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当前共找到 39644 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-26 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
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研究论文 | 利用单细胞和多重空间转录组学揭示人类丘脑发育过程中的时空分子动态 | 首次在人类发育中的丘脑中描绘分子定义的神经元分化轨迹和空间组织模式，鉴定出不同丘脑核团中富集的谷氨酸能和GABA能神经元亚型 | 对丘脑发育的分子架构理解仍不完整，尤其对人类而言 | 阐明人类丘脑发育中细胞命运特化和组织的分子轨迹 | 人类发育中的丘脑组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、多重空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类发育中期（第二孕期）的丘脑样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组平台 |
| 2 | 2026-05-26 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
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研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序富集线粒体变异，解析克隆群体 | 结合常见3'单细胞RNA测序方案与线粒体转录组富集技术，将覆盖率提高50倍以上，实现高置信度突变检测 | NA | 建立可扩展且高灵敏度的线粒体DNA变异检测方法，以解析复杂组织中细胞克隆关系 | 原代人细胞（克隆造血中的免疫细胞） | 机器学习 | 克隆造血 | 单细胞RNA测序, 线粒体转录组富集 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 常见3'单细胞RNA测序方案 |
| 3 | 2026-05-26 |
Novel bi-allelic variants in KASH5 are associated with meiotic arrest and non-obstructive azoospermia
2022-06-30, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaac021
PMID:35674372
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研究论文 | 本研究在非梗阻性无精子症患者中鉴定出KASH5基因的新型双等位变异，证实其与减数分裂阻滞和男性不育相关 | 首次在人类细胞中评估KASH5蛋白表达，并揭示LINC复合物在人类和小鼠中的保守调控机制 | 功能验证主要依赖小鼠模型，人类样本数量有限，具体分子机制尚需进一步研究 | 探究KASH5基因变异与非梗阻性无精子症和减数分裂阻滞的关联 | 非梗阻性无精子症患者及其不孕姐妹 | 机器学习 | 男性不育症 | 全外显子组测序、CNV芯片、单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据、单细胞转录组数据 | 1例先证者及其姐妹，以及Kash5基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-25 |
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2650234
PMID:41913413
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研究论文 | 通过整合肿瘤和免疫细胞转录组学预测转移性黑色素瘤对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 使用单细胞RNA测序指导的免疫解卷积方法，识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标，并构建了82基因转录组特征签名 | 样本量较小（46例发现队列和54例验证队列），且液态活检仅用于8例患者的scRNA-seq分析 | 基于新型基因表达特征预测免疫检查点抑制剂原发性耐药的生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤患者治疗前的肿瘤微环境转录组和外周血单核细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46例发现队列FFPE RNA-seq样本，54例独立验证队列样本，8例scRNA-seq液态活检样本，46例流式细胞术样本 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-25 |
Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study
2026-Jun, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-025-11351-y
PMID:40946247
|
研究论文 | 采用多组学整合框架，结合网络药理学、机器学习、SHAP分析和单细胞RNA测序，系统研究肠道菌群代谢产物与基质金属蛋白酶-3（MMP3）在乳腺癌中的相互作用 | 首次整合网络药理学、机器学习与单细胞测序揭示肠道菌群代谢物-MMP3轴在乳腺癌中的作用，发现8种无毒菌群代谢物具有靶向MMP3的治疗潜力 | 结果基于计算分析和数据库验证，尚未进行体外和体内实验验证，缺乏临床样本的直接证据 | 探索肠道菌群代谢产物与乳腺癌相关靶点（尤其是MMP3）的相互作用机制 | 乳腺癌相关的肠道菌群代谢产物及其靶点MMP3 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 网络药理学, 分子对接, 孟德尔随机化 | 机器学习模型（SHAP分析） | 基因表达数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-25 |
18-β-glycyrrhetinic acid facilitates nuclear-mitochondrial communications to alleviate oxidative stress through HMGB1-cGAS-Mul1 axis in tendinopathy
2026-04-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08091-4
PMID:41998635
|
研究论文 | 研究18-β-甘草次酸通过HMGB1-cGAS-Mul1轴减轻肌腱病中氧化应激的机制 | 首次阐明GA通过DOT1L介导的HMGB1甲基化调控cGAS降解的分子机制，揭示了核-线粒体通讯在肌腱病中的作用 | 仅在大鼠模型和细胞实验中验证，缺乏临床人体试验数据 | 阐明18-β-甘草次酸缓解肌腱病的分子机制，特别是对HMGB1-cGAS-STING通路和氧化应激的调控 | 肌腱病大鼠模型和H2O2诱导的肌腱干细胞氧化应激模型 | 机器学习 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 临床样本单个细胞，大鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 7 | 2026-05-25 |
ANP32E drives lung adenocarcinoma progression via GSK3β-mediated glycolytic reprogramming
2026-Apr-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08712-2
PMID:41980942
|
研究论文 | 发现ANP32E通过KDM3B/EGFR介导的GSK3β失活促进肺腺癌糖酵解重编程和进展 | 首次揭示ANP32E通过表观遗传-代谢串扰调控肺腺癌进展的机制，并筛选出靶向ANP32E的化合物PGG | 未提及临床验证PGG在人体中的疗效和安全性 | 探究ANP32E在肺腺癌进展中的表观遗传-代谢调控机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌细胞系A549/H1975和异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 多重组学分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA和临床样本分析，具体数量未提及 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina Novaseq (推断) | NA |
| 8 | 2026-05-25 |
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8684
PMID:41931605
|
研究论文 | 研究C15ORF48在基底细胞亚群中调节线粒体ROS导致三阴性乳腺癌化疗耐药的机制 | 首次发现C15ORF48在基底细胞亚群中上调并通过抑制ROS积累导致化疗耐药，并鉴定其为潜在的AC化疗耐药治疗靶点 | 研究主要基于患者来源异种移植模型，可能未完全反映人体内微环境的复杂性 | 阐明三阴性乳腺癌对AC化疗耐药的分子机制 | 三阴性乳腺癌肿瘤上皮细胞（特别是基底细胞亚群） | 单细胞转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 原位三阴性乳腺癌患者来源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-05-25 |
Research progress in heterogeneity of dental mesenchymal stem cells
2026-Apr-03, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00433-8
PMID:41932866
|
综述 | 综述了牙间充质干细胞在发育和亚群层面的异质性研究进展 | 系统总结了单细胞RNA测序等新技术揭示的牙间充质干细胞发育层级和异质性，为组织再生工程提供新框架 | 未提及现有研究的局限性 | 整合牙间充质干细胞及其相关细胞的发育异质性和亚群异质性研究，促进牙齿和牙周组织发育的理解及组织再生修复工程 | 牙间充质干细胞及其相关细胞，包括牙胚祖细胞、牙囊干细胞、脱落乳牙干细胞、根尖牙乳头干细胞、牙髓干细胞、牙周膜干细胞、牙龈间充质干细胞和牙槽骨间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-05-25 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
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研究论文 | 开发了一种通过基因工程造血干细胞在胸腺中持续生成CAR-T细胞的平台，并利用诱导型基因表达克服胸腺负选择 | 首次利用胸腺微环境持续生成CAR-T细胞，并通过诱导型基因表达系统绕过中枢耐受，实现自体更新的CAR-T细胞疗法 | NA | 解决CAR-T细胞体内持久性有限和肿瘤复发问题，开发可持续生成CAR-T细胞的平台 | 造血干细胞和祖细胞、CAR-T细胞、胸腺微环境 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-25 |
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2026-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02339-4
PMID:41457181
|
研究论文 | 通过多模态分子与空间分析，发现NNT作为肥胖相关结直肠癌的预后生物标志物 | 首次整合转录组数据、临床验证和空间转录组学揭示NNT在肥胖相关结直肠癌中的预后价值及其肿瘤微环境特征 | 未提及明确局限性 | 识别反映肥胖相关肿瘤特征并分层患者预后的分子生物标志物 | 肥胖相关结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 免疫组化, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | TCGA-COADREAD数据集及独立队列 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析系统 |
| 12 | 2026-05-25 |
Oxidative stress reprograms benign prostatic hyperplasia microenvironments: insights from integrative multi-omics and machine learning
2026-04-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08055-8
PMID:41923163
|
研究论文 | 整合多组学和机器学习方法，揭示氧化应激在良性前列腺增生微环境中的重编程作用 | 首次通过整合多组学和机器学习构建氧化应激相关诊断模型，并结合单细胞转录组、空间转录组及体内外实验验证ACOX2等关键基因在BPH中的功能 | 样本量较小（12个BPH样本，16个对照），研究结论应视为假设生成性质，需在更大规模独立人群中验证 | 识别与氧化应激相关的良性前列腺增生生物标志物，并刻画氧化应激相关的基质细胞状态 | 良性前列腺增生患者的组织样本及前列腺基质细胞系WPMY-1 | 机器学习和数字病理学 | 前列腺增生 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 流式细胞术, RT-qPCR, western blot, 免疫组化 | WGCNA, 四种机器学习算法（逻辑回归、随机森林、支持向量机、XGBoost）, 一致性聚类 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 实验数据 | 28个组织样本（12 BPH, 16 对照）; 124,616个单细胞; 细胞系实验（WPMY-1） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组, Illumina NovaSeq批量转录组测序 |
| 13 | 2026-05-25 |
AI-guided multi-omics analysis identifies NPC1-modulated susceptibility to SARS-CoV-2 infection under PM2.5 exposure
2026-Mar-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71196-3
PMID:41912520
|
研究论文 | 研究利用AI引导的多组学分析，鉴定NPC1调节PM2.5暴露下SARS-CoV-2感染易感性的分子机制 | 首次通过微调的单细胞转录组基础模型整合PM暴露与SARS-CoV-2感染共享转录特征，并结合流行病学、GWAS和功能基因组学揭示NPC1调节的内体-溶酶体通路污染相关易感性机制 | NA | 阐明空气细颗粒物暴露增加SARS-CoV-2感染风险的分子机制 | SARS-CoV-2感染易感性、PM2.5暴露、NPC1基因调控 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、功能基因组学 | 基础模型 | 转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-25 |
Cardiomyocyte-derived GPX4 stabilizes BNIP3 to facilitate mitophagy and mitigate myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71232-2
PMID:41904174
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研究论文 | 研究发现心肌细胞来源的GPX4通过稳定BNIP3促进线粒体自噬，减轻心肌缺血再灌注损伤 | 首次揭示GPX4通过其U46活性位点增强BNIP3与USP20相互作用，减少BNIP3的K131位泛素化，从而稳定BNIP3并促进线粒体自噬的新机制，将GPX4与铁死亡相关的线粒体损伤联系起来 | 未提及 | 阐明GPX4在心肌缺血再灌注损伤中的效应及分子机制 | 心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 15 | 2026-05-25 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization during CD4+ T cell activation reveals immune-mediated mechanisms and drug targets for neuropsychiatric disorders
2026-Mar-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09941-z
PMID:41904330
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研究论文 | 结合单细胞转录组学、表达数量性状位点鉴定、孟德尔随机化和共定位分析，识别神经精神疾病在CD4+ T细胞激活过程中的致病基因、通路和药物靶点 | 首次在动态T细胞激活状态下整合单细胞转录组学与孟德尔随机化，发现时间特异性因果模式，并优先考虑RAC1和PARP1等21个潜在药物重定位靶点 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或因果推断的潜在混杂因素 | 阐明CD4+ T细胞激活在阿尔茨海默病和重度抑郁症免疫介导机制中的作用并识别药物靶点 | 阿尔茨海默病和重度抑郁症 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 重度抑郁症 | 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-05-25 |
The CD4+ T cell population partners with Tpex CD8+ T cells to mediate antitumor immunity in the tumor microenvironment
2026-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71161-0
PMID:41904165
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱流式分析，发现CD4+ T细胞亚群Th7R与Tpex CD8+ T细胞在肿瘤微环境中协同作用，维持抗肿瘤免疫 | 首次鉴定出IL-7R CCR6+ Th1样CD4+ T细胞亚群（Th7R）作为Tpex的伴侣细胞，阐明其在三级淋巴结构中与Tpex共定位并支持抗肿瘤免疫的新机制 | 部分数据来自肾细胞癌样本，且主要基于肺癌患者，可能限制结论的普适性；小鼠模型为过继转移实验，人类研究为关联性分析，因果验证不足 | 探究肿瘤微环境中CD4+ T细胞如何与Tpex CD8+ T细胞协作以维持抗肿瘤免疫 | 肺癌患者（主要）和肾细胞癌患者的外周血、肿瘤和淋巴结样本 | 机器学习 | 肺癌, 肾细胞癌 | NA | NA | NA | 肺癌和肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-25 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
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研究论文 | 通过单细菌细胞视角揭示头孢曲松耐药在奈瑟氏球菌亚种中的机制 | 首次结合实验进化和单细胞转录组学来解析奈瑟氏球菌亚种在抗生素压力下从共生菌向病原菌转变的多因素策略 | 尚未在更多临床菌株或体内模型中验证该适应性过程 | 研究抗生素压力如何驱动奈瑟氏球菌亚种适应并增强致病性 | 奈瑟氏球菌亚种（Neisseria subflava） | 机器学习和数字病理学 | 慢性呼吸系统疾病 | 全基因组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 实验进化过程中多个时间点的细菌培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-25 |
Conserved Ductular Reaction Mechanisms in Biliary Atresia and Primary Sclerosing Cholangitis Derived From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Mar-27, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101778
PMID:41903685
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示胆道闭锁与原发性硬化性胆管炎中保守的导管反应机制 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术比较两种胆道疾病（BA和PSC），发现保守的纤维炎症机制，包括上皮、间质和先天免疫过程的共享，而适应性免疫过程存在差异 | 未来研究需纳入更广泛的早期和晚期疾病样本（尤其是非肝硬化PSC），当前对配体-受体相互作用的预测置信度有限 | 阐明胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎中导管反应的保守分子机制，识别跨纤维炎症性疾病的治疗靶点 | 胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎患者的胆管组织及细胞类型 | 数字病理学 | 胆道闭锁, 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA（提及需涵盖早晚期样本，但未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-25 |
Spatial Transcriptomics of Early Tooth Morphogenesis in Formalin-fixed Paraffin-embedded Mouse Embryonic Tissue
2026-03-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70340
PMID:41911219
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研究论文 | 描述了用于小鼠胚胎甲醛固定石蜡包埋组织的空间转录组学分析方案，以研究早期牙齿形态发生 | 优化了从收集、固定到石蜡包埋的完整工作流程，确保RNA完整性和组织形态，兼容多种空间转录组学平台 | NA | 建立可重复的空间转录组学分析方法，用于研究胚胎牙齿发育的分子机制 | 小鼠胚胎颅面组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-25 |
Multi-omics analysis of NEDD1 in hepatocellular carcinoma: biological function, prognostic value, and clinical significance
2026-Mar-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42505-z
PMID:41775913
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研究论文 | 通过多组学分析研究NEDD1在肝细胞癌中的生物学功能、预后价值和临床意义 | 首次多组学揭示NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用及NEDD1-MZT2B模块在肿瘤细胞和免疫抑制性巨噬细胞中的动态功能模型 | 可能受到公共数据集异质性的影响，且功能性验证仅涉及单一基因敲减和皮下异种移植模型 | 探索NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用、调控机制及与肿瘤微环境的相互作用 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | DNA甲基化测序, 磷酸化组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 表达数据, 甲基化数据, 磷酸化数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA和GEO公共数据集及临床样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 使用GSE140228和HRA000437公共数据集 |