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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-06-19
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals a baicalein-responsive 10-gene signature for non-small cell lung cancer
2026-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 整合单细胞和空间转录组学分析揭示了黄芩素应答的10基因签名用于非小细胞肺癌 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、批量转录组学、空间转录组学、机器学习和体外实验,系统鉴定非小细胞肺癌中黄芩素应答基因,并建立了高诊断准确性的10基因签名,通过分子对接和动力学模拟验证了黄芩素与关键靶蛋白的结合稳定性 研究主要基于公开数据和体外实验,缺乏体内动物模型和临床试验验证,且黄芩素的具体作用机制仍需进一步深入探究 识别非小细胞肺癌中黄芩素应答基因并建立诊断签名 非小细胞肺癌细胞系(PC-9和A549细胞)及肿瘤微环境中的不同细胞类型 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 机器学习模型(用于选择基因签名) 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确说明样本数量,但使用了公开数据集及体外实验中的PC-9和A549细胞系 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
2 2026-06-19
Telomerase-related gene EHHADH drives lung cancer progression and shapes the immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究基于端粒酶相关基因构建肺癌预后风险模型,发现EHHADH驱动肺癌进展并塑造免疫抑制性肿瘤微环境 首次从端粒酶相关基因角度构建肺癌预后模型,并发现EHHADH作为关键致癌驱动基因在免疫逃逸中的作用 未在更大规模临床队列中验证模型,EHHADH的分子机制仍需进一步深入探索 评估端粒酶相关基因在肺癌中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 肺癌患者样本及公开数据集中的端粒酶相关基因 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 Cox回归风险模型 基因表达数据 来自七个公开数据集的肺癌病例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-06-19
Transcriptome profiling of peripheral blood for inflammatory subtype classification and diagnostic model construction in asthma
2026-Jul, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
研究论文 通过外周血转录组测序进行哮喘炎症亚型分类并构建诊断模型 首次利用外周血转录组学数据,结合批量RNA测序和单细胞RNA测序,通过多级验证识别哮喘炎症亚型的关键生物标志物 研究主要基于公共数据库的样本,可能无法完全代表不同人群的异质性,且验证仅通过体外细胞模型进行 利用外周血转录组学识别哮喘炎症亚型并筛选候选生物标志物 哮喘患者的外周血样本 机器学习 哮喘 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR LASSO, SVM-RFE RNA测序数据 GSE69683数据集(批量RNA测序)和GSE172495数据集(单细胞RNA测序) NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-06-19
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals peripheral immune dysregulation in adolescent major depressive disorder
2026-Jul, Brain, behavior, and immunity
研究论文 通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序揭示青少年重度抑郁症的外周免疫失调 首次结合批量与单细胞RNA测序对青少年重度抑郁症进行多组学分析,揭示其独特的外周免疫基因下调模式,并发现现有单胺类抗抑郁药物对免疫失调的纠正作用有限 样本量较小(仅4例患者和4例对照进行单细胞测序),且未涉及药物治疗的长期跟踪 利用多组学方法表征青少年重度抑郁症的外周转录变化,探索免疫相关机制及潜在治疗靶点 青少年重度抑郁症患者的外周血样本 自然语言处理 青少年抑郁症 批量RNA测序、单细胞RNA测序、Connectivity Map分析 NA 基因表达数据 180例MDD患者和99名健康对照的批量RNA测序,其中4例患者和4名对照进行单细胞测序 Illumina 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NovaSeq NA
5 2026-06-19
Integrative single-cell and bulk transcriptomics analysis reveals cellular heterogeneity, immune microenvironment dynamics, and prognostic signatures in oral squamous cell carcinoma
2026-Jul, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 通过整合单细胞和批量转录组学分析,揭示了口腔鳞状细胞癌的细胞异质性、免疫微环境动态及预后标志物 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学与批量转录组数据,系统解析了OSCC的细胞异质性、免疫微环境动态及预后特征,并识别出六基因预后标志和免疫治疗响应生物标志 未提及明确局限,但样本量(如复发与非复发病例数)未详细说明,可能影响结论的普适性 阐明口腔鳞状细胞癌的分子和细胞复杂性,为精准治疗策略提供依据 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤样本,包括HPV阳性、HPV阴性、复发和非复发病例 计算机视觉 口腔癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、甲基化测序 Kaplan-Meier生存分析、GSEA通路富集分析、降维和轨迹推断 基因表达数据 未明确提及总体样本量,但涉及HPV阳性、HPV阴性、复发和非复发病例等多个亚组 10x Genomics, Illumina, 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'试剂盒, 10x Visium 空间基因表达解决方案, Illumina NovaSeq 测序平台
6 2026-06-19
Single-nucleus multi-omics dissection of dysregulated trophoblast development and disrupted immune microenvironment in complete hydatidiform moles
2026-Jul, Science China. Life sciences
研究论文 通过单核多组学分析揭示完全性葡萄胎中滋养层发育失调和免疫微环境紊乱的细胞与分子机制 首次整合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学构建完全性葡萄胎的细胞图谱,并鉴定出RASA1作为新的关键调控因子 样本量有限且仅关注完全性葡萄胎,未涉及部分性葡萄胎或其他妊娠相关疾病 阐明完全性葡萄胎中滋养层细胞发育异常和免疫微环境紊乱的分子机制 完全性葡萄胎与孕龄匹配对照组的胎盘组织样本 机器学学 妊娠滋养层疾病 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 机器学习 NA 单细胞转录组, 单细胞染色质可及性, 空间转录组数据 完全性葡萄胎和对照组胎盘组织样本 10x Genomics, Illumina 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium 空间基因表达, Illumina NovaSeq 测序平台
7 2026-06-19
Spatial transcriptomics identifies distinct domains regulating yield-component traits of the wheat ear
2026-Jun-19, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 利用空间转录组学分析小麦花序发育过程中的转录景观,鉴定出两个空间上不同的区域调控小穗结构与产量相关性状 首次运用空间转录组学技术研究小麦花序的转录图谱,揭示了两个调控小穗结构的空间不同区域及其基因表达特征 未明确说明局限性,但可能包括样本数量有限或实验条件限制 探究小麦花序发育过程中基因如何相互作用调控花序形态及支持结构的发育 发育中的小麦花序 数字病理学、机器学习 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
8 2026-06-19
Spatial transcriptome mapping identifies Ppara-Anxa2 cross-talk in microplastic-induced hepatotoxicity
2026-Jun-19, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过空间转录组分析揭示聚乙烯微塑料通过Ppara-Anxa2信号通路导致肝脏毒性的机制 首次结合整体和空间转录组学分析,鉴定出Ppara通过增强子和启动子结合调控Anxa2,揭示了微塑料诱导肝毒性的细胞异质性和空间转录特征 未明确描述研究局限 探究聚乙烯微塑料在代谢正常和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎饮食条件下对肝脏的毒性机制 小鼠肝脏组织 空间转录组学 肝脏毒性 整体转录组测序,空间转录组测序 NA 基因表达数据 研究者喂食标准或MASH诱导饮食的小鼠 NA 整体RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
9 2026-06-19
CXCL12 upregulates PD-L1 expression and promotes M2 polarisation of tumour-associated macrophages to confer anti-PD-1 resistance in gastric cancer
2026-Jun-18, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association IF:6.0Q1
研究论文 探究 CXCL12 通过上调 PD-L1 表达和促进肿瘤相关巨噬细胞 M2 极化导致胃癌抗 PD-1 耐药的机制 首次发现 CXCL12 作为胃癌抗 PD-1 耐药新基因,揭示 CXCL12/CXCR4/PI3K/AKT/HIF-1α 轴通过双重途径促进耐药 NA 阐明 CXCL12 在胃癌抗 PD-1 耐药中的作用及机制 抗 PD-1 耐药胃癌小鼠模型、人及小鼠胃癌细胞系 machine learning 胃癌 单细胞转录组测序、分子对接、药物亲和力响应靶标稳定性实验、RT-qPCR、ELISA、免疫荧光、蛋白质印迹 NA 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2026-06-19
Identifying breast cancer subtypes and exploring spatial expression patterns of the key subtype-specific gene based on pathological images, single-cell sequencing, and spatial transcriptomic data
2026-Jun-18, Breast cancer (Tokyo, Japan)
研究论文 基于病理图像、单细胞测序和空间转录组数据识别乳腺癌亚型并探索关键亚型特异性基因的空间表达模式 结合病理图像特征提取、共识聚类和空间转录组学分析,识别出与预后相关的乳腺癌亚型,并揭示关键基因ESRP1在肿瘤区域中的空间分布及其与成纤维细胞的共定位模式 未明确说明方法的局限性 基于病理图像特征识别乳腺癌的预后亚型,并利用空间转录组学和单细胞RNA测序探索其潜在的分子和细胞机制 乳腺癌患者 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 H&E染色图像, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Cox回归, 机器学习, 共识聚类, WGCNA, Lasso回归 图像, 文本 TCGA-BRCA数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
11 2026-06-19
TYRP1 defines a proliferative melanoma cell subpopulation, driving malignant progression and therapy resistance via the GPNMB-Notch1-SOX10/MITF axis
2026-Jun-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究鉴定了TYRP1阳性的黑色素瘤细胞亚群,并阐明其通过GPNMB-Notch1-SOX10/MITF轴驱动肿瘤恶性进展和治疗耐药性的机制 首次发现TYRP1作为高度增殖的黑色素瘤亚群标志物,揭示其通过GPNMB-Notch1-SOX10/MITF正反馈环路驱动肿瘤进展并影响治疗反应 未探讨TYRP1亚群在转移能力外的其他恶性特征,且临床样本量及其异质性的影响需进一步验证 表征TYRP1阳性黑色素瘤细胞的功能特性及其在肿瘤增殖、信号调控和治疗反应中的作用 TYRP1阳性的黑色素瘤细胞亚群 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 原发性和转移性黑色素瘤样本(具体数量未说明),以及患者来源类器官和细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-06-19
Integrated Bioinformatics and Explainable Machine Learning Analyses Reveal Mesenchymal Stem Cell Exosome-Related Biomarkers for Diabetic Retinopathy
2026-Jun-18, Journal of ocular pharmacology and therapeutics : the official journal of the Association for Ocular Pharmacology and Therapeutics IF:1.9Q3
研究论文 通过整合生物信息学和可解释机器学习分析,发现间充质干细胞外泌体相关的糖尿病视网膜病变生物标志物 首次结合Mfuzz聚类、可解释机器学习(LASSO和随机森林)与单细胞RNA测序,从间充质干细胞外泌体相关基因中识别出YBX1和PSMA7作为糖尿病视网膜病变的核心生物标志物,并基于此构建了诊断预测模型 诊断模型的AUC仅超过0.7,临床效用和治疗相关性仍需进一步研究验证 识别与间充质干细胞外泌体相关的糖尿病视网膜病变潜在生物标志物 糖尿病视网膜病变小鼠模型的视网膜组织 机器学习 糖尿病视网膜病变 转录组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 蛋白质印迹法 LASSO回归, 随机森林 转录组数据, 蛋白质数据, 单细胞RNA测序数据 糖尿病视网膜病变小鼠模型样本(数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-06-19
Deciphering the metabolic landscape of MYCN non-amplified neuroblastoma through integrated multiomics
2026-Jun-18, The FEBS journal
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、蛋白质组学和代谢组学,系统解析了MYCN非扩增型神经母细胞瘤的代谢特征,特别是脂质代谢重编程在高危疾病进展中的关键作用 首次对MYCN非扩增型神经母细胞瘤进行多组学整合代谢特征分析,结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和代谢组学,并利用随机森林分类器和双向正交偏最小二乘法筛选生物标志物,揭示了脂质代谢重编程在高危疾病进展中的核心作用 样本量较小(仅22例神经母细胞瘤样本),可能限制结果的普遍性;缺乏功能验证实验来确认鉴定到的关键分子(如RPL9和POLR2G)和代谢物的因果关系 阐明MYCN非扩增型神经母细胞瘤的代谢景观,揭示脂质代谢重编程在其发病机制中的重要作用,并识别潜在的治疗靶点 22例神经母细胞瘤样本(包括MYCN扩增组和MYCN非扩增组) 数字病理学 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 代谢组学, 多组学整合分析 随机森林分类器 单细胞转录组, 蛋白质组, 代谢组 22例神经母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 代谢组学 NA NA
14 2026-06-19
Slit2/Robo Signaling Restores Diabetic Erectile Function via Neurovascular Remodeling
2026-Jun-18, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 本文研究了Slit2/Robo信号通路在糖尿病性勃起功能障碍中通过神经血管重塑恢复勃起功能的作用 首次揭示了Slit2/Robo信号通路在糖尿病性勃起功能障碍中的调控作用,并通过AAV递送Slit2实现了同步的神经血管再生和功能恢复 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证,且AAV递送的安全性和长期效果需要进一步评估 探索Slit2/Robo信号通路在糖尿病性勃起功能障碍中的作用及其作为治疗靶点的潜力 糖尿病小鼠的阴茎海绵体组织 数字病理学 糖尿病相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 胚胎到出生后阶段的生殖结节样本以及糖尿病和对照小鼠的阴茎海绵体组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
15 2026-06-19
Comprehensive multi-omic profiling of desmoplastic small round cell tumors identifies targetable pathways with therapeutic opportunities
2026-Jun-18, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 对促纤维增生性小圆细胞肿瘤进行综合多组学分析,确定具有治疗机会的可靶向通路 首次对DSRCT患者肿瘤样本进行综合多组学分析,结合单细胞和整体RNA测序、蛋白质分析、免疫功能检测和同源重组缺陷功能性检测,揭示了患者特异性脆弱点和可靶向的生物学特征 样本量较小,仅来自5名患者的9个肿瘤活检样本 深入表征DSRCT肿瘤特征,发现可靶向通路以指导精准治疗策略 促纤维增生性小圆细胞肿瘤(DSRCT) 机器学习 肉瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质谱, 免疫组化, 功能性HRD检测 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 蛋白质数据 5名患者的9个肿瘤活检样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 整体RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq整体RNA-seq
16 2026-06-19
Evolution of artificial intelligence in breast cancer pathology: a bibliometric analysis
2026-Jun-18, Discover oncology IF:2.8Q2
文献计量分析 对乳腺癌病理学中人工智能应用的文献进行计量分析,梳理研究现状、关键趋势和新兴方向 应用BERTopic模型从摘要中提取语义主题,系统揭示了从单模态图像分析向多模态'病理组学'和跨学科领域的转变 仅依赖Web of Science数据库,可能遗漏其他来源的相关文献;分析时间范围截至2025年,未来趋势需持续更新 描绘乳腺癌病理人工智能领域的研究图景,识别关键趋势和新兴方向 2011至2025年间发表的1089篇乳腺癌病理人工智能相关文献 计算机视觉,自然语言处理,机器学习 乳腺癌 NA 深度学习,CNN,BERTopic 文本,文献数据 1089篇出版物 NA NA NA NA
17 2026-06-19
Single-cell Technologies in Atherosclerosis: Uncovering Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Opportunities
2026-Jun-18, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1
综述 综述单细胞分析技术在动脉粥样硬化研究中的应用,揭示细胞异质性和疾病机制 整合单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组和空间数据,发现新的巨噬细胞和血管平滑肌细胞表型、内皮功能障碍特征及寡克隆T细胞群体 未提及具体局限性 探讨单细胞技术如何阐明动脉粥样硬化的细胞和分子复杂性,推动生物标志物发现和精准治疗 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和血管细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA 转录组数据、表观基因组数据、蛋白质组数据、空间数据 人及实验动物模型 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组学 NA NA
18 2026-06-19
An Adaptive Multi-Scale Manifold Embedding Preprocessing Framework for High-Dimensional Data Visualization
2026-Jun-17, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 提出一种基于序数距离的自适应多尺度流形嵌入预处理框架,用于改善高维数据可视化的鲁棒性和聚类结构分离 创新性地引入序数距离替代传统欧氏距离,并设计自适应邻域调整策略,同时优化簇内紧凑性和簇间可分离性 未明确讨论方法的计算复杂度或在大规模数据集上的扩展性,且验证案例仅基于小鼠DRG scRNA-seq数据 提升高维可视化中邻域构建的鲁棒性以及簇内与簇间结构的区分能力 多个真实世界高维数据集,包括小鼠腰椎背根神经节单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 流形嵌入算法(t-SNE、UMAP、PaCMAP) 高维数值数据 多个真实数据集,其中小鼠DRG scRNA-seq数据包含神经元子类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-06-19
Praxis-BGM: Clustering of Omics Data Using Semi-Supervised Transfer Learning for Gaussian Mixture Models via Natural-Gradient Variational Inference
2026-Jun-17, Bioinformatics (Oxford, England)
research paper 开发了一种基于自然梯度变分推断的Praxis-BGM框架,用于高斯混合模型的半监督迁移学习,以改善小样本组学数据的聚类性能 首次将自然梯度变分推断与半监督迁移学习结合用于高斯混合模型,实现了从小样本到大规模参考数据的知识迁移,并利用VON算法推导了标准参数的自然梯度更新 对先验模型部分不匹配的情况仍具有鲁棒性,但完全错误匹配的先验可能影响性能 开发一种适用于高维小样本组学数据的聚类方法,提升模型稳定性和泛化能力 乳腺癌批量转录组数据和单细胞转录组数据 machine learning breast cancer RNA-seq, single-cell RNA-seq Gaussian mixture model omics data NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
20 2026-06-19
Deciphering viral infections at single-cell resolution: From immune dynamics to host-pathogen interactions
2026-Jun-17, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
review 综述单细胞RNA测序在病毒性感染研究中的应用,重点关注免疫异质性、宿主-病原体相互作用及单细胞水平的病毒动态 系统总结了scRNA-seq在多种病毒(SARS-CoV-2、HBV、HIV、流感病毒、RSV)中揭示免疫细胞异质性和病毒转录组重编程的进展,并强调了联合免疫组库测序和病毒进化分析的独特视角 当前scRNA-seq技术存在通量限制、病毒转录本检测灵敏度不足以及数据分析计算挑战,未来需与空间转录组学和多组学平台整合 阐述单细胞RNA测序在病毒性感染研究中的最新进展、技术挑战及转化潜力 多种病毒(SARS-CoV-2、HBV、HIV、流感病毒、RSV)感染中的免疫细胞、感染细胞及宿主组织 machine learning geriatric disease 单细胞RNA测序,TCR/BCR测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,免疫组库序列 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
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