单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 45138 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-02 |
Amygdala Oligodendrocyte MDH1 Dysregulation and Mitochondrial Dysfunction in High Urea-Induced Anxiety-Like Behavior
2027-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70254
PMID:42965298
|
研究论文 | 该研究通过snRNA-seq、行为学测试和细胞实验，揭示高尿素通过下调少突胶质细胞MDH1表达和线粒体功能障碍诱导焦虑样行为的代谢-胶质细胞机制 | 首次将尿素毒性、少突胶质细胞谱系分化、MDH1代谢失调和线粒体生物能量障碍联系起来，提出代谢-胶质细胞模型解释CKD相关焦虑；发现OAA补充可部分恢复MDH1表达并缓解焦虑样行为 | 研究主要基于UT-B/小鼠模型和MO3.13细胞系，样本来源有限；未明确少突胶质细胞亚群变化与焦虑行为的直接因果关系；OAA补充仅部分恢复表型，机制尚未完全阐明 | 探究高尿素对杏仁核少突胶质细胞谱系动态分化的影响及其在CKD相关焦虑样行为中的作用机制 | 野生型小鼠和高尿素UT-B/小鼠的杏仁核组织，以及MO3.13少突胶质细胞系 | 数字病理学, 机器学习 | 焦虑症, 慢性肾脏病, 心血管疾病 | 单核RNA测序, 行为学测试, 细胞实验 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | 野生型和高尿素UT-B/小鼠的杏仁核组织样本（具体数量未在摘要中说明），以及MO3.13细胞系 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-11-02 |
DSSMST: A Deterministic State Space Model for Self-Supervised Spatial Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Dec, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11441-y
PMID:42507063
|
研究论文 | 提出一种用于空间转录组自监督空间域识别的确定性状态空间模型DSSMST | 引入确定性状态空间模型（DSSM）动态建模空间梯度变化和连续依赖，克服静态图方法的局限，并结合定制自监督对比学习细化潜在嵌入空间以区分细微空间域特征 | 摘要未明确说明方法局限性 | 准确识别复杂高维空间转录组数据中的功能区域（空间域） | 多个代表性空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 确定性状态空间模型（DSSM）、图神经网络（GNN）、对比学习 | 空间转录组数据 | 多个代表性空间转录组数据集（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-02 |
Early-life exposure to environmental pollutants and endocrine disruptors: emerging risks and mechanistic insights in maternal, fetal, and child health
2026-Dec-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125878
PMID:42869363
|
综述 | 本文综述了生命早期暴露于环境污染物和内分泌干扰物对母体、胎儿和儿童健康的影响，涵盖暴露途径、生物监测方法、胎盘机制、分子与表观遗传修饰，以及多组学、单细胞测序等新技术在暴露评估和机制研究中的应用 | 强调暴露组学与系统生物学、纵向流行病学方法结合，突出生命历程视角和环境正义，并总结了胎盘作为评估胎儿暴露和发育编程的生物标志物矩阵的价值 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且未对现有研究方法进行系统性定量评估 | 总结生命早期环境污染物和内分泌干扰物暴露对母体、胎儿和儿童健康的风险及机制，并探讨暴露评估、预防措施和政策框架的最新进展 | 孕妇、胎儿和儿童 | 环境健康与暴露组学 | 神经发育障碍, 代谢功能障碍, 内分泌异常, 生殖损伤 | 暴露组学, 高分辨率质谱, 生物监测, 被动采样, 多组学, 单细胞测序, 空间生物学, 微生物组研究 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-11-02 |
Transcription factors in liver fibrosis: Mechanistic insights and nanotechnology‑driven therapeutic strategies (Review)
2026-Dec, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.6020
PMID:42924606
|
综述 | 本文综述了转录因子在肝纤维化中的调控机制，以及纳米技术驱动的精准抗纤维化治疗策略 | 系统整合了单细胞组学、空间转录组学和表观基因组学揭示的细胞类型特异性转录因子网络，并探讨了纳米载体递送核酸、通路抑制剂和表观遗传调节剂以实现转录因子精准调控的策略 | 纳米递送系统仍面临生物相容性、靶向效率和临床转化等挑战，且综述主要基于临床前研究，缺乏临床验证数据 | 总结转录因子介导的肝纤维化调控机制及纳米技术治疗策略，并展望精准抗纤维化治疗的未来方向 | 肝纤维化相关的肝细胞、肝星状细胞、Kupffer细胞、肝窦内皮细胞和胆管上皮细胞，以及相关转录因子网络 | 数字病理学、单细胞组学、空间转录组学 | 肝纤维化、慢性肝病 | 单细胞组学、空间转录组学、表观基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞组学、空间转录组学、表观基因组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-11-02 |
T-cell states in aortic dissection: from molecular immune profiling toward causal and translational validation
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2753327
PMID:42956058
|
综述 | 该综述系统评估了主动脉夹层中T细胞状态的人体与实验证据，区分描述性分析与因果推断，并提出未来研究方向 | 按疾病阶段、组织区室、功能验证、T细胞特异性和干预时机对证据进行分层评估，明确区分单细胞/TCR谱分析提供的候选T细胞状态与因果证据，并提出亚急性期作为研究窗口 | 现有证据多为横断面研究且获取于临床发病之后，缺乏抗原特异性、直接主动脉壁细胞毒性、Treg抑制功能受损及T细胞介导主动脉壁损伤的直接证据 | 评估T细胞反应在主动脉夹层中是否参与血管损伤或仅反映发病后免疫激活，区分描述性免疫谱分析与支持因果及转化推断的证据 | 主动脉夹层患者及实验模型中的T细胞 | 免疫学、单细胞组学、转化医学 | 主动脉夹层、心血管疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞受体谱分析 | NA | 文本（文献证据综述） | NA | NA | single-cell RNA-seq, TCR profiling | NA | NA |
| 6 | 2026-11-02 |
Comprehensive approach to characterize the circuit between the E and the MVL concerned with visual processing in the avian pallium
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117356
PMID:42964836
|
研究论文 | 该文通过病毒示踪、单细胞RNA测序、电生理和三维重建等技术，全面解析了鸽子端脑内E与MVL两个视觉处理区域之间的双向神经环路连接 | 首次综合运用病毒示踪、单细胞转录组和电生理手段系统刻画鸟类端脑E与MVL之间的双向环路，揭示E→MVL连接占主导地位，并发现MVL神经元具有更延长的感受野及SATB2阳性投射神经元的树突棘特征 | 研究仅基于鸽子单一物种，样本量较小，单细胞RNA测序数据的配体-受体互作分析（NeuronChat）属于计算预测，尚需功能实验验证 | 阐明鸟类端脑内端层（E）与腹外侧中皮层（MVL）之间与视觉处理相关的神经环路组织方式 | 鸽子（Columba livia）端脑中的端层（E）和腹外侧中皮层（MVL）区域 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞RNA测序、电生理记录、免疫组化、三维重建 | NA | 图像、文本（基因表达数据）、电生理信号 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-11-02 |
Alveolar type 2 cell dysfunction is associated with bile acid alterations in experimental hepatopulmonary syndrome
2026-Nov-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag067
PMID:42048159
|
研究论文 | 该研究探索了实验性肝肺综合征中肺泡2型细胞功能障碍与胆汁酸变化之间的关联 | 揭示了胆汁酸水平升高与AT2细胞生物学改变（包括表面活性物质表达减少）之间的关联，并发现FXR激动剂可恢复SP-C生成AT2细胞 | 研究为动物实验，机制尚未完全阐明，需要进一步研究胆汁酸信号与AT2细胞完整性的具体机制 | 研究实验性肝肺综合征中肺泡功能、细胞类型及胆汁酸变化的作用 | CBDL小鼠模型和MLE12细胞 | 数字病理学 | 肝肺综合征 | RiboTag RNA测序, 单细胞RNA测序, 质谱胆汁酸分析 | NA | RNA测序数据, 质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-11-02 |
Mendelian randomization and single-cell transcriptomics prioritize CD7 and LAPTM5 in primary Sjögren's disease: an integrative multi-omics analysis
2026-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08438-8
PMID:42821046
|
研究论文 | 该文整合单细胞转录组、批量转录组、全血eQTL、孟德尔随机化和共定位分析，结合RT-qPCR，识别并优先排序了原发性干燥综合征的候选基因CD7和LAPTM5 | 首次将孟德尔随机化、共定位分析与单细胞转录组整合用于原发性干燥综合征候选基因优先排序；提出乳酰化相关基因集评分作为探索性分析；在pSD外周血中表征了巨核细胞/血小板样细胞群 | 乳酰化相关基因集评分依赖方法且经文库复杂度校正后缺乏稳健的细胞类型特异性；RT-qPCR样本量小且差异无统计学显著性；遗传关联基于电子健康记录表型的名义关联；缺乏疾病相关组织的直接实验验证 | 整合多组学数据识别原发性干燥综合征的候选基因并探索乳酰化修饰在其发病中的潜在作用 | 原发性干燥综合征患者及对照的外周血单个核细胞、全血样本和单细胞转录组数据 | 多组学整合分析、遗传学、单细胞转录组学 | 原发性干燥综合征、自身免疫性疾病、干燥综合征 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、eQTL分析、孟德尔随机化、共定位分析、RT-qPCR | 孟德尔随机化模型、共定位分析、五种基因集评分算法 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、全血eQTL数据、电子健康记录表型数据、RT-qPCR数据 | 单细胞数据10名供者；全血GSE51092队列190例患者和32例对照；RT-qPCR 10例患者和10例对照；乳酰化相关基因集332条文献条目代表330个独特基因 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-11-02 |
Global landscape of clinical trials and therapeutic targets in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: an integrative multi-omics analysis
2026-Nov, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-026-02991-4
PMID:42645756
|
研究论文 | 整合全球临床试验数据与多组学证据，评估MASLD的治疗策略、靶点分布、组织特异性安全性及不同疾病阶段的表达模式 | 将全球MASLD临床试验格局与多组学靶点表征相结合，综合组织特异性、疾病相关表达变化、蛋白表达证据、可成药性和转化证据对候选靶点进行优先级排序 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 整合全球临床试验数据与多组学证据，评估MASLD治疗策略、靶点分布、组织特异性安全性及跨疾病阶段表达模式，为靶点优先级排序、安全性评估和精准治疗开发提供框架 | 1998年至2025年5月注册的MASLD相关临床试验，以及GEO来源的bulk转录组和单细胞RNA测序数据集 | 多组学分析 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）、肝细胞癌（HCC） | bulk转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 文本（临床试验注册数据）、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-11-02 |
Single-cell transcriptome atlas reveals a WRKY33-HSP81 regulatory module that orchestrates phenylpropanoid-mediated defense against Sclerotium rolfsii in Dendrobium officinale
2026-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.71190
PMID:42958626
|
研究论文 | 该文构建了铁皮石斛茎基部在受齐整小核菌感染后的单细胞转录组图谱，揭示了WRKY33-HSP81调控模块介导苯丙烷代谢防御的机制 | 首次在药用兰科植物铁皮石斛中构建单细胞转录组图谱解析病原菌感染后的细胞异质性免疫响应，并发现WRKY33直接结合木质素合成基因C4H和HCT启动子的W-box基序促进木质素沉积，同时揭示HSP81通过与WRKY33互作并隔离辅因子负调控防御的新机制 | 仅分析了侵染后12和24小时两个时间点，样本时间分辨率有限；未进行田间或温室水平的抗病性验证实验；单细胞图谱仅针对茎基部组织，未涵盖其他器官 | 解析铁皮石斛响应齐整小核菌感染的细胞类型特异性免疫转录程序，鉴定调控苯丙烷代谢防御的关键转录调控模块 | 铁皮石斛茎基部组织及齐整小核菌 | 植物单细胞转录组学 | 植物真菌病害（白绢病） | 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、酵母双杂交/免疫共沉淀等蛋白互作实验、染色质免疫共沉淀 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 超过20000个细胞，涵盖侵染后12小时和24小时两个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-11-02 |
Identification and functional characterization of ASCC2 as a diagnostic biomarker and immune regulatory hub in Kawasaki disease
2026-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08453-9
PMID:42816712
|
研究论文 | 通过bulk转录组和单细胞RNA测序数据识别川崎病的诊断生物标志物，并验证ASCC2的免疫功能 | 识别并独立验证了EPB42、RUNDC3A和ASCC2三个下调基因作为川崎病诊断标志物，并对ASCC2进行了单细胞和体外功能验证 | 该标志物作为辅助分子标记而非独立诊断工具，对临床相关发热感染的区分能力中等 | 识别川崎病下调候选诊断生物标志物并研究优先候选基因的功能相关性 | 川崎病患者、健康对照、腺病毒感染和A组链球菌感染发热对照的外周血样本及TNF-α刺激的HUVECs | 数字病理学/转录组学 | 川崎病 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、WGCNA、机器学习、CellChat、scTenifold扰动分析、siRNA敲低 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据（转录组）、单细胞转录组数据 | GSE73461发现队列和GSE68004独立验证队列的外周血样本，GSE168732单细胞数据 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-11-02 |
Route-aware Therapeutic Target Atlas for Desmoplastic Small Round Cell Tumor
2026 Nov-Dec, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20617
PMID:42966626
|
研究论文 | 该研究构建了促纤维增生性小圆细胞肿瘤（DSRCT）的路线感知治疗靶点图谱，系统评估了80个基因候选靶点的表达情况 | 提出了一个整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、融合抑制队列和正常组织参考的多层次靶点评估框架，并为每个靶点指明了下一步所需的验证研究 | RNA检测本身不能确定蛋白质丰度、治疗可及性、疗效或安全性；部分候选靶点在不同队列间结果不一致 | 构建DSRCT的治疗靶点图谱，评估候选靶点的表达流行率、细胞来源、融合相关表达变化、正常组织表达及治疗特异性验证需求 | 促纤维增生性小圆细胞肿瘤（DSRCT）患者肿瘤标本及正常组织 | 数字病理学 | 肉瘤 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据、图像 | 两个bulk RNA测序队列共61例患者86个肿瘤标本；单细胞RNA测序9520个细胞（2个标本）；空间转录组学5例患者6个标本；3个融合抑制队列；1个细胞状态队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-11-02 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals fibroblast state-specific remodeling of purinergic signaling in diabetic gingiva
2026-Oct-31, Purinergic signalling
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11302-026-10195-x
PMID:42965721
|
研究论文 | 该文章通过分析公开的单细胞RNA测序数据，揭示了糖尿病牙龈中成纤维细胞状态特异性的嘌呤能信号重塑 | 首次在单细胞水平上表征了糖尿病牙龈中不同成纤维细胞状态下嘌呤能信号（包括细胞外核苷酸代谢、腺苷信号、ATP释放和炎症小体相关通路）的表达变化 | 研究基于公开数据集，样本量有限，且仅进行了转录组分析，缺乏实验验证 | 探究糖尿病状态下牙龈成纤维细胞不同状态中嘌呤能信号通路的作用 | 野生型和糖尿病db/db小鼠的牙龈组织 | 单细胞转录组学 | 糖尿病, 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-11-02 |
Integrating Immunogenetics, Single-Cell Transcriptomics, and AI-Assisted Drug Discovery Reveals CXCL10-Associated Immune Remodelling in Breast Cancer
2026-Oct-31, International journal of immunogenetics
IF:2.3Q3
DOI:10.1111/iji.70076
PMID:42965880
|
研究论文 | 整合批量转录组、孟德尔随机化、单细胞转录组与AI辅助药物发现，揭示乳腺癌中CXCL10相关的免疫重塑 | 将免疫遗传学（两样本MR）、单细胞转录组（CellChat、in silico扰动）与AI辅助化合物筛选及分子对接相结合，系统刻画细胞因子相关调控因子在乳腺癌中的遗传、免疫与治疗相关性 | 研究结果完全基于计算分析，属于假设生成性质，需在独立队列与实验模型中验证；PRLR仅在IVW分析中显著，仅为待验证候选 | 识别乳腺癌中有遗传学支持的细胞因子相关候选基因，刻画其免疫与细胞背景，并探索其潜在调控与治疗相关性 | 乳腺癌相关的批量转录组数据集及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 两样本孟德尔随机化, 功能富集分析, 免疫浸润分析, CellChat细胞通讯分析, in silico基因扰动, AI辅助化合物筛选, 分子对接 | 孟德尔随机化模型, 基于CXCL10/PRLR的诊断模型, AI辅助化合物筛选模型, 分子对接模型 | 文本（转录组表达数据）, 单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-11-02 |
Exploring the role and mechanism of methionine metabolism in chronic rhinosinusitis with nasal polyps based on bioinformatics analysis
2026-Oct-31, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2026.101917
PMID:42965986
|
研究论文 | 该研究通过整合转录组数据和单细胞数据，结合多种机器学习算法和可解释性分析方法，系统探究了甲硫氨酸代谢在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中的作用及机制，并筛选出核心基因和潜在治疗药物 | 首次系统性地将甲硫氨酸代谢与CRSwNP联系起来，整合多组学数据和可解释机器学习（SHAP）方法筛选核心基因，并结合单细胞分析、ceRNA网络、免疫浸润和分子对接等多维度分析揭示机制 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析，缺乏实验验证（如体内外功能实验）；证据等级为3级；样本来源有限，结论的临床转化仍需进一步验证 | 系统研究甲硫氨酸代谢在CRSwNP中的作用，识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO, SVM-RFE, XGBoost, SHAP, GSEA, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 免疫浸润分析, 拟时序轨迹分析, 分子对接 | LASSO, SVM-RFE, XGBoost, SHAP | 基因表达数据（转录组数据、单细胞数据） | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-11-02 |
Multi-omic profiling reveals coordinated remodeling of inflammatory glial states and oligodendrocyte-myelin homeostasis by BoNT/A in CCI-induced neuropathic pain
2026-Oct-31, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117630
PMID:42966126
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示BoNT/A在CCI诱导的神经病理性疼痛中协调重塑炎症性胶质状态与少突胶质-髓鞘稳态 | 在痛觉过敏已形成后给予BoNT/A，整合转录组学、蛋白质组学、scRNA-seq及功能验证，揭示IL-1β介导的炎症胶质微环境与C3/OLIG2/MBP之间的功能联系 | 研究仅使用雄性大鼠，未评估性别差异；IL-1β回补实验仅支持相关性联系，机制因果关系仍需进一步验证 | 探究CCI后炎症相关小胶质细胞状态、跨胶质炎症信号及脊髓髓鞘异常，并评估BoNT/A对其的治疗反应 | CCI诱导神经病理性疼痛的雄性大鼠脊髓组织及体外胶质细胞 | 神经科学、多组学 | 神经病理性疼痛 | 转录组学, 蛋白质组学, scRNA-seq, Western blotting, 免疫荧光, TEM, 条件培养基转移, TNF-α刺激, IL-1β回补 | CellChat | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-11-02 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing with ML algorithms identified MYBL2 as a candidate transcriptomic biomarker for diagnosing laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC)
2026-Oct-31, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103095
PMID:42966320
|
研究论文 | 该研究整合单细胞和批量RNA测序数据，结合机器学习算法识别MYBL2作为诊断喉鳞状细胞癌的候选转录组生物标志物 | 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，结合WGCNA、LASSO回归和拷贝数变异分析，首次将MYBL2识别为喉鳞状细胞癌的候选诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证和前瞻性临床队列验证 | 识别跨队列稳健一致的喉鳞状细胞癌诊断生物标志物 | 喉鳞状细胞癌患者样本 | 转录组学 | 喉鳞状细胞癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-11-02 |
MANF promotes cell fitness and attenuates bortezomib sensitivity in multiple myeloma
2026-Oct-31, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103094
PMID:42966321
|
研究论文 | 该文通过CRISPR依赖数据、单细胞转录组及功能实验，揭示MANF是多发性骨髓瘤细胞适应性的候选依赖因子，并可调节硼替佐米敏感性 | 首次将MANF鉴定为多发性骨髓瘤偏好性依赖候选因子，并结合DepMap、单细胞RNA测序、计算机模拟扰动与siRNA敲低及回复实验系统阐明其促增殖及影响硼替佐米敏感性的作用 | 研究主要基于公共数据库分析和体外细胞系模型，缺乏体内动物实验及原代患者样本验证，MANF作为治疗靶点的临床转化价值仍需进一步研究 | 识别支持骨髓瘤细胞适应性的分子依赖，并探讨MANF在多发性骨髓瘤中的临床与生物学意义及其对硼替佐米敏感性的影响 | 多发性骨髓瘤细胞系RPMI-8226和OPM-2，以及MMRF CoMMpass队列和DepMap公共数据 | 数字病理, 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | CRISPR依赖筛选, 单细胞RNA测序, 转录组测序, siRNA敲低, 基因回复实验 | NA | 文本, 基因表达数据, 图像 | MMRF CoMMpass队列样本及DepMap公共数据，体外实验使用RPMI-8226和OPM-2两种骨髓瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-11-02 |
Targeting ACKR1+ Endothelial Cells Attenuates Pulmonary Fibrosis by Halting Monocytes Infiltration/Polarization and Endothelial-to-Mesenchymal Transition
2026-Oct-31, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.109710
PMID:42966481
|
研究论文 | 该研究通过单细胞和空间转录组学整合分析，发现IPF中病理性扩增的ACKR1+内皮细胞亚群，并揭示其通过TGF-β/SMAD2/ACKR1轴促进EndMT和单核细胞招募/极化的双重促纤维化机制，同时鉴定1F-Fructofuranosylnystose作为ACKR1抑制剂在多种模型中验证其治疗潜力 | 首次鉴定IPF中病理性扩增的ACKR1+内皮细胞亚群及其促纤维化内皮-成纤维细胞生态位；揭示ACKR1通过竞争性隔离NUMB维持NOTCH1过度激活驱动EndMT的新机制；发现ACKR1+内皮细胞通过CCL2转胞吞和IGFBP7分泌极化M2巨噬细胞；通过结构虚拟筛选发现1F-Fructofuranosylnystose作为直接ACKR1抑制剂并在小鼠、雪貂和人类精密切片模型中验证疗效 | 摘要未明确说明研究局限性 | 探究特发性肺纤维化中病理性内皮细胞亚群及其分子网络，并开发靶向ACKR1的治疗策略 | 特发性肺纤维化患者肺组织内皮细胞、小鼠模型、雪貂模型及人类精密切片 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 结构虚拟筛选 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-11-02 |
CRYAB as a key mediator of Xianlian Jiedu Decoction-induced suppression of colorectal cancer stemness
2026-Oct-31, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122585
PMID:42966514
|
研究论文 | 本研究探讨仙连解毒汤（XLJDD）抑制结直肠癌干性的分子机制，确定CRYAB为其关键介导因子 | 首次证明XLJDD通过靶向CRYAB-STC1轴抑制结直肠癌肿瘤干性，并将CRYAB与OCT4/SOX2/NANOG干性网络联系起来 | 研究主要基于小鼠原位模型和体外细胞实验，缺乏临床试验验证；XLJDD的具体活性成分尚未完全明确 | 研究XLJDD对结直肠癌肿瘤干性的抑制作用并阐明其潜在分子机制 | 结直肠癌原位小鼠模型、HCT116和HT29结直肠癌细胞系 | 肿瘤生物学、中医药药理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、转录组测序、UPLC-MS/MS、血浆代谢组学、Western blot、免疫组化、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、代谢数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、代谢组学 | NA | NA |