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当前共找到 44214 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-10-15
Characterization of hematopoietic stem cell-derived microglia-like cells in nonhuman primates
2026-Oct-13, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究利用自体非人灵长类造血干细胞移植模型,探究基因修饰移植后造血干细胞来源的小胶质细胞样细胞在脑内的植入情况及其转录组特征 首次在非人灵长类自体造血干细胞移植模型中系统表征了基因标记的小胶质细胞样细胞的脑内植入情况,并利用单细胞RNA测序揭示了其边界相关巨噬细胞样表型 研究仅纳入5只非人灵长类动物,样本量较小;未对内源性小胶质细胞与MLCs进行全面的功能比较 探究造血干细胞移植后造血干细胞来源的小胶质细胞样细胞在脑内的植入能力及其转录组身份 非人灵长类(NHP)自体造血干细胞移植模型中的小胶质细胞样细胞(MLCs) 单细胞转录组学 神经性溶酶体贮积症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5只非人灵长类动物 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-10-15
Multimodal learning enables chat-based exploration of single-cell data
2026-Oct, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 该论文提出了CellWhisperer,一个基于多模态学习的人工智能模型和软件工具,用于通过聊天方式交互式探索单细胞基因表达数据 建立了转录组与文本注释的多模态嵌入,使用对比学习在100万个RNA测序图谱上进行训练,并结合大型语言模型实现自然语言聊天交互,这是首个将单细胞数据与聊天式AI探索相结合的工具 论文未明确说明其局限性,但可能受限于训练数据的覆盖范围和注释质量,以及模型对未见细胞类型的泛化能力 实现基于聊天的单细胞数据交互式探索,使研究人员能够通过自然语言提问来查询细胞和基因相关信息 单细胞RNA测序数据及其文本注释 自然语言处理, 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习, 大型语言模型 文本, 基因表达数据 100万个RNA测序图谱 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-10-15
Spatial Transcriptomics Delineates the Inflammatory Landscape of Human Dental Pulp: Regional Crosstalk and Therapeutic Implications
2026-10, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 本研究利用Visium HD空间转录组技术,对健康与炎症牙髓组织进行空间细胞架构和分子互作分析,揭示牙髓炎的病理机制和潜在治疗靶点 首次利用空间转录组测序技术鉴定牙髓中九种细胞群及其空间定位和细胞间串扰,绘制牙髓炎症图谱;发现APP抑制、CXCL14缺失和TGFβ激活驱动的细胞重塑是牙髓炎进展的核心机制 样本量较小(仅2例健康个体和2例牙髓炎患者),结果属于初步空间转录组基础,需要更大样本量验证 利用空间转录组技术研究健康和炎症牙髓的空间细胞架构和分子互作,阐明牙髓炎的病理机制并鉴定活髓治疗的潜在治疗靶点 健康个体和牙髓炎患者的牙髓组织 空间转录组学 牙髓炎 空间转录组测序 Seurat聚类、细胞轨迹推断、CellphoneDB互作网络建模、PROGENy通路活性评估 空间转录组数据 4例牙髓组织样本(2例健康个体和2例牙髓炎患者) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium HD 10x Genomics Visium HD空间转录组平台
4 2026-10-15
Diversity and Feature Selectivity of Primate Retinal Ganglion Cells
2026-Sep, Annual review of vision science IF:5.0Q1
综述 该综述总结了灵长类视网膜中宽视野视网膜神经节细胞的多样性及其编码复杂视觉特征的功能 整合单细胞测序和生理学方法,揭示宽视野视网膜神经节细胞的分子标记与功能联系 未涉及具体实验数据,主要基于现有文献的综合分析 综合当前关于灵长类视网膜宽视野视网膜神经节细胞多样性的知识,并强调编码复杂视觉特征的细胞类型 灵长类视网膜中的宽视野视网膜神经节细胞 计算机视觉 NA 单细胞测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-10-15
Study on the Mechanisms of Allogeneic NK Cells Combined with Myeloid Cells in Treating Acute Myeloid Leukemia
2026-Aug, Transplantation and cellular therapy IF:3.6Q1
研究论文 本研究探讨了异基因NK细胞联合髓系细胞治疗急性髓系白血病的机制,发现G-CSF动员后NK细胞直接细胞毒性降低,但可能通过髓系细胞相互作用间接发挥抗肿瘤免疫作用 通过单细胞RNA测序揭示G-CSF动员后NK细胞上调免疫调节、髓系细胞相互作用和趋化因子信号相关基因,配体-受体配对分析提示动员后NK细胞与髓系细胞相互作用增强,特别是C5AR1和CCL5通路 该研究为回顾性分析,NK细胞剂量与生存改善的关联在多变量调整后失去统计学显著性,且髓系细胞相互作用假设需进一步体内研究验证 研究G-CSF动员的NK细胞是否发挥抗肿瘤效应及其潜在机制 72例接受微移植治疗的急性髓系白血病患者,以及8名供者动员前后的NK细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据 72例AML患者,8名供者动员前后的NK细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-10-15
Intestinal FXR deficiency uncouples steatosis protection from liver inflammation and fibrosis in MASH-diet fed mice
2026-Jul-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究在MASH饮食喂养的小鼠模型中探讨了肠道FXR缺失对MASH发展的影响,发现肠道FXR缺失虽能保护小鼠免受肝脂肪变性,但未能阻止肝脏炎症和纤维化的进展 首次揭示肠道FXR缺失可将脂肪变性保护与肝脏炎症和纤维化解耦联,即肠道FXR缺失虽减轻肝脏脂肪变性,却促进了独特的肝脏免疫炎症反应,且未能阻止MASH进展 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;未探讨其他FXR亚型或组织特异性功能的补偿机制 探究肠道FXR缺失对MASH发生发展的影响及其潜在机制 肠道FXR缺陷(FXR KO)小鼠与对照小鼠 机器学习 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
7 2026-10-15
Decoding the Lymphangioleiomyomatosis (LAM) Niche Microenvironment via Integrative Analysis of Single Cell Multiomics and Spatial Transcriptomics
2026-Jun-25, The European respiratory journal
研究论文 该研究通过整合单细胞/单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学,构建了人类淋巴管肌瘤病(LAM)微环境的首个多组学图谱,揭示了LAM细胞异质性、新亚型及空间生态位 首次提供人类LAM生态位微环境的高分辨率多组学蓝图,发现新型成纤维细胞样LAM亚型和LAMi亚状态,揭示LAM相关成纤维细胞(LAF)的两种空间状态及其介导的TGF-β信号和ECM重塑,识别了新的细胞串扰和潜在治疗靶点 摘要中未明确提及研究局限性 解析LAM生态位微环境的细胞异质性和空间结构,以理解疾病进展机制并识别治疗靶点 人类LAM肺组织样本 数字病理学 淋巴管肌瘤病 单细胞/单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA NA
8 2026-10-15
High-resolution spatial transcriptomics of adult and pediatric human liver with Visium HD
2026-Jun-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 该研究利用Visium HD空间转录组技术对成人及儿童健康人肝脏进行高分辨率空间基因表达图谱构建 首次将Visium HD(2 µm分辨率)应用于人类肝脏空间转录组研究,实现了亚细胞分辨率转录本定量,并结合单细胞参考图谱进行细胞类型鉴定 样本量较小,仅纳入三个健康供体样本(两个成人一个儿童),缺乏疾病样本对照 构建高分辨率人类肝脏空间基因表达图谱,揭示肝脏细胞和解剖学异质性 健康人类肝脏组织(两个成人供体和一个儿童供体) 空间转录组学 NA 空间转录组测序 NA 空间转录组数据、图像 3例健康人肝脏供体样本(2例成人,1例儿童) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium HD Visium HD空间转录组技术,2 µm bin宽度,采用8 µm bins进行聚类分析
9 2026-10-15
Hierarchical classification of immune cell transcriptomes at population-scale
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该文章提出了Suco(单细胞通用分类汇编)独立专家注释资源和Compocyte模块化分层分类器,用于群体规模的免疫细胞转录组分类 1. 建立了独立、统一的高分辨率专家注释基准Suco,解决了常规数据整合引入统计依赖性导致模型泛化性膨胀的问题;2. 开发了模块化分层分类器Compocyte,显著优于现有分类器,并支持对模糊注释的专家审查;3. 在50项研究中分类了3965名患者的1560万个白细胞,发现了新的肿瘤相关吸收性巨噬细胞表型、亚临床细胞因子释放综合征中的非经典单核细胞亚型以及转移部位T细胞记忆干性的程序性侵蚀 摘要中未明确提及研究局限性 实现群体规模下免疫细胞转录组的准确分类,建立可推广的框架以揭示人类免疫学规律 50项研究中的1560万个白细胞,来自3965名患者,包括三个新生成的数据集 机器学习 肺癌 single-cell RNA-seq 分层分类器 文本 1560万个白细胞,来自3965名患者,涵盖50项研究 NA single-cell RNA-seq NA NA
10 2026-10-15
Regenerative repair is connected to early and specific structural, immune, and metabolic MSC signatures in adult mammals
2026-06-19, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过对小鼠组织损伤模型进行单细胞RNA测序,鉴定了再生性与非再生性修复中不同的间充质干细胞亚群,并提出了SIM(结构-免疫-代谢)框架来解释MSC在组织修复中的协调作用 在相同发育阶段和遗传背景的成年小鼠模型中系统比较再生性与非再生性修复,识别了不同的再生与非再生MSC亚群,并首次提出SIM框架将MSC行为解释为协调的组织级反应而非孤立的多效性活动集合 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类或其他成年哺乳动物中验证;单细胞RNA测序主要反映转录组水平变化,缺乏蛋白质和功能层面的验证 探究再生性与非再生性修复早期事件中MSC异质性的变化,以及这些变化如何决定修复结果 成年小鼠组织损伤模型中的间充质干细胞(MSCs) 单细胞组学 组织损伤与再生 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-10-15
The Logic of Thalamic Inputs onto the Molecular Taxonomy of Cortical Neurons Reveals a Visual Hierarchy
2026-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 结合顺行跨突触示踪与空间转录组学,揭示小鼠视觉皮层中丘脑输入所靶向的皮层神经元分子与空间身份,并构建细胞层级框架 将顺行跨突触示踪与空间转录组学结合,首次系统解析丘脑不同输入通路在视觉皮层分子细胞类型上的映射规律,提出由细胞类型组成及GABA能/谷氨酸能比例定义的自下而上与自上而下“特征”,并揭示独立于解剖连接的分子层级 研究仅基于小鼠视觉皮层,未验证其他感觉皮层或物种;跨突触示踪可能受标记效率与多级传递影响;空间转录组分辨率可能限制单细胞水平精确解析 探究丘脑自下而上与自上而下的投射如何映射到视觉皮层分子细胞分类,并建立皮层层级的细胞框架 小鼠视觉皮层及丘脑核团中的神经元 空间转录组学, 神经科学 NA 顺行跨突触示踪, 空间转录组学 NA 空间转录组数据, 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
12 2026-10-15
A method utilizing chemical carcinogens and a Western diet to reliably induce advanced hepatocellular carcinoma in male and female mice
2026-Jun-09, Cancer & metabolism IF:6.0Q1
研究论文 本研究开发了一种结合化学致癌物和西方饮食的方法,能在雄性和雌性小鼠中可靠诱导晚期肝细胞癌 该方法能在100%的雄性小鼠和96%的雌性小鼠中诱导2-3期肝细胞癌,且死亡率低,并具有与人类肝细胞癌相似的基因和蛋白质标志物 未提及 创建一种简单、可耐受且可靠的方法,利用化学致癌物和西方饮食在雄性和雌性小鼠中诱导晚期肝细胞癌 雄性小鼠和雌性小鼠 机器学习 肝癌 空间转录组学,蛋白质组学,免疫印迹 NA 图像,文本 雄性小鼠和雌性小鼠,研究周期30周 NA 空间转录组学,蛋白质组学 NA NA
13 2026-10-15
Comprehensive single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and immune interactions in colorectal cancer
2026-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术对结直肠癌组织中的18,741个细胞进行综合分析,揭示了肿瘤细胞的异质性、免疫细胞亚群分化特征及其与患者预后的关系 构建了基于C3亚型T_NK细胞标志物与年龄相关基因联合的预后模型,并通过多种免疫算法(ESTIMATE、CIBERSORT、Xcell)系统解析了CRC肿瘤免疫微环境,结合TMB分析揭示了不同风险组之间的差异模式 样本量有限,仅分析了18,741个单细胞,未进行大规模多中心验证;预后模型需要进一步的前瞻性临床验证 揭示结直肠癌的细胞异质性和免疫相互作用,开发预后模型以支持靶向和个性化治疗 结直肠癌组织样本中的单细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 CytoTRACE, Monocle, GSVA, ssGSEA, ESTIMATE, CIBERSORT, Xcell 图像, 文本 18,741个单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-10-15
Endothelial MerTK impairment promotes cardiac dysfunction in the condition of high fat diet
2026-Jun, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了内皮细胞MerTK在高脂饮食条件下调控心脏功能障碍的新作用 首次揭示内皮细胞MerTK损伤是促进心脏功能障碍的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 研究内皮细胞MerTK在高脂饮食条件下调控心脏功能障碍的新作用 MerTK内皮细胞特异性敲除小鼠(MerTKflox/floxTie2Cre)及其同窝对照小鼠(MerTKflox/flox),以及扩张型心肌病和肥厚型心肌病患者标本 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,单核RNA测序,蛋白质组学 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序,蛋白质组学 NA NA
15 2026-10-15
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-05-28, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本文通过整合12种癌症类型的空间转录组数据构建泛癌三级淋巴结构(TLS)图谱,并训练人工智能框架从H&E图像预测TLS成熟状态 构建了泛癌TLS空间图谱,揭示了TLS成熟过程中微环境细胞群的重塑和距离依赖性梯度变化,并开发了能直接从H&E染色图像预测TLS成熟状态的人工智能框架,提出了成熟度感知的复合评分用于患者分层 摘要中未明确提及研究局限性 全面定义三级淋巴结构在多种癌症中的空间组织、成熟状态及临床相关性,并开发可扩展的TLS分析方法 12种癌症类型的肿瘤组织样本 数字病理学 泛癌 空间转录组学, 超高通量单细胞空间分析 人工智能框架(具体模型类型未明确) 图像, 空间转录组数据, H&E染色图像 12种癌症类型的空间转录组数据,TCGA队列及独立治疗队列 NA 空间转录组学 NA NA
16 2026-10-15
A single-cell atlas of Toxoplasma sexual development in the feline intestinal tract
2026-May, Nature microbiology IF:20.5Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组学解析了弓形虫在猫肠道中的有性发育过程,并鉴定了调控大配子体发育的关键基因AP2X6 首次对猫肠道内弓形虫进行单细胞转录组测序,结合荧光报告菌株和流式分选,发现了罕见的配子体细胞群,并通过CRISPR-Cas9扰动测序鉴定了AP2X6作为大配子体发育的调控因子 样本量有限(15,068个细胞,2个实验),可能未完全覆盖弓形虫有性发育的所有阶段和细胞类型,且体外验证尚不充分 揭示驱动弓形虫在猫肠道中有性发育的基因调控网络 猫肠道中分离的弓形虫(Toxoplasma gondii)虫体 单细胞组学 弓形虫病 单细胞转录组测序, CRISPR-Cas9扰动测序 NA 单细胞转录组数据, 图像 15,068个细胞,来自2个实验 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'转录组测序,结合流式细胞术分选荧光报告菌株
17 2026-10-15
Enhancer-directed gene delivery for digit regeneration based on conserved epidermal factors
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究利用具有高再生能力物种的保守表皮因子,设计了一种增强子导向的基因递送平台,用于促进小鼠指端再生 利用斑马鱼尾鳍再生单细胞RNA测序数据,结合蝾螈肢体和小鼠指端再生表达数据,鉴定SP转录因子家族为保守的表皮表达附属器再生介质,并设计了基于斑马鱼组织再生增强子元件的增强子导向基因递送平台 摘要中未明确提及研究局限性 设计增强子导向的基因递送平台,以触发内源性再生程序,解决肢体缺失的临床挑战 斑马鱼尾鳍、蝾螈肢体、小鼠指端 再生医学 肢体缺失 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体基因递送、条件性基因敲除 NA 基因表达数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
18 2026-10-15
Immune modulation promotes heart regeneration through macrophage and Granulin functions in medaka
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究利用青鳉鱼模型,通过poly I:C免疫调节、bulk与单细胞转录组及功能实验,揭示巨噬细胞和Granulin A促进心脏再生的机制 首次在非再生性青鳉鱼中证明TLR3激动剂poly I:C可通过加速巨噬细胞依赖的碎片清除和炎症消退促进心脏修复,并鉴定出表达granulin a的再生相关巨噬细胞亚群及重组Granulin A的促再生功能 研究基于青鳉鱼模型,其结果向哺乳动物尤其是人类心脏再生的转化适用性仍需进一步验证 探究免疫调节如何加速青鳉鱼心脏修复,并阐明巨噬细胞及Granulin在心脏再生中的作用 青鳉鱼(medaka)心脏损伤模型及富集的髓系细胞群 单细胞转录组学,空间转录组学,免疫学,再生医学 心肌梗死,心血管疾病 bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,杂交链式反应(HCR)空间分析,功能实验 NA 转录组数据,图像数据 NA NA bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq,spatial transcriptomics NA NA
19 2026-10-15
TGFβ signaling promotes cell cycle progression and resistance to the CDK4/6 inhibitor palbociclib through SOX4 transcriptional modulation in breast cancer cells
2026-Feb-04, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文研究了TGFβ信号通过SOX4转录调控促进乳腺癌细胞周期进展和对CDK4/6抑制剂palbociclib耐药的作用机制 揭示了TGFβ通过SMAD3与SOX4相互作用共激活下游靶基因,促进细胞周期进展和CDK4/6抑制剂耐药的新型致癌功能 研究主要基于3D培养模型和单细胞RNA-seq数据,缺乏体内动物实验验证 解析TGFβ诱导的染色质转录响应,探究其在乳腺癌进展中的致癌作用机制 等基因人乳腺上皮细胞MCF-10A(MI)及其HRAS转化对应物(MII)3D培养模型,以及原发性乳腺肿瘤 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA-seq, 染色质可及性测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-10-15
Single-cell omics in investigating the effect of CAFs with KRAS overexpression on the malignant progression of anaplastic thyroid cancer
2026-02-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA IF:1.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞(CAFs)对未分化甲状腺癌(ATC)恶性生物学行为的影响及其分子机制 首次通过单细胞RNA测序揭示了KRAS在ATC中成纤维细胞亚群(Fib_KRAS+)的高表达特征,且该亚群在甲状腺乳头状癌中不表达,并证实KRAS过表达的CAFs通过激活RAS/RAF/MAPK信号通路促进ATC恶性进展 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;单细胞RNA测序样本量有限;未深入探讨KRAS抑制剂BI-2865在临床中的应用可行性 揭示KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞对未分化甲状腺癌恶性生物学行为的影响及其分子机制 未分化甲状腺癌(ATC)及甲状腺乳头状癌(PTC)中的成纤维细胞和癌细胞 digital pathology thyroid cancer scRNA-seq, Western blot, colony formation assay, EdU staining, Transwell, Annexin V-FITC/PI staining NA text, image NA NA single-cell RNA-seq NA NA
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