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当前共找到 44919 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-29 |
Deficiency of NBAS causes immune dysregulation due to hyperactivation of IFN signaling
2027-Jan-04, Journal of human immunity
DOI:10.70962/jhi.20260018
PMID:42949555
|
研究论文 | 本文通过四名携带五个NBAS功能丧失突变的患者，扩展了NBAS缺陷的基因型和表型谱，并揭示其免疫失调由髓系细胞驱动的I型干扰素信号过度激活所致 | 首次将NBAS缺陷定义为一种由髓系细胞驱动的I型干扰素病，并通过单细胞RNA测序明确炎症上调主要由髓系细胞驱动，同时扩展了NBAS相关疾病的临床谱 | 样本量较小，仅包含四名患者，结论的普适性有待更大队列验证 | 阐明NBAS缺陷的免疫学表现及其潜在机制 | 携带五个NBAS功能丧失突变的四名NBAS缺陷患者 | 医学基因组学 | NBAS缺陷相关多系统疾病 | minigene实验、RNA分析、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 文本、基因表达数据 | 4名患者 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk转录组分析 | NA | NA |
| 2 | 2026-10-29 |
High-resolution Spatial Transcriptomics Reveals Contrasting Tumor States in Two Early Gastric Cancers
2026-Nov, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.18444
PMID:42946435
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研究论文 | 该研究应用高分辨率空间转录组学（Visium HD）分析了两例组织学对比鲜明的早期胃癌，揭示了肿瘤内不同的肿瘤状态和微环境分区 | 首次使用Visium HD高分辨率空间转录组学在单切片内解析两例组织学对比鲜明的早期胃癌（胃底腺型腺癌和印戒细胞癌）的空间组织架构和肿瘤状态差异 | 研究结果为描述性和假设生成性的，而非亚型定义性的，需要在更大队列中验证；仅分析了两个样本，样本量有限 | 利用高分辨率空间转录组学揭示早期胃癌的瘤内异质性及其空间组织架构 | 两例组织学对比鲜明的早期胃癌：一例胃底腺型腺癌和一例印戒细胞癌（含印戒和非印戒低黏附成分） | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 2例FFPE组织标本（1例胃底腺型腺癌，1例印戒细胞癌） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Genomics Visium HD 高分辨率空间转录组学平台，用于FFPE标本分析 |
| 3 | 2026-10-29 |
Ginsenoside Rg2 attenuates TGF-β1/Smad-mediated fibrotic remodeling in aged male mice with sarcopenia
2026-Nov, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2026.101115
PMID:42948583
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序、转录组分析和孟德尔随机化，揭示TGF-β1介导的纤维化与肌少症的因果关系，并证明人参皂苷Rg2通过靶向TGF-β1/Smad通路改善衰老骨骼肌的纤维化重塑 | 首次整合单细胞测序、孟德尔随机化和多种分子生物学手段，系统阐明TGF-β1/Smad介导的纤维化在肌少症中的作用，并发现人参皂苷Rg2可直接结合TGF-β1并抑制其下游信号 | 研究主要基于小鼠模型和C2C12细胞，缺乏人体临床试验验证；样本量有限；Rg2的长期安全性和药代动力学特征未充分评估 | 探索人参皂苷Rg2改善衰老相关肌少症的潜在机制，重点关注TGF-β1/Smad介导的纤维化 | 衰老雄性小鼠和C2C12细胞模型 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞测序, 转录组分析, 孟德尔随机化, siRNA基因敲低, RT-qPCR, 蛋白质印迹, 组织学染色, 分子对接, 分子动力学模拟, 表面等离子体共振, 细胞热位移实验, 药物亲和响应靶稳定性实验 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-10-29 |
Ginseng-derived extracellular vesicles alleviate ulcerative colitis by regulating macrophage glycolytic reprogramming and H3K18la-mediated epigenetic modification
2026-Nov, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2026.101123
PMID:42948586
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研究论文 | 该文章研究人参来源细胞外囊泡（GEs）通过抑制巨噬细胞糖酵解、降低H3K18la介导的促炎基因表达、保护肠道屏障并调节肠道菌群来缓解溃疡性结肠炎 | 首次揭示人参来源细胞外囊泡通过调控巨噬细胞糖酵解重编程及H3K18la介导的表观遗传修饰缓解溃疡性结肠炎，并发现其可重塑结肠巨噬细胞亚群及调节肠道菌群和短链脂肪酸代谢 | 研究主要基于DSS诱导的小鼠模型和体外细胞实验，缺乏临床人体试验数据，且GEs的具体活性成分及长期安全性有待进一步验证 | 探究人参来源细胞外囊泡对溃疡性结肠炎的治疗作用及其通过调控巨噬细胞糖酵解和组蛋白乳酸化修饰发挥抗炎作用的机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠、RAW264.7巨噬细胞、Caco-2肠上皮细胞、肠道菌群 | 数字病理, 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序, 气相色谱 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-10-29 |
Integrated Spatial Multi-Omics Reveals Metabolic Hotspots of Paclitaxel Biosynthesis in Taxus yunnanensis
2026-Oct-28, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.102162
PMID:42947487
|
研究论文 | 该研究结合空间代谢组学、空间转录组学和单核RNA测序，揭示了云南红豆杉茎中紫杉醇生物合成的代谢热点及其空间区隔化特征 | 首次将DESI-MSI空间代谢组学与Stereo-seq空间转录组学和单核RNA-seq整合，在40μm bin水平上对相邻切片进行跨模态对齐，发现了紫杉醇生物合成的两类空间微结构域（代谢热点），并提出了紫杉醇生物合成的空间协调多细胞模型 | 研究仅对单个云南红豆杉茎的一个纵向位置（P2）进行了空间转录组学和单核RNA-seq分析，样本量有限，且空间分辨率受限于40μm bin水平 | 探究云南红豆杉茎组织中紫杉醇生物合成的空间区隔化特征及其调控机制 | 云南红豆杉茎组织，涵盖从幼嫩（P1）到成熟（P6）的六个纵向位置 | 空间多组学 | 肺癌 | DESI-MSI空间代谢组学、Stereo-seq空间转录组学、单核RNA-seq | NA | 图像、文本 | 一个云南红豆杉茎的六个纵向位置用于空间代谢组学分析，P2位置三个生物学重复用于空间转录组学和单核RNA-seq分析 | BGI | 空间转录组学、单核RNA-seq、空间代谢组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组学（40μm bin水平）、DESI-MSI空间代谢组学、单核RNA-seq |
| 6 | 2026-10-29 |
scEvoSel maps evolutionary selection signals onto single-cell transcriptomic atlases to reveal selection-relevant cellular contexts
2026-Oct-28, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag271
PMID:42948897
|
研究论文 | 开发了scEvoSel分析框架，将群体水平的选择信号与单细胞RNA测序数据整合，以识别与选择相关的细胞类型 | 首次将群体遗传学选择信号（DCMS评分）映射到单细胞转录组图谱，实现单细胞分辨率下解析选择信号的细胞背景 | 仅在野猪/家猪和红原鸡/来航鸡两个物种中验证，未在其他物种或更多组织类型中广泛测试 | 解决基因组扫描识别的选择信号难以揭示其作用的具体细胞背景的问题 | 野猪和家猪的骨骼肌、红原鸡和来航鸡的肝脏 | 单细胞转录组学、群体遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、群体变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-10-29 |
Epigenomic Characterization of Fibroblasts in Darier Disease Identifies Cross-cell-type Regulatory Gene Signatures
2026-Oct-28, Acta dermato-venereologica
IF:3.5Q1
|
研究论文 | 该研究对Darier病皮损与非皮损皮肤的原代成纤维细胞进行全基因组DNA甲基化谱分析，并结合蛋白互作网络、qPCR和单细胞RNA-seq数据，识别跨细胞类型的调控基因特征 | 首次系统表征Darier病皮肤成纤维细胞的表观遗传改变，发现皮损成纤维细胞存在稳定的位点特异性异常甲基化，且这些枢纽基因的变化与角质形成细胞的转录异常方向一致，提示跨细胞类型的调控网络紊乱 | 样本量有限，仅基于原代成纤维细胞的甲基化数据，qPCR验证的枢纽基因数量较少（12个），缺乏功能实验验证表观遗传改变与疾病表型的因果关系，单细胞数据来自健康皮肤而非患者 | 探究Darier病皮肤成纤维细胞是否存在疾病相关的表观遗传改变，并鉴定具有跨细胞类型调控意义的枢纽基因 | Darier病患者皮损区与非皮损区皮肤的原代成纤维细胞，以及健康皮肤单细胞RNA-seq数据与已发表的Darier病角质形成细胞RNA-seq数据 | 表观遗传学 | Darier病 | 全基因组DNA甲基化芯片分析、STRING蛋白互作网络分析、qPCR、单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | 甲基化数据、基因表达数据、文本 | Darier病患者皮损与非皮损皮肤的原代成纤维细胞样本，以及健康皮肤单细胞RNA-seq数据与已发表的角质形成细胞RNA-seq数据（具体样本数未在摘要中说明） | Illumina | 全基因组DNA甲基化芯片分析、单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | Illumina Infinium Methylation BeadChip | NA |
| 8 | 2026-10-29 |
An atlas of cartilage in the distal radius generated via single-cell RNA sequencing reveals cell‒cell interaction patterns similar to those of the ankle
2026-Oct-27, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05778-6
PMID:42945012
|
研究论文 | 该研究对5名供体的桡骨远端关节软骨组织进行scRNA-seq，构建了包含51,826个细胞和11种细胞类型的图谱，并分析了细胞间相互作用和软骨细胞亚群的转录因子 | 首次构建桡骨远端关节软骨的单细胞转录组图谱，鉴定出11种细胞类型，发现ATF1、IRF3、KDM5B、SMARCC2为SpCs特异性转录因子，并揭示桡骨远端与踝关节相似的FN1、COMP和CD99通路及细胞间相互作用模式 | 样本量较小（仅5名供体），需进一步扩大样本验证，且未提及功能实验验证 | 深入探究桡骨远端关节软骨的细胞组成、细胞间相互作用及软骨细胞亚群特异性转录因子 | 桡骨远端关节软骨组织 | 单细胞转录组学 | 骨科疾病 | scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | 5个桡骨远端软骨组织样本（来自5名供体），共分析51,826个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-10-29 |
Dissecting the earliest molecular drivers of HFpEF through single-cell transcriptomics
2026-Oct-27, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag256
PMID:42945462
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-10-29 |
Bulk RNA sequencing deconvolution of early-onset pancreatic ductal adenocarcinoma identifies cancer-associated fibroblast subsets associated with survival and tumor microenvironment composition
2026-Oct-27, Cancer treatment and research communications
DOI:10.1016/j.ctarc.2026.101490
PMID:42945720
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研究论文 | 该研究利用bulk RNA测序去卷积技术分析早发性胰腺导管腺癌的肿瘤微环境，识别与生存和微环境组成相关的癌相关成纤维细胞亚群 | 首次在早发性PDAC队列中应用Statescope去卷积方法识别CAF亚群，并发现促结缔组织增生型CAF亚群，揭示iCAF高丰度与改善生存相关 | 研究基于bulk RNA测序去卷积的計算推断而非直接单细胞测序验证，样本量有限（74例），且未进行实验验证 | 探索早发性胰腺导管腺癌肿瘤微环境中癌相关成纤维细胞亚群的异质性及其与生存、微环境组成和突变特征的关联 | 74例60岁以下的早发性胰腺导管腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq | Statescope去卷积算法 | 文本（基因表达数据） | 74例早发性胰腺导管腺癌患者样本 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-10-29 |
Macrophage lipid signaling drives glioblastoma invasion and represents a therapeutic vulnerability
2026-Oct-27, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.10.006
PMID:42945959
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研究论文 | 该研究揭示了肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞通过CSF1R-PI3K信号诱导脂质代谢重编程并分泌LPC和LPA等生物活性脂质，从而促进胶质母细胞瘤侵袭的旁分泌信号轴 | 首次整合单细胞转录组学、空间脂质组学和功能扰动实验，鉴定出髓系细胞-胶质瘤细胞间由CSF1R-PI3K信号驱动的脂质介导旁分泌回路，并发现LPA-LPAR和YAP/TAZ信号作为下游促侵袭通路及潜在治疗靶点 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 阐明驱动胶质母细胞瘤弥漫性侵袭的机制，并寻找减少肿瘤浸润、改善手术切除的治疗策略 | 小鼠胶质瘤模型和人类GBM样本中的肿瘤细胞及肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞 | 肿瘤生物学、空间组学、单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学、空间脂质组学、功能扰动实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间脂质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间脂质组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-10-29 |
A ubiquitin network safeguards cell identity by continuously degrading a stem cell-related translational machinery
2026-Oct-27, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353786.126
PMID:42946455
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研究论文 | 本文揭示了成年果蝇中肠中一个转录后调控层通过泛素网络持续降解干细胞相关翻译机器来维持肠上皮细胞身份，并在衰老过程中失效 | 发现了Rogue-Orb2复合物在衰老时异位表达并重新激活干细胞相关翻译抑制机器，揭示了dUSP22-dUbcH8/Kdo-CTLH泛素网络通过降解干细胞相关RNA结合蛋白 safeguarding 细胞身份的机制，并利用纳米孔直接RNA测序鉴定Rogue靶标RNA | 研究主要基于果蝇中肠模型，在哺乳动物中的保守性尚未验证；对Rogue调控poly(A)尾缩短的具体分子机制尚需进一步解析 | 探究细胞身份如何被维持以及衰老过程中细胞身份丢失的转录后调控机制 | 成年果蝇中肠肠上皮细胞（ECs） | 衰老生物学与细胞身份调控 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA-seq、谱系追踪、经典遗传学、RNA免疫沉淀、纳米孔直接RNA测序 | NA | 基因表达数据、RNA序列数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq、direct RNA-seq | Nanopore direct RNA sequencing | Nanopore-based direct RNA sequencing用于RNA免疫沉淀后的转录本poly(A)尾分析 |
| 13 | 2026-10-29 |
A three-dimensional human co-culture system reveals reciprocal embryo-endometrial adaptation at implantation onset
2026-Oct-27, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-026-02106-4
PMID:42946776
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研究论文 | 该研究利用子宫内膜组装体与人类胚泡样结构和天然囊胚的三维共培养系统，通过时间序列单细胞转录组学和功能扰动解析了植入起始阶段胚胎与子宫内膜的相互适应过程 | 首次在三维子宫内膜组装体共培养系统中结合人类胚泡样结构和天然囊胚，通过时间序列单细胞转录组学鉴定出共培养诱导的SDC1和MMP7标记的滋养层亚群，并揭示其与基质来源CSF3信号传导的关联 | 研究使用体外共培养系统模拟植入过程，可能无法完全反映体内复杂的三维组织和生理环境；天然囊胚样本来源有限 | 解析人类胚胎植入起始阶段滋养层与子宫内膜界面的动态相互作用及相互适应机制 | 人类胚泡样结构、天然囊胚和子宫内膜组装体 | 单细胞转录组学、发育生物学、生殖医学 | NA | 时间序列单细胞转录组学、功能扰动、细胞间通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-10-29 |
Single-cell insights into plant responses to biotic and abiotic stresses: cellular heterogeneity and regulatory mechanisms
2026-Oct-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-04033-y
PMID:42946844
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综述 | 系统总结了单细胞和空间组学技术在植物生物与非生物胁迫响应研究中的应用，比较了两类胁迫在空间响应模式、细胞分工、细胞状态转变和基因调控网络上的异同 | 首次系统比较了生物胁迫与非生物胁迫在单细胞和空间维度上的响应模式差异，并归纳了二者共享的核心调控模块及技术挑战 | 未涉及原始实验数据验证，讨论的技术挑战（原生质体和细胞核制备、细胞类型注释、空间分辨率、多模态数据整合）尚缺乏标准化解决方案 | 综述单细胞和空间组学技术在植物胁迫生物学中的最新应用，解析细胞异质性和调控机制 | 植物对生物胁迫和非生物胁迫的响应 | 植物科学, 单细胞组学, 空间组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单细胞染色质可及性测序, 空间转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | 文本, 转录组数据, 表观遗传数据, 空间数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-10-29 |
Targeting Engrailed-1 Fibroblasts in Idiopathic Subglottic Stenosis
2026-Oct-27, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.71012
PMID:42947382
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研究论文 | 该研究探讨了Engrailed-1成纤维细胞在特发性声门下狭窄（iSGS）中的作用，并评估了维替泊芬通过抑制YAP/TAZ信号通路减少纤维化的潜力 | 首次在iSGS中研究EN1表达、YAP/TAZ信号通路以及维替泊芬治疗，揭示了EN1成纤维细胞作为iSGS纤维化治疗靶点的可能性 | 样本量较小（n=6），仅进行了体外实验，缺乏体内验证和临床治疗数据 | 探究EN1成纤维细胞和YAP/TAZ信号通路在iSGS发病机制中的作用，并评估维替泊芬作为潜在治疗手段的效果 | iSGS患者的病变声门下组织和远端健康气管组织，以及来自病变组织的成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | 6例iSGS患者的病变声门下组织和远端健康气管组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-10-29 |
Integrative single-cell transcriptomic and metabolic profiling reveals lactate-driven glycolytic reprogramming and histone lactylation in colorectal cancer liver metastasis
2026-Oct-27, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70138
PMID:42947461
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组与代谢分析，揭示结直肠癌肝转移中乳酸驱动的糖酵解重编程及组蛋白乳酰化调控免疫逃逸的机制 | 首次揭示PGK1驱动的糖酵解通过乳酸诱导H3K18乳酰化激活ADAM10，进而剪切CDH1释放可溶性胞外域作为KLRG1配体驱动T细胞耗竭，提出代谢-表观遗传-免疫轴及CDH1双功能分子新概念 | 摘要未明确说明具体样本量及队列规模，功能验证主要基于原发与肝转移CRC模型，临床转化验证有待进一步开展 | 探究肿瘤代谢如何塑造结直肠癌肝转移过程中的免疫微环境，以及CDH1在细胞黏附之外的作用 | 结直肠癌原发灶与肝转移灶模型及T细胞 | 数字病理学、肿瘤免疫学、单细胞组学 | 结直肠癌、肝癌 | 单细胞RNA测序、拟时序轨迹推断、CellChat细胞通讯分析、生化与免疫组化实验、体内外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-10-29 |
M4-like Macrophages Drive Skeletal Muscle Fibrosis and Suppress Myogenesis via the MMP12/SPP1/NF-κB Axis
2026-Oct-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27209369
PMID:42942136
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研究论文 | 本研究揭示了M4样巨噬细胞通过MMP12/SPP1/NF-κB轴促进骨骼肌纤维化并抑制肌生成的机制 | 首次在急性骨骼肌损伤模型中系统表征M4样巨噬细胞亚群，并阐明其通过MMP12-SPP1相互作用及自分泌SPP1激活NF-κB/TNF-α信号促进纤维化和抑制肌生成的分子机制 | QNZ抑制剂缺乏TNF-α特异性，可能影响多种细胞类型；研究主要基于小鼠模型，人体中的相关性尚需验证 | 探究M4样巨噬细胞在骨骼肌损伤修复中的作用及其分子机制 | BALB/c小鼠心脏毒素诱导的急性骨骼肌损伤模型、L929成纤维细胞、C2C12成肌细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌损伤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、共免疫沉淀、转录组分析、AlphaFold3结构预测 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-10-29 |
CCCView: A Knowledge Platform for Integrated Analysis of Spatial Transcriptomic Cell-Cell Communication
2026-Oct-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27209382
PMID:42942149
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研究论文 | 该文介绍了CCCView，一个整合699个空间转录组样本和747万个推断细胞通讯互作的知识平台，支持搜索、可视化、比较和在线分析 | 整合大规模空间转录组细胞通讯结果，统一细胞类型注释流程，组织三种互补推断方法（COMMOT、CellNEST、SpatialDM）的结果，并提供基于Tweedie回归的MuCIA统计模块用于跨样本比较 | 摘要未明确说明平台在数据异质性、方法一致性或可扩展性方面的具体局限 | 构建一个可搜索、可视化、可比较的大规模空间转录组细胞通讯知识平台，促进跨研究的数据重用和假设生成 | 人类和小鼠的24种组织、182种注释细胞类型、27种生物条件下的空间转录组样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、细胞通讯推断 | COMMOT、CellNEST、SpatialDM、Tweedie回归 | 空间转录组数据、细胞通讯互作数据 | 699个空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-10-29 |
Integrative Computational Food Toxicology Implicates a CXCL1-Associated Fibroblast Inflammatory Remodeling Signature in Deoxynivalenol-Related Intestinal Barrier Dysfunction
2026-Oct-20, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15203733
PMID:42940370
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研究论文 | 该文构建整合计算毒理学框架，结合网络毒理学、bulk转录组、单细胞转录组与机器学习，揭示脱氧雪腐镰刀菌烯醇相关肠屏障功能障碍中CXCL1相关成纤维细胞炎症重塑特征 | 首次将网络毒理学、WGCNA、机器学习、免疫浸润、分子对接、单细胞转录组、CellChat与in silico基因扰动整合用于DON肠毒性研究，并提出CXCL1相关成纤维细胞炎症重塑作为候选基质背景特征 | 研究为纯计算与假设生成性质，缺乏实验验证，且所识别的特征并非DON特异性机制 | 解析DON相关肠屏障功能障碍的分子与细胞重塑模式 | DON相关肠屏障功能障碍相关的肠道疾病基因与转录组数据、成纤维细胞 | 计算毒理学 | 肠道疾病 | 网络毒理学, bulk转录组, WGCNA, 机器学习, 免疫浸润分析, 分子对接, 单细胞转录组, CellChat, in silico基因扰动 | 机器学习模型 | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-10-29 |
CAV1 as a Potential Regulator of Endothelial-Macrophage Communication Through the CD74/MIF Pathway in Breast Cancer
2026-Oct-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27209298
PMID:42942068
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研究论文 | 该研究整合复方斑蝥胶囊的预测化合物靶点与乳腺癌相关基因，利用LASSO回归、相关分析和ROC分析筛选候选基因，并通过单细胞RNA测序分析其在内皮细胞中的表达模式、异质性及内皮-巨噬细胞通讯。 | 将复方斑蝥胶囊的预测靶点与乳腺癌相关基因整合，结合LASSO回归、AUCell评分、虚拟敲除和细胞通讯分析，首次提出CAV1可能通过CD74/MIF通路调控乳腺癌内皮-巨噬细胞通讯。 | 研究主要基于计算预测和单细胞数据的推断分析，缺乏实验验证和临床样本验证，所提出的CAV1-CD74/MIF调控机制仍为假设。 | 筛选与复方斑蝥胶囊预测靶点相关的乳腺癌关键基因，并探索其在内皮细胞异质性和内皮-巨噬细胞通讯中的潜在作用。 | 乳腺癌（BRCA）及其肿瘤微环境中的内皮细胞和巨噬细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归, ROC分析, AUCell, 虚拟敲除分析 | 单细胞转录组数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |