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当前共找到 45553 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-09 |
MUC16 drives macrophage-mediated immunosuppression in pancreatic cancer
2026-Dec-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218927
PMID:42933591
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研究论文 | 本文揭示MUC16通过CCL2和Serpin-E1驱动巨噬细胞M2样极化，从而介导胰腺癌免疫抑制微环境 | 首次系统阐明MUC16通过分泌CCL2和Serpin-E1调控巨噬细胞招募与极化，进而驱动胰腺癌免疫抑制，并结合空间转录组揭示MUC16肿瘤微环境的全局重塑 | 研究主要基于小鼠KPC模型，缺乏人体临床样本验证，MUC16靶向干预的治疗策略尚未在临床前治疗实验中充分评估 | 探究MUC16在胰腺导管腺癌肿瘤免疫微环境调控中的作用及机制 | KPC和KPC-MUC16敲除基因工程小鼠及原位胰腺癌模型、骨髓来源巨噬细胞（BMDM） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 基因敲除小鼠模型、空间转录组测序、细胞因子谱分析、体外巨噬细胞极化实验、氯磷酸脂质体巨噬细胞清除 | KPC原位小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、细胞因子蛋白数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-11-09 |
An ibuprofen-eluting electrospun membrane prevents ureteral fibrosis by dampening macrophage-associated fibroblast activation
2026-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.103771
PMID:42997115
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研究论文 | 结合人类输尿管狭窄空间转录组学与体外逐步实验，揭示巨噬细胞活化驱动成纤维细胞Smad2/3相关重塑的机制，并验证布洛芬洗脱电纺膜在兔输尿管热损伤模型中预防纤维化 | 首次整合人类输尿管正常与狭窄组织的空间转录组学与内部scRNA-seq参考数据，系统解析纤维炎症微环境；提出并验证布洛芬功能化PCL/明胶电纺膜（P/G-PLL-IBU）作为局部递药系统，通过抑制巨噬细胞NF-κB/COX-2活化及PGE2信号来阻断巨噬细胞-成纤维细胞轴，实现长达90天的抗纤维化效果 | 延迟放置膜在30天观察窗口内未能逆转已形成的纤维化；机制验证主要依赖体外细胞模型，体内机制阐释有限；兔模型与人类输尿管狭窄的病理生理差异可能影响转化外推；未评估长期生物降解及完整安全性 | 阐明输尿管狭窄中上皮-免疫-基质信号驱动纤维化的机制，并开发基于布洛芬局部递送的电纺膜以预防输尿管损伤后纤维化 | 人类正常与狭窄输尿管组织、三例狭窄标本来源的scRNA-seq数据、正常输尿管数据集GSE194129、THP-1来源巨噬细胞、原代输尿管成纤维细胞、兔输尿管热损伤模型 | 空间转录组学、单细胞转录组学、组织工程与药物递送 | 输尿管狭窄、纤维化疾病 | 空间转录组学、scRNA-seq、体外细胞共培养与条件培养基实验、静电纺丝制膜、药物缓释表征、兔热损伤模型 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像、文本 | 人类正常与狭窄输尿管组织空间转录组样本、3例狭窄标本scRNA-seq、GSE194129正常输尿管数据集、体外THP-1巨噬细胞与原代输尿管成纤维细胞、兔输尿管热损伤模型动物 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-09 |
Single-cell profiling reveals GABBR1 as a cuproptosis-regulated prognostic biomarker in pancreatic cancer
2026-Dec, iLIVER
DOI:10.1016/j.iliver.2026.100276
PMID:42999371
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析和批量转录组数据整合，揭示GABBR1是胰腺癌中铜死亡调控的预后生物标志物 | 首次在癌症相关成纤维细胞中基于铜死亡相关AUCell评分对成纤维细胞进行分层，并将WGCNA与随机生存森林模型结合筛选出GABBR1作为CAF特异性铜死亡相关预后标志物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究铜死亡在癌症相关成纤维细胞中的活性及其与胰腺癌预后的关联 | 胰腺癌患者的单细胞转录组数据和TCGA-PAAD数据集 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | 随机生存森林模型, WGCNA, AUCell, CIBERSORT | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-11-09 |
SCAN: a cross-species single-cell transcriptome resource for domestic animals-revealing divergent spermatogenesis in avian and mammalian systems
2026-Nov-07, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01526-4
PMID:42995603
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研究论文 | 构建了整合超过210万个单细胞转录组数据的家畜跨物种资源平台SCAN，并基于此比较了鸟类和哺乳动物精子发生过程的差异 | 整合了六个家畜物种和斑马鱼的单细胞转录组数据，建立了标准化分析流程、可视化工具、家畜标记基因库和鸡单细胞注释参考数据集CARD | 鸡精子发生后期的代谢策略差异机制仍需功能实验验证 | 构建家畜单细胞转录组资源平台，促进数据整合、标准化和深度解读，并展示其在跨物种比较研究中的应用 | 猪、鸡、牛、牦牛、绵羊、兔和斑马鱼的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过210万个单细胞，覆盖33种组织和155种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-11-09 |
B cell/adipocyte crosstalk amplifies MCP-1 secretion, M2-like macrophage accumulation, and polarization in gut-associated, inflamed adipose tissue
2026-Nov-07, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjag182
PMID:42998367
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研究论文 | 该研究探讨了克罗恩病相关炎症脂肪组织中B细胞与脂肪细胞的相互作用对MCP-1分泌和巨噬细胞募集及极化的影响 | 揭示了B细胞与脂肪细胞之间的crosstalk在肠道相关炎症脂肪组织中放大MCP-1分泌、促进M2样巨噬细胞积累和极化的新机制 | 未明确说明研究的具体局限性 | 研究B细胞与脂肪细胞的相互作用对炎症性肠病相关脂肪组织中免疫细胞募集和炎症的影响 | 克罗恩病患者的爬行脂肪活检组织、小鼠肠道炎症模型的白色脂肪组织、原代人及小鼠3D脂肪细胞培养物 | 免疫学、单细胞组学 | 克罗恩病、炎症性肠病 | 流式细胞术、3D培养、质谱分析、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、质谱数据、流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-11-09 |
APOC1 drives M2 macrophage polarization and prostate cancer progression via PPARG-IL-10 and is targeted by α-NAD
2026-Nov-07, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117658
PMID:42998492
|
研究论文 | 该研究揭示APOC1通过结合PPARG促进IL-10转录激活，驱动M2巨噬细胞极化并促进前列腺癌进展，且可被小分子化合物α-NAD靶向 | 首次发现APOC1-PPARG-IL-10信号轴在肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的关键调控作用，并鉴定α-NAD作为靶向APOC1的小分子干预化合物 | 研究主要基于体外模型和小鼠模型，尚需临床转化验证，α-NAD的药代动力学和安全性未充分评估 | 探究APOC1在前列腺癌微环境中的表达特征及其调控巨噬细胞极化促进肿瘤进展的分子机制 | 前列腺癌组织、肿瘤相关巨噬细胞、前列腺癌细胞系、髓系细胞特异性敲除小鼠模型 | 肿瘤免疫学、数字病理、单细胞分析 | 前列腺癌 | 转录组测序、单细胞测序、免疫共沉淀、GST pull-down、双荧光素酶报告基因实验、免疫荧光 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-11-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional remodeling of splenic lymphocytes following zearalenone exposure in mice
2026-Nov-07, Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.toxicon.2026.109349
PMID:42998713
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示玉米赤霉烯酮暴露后小鼠脾脏淋巴细胞的转录重塑 | 首次在细胞类型分辨率下解析玉米赤霉烯酮暴露对小鼠脾脏淋巴细胞的转录组影响，结合TUNEL染色、免疫荧光和scRNA-seq多维度分析 | 仅使用单一剂量（20 mg/kg·bw）和单一时间点（21天），样本量有限（每组两个混合文库，每个文库来自五只小鼠脾脏），未进行剂量-反应关系研究，属于探索性图谱分析 | 探究玉米赤霉烯酮暴露对小鼠脾脏免疫细胞类型特异性的转录组影响及细胞间通讯变化 | C57BL/6小鼠脾脏淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫毒性 | 单细胞RNA测序、TUNEL染色、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 每组两个混合文库，每个文库由五只小鼠脾脏构建，共解析44,759个高质量脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-11-09 |
Isoimperatorin attenuates renal ischemia-reperfusion injury by targeting DLAT-associated cuproptosis
2026-Nov-07, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.107072
PMID:42998831
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研究论文 | 本研究探讨天然香豆素异欧前胡素（ISO）通过靶向DLAT相关的铜死亡减轻肾脏缺血再灌注损伤的作用及机制 | 首次揭示ISO通过结合DLAT抑制铜死亡，从而减轻肾缺血再灌注损伤，提出铜-DLAT轴作为缺血性肾损伤的治疗靶点 | 未明确说明ISO的剂量效应关系及长期安全性，DLAT调控铜死亡的下游具体分子机制尚需进一步阐明 | 探究ISO对肾缺血再灌注损伤中铜死亡的影响及其靶向DLAT的分子机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型及体外缺氧/复氧细胞模型 | 肾脏病学、分子药理学 | 肾缺血再灌注损伤、急性肾损伤 | 单细胞转录组测序、RNA测序、分子互作实验 | NA | 基因表达数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-11-09 |
Mechanosensing channels PIEZO1 and PIEZO2 regulate mitral valve serotonin-mediated homeostasis and pathophysiology
2026-Nov-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag190
PMID:42687771
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研究论文 | 本文研究了机械敏感钙通道PIEZO1和PIEZO2通过5-羟色胺机制调控正常二尖瓣稳态及二尖瓣反流病理生理的作用 | 首次在二尖瓣反流中研究PIEZO1和PIEZO2，揭示了机械转导、5-HT产生与受体信号及胶原合成之间的新联系 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究PIEZO1和PIEZO2是否通过5-HT机制介导正常二尖瓣稳态和二尖瓣反流的病理生理过程 | 人类正常二尖瓣和二尖瓣反流瓣膜样本及瓣膜间质细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blot、细胞培养、生物反应器 | NA | 单细胞转录组数据、图像、蛋白质数据 | 9例二尖瓣反流和5例正常二尖瓣样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-11-09 |
Vascular nexus glia regulates vascular homeostasis and undergoes dynamic remodelling in deep vein thrombosis
2026-Nov-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag180
PMID:42704474
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析鉴定出一群存在于大血管外膜的血管神经连接胶质细胞（VNGs），并揭示其在深静脉血栓形成过程中发生动态重塑 | 首次鉴定并命名血管神经连接胶质细胞（VNGs），揭示其依赖Suz12的表观遗传发育机制，并发现其在深静脉血栓中经历从神经支持态向促纤维化激活态的双相转变 | 研究主要基于小鼠模型和公共单细胞数据，人类样本验证有限，VNGs在人类血栓性疾病中的具体功能尚需进一步验证 | 探究血管外膜中是否存在特化的胶质细胞群体及其在病理应激下的分子和形态重塑 | 人类和小鼠大血管组织、hGFAP-Cre;tdTomato报告小鼠、MADM小鼠、小鼠深静脉血栓模型 | 单细胞组学、血管生物学、神经血管界面 | 深静脉血栓、静脉血栓栓塞性疾病、心血管疾病 | 单细胞RNA测序、跨组织转录组整合、组织透明化、遗传谱系追踪、MADM系统 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-11-09 |
Atherosclerotic plaque fibroblasts derive from adventitial and medial Pdgfra-lineage-positive cells and predominantly maintain fibroblast identity
2026-Nov-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag183
PMID:42713730
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序元分析及谱系示踪小鼠，揭示动脉粥样硬化斑块中成纤维细胞的来源、身份与命运，发现其主要来源于外膜和media的Pdgfra谱系阳性细胞，并大多维持成纤维细胞身份。 | 首次系统阐明斑块成纤维细胞的精确身份（Pdgfra、Pi16、Cygb、Serpinf1）及其双来源（主要来自外膜Pdgfra+祖细胞，少量来自media的Pdgfra+Myh11+平滑肌细胞），并发现斑块中存在EC样成纤维细胞亚群与人类斑块不稳定性相关。 | 研究主要基于小鼠模型和元分析，人类样本验证有限；EC样成纤维细胞的转分化机制及体内功能需进一步实验验证。 | 阐明动脉粥样硬化斑块中成纤维细胞的身份、来源及在斑块进展中的命运。 | 小鼠（Myh11和Cdh5谱系报告小鼠、Pdgfra-CreERT2/tdTomato谱系报告小鼠、Ldlr-/-小鼠）及人类对照和动脉粥样硬化动脉组织。 | 单细胞转录组学、心血管生物学 | 心血管疾病（动脉粥样硬化） | 单细胞RNA测序、谱系示踪、伪时间分析、跨物种整合分析 | NA | 单细胞转录组数据、图像/组织学数据 | 54个单细胞RNA测序文库，包括小鼠和人类动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-11-09 |
Endothelial senescence orchestrates the tumor immune microenvironment and immunotherapy response in non-small cell lung cancer
2026-Nov-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168514
PMID:42988230
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研究论文 | 该文揭示衰老内皮细胞通过FOSB-CXCL9-CXCR3轴调控非小细胞肺癌肿瘤免疫微环境及免疫治疗疗效 | 首次将衰老内皮细胞鉴定为免疫治疗疗效的关键基质调控者，并阐明其通过FOSB调控CXCL9分泌招募CD8 T细胞形成免疫富集生态位的机制 | 摘要中未明确说明研究队列规模及前瞻性验证情况，机制结论主要基于相关性分析与敲低实验 | 探究非小细胞肺癌中基质细胞对免疫治疗应答的驱动作用及内皮细胞衰老与免疫治疗疗效的关系 | 非小细胞肺癌患者肿瘤微环境中的内皮细胞、CD8 T细胞及三级淋巴结构 | 数字病理, 肿瘤免疫学, 多组学 | 肺癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 跨平台空间转录组学与多重免疫荧光 |
| 13 | 2026-11-09 |
A transcriptional and cellular exploration of obesity and type II diabetes in human adipose tissues
2026-Nov-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee1641
PMID:42993852
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和组织学方法，探索肥胖伴或不伴II型糖尿病（T2D）患者脂肪组织的转录和细胞差异，揭示网膜脂肪间质重塑和免疫细胞表型变化 | 发现网膜基质区室重编程以间皮细胞和内皮细胞为中心，间皮细胞和IGFBP2细胞呈现纤维化和上皮-间质转化样表型，网膜内皮细胞在T2D中呈现脂质过载、炎症和抗原呈递特征，网膜和皮下脂肪固有T细胞展现不同的炎症特征 | 样本量相对有限（单细胞RNA测序仅10例），未涵盖其他代谢状态人群，未进行纵向随访，机制研究有待进一步验证 | 探究肥胖个体中II型糖尿病易感性的生物学因素，揭示脂肪组织在T2D病理生理中的作用 | 58名肥胖患者（伴或不伴临床诊断为II型糖尿病），配对网膜和皮下脂肪组织样本以及配对全血样本 | 单细胞组学 | II型糖尿病、肥胖 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学、趋化因子定量 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、组织学图像、趋化因子定量数据 | 58名肥胖患者，单细胞RNA测序n=10，流式细胞术n=42，组织学n=17，全血配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-11-09 |
Efficient and accurate mixed model association tool for single-cell eQTL analysis
2026-Nov-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02798-2
PMID:42995228
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研究论文 | 本文提出了一种基于泊松混合模型的高效且准确的单细胞eQTL分析工具SAIGE-QTL，可直接对单细胞读取计数建模 | SAIGE-QTL直接对单细胞读取计数建模，而非聚合表达或使用高斯模型，可处理供体水平和细胞水平协变量以及每个供体细胞数不等的问题，计算可扩展且统计效率更高 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种高效、准确且可扩展的单细胞eQTL定位方法，以发现更多eGene并支持全基因组反式eQTL和罕见变异集测试 | 单细胞RNA测序数据中的免疫细胞（包括120万个免疫细胞）以及模拟数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松混合模型 | 文本（单细胞读取计数） | 120万个免疫细胞（来自三个单细胞数据集）及模拟数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-11-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics of cellular heterogeneity in Alzheimer disease
2026-Nov-06, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-026-01096-4
PMID:42995230
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学在阿尔茨海默病细胞异质性研究中的应用与进展 | 系统整合了单细胞和单核RNA测序与空间转录组学及多重成像在AD研究中的发现，强调从因果驱动与下游后果角度解析分子变化，并提出多组学基准测试动物模型和基于单细胞的药物重定位策略 | 指出当前单细胞和空间研究在性别和祖先多样性方面代表性不足，需要更广泛的人群覆盖 | 重新定义对阿尔茨海默病异质性的理解，并为精准治疗提供依据 | 阿尔茨海默病患者脑组织中的神经元、胶质细胞和血管细胞 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多重成像 | NA | 转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-11-09 |
Pregestational maternal diabetes primes neonatal beta cell dysfunction with structural remodelling, impaired calcium buffering and altered mTORC2-Gαq-PKCα signalling in a pig model
2026-Nov-06, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06906-z
PMID:42995267
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研究论文 | 该研究利用遗传性糖尿病和β细胞报告基因猪模型，揭示母体高血糖导致新生儿胰岛β细胞功能障碍，表现为结构重塑、钙缓冲受损及mTORC2-Gαq-PKCα信号改变 | 首次在猪 translational 模型中系统定义母体糖尿病对新生儿β细胞的功能、形态和分子影响，发现与2型糖尿病部分重叠但独特的β细胞功能障碍特征，包括GLUT2和calbindin D28K几乎缺失、HADH下调、ATF4应激特征及低核糖体基因表达的β细胞亚群 | 研究仅基于猪模型，需进一步验证在人类中的相关性；样本量未明确说明；机制因果关系需功能实验验证 | 定义母体高血糖相关的新生儿胰岛功能、形态和分子改变，重点关注β细胞 | 高血糖母猪所生新生儿猪（PHGs）和正常血糖母猪所生新生儿猪（PNGs）的胰腺胰岛 | 数字病理学, 单细胞组学 | 糖尿病, 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 葡萄糖刺激胰岛素分泌功能检测, 形态学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 图像, 生理功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-11-09 |
Antigen-driven CD8+ T cell activation drives the immunopathogenesis of myasthenia gravis-associated myocarditis
2026-Nov-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxag067
PMID:42984174
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研究论文 | 通过对MG-心肌炎和单纯MG患者外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序和TCR repertoire分析，揭示抗原驱动的CD8+ T细胞激活驱动MG相关心肌炎的免疫发病机制 | 首次鉴定了非经典CD16+单核细胞和cDCs作为潜在的心脏抗原提呈细胞群体，能够启动致病性CD8+ T细胞反应；发现扩张的TCR克隆型对心脏蛋白（Titin、MYO10、MYH6）具有优先反应性 | 样本量较小（仅3例MG-心肌炎和4例单纯MG患者），未进行功能验证实验，TCR-肽结合预测分析需要实验验证 | 阐明驱动MG患者心肌炎发展的免疫通路 | MG-心肌炎患者和单纯MG患者的外周血单个核细胞 | 单细胞免疫学 | 重症肌无力相关心肌炎 | 单细胞RNA测序，TCR repertoire分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | 7例患者（3例MG-心肌炎，4例单纯MG）的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-11-09 |
AI-enhanced CRISPR-Cas9 therapeutics: Advances in precision, safety, and delivery
2026-Nov-05, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.101967
PMID:42987985
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综述 | 综述AI增强的CRISPR-Cas9治疗在精准性、安全性和递送方面的最新进展，涵盖机制、编辑器变体、治疗应用、AI驱动的递送优化及安全性挑战 | 系统整合AI在guide RNA设计、脱靶预测、AI设计核酸酶（如OpenCRISPR-1）、紧凑高保真SaCas9变体设计、强化学习流程优化及CAR T细胞治疗与安全性评估中的应用 | 作为综述缺乏原始实验验证，AI模型的临床验证仍不足，可解释性和多尺度建模尚待完善 | 总结AI增强CRISPR-Cas9基因编辑在医学应用中的精准性、安全性和递送优化进展并展望未来方向 | CRISPR-Cas9基因编辑系统、碱基编辑器、先导编辑器、CAR T细胞、CAR-NK细胞、遗传病、传染病及再生医学相关应用 | 机器学习 | 遗传病, 传染病, 肿瘤 | CRISPR-Cas9基因编辑, 碱基编辑, 先导编辑, 深度学习, 强化学习 | 深度学习, 强化学习 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-11-09 |
Hypoxia orchestrates the natural history of inflammatory bowel disease: Mechanisms and therapeutic opportunities
2026-Nov-05, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.109736
PMID:42988189
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综述 | 该综述提出缺氧是连接肠道稳态与慢性炎症及结构损伤的生物学组织者，整合单细胞转录组学、空间生物学和微生物组研究证据，探讨缺氧在炎症性肠病自然史中的作用机制及治疗机会 | 将缺氧从炎症的下游后果重新定位为上皮、免疫、微生物和基质程序的共享上游约束和药理可干预网络，强调空间上 distinct 的缺氧相关生态位在维持慢性炎症和纤维化进展中的作用，并整合铁代谢和铁死亡等新机制 | 成功转化需要细胞和亚型选择性调节、足够的组织暴露以及长期安全性的仔细评估，目前仍缺乏这些方面的充分证据 | 阐明缺氧作为生物学组织者在炎症性肠病从肠道稳态向慢性炎症和结构性组织损伤转变中的作用机制，并探讨靶向缺氧反应信号的治疗机会 | 炎症性肠病（包括克罗恩病和溃疡性结肠炎）中的肠道上皮、免疫细胞、基质和微生物组 | 空间生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学, 空间生物学, 微生物组研究 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-11-09 |
CA1-associated epithelial-state remodeling in colon cancer cells exposed to polystyrene nanoplastics: Integrated multi-omics and In vitro analyses
2026-Nov-03, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116476
PMID:42977244
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研究论文 | 整合bulk转录组学、可解释机器学习、WGCNA、单细胞与空间转录组学、结构分析及体外实验，揭示聚苯乙烯纳米塑料暴露与结肠癌细胞CA1相关上皮状态重塑的关系 | 首次将CA1/CA2-low上皮状态与聚苯乙烯纳米塑料暴露联系起来，整合多组学与可解释机器学习（LASSO+GBM、SHAP）及分子对接与动力学模拟进行系统分析 | 机器学习模型的交叉队列比较仅为探索性且训练AUC达1.000提示可能存在过拟合；分子对接与动力学仅显示苯乙烯与CA1之间微弱且动态的接触；体外实验仅使用HCT116单一细胞系 | 探究聚苯乙烯纳米塑料暴露后结肠癌上皮细胞的分子状态变化及其与CA1相关的响应机制 | 结肠癌细胞（HCT116）、结肠癌转录组数据、单细胞与空间转录组数据、类器官及TCGA-COAD与Human Protein Atlas数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 可解释机器学习, WGCNA, 分子对接, 分子动力学模拟 | LASSO, GBM, SHAP | 文本（基因表达数据）, 图像（空间转录组数据） | 2139个结肠癌差异表达基因与766个苯乙烯相关基因交集得到159个候选基因；45个分类模型；HCT116细胞体外实验 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |