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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-12 |
scMINA: an interpretable workflow for paired scRNA-scATAC multiome integration and regulatory prioritization
2026-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag140
PMID:43011234
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研究论文 | 该文提出了scMINA,一个用于配对scRNA-seq和scATAC-seq多组学数据整合与可解释调控优先级分析的工作流 | 结合多模态整合、技术协变量校正和基于可解释人工智能的归因策略来优先排序与细胞状态异质性和疾病相关调控改变有关的候选基因和转录因子 | 仅在阿尔茨海默病脑细胞图谱数据上进行了应用验证,未在其他疾病或数据集上广泛评估 | 解决配对单细胞多组学数据分析中的模态特异性技术变异、整合复杂性和下游调控推断可解释性有限的问题 | 配对scRNA-seq和scATAC-seq单细胞多组学数据集,具体为西雅图阿尔茨海默病脑细胞图谱数据 | 单细胞多组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 可解释人工智能归因模型 | 单细胞转录组和表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-11-12 |
RNF216 Drives Hepatocellular Carcinoma Progression by Ubiquitin-Dependent Degradation of the Tumour Suppressor CYLD
2026-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70949
PMID:43012338
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序描绘肝细胞癌的泛素化异质性,并揭示E3泛素连接酶RNF216通过泛素化降解抑癌蛋白CYLD促进肝癌进展的机制 | 首次在单细胞水平上绘制肝细胞癌不同细胞类型的泛素化异质性图谱,并发现RNF216作为关键的泛素化相关预后基因,阐明其通过泛素依赖性降解CYLD进而激活β-catenin/EMT通路的新机制 | 单细胞样本量较小(10例肝细胞癌样本),机制验证主要在细胞系和异种移植模型中进行,缺乏更大规模的临床队列验证及RNF216靶向治疗的体内药效评估 | 探究肝细胞癌中不同细胞类型的泛素化异质性,并研究E3泛素连接酶RNF216在肝细胞癌进展中的功能及分子机制 | 肝细胞癌患者肿瘤样本及肝癌细胞系(Huh7、MHCC97H) | 数字病理学, 肿瘤生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, Western blotting, 免疫共沉淀, 泛素化实验, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | 10例肝细胞癌样本进行scRNA-seq,另使用公共数据集及内部队列进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-12 |
Spatial transcriptomics reveals organizational properties of the mouse spinal cord and alterations in neuropathic pain
2026-Nov-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2623177123
PMID:43008029
|
研究论文 | 该文利用空间转录组学对成年小鼠脊髓进行空间分辨单细胞转录组分析,揭示脊髓组织构造逻辑及神经病理性疼痛中的改变 | 首次在空间层面系统解析脊髓神经元亚型的层状分布、轴向水平和性别差异,并预测细胞间通讯模式及在神经病理性疼痛模型中的转录组状态改变 | 研究基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;预测的细胞间通讯需功能实验证实 | 解析脊髓的空间组织逻辑及神经病理性疼痛下的分子和细胞改变 | 成年小鼠脊髓 | 空间转录组学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学, 单细胞转录组测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-11-12 |
Distinct cell-type-specific gene expression programs associated with persistence versus clearance of arterivirus infection
2026-Nov-11, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02075-26
PMID:43012420
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较急性期和长期感染阶段猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染猪的血液免疫转录组和细胞组成,识别与持续性感染或病毒清除相关的细胞类型特异性基因表达程序 | 首次生成PRRSV持续性感染的单细胞RNA测序数据集;发现单核细胞是感染结局的主要细胞驱动因素,其差异主要由细胞类型特异性转录程序而非免疫细胞组成差异驱动;揭示免疫激活的时机和方式而非强度是决定感染结局的关键因素 | 病毒灭绝组(VE)样本量较小(n=2),可能影响统计效力;研究仅聚焦于血液单核细胞,未涵盖组织局部免疫微环境;猪模型与人类免疫系统的差异可能限制结论的外推 | 通过综合比较急性和长期感染阶段的血液免疫转录组和细胞组成,识别与持续性病毒感染相关的细胞标志物 | 感染猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的猪的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | PRRSV感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 14 DPI时持续性感染组5头、病毒灭绝组2头;84 DPI时持续性感染组10头 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-11-12 |
Connexin43 Links Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells to Peripheral Adiposity in Female Mice Under HFD
2026-Nov-11, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.70334
PMID:43012446
|
研究论文 | 该研究通过BMSC特异性Cx43敲除小鼠结合单细胞RNA测序,揭示Cx43通过调控BMSC亚群及TXNIP分泌影响高脂饮食诱导的外周脂肪积累,且在雌性小鼠中效应更显著 | 首次发现Cx43缺失可抵抗HFD诱导的肥胖并增加能量消耗且存在性别差异;鉴定出两个新的BMSC亚群(Prrx1+Ly6a+和Adipoq+Clec11a+)参与Cx43缺失抗HFD效应;揭示Cx43抑制通过降低血清TXNIP分泌减少脂肪生成,并提出骨-脂肪轴概念 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;性别差异机制未深入阐明;TXNIP作为下游因子的具体信号通路仍需进一步解析 | 探究连接蛋白43(Cx43)对骨髓间充质干细胞(BMSCs)在高脂饮食条件下调控外周脂肪组织的影响及其分子机制 | BMSC特异性Cx43敲除小鼠(Prrx1-Cre; Cx43flox/flox)及对照小鼠(Cx43flox/flox),分雌雄两组 | 单细胞组学、代谢生物学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除 | 小鼠模型、单细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据、表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-11-12 |
Competing endogenous RNA networks in insects: Methodologies, physiological functions, and implications for pest management
2026-Nov-11, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70390
PMID:43012632
|
综述 | 系统总结了昆虫竞争性内源RNA(ceRNA)网络的研究方法、生理功能及其在害虫治理中的应用潜力 | 全面整合了昆虫ceRNA网络从组分鉴定、靶标预测、网络组装到多层次实验验证的方法学体系,并首次系统阐述了ceRNA在昆虫发育、生殖、免疫和杀虫剂抗性中的调控作用及害虫治理应用前景 | 组学发现与功能验证之间存在差距,相互作用特异性不明确,时空和单细胞数据稀缺,分子事件到表型的链接碎片化 | 梳理昆虫ceRNA网络的研究方法学与生理功能,探讨其在绿色害虫治理中的分子靶标价值 | 昆虫的ceRNA网络(mRNA、microRNA、lncRNA和circRNA) | 非编码RNA调控与害虫治理 | NA | 全转录组测序、生物信息学分析、RT-qPCR、荧光原位杂交、双荧光素酶报告基因实验、RNA免疫沉淀 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-11-12 |
Perinatal nicotine exposure disrupts hematopoietic stem cell development and elevates influenza severity in adulthood
2026-Nov-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.103118
PMID:42880243
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研究论文 | 本文建立围产期尼古丁暴露(PNE)小鼠模型,发现其选择性破坏造血干细胞(HSC)及组织驻留免疫细胞的建立,且该缺陷持续至成年,导致成年后流感病毒感染加重 | 首次将PNE确立为发育性免疫适应不良模型,揭示PNE通过持久重编程HSC及其子代(而非循环免疫细胞)导致肺部组织驻留免疫细胞减少,并证明HSC是PNE诱导的呼吸道易感性的造血起源 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类队列中验证;未明确尼古丁暴露通过何种具体表观遗传机制持久重编程HSC;单细胞转录组分析未涵盖所有免疫细胞亚群及时间动态 | 探究围产期尼古丁暴露对造血干细胞发育及成年后呼吸道病毒感染易感性的长期影响 | 围产期尼古丁暴露小鼠模型及其子代,包括胚胎期、新生期及成年期小鼠的造血干细胞、肺组织驻留免疫细胞和循环免疫细胞 | 免疫学、发育生物学、单细胞转录组学 | 流感、呼吸道病毒感染、免疫适应不良 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、组织病理学、病毒挑战实验 | NA | 单细胞转录组数据、表型数据、病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-11-12 |
Characterization of structural variants in KOLF2.1J iPSCs and their potential impact on forebrain organoid differentiation
2026-Nov-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.103112
PMID:42849453
|
研究论文 | 该论文对KOLF2.1J iPSC系进行长读长测序和光学基因组图谱分析,鉴定结构变异,并通过单细胞RNA测序评估其对前脑类器官分化的影响 | 利用长读长测序和光学基因组图谱新发现37个结构变异,并首次发现已知结构变异与神经发育基因RYBP的重叠 | 仅分析了两个独立对照iPSC系,样本量有限,且未进行功能验证实验 | 表征KOLF2.1J iPSC中的结构变异并评估其对前脑类器官分化的潜在影响 | KOLF2.1J人诱导多能干细胞系及其衍生的前脑类器官,以及两个独立对照iPSC系 | 神经科学、基因组学、干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 长读长测序、光学基因组图谱、单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列、基因图谱、单细胞转录组数据 | KOLF2.1J和两个对照iPSC系,第90天前脑类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 9 | 2026-11-12 |
Ferroptosis-associated macrophages suggest a potential ACSL1-PGE2-stromal iron homeostasis-related axis in endometriosis
2026-Nov-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-13044-7
PMID:43007482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据表征子宫内膜异位症中与铁死亡相关的巨噬细胞异质性,并结合体外实验提出ACSL1-PGE2-基质铁稳态相关轴 | 首次在子宫内膜异位症中鉴定铁死亡相关巨噬细胞(FAMs)亚群,并提出连接ACSL1-PGE2信号、基质铁稳态与细胞外铁负载的巨噬细胞-基质相互作用轴 | 主要基于公共单细胞数据的再分析,体外实验验证范围有限,缺乏体内模型或临床样本的进一步验证 | 探究子宫内膜异位症中铁死亡相关巨噬细胞的异质性及其与局部铁稳态耦合的潜在机制 | 子宫内膜异位症患者的在位子宫内膜样本及无病对照者的子宫内膜样本,以及巨噬细胞和子宫内膜异位基质细胞的体外实验 | 数字病理学, 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外细胞实验 | NA | 文本(基因表达数据), 图像(NA) | 公共单细胞RNA测序数据(子宫内膜异位症患者与无病对照者的在位子宫内膜样本)及独立的批量RNA测序数据,具体样本数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-11-12 |
Mechanistic Study of the Role of Obesity and Muscle Strength Factors in Recurrent Patellar Dislocation Based on Multi-Omics Data
2026-Nov-10, Obesity surgery
IF:2.9Q1
DOI:10.1007/s11695-026-09025-1
PMID:43007609
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化结合基因组、转录组、蛋白质组和单细胞数据,探究肥胖和肌肉相关性状与复发性髌骨脱位的关系,并识别候选分子信号 | 首次将双向孟德尔随机化与SMR、蛋白质组学和单细胞测序数据整合,系统研究肥胖及肌肉相关性状与复发性髌骨脱位的因果关系,并优先识别出DBI作为候选分子因子 | DBI的生物学和治疗相关性需要进一步的功能和临床验证;已确立的解剖异常仍是复发性髌骨不稳的主要决定因素;研究主要基于遗传预测和关联分析,缺乏实验验证 | 探究肥胖相关和肌肉相关性状与复发性髌骨脱位之间的因果关系,并探索候选分子信号 | 复发性髌骨脱位及其与肥胖相关性状(出生体重、儿童BMI、体脂百分比)和肌肉相关性状(握力、步行速度、四肢瘦体重)的关系 | 机器学习 | 复发性髌骨脱位 | 孟德尔随机化, 基于汇总数据的孟德尔随机化, 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-11-12 |
Molecular imaging of the TGF-β activating integrin αvβ6 detects chronic lung allograft dysfunction
2026-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.204555
PMID:43007719
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,发现TGF-β激活整合素αvβ6在慢性肺移植物功能障碍(CLAD)中高表达,并开发了特异性PET放射性示踪剂[64Cu]Cu-DOTA-A20-K16R用于无创检测CLAD | 首次揭示了TGF-β激活整合素αvβ6在CLAD中的表达模式,并开发了新型αvβ6特异性PET放射性示踪剂[64Cu]Cu-DOTA-A20-K16R用于CLAD的分子成像检测 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究TGF-β激活整合素在肺移植中的表达模式,并评估αvβ6分子成像检测CLAD的潜力 | 小鼠CLAD模型组织和人CLAD切除肺组织 | 分子影像学 | 慢性肺移植物功能障碍 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, 正电子发射断层扫描(PET)分子成像, 放射自显影 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-11-12 |
Manganese Dioxide Nanozyme-Integrated Aligned Nanofibers Promote Diabetic Wound Repair through Growth Arrest-Specific Protein 6-Mediated Fibroblast-to-Macrophage Communication
2026-Nov-10, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c14229
PMID:43007787
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研究论文 | 该研究开发了一种集成二氧化锰纳米酶的定向电纺纳米纤维水凝胶膜,通过Gas6介导的成纤维细胞-巨噬细胞通讯促进糖尿病创面修复 | 将MnO2纳米酶与定向电纺纳米纤维水凝胶相结合,首次揭示了通过Gas6介导的成纤维细胞向巨噬细胞信号通讯来连接氧化还原调控与糖尿病创面修复的机制 | 仅在链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型中验证,缺乏大型动物实验和临床数据;Gas6信号通路的分子机制仍需进一步深入研究 | 开发一种生物启发的定向纳米纤维水凝胶膜来调控糖尿病创面微环境,促进创面修复 | 糖尿病慢性创面、成纤维细胞、巨噬细胞、内皮细胞 | 组织工程与再生医学 | 糖尿病 | 静电纺丝、单细胞RNA测序、计算配体-受体分析 | NA | 图像、文本(单细胞转录组数据) | 三种MnO2负载量配方(其中180 μg/mL为优化配方)、链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠创面模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-11-12 |
SigBridgeR: An R Toolkit for Standardized Identification and Benchmarking of Phenotype-Associated Cell Subpopulations in Single-Cell Transcriptomics
2026-Nov-10, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag100
PMID:43008316
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研究论文 | 本文提出了SigBridgeR,一个可扩展的R框架,集成了八种代表性表型相关细胞亚群识别算法,并在四种癌症的配对bulk RNA-seq和scRNA-seq数据上进行了系统基准测试 | 提供了一个统一的R框架和基于注册表的可扩展架构,集成八种算法,实现了标准化预处理、统一算法接口、系统基准测试和优化实现的整合 | 基准测试仅涉及四种癌症类型和八种算法,未涵盖所有现有方法或其他疾病类型;部分方法在可扩展性、参数敏感性或表型检测稳定性方面存在局限 | 标准化识别和基准测试单细胞转录组学中表型相关细胞亚群,公平比较不同算法并支持精准医学中改进的表型引导单细胞分析方法开发 | 四种癌症类型的配对bulk RNA-seq和scRNA-seq数据集,包括二元表型和生存表型 | 单细胞转录组学 | 肺癌, 前列腺癌, 心血管疾病, 老年疾病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | Scissor, scAB等八种表型相关细胞亚群识别算法 | 转录组数据 | 四种癌症类型的配对bulk RNA-seq和scRNA-seq数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-11-12 |
CD74 links MHC class II risk to tumor immune microenvironment remodeling across the Sjögren-to-lymphoma axis
2026-Nov-10, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103103
PMID:43008348
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研究论文 | 该文整合人类遗传学、单细胞转录组学和功能细胞生物学,解析干燥综合征向B细胞淋巴瘤转变过程中MHC II类风险通过CD74重塑肿瘤免疫微环境的机制 | 首次将双向孟德尔随机化与MHC排除敏感性分析、共定位及HLA精细定位相结合,并联合单细胞转录组学定位遗传风险,揭示MIF-CD74轴作为连接遗传易感性与B细胞存活的可操作微环境靶点 | 机制验证主要基于Raji细胞系和公共队列,缺乏组织层面和前瞻性验证,临床转化证据仍有限 | 阐明将干燥综合征相关癌前炎症微环境重塑为肿瘤支持性免疫微环境的遗传与细胞机制,并寻找可干预的介导因子 | 干燥综合征患者、边缘区/MALT淋巴瘤、弥漫大B细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤及慢性淋巴细胞白血病相关的唾液腺和脾脏边缘区淋巴瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 干燥综合征, 淋巴瘤, 肺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, HLA精细定位, 功能细胞生物学实验 | 孟德尔随机化模型, 单细胞转录组分析模型, 细胞系模型 | 遗传数据, 单细胞转录组数据, 文本 | 唾液腺和脾脏边缘区淋巴瘤单细胞RNA测序样本,另使用公共慢性淋巴细胞白血病队列,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-11-12 |
Association of exposure to the organophosphate flame retardant EHDPP with early pregnancy loss: An integrated case-control, population-based, and computational study
2026-Nov-10, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.121022
PMID:43008703
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研究论文 | 本研究综合靶向暴露组学、NHANES分析、网络毒理学、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,探讨有机磷阻燃剂EHDPP暴露与早期流产的关联及潜在机制 | 首次整合病例对照、人群研究和计算方法系统评估EHDPP暴露与早期流产的关联,并结合单细胞转录组学提出机制假说 | 孟德尔随机化结果来自多候选蛋白筛选,仅为假说生成性发现,需实验验证;部分关联在年轻女性中未达统计学显著 | 探究EHDPP暴露与早期妊娠丢失的关联及其潜在生物学机制 | 早期妊娠丢失病例与对照、NHANES人群样本中的女性 | 环境流行病学与毒理学 | 早期妊娠丢失 | 靶向暴露组学、NHANES数据分析、网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接 | 孟德尔随机化模型、网络毒理学模型、分子对接模型 | 血浆浓度数据、尿液生物标志物数据、基因表达数据、单细胞转录组数据 | 靶向暴露组学50例,NHANES 860例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-11-12 |
Lung development: from static snapshots to dynamic lineage trajectories
2026-Nov-10, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.11.004
PMID:43008852
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综述 | 该综述总结了肺发育的分子与生物力学驱动因素,并提出了整合谱系记录技术与多组学重建克隆系统发育的LungSCAPE概念框架。 | 提出LungSCAPE概念路线图,将新兴谱系记录技术与多组学整合以重建克隆系统发育,弥补传统终点映射和推断轨迹在时间与克隆分辨率上的不足。 | 作为综述和概念框架,LungSCAPE尚未在实验中得到验证,缺乏具体实施数据和实证结果。 | 综述肺发育机制并探讨如何利用谱系记录技术构建全面的肺发育细胞命运图谱以解决领域内长期存在的问题。 | 哺乳动物肺发育过程中的细胞谱系、祖细胞及其命运决定。 | 单细胞组学、发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系记录技术、多组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-11-12 |
A tumor-responsive p53-loaded nanovesicle system for senescence induction and immune microenvironment reprogramming
2026-Nov-10, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2026.127625
PMID:43008957
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研究论文 | 该文构建了一种肿瘤响应型载p53纳米囊泡系统,通过诱导衰老和重塑免疫微环境来治疗三阴性乳腺癌 | 利用基因工程改造大肠杆菌表达p53并制备外膜囊泡,再通过仿生矿化包覆磷酸钙外壳形成酸响应纳米囊泡,实现p53的肿瘤微环境触发释放,将系统级生物信息学与实验纳米医学相结合 | 摘要中未明确说明 | 恢复p53活性并利用完整的免疫响应通路,通过诱导细胞衰老和重塑肿瘤免疫微环境实现肿瘤清除 | 三阴性乳腺癌(TNBC)细胞及肿瘤模型 | 纳米医学、肿瘤免疫治疗 | 三阴性乳腺癌 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、基因工程改造、仿生矿化纳米递送 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-11-12 |
Collagen-PMMA scaffolds induce dermal remodeling and immune recruitment distinct from simple volar fibroblast therapy in human skin
2026-Nov-10, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.10.040
PMID:43008965
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研究论文 | 研究将掌部成纤维细胞疗法与胶原蛋白/PMMA支架联合应用于人体非掌部皮肤,评估其对皮肤重塑和免疫细胞招募的影响 | 首次在人体中比较掌部成纤维细胞疗法与胶原蛋白/PMMA支架联合使用的效果,并通过单细胞和空间转录组学区分成纤维细胞介导的皮肤身份改变与支架诱导的基质重塑及异物反应 | 样本量有限,仅涉及健康志愿者,未评估长期安全性及临床疗效,且胶原蛋白/PMMA支架可能引发炎症和纤维化/肌成纤维细胞相关成分 | 探究掌部成纤维细胞疗法联合胶原蛋白/PMMA支架是否能通过提供额外生态位增强非掌部皮肤的重塑效果 | 健康志愿者的非掌部皮肤 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 组织学, 光学相干断层扫描, 硬度计 | NA | 图像, 文本 | 健康志愿者接受注射的皮肤样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-11-12 |
Spatial transcriptomics tumor microenvironment determinants of tyrosine kinase inhibitor response in renal cell carcinoma: results from a phase 2 clinical trial
2026-Nov-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-03024-5
PMID:43009462
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研究论文 | 该研究利用全转录组数字空间表达谱分析肾细胞癌肿瘤微环境,以预测舒尼替尼(TKI)治疗应答 | 将全转录组数字空间表达谱(DSP)应用于TKI临床试验样本,揭示应答者与非应答者肿瘤微环境的空间差异,并结合机器学习模型进行预后和预测建模 | 基于DSP的机器学习模型在外部JAVELIN Renal 101队列中表现出治疗情境特异性,在avelumab联合axitinib队列中预测性能减弱 | 评估预测转移性透明细胞肾细胞癌患者对酪氨酸激酶抑制剂舒尼替尼临床应答的细胞区室特异性转录生物标志物 | 46例接受舒尼替尼治疗的转移性透明细胞肾细胞癌患者(2期临床试验NCT00715442) | 数字病理 | 肾细胞癌 | 全转录组数字空间表达谱(DSP) | 机器学习模型 | 空间转录组数据、图像 | 46例转移性ccRCC患者的肿瘤组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | 全转录组数字空间表达谱(DSP)分析 |
| 20 | 2026-11-12 |
Efficient count-based models improve power and robustness for large-scale single-cell eQTL mapping
2026-Nov-10, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02830-5
PMID:43009566
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研究论文 | 开发了基于计数模型的高效单细胞eQTL定位框架jaxQTL,并在模拟和真实数据中验证了其性能和优势 | 使用基于负二项分布的高效计数模型进行单细胞eQTL定位,相比线性模型有更高的统计功效和稳健性,且计算速度远快于单细胞泊松混合效应模型 | 虽然改进了GWAS与eQTL之间的关联,但并未完全填补缺失的关联 | 开发高效且稳健的单细胞eQTL定位方法,并应用于大规模单细胞RNA测序数据以揭示细胞类型特异性的遗传调控效应 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达和遗传变异 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项模型 | 文本 | OneK1K数据集(包含约100万个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |