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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-09 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals hepatocyte reprogramming in Fontan-associated liver disease
2026-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198823
PMID:41734025
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研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示Fontan相关肝病中肝细胞的重编程过程 | 首次通过单细胞空间转录组鉴定了晚期FALD中出现的“区域模糊且应激的肝细胞”亚群,并揭示了异位WNT2信号驱动肝细胞区域化紊乱的机制 | 样本量较小(早期和晚期纤维化各仅1例用于空间转录组分析),且未对肝细胞代谢功能进行直接验证 | 探究Fontan相关肝病(FALD)进展的病理生理机制,尤其是肝细胞区域化的改变 | Fontan姑息术后的单心室患者肝脏组织样本 | 数字病理学 | Fontan相关肝病 | 原位杂交,免疫荧光 | CellChat | 空间转录组数据,图像 | 2例用于空间转录组分析(早期/晚期纤维化各1例),18例用于免疫荧光验证 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imaging | 使用6000个基因原位杂交的CosMx空间分子成像系统 |
| 2 | 2026-07-09 |
PTBP1 knockdown reprograms glioma stem cells into neuronal-like cells and suppresses tumorigenesis via the DUSP5-ERK1/2 signaling pathway
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag068
PMID:41903206
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研究论文 | 通过多组学分析和体内外实验揭示PTBP1通过DUSP5-ERK1/2通路调控胶质瘤干细胞分化为神经元样细胞并抑制肿瘤发生的机制,并开发A2-PLGA/venetoclax纳米治疗策略 | 首次发现PTBP1通过调控DUSP5-ERK1/2信号轴影响胶质瘤干细胞形态和分化,并利用已知临床药物venetoclax靶向PTBP1开发纳米治疗新策略 | 未提及 | 研究胶质瘤干细胞分化为神经元样细胞的机制并探索靶向治疗新策略 | 65例胶质瘤患者标本、小鼠模型、胶质瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 深度学习形态分类、组织透明化与3D成像、转录组分析、单细胞RNA-seq、慢病毒敲低、结构导向药物筛选 | NA | H&E染色图像、RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 65例患者标本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-07-09 |
Immunomodulatory strategies and targeted delivery systems in atherosclerosis therapy
2026-Jun, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2026.2636761
PMID:41729255
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综述 | 综述了动脉粥样硬化免疫病理学及靶向纳米药物的研究进展 | 从广谱免疫抑制转向亚群特异性精准干预,并采用智能仿生纳米递送系统实现时空精准调控 | 斑块穿透性不足、肝脏纳米载体蓄积以及系统性免疫抑制风险等挑战尚未解决 | 探讨动脉粥样硬化的免疫调节策略及靶向递送系统 | 动脉粥样硬化免疫病理机制和纳米药物递送平台 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-09 |
In Silico Reconstruction of Primary and Metastatic Tumor Architecture Using Geographic Information System-Augmented Spatial Transcriptomics
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3161
PMID:41734374
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研究论文 | 建立了一个整合地理信息系统(GIS)的空间转录组学分析框架,用于重建原发性和转移性肿瘤的异质性结构 | 首次将GIS增强的空间自相关测量与通路/细胞类型富集分析相结合,在识别空间域之前先考虑生物学功能,减少了传统聚类方法的主观性 | 未提及明显局限性,可能依赖特定数据集(仅应用于雌激素受体阳性乳腺癌样本) | 开发一种新的空间转录组学分析框架,以揭示肿瘤微环境中的功能空间域 | 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺肿瘤样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 5 | 2026-07-09 |
Serglycin Drives LAG3+ Treg Differentiation and Immunosuppression in Gastric Cancer
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3071
PMID:41734377
|
研究论文 | 本文研究了胃癌中肿瘤细胞来源的Serglycin通过CD44信号通路促进LAG3+调节性T细胞分化及免疫抑制的机制 | 首次揭示SRGN-CD44介导的糖酵解-氧化-泛素化级联反应驱动胃癌中LAG3+ Treg分化的新机制,并发现靶向该轴可改善免疫治疗效果 | 未提及具体局限性 | 探讨胃癌中肿瘤细胞来源的Serglycin的免疫调节功能及其在Treg分化中的作用机制 | 胃癌患者组织样本及CD4+调节性T细胞 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23对胃癌及癌旁正常胃黏膜组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘测序系统 |
| 6 | 2026-07-09 |
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-May, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70108
PMID:41732956
|
研究论文 | 探究牙周肉芽组织内部细菌组和细胞特征,揭示其生物学本质和转化潜力 | 首次同时分析牙周肉芽组织的组织内细菌组和单细胞特征,发现骨缺损来源肉芽组织具有与牙周健康相关的微生物组和干细胞富集特性 | 样本量较小,且未来需要进一步转化研究验证肉芽组织作为间充质干细胞替代来源的应用潜力 | 研究牙周肉芽组织的组织内细菌和细胞图谱,探索其生物学本质和转化应用价值 | 来自49名重度牙周炎患者的牙周肉芽组织样本,包括骨缺损肉芽组织、拔牙窝肉芽组织和拔除牙根面组织 | 微生物组学、单细胞组学、牙周病学 | 牙周炎 | 16S rRNA测序、单细胞测序、组织学评估 | NA | 基因序列数据、图像数据 | 49名重度牙周炎患者的若干组织样本 | NA | 16S rRNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-09 |
ATP-binding cassette subfamily A member 5 suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression and chemoresistance by promoting β-catenin ubiquitin-dependent degradation
2026-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101381
PMID:41734476
|
research paper | 本研究首次证明ATP结合盒亚家族A成员5(ABCA5)在胰腺导管腺癌中作为肿瘤抑制因子,通过促进β-连环蛋白泛素依赖性降解抑制肿瘤进展和化疗耐药 | 首次确定ABCA5在胰腺导管腺癌中的抑癌作用,并阐明其通过结合β-TrCP的WD40重复结构域诱导β-连环蛋白泛素依赖性降解,从而抑制WNT通路的新型分子机制 | 未提及具体局限性 | 探讨ABCA5在胰腺导管腺癌中的作用及分子机制,以及其作为治疗靶点的潜力 | 80例临床胰腺导管腺癌样本及患者来源类器官 | machine learning | 胰腺导管腺癌 | NA | NA | 转录组数据 | 80例临床胰腺导管腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-07-09 |
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153484
PMID:41734714
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的免疫景观,揭示桥本甲状腺炎的细胞机制 | 构建了NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的单细胞转录组图谱,首次揭示甲状腺细胞可塑性和调节性T细胞功能障碍可能是疾病进展的驱动因素 | 未明确提及局限性 | 阐明桥本甲状腺炎中每种甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 | NOD.H-2h4小鼠甲状腺组织 | 单细胞转录组学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4、8和16周)的甲状腺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 9 | 2026-07-09 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
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研究论文 | 该研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和多重免疫组化技术,鉴定了PARP抑制剂耐药中由肿瘤细胞来源的IFN通过STAT信号诱导巨噬细胞表达骨桥蛋白(SPP1)形成免疫抑制微环境的机制 | 首次揭示肿瘤细胞来源的IFN通过空间重编程SPP1富集的巨噬细胞微环境促进PARP抑制剂耐药,并确立SPP1作为关键治疗靶点和预后生物标志物 | 研究未明确提及局限性 | 阐明PARP抑制剂耐药的微环境机制并鉴定新的治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌患者标本及同源重组缺陷小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间分析、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、免疫组化图像 | 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗临床试验中的初治高级别浆液性卵巢癌标本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析系统 |
| 10 | 2026-07-09 |
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-Apr-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00647.2025
PMID:41730286
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了出生后环氧合酶-2(COX-2)的上调驱动动脉导管解剖闭合的分子机制 | 首次发现COX-2在出生后动脉导管平滑肌细胞中显著上调,并证实其通过氧化应激和血栓素A2信号促进平滑肌细胞增殖,从而驱动动脉导管解剖闭合,为理解动脉导管闭合机制提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型,且COX-2抑制剂的干预仅针对出生后早期阶段,未探讨长期抑制的影响,同时涉及的中间分子(如)在摘要中未完全阐明 | 阐明出生后动脉导管血管重塑的分子机制,特别是COX-2在动脉导管解剖闭合中的作用 | 小鼠动脉导管平滑肌细胞(DASMCs)及其他细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-09 |
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01068-4
PMID:41731121
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现衰老过程中树突状细胞迁移缺陷,并通过口服酵母纳米颗粒增强其功能以改善疫苗效力 | 揭示了衰老中树突状细胞迁移缺陷是免疫衰退的关键机制,并开发了口服酵母纳米颗粒的非侵入性策略来增强树突状细胞功能 | 未明确提及 | 探究树突状细胞在衰老相关疫苗效力下降中的作用及改善策略 | 年轻与老年小鼠的淋巴结、树突状细胞及肠道免疫系统 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻与老年小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 12 | 2026-07-09 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究探讨了炎症小体适配器ASC在闭合性脑损伤模型中促进持续性神经炎症和轻度认知障碍的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示ASC在闭合性脑损伤后主要在小胶质细胞簇中表达,并证实其缺失可减轻神经炎症和认知缺陷 | 未明确提及局限性 | 研究闭合性脑损伤后炎症小体相关基因的细胞表达及其功能意义 | 闭合性脑损伤小鼠模型的皮层组织 | 自然语言处理 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-07-09 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示蝉细胞对艾希体感染的转录动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序解析ISE6蝉细胞系的异质性及其在艾希体感染过程中的时间依赖性转录变化 | 未说明具体局限性 | 探究蝉细胞系对艾希体感染的转录响应机制 | ISE6蝉胚胎细胞系及其感染艾希体后的转录谱 | 机器学习和单细胞转录组学 | 蜱传疾病(艾希体病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序分析(具体样本数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序平台 |
| 14 | 2026-07-09 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
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研究论文 | 本研究开发了一种基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可在无Matrigel条件下产生稳定的空间形态发生素梯度,用于人神经类器官的模式化 | 首次报道一种无Matrigel、基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可稳定建立陡峭的外源空间形态发生素梯度,实现人神经类器官的稳健区域化 | 当前技术难以在神经类器官中生成稳定、界限明确的梯度以实现稳健区域化 | 研究人类大脑区域化过程中单个形态发生素的作用,并建立模拟空间-时间形态发生素动态的类器官模型 | 人神经类器官 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人神经类器官(具体样本量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-07-09 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-Mar-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
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研究论文 | 通过长读长和短读长测序结合Hi-C染色质构象捕获,组装了环节动物模式物种Capitella teleta的染色体水平核基因组和线粒体基因组,并构建了功能基因组资源 | 首次提供C. teleta的染色体水平基因组组装,发现核基因组与线粒体基因组广泛重排,揭示了基因家族库与染色体进化之间的解耦现象,并通过多组学数据显著提升细胞类型特异性基因标记的识别质量 | 未明确提及,可能包括对实验室品系的依赖以及基因组重排功能意义的进一步验证需求 | 为环境模式生物C. teleta提供现代化染色体水平基因组资源,支持进化发育生物学、比较基因组学和生态毒理学研究 | 环节动物Capitella teleta的实验室品系 | 基因组学 | NA | 长读长测序、短读长测序、Hi-C染色质构象捕获、RNA-seq、ATAC-seq、EM-seq | NA | 基因组序列、染色质构象数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据、表观基因组数据 | 一个实验室品系的C. teleta样本 | NA | 单细胞RNA测序、ATAC测序、EM测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-07-09 |
BiGCN Learns B Cell Functional States by Integrating Single-Cell Transcriptomes and BCR Repertoires
2026-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202501919
PMID:41725270
|
研究论文 | 提出BiGCN方法,通过整合单细胞转录组和BCR库数据,学习B细胞功能状态 | 首次在单细胞分辨率下显式整合转录组和BCR数据,利用图卷积网络框架统一嵌入,高保真表征B细胞状态和克隆关系 | NA | 开发能够整合单细胞转录组和BCR库数据的方法,以揭示B细胞的功能多样性 | B细胞 | 机器学习 | 感染性疾病, 自身免疫病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | 图卷积网络 | 转录组数据, BCR序列数据 | 涵盖感染性疾病、自身免疫病和泛癌图谱的多组配对单细胞RNA测序和单细胞BCR测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-07-09 |
Single-cell transcriptomics reveals phenotypic and functional alterations of erythroid progenitor cells in tuberculosis patients
2026-Mar, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2026.102746
PMID:41734583
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示结核病患者红细胞祖细胞的表型和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了结核病不同阶段(潜伏感染、活动性、播散性)及肺组织中红细胞祖细胞的异质性,发现了疾病特异性亚群及其代谢重编程,并建立了基于EPC标志基因的潜伏结核预测模型 | NA | 探究结核病对红细胞祖细胞动态变化的影响及其与免疫细胞的双向调控机制 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核患者的外周血单个核细胞,以及结核肺组织和邻近未受累区域 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核队列的外周血样本以及结核肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-07-09 |
Integrating scRNA-seq and snRNA-seq with spatial transcriptomics to unlock the xylem puzzle
2026-Feb-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04007-z
PMID:41724975
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学技术,重建杨树茎发育木质部的完整分化轨迹,揭示次生细胞壁形成和程序性细胞死亡的转录调控机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单核RNA测序数据,克服了传统单细胞RNA测序无法捕获具有次生细胞壁的晚期木质部细胞的局限性,成功构建木质部发育的完整图谱 | 未明确提及局限性 | 通过整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学,解决木质部发育研究中晚期细胞类型难以捕获的问题 | 杨树茎发育木质部细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 激光捕获显微切割转录组, 支持向量机分类 | 支持向量机 | 转录组数据 | 不适用(论文未明确提及样本数量) | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 19 | 2026-07-09 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
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研究论文 | 通过单细胞免疫表型分析,鉴定出CD8+GZMK+IFNG+ T细胞是皮肤莱姆病中的关键免疫细胞群 | 首次在莱姆病红斑迁移性皮损中鉴定出克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞,并揭示其IFN调节基因的差异表达及炎症潜力 | 未提及明显局限性 | 探究莱姆病皮肤迁延性红斑中T细胞免疫反应的细胞和分子特征 | 红斑迁移性皮损及未受累自身皮肤组织中的T细胞 | 单细胞转录组学、免疫学 | 莱姆病(皮肤感染性疾病) | 单细胞RNA测序、适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、适应性免疫受体序列数据 | 扩大样本量后的红斑迁移性皮损和自身未受累皮肤配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-07-09 |
HDAC1 modulates sepsis-induced immunosuppression by driving the exhaustion of CD8+ T cells
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197224
PMID:41729078
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭及免疫抑制中的作用 | 首次揭示HDAC1通过与NFAT1直接相互作用促进其核转位,进而驱动CD8+ T细胞耗竭的分子机制,并证明HDAC1抑制可恢复AP-1与NFAT平衡来逆转免疫抑制 | 未提及具体局限性 | 阐明HDAC1在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭中的作用机制,评估其作为免疫抑制治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者外周血淋巴细胞及小鼠脓毒症模型中的CD8+ T细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者外周血样本和小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |