单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39812 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-05-30
Exploring the key functions of T cells and the regulation of the immune microenvironment in prostate cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2026-12-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序探索前列腺癌中T细胞的关键功能及免疫微环境调控 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,系统分析T细胞亚群在前列腺癌肿瘤微环境中的分布模式及其与临床病理参数的相关性,并构建基于T细胞标志基因的预后风险模型 未明确说明 系统阐明前列腺癌肿瘤微环境中T细胞亚群的分布及其功能,并构建预后模型以评估免疫治疗相关性 前列腺癌患者肿瘤微环境中的T细胞 自然语言处理 前列腺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 预后风险模型 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 16,999个单细胞(质量控制后) NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
2 2026-05-30
The shared mechanisms and potential diagnostic markers for IgA nephropathy and celiac disease
2026-12-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 通过整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,识别共享机制和潜在诊断标志物 首次整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,通过多种方法(差异表达分析、WGCNA、机器学习)共享诊断标志物,并利用单细胞RNA测序探索细胞定位 部分验证数据来自独立队列,但未进一步探讨这些标志物在临床实践中的具体应用 揭示IgA肾病和乳糜泻共病的分子机制并发现潜在诊断标志物 IgA肾病和乳糜泻患者的转录组数据 机器学习 肾病, 乳糜泻 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习模型(如特征选择模型) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个独立队列的转录组数据,具体样本数量未在摘要中说明 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-05-30
Exploring the molecular mechanisms underlying the inflammation-cancer transformation in Hashimoto thyroiditis using single-cell transcriptomics
2026-12-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 通过单细胞转录组学探究桥本甲状腺炎炎症-癌变转化的分子机制 首次利用单细胞RNA测序技术揭示桥本甲状腺炎向甲状腺乳头状癌转化过程中IL1B阳性滤泡上皮细胞通过FN1/CD44轴招募肥大细胞,后者分泌IL-8激活PI3K/AKT通路促进恶性表型的创新机制 仅基于公共数据库和体外细胞模型验证,缺乏体内实验和更大样本量的临床验证 阐明桥本甲状腺炎相关甲状腺乳头状癌中炎症向癌症转化的分子机制 桥本甲状腺炎和甲状腺乳头状癌组织中的单细胞 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,差异基因表达筛选,功能富集分析,细胞间通讯分析,Transwell共培养模型 NA 单细胞转录组数据,体外实验数据 未明确说明具体样本数量,但包括HT相关和PTC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-05-30
Anemoside B4 alleviates pulmonary fibrosis by targeting the Keap1/Nrf2 axis to suppress NLRP3 inflammasome-mediated pyroptosis and epithelial-mesenchymal transition
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 该研究揭示了白头翁皂苷B4通过靶向Keap1/Nrf2轴抑制NLRP3炎症小体介导的细胞焦亡和上皮间质转化,从而减轻肺纤维化的作用机制 首次发现白头翁皂苷B4作为预防性而非治疗性药物对抗肺纤维化,并阐明了其通过直接结合Keap1激活Nrf2抗氧化途径、抑制NLRP3依赖性细胞焦亡及分泌组驱动的上皮间质转化的完整分子机制 未提及具体局限性 探究白头翁皂苷B4在肺纤维化中的保护作用及其分子机制,重点关注Keap1/Nrf2轴、NLRP3介导的细胞焦亡和上皮间质转化 野生型和Nlrp3基因敲除小鼠的博莱霉素诱导肺纤维化模型 机器学习 肺纤维化 NGS, scRNA-seq, Co-IP, CETSA NA 转录组数据 野生型和Nlrp3基因敲除小鼠(具体数量未提及) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-05-30
Targeting CIRP and IL-6R-mediated microglial inflammation to improve outcomes in intracerebral hemorrhage
2026-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 探讨冷诱导RNA结合蛋白通过IL-6受体介导小胶质细胞炎症在脑出血后损伤中的作用,并评估靶向CIRP和IL-6R的肽抑制剂Tat-CIRP-CMA的治疗潜力 首次揭示神经元来源的CIRP通过IL-6R/STAT3通路激活小胶质细胞炎症的机制,并设计特异性肽抑制剂TCC进行干预 未提及临床样本量及长期随访数据,大鼠模型和体外实验的转化价值有待验证 阐明CIRP在脑出血后神经炎症中的作用机制及靶向治疗可行性 大鼠脑出血模型、小胶质细胞特异性IL-6Rα敲除小鼠、人脑出血患者外周血样本 机器学习 脑出血 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大鼠模型、小鼠模型及人脑出血患者外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
6 2026-05-30
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2026-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了Epac1基因敲除对缺血性视网膜病变中Müller胶质细胞病理激活和视网膜神经变性的影响 首次发现Epac1通过调节Müller细胞中VEGF信号通路促进视网膜神经变性,靶向Epac1可能同时保护神经和血管 仅使用小鼠模型,需在人类样本中验证;未探讨Epac1在其他视网膜细胞类型中的具体作用 研究Epac1在缺血性视网膜病变中的作用及其分子机制 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型中的视网膜神经元、Müller胶质细胞及血管 数字病理学 缺血性视网膜病变(包括早产儿视网膜病变和增殖性糖尿病视网膜病变) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠视网膜样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-05-30
A systems biology framework uncovers multi-level genetic regulation of dizziness/vertigo through eQTL-GWAS integration and single-cell analysis
2026-Jun, The International journal of neuroscience
研究论文 通过整合eQTL-GWAS和单细胞分析,构建系统生物学框架揭示头晕/眩晕的多层次遗传调控机制 首次将大脑单细胞类型、CD4+ T细胞、免疫细胞和血浆的eQTL数据与GWAS整合,结合听神经单细胞RNA测序及伪时间分析,系统揭示头晕/眩晕的因果基因和细胞类型特异性调控 文章未明确提及局限,但可能包括样本来源的异质性和单细胞数据覆盖的组织有限 阐明头晕/眩晕的分子机制并识别潜在治疗靶点 头晕/眩晕患者的遗传数据和听神经单细胞转录组 系统生物学 神经系统疾病(头晕/眩晕) GWAS、eQTL整合、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序、伪时间分析、药物靶点网络 NA 基因组关联数据、表达数量性状位点数据、单细胞转录组数据 未明确样本量,涉及多种公共数据集(如GWAS、eQTL和单细胞数据) NA 单细胞RNA测序、全基因组关联分析(GWAS) NA NA
8 2026-05-30
High MAP3K6 expression in spinal cord injury tissues enhances neuronal apoptosis: insights from multi-omics data integrating WGCNA, machine learning and experimental validation
2026-Jun, The International journal of neuroscience
研究论文 通过多组学数据整合WGCNA、机器学习及实验验证,发现高表达的MAP3K6促进脊髓损伤后神经元凋亡 首次结合转录组数据、WGCNA共表达网络、随机森林特征选择及单细胞测序,系统鉴定并验证MAP3K6在SCI中的关键调控作用,并通过体外实验证实其促凋亡功能 主要基于公共数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证及大规模临床样本确认 探索脊髓损伤后差异表达基因及其调控机制,寻找诊断标志物和治疗靶点 脊髓损伤组织及小鼠脊髓神经元细胞 机器学习 脊髓损伤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq WGCNA, 随机森林, ROC分析 转录组数据, 单细胞转录组数据 GSE226238数据集(SCI组与对照组),GSE151371验证数据集,体外小鼠脊髓神经元细胞 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-05-30
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-06, American journal of hematology IF:10.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示I型干扰素信号驱动镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系偏向性分化的机制 首次阐明I型干扰素异常激活是镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系分化的核心驱动因素,并发现G-CSF受体CSF3R上调导致单核细胞谱系偏向性生成 未涉及体内模型验证以及长期治疗对造血系统其他谱系的影响 探究镰状细胞贫血中中性粒细胞和单核细胞持续增高的内在机制 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 单细胞转录组学 镰状细胞贫血 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确提及样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-05-30
SMAD7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension Via the TGF-β1-SMAD2/3 Pathway
2026-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 通过整合单细胞转录组、蛋白质组和孟德尔随机化分析,研究SMAD7下调通过TGF-β1-SMAD2/3通路促进肺动脉高压中铁死亡的机制 首次揭示SMAD7作为铁死亡负调控因子在肺动脉高压中的作用,并整合多组学数据阐明其通过TGF-β1-SMAD2/3通路影响肺血管重塑 初步证据,需进一步验证SMAD7作为治疗靶点的临床转化潜力 探究肺动脉高压中铁死亡的调控机制及其对肺血管细胞景观的影响 肺动脉内皮细胞,肺动脉高压大鼠模型和缺氧诱导的肺动脉内皮细胞模型 机器学习 肺动脉高压 单细胞转录组测序,蛋白质组学,孟德尔随机化 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-05-30
SYT8 Drives Colorectal Cancer Progression and Immune Evasion via the SETD1A-H3K4me3 Axis
2026-Jun, The American journal of pathology
研究论文 通过整合多组学数据,发现SYT8在结直肠癌中上调并通过SETD1A-H3K4me3轴驱动肿瘤进展和免疫逃逸 首次揭示SYT8通过与SETD1A互作形成正反馈回路,增强H3K4me3修饰并激活促肿瘤基因转录 NA 探究SYT8在结直肠癌进展和免疫逃逸中的作用及分子机制 结直肠癌肿瘤细胞 机器学习 结直肠癌 RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,免疫荧光,免疫共沉淀/质谱分析 NA 转录组数据,单细胞转录组数据 TCGA、GEO数据库及自建结直肠癌队列的多组样本 Illumina 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Illumina NovaSeq NA
12 2026-05-30
Innate lymphoid cells in rheumatoid arthritis as mediators of pathology and resolution
2026-Jun, Nature reviews. Rheumatology
综述 该文章综述了先天性淋巴细胞在类风湿关节炎病理和缓解中的作用 文章全面总结了不同ILC亚群在类风湿关节炎中的双重作用——第3组ILC促进炎症而第2组ILC促进修复,并探讨了基于ILC的潜在治疗策略如CAR-ILC2 目前这些治疗策略仍处于临床前阶段 探讨先天性淋巴细胞作为类风湿关节炎生物标志物和治疗靶点的潜力 先天性淋巴细胞亚群(ILC1、ILC2、ILC3、LTi细胞) 数字病理 类风湿关节炎 NA NA 文本 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
13 2026-05-30
Hyperinnervation inhibits organ-level regeneration in mammalian skin
2026-May-28, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本论文揭示哺乳动物皮肤在晚期胚胎阶段能进行包含上皮、间充质、神经和血管组织的器官级再生,但这种能力在出生后迅速丧失,并发现成纤维细胞驱动的神经过度支配是阻止再生的关键障碍 首次鉴定出抑制器官级再生的关键因素——出生后伤口特异性成纤维细胞(PWF)及其富集基因(Timp1、Cxcl12、Ccl7),并证明消除神经过度支配可解锁器官级再生 未阐述神经过度支配具体如何抑制多种细胞谱系的再生机制,且研究主要基于小鼠模型,人类相关性有待验证 探究哺乳动物皮肤从再生性向非再生性转变的机制,寻找阻止器官级再生的关键障碍 小鼠胚胎和出生后皮肤伤口组织 再生医学 皮肤创伤 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠胚胎和出生后皮肤伤口样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-05-30
Molecular insight into the interplay among heterogeneous plasmacytes and microenvironment cells and their clinical relevance in myeloma
2026-May-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过多组学分析揭示多发性骨髓瘤中异质性浆细胞与微环境细胞之间的相互作用及其临床相关性 首次在大量中国多发性骨髓瘤患者中结合全基因组/全外显子测序、RNA测序和单细胞RNA测序,定义了8种浆细胞亚群并构建了分化轨迹,同时揭示了肿瘤细胞与微环境细胞间的动态、全面的配体-受体相互作用网络 样本主要来自中国人群,可能限制了结果的普适性;部分单细胞数据来自公共数据库的复发患者,可能存在批次效应 探究多发性骨髓瘤中异质性浆细胞与微环境细胞的相互作用及其临床意义 277例新诊断多发性骨髓瘤患者、20例复发患者(来自公共数据库)和30例正常对照 机器学习 多发性骨髓瘤 全基因组测序、全外显子测序、RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因测序数据 267例进行WGS/WES和RNA-seq,59例进行scRNA-seq,20例复发患者(公共数据库),30例正常对照 NA 全基因组测序、全外显子测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-05-30
TAZ integrates ECM remodeling with uterine stromal differentiation to maintain early pregnancy
2026-May-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了TAZ整合细胞外基质重塑与子宫基质分化以维持早期妊娠的机制 首次发现Hippo信号通路效应因子TAZ通过调控胶原相关的细胞外基质重塑,在蜕膜形成中发挥关键作用,并利用小鼠条件性敲除模型验证其功能 NA 探究子宫蜕膜化过程中基质细胞分化和细胞外基质重塑的分子调控机制 小鼠和人类子宫内膜组织,包括患者样本 单细胞组学、空间转录组学 妊娠相关疾病、胎盘缺陷 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织学分析 NA 基因表达数据、空间转录数据、组织图像 小鼠子宫内膜和人类患者子宫内膜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,10x Visium空间转录组学平台
16 2026-05-30
Molecular architecture of the tumor microenvironment caused by BRCA1 and BRCA2 somatic mutations in human lung adenocarcinoma
2026-May-26, eLife IF:6.4Q1
研究论文 利用单细胞测序和多组学数据,表征BRCA1和BRCA2体细胞突变引起的人肺腺癌肿瘤微环境的分子架构 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变在肺腺癌中不同的免疫微环境特征和转录模式,并发现其与免疫检查点阻断治疗反应及组蛋白去乙酰化酶抑制剂敏感性的关联 该研究仅提供了对BRCA突变肿瘤微环境的初步表征,未在更大规模队列或前瞻性研究中验证 探讨BRCA1和BRCA2体细胞突变对肺腺癌肿瘤微环境中免疫组成、T细胞功能及治疗反应的影响 BRCA1或BRCA2体细胞突变的肺腺癌患者 数字病理学 肺癌 单细胞测序, 多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-05-30
IL-6/STAT3 signaling drives mitochondrial oxidative phosphorylation dysfunction and AP-1 activation in fibroblasts during sepsis-induced lung injury
2026-May-26, Free radical biology & medicine
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示IL-6/STAT3信号驱动脓毒症诱导肺损伤中成纤维细胞的线粒体氧化磷酸化功能障碍和AP-1激活 首次通过单细胞RNA测序系统描绘脓毒症期间成纤维细胞从静息态向促炎和促纤维化表型转变的图谱,并阐明IL-6/STAT3信号通过线粒体代谢重塑调控AP-1激活的新机制 未提及具体局限性,但研究主要基于动物模型,临床相关性需进一步验证 探索脓毒症诱导肺损伤和纤维化中成纤维细胞的角色及潜在治疗靶点 脓毒症诱导的肺损伤小鼠模型中的成纤维细胞 单细胞转录组学 脓毒症相关肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量,包括小鼠肺组织样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium NA
18 2026-05-30
Targeting dysregulated glycolysis in type 2 diabetic osteoporosis: Identification of a diagnostic gene signature and therapeutic validation of calcifediol
2026-May-25, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究结合生物信息学与实验验证,识别2型糖尿病性骨质疏松症中与糖酵解相关的诊断基因标志物,并验证骨化二醇的治疗潜力 首次通过整合113种机器学习算法和单细胞RNA测序,系统鉴定2型糖尿病性骨质疏松症中的糖酵解相关基因标志物,并发现骨化二醇作为潜在治疗药物 研究结论需在后续研究中进一步验证其临床价值 识别2型糖尿病性骨质疏松症的诊断和治疗靶点 2型糖尿病性骨质疏松症患者和小鼠模型 机器学习 2型糖尿病性骨质疏松症 生物信息学分析、单细胞RNA测序、分子对接、小鼠模型实验 机器学习算法(113种) 基因表达数据、单细胞转录组数据 多个数据集整合,具体样本量未在标题和摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-05-30
Dual orexin receptor antagonism with lemborexant enhances microglial clearance of β-amyloid in mice
2026-May-22, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 研究FDA批准的食欲素双受体拮抗剂lemborexant与抗组胺能睡眠药物多塞平对PSAPP小鼠β-淀粉样蛋白病理和小胶质细胞反应的影响 首次证明了FDA批准的食欲素双受体拮抗剂lemborexant通过增强小胶质细胞吞噬功能来减轻淀粉样蛋白病理,且这种作用不依赖于广泛炎症诱导 小鼠模型结果需在人类中验证,未探讨长期治疗效果和潜在副作用 评估lemborexant对淀粉样蛋白病理和小胶质细胞反应的影响,并与多塞平比较 PSAPP小鼠(淀粉样前体蛋白转基因小鼠模型) 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 PSAPP小鼠,未具体说明数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
20 2026-05-30
A GPCR atlas across human microglial states in Alzheimer's disease: Insights from snRNA-seq and hiPSC models
2026-May-21, Experimental neurology IF:4.6Q1
综述 通过整合snRNA-seq和hiPSC模型数据,系统分析了阿尔茨海默病中不同小胶质细胞状态下的GPCR表达特征 首次系统绘制了AD相关五种关键小胶质细胞状态(疾病相关、tau相关、炎症相关、增殖相关和干扰素相关)的GPCR表达图谱,并跨物种验证hiPSC来源小胶质细胞中保守的候选GPCR 文献发表时间为2020-2025年,可能遗漏早期研究;依赖于公开数据集,部分分析深度受限于原始数据质量 阐明AD中小胶质细胞不同状态的GPCR表达异质性并提供药物开发候选靶点 人类AD脑组织单核RNA测序数据及hiPSC衍生小胶质细胞单细胞测序数据 自然语言处理 阿尔茨海默病 snRNA-seq, 单细胞测序, hiPSC模型 NA 序列数据 2020-2025年发表的多个人类脑组织snRNA-seq研究数据集 NA 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部