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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-28 |
Single-cell landscape of piglet lung response with Actinobacillus pleuropneumoniae
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2646800
PMID:41843736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了猪肺在感染胸膜肺炎放线杆菌后的免疫反应和纤维化特征 | 首次在猪肺中应用单细胞RNA测序技术,系统性地描绘了感染胸膜肺炎放线杆菌后的细胞亚群变化、免疫反应机制以及纤维化发展过程 | 研究仅针对猪肺模型,未涉及人类或其他动物模型,且样本数量可能有限 | 阐明胸膜肺炎放线杆菌感染引起的猪肺免疫反应和纤维化机制 | 感染或未感染胸膜肺炎放线杆菌的仔猪肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及感染和未感染仔猪肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-28 |
Integrated bioinformatics analysis reveals cross-talking hub genes and therapeutic agents between sepsis and acute myocardial infarction
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2645276
PMID:41863100
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析,识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因,并探讨了其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 首次系统性地识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的交叉核心基因(JAK2、MYD88、TIMP1),并验证了槲皮素作为潜在靶向治疗药物的结合亲和力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏临床前或临床试验数据来证实治疗效果的体内有效性 | 识别脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因,并探索其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 脓毒症和急性心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症和急性心肌梗死 | RNA测序、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接模拟、qPCR验证 | MCC/Degree算法 | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-03-28 |
Cell-type-specific genetic associations in Lewy body dementia identified using single-cell eQTL-based Mendelian randomization
2026-Jun, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2026.106205
PMID:41855783
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研究论文 | 本研究利用单细胞eQTL进行孟德尔随机化分析,识别了路易体痴呆中细胞类型特异的遗传关联 | 首次将单细胞转录组范围的孟德尔随机化与脑细胞类型特异性eQTL结合,揭示了ANKRD65在兴奋性神经元中表达与路易体痴呆风险的关联 | 研究主要基于遗传推断,需要进一步实验验证功能机制;样本分层可能影响统计效力 | 探索遗传变异通过细胞类型特异性机制影响路易体痴呆易感性的关联 | 路易体痴呆患者及对照人群的脑组织样本 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 | 逆方差加权模型 | 遗传与转录组数据 | 基于APOE ε4携带状态分层的独立路易体痴呆队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-28 |
Multi-omics analysis reveals AR as a potential prognostic factor and immune-related therapeutic target in gastric cancer
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102537
PMID:41890218
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术全面分析了雄激素受体(AR)在胃癌中的表达、预后价值及免疫相关作用 | 首次系统性地分析了AR在多种癌症类型中的肿瘤免疫微环境作用及其对预后和免疫治疗反应的预测价值,特别是在胃癌中作为不良预后风险因子的发现 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未具体说明;未涉及AR靶向治疗的临床前或临床试验 | 探讨AR在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 多种癌症类型,重点关注胃癌 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析、基因集富集分析、单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-28 |
Genome and Single-Cell Transcriptome Reveal the Evolution of Holoparasitic Plants: A Case Study of Cistanche deserticola
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70464
PMID:41334776
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研究论文 | 本研究通过构建染色体级别基因组图谱和单细胞转录组图谱,揭示了肉苁蓉作为全寄生植物的分子与细胞进化机制 | 首次构建了肉苁蓉的染色体级别基因组图谱,并结合单细胞转录组技术揭示了寄生相关细胞的阶段特异性分化过程 | 研究主要聚焦于单一物种,未与其他寄生植物进行广泛比较,且数据库功能可能受限于当前数据整合范围 | 探索全寄生植物肉苁蓉在分子和细胞水平的进化机制 | 肉苁蓉(Cistanche deserticola)及其基因组与单细胞转录组数据 | 植物基因组学与单细胞生物学 | NA | 基因组测序、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议,以增强胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议并采用胰岛素转录本靶向耗竭策略,提高了长读长测序在单细胞水平上的转录本检测效率和准确性 | 技术挑战包括读长不足和较高错误率,可能影响某些低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议,以改善胰腺胰岛中异构体的检测和基因表达分析 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-28 |
Activation of the Pancreatic "Metabolic Synapse" Aggravates Type 2 Diabetes Mellitus by Inducing PANoptosis in β-Cells
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0863
PMID:41701561
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序和体外实验,揭示了胰腺成纤维细胞通过分泌过量谷氨酸激活β细胞中的NMDAR,从而触发PANoptosis并加速2型糖尿病进展的新机制 | 首次提出“代谢突触”概念来描述胰腺成纤维细胞与β细胞间的相互作用,并发现谷氨酸-NMDAR轴在2型糖尿病发病中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏大规模临床验证;人类胰腺样本的NMDAR表达变化仅作为相关性观察,未进行功能验证 | 探究胰腺成纤维细胞对β细胞功能障碍和2型糖尿病进展的贡献,并阐明减肥手术改善糖尿病的机制 | 胰腺β细胞、胰腺成纤维细胞、2型糖尿病患者胰腺样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-28 |
Endogenous oestrogens as neuroprotective modulators in the human retina: Evidence from transcriptomic profiling and aromatase inhibition
2026-Apr, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70171
PMID:41877439
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类视网膜中类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的表达,并利用芳香化酶抑制剂letrozole在小鼠视网膜外植体中验证局部雌激素合成的功能相关性 | 首次在人类视网膜单细胞水平系统分析类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的细胞类型特异性表达,并实验证明局部雌激素合成对光感受器维持和免疫调节的潜在保护作用 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步的功能验证;小鼠外植体模型可能无法完全模拟人类视网膜的生理环境 | 探究人类视网膜中内源性雌激素的神经保护作用机制 | 人类视网膜细胞和小鼠视网膜外植体 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据集E-MTAB-7316(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-28 |
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70240
PMID:41888970
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征,揭示了免疫-基质互作在疾病微环境中的差异 | 首次在单细胞水平上系统识别早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎之间的转录组差异,包括角质形成细胞、成纤维细胞、髓系细胞和恶性T细胞的独特基因表达模式 | 研究样本量可能有限,且未涉及晚期疾病阶段或其他皮肤淋巴瘤类型的比较 | 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变,以改善诊断准确性 | 早期蕈样肉芽肿、特应性皮炎及健康对照的皮肤组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及早期MF、AD和健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-28 |
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD25178
PMID:41630526
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型探究了FAM216A和CCDC166基因在雄性生育力中的作用 | 首次系统评估了FAM216A和CCDC166这两个睾丸富集基因在雄性生育中的功能,并发现其敲除不影响小鼠生育力 | 研究仅在小鼠模型中进行,未直接在牛等牲畜中验证,且可能存在物种特异性差异 | 探究FAM216A和CCDC166基因在雄性生育力中的功能 | 基因敲除小鼠模型 | 生殖生物学 | 生育障碍 | 系统发育分析、序列比对、单细胞转录组数据分析、RT-PCR、基因敲除、组织化学染色、生育力分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因序列数据、转录组数据、组织切片图像 | 未明确说明具体样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-28 |
Pathogenic GM-CSF drives functional diversification of inflammatory macrophages in autoimmune arthritis
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec0986
PMID:41880492
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了在自身免疫性关节炎中,GM-CSF如何驱动炎症巨噬细胞的功能多样化,从而加剧关节炎症和疼痛 | 首次阐明GM-CSF在自身免疫性关节炎中促进Ly6C单核细胞分化为功能不同的巨噬细胞亚群,并识别出两个GM-CSF依赖的致病性巨噬细胞亚群,包括独特的EpCAM巨噬细胞亚群,后者表达与关节炎疼痛相关的促痛介质 | 研究基于T辅助17细胞介导的自身免疫性关节炎模型,可能不完全反映所有类型的关节炎或人类疾病情况,且单细胞RNA测序数据可能受样本大小和技术限制影响 | 探究自身免疫性关节炎中巨噬细胞发育和功能多样化的机制,特别是GM-CSF在其中的作用 | 关节浸润的Ly6C单核细胞和GM-CSF依赖的致病性滑膜巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-28 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本研究开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增技术,通过机器学习优化调控扩增效率,应用于DNA数据存储和临床RNA变异分析 | 提出通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦,实现连续精确的扩增效率调控;构建机器学习模型显著提升预测精度;在DNA数据存储中实现近一个数量级的信息预览密度提升和稳健的文件隐写 | 未明确说明技术在实际临床样本中的大规模验证情况;单细胞测序和空间转录组学的扩展应用仅为预期方向 | 开发可动态调控扩增效率的分子诊断和DNA数据存储技术 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 可编程核酸扩增技术、机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据、测序数据 | 基于2483个实验数据构建模型,临床验证中进行了模拟测序深度测试 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-03-28 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化分析,基于两个大型欧洲前瞻性队列数据,探讨了原发性肿瘤与继发性原发性恶性肿瘤之间的因果关系 | 首次系统性地使用孟德尔随机化方法验证了胃癌与特定继发性癌症(如食管癌和直肠癌)之间的因果关联,并进一步通过单细胞测序分析识别了PLK1癌症干细胞作为潜在驱动因素 | 研究主要基于欧洲人群数据,结果可能不适用于其他种族或地区人群,且孟德尔随机化分析依赖于遗传工具变量的假设 | 评估原发性肿瘤与继发性原发性恶性肿瘤之间的因果关系,以优化癌症幸存者的精准随访策略 | 涵盖八大人类器官系统的癌症类型,包括胃癌、食管癌、直肠癌等 | 遗传流行病学 | 多种癌症 | 孟德尔随机化分析,单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据,流行病学数据 | 两个大型欧洲前瞻性队列:UK Biobank(31种癌症类型)和FinnGen(28种癌症类型) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-03-28 |
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01459-8
PMID:41888646
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-03-28 |
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Mar-26, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281171.125
PMID:41786602
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研究论文 | 本文提出了一种名为NeighbourNet (NNet)的新方法,用于从单细胞RNA测序数据构建细胞特异性共表达网络,以发现精细的调控模式 | NNet方法不依赖预定义的细胞簇或状态,而是通过主成分分析和K近邻局部回归为每个细胞构建特异性共表达网络,从而捕捉细胞间动态、细微的调控变异 | 方法性能可能受单细胞RNA测序数据固有噪声和稀疏性的影响,且K近邻回归在小样本情况下存在挑战 | 开发一种可扩展的计算方法,用于从单细胞分辨率数据中推断基因调控网络,以更精细地理解基因表达调控机制 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达谱 | 生物信息学,单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 主成分分析 (PCA), K近邻回归 (KNN regression) | 基因表达数据 (单细胞RNA测序数据) | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-28 |
Identifying prognosis-associated spatial patterns by integrating bulk RNA-seq and spatial transcriptomic data
2026-Mar-26, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3677899
PMID:41886327
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研究论文 | 本研究提出了一种名为stSurvTrans的深度迁移学习框架,用于识别与预后相关的空间模式,通过整合bulk RNA-seq和空间转录组数据 | 利用条件变分自编码器(CVAE)整合bulk RNA-seq和空间转录组数据,并采用Weibull模块将临床生存信息从bulk样本迁移到空间数据中 | NA | 将空间特征与生存信息关联起来,以识别与预后相关的空间模式 | 肝细胞癌(HCC)的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | 条件变分自编码器(CVAE), Weibull模块 | bulk RNA-seq数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-28 |
Smad7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension via the TGF-β1-Smad2/3 Pathway
2026-Mar-26, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002832
PMID:41886369
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研究论文 | 本研究探讨了Smad7下调通过TGF-β1-Smad2/3通路促进肺动脉高压中铁死亡的作用机制 | 整合单细胞转录组测序、蛋白质组学和孟德尔随机化分析,首次揭示SMAD7作为PAH中铁死亡的负调控因子 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,人体样本验证不足 | 探究铁死亡在肺动脉高压中的致病机制及其对肺血管细胞景观的影响 | 肺动脉内皮细胞、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、MCT诱导的PAH大鼠模型、缺氧诱导的PAEC模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | MCT诱导的PAH大鼠模型和缺氧诱导的PAEC模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-28 |
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar-26, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014101
PMID:41886524
|
研究论文 | 本文开发了一种基于U-Net的深度学习算法BLUE,用于从批量RNA-seq样本中解卷积细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 | 利用U-Net强大的特征提取和表示学习能力,首次实现了对细胞类型特异性基因表达谱的准确预测,性能显著优于现有解卷积算法 | 算法依赖于单细胞RNA-seq数据作为参考,可能受限于参考数据的质量和覆盖范围 | 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq的优势,利用现有批量RNA-seq数据集进行细胞类型特异性分析 | 批量RNA-seq样本中的细胞类型组成和基因表达 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | U-Net | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-28 |
Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-Mar-26, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deag051
PMID:41886635
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,探究了人类成年卵巢中卵泡闭锁过程中的关键信号通路(WNT、TGFβ/BMP、NOTCH、HH)的变化 | 首次在人类成年卵巢中应用空间转录组学技术,系统性地研究了卵泡闭锁过程中关键信号通路的时空表达变化 | 研究使用的卵巢组织来自跨性别男性捐赠者,无法排除睾酮治疗对卵泡动态的影响 | 探究人类成年卵巢卵泡闭锁过程中关键信号通路(WNT、TGFβ/BMP、NOTCH、HH)的参与情况 | 人类成年卵巢组织中的健康及处于不同闭锁阶段的小窦状卵泡(直径0.5-4 mm) | 空间转录组学 | 卵巢相关疾病/生殖衰老 | 空间转录组学,单分子荧光原位杂交,苏木精-伊红染色 | NA | 空间转录组数据,组织切片图像 | 6名捐赠者的卵巢组织,共16个区域,包含21个小窦状卵泡 | Resolve BioSciences | 空间转录组学 | Molecular Cartography平台 | Resolve BioSciences Molecular Cartography平台,基于冷冻切片的单分子荧光原位杂交多重检测 |
| 20 | 2026-03-28 |
Enhancing Proteasome Activity in T Cells Alleviates Exhaustion and Improves Antitumor Immunity
2026-Mar-26, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1246
PMID:41886620
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研究论文 | 本研究通过增强T细胞中的蛋白酶体活性,延缓了T细胞耗竭,改善了其功能,并转化为更强的抗肿瘤免疫和肿瘤控制 | 首次提出并验证了蛋白酶体活性是T细胞耗竭的关键调节因素,并证明通过药理学和遗传学方法增强蛋白酶体活性可以改善T细胞功能和抗肿瘤免疫 | 研究主要在体外模型和单细胞转录组学分析中进行,体内验证和临床转化效果需要进一步研究 | 探究T细胞耗竭的机制并寻找改善抗肿瘤免疫的新策略 | 耗竭T细胞 (TEX) 和非耗竭T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 涵盖16种肿瘤类型的单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |