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当前共找到 39284 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-09 |
Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation
2026-Jul, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116073
PMID:41895505
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和实验验证，发现免疫基因MMP9是TCDD暴露相关动脉粥样硬化的关键介质 | 首次通过系统生物信息学分析与实验结合，揭示MMP9作为TCDD暴露诱导动脉粥样硬化的核心免疫基因及其调控通路 | 主要依赖公开数据库和计算机模拟，体外模型仅涉及HUVEC细胞，缺乏体内动物模型验证 | 探索TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制，为环境相关动脉粥样硬化的风险评估、早期诊断和靶向干预提供新见解和候选靶点 | TCDD暴露相关动脉粥样硬化 | 网络毒理学 | 心血管疾病 | 网络毒理学, RT-qPCR, Western blot, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习, SHAP, WGCNA, 伪时间分析 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Jun, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性肺移植功能障碍中内皮和上皮细胞的激活蛋白-1协同激活 | 首次通过空间转录组学分析揭示慢性肺移植功能障碍（CLAD）中上皮和内皮细胞AP-1靶基因（如JUNB和FOS）的协同上调，以及抗纤维化基因的下调，提供了CLAD发病机制的新见解 | 未提及明确限制，但可能包括样本量有限或缺乏功能验证实验 | 阐明慢性肺移植功能障碍中特定基因表达谱及其在发病机制中的作用 | 人类肺组织，包括CLAD患者、非CLAD移植受体和未移植对照组 | 数字病理学 | 慢性肺移植功能障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本，包括CLAD患者、非CLAD移植受体和未移植对照组 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 3 | 2026-05-09 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
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研究论文 | 利用空间和单细胞转录组学等技术揭示母体阿片类药物使用障碍和丙型肝炎感染对胎盘免疫景观和结构的影响 | 首次综合运用流式细胞术、组织学、空间和单细胞转录组学，系统研究母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和功能的影响，并根据丙型肝炎感染状态进一步分层分析 | 未明确提及局限性 | 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘组织的影响及其潜在机制 | 胎盘组织 | 机器学习 | NA | 流式细胞术, 组织学, 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-09 |
Focal adhesion proteins confer smooth muscle anoikis resistance and protection against aortic aneurysm and dissection
2026-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195291
PMID:41874580
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研究论文 | 本研究探究黏着斑蛋白在平滑肌细胞失巢凋亡抵抗及防止主动脉瘤和夹层中的作用 | 发现黏着斑蛋白（如FAK、VCL、ILK）通过非激酶活性依赖的方式保护平滑肌细胞免受失巢凋亡，从而抑制胸主动脉瘤和夹层进展 | 主要基于小鼠模型和体外实验，需进一步验证人类患者中的机制 | 明确平滑肌细胞黏着斑蛋白在胸主动脉瘤和夹层发病机制中的功能 | 人类胸主动脉瘤样本、平滑肌细胞特异性Ptk2、Vcl和Ilk基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，小鼠模型，免疫印迹，细胞凋亡检测 | NA | 基因表达数据，组织病理图像 | 人类胸主动脉瘤样本及基因敲除小鼠队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析人类TAA主动脉样本 |
| 5 | 2026-05-09 |
Distinct single-cell cellular states and ecosystems linked to HPV status distinguish therapeutic vulnerability of head and neck squamous cell carcinoma
2026-May-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10213-z
PMID:42098219
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research paper | 使用EcoTyper框架分析HPV感染对头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中细胞状态和生态系统的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示HPV相关HNSCC中46种独特细胞状态和生态型，并关联预后与药物敏感性 | 尚未验证细胞状态在更大样本队列中的临床可重复性及机制细节 | 阐明HPV感染如何塑造HNSCC肿瘤微环境的细胞异质性和生态系统 | HPV阳性和阴性头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达 |
| 6 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics defines IM-crypt as a premalignant niche with bidirectional divergence in early gastric carcinogenesis
2026-May-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10179-y
PMID:42098407
|
研究论文 | 利用空间转录组学定义IM隐窝为早期胃癌发生过程中具有双向分化的癌前微环境 | 首次通过空间转录组学在人类胃组织疾病进展过程中识别出OLFM4阳性过渡亚群，揭示了肠化生隐窝作为癌前微环境且具有向不同肠分化程序的双向转录轨迹，并发现USF2相关调控网络在隐窝和癌症区域的共享活性 | 未明确说明局限性 | 阐明早期胃癌发生过程中恶性转化和亚型分化的空间起源 | 人类胃组织样本，涵盖从胃炎、肠化生到早期胃癌的疾病进展阶段 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 涵盖疾病进展的不同阶段的人类胃组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 7 | 2026-05-09 |
10 × Genomics Flex Gene Expression is a powerful tool for single-cell transcriptomics of xenografts models
2026-May-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04092-0
PMID:42098734
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研究论文 | 该研究展示了10× Genomics Flex基因表达方案能有效分析异种移植模型中的单细胞转录组，通过组合人源和鼠源探针实现物种特异的细胞图谱 | 首次证明在单次反应中同时使用人鼠两种探针集可对混合细胞异种移植样本进行单细胞转录组分析，无需流式分选即可获得干净的物种特异性数据 | NA | 验证10× Genomics Flex基因表达方案在异种移植模型单细胞转录组研究中的适用性 | 异种移植样本中的人源和鼠源混合细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Flex | 10× Genomics Flex基因表达方案，基于探针的固定或冷冻样本处理方法 |
| 8 | 2026-05-09 |
Cross-Species Plant Single-Cell Analysis: Community Challenges and Shared Solutions
2026-May-08, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag218
PMID:42099283
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综述 | 报告了2025年植物单细胞分析暑期研讨会的成果，包括社区面临的挑战和解决方案，并建立了PlantSCHub社区门户以支持可重复的植物单细胞分析 | 通过研讨会形式系统梳理植物单细胞分析的五大优先挑战领域，并提出跨物种整合、多模态轨迹与基因调控网络推断、空间锚定可视化以及AI科学家代理等概念路线图 | 未具体说明局限性 | 推动植物单细胞分析领域从孤立研究转变为互操作、不断发展的生态系统，加速发现和作物改良 | 植物单细胞分析社区的需求和解决方案 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 深度生成模型, AI基础模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-05-09 |
A stem and progenitor cell-derived gene expression signature is prognostic for survival in myelofibrosis
2026-May-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030094
PMID:41481381
|
research paper | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序，开发了一个基于造血干细胞和祖细胞基因表达特征（MPN24）的预后评分，用于改善骨髓纤维化的风险分层 | 首次利用造血干细胞和祖细胞的转录组特征构建基因表达评分，并在多个独立队列中验证其独立于现有临床和基因组预后变量的预后价值 | 研究未详细说明MPN24评分在不同治疗干预或疾病亚型中的表现，且样本可能来自特定人群，需进一步验证其通用性 | 改善骨髓纤维化的风险分层模型，开发一种基于干细胞和祖细胞基因表达特征的预后评分 | 骨髓纤维化患者的造血干细胞和祖细胞以及外周血样本 | machine learning | myelofibrosis | RNA-seq, single-cell RNA-seq, NanoString assay | prognostic model based on weighted-sum expression score | gene expression data | 358名骨髓纤维化患者（培训组和测试组），以及两个独立验证队列（170名和100名患者） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-05-09 |
EssentCell: Discovering Essential Evolutionary Relations in Noisy Single-Cell Data
2026-May-07, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3691222
PMID:42096398
|
研究论文 | 提出EssentCell算法，通过整数线性规划识别噪声单细胞数据中所有最优进化关系中的本质关系 | 首次关注单细胞测序数据中多个最优完美系统发育树间的本质关系，而非仅重建单一树 | 未明确讨论算法在大规模数据集上的计算效率及对噪声水平的鲁棒性 | 在考虑假阳性率约束下，从噪声单细胞数据矩阵中寻找最小翻转问题的最优解中的本质进化关系 | 肿瘤细胞单细胞测序数据中的突变矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | 整数线性规划 | 二元突变矩阵 | 多个数据集（具体样本量未说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-09 |
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-May-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aec8514
PMID:42096520
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研究论文 | 开发了名为TranscriptFormer的生成式基础模型，基于多达1.12亿个细胞、跨越12个物种（涵盖15.3亿年进化历程）进行训练，实现了跨物种细胞类型分类、零样本疾病状态识别以及系统发育关系的自然涌现 | 首次训练跨越15.3亿年进化历程的跨物种单细胞基础模型，零样本识别人类疾病状态，且在不依赖显式训练的情况下从表示中自然涌现发育轨迹与系统发育关系 | 未提及具体限制 | 建立跨物种单细胞转录组定量分析与比较细胞生物学的通用框架 | 12个物种的细胞（跨越15.3亿年进化历程） | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 生成式基础模型（Transformer架构的变体） | 基因表达数据 | 1.12亿个细胞，12个物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-05-09 |
SCOTCH: isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2026-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72665-5
PMID:42098110
|
研究论文 | 提出了SCOTCH，一个端到端、平台无关的分析流程，用于从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征 | 通过非重叠子外显子组合建模、动态阈值分配、整合读段覆盖与现有注释优化子外显子边界以及迭代聚类重构新转录本，比现有拼接图方法更可靠地恢复真实新异构体，并具有poly(A)感知过滤减少假阳性 | NA | 开发一种从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征的平台无关流程 | 人类血液和脑类器官数据集中的细胞类型特异性转录组谱和新异构体 | 计算生物学 | NA | 长读长单细胞RNA测序（lr-scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 多平台人类血液和脑类器官数据集 | 牛津纳米孔科技（ONT）, 太平洋生物科学（PacBio）, 10x Genomics, Parse Biosciences, BGI | 单细胞RNA测序 | 纳米孔测序仪（MinION, PromethION）, PacBio测序仪（Sequel, Revio）, 10x Chromium, Parse Biosciences分区生物试剂盒 | NA |
| 13 | 2026-05-09 |
A D-dimer and ADAMTS8 based multi-marker score for the diagnosis of acute aortic dissection
2026-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51121-w
PMID:42098242
|
研究论文 | 通过空间转录组学筛选AAD相关基因并验证其编码蛋白，构建含D-二聚体与ADAMTS8的多标志物评分系统以诊断急性主动脉夹层 | 首次将空间转录组学与血浆蛋白标志物结合，建立包含D-二聚体、ADAMTS8、身高、收缩压和年龄的多标志物诊断评分，实现高准确率（AUC 0.921） | 未提及外部验证队列中混杂因素控制或样本量对评分泛化能力的影响 | 探索优化急性主动脉夹层诊断的生物标志物 | 急性主动脉夹层患者血浆蛋白及主动脉组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学、蛋白检测（如酶联免疫吸附试验） | 逻辑回归模型（多标志物评分） | 基因表达数据、蛋白质定量数据、临床指标 | 302名参与者（173例AAD患者，129例对照）及独立验证集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-09 |
Refinement of renal T lymphocytes enrichment strategies: advancing the in-depth study of renal immune responses
2026-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51954-5
PMID:42098282
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研究论文 | 优化从小鼠和人类肾脏中分离和纯化T淋巴细胞的方案，以提高细胞产量和存活率，并应用于肾脏疾病研究 | 首次系统评估不同组织破碎、酶消化和Percoll梯度离心条件，优化出机械剪切结合0.2% IV型胶原酶和0.02% DNase I消化45分钟，再经33-80% Percoll梯度离心的高效方案 | 该方案主要基于小鼠和人类肾脏组织，对不同物种或病理条件下的适用性需进一步验证；单细胞测序分析仅使用公共数据库数据，未进行独立验证 | 建立优化的肾脏T淋巴细胞分离纯化方案，支持肾脏免疫反应的深入研究 | 小鼠和人类肾脏组织中的T淋巴细胞，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞和双阴性T细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 小鼠肾脏组织（缺血再灌注损伤、肾纤维化、顺铂诱导急性肾损伤模型）及正常人类肾脏组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA-seq数据作为补充参考 |
| 15 | 2026-05-09 |
NSUN6-Mediated m5C Modification of OAS2 Is Implicated in Neuronal PANoptosis during Perioperative Neurocognitive Disorders
2026-May-07, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05770-7
PMID:42098355
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研究论文 | 该研究通过多组学技术揭示NSUN6介导的OAS2 m5C修饰在围术期神经认知障碍神经元PANoptosis中的作用 | 首次发现PANoptosis在围术期神经认知障碍中的角色，并揭示NSUN6通过OAS2的m5C修饰调控神经元PANoptosis的新机制 | 未提及具体局限性 | 探究PANoptosis在围术期神经认知障碍中的作用及潜在机制 | 围术期神经认知障碍小鼠模型及神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序, meRIP-seq, RNA-seq, 免疫荧光, TUNEL染色 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-05-09 |
Early transcriptional divergence underlies cell fate bias in bovine embryos
2026-May-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10198-9
PMID:42098360
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究牛胚胎从2细胞到8细胞阶段的转录不对称性 | 发现牛胚胎早期卵裂中姐妹卵裂球在压实前就出现渐进性转录差异，且与卵裂球大小相关 | 未提及具体限制 | 探究早期胚胎细胞谱系偏差的分子基础 | 牛胚胎的2细胞至8细胞阶段卵裂球 | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牛胚胎从2细胞到8细胞阶段的多个胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-09 |
A three-dimensional spatial transcriptome atlas reconstructs early organogenesis in primate Carnegie stages 9 and 10 embryos
2026-May-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-026-01956-2
PMID:42098384
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研究论文 | 构建了食蟹猴胚胎在卡内基阶段9和10的三维空间转录组图谱，揭示了早期器官发生的关键形态发生事件 | 首次提供高分辨率三维空间转录组图谱，解析早期灵长类胚胎发育中跨胚层的空间谱系域和区域特异性基因表达调控景观 | 受限于样本数量和时间点覆盖，可能未完全捕捉早期器官发生的动态变化 | 阐明灵长类早期器官发生的空间转录组程序 | 食蟹猴胚胎（卡内基阶段9和10） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 多个食蟹猴胚胎（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 高分辨率空间转录组学用于三维重建 |
| 18 | 2026-05-09 |
Integrated multi-omics and single-cell analyses identify metabolic heterogeneity and therapeutic vulnerabilities in medullary thyroid cancer
2026-May-07, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03467-1
PMID:42098434
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研究论文 | 通过整合多组学和单细胞分析，揭示甲状腺髓样癌的代谢异质性与治疗脆弱性 | 首次提出基于代谢的甲状腺髓样癌亚型分类系统，并发现CHSY1通过糖胺聚糖合成促进上皮间质转化的机制 | 样本量相对有限，代谢亚型的临床验证需要更多独立队列支持 | 解析甲状腺髓样癌的代谢异质性并探索精准管理策略 | 甲状腺髓样癌患者的RNA测序样本（101例）和代谢组学样本（51例） | 机器学习 | 甲状腺髓样癌 | RNA-seq, 非靶向代谢组学, 单细胞RNA-seq, 深度学习 | 聚类分析, 深度学习的预后模型 | 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞RNA测序数据 | RNA-seq 101例, 代谢组学 51例, 免疫组化 47例, 多重免疫荧光 12例, 单细胞RNA-seq 7例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-05-09 |
Integrated analyses reveal a potential role for PFKFB4 in M2 macrophage polarization and hepatocellular carcinoma progression
2026-May-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04326-y
PMID:42098724
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研究论文 | 综合分析揭示PFKFB4在M2巨噬细胞极化和肝细胞癌进展中的潜在作用 | 首次通过单细胞转录组学、生物信息学、体外功能实验和体内验证的综合分析，阐明PFKFB4在肝细胞癌中通过激活MEK/ERK信号通路促进肿瘤进展，并通过肿瘤细胞介导的M2巨噬细胞极化影响免疫调节，揭示了其在代谢和免疫调控中的双重作用 | 未在更大样本队列或不同肝癌亚型中验证PFKFB4的表达和功能，且其调控MEK/ERK及M2极化的详细分子机制需进一步探索 | 探索PFKFB4在肝细胞癌进展中的作用及其对巨噬细胞极化的影响 | 肝细胞癌细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学, 生物信息学, 体外功能实验, 体内验证 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-09 |
Super-enhancer-driven LncRNA MIR205HG promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via glycolysis reprogramming
2026-May-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08202-1
PMID:42098726
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研究论文 | 鉴定并表征了超级增强子驱动的长链非编码RNA MIR205HG通过糖酵解重编程促进食管鳞状细胞癌进展的机制 | 首次发现并阐明了超级增强子驱动的lncRNA MIR205HG通过与PTBP3相互作用作为分子支架促进HIF-1α翻译，进而上调HK2和LDHA表达增强糖酵解，从而驱动食管鳞癌进展的分子机制 | 未明确说明研究局限性 | 探索超级增强子相关长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌中的分子机制及功能 | 食管鳞状细胞癌组织和细胞系 | 分子生物学 | 食管癌 | ChIP-Seq, HiChIP-Seq, ChIP-qPCR, 双荧光素酶报告基因检测, CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据, 蛋白表达数据, 临床生存数据 | 未明确说明样本数量 | Illumina | ChIP-seq, HiChIP-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于ChIP-seq和HiChIP-seq测序的平台 |