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当前共找到 44270 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-19 |
RNA binding proteins PCBP1 and PCBP2 regulate pancreatic β cell translation
2025-08, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102175
PMID:40451383
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研究论文 | 研究RNA结合蛋白PCBP1和PCBP2在胰腺β细胞翻译调控及血糖稳态中的作用 | 首次揭示PCBP1与PCBP2协同调控β细胞翻译起始因子和核糖体mRNA的稳定与翻译，共同维持β细胞功能和血糖稳态 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类β细胞中验证；对PCBP1/2直接靶标mRNA的全景图及分子机制细节仍需进一步阐明 | 探究PCBP2及其同源异构体PCBP1在β细胞稳态和翻译调控中的关系与作用 | 小鼠胰腺β细胞 | 分子生物学、糖尿病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blot、RNA免疫沉淀、CRISPR-Cas9、shRNA、嘌呤霉素标记翻译监测 | NA | 基因表达数据、RNA-蛋白质互作数据、图像（western blot） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-10-19 |
Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells
2025-07-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141102
PMID:40710355
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析Graves病（GD）患者外周血和甲状腺内B细胞在甲状腺自身抗原肽刺激下的反应 | 首次结合单细胞RNA测序与甲状腺自身抗原（TSHR、Tg、TPO）重叠肽刺激，对比分析GD患者外周血与甲状腺内B细胞的转录组和BCR特征 | 摘要中部分基因名称缺失，样本量未明确说明，仅涉及接受甲状腺切除术的GD患者，可能存在选择偏倚 | 探究Graves病中B细胞对甲状腺自身抗原（TSHR、Tg、TPO）的免疫反应差异及其在发病机制中的作用 | 接受甲状腺切除术的Graves病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和甲状腺内血液单核细胞中的B细胞 | 单细胞组学/免疫学 | Graves病（自身免疫性甲状腺疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-10-19 |
Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index
2025-07, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161
PMID:40348015
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析人脂肪细胞去分化后的细胞亚群，发现一个代谢活跃的亚群，其丰度与体重指数呈负相关 | 首次在去分化脂肪细胞中鉴定出具有肌肉细胞基因特征的独特亚群C7，该亚群能量消耗增加，且其比例与BMI呈负相关，并在大规模人皮下脂肪组织队列中验证了相关基因与临床代谢参数的相关性 | 样本量有限（11名供体），且主要基于体外去分化细胞模型，需要进一步体内验证和更大规模研究 | 探究人脂肪细胞中是否存在具有独特基因表达和功能特征的亚群，并分析其与代谢疾病的关系 | 人脂肪细胞去分化细胞（DFAT）及人皮下脂肪组织 | 单细胞转录组学 | 肥胖、代谢疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据 | 11名供体用于单细胞分析，1759名供体用于皮下脂肪组织bulk分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序（具体型号未提及），bulk RNA测序（平台未明确） |
| 4 | 2026-10-19 |
A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma
2025-05, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01432-0
PMID:39690246
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研究论文 | 该文章通过蛋白质组学和单细胞RNA测序分析晚期肝细胞癌组织，揭示了GMPS通过STT3A依赖的PD-L1糖基化修饰驱动肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现GMPS作为连接Sec61通道复合物和STT3A的额外模块，促进新生肽的转位和修饰，从而增加PD-L1表达并诱导免疫逃逸；提出靶向GMPS的抑制剂angustmycin A可抑制PD-L1表达和肿瘤生长并增强抗CTLA-4免疫治疗敏感性 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索肝细胞癌快速生长和转移的调控机制，特别是免疫逃逸的分子机制 | 晚期肝细胞癌组织及CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-10-19 |
Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement
2025-May, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-025-01581-3
PMID:39893595
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析大鼠正畸牙齿移动过程中牙周膜细胞群和基因表达变化，探讨Mkx在机械转导中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示正畸牙齿移动过程中Mkx表达细胞群的动态变化及其与肌腱基因表达的关系 | 研究主要基于大鼠模型，人类牙周膜细胞实验仅验证了MKX过表达对COL1A1和DECORIN的影响，样本量有限 | 阐明Mkx在正畸牙齿移动过程中对牙周膜机械转导的调控作用及细胞群变化 | 野生型大鼠牙周膜组织及人类牙周膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 文本 | 大鼠牙周膜组织在0天、1周、2周三个时间点进行单细胞RNA测序，人类牙周膜细胞用于RT-qPCR验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-10-19 |
Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants
2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110460
PMID:39993695
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案例研究 | 本文利用数字空间表达谱分析技术，对一名肾移植患者治疗前后的四次活检样本进行转录本定位分析，以研究以肾小球为中心的抗体介导排斥反应 | 采用数字空间表达谱技术揭示了急性抗体介导排斥反应中肾小球内先天免疫细胞（如NK细胞和巨噬细胞）的分子特征及HLA II类抗原转录本上调，同时发现足细胞特征基因转录本在排斥反应期间下降，且IVIg治疗虽缓解组织学肾小球炎但未恢复足细胞转录本表达 | 本研究为单病例的案例研究，样本量小（仅一名患者的4次活检），结果需在更多患者中验证 | 研究以肾小球为中心的急性抗体介导排斥反应的空间分子特征及治疗后的转录本变化 | 一名接受肾移植并发生急性抗体介导排斥反应（以肾小球强C4d染色为特征）的患者 | 空间转录组学, 肾脏病理学 | 肾移植抗体介导排斥反应 | 数字空间表达谱分析（Digital Spatial Profiling） | NA | 空间转录组数据 | 4例活检样本（来自同一患者治疗前、治疗期间及治疗后） | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | Digital Spatial Profiling |
| 7 | 2026-10-19 |
Inactivation of GSK3β by Ser389 phosphorylation prevents thymocyte necroptosis and impacts Tcr repertoire diversity
2025-05, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01441-z
PMID:39779909
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析小鼠双阴性（DN）3和DN4胸腺细胞，揭示了GSK3β Ser389磷酸化失活对胸腺细胞坏死性凋亡和TCR库多样性的影响 | 发现了除已知G1检查点外的G2M细胞周期检查点，在Tcrb和Tcra重组过程中；揭示了GSK3β通过坏死性凋亡而非凋亡促进DN3/DN4胸腺细胞死亡；GSK3β失活对胸腺细胞存活和TCR库多样性至关重要 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类胸腺细胞中验证；未详细探讨其他可能参与胸腺细胞存活的信号通路 | 探究V(D)J重组过程中胸腺细胞存活的机制，特别是GSK3β在其中的作用 | 小鼠双阴性（DN）3和DN4胸腺细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 分选的小鼠DN3和DN4胸腺细胞（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-10-19 |
CellPie: a scalable spatial transcriptomics factor discovery method via joint non-negative matrix factorization
2025-03-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf251
PMID:40167331
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研究论文 | 本文提出了一种基于联合非负矩阵分解的空间转录组因子发现方法CellPie，可同时分析空间RNA转录本和组织学图像特征 | 结合空间RNA转录本与组织学图像特征进行联合非负矩阵分解，并采用加速层次最小二乘法显著降低计算时间，适用于高维空间转录组数据集 | 仅在三种人类癌症类型上进行了评估，未涉及其他疾病或组织类型，且未与其他多模态因子发现方法进行全面比较 | 开发一种快速、无监督的因子发现方法，用于整合空间转录组数据与组织学图像特征，以揭示组织中的潜在因子 | 三种不同人类癌症类型的空间转录组数据集，包括高分辨率的Visium HD数据集 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，组织学图像分析 | 联合非负矩阵分解，加速层次最小二乘法 | 空间RNA转录本数据，组织学图像 | 三种人类癌症类型的数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | Visium HD高分辨率空间转录组平台 |
| 9 | 2026-10-19 |
ScRNA-seq revealed disruption in CD8+ NKG2A+ natural killer T cells in patients after liver transplantation and immunosuppressive therapy
2023-09, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.990
PMID:37773707
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序揭示了肝移植患者接受免疫抑制治疗后CD8+ NKG2A+自然杀伤T细胞的动态变化 | 首次在单细胞水平上分析了肝移植后不同时间点接受免疫抑制治疗患者的外周血免疫细胞组成和基因表达，发现特异性表达NKG2A的CD8+ NKT细胞可能在肝移植免疫耐受中起重要作用 | 样本量较小（仅5例外周血样本），未进行功能验证实验，需要更大规模的队列研究来验证发现 | 探究肝移植后免疫抑制治疗期间免疫耐受过程中细胞免疫系统组成的动态变化 | 外周血单个核细胞（来自1名正常个体和4名接受肝移植及免疫抑制治疗2个月、1年、3年和7年的患者） | 单细胞转录组学 | 肝移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例外周血样本，共获得17,462个外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-10-18 |
Estradiol Augments Tumor-Induced Neutrophil Production to Promote Tumor Cell Actions in Lymphangioleiomyomatosis Models
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad061
PMID:37042477
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研究论文 | 该文章探讨了雌二醇通过促进中性粒细胞生成来促进淋巴管肌瘤病（LAM）肿瘤生长的机制 | 揭示了雌二醇和肿瘤因子通过正反馈环路诱导中性粒细胞扩增，进而促进TSC2缺失肿瘤生长的机制，并建立了新型TSC2缺失小鼠子宫肌层细胞系 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类LAM患者的单细胞RNA测序数据仅用于验证，未进行临床干预实验 | 探究雌二醇在LAM肿瘤进展中的作用机制，特别是其与中性粒细胞生成的关联 | LAM小鼠模型、TSC2缺失细胞系、LAM患者单细胞RNA测序数据 | 肿瘤生物学、免疫学 | 淋巴管肌瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（单细胞RNA测序数据）、实验数据 | 未明确说明（包括小鼠模型和患者样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-10-17 |
Leveraging Single-Cell RNA Sequencing to Characterize Murine Ewing Sarcoma Xenografts
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5587-0_29
PMID:42879034
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研究方法论文 | 本文描述了一种从尤文肉瘤肿瘤中分离、冷冻保存和处理单细胞悬液的稳健且可重复的实验方案，并配套了生物信息学分析流程 | 采用冷活性地衣芽孢杆菌蛋白酶消化策略结合温和机械解离，在严格冷链条件下处理组织，减少细胞应激和转录扰动；计算流程整合了ambient RNA校正、doublet检测、SCTransform标准化以及AUCell模块评分与多参考Azimuth标签转移 | 该方案主要针对小鼠尤文肉瘤异种移植模型进行优化，尚未在人类原发肿瘤或其他肉瘤亚型中广泛验证 | 建立标准化的尤文肉瘤单细胞RNA测序组织处理和计算分析工作流程 | 小鼠尤文肉瘤异种移植肿瘤组织 | 单细胞组学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-10-17 |
Spatial Transcriptomics Analysis of Ewing Sarcoma
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5587-0_30
PMID:42879035
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综述 | 本文介绍了尤文肉瘤空间转录组学分析中组织选择、样本制备、panel设计及分析流程的系列教程 | 为尤文肉瘤空间转录组学研究提供系统性的操作指南，涵盖从组织选择到数据分析的全流程 | 作为教程章节，可能缺乏原始实验数据验证，且未涉及具体实验结果的深入讨论 | 指导尤文肉瘤空间转录组学实验的设计与数据分析 | 尤文肉瘤肿瘤组织及其肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 尤文肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-10-17 |
FOXG1 spatiotemporally orchestrates subtype fate specification and patch/matrix identity of striatal spiny projection neurons
2026-Oct-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2603031123
PMID:42879492
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能缺失实验，揭示了转录因子FOXG1在纹状体棘突投射神经元亚型命运特化及 patch/matrix 区域身份决定中的时空调控作用 | 首次发现eSPNs与iSPNs在发育上更为相似，并证明FOXG1在侧神经节隆起腹侧区域促进dSPN和iSPN命运而抑制eSPN命运；同时揭示FOXG1通过直接调控细胞迁移和黏附相关分子控制SPN迁移，从而影响patch/matrix身份 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 阐明纹状体棘突投射神经元亚型特化（尤其是eSPNs）以及patch/matrix互补模式形成的细胞和分子机制 | 纹状体棘突投射神经元（SPNs），包括dSPNs、iSPNs和eSPNs | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-10-17 |
Distinguishing the endotypes of Chronic rhinosinusitis: the emerging roles of macrophages
2026-Oct-16, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2026.2747885
PMID:42878110
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在慢性鼻窦炎不同内型中的异质性及其作用 | 系统总结了单细胞转录组分析鉴定的与慢性鼻窦炎内型相关的巨噬细胞亚群，并提出了基于巨噬细胞的生物标志物用于内型分型和靶向治疗的新视角 | 未明确说明，但作为综述可能缺乏原始实验数据验证 | 剖析巨噬细胞在慢性鼻窦炎不同内型中的异质性，并探讨其作为生物标志物和靶向治疗靶点的潜力 | 慢性鼻窦炎患者及相关的巨噬细胞 | 单细胞转录组学、免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-10-17 |
Biased signaling of endothelial GPCRs as a therapeutic frontier in atherosclerosis
2026-Oct-15, Journal of receptor and signal transduction research
DOI:10.1080/10799893.2026.2748609
PMID:42878053
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综述 | 本文综述了内皮GPCR偏向性信号作为动脉粥样硬化治疗前沿的研究进展，探讨了主要内皮GPCR家族的功能选择性机制及新兴转化工具 | 提出将内皮靶向的偏向性GPCR信号工程化作为精准、通路特异性的策略来阻止斑块进展和稳定易损病变，并强调高分辨率结构生物学、单细胞转录组学、空间组学和动态生物工程模型作为新兴转化工具指导未来药物发现 | 未涉及具体临床试验数据或药物开发验证，主要基于机制综述和理论探讨 | 探讨内皮GPCR偏向性信号在动脉粥样硬化治疗中的应用潜力，分析功能选择性机制并展望未来精准心血管药物发现方向 | 内皮GPCR家族（包括血管紧张素II受体、1-磷酸鞘氨醇受体、非典型趋化因子受体和β-肾上腺素能受体）及动脉粥样硬化 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-10-17 |
Multimodal assessment of exceptional responders refines subtyping-directed precision treatment in HR+/HER2- breast cancer
2026-Oct-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202305
PMID:42878074
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研究论文 | 本研究整合了FASCINATE-N试验中230例HR+/HER2-乳腺癌患者的多组学、数字病理和临床数据，聚焦于异常应答者，探索优化亚型导向精准治疗的策略 | 首次通过整合转录组学、基因组学、数字病理和空间转录组学进行多模态评估，针对HR+/HER2-乳腺癌四种分子亚型中的异常应答者，揭示了神经周围侵犯、肿瘤-基质-免疫界面空间结构、DNA修复基因突变和淋巴管浸润等与不同治疗疗效的关联，提出了各亚型精准治疗优化的新方向 | 研究基于FASCINATE-N概念验证试验的230例样本，样本量有限，异常应答者亚组分析可能受限于统计效能，且发现需要在更大规模的前瞻性临床试验中进一步验证 | 通过多模态评估异常应答者，优化HR+/HER2-乳腺癌亚型导向的精准治疗策略 | HR+/HER2-乳腺癌患者，来自FASCINATE-N试验，共230例 | 数字病理 | 乳腺癌 | 转录组学，基因组学，数字病理，空间转录组学 | NA | 图像，文本，基因组数据，转录组数据 | 230例HR+/HER2-乳腺癌患者 | NA | 空间转录组学，转录组学，基因组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-10-17 |
The petal identity gene PhDEF has a major binding and regulatory action in the epidermis
2026-Oct-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.113154
PMID:42878643
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀技术，研究矮牵牛花花瓣身份基因PHDEF在表皮和叶肉细胞层中的不同调控作用 | 首次揭示了花同源异型基因PHDEF在不同细胞层（表皮和叶肉）中具有不同的靶基因调控作用，发现其在表皮中具有更主要的结合和调控功能，证明了细胞层身份确实影响同源异型身份的调控过程 | 研究仅限于矮牵牛花花瓣组织，未涉及其他花器官或其他植物物种，且未深入探讨PHDEF在不同细胞层中差异调控的分子机制 | 探究花同源异型基因PHDEF在花瓣不同细胞层中的晚期功能和细胞类型特异性调控作用 | 矮牵牛花花瓣组织的表皮和叶肉细胞层特异性突变体 | 机器学习, 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-10-17 |
Altered cholangiocyte subsets with neural pathway enrichment in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2026-Oct-15, Internal and emergency medicine
IF:3.2Q1
DOI:10.1007/s11739-026-04553-1
PMID:42879090
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研究论文 | 该研究整合单细胞测序和批量测序数据，利用hdWGCNA、细胞互作分析、机器学习、免疫浸润分析和孟德尔随机化等方法，揭示了MASLD中胆管细胞亚群改变及神经通路富集的特征 | 首次系统性地揭示了MASH患者中胆管细胞亚群的显著改变，特别是SEMA3通路表达升高的胆管细胞增加，并发现神经相关通路在胆管细胞中的富集及其与免疫细胞的复杂互作，同时通过孟德尔随机化鉴定PLEKHA5为MASLD的候选因果基因 | 本研究为假设生成性的生物信息学研究，缺乏实验验证，孟德尔随机化分析中部分关联仅为提示性（如SEL1L3 P=0.0413），需要进一步的体内外实验和更大规模的队列研究来验证胆管细胞相关机制在MASLD发病中的作用 | 探究胆管细胞在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中的作用，特别是胆管细胞亚群变化及神经通路在疾病发病机制中的潜在贡献 | MASLD/MASH患者的单细胞测序数据和批量测序数据集中的胆管细胞亚群 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化 | hdWGCNA, 机器学习模型（共7种） | 基因表达数据（单细胞和批量测序数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-10-17 |
Network pharmacology and single-cell sequencing analysis of gastrodin in anticancer effects against colorectal cancer by regulating key target genes and the tumor immune microenvironment
2026-Oct-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103076
PMID:42879954
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研究论文 | 本研究通过网络药理学和单细胞测序分析，探索天麻素通过调控关键靶基因和肿瘤免疫微环境发挥抗结直肠癌作用的机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、机器学习算法和分子对接等多种方法，系统揭示天麻素抗结直肠癌的关键靶基因NFE2L3及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内动物实验和临床样本验证 | 探索天麻素抗结直肠癌的潜在靶点和分子机制 | 结直肠癌相关基因、天麻素潜在靶点、结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、分子对接 | LASSO回归、支持向量机、随机森林、SHAP分析 | 基因表达数据、图像 | TCGA和GEO数据集的结直肠癌转录组数据以及单细胞RNA测序数据，具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-10-17 |
Emerging frontiers for AI in single-cell genomics
2026-Oct-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.09.014
PMID:42880218
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综述 | 该综述文章回顾了人工智能在单细胞基因组学中的嵌入模型和基础模型，涵盖scRNA-seq、scATAC-seq、单细胞多组学调控基因组学以及基于Perturb-seq的虚拟细胞模型，并讨论了当前局限与未来展望 | 系统性地梳理了从早期单细胞RNA嵌入模型到基础模型的发展脉络，并首次将单细胞表观遗传/多组学检测与Perturb-seq技术带来的AI建模新机遇进行整合论述，提出了利用大规模图谱数据资源和虚拟细胞模型的前瞻性视角 | 早期单细胞RNA嵌入模型和基础模型在实验生物学家中未获得广泛关注和应用；单细胞AI模型仍存在诸多当前局限性，文中对此进行了描述但未提出具体解决方案 | 综述单细胞基因组学中AI嵌入模型和基础模型的发展现状，探讨scRNA-seq和scATAC-seq的AI建模方法、单细胞多组学在调控基因组学中的机器学习应用以及从Perturb-seq学习虚拟细胞模型的AI策略 | 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据、单细胞多组学数据、Perturb-seq数据及相关AI模型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 单细胞多组学, Perturb-seq | 基础模型, 嵌入模型, 虚拟细胞模型 | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, single-cell multi-omics | NA | NA |