细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,电子显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,显微图像 | CDHR5缺陷小鼠和溃疡性结肠炎患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-11-19 |
Deciphering pathogenic cellular module at single-cell resolution in checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02805-4
PMID:37653115
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示检查点抑制剂相关肺炎的关键致病细胞模块和分子通路 | 首次在单细胞分辨率下系统解析CIP的免疫微环境，发现CXCL13+ T细胞和CXCL9+单核细胞的关键作用，并提出具有高诊断能力的免疫特征 | 样本来源仅限于支气管肺泡灌洗液，未涉及其他组织部位；样本量相对有限 | 阐明检查点抑制剂相关肺炎的病理生理机制，为精准诊断和治疗提供新策略 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫相关肺炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-11-19 |
Old and newly synthesized histones are asymmetrically distributed in Drosophila intestinal stem cell divisions
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256404
PMID:37255015
|
研究论文 | 本研究报道了果蝇肠道干细胞分裂过程中新旧组蛋白H3和H4的不对称分配现象及其与细胞命运决定的关系 | 首次在体细胞干细胞谱系中发现组蛋白不对称继承现象，并证明其通过影响Delta基因表达参与细胞命运决定 | 研究仅针对果蝇肠道干细胞，在其他物种或组织中的普适性尚未验证 | 探究组蛋白继承模式在干细胞分裂和细胞命运决定中的作用机制 | 果蝇肠道干细胞及其分裂后的细胞对 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，突变体表达 | NA | 基因表达数据，蛋白质分布数据 | 果蝇肠道干细胞及其衍生细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-11-19 |
Monocytes differentiate along two alternative pathways during sterile inflammation
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256308
PMID:37191947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了单细胞在无菌炎症中沿两种不同途径分化为巨噬细胞或树突状细胞的命运决定机制 | 首次通过时间序列单细胞RNA测序在体外模型中同时追踪人类单细胞向巨噬细胞和树突状细胞的分化路径，并鉴定出关键的命运决定转录因子 | 研究主要基于体外模型和小鼠体内验证，人类体内直接证据有限 | 阐明单细胞在炎症过程中分化为巨噬细胞或树突状细胞的命运决定机制 | 人类单细胞和小鼠无菌性腹膜炎模型 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，计算生物学方法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2025-11-18 |
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.06.018
PMID:40617259
|
研究论文 | 本研究通过克隆追踪和单细胞空间转录组学揭示了小鼠肝脏发育过程中肝细胞时空动态变化及其对体内基因工程的影响 | 发现新生儿肝脏中15-20%的克隆性肝细胞产生90%以上成年组织，并识别出支持克隆性肝细胞和造血祖细胞增殖的组织微环境 | 研究仅限于小鼠模型，人类肝脏可能存在差异 | 探索肝细胞异质性在肝脏生长过程中的演变及其对体内基因工程的影响 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 克隆追踪, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-11-18 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Dec, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中通过血脑屏障功能障碍和神经炎症的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用，并揭示其通过影响小胶质细胞、血脑屏障功能和IL-1β表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因，为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 基因表达数据、慢性不可预见应激小鼠模型的前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据 | 慢性不可预见应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-11-18 |
Multi-tissue spatial transcriptomics identified simultaneous responses to oxidative stress and apoptosis in parallel with tissue-specific reprogramming in modeled chronic kidney disease-mineral and bone disorder
2025-Dec, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf161
PMID:41216610
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研究论文 | 本研究通过多组织空间转录组学方法，揭示了慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱模型中氧化应激和凋亡的同步响应以及组织特异性重编程 | 首次采用多组织空间转录组学方法同时分析皮质骨、肌肉和骨髓中的基因组重编程，识别了组织特异性和共同性转录变化 | 研究仅使用雄性小鼠模型，样本量有限，且仅采用一种疾病诱导方法 | 识别和区分慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱中组织特异性和共同性基因组重编程 | 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱雄性小鼠的股骨-肌肉组织 | 空间转录组学 | 慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱 | 空间转录组学，qPCR | 均匀流形逼近与投影 | 空间转录组数据，基因表达数据 | 腺嘌呤饮食诱导CKD-MBD小鼠和酪蛋白对照饮食小鼠的股骨-肌肉组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术 |
| 138 | 2025-11-18 |
Claudin-1 is a mediator and therapeutic target in primary sclerosing cholangitis
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.005
PMID:40846184
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研究论文 | 本研究揭示Claudin-1在原发性硬化性胆管炎发病机制中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统证实CLDN1在PSC中的病理作用，并开发特异性单克隆抗体作为新型治疗策略 | 主要依赖临床前模型验证，需要进一步临床试验确认疗效 | 探究CLDN1在PSC发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的可行性 | PSC患者队列、小鼠模型和患者来源的细胞模型 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 五个PSC患者队列的肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2025-11-18 |
Biological and Therapeutic Potentials of MXenes in Tumor Microenvironment-Driven Oncology
2025-Nov-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00982
PMID:41200882
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综述 | 探讨MXenes二维纳米材料在肿瘤微环境驱动肿瘤学中的生物学和治疗潜力 | 首次系统阐述MXenes在直接肿瘤消融和肿瘤免疫微环境调控中的双重作用机制 | NA | 探索MXenes在精准肿瘤学中的治疗应用潜力 | MXenes二维纳米材料及其在肿瘤治疗中的应用 | 纳米医学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 高维免疫分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-11-18 |
Spatial Transcriptomic Characteristics of the Aging Human Ovary
2025-Nov-17, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70288
PMID:41243550
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术，构建了人类卵巢衰老的综合图谱 | 发现了一种新型内皮细胞亚型CLDN5血液EDCs，揭示了其在衰老过程中作为半专业抗原呈递细胞的独特功能特化 | 样本量相对有限（共12个样本），特别是青春期前样本仅1例 | 阐明人类卵巢衰老的时空动态变化机制 | 12个不同年龄段的人类卵巢组织（12-54岁） | 空间转录组学 | 卵巢衰老及相关生殖障碍 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 12个人类卵巢组织样本（青春期前1例，年轻4例，中年2例，老年5例） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |