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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-05-15
Integrative multi-omics analysis identifies coronin 1C as a potential mediator linking circadian rhythm disruption to neuroimmune dysregulation in ischemic stroke
2026-Jul-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究通过整合多组学分析,发现冠状蛋白1C(CORO1C)是连接昼夜节律紊乱与缺血性卒中后神经免疫失调的潜在中介因子 首次利用机器学习构建昼夜节律紊乱评分模型,并结合单细胞转录组学和虚拟基因敲除分析,揭示CORO1C在昼夜节律紊乱驱动的神经免疫失调中的核心调控作用 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白水平和表观遗传学层面的验证;且动物模型及体外实验的临床转化意义需进一步评估 探讨昼夜节律紊乱是否通过免疫失衡促进缺血性卒中进展,并阐明其潜在的分子机制 人类缺血性卒中脑组织转录组数据、外周血单核细胞单细胞RNA测序数据、以及小鼠昼夜节律依赖的卒中模型 机器学习 缺血性卒中 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲除, AAV介导的基因干预 机器学习模型(如CRD评分模型), 虚拟基因敲除框架(scTenifoldKnk) 转录组数据, 单细胞转录组数据 人类缺血性卒中脑组织样本(具体数量未提供)及小鼠卒中模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-05-15
Ebselen's role in overcoming cisplatin resistance in colorectal Cancer via SQSTM1 ubiquitination modulation
2026-Jul-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过体内外实验、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示Ebselen通过调节SQSTM1泛素化逆转结直肠癌顺铂耐药的机制 首次阐明Ebselen通过抑制SQSTM1介导的RAD51蛋白酶体降解来逆转顺铂耐药,并结合单细胞和空间转录组学全面解析肿瘤微环境重塑 未提及 探究Ebselen逆转结直肠癌顺铂耐药的分子机制 HCT116/DDP顺铂耐药结直肠癌细胞、人源化PBMC皮下CDX小鼠模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫共沉淀,泛素化分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
3 2026-05-15
Transcriptome and single-cell RNA sequencing data identify and validate candidate biomarkers associated with lysosomal and ferroptosis in osteoarthritis
2026-Jun-15, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据,鉴定并验证了与骨关节炎中溶酶体功能和铁死亡相关的候选生物标志物SLC7A5和SLC3A2 首次整合溶酶体相关基因与铁死亡相关基因筛选骨关节炎候选生物标志物,并通过单细胞测序确定成纤维细胞为关键细胞群 需要进一步的实验和临床验证来确认生物标志物的可靠性 鉴定骨关节炎中与溶酶体功能和铁死亡相关的候选生物标志物,为后续实验研究提供理论基础 骨关节炎患者样本数据及正常对照样本 机器学习 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自公共数据库的骨关节炎数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
4 2026-05-15
Bisphenol A potentiates ischemia-reperfusion-induced endothelial and blood-brain barrier dysfunction associated with CX3CL1-CX3CR1 signaling
2026-Jun-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究综合运用网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接和单细胞转录组学等方法,发现双酚A通过CX3CL1-CX3CR1信号通路加剧缺血再灌注引起的内皮和血脑屏障功能障碍 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接和单细胞转录组学多种方法,系统揭示双酚A加剧缺血性中风损伤的分子机制,并锁定CX3CL1-CX3CR1信号通路作为关键靶点 仅使用体外细胞模型,缺乏体内动物实验验证;双酚A浓度较高(50和100 μM)可能不完全反映环境暴露水平 探究双酚A是否以及如何调节缺血性神经血管损伤 bEnd.3脑内皮细胞和内皮-星形胶质细胞Transwell血脑屏障共培养模型 NA 缺血性中风 单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
5 2026-05-15
Curcumin Targets Crispld2 to Suppress Hepatic Stellate Cell Activation via PI3K/AKT Pathway Inhibition in Hepatic Fibrosis
2026-Jun, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了姜黄素通过靶向Crispld2并抑制PI3K/AKT通路来抑制肝星状细胞活化,从而缓解肝纤维化的分子机制 首次通过单细胞RNA测序结合扰动模型预测和伪时间分析,鉴定出Crispld2是姜黄素抗肝纤维化的关键靶基因,并阐明其通过PI3K/AKT通路调控肝星状细胞活化的新机制 未提及具体局限性,但可能包括动物模型与人类疾病的差异、Crispld2在其他细胞类型中的作用未充分探索等 探究姜黄素在肝纤维化中的具体分子机制,特别是对肝星状细胞活化的影响 肝纤维化小鼠模型及TGF-β诱导的LX-2肝星状细胞活化模型 机器学习和数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序 扰动模型预测与伪时间分析 单细胞转录组数据 CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型(具体样本量未明确)及LX-2细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-05-15
scRAPID-web: a web server for predicting protein-RNA interactions from single-cell transcriptomics
2026-May-14, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 介绍scRAPID-web网络服务器,用于从单细胞转录组数据预测蛋白质-RNA相互作用 通过整合单细胞基因调控网络推断与catRAPID结合倾向预测,开发了用户友好的网络服务器,支持八个模式生物的分析 NA 提供一个用户友好的网络工具,用于从单细胞RNA测序数据预测RNA结合蛋白与RNA的相互作用 单细胞RNA测序数据中的RNA结合蛋白和RNA 机器学习 NA RNA测序 NA 基因表达矩阵 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-05-15
RNA-based CLEM (RCLEM) bridging RNA localisation and ultrastructural mapping in 3D
2026-May-14, Journal of microscopy IF:1.5Q3
研究论文 开发了一种基于RNA的三维相关光镜与电镜(RCLEM)工作流程,用于在超微结构环境中高分辨率可视化RNA分子 首次将RNA标记与连续块面扫描电子显微镜(SBF-SEM)整合,实现厚组织中mRNA三维超微结构定位,无需抗体优化,通过优化去污剂条件保持超微结构与探针可及性 NA 克服当前空间转录组学分辨率限制,建立连接基因表达与细胞超微结构的高分辨率三维空间转录组分析平台 脉络丛和肝脏组织中的mRNA分子 数字病理学 NA RNA-seq, 空间转录组学, 原位杂交, 连续块面扫描电子显微镜 NA 图像, 三维数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
8 2026-05-15
Integrated Single-Cell Atlas Reveals Cross-Subtype Heterogeneity in Human Pulmonary Hypertension
2026-May-14, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
research paper 通过整合单细胞RNA测序数据构建人类肺动脉高压核心单细胞图谱,揭示跨亚型异质性,并开发了多任务学习工具PH-Map用于快速分层细胞注释 首次构建涵盖多个临床亚型的人类肺动脉高压核心单细胞图谱,并开发基于该图谱的预训练多任务学习工具PH-Map,实现快速分层细胞注释 未提及具体局限性 整合单细胞RNA测序数据,构建人类肺动脉高压核心单细胞图谱,揭示跨亚型细胞异质性,并为下游研究提供可重复的分层注释工具 64个人类样本(包括特发性肺动脉高压、系统性硬化症相关肺动脉高压、慢性血栓栓塞性肺动脉高压和健康对照)的235621个高质量细胞 machine learning pulmonary hypertension single-cell RNA-seq multitask learning single-cell RNA sequencing data 64个人类样本,包含235621个细胞 NA single-cell RNA-seq NA NA
9 2026-05-15
Perk Is Dispensable for Smooth Muscle Cell Phenotype Switching in Atherosclerosis
2026-May-14, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨Perk蛋白在平滑肌细胞表型转换及动脉粥样硬化病变中的作用,发现其并非必需 首次通过体内基因敲除和单细胞分析明确Perk在动脉粥样硬化平滑肌细胞调节中不发挥关键作用 主要基于小鼠模型,且未在更多人类样本中验证Perk通路与病变稳定性的直接因果关系 阐明未折叠蛋白反应蛋白Perk在动脉粥样硬化平滑肌细胞调控和病变稳定性中的作用 成年Ldlr基因敲除高胆固醇血症小鼠的平滑肌细胞及人颈动脉病变组织 心血管疾病 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、批量RNA测序、Xenium空间转录组、基因敲除 NA 基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型(样本量未明确说明)、人类颈动脉病变样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序,Xenium空间转录组学平台
10 2026-05-15
Balancing off-target and on-target considerations for optimized CRISPR-Cas9 knockout library design
2026-May-13, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 提出一种平衡脱靶与靶向活性的CRISPR-Cas9敲除文库设计策略,并创建了人类(Jacquere)和小鼠(Julianna)基因组规模文库 首次建立同时权衡脱靶和靶向活性的选择框架,避免因过度排除脱靶活性而丢失高效靶向的向导RNA 未详细说明脱靶活性阈值设定的具体标准及文库在长期应用中的稳定性验证 优化CRISPR-Cas9敲除文库设计,以支持高维筛选(如单细胞RNA测序、高内涵成像)中的紧凑文库需求 人类和小鼠基因组中的CRISPR-Cas9向导RNA文库 机器学习和基因组编辑 遗传病 CRISPR-Cas9敲除筛选 NA 基因组序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-05-15
A skeletal muscle atlas shows neuromuscular junction adaptations to growth and atrophy
2026-May-13, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 该研究构建了小鼠后肢骨骼肌的单细胞和单核转录组图谱,结合空间转录组分析,揭示了神经肌肉接头在肌肉萎缩和肥大过程中的适应性变化 首次通过多组学联合分析(单细胞转录组、单核转录组和空间转录组)系统描绘了小鼠骨骼肌在休息、萎缩和肥大状态下的细胞图谱,并发现神经肌肉接头处的突触肌核和终末施万细胞在不同状态下发生显著重塑 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅用于验证部分结果,且实验诱导的萎缩和肥大条件可能无法完全模拟自然衰老或疾病状态下的肌肉变化 阐明骨骼肌在萎缩和肥大过程中的分子机制,特别是神经肌肉接头的重塑机制 小鼠后肢骨骼肌(静止状态和实验诱导的萎缩或肥大状态)及人类骨骼肌样本(去神经支配和运动后) 转录组学, 空间组学 肌肉萎缩相关疾病 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 高分辨率3D成像 NA 转录组数据, 空间基因表达数据, 成像数据 小鼠后肢骨骼肌样本(具体数量未提及),人类去神经支配和运动后肌肉样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'基因表达测序,10x Visium空间转录组学
12 2026-05-15
Guidelines for single-cell RNA sequencing analysis of eosinophils
2026-May-13, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 为嗜酸性粒细胞单细胞RNA测序分析提供指导方针 整合多个公共嗜酸性粒细胞scRNA-seq数据集,开展跨平台、跨组织、跨物种比较分析,揭示了嗜酸性粒细胞转录组覆盖率最低的特点,并开发了专用的标记基因面板和内含子包含比对策略 未明确说明局限性 建立嗜酸性粒细胞特异的scRNA-seq分析框架,改进其回收、注释和生物学解释 嗜酸性粒细胞 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个公共数据集整合 NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-05-15
Macrophage heterogeneity influences cellular response to HIV infection and latency modulation
2026-May-13, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文利用体外HIV潜伏感染模型,研究了不同巨噬细胞亚型对HIV感染和潜伏期调节的差异性反应 首次系统比较了单核细胞来源的巨噬细胞、肺泡样巨噬细胞和单核细胞来源的小胶质细胞在HIV潜伏建立和逆转中的差异,并鉴定了MERTK和CD137等细胞表面受体作为潜伏感染的潜在标志物 体外模型可能无法完全反映体内巨噬细胞的异质性和微环境的影响 阐明不同巨噬细胞亚型对HIV潜伏建立、维持和逆转的调控机制差异 人单核细胞来源的巨噬细胞、肺泡样巨噬细胞和单核细胞来源的小胶质细胞 机器学习 艾滋病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 体外培养的三种巨噬细胞类型,具体样本量未在标题和摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
14 2026-05-15
Hypoxia-induced ADAM8⁺ macrophages and FAP⁺ fibroblasts form an extracellular matrix-remodeling niche at the tumor boundary in HCC
2026-May-13, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了肝细胞癌中缺氧诱导的ADAM8⁺巨噬细胞和FAP⁺成纤维细胞在肿瘤边界形成细胞外基质重塑微环境 首次鉴定出ADAM8⁺巨噬细胞与FAP⁺成纤维细胞通过胶原-CD44轴相互作用,形成缺氧相关的ECM重塑微环境,并证明ADAM8可作为治疗靶点 主要基于体外实验和组织微阵列分析,缺乏体内功能验证;样本量有限,需在更大队列中验证预后相关性 探究肝细胞癌中驱动细胞外基质重塑的细胞状态,明确其肿瘤边界组织方式及与预后的关联 79例肝细胞癌患者的肿瘤边界基质区域 数字病理学, 单细胞组学 肝细胞癌 scRNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 配体-受体分析, 基因敲降实验 基因表达数据, 空间转录数据, 组织图像 79例患者样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
15 2026-05-15
Natural killer cell immunotherapy reverses lung fibrosis by eliminating senescent fibroblasts
2026-May-13, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示NKG2A/HLA-E免疫检查点轴让衰老成纤维细胞逃避免疫监视,靶向该轴可逆转肺纤维化 首次鉴定NKG2A作为纤维化肺部疾病中NK细胞的主要抑制性检查点受体,并发现HLA-E/NKG2A免疫检查点轴介导衰老成纤维细胞的免疫逃逸,提出空间受限的免疫特权生态位概念 未明确提及 阐明自然杀伤细胞在肺纤维化中清除衰老成纤维细胞的免疫逃逸机制,并探索免疫检查点阻断治疗策略 特发性肺纤维化患者肺部组织及博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、空间转录组学、多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 特发性肺纤维化患者肺部样本及小鼠肺组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序, 10x Visium 用于空间转录组学
16 2026-05-15
Sensory nerves protect against preclinical tendinopathic changes through FGF1 signaling
2026-May-13, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 感觉神经通过FGF1信号在肌腱病前变化中发挥保护作用 首次揭示感觉神经元在慢性肌腱病发展中的调节功能,并发现其通过分泌FGF1对肌腱退化起预防作用 研究主要基于临床前模型,人类样本验证有限 探究感觉神经元在慢性肌腱病发展中的调控作用及其机制 小鼠慢性肌腱病模型和人类肌腱病标本 机器学习和单细胞测序 肌腱病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 三种互补的小鼠手术和转基因模型,以及人类肌腱病标本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
17 2026-05-15
First-in-human single-cell and TCR atlas reveals peripheral immune remodeling before and after irreversible electroporation in prostate cancer
2026-May-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 首次在人体中通过单细胞和TCR图谱揭示不可逆电穿孔治疗前列腺癌前后的外周免疫重塑 首次利用单细胞RNA测序和TCR谱分析绘制前列腺癌IRE治疗后系统性免疫应答的时空动态图谱 样本量较小(仅5例患者),且仅收集了治疗前和治疗后第7天的外周血样本,尚缺乏更长时间点及组织层面的数据 探究不可逆电穿孔(IRE)治疗前列腺癌后系统性免疫应答的机制和时间动态 5例局限性前列腺癌患者(T2a-T2c期) 单细胞组学 前列腺癌 单细胞RNA测序、T细胞受体(TCR)谱分析 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据 5例前列腺癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞TCR分析 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序和TCR谱分析平台
18 2026-05-15
Synthetic DNA vaccine platform elicits potent immunity where electroporated naked-mRNA is non-immunogenic
2026-May-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 开发了一种基于线性发夹DNA(hpDNA)的合成DNA疫苗平台,在电穿孔递送下能诱导强效免疫反应,而电穿孔递送的裸mRNA无免疫原性 首次证明电穿孔递送的hpDNA疫苗相比电穿孔递送的假尿苷修饰mRNA疫苗,能有效激活T细胞免疫并诱导促炎转录谱,而后者在相同条件下无法检测到抗原特异性T细胞反应 未比较不同递送载体(如脂质纳米颗粒)对mRNA疫苗免疫原性的影响,且hpDNA平台需要电穿孔设备,可能限制临床应用场景 评估hpDNA作为个性化新抗原癌症疫苗平台的安全性和有效性 MC38和CT26小鼠肿瘤模型的20种新抗原 机器学习 癌症 假尿苷修饰mRNA NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA/T细胞受体测序的10x Chromium平台
19 2026-05-15
Chromatin rewiring of β-globin and MYC enhancers by TGF-β1 drives defective erythropoiesis
2026-May-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 揭示TGF-β1通过染色质重构调控β-珠蛋白和MYC增强子导致红细胞生成缺陷的机制 首次通过整合RNA-seq、ChIP-seq和Micro-C分析,揭示TGF-β1/SMAD2信号通过双重作用——激活β-珠蛋白LCR促进早熟分化并破坏MYC增强子-启动子互作抑制增殖——来调控红细胞生成 未明确讨论临床转化潜力及体内模型与人类疾病的完全一致性限制 阐明TGF-β1调控红细胞生成的具体分子机制 骨髓增生异常综合征患者样本及原代人造血干细胞/祖细胞 数字病理学 血液疾病 RNA-seq, ChIP-seq, Micro-C, 单细胞RNA-seq NA 测序数据 骨髓增生异常综合征患者样本及TGF-β1过表达小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq, Micro-C NA NA
20 2026-05-15
High-throughput generation of patient-derived cancer stem cells for precision medicine using a microwell-chip platform
2026-May-13, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 开发了一种基于微孔芯片的平台,可高通量生成源自患者乳腺癌标本的微小肿瘤球,用于癌症干细胞的功能富集和个性化药物测试 提出了一种微孔细胞芯片培养平台,能够从临床小样本(如穿刺活检)中快速、高通量生成均匀的微小肿瘤球,并在8天内实现功能性癌症干细胞富集和个性化药物测试 未明确说明局限性 开发一种高通量平台,从患者样本中生成癌症干细胞,用于精准肿瘤学的药物测试 乳腺癌患者标本中的癌症干细胞 机器学习 乳腺癌 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 16名乳腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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