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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-19
Targeting perilipin 5 ameliorates diabetic cardiomyopathy via regulating glycolysis and mitochondrial dynamics
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
研究论文 本研究探讨了脂滴相关蛋白perilipin 5在高糖条件下如何调节糖酵解、细胞凋亡和线粒体功能,并评估其在糖尿病心肌病中的治疗潜力 首次系统揭示了Plin5在糖尿病心肌病中调节糖酵解和细胞凋亡的双重作用,并利用单细胞RNA测序技术明确了其在心肌细胞中的特异性表达 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人体中进行验证;高糖条件下对成纤维细胞的作用机制仍需进一步阐明 探究Plin5在糖尿病心肌病发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 AC16人心肌细胞、人心脏成纤维细胞、野生型和Plin5敲除小鼠 分子生物学与心血管疾病研究 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序、分子生物学技术、心脏超声、免疫染色 NA 基因表达数据、影像数据、蛋白质检测数据 细胞系(AC16和HCFs)及小鼠模型(野生型和Plin5敲除型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-02-19
CAD manipulates tumor intrinsic DHO/UBE4B/NF-κB pathway and fuels macrophage cross-talk, promoting HCC metastasis
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了CAD通过调控DHO/UBE4B/NF-κB通路和巨噬细胞重编程促进肝细胞癌转移的机制 首次发现CAD通过调控嘧啶从头合成代谢,导致DHO积累并直接结合UBE4B,进而激活NF-κB通路和重编程巨噬细胞,从而促进HCC转移 研究样本量相对有限(159例患者),且主要基于回顾性队列分析,需要进一步的前瞻性研究和临床试验验证 阐明门静脉癌栓形成和肿瘤转移的机制,并寻找临床干预的潜在靶点 肝细胞癌患者(包括37例门静脉癌栓患者)的肿瘤组织和细胞模型 肿瘤生物学 肝细胞癌 多组学分析、代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA测序数据 159例HCC患者(包括37例PVTT患者) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-02-19
Multi-omics approaches for identifying the PANoptosis signature and prognostic model via a multimachine-learning computational framework for intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过多组学方法识别肝内胆管癌中的PANoptosis特征,并利用多机器学习计算框架构建预后模型 整合Cox回归分析和5种机器学习算法,筛选出5个核心基因,构建的PANoptosis风险评分在预测预后和临床转化方面表现优异 NA 表征肝内胆管癌患者的PANoptosis特征,构建指导临床诊断和治疗的模型,并探索耐药相关分子机制 肝内胆管癌患者 机器学习 肝内胆管癌 转录组学、蛋白质组学测序 Cox回归分析、机器学习算法 转录组数据、蛋白质组数据 来自OEP001105公共队列和重庆医科大学第一附属医院的多中心队列 NA 单细胞转录组分析、空间转录组学 NA NA
4 2026-02-19
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究利用基于AI的FibroNest算法量化MASLD肝纤维形态表型,并结合多组学分析揭示其与分子改变及HCC风险的关联 首次将AI驱动的肝纤维形态表型量化与空间单细胞转录组技术结合,系统揭示纤维表型与MASLD分子机制及HCC发生的关系 样本量相对有限(94例活检),且部分样本伴有HCC,可能影响表型特异性 全面表征MASLD肝纤维形态表型及其相关分子改变,探索疾病进展机制 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝活检组织 数字病理学 肝病 全基因组转录组学、空间单细胞转录组学、体外实验 AI算法(FibroNest) 组织图像、转录组数据、空间转录组数据 94例MASLD肝活检样本(其中12例伴发HCC) PharmaNest, NanoString 空间单细胞转录组学 CosMx CosMx空间单细胞转录组平台
5 2026-02-19
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2026-Mar, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了兔子角膜在非纤维化伤口愈合过程中基质细胞的转录变化 首次在兔子模型中利用单细胞RNA测序技术,详细描述了非纤维化伤口愈合过程中基质细胞从静息态到成纤维细胞的连续转录动态,并识别了与机械活性相关但不导致纤维化的基因表达模式 研究仅基于兔子模型,可能无法完全反映人类角膜伤口愈合的复杂性,且样本时间点有限(仅第7天和第28天),未能覆盖整个愈合过程的动态变化 探究角膜非纤维化伤口愈合的分子机制,以预防角膜手术或损伤后的疤痕形成 兔子角膜基质细胞,包括静息态角膜细胞和伤口愈合过程中出现的成纤维细胞 数字病理学 角膜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-02-19
Mendelian randomization analysis identifies HLA-A and AP2M1 as genetic biomarkers linked to immune-endocytic crosstalk in intervertebral disc degeneration
2026-Mar, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
研究论文 本研究通过整合转录组数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,系统研究了与椎间盘退变相关的内吞作用相关基因,并确定了HLA-A和AP2M1作为潜在的生物标志物 首次通过整合孟德尔随机化分析、单细胞测序和功能实验,系统性地揭示了HLA-A和AP2M1在椎间盘退变中连接免疫失调与内吞功能障碍的作用 NA 探究内吞作用在椎间盘退变发病机制中的作用,并识别相关的遗传生物标志物 椎间盘退变 生物信息学 椎间盘退变 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析, 功能富集分析, 免疫浸润分析 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
7 2026-02-19
Soluble urokinase plasminogen activator receptor is a prognostic biomarker in decompensated cirrhosis
2026-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本研究评估了可溶性尿激酶纤溶酶原激活物受体(suPAR)作为失代偿性肝硬化预后生物标志物的潜力 首次在独立队列中验证suPAR水平≥14.0 ng/ml可独立预测失代偿性肝硬化患者的90天死亡率,并通过单细胞RNA测序揭示了HBV相关肝硬化中免疫细胞PLAUR表达的增加 需要进一步研究阐明表达uPAR的细胞在疾病进展中的具体作用机制 评估suPAR作为慢性肝病预后标志物的临床价值及其在疾病进展中的作用 健康对照者、肝硬化患者、急性失代偿患者和慢加急性肝衰竭患者,以及小鼠模型 NA 肝硬化 单细胞RNA测序 NA 临床数据、实验室检测数据、单细胞RNA测序数据 推导队列178例,验证队列197例,加上小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-02-19
Direct detection of rare circulating tumor cells in peripheral blood mononuclear cells by scRNA seq: Spike-in strategy based feasibility study
2026-Mar, The journal of liquid biopsy
研究论文 本研究评估了基于计算spike-in框架的单细胞RNA测序在检测外周血中罕见循环肿瘤细胞中的可行性和性能 提出了一种计算spike-in策略来评估scRNA-seq检测罕见CTC的敏感性和特异性,避免了传统富集方法的选择偏差 研究基于模拟数据,未在真实临床样本中验证,且仅针对宫颈癌细胞,可能不适用于其他肿瘤类型 评估scRNA-seq在检测外周血中罕见循环肿瘤细胞的可行性和准确性 外周血单核细胞和宫颈癌细胞 单细胞测序 宫颈癌 单细胞RNA测序 k-means聚类 单细胞转录组数据 三个PBMC数据集(共约49,000个细胞)和宫颈癌细胞数据集 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium Cell Ranger分析流程
9 2026-02-19
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子与功能影响 首次在单细胞水平系统描绘肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被确定为关键的驱动基因 研究主要基于转录组数据,功能验证仅在细胞系中进行,缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 肝内胆管癌恶性细胞 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量聚合酶链反应, 细胞计数试剂盒-8, 集落形成, 伤口愈合, Transwell实验 LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树, SHAP RNA测序数据, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
10 2026-02-19
Cerebral Venous Thrombosis in Previously Healthy Patients with Cryptococcal Meningitis
2026-Feb-18, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究回顾性分析了免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和潜在机制 首次在免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中系统研究脑静脉窦血栓形成的发生率,并利用单细胞RNA测序技术探索了神经炎症期间血栓相关基因的表达模式 样本量较小(89例患者),为单中心回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证发现 探讨隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征、发生率和潜在发病机制 免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 数字病理学 神经系统感染性疾病 单细胞RNA测序,遗传分析 NA 医疗记录,神经影像数据,实验室数据,基因表达数据 89例免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-02-19
Computational integration of in vivo single cell and in vitro bulk transcriptomics across 236 human and mouse datasets differentiates physiological versus non-physiological hepatic cell lines for hepatotoxicity screening
2026-Feb-18, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合236个人类和鼠类数据集中的单细胞与批量转录组数据,评估了不同肝细胞系在模拟体内生理条件方面的适用性,以指导肝毒性筛选的体外模型选择 提出了一种新的计算生物学方法,首次大规模整合了体内单细胞转录组数据与体外细胞系批量转录组数据,用于系统性地评估和筛选最能模拟体内生理状态的肝细胞系 研究主要依赖于已发表的转录组数据集,可能受到原始实验条件和技术差异的影响;分析聚焦于基线基因表达谱,对动态毒性响应过程的模拟可能有限 旨在识别和验证最能模拟体内肝脏生理状态的细胞系,以提高体外肝毒性筛选模型的预测准确性和功能相关性 人类和鼠类的肝细胞、肝星状细胞和胆管细胞,以及代表这些细胞类型的17种肝细胞系 计算生物学 肝毒性 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 计算整合分析模型 转录组数据 236个数据集(包括214个细胞系数据集和7个体内单细胞数据集,以及15个肝毒性研究相关数据集) NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
12 2026-02-19
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Macaque LGN Neurons Reveals Novel Subpopulations
2026-Feb-18, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过分析猕猴外侧膝状体核(LGN)的单细胞转录组数据,揭示了LGN神经元中新的亚群,挑战了传统的三种细胞类型分类 利用公开数据库的单细胞转录组数据,在灵长类LGN神经元中发现了超出经典M、P、K分类的转录组亚群,暗示了功能差异 研究依赖于公开数据库的原始数据,缺乏功能实验验证,需要结合转录组和功能评估以全面理解细胞多样性 探索猕猴LGN神经元的异质性,以更精细地理解视觉系统中神经元的多样性和功能 猕猴外侧膝状体核(LGN)的神经元 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-02-19
Deciphering immune features and cellular heterogeneity in PRRSV infection via single-cell RNA sequencing
2026-Feb-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了PRRSV感染猪肺组织中的免疫特征和细胞异质性 首次在单细胞水平上全面描绘了PRRSV感染期间肺组织的细胞异质性,并识别出SPP1巨噬细胞亚群作为PRRSV感染的主要靶细胞 研究仅基于转录组数据,未结合蛋白质组或功能验证实验,且样本来源单一(仅猪肺组织) 解析PRRSV感染导致的免疫特征和细胞异质性,以阐明病毒诱导免疫功能障碍的机制 PRRSV感染的猪肺组织细胞 数字病理学 猪繁殖与呼吸综合征 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 46,922个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-02-19
Elucidation of population-based bacterial adaptation to antimicrobial treatment by single-cell sequencing analysis of the gut microbiome of a hospital patient
2026-Feb-17, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序技术,分析了一名接受抗生素治疗的急性脑出血患者的肠道微生物组,揭示了细菌对抗菌治疗的群体适应性机制 首次在患者肠道微生物组中,通过单细胞测序技术系统地追踪了抗生素耐药基因(ARGs)的进化路径和水平基因转移(HGT)事件,并发现了具有不同ARG进化模式的肺炎克雷伯菌菌株 研究仅基于一名患者的样本,样本量较小,且未对未分类菌株进行更深入的分类学鉴定 阐明在抗生素治疗压力下,肠道微生物组中细菌群体的适应性进化机制,特别是抗生素耐药基因的获得与传播 一名成年男性急性脑出血患者的肠道微生物组 微生物组学 急性脑出血 单细胞测序 NA 单细胞基因组数据 1名患者 NA 单细胞测序 NA NA
15 2026-02-19
ISL1 Restricts Progenitor Programs and Promotes β-Cell Maturation, Revealing Sex Differences in Diabetes Progression
2026-Feb-17, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了转录因子ISL1在胰腺内分泌细胞命运决定和成熟中的关键作用,及其缺失如何导致糖尿病相关缺陷 首次通过单细胞多组学分析揭示了ISL1在抑制祖细胞程序、促进β细胞成熟中的分子机制,并发现了糖尿病进展中的性别差异 研究主要基于小鼠模型,人类胰岛中的验证尚需进一步研究 阐明ISL1转录因子在胰腺内分泌细胞发育和成熟中的分子功能 小鼠胰腺内分泌前体细胞和成熟胰岛细胞 发育生物学 糖尿病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序、染色质分析(H3K27ac和H3K27me3) Isl1条件性敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、表观基因组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq、染色质分析 NA NA
16 2026-02-19
Single-Cell Analysis of Chemotherapy-induced Remodeling Reveals CD276-driven Basal-like Chemoresistance in Pancreatic Cancer
2026-Feb-17, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺癌患者化疗前后的肿瘤样本,揭示了化疗诱导的肿瘤细胞状态重塑和免疫微环境变化,并鉴定出CD276/B7-H3是驱动基底样化疗耐药的关键调节因子 首次在配对化疗前后的胰腺癌患者样本中,通过单细胞分辨率揭示了化疗诱导的动态重塑过程,并识别出由SNCG+基底样肿瘤细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞和耗竭T细胞组成的化疗耐药生态位,同时发现CD276/B7-H3具有双重免疫检查点功能 样本量相对有限(28例患者),且研究主要基于观察性数据,尽管进行了功能验证,但临床转化仍需进一步研究 探究化疗如何重塑胰腺导管腺癌的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境,并识别影响临床结果的机制 28例接受白蛋白紫杉醇联合吉西他滨化疗的胰腺导管腺癌患者的配对治疗前后肿瘤活检样本和外周血单个核细胞 单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学, CRISPR-Cas9敲除, 体外肿瘤杀伤实验, 体内小鼠模型研究 KPC小鼠模型, 裸鼠异种移植瘤模型 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 28例胰腺癌患者的配对治疗前后样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10X Visium HD 10X Visium HD空间转录组平台,分辨率达2微米
17 2026-02-19
Overcoming CXCR4-Mediated T-Cell Exclusion Potentiates Antitumor Cytotoxicity in Fibrolamellar Carcinoma
2026-Feb-17, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究探讨了纤维板层型肝癌中CXCR4介导的T细胞排斥如何限制抗肿瘤免疫反应,并通过联合CXCR4和PD-1阻断在人类肿瘤切片培养模型中增强抗肿瘤细胞毒性 首次在纤维板层型肝癌中利用单核RNA测序和空间蛋白质组学揭示CXCL12+肌成纤维细胞与CXCR4+淋巴细胞间的相互作用是T细胞排斥的关键机制,并证明联合CXCR4和PD-1阻断可协同克服免疫抵抗 研究基于人类肿瘤切片培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本量有限,作为罕见癌症,需要进一步临床验证 探究纤维板层型肝癌对免疫疗法缺乏响应的机制,并开发有效的联合免疫治疗策略 纤维板层型肝癌的肿瘤免疫微环境,特别是T细胞排斥和免疫抑制机制 数字病理学 肝癌 高通量单核RNA测序, 多重免疫组织化学, 活体成像, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 人类肿瘤切片培养模型 RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质组学数据 未明确指定样本数量,但涉及纤维板层型肝癌患者组织 NA 单核RNA测序, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 NA NA
18 2026-02-19
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Impaired CHIP-Mediated Heat Stress Response in SCA3 Pathogenesis
2026-Feb-17, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHIP介导的热应激反应在SCA3发病机制中的受损作用 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析SCA3小鼠小脑的细胞应激反应失调,并发现CHIP-HSF1/DNAJB1轴在疾病进展中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;CHIP过表达的长期治疗效果和安全性尚未明确 阐明SCA3进展的关键病理生理级联反应并确定潜在治疗靶点 SCA3细胞模型和转基因小鼠 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序,原生凝胶电泳 NA 单细胞转录组数据 SCA3转基因小鼠的小脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-02-19
ERBB2 as a Prognostic Biomarker in Prostate Cancer: Integration of Single-Cell Transcriptomics, Deep Learning, and Immunohistochemical Validation
2026-Feb-17, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究整合单细胞转录组学、深度学习和免疫组化验证,揭示了ERBB2作为前列腺癌生化复发关键预后生物标志物的作用 首次整合单细胞转录组测序、深度学习模型构建和免疫组化验证三种方法,系统性地识别并验证了ERBB2在前列腺癌预后中的关键作用 未在摘要中明确说明研究的局限性,例如样本队列的规模、单细胞数据的来源或深度学习模型的可解释性等 识别与前列腺癌生化复发相关的关键基因,并验证其临床意义 前列腺癌患者,特别是与生化复发、T细胞耗竭和转移相关基因相关的患者 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,深度学习 深度学习神经网络模型 单细胞转录组数据,临床病理数据,免疫组化图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-02-19
Activation of the Pancreatic "Metabolic Synapse" Aggravates Type 2 Diabetes Mellitus by Inducing PANoptosis in β-Cells
2026-Feb-17, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术和体外实验,揭示了胰腺成纤维细胞与β细胞之间通过“代谢突触”相互作用,其中过量谷氨酸激活NMDAR导致β细胞PANoptosis,从而加剧2型糖尿病进展 提出了“代谢突触”这一新概念来描述胰腺成纤维细胞与β细胞间的相互作用,并首次发现谷氨酸-NMDAR轴在T2DM发病机制中的关键作用 研究主要基于单细胞测序和体外实验,缺乏大规模临床验证,且人类胰腺样本的具体样本量未明确说明 探究胰腺成纤维细胞对β细胞功能障碍和2型糖尿病进展的贡献 胰腺β细胞、胰腺成纤维细胞及胰岛微环境 数字病理学 2型糖尿病 单细胞测序技术 NA 单细胞测序数据、体外实验数据 人类T2DM患者胰腺样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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