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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-10-06
Astrocytes and Alcohol Throughout the Lifespan
2026-01-01, Biological psychiatry IF:9.6Q1
综述 本文综述了星形胶质细胞对酒精的反应及其在酒精使用障碍发展中的作用,涵盖单细胞RNA测序研究、星形胶质细胞异质性、反应性、细胞外基质重塑、突触传递调节以及胎儿酒精谱系障碍中的角色 首次系统综述了星形胶质细胞在酒精使用障碍中的新兴证据,特别强调了此前从未被综述过的酒精对星形胶质细胞调节突触传递影响的研究,以及胎儿酒精谱系障碍中星形胶质细胞的作用 知识空白仍然存在,亟需识别对酒精暴露敏感的星形胶质细胞亚群和分子,目前缺乏可作为治疗干预靶点的明确分子靶标 评估现有临床前文献中支持星形胶质细胞参与酒精暴露效应的证据,综述星形胶质细胞对酒精的反应及其在酒精使用障碍发展中的贡献 星形胶质细胞、酒精暴露、酒精使用障碍、胎儿酒精谱系障碍 神经科学 酒精使用障碍、胎儿酒精谱系障碍 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-10-06
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过多组学分析揭示了胰腺导管腺癌中导管周围成纤维细胞密度通过CD44依赖的基质检查点决定淋巴细胞排斥的空间机制 首次建立以癌症相关成纤维细胞分层的导管空间架构作为PDAC免疫排斥的基本决定因素,发现胶原-CD44信号轴作为锚定免疫细胞的粘附轴,并提出可靶向的基质检查点概念 研究主要基于治疗初治患者样本的相关性分析,CD44阻断的功能验证仅限于纤维化球体模型,缺乏体内动物模型和临床干预验证 探究胰腺导管腺癌中纤维化对基质-导管架构和免疫细胞定位的影响,确定免疫排斥的空间决定因素及可靶向的基质检查点 胰腺导管腺癌患者的恶性导管上皮区域及肿瘤微环境中的免疫细胞和癌症相关成纤维细胞 数字病理学 胰腺癌 成像质谱流式、多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 配体-受体推断分析、纤维化球体模型 图像、文本 来自三个独立队列的治疗初治患者样本 NA 成像质谱流式、多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-10-06
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems from multiple cancer types reveals convergent and divergent mechanisms of bone colonization
2025-07-09, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 该研究通过对来自八种癌症类型的42个骨转移样本进行单细胞RNA测序,揭示了骨转移生态系统的三种不同原型及其趋同与趋异机制 首次对多种癌症类型的骨转移进行大规模单细胞RNA测序,发现了三种不同的生态系统原型,并揭示了骨转移与原发组织之间仅有适度相关性,即同一癌症类型的骨转移常落入不同原型,而不同癌症类型的骨转移有时趋同于同一原型 摘要中未明确提及研究局限性 探究骨转移的组织学和分子特征多样性,揭示骨定植的趋同与趋异机制 来自八种癌症类型的42个骨转移样本以及来自10种以上癌症类型的158个骨转移样本的bulk RNA测序/微阵列数据 单细胞转录组学 骨转移(多种癌症类型) 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列分析, 免疫染色 NA 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据, 微阵列数据, 图像 42个骨转移样本(单细胞RNA测序)和158个骨转移样本(bulk RNA测序/微阵列数据) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
4 2026-10-06
SpaLinker identifies phenotype-associated spatial tumor microenvironment features by integrating bulk and spatial sequencing data
2025-07-09, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一个名为SpaLinker的创新整合框架,通过整合批量RNA测序数据和空间转录组数据,在分子、细胞和组织结构水平上识别与表型相关的空间肿瘤微环境特征 提出了SpaLinker整合框架,利用表型驱动的计算框架,通过整合积累的批量RNA测序数据来评估空间定义特征的预后意义,解决了空间测序样本临床注释稀缺的问题 摘要中未明确提及研究的具体局限性 开发一个泛癌分析平台,从头识别与表型相关的空间肿瘤微环境特征,增强空间测序技术的临床实用性 多种肿瘤的空间转录组数据集 空间转录组学 泛癌 空间转录组学,批量RNA测序 NA 空间转录组数据,批量RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
5 2026-10-06
Single-cell meta-analysis of T cells reveals clonal dynamics of response to checkpoint immunotherapy
2025-05-14, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 该研究通过对6种癌症类型、460个样本中767,606个T细胞进行配对的单细胞RNA测序和T细胞受体测序的meta分析,揭示了T细胞克隆动态与免疫检查点抑制剂治疗反应之间的关系 首次大规模跨6种癌症类型的单细胞RNA测序/T细胞受体测序配对分析,基于扩增的CD8克隆建立了可区分应答者与非应答者的稳健反应特征,发现了持续性克隆的转录变化、新发克隆的拟时序状态变化以及与临床结局相关的肿瘤-血液共享克隆 摘要中未明确提及研究局限性 表征T细胞克隆并探究其与免疫检查点抑制剂治疗后临床结局的关联 6种癌症类型中接受免疫检查点抑制剂治疗的患者的T细胞 数字病理学, 机器学习 肺癌, 多种癌症类型 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, 文本 767,606个T细胞,来自460个样本,涵盖6种癌症类型 NA 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA NA
6 2026-10-06
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2025-03, Pediatric research IF:3.1Q1
综述 本篇综述总结了新生儿出血后脑积水(PHH)的神经炎症通路及新兴治疗靶点的最新分子研究进展 从分子和细胞机制(包括神经炎症通路、免疫介质和调控基因)角度系统阐述PHH的病理生理,并探讨全基因组/外显子测序、蛋白质组学、表观遗传学和单细胞转录组学等先进技术在识别关键分子靶点及基因和干细胞治疗中的应用潜力 新兴疗法在新生儿群体中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未解决,需要进一步研究验证这些方法、提高安全性并改善患儿预后 概述PHH病理生理的最新分子见解,并评估针对其潜在机制的新兴治疗方法 新生儿出血后脑积水(PHH)患者,尤其是早产儿脑室内出血(IVH)后并发PHH的群体 数字病理学 新生儿出血后脑积水 全基因组/外显子测序,蛋白质组学,表观遗传学,单细胞转录组学 NA 文本 NA NA NA NA NA
7 2026-10-06
scRNA + BCR-seq identifies proportions and characteristics of dual BCR B cells in the peritoneal cavity of mice and peripheral blood of healthy human donors across different ages
2024-Dec-28, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 利用单细胞RNA与BCR联合测序技术,分析了小鼠腹腔和健康人外周血中双BCR B细胞的比例和特征,并探讨其与年龄的关系。 首次在衰老过程中系统研究双BCR B细胞,并发现老年小鼠中双BCR B细胞增加,且主要来源于B1细胞,同时在人类外周血中验证了年龄相关变化。 样本量有限,仅涉及小鼠腹腔和健康人外周血,未深入探究双BCR B细胞的功能机制。 探究双受体B细胞在不同年龄的小鼠腹腔和健康人外周血中的存在情况以及年龄相关差异。 小鼠腹腔B细胞和健康人类志愿者外周血B细胞。 免疫学 NA scRNA-seq, scBCR-seq NA 单细胞转录组和BCR序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR-seq NA NA
8 2026-10-06
The vascular phenotype of BPD: new basic science insights-new precision medicine approaches
2024-10, Pediatric research IF:3.1Q1
综述 本文综述了支气管肺发育不良(BPD)相关肺高压的血管表型,重点探讨了单细胞RNA测序揭示的内皮祖细胞耗竭、miRNA信号异常以及基于细胞外囊泡和miRNA的治疗策略 整合了胎盘生物学和单细胞水平肺发育研究的新见解,提出BPD的血管表型概念,并强调基于细胞外囊泡和miRNA的精准医学治疗策略 对 disrupted pathways、干预时机和递送方式仍需进一步研究 探讨BPD相关肺高压的血管表型及其精准医学治疗策略 BPD和BPD相关肺高压患者,以及相关内皮祖细胞和细胞外囊泡 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-10-06
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 该研究构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据,评估了多种细胞类型去卷积方法在FFPE乳腺组织中的应用,并开发了SCdeconR R包 构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据,系统评估了去卷积方法在FFPE样本中的表现,发现Scaden方法对FFPE伪影具有鲁棒性,并开发了SCdeconR R包用于去卷积评估和下游分析 研究仅针对乳腺组织,去卷积方法在其他组织类型的适用性未知 优化FFPE乳腺组织的细胞类型去卷积策略,以解决bulk RNA-seq中细胞比例变异对生物标志物识别的影响 FFPE乳腺组织样本,包括良性乳腺疾病队列 数字病理学 良性乳腺疾病 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 数字病理学 Scaden(深度学习) 基因表达数据、图像 62个样本 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
10 2026-10-06
Single-cell transcriptome reveals the heterogeneity of malignant ductal cells and the prognostic value of REG4 and SPINK1 in primary pancreatic ductal adenocarcinoma
2024, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 该研究通过对16例原发性胰腺导管腺癌和3例癌旁组织进行单细胞RNA测序分析,揭示了恶性导管细胞的异质性,并鉴定了REG4和SPINK1作为胰腺导管腺癌的预后标志物 全面描绘了胰腺导管腺癌中恶性导管细胞的异质性,将恶性细胞进一步分为五个具有特定免疫和代谢特征的亚群,并通过伪时间轨迹分析揭示了肿瘤进展过程中致癌通路的差异表达,同时发现REG4和SPINK1可作为胰腺导管腺癌的潜在治疗靶点 摘要中未明确提及研究局限性 全面描绘胰腺导管腺癌的异质性并鉴定预后靶点 16例原发性胰腺导管腺癌组织和3例癌旁组织 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 16例原发性胰腺导管腺癌组织和3例癌旁组织,共32,480个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-10-06
Multiomics Analysis Reveals Cuproptosis-Related Signature for Evaluating Prognosis and Immunotherapy Efficacy in Colorectal Cancer
2023-Jan-06, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 通过多组学分析揭示结直肠癌中与铜死亡相关的分子亚型和预后模型,用于评估预后和免疫治疗疗效 构建了包含五个基因的铜死亡相关预后模型(CPS评分),发现CPS评分与肿瘤突变负荷、MSI-H比例、免疫检查点阻断及HLA基因表达正相关,可预测免疫治疗反应 未提及 探究铜死亡在结直肠癌肿瘤微环境重塑和抗肿瘤治疗中的作用,并构建预后评估模型 结直肠癌患者 多组学分析 结直肠癌 单细胞测序 Cox比例风险模型 基因表达数据、单细胞测序数据 未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-10-06
A single-cell transcriptomic atlas characterizes cell types and their molecular features in yak ovarian cortex
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术构建了牦牛卵巢皮质的细胞图谱,揭示了各种细胞类型的分子特征及其细胞间通讯网络 首次构建了牦牛卵巢皮质的单细胞转录组图谱,鉴定了8种细胞类型及其特征基因,发现了4种卵母细胞亚型,并通过免疫染色验证了FST和TOP2A作为卵母细胞标记基因 摘要中未明确提及研究局限性 构建牦牛卵巢皮质的细胞图谱,阐明各种细胞类型的分子特征,为牦牛雌性生殖生物学提供细胞分子层面的见解 牦牛卵巢皮质 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-10-05
Patient-derived surgical samples reveal the cellular and molecular signatures of glioblastoma infiltration in distinct radiological zones
2026-Nov, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
研究论文 通过收集45名胶质母细胞瘤患者的161份活检样本,结合MRI分类和转录组分析,揭示了不同影像学区域肿瘤浸润的细胞和分子特征及其临床意义 首次系统性地对胶质母细胞瘤不同影像学区域(增强肿瘤、非增强肿瘤、血管源性水肿和影像学正常组织)进行前瞻性活检采样,并结合组织学和转录组学分析,发现MRI对水肿区域肿瘤浸润的低估现象,以及外周细胞密度对完全切除后早期复发的预测价值 样本量相对有限(45名患者),研究未明确说明转录组分析的具体技术平台,且未提及是否进行了单细胞水平的验证 定义胶质母细胞瘤周边的细胞景观及其临床相关性,为手术和治疗决策提供依据 45名胶质母细胞瘤患者的161份活检样本,样本按MRI分类为增强肿瘤、非增强肿瘤、血管源性水肿或影像学正常组织 数字病理学 脑肿瘤 免疫组织化学(MIB1染色)、转录组分析、单细胞RNA测序数据分析 NA 图像、文本 45名胶质母细胞瘤患者的161份活检样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
14 2026-10-05
Integrated transcriptomic and epigenomic profiling reveals conserved molecular subtypes across systemic autoimmune diseases
2026-Oct, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 该研究通过对262例初治中国汉族系统性自身免疫疾病患者进行转录组和表观基因组联合分析,揭示了跨越类风湿关节炎、系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征的两种保守分子亚型 首次在类风湿关节炎、系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征三种系统性自身免疫疾病中定义了保守的分子亚型(巨核细胞富集型和B细胞富集型),并整合转录组、染色质可及性、超级增强子及单细胞转录组多组学数据揭示了亚型特异的调控机制 样本仅限中国汉族人群,需要进一步的多中心验证,分子亚型背后的表观遗传机制尚待深入研究 定义跨越系统性自身免疫疾病的保守分子亚型,并阐明其转录和表观遗传基础 262例初治中国汉族系统性自身免疫疾病患者(类风湿关节炎109例、系统性红斑狼疮69例、原发性干燥综合征84例),以女性为主(83.2%) 机器学习 自身免疫疾病 bulk RNA测序, ATAC-seq, CUT&Tag, 单细胞RNA测序 NA 文本, 图像 262例初治中国汉族系统性自身免疫疾病患者(发现队列119例,验证队列143例) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq NA NA
15 2026-10-05
Transcriptional analyses identify pericyte-centered signaling programs altered by sex and brain region in Alzheimer's Disease
2026-06-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 该研究通过单核RNA测序和细胞间通讯分析工具,表征了阿尔茨海默病中周细胞在性别和脑区差异下的转录和信号传导变化 揭示了周细胞-内皮细胞TGFβ信号程序在女性AD供体的MTG中特异性上调,以及涉及周细胞-星形胶质细胞配体-受体相互作用的雌激素通路下调,并通过空间转录组学支持了周细胞-星形胶质细胞分离增加的现象 摘要中未明确提及研究局限性 探讨周细胞在阿尔茨海默病中与性别差异和脑区特异性相关的角色 阿尔茨海默病和非阿尔茨海默病供体的中颞回(MTG)和背外侧前额叶皮层(DLPFC)组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序,空间转录组学 NA 转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
16 2026-10-05
CNS1-dependent regulatory T cells shape recovery from acute lung injury
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 该研究利用CNS1缺失小鼠模型,结合单细胞RNA测序,揭示了CNS1依赖的外周诱导性调节性T细胞在急性肺损伤恢复过程中的关键作用 首次阐明CNS1依赖的外周诱导性Treg亚群在急性肺损伤消退中的关键作用,并通过单细胞RNA测序揭示了CNS1缺失Treg无法完全激活支持肺内最佳抑制和修复功能的转录程序 研究主要基于小鼠模型,CNS1依赖的Treg在人类急性肺损伤中的对应机制尚待验证 探究外周诱导性Treg(特别是CNS1依赖的Treg)在急性肺损伤恢复和炎症消退中的作用及机制 CNS1缺失小鼠与野生型小鼠在急性肺损伤及流感感染模型中的调节性T细胞 免疫学 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-10-05
Hepatocyte-targeted Bap1 reduction in the liver primes an inflammatory transcriptional response
2026-05-06, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 利用AAV8介导的CRISPR/Cas9基因组编辑技术构建肝细胞特异性Bap1敲除小鼠模型,结合单细胞空间转录组学和免疫组化分析,揭示Bap1缺失对肝脏炎症转录反应和免疫细胞募集的影响 首次在体内系统中通过AAV8介导的CRISPR/Cas9技术构建肝细胞特异性Bap1敲除小鼠模型,并结合单细胞空间转录组学与定量纹理分析揭示Bap1在肝脏免疫微环境调控中的关键作用 摘要中未明确提及研究局限性 定义Bap1在体内肝脏中的正常功能,并表征Bap1缺失如何改变肝脏对损伤的响应 小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型 空间转录组学 肝癌 CRISPR/Cas9基因组编辑, 单细胞空间转录组学, 免疫组织化学, 批量RNA测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
18 2026-10-05
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-04-09, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 该研究开发了一种快速共分化平台,从人类诱导多能干细胞生成结肠样肠道组织补片,并验证其体内移植后形成肠道结构和血管化能力 开发了新型早期人类诱导多能干细胞共分化平台,能在8天内生成多种肠道细胞谱系(上皮、间充质和内皮),且该平台无血清、减少动物产品使用,并能在体内形成结肠样组织结构和人源血管 该研究仍处于早期阶段,需要进一步开发以用于新型肠道黏膜再生治疗 开发可移植的肠道黏膜组织移植物,作为辅助愈合的潜在治疗策略 人类诱导多能干细胞 再生医学 肠道疾病 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA RNA表达数据 多个hiPSC细胞系 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
19 2026-10-05
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-Apr, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 该研究用小鼠适应性SARS-CoV-2(MA10)感染老龄5xFAD和野生型小鼠,评估其对阿尔茨海默病神经病理和脑内基因表达的影响 首次在5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型中系统评估小鼠适应性SARS-CoV-2感染对AD神经病理及脑内多细胞类型基因表达的影响,并结合空间转录组学进行分析 未在脑内检测到病毒RNA,未观察到胶质细胞激活或神经炎症,且MA10感染未改变Aβ斑块负荷,因此结论可能仅限于该特定病毒株和小鼠模型 探究SARS-CoV-2感染是否会加剧阿尔茨海默病神经病理及疾病进展 老龄5xFAD转基因阿尔茨海默病小鼠和野生型小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病, 新冠肺炎 空间转录组学 NA 图像, 文本 老龄5xFAD和野生型小鼠(具体数量未提及) NA 空间转录组学 NA NA
20 2026-10-05
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-03-14, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 该研究通过液滴式单细胞RNA测序技术,在六名终末期骨关节炎患者的膝关节软骨中鉴定出一个新的前体样软骨细胞亚群,并利用无监督聚类和拟时序轨迹分析揭示了其分子特征和谱系关系 首次在骨关节炎人类软骨中鉴定出前体样软骨细胞(PLC)亚群,该亚群高表达干性相关基因(如RGS5、PDGFRB、THY1/CD90、MCAM/CD146等),并在拟时序轨迹中位于分化早期分支点,提示其具有前体细胞角色;此外还发现了NRF2⁺调节性软骨细胞和分泌性软骨细胞两个新亚群 研究仅基于转录组数据,缺乏功能验证和空间验证,PLC在体内行为及其在软骨修复或骨关节炎病理中的具体作用仍需进一步实验证实 描绘骨关节炎软骨的单细胞转录组图谱,鉴定并表征前体样软骨细胞亚群,为软骨再生或骨关节炎调控提供分子框架 六名终末期骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 单细胞转录组学 骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 无监督聚类、Monocle拟时序轨迹分析 单细胞转录组数据 约14000个软骨细胞,来自六名终末期骨关节炎患者 NA 单细胞RNA测序 NA 基于液滴的单细胞RNA测序
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