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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-10-10
Mapping the Immune cell-specific gene regulatory network in bipolar disorder: A framework from scTWMR to exploratory drug-target annotation
2026-Dec, Psychiatry research IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组范围孟德尔随机化(scTWMR)与共定位分析,揭示了双相情感障碍中免疫细胞特异性基因表达的调控网络,并进行了探索性药物靶点注释 首次将单细胞转录组范围孟德尔随机化(scTWMR)与共定位分析相结合,系统性地解析双相情感障碍中特定免疫细胞亚型的基因表达与疾病的因果关系,并发现新的细胞类型特异性治疗靶点 研究为探索性分析,药物靶点注释仅为初步提名,需要进一步的实验验证和临床研究来确认所提名化合物的有效性和安全性 系统阐明特定免疫细胞亚型中基因表达与双相情感障碍之间的因果关系,并构建免疫细胞特异性基因调控网络以指导药物靶点发现 双相情感障碍患者及对照人群的免疫细胞(包括14种不同免疫细胞类型),基于41,917例病例和371,549例对照的GWAS汇总统计数据 机器学习 双相情感障碍 scTWMR、cis-eQTL分析、共定位分析、GWAS、PheWAS、PPI网络分析 孟德尔随机化模型 文本、基因表达数据、GWAS汇总统计数据 41,917例病例和371,549例对照的GWAS汇总统计数据,以及14种不同免疫细胞类型的cis-eQTL数据 NA 单细胞转录组、bulk RNA-seq NA NA
2 2026-10-10
Association of environmental xylene exposure with diabetic kidney disease: a cross-sectional analysis and multi-omics evaluation of immune microenvironment mechanisms
2026-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 结合NHANES横断面分析和多组学方法,探讨环境二甲苯暴露与糖尿病肾病(DKD)的关联及其免疫微环境机制 首次将环境污染物二甲苯暴露与DKD免疫微环境联系起来,通过多组学整合分析(网络毒理学、批量转录组、单细胞RNA测序和分子对接)揭示了二甲苯可能通过ITGAM、CSF1R和CTSS受体促进M2样巨噬细胞极化和纤维化重塑的环境-免疫轴假说 研究为横断面设计,无法确定因果关系;机制假说主要基于生物信息学分析和分子对接预测,缺乏实验验证;样本来源为公共数据库,可能存在批次效应和人群代表性限制 评估尿液VOC代谢物与DKD患病率的关联,并通过多组学方法探索二甲苯暴露影响DKD免疫微环境的潜在分子机制 NHANES数据库中的参与者(尿液VOC代谢物与DKD关联分析)、GSE142025批量转录组数据、GSE209781单细胞RNA测序数据 机器学习 糖尿病肾病 bulk transcriptomics, single-cell RNA sequencing, network toxicology, molecular docking NA 文本, 图像 NHANES数据库参与者(具体人数未在摘要中说明);GSE142025和GSE209781公共数据集样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
3 2026-10-10
An imputation method for single-cell RNA sequencing data based on a parallel gated recurrent unit neural network
2026-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
研究论文 该文提出了一种基于并行门控循环单元神经网络的单细胞RNA测序数据插补方法IPGRU,用于恢复dropout事件中丢失的基因表达信号 将原始多特征预测问题重构为多个单特征预测任务,大幅降低插补过程复杂度,并利用GRU隐藏状态建模基因表达模式来预测dropout事件 摘要中未明确提及该方法的局限性 准确插补scRNA-seq数据中的dropout事件,恢复真实表达信号,提高下游分析的可靠性 单细胞RNA测序数据中的dropout事件及基因表达值 机器学习 NA 单细胞RNA测序 GRU 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-10-10
From beta-cell stress to tertiary lymphoid structure formation: a stage-dependent framework for interpreting type 1 diabetes progression
2026-Nov, Diabetes research and clinical practice IF:6.1Q1
综述 本文综述了β细胞应激在1型糖尿病中可能先于免疫激活的作用,并提出了一个阶段依赖的概念框架,将β细胞应激、先天免疫激活和三级淋巴结构形成联系起来 提出了β细胞内在应激先于免疫激活的替代解释,并整合了内质网应激、线粒体功能障碍和cGAS-STING信号通路在MHC I类分子上调、趋化因子产生和三级淋巴结构形成中的作用,构建了阶段依赖的T1D进展框架 直接证明人类中β细胞应激先于免疫浸润的证据仍然有限 综合实验模型、人类胰岛研究和空间转录组学分析,提出一个解释1型糖尿病发病机制并指导未来转化研究的整合框架 1型糖尿病中的β细胞应激、免疫激活和三级淋巴结构 数字病理学 1型糖尿病 空间转录组学 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
5 2026-10-10
Active ion transport in the gill of the estuarine bivalve Crassostrea hongkongensis under salinity stress: molecular evidence from homologs of typical ion transporters NKAα, NKCC1 and NHE3
2026-Nov, Comparative biochemistry and physiology. Part A, Molecular & integrative physiology
研究论文 通过单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交、多重免疫荧光和RNA干扰等技术,研究了香港牡蛎鳃在盐度胁迫下离子转运蛋白同源物CHNKAα、CHNKCC1和CHNHE3的分子特征和功能 首次在双壳贝类中揭示了不同于硬骨鱼模式的分布式、灵活的鳃上皮细胞离子转运网络,发现CHNKAα主要定位基底膜而CHNKCC1呈顶部定位这一 unusual 的膜分布模式 摘要中未明确提及研究局限性 探究海洋双壳贝类作为渗透顺应者是否通过主动转运无机离子来应对渗透压胁迫 香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)的鳃组织 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交, 多重免疫荧光, RNA干扰 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-10-10
Inducing CD8+ Tregs Limits Atherosclerosis via Notch-Mediated VSMC Quiescence
2026-Oct-09, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析人类动脉粥样硬化斑块中免疫细胞与血管平滑肌细胞的通讯,并在小鼠模型中验证CD8+ Tregs通过Notch信号通路诱导VSMC静止从而限制动脉粥样硬化 首次揭示了CD8+ T细胞通过CD8α与VSMC通讯并抑制Notch信号促进动脉粥样硬化,发现CD8+CD44+CD122+ Tregs通过IL-10激活VSMC Notch信号、抑制VSMC增殖和转分化,并阐明Notch-RBPJ-Hes1-EZH2-H3K27me3表观遗传调控机制,提出CD8+ Treg-Notch轴作为动脉粥样硬化的新治疗靶点 摘要中未明确提及研究局限性 探究CD8+ T细胞如何影响血管平滑肌细胞以及CD8+调节性T细胞的保护作用和体内诱导策略 人类动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序数据、AAV-Pcsk9或Apoe-/-动脉粥样硬化小鼠模型、CD45.1+CD8+ T细胞过继转移的CD45.2+Apoe-/-小鼠、Myh11CreER;Rbpjfl/fl;Apoe-/-小鼠、Myh11CreER;Rosa26YFP;Apoe-/-小鼠 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、染色质免疫共沉淀测序 NA 单细胞RNA测序数据、ChIP-seq数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-10-10
SLC39-driven zinc influx orchestrates pleiotropic tumor-immune system cross-talk to establish immune suppression in colorectal cancer
2026-Oct-09, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该研究通过整合多组学、单细胞转录组学、空间分析和功能实验,揭示了SLC39驱动的锌流入通过CDX2-CD24-SIGLEC10轴介导结直肠癌免疫抑制的机制。 首次发现SLC39驱动的锌流入通过CDX2远端增强子诱导CD24表达,进而与SIGLEC10+巨噬细胞形成空间生态位,重塑肿瘤免疫微环境,并建立了一个预测免疫治疗反应的七基因特征。 研究主要基于相关性分析和体外功能实验,锌流入调控CDX2的具体分子机制及体内验证仍需进一步探索。 探究营养转运系统如何重编程肿瘤-免疫细胞相互作用,特别是锌转运在结直肠癌免疫抑制中的作用。 258例结直肠癌患者的多组学数据及结直肠癌细胞系和免疫细胞。 数字病理学,机器学习 结直肠癌 批量多组学,单细胞转录组学,空间分析,功能实验 NA 图像,文本 258例结直肠癌患者 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 NA NA
8 2026-10-10
Heat shock pathway activation by TRC051384 protects spiral ganglion neurons from noise-induced hearing loss
2026-Oct-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过RNA-seq和空间转录组学揭示了噪声暴露诱导螺旋神经节神经元中内质网伴侣和蛋白酶体亚基的短暂上调,并发现Hsf1激活剂TRC051384可保护小鼠免受噪声性听力损失 首次发现噪声暴露后螺旋神经节神经元中发生蛋白质毒性应激反应,并证明药理学激活HSF1可作为一种有前景的噪声性听力损失治疗策略 研究仅在小鼠模型中进行,TRC051384的长期安全性和临床转化潜力尚需进一步验证 探究噪声暴露诱导的细胞应激反应机制,并评估HSF1激活剂TRC051384对噪声性听力损失的保护作用 小鼠耳蜗突触病模型中的螺旋神经节神经元及其支持细胞 转录组学 听力损失 RNA-seq,空间转录组学 NA 转录组数据,空间转录组数据 NA NA bulk RNA-seq,空间转录组学 NA NA
9 2026-10-10
Time-restricted feeding reverses kidney fibrosis through reducing CD8+ T cell infiltration in obese mice
2026-Oct-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究探讨了限时进食通过减少肥胖小鼠肾脏CD8+ T细胞浸润来逆转肾脏纤维化的机制 首次揭示限时进食通过减少从小肠迁移的CD8+ T细胞浸润及其特定耗竭/活化基因高表达亚群来逆转肥胖小鼠肾脏纤维化 研究仅基于饮食诱导肥胖小鼠模型,未在人类中验证,且未全面阐明TRF调控CD8+ T细胞迁移和浸润的分子机制 探究限时进食能否通过减轻T细胞炎症来改善肥胖小鼠的肾脏纤维化 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠模型及其肾脏组织、CD8+ T细胞 单细胞组学 肾脏纤维化, 肥胖 单细胞RNA测序, 空间分析, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-10-10
Fracture healing requires proliferation of callus cells at early and mature stages of osteoblast differentiation
2026-Oct-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究通过基因敲除小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了骨折愈合过程中骨痂细胞在成骨细胞分化早期和成熟阶段的增殖对矿化骨痂形成和骨折愈合的关键作用 首次系统性地在不同成骨细胞分化阶段(早期和成熟阶段)特异性敲除增殖的骨系细胞,结合单细胞RNA测序技术,证明骨痂细胞在成骨细胞分化的早期和成熟阶段的增殖对骨折愈合至关重要 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类骨折样本中验证;未深入探讨不同阶段增殖细胞的具体分子调控机制 解析增殖性成骨细胞谱系细胞在骨折骨痂形成中的贡献 小鼠骨折模型中的骨痂细胞,包括成骨细胞、软骨细胞、肌成纤维细胞和免疫细胞等 单细胞组学 骨折 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-10-10
Histone H4K5 lactylation-driven feedback loop modulates glycerol-linked immunosuppressive activity of tumor-associated T regulatory cells
2026-Oct-08, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞分析和空间转录组学,揭示了结直肠癌肝转移灶中CD177+GK+调节性T细胞亚群通过甘油代谢和组蛋白H4K5乳酰化形成的正反馈环路增强免疫抑制活性的机制 首次鉴定出CD177+GK+ Treg细胞亚群在结直肠癌肝转移灶中富集,揭示了甘油来源的乳酸通过促进H4K5组蛋白乳酰化上调FOXP3和GK表达形成正反馈环路的新机制,并发现转移微环境中GK Treg克隆的选择性克隆扩增现象 摘要中未明确提及研究的具体局限性 探究结直肠癌肝转移中不同营养微环境如何塑造肿瘤免疫景观,以及甘油代谢和组蛋白乳酰化在Treg介导的免疫逃逸中的作用 结直肠癌肝转移患者的自体样本及泛癌种样本中的肿瘤相关调节性T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞分析,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
12 2026-10-10
BRD8 deficiency leads to progressive impairment of spermatogenesis in mice
2026-Oct-08, Journal of cell science IF:3.3Q3
研究论文 该研究通过生殖细胞特异性Brd8敲除小鼠模型,揭示BRD8缺失导致精子发生进行性损伤及其对雄性生育力的影响 首次在体内系统研究BRD8在正常睾丸生理功能中的作用,发现其缺失导致生殖细胞分化的进行性缺陷,并通过单细胞转录组揭示精原细胞和精母细胞的转录改变及内皮微环境的继发性重塑 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;未深入探讨BRD8调控的具体分子机制及其下游靶基因 探究BRD8在雄性生殖中的生理功能及其在精子发生中的作用 生殖细胞特异性Brd8敲除小鼠的睾丸组织及生殖细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-10-10
Targeting hypoxia-driven histone lactylation in myeloid cells synergizes with CD137 agonism to expand effector-like exhausted CD8+ T cells in glioblastoma
2026-Oct-08, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示了缺氧通过组蛋白乳酸化重编程髓系细胞抑制CD8+ T细胞,并证明低剂量阿西替尼联合CD137激动剂可扩增效应样耗竭CD8+ T细胞,改善胶质母细胞瘤治疗效果。 首次揭示缺氧驱动髓系细胞组蛋白乳酸化介导免疫抑制,并提出靶向髓系细胞缺氧-乳酸化联合CD137激动剂的双重免疫治疗策略。 研究主要基于小鼠胶质母细胞瘤模型,临床样本验证有限,联合治疗的毒性和最佳剂量尚未系统评估。 探究缺氧如何塑造胶质母细胞瘤免疫微环境并限制CD8+ T细胞应答,以及联合靶向髓系细胞和CD137能否克服免疫治疗耐药。 小鼠胶质母细胞瘤模型(SB28、CT2A)及胶质母细胞瘤患者样本 肿瘤免疫学、单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、免疫表型分析、功能分析 NA 单细胞RNA测序数据、免疫表型数据 两种小鼠胶质母细胞瘤模型及患者样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-10-10
Transplantation of endothelial progenitor cells attenuates pulmonary fibrosis via IFITM3-containing exosomes
2026-Oct-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究发现了共表达c-KIT和FOXF1的肺毛细血管内皮祖细胞(capEPCs),并证明其移植或递送含IFITM3的外泌体可减轻肺纤维化 首次鉴定出成年人和小鼠肺中共表达c-KIT和FOXF1的capEPCs群体,揭示其在肺纤维化中的减少,并发现IFITM3是capEPCs中高度富集的转录本,含IFITM3的外泌体可重现capEPC移植的治疗效果 摘要中未明确提及研究局限性 探究内皮祖细胞在肺纤维化中的作用及其治疗潜力 成年人和小鼠肺组织、肺纤维化患者、博来霉素损伤小鼠、capEPCs、外泌体 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-10-10
Innate allorecognition induces HSP70 in monocytes contributing to renal allograft rejection
2026-Oct-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该文章通过分析单细胞RNA测序数据,发现同种异体刺激后单核细胞中HSP70编码基因Hspa1a上调,并在小鼠移植模型和肾活检数据中验证HSP70在先天同种异体识别和移植排斥中的作用。 首次揭示先天同种异体识别诱导单核细胞表达HSP70,并证明靶向HSP70可减轻慢性肾脏移植物排斥。 摘要未明确说明样本量、具体平台信息及潜在机制细节,需要进一步研究。 探究先天同种异体识别后单核细胞的转录变化及HSP70在移植排斥中的作用。 小鼠模型(WT、Hspa1a/Hspa1b-/-、DSG处理B6小鼠)和人类肾脏活检样本。 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-10-10
Latexin deletion in the bone marrow niche suppresses leukemia via LIFR downregulation and immune activation
2026-Oct-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过MLL-AF9诱导的AML小鼠模型,揭示骨髓微环境中Latexin缺失通过下调LIFR信号通路并激活免疫反应来抑制白血病 首次发现Latexin在骨髓微环境中对白血病发生具有外在调控功能,并阐明其通过LIFR-CXCL9轴招募CD8 T细胞增强抗白血病免疫的机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类AML患者中验证Latexin靶向治疗的临床可行性 探究骨髓微环境中Latexin对白血病干细胞和白血病发生的影响及其分子机制 MLL-AF9诱导的急性髓系白血病小鼠模型、骨髓微环境基质细胞 机器学习, 数字病理学 肺癌, 前列腺癌, 心血管疾病, 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 文本, 图像 野生型和Lxn基因敲除小鼠的骨髓基质细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
17 2026-10-10
Spatio-temporal expression of E-cadherin mediates trophoblast lineage transitions during human placentation
2026-Oct-08, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文综述了E-cadherin在人类胎盘形成过程中时空动态表达及其调控滋养层细胞谱系分化的作用 提出E-cadherin在滋养层亚群中呈动态波动表达而非静态结构连接,并系统阐述其在绒毛通路和绒毛外通路中的差异化调控机制 文章主要为描述性综述,缺乏功能性机制研究,未明确E-cadherin在滋养层谱系中的精确细胞内降解途径及上游调控网络 阐明E-cadherin时空表达在人类胎盘形成过程中介导滋养层谱系转换的机制,并指出未来研究方向 人类滋养层细胞谱系,包括细胞滋养层细胞、合体滋养层、绒毛外滋养层及血管内滋养层 数字病理学 妊娠相关疾病 空间转录组学 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
18 2026-10-10
Monocyte-derived pro-angiogenic ocular macrophages identified by spatial transcriptomics are essential for choroidal neovascularization
2026-Oct-08, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
19 2026-10-10
Serval: A modular framework for decoding imaging based spatial transcriptomics data
2026-Oct-07, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了Serval,一个用于开发和基准测试多种空间转录组平台上解码方法的模块化框架,并基于该框架开发了新的解码方法CoSiD 提出了模块化框架Serval,将关键解码阶段分离为可独立配置的模块;开发了CoSiD(余弦相似度解码器),通过优化与已知条形码的余弦相似度来提高转录本恢复率;证明了该框架可推广到MERFISH以外的平台(DART-FISH) 目前仅在合成数据和MERFISH、DART-FISH真实数据集上进行了验证,尚未在其他空间转录组平台上广泛评估 为基于成像的空间转录组学数据开发模块化解码框架,并系统性地基准测试不同的解码方法 MERFISH和DART-FISH空间转录组学数据集(包括合成数据和真实数据),以及人初级运动皮层等生物组织 数字病理学, 计算机视觉 NA 空间转录组学, MERFISH, DART-FISH 余弦相似度解码器 (CoSiD) 图像 NA NA 空间转录组学 MERFISH, DART-FISH 基于成像的空间转录组学平台,通过荧光模式重建条形码并映射到基因身份
20 2026-10-10
Mapping the Tissue Architecture and Endothelial-PEC Network in HAML Using Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Oct-07, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 该研究整合单核RNA测序和空间转录组学技术,对三例散发性肝血管平滑肌脂肪瘤(HAML)样本进行分析,构建了HAML的空间多组学图谱,揭示了PEComa亚群的异质性及其与内皮细胞的信号网络 首次将单核RNA测序与空间转录组学整合应用于HAML研究,构建了HAML的空间多组学图谱;发现了内皮细胞与PEComa亚群之间的高度相似性及潜在转化轨迹;鉴定出内皮来源的PDGFD-PDGFRB旁分泌信号轴及其下游Ras级联通路维持PEComa自噬流的新型补偿性生存机制 仅基于三例散发性HAML样本,样本量较小;缺乏体内功能命运图谱和扰动实验验证,PDGFD-PDGFRB信号轴的功能需进一步实验证实 解析HAML独特的空间微环境及其特异性进展机制,为HAML发病机制提供新的空间框架并寻找潜在治疗靶点 三例散发性肝血管平滑肌脂肪瘤(HAML)样本 数字病理学 肝癌 单核RNA测序,空间转录组学 NA 图像,文本 3例散发性HAML样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
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