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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-20 |
Identifying mitochondria-related signatures for tuberculosis diagnosis through machine learning on single-cell transcriptomics data and experimental verification
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108489
PMID:41967724
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据和机器学习识别线粒体相关基因特征用于结核病诊断,并经过实验验证 | 首次将单细胞RNA测序数据与机器学习算法相结合,识别出三个线粒体相关基因(STAT2、CASP1和COX7B)作为结核病诊断标志物,构建了基于血液的诊断模型 | 模型在独立临床队列中进行了初步验证,但样本量有限,需更大规模研究进一步确认 | 探索线粒体相关基因特征作为结核病诊断的生物标志物 | 活动性结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序、微阵列、定量PCR、LASSO、SVM-RFE | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 训练集125例,验证集30例,两个测试集分别15例和26例,独立临床队列52例 | Illumina | 单细胞RNA测序、微阵列 | Illumina NovaSeq, Illumina HumanHT-12 | GSE19491微阵列数据,SRP247583单细胞RNA测序数据,GSE54992和GSE34608微阵列数据 |
| 2 | 2026-05-20 |
Atopic dermatitis: Multi-omics insights into microbiota-driven modulation of the gut-skin axis
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108504
PMID:42019770
|
综述 | 本文综述了多组学技术揭示的微生物群驱动肠-皮肤轴调控特应性皮炎的作用机制 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞转录组学等多组学数据,识别出以拟杆菌和普雷沃菌为主的特应性皮炎内型特征,为精准分层和靶向治疗提供了新框架 | 该综述主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证,且未详细讨论不同研究间方法学差异对结论一致性的影响 | 总结宿主遗传学、微生物群网络和多组学生物标志物在特应性皮炎内型中的作用,为精准诊断和靶向干预提供依据 | 特应性皮炎患者及其肠道微生物群、代谢产物和免疫反应特征 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 宏基因组学, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-20 |
Extracellular vimentin promotes neutrophil-dominant granulomatous inflammation in progressive pulmonary sarcoidosis
2026-Jun-10, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20250651
PMID:42084847
|
研究论文 | 本研究通过计算机分析和动物实验,发现细胞外波形蛋白在进展性肺结节病中促进中性粒细胞主导的肉芽肿性炎症 | 首次揭示细胞外波形蛋白可作为触发因子,驱动中性粒细胞介导的炎症通路,导致肺结节病进展和纤维化 | 未明确提及具体局限性 | 探索进展性肺结节病中中性粒细胞及其效应分子的作用机制 | 进展性肺结节病患者肺组织样本和波形蛋白诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 进展性纤维化结节病患者与自愈性疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-20 |
Cuproptosis-Related Gene FDX1 Induces Malignant Progression and Immune Suppression in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11242-9
PMID:40911146
|
研究论文 | 本文研究了铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌中诱导恶性进展及免疫抑制的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铜死亡关键基因FDX1在三阴性乳腺癌上皮细胞中高表达,并通过体外实验和共培养模型证明其促进肿瘤细胞增殖、迁移并抑制CD8 T细胞免疫应答 | 研究仅基于公共单细胞RNA测序数据集和体外实验,缺乏临床样本验证及体内免疫微环境动态调控机制的深入探讨 | 探究铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌恶性进展及免疫抑制中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、细胞功能实验、共培养体系、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及体外细胞系(未明确样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共scRNA-seq数据集(具体平台未说明) |
| 5 | 2026-05-20 |
Integrating multiomic layers to decode psychiatric disease mechanisms
2026-Jun, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102451
PMID:41831411
|
综述 | 整合多组学数据以解析精神疾病的分子机制 | 通过单细胞转录组学、表观组学、蛋白质组学和空间组学等多组学技术,系统连接遗传变异与基因调控、细胞类型脆弱性和环路功能障碍,推动从变异到机制和环路的转化 | 未提及具体局限性 | 利用新兴多组学技术整合分析精神疾病的遗传机制,为生物标志物发现、患者分层和精准治疗策略奠定基础 | 精神疾病,包括精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症 | 计算生物学 | 精神疾病 | NA | NA | 多组学数据(转录组、表观组、蛋白质组、空间组) | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 单细胞 ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-06, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-05-20 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Identifies Prognostic Biomarkers in Breast Cancer Metastasis
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11228-7
PMID:40828203
|
研究论文 | 整合批量与单细胞转录组数据,鉴定乳腺癌转移相关预后生物标志物 | 首次通过整合批量微阵列数据和单细胞RNA测序分析,发现PRC1和POLR3H作为新的预后生物标志物,并揭示其在恶性上皮和EMT细胞中的表达模式 | 未提及具体局限性,但可能包括数据来源的公共数据库限制、缺乏独立外部验证队列、以及生物标志物的临床验证有待进一步研究 | 识别乳腺癌转移相关的预后生物标志物 | 乳腺癌转移相关基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 三个公共微阵列数据集共包含295个共差异表达基因,以及GSE180286单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-05-20 |
Molecular phenotypes stratify small cell lung cancer for targeted therapy and immunotherapy
2026-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03390-5
PMID:41933195
|
研究论文 | 通过分子分型将小细胞肺癌分为三种亚型,并评估其对靶向治疗和免疫治疗的响应差异 | 首次通过共识聚类和单细胞RNA测序识别出三种具有不同治疗敏感性的小细胞肺癌分子表型,特别是发现ANXA1高表达的浸润型亚群对免疫检查点抑制剂耐药 | 样本量较小,仅基于41例新采集患者数据及一个公共数据集,且未进行前瞻性验证,ANXA1相关的耐药机制尚需进一步实验证实 | 揭示小细胞肺癌的分子异质性,并明确不同亚型对免疫检查点抑制剂治疗的反应差异,为精准治疗提供依据 | 小细胞肺癌患者肿瘤组织及单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 41例广泛期小细胞肺癌患者及公共数据集中的样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-05-20 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2026-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziag070
PMID:42124856
|
研究论文 | 针对小鼠肌肉骨骼组织,开发了利用Xenium Prime 5K平台进行空间转录组分析的高质量样本处理流程,包括灌注、固定、脱钙、石蜡包埋和共嵌入策略,实现了多组织同时切片和高转录本检测 | 首次系统建立了适用于小鼠完整肌肉骨骼组织(包括矿化组织)的空间转录组样本处理流程,通过优化固定、脱钙和共嵌入步骤,在保持组织解剖结构的同时实现了高比例优质转录本检测 | 不同组织类型间检测到的转录本数量差异显著,矿化组织转录本数较低;且流程涉及多步骤处理,可能仍存在RNA降解风险 | 建立高质量空间转录组分析的标准流程,以解决小鼠肌肉骨骼组织因脱钙等处理导致的RNA完整性难题 | 成年小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎样本 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 基于成像的空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年小鼠膝关节、胫骨和腰椎样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | Xenium Prime 5K平台 |
| 10 | 2026-05-20 |
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag044
PMID:41779628
|
研究论文 | 本文研究CYLD皮肤综合征中非经典核因子κB信号通路的异常,并探索通过选择性抑制IκB激酶α(IKKα)作为潜在治疗方案 | 首次在CYLD皮肤综合征中证实非经典NF-κB信号通路的激活,并发现IKKα可作为新治疗靶点,利用新型高选择性IKKα抑制剂SU1644在患者来源的肿瘤球体中验证疗效 | 研究仅基于细胞和肿瘤球体模型,尚未进行体内实验或临床试验验证 | 探究CYLD皮肤综合征肿瘤中NF-κB信号通路的异常,以识别可药物靶点 | 来自CYLD皮肤综合征患者的肿瘤角质细胞及肿瘤球体培养模型 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 患者来源的肿瘤细胞及肿瘤球体样本,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-20 |
Myeloid Mas drives pyruvate kinase M2-mediated Spi1 lactylation to fuel inflammatory senescence in MASLD
2026-May-19, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02704-6
PMID:42151117
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研究论文 | 揭示了髓系Mas通过驱动丙酮酸激酶M2介导的Spi1乳酰化促进MASLD炎症性衰老的机制 | 首次发现G蛋白偶联受体Mas作为MASLD的代谢检查点,并通过Mas-PKM2-Spi1乳酰化轴调控糖酵解重编程和单核前体细胞分化 | 未提及具体局限性 | 阐明免疫代谢与MASLD疾病进展之间的精确机制 | MASLD患者及饮食诱导小鼠模型的肝髓系细胞 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肝组织样本及饮食诱导小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-05-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal an arachidonic acid-related cellular atlas in lung adenocarcinoma
2026-May-19, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02251-4
PMID:42151495
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示肺腺癌中花生四烯酸相关的细胞图谱 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,首次在肺腺癌中系统探索花生四烯酸代谢相关的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的作用 | 未明确说明局限性 | 探究肺腺癌中花生四烯酸代谢的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的调控机制 | 肺腺癌组织中的肿瘤细胞、T细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-20 |
Basal cell subsets, as biomarker to predict the therapeutic effect of neoadjuvant therapy for esophageal carcinoma
2026-May-19, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06503-y
PMID:42151650
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析食管癌新辅助治疗中基底细胞亚群作为疗效预测的生物标志物 | 首次发现基底细胞亚群Basal3、Basal8与病理完全缓解相关,Basal7与不完全病理反应相关,并识别了ATF3和JUN基因对生存的影响 | 样本量较小(仅22例患者),且包含多数食管鳞癌和1例腺鳞癌,统计结果代表性有限 | 探索食管癌新辅助治疗疗效预测的生物标志物 | 来自22例II-IV期接受新辅助化免疫治疗的食管癌患者的肿瘤及配对邻近组织 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22例食管癌患者(21例食管鳞癌,1例食管腺鳞癌) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-05-20 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving Metastasis and Immune Evasion
2026-May-19, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3134
PMID:42153907
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序,发现ETS1转录因子是驱动上呼吸消化道鳞状细胞癌转移和免疫逃逸的混合上皮-间质转化程序的主调控因子,并揭示HSP90抑制剂可作为潜在治疗策略 | 首次识别ETS1作为同时驱动肿瘤转移和免疫逃逸的混合EMT程序的主调控因子,并发现HSP90抑制剂可通过破坏HIF1α介导的转录激活来抑制ETS1 | 研究主要集中于上呼吸消化道鳞状细胞癌,可能在其他癌症类型中需进一步验证;未深入探讨ETS1调控的免疫逃逸机制在不同微环境下的差异 | 探究驱动肿瘤转移和免疫逃逸的转录组瘤内异质性程序,以寻找潜在治疗和预防方法 | 上呼吸消化道鳞状细胞癌细胞、患者肿瘤组织及多个临床队列 | 机器学习 | 上呼吸消化道鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个临床队列的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 15 | 2026-05-20 |
Mastication-Induced Electrical Stimulation Activates Prg4+ Chondroprogenitors for Osteoarthritis Therapy
2026-May-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75725
PMID:42153977
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研究论文 | 开发了一种咀嚼驱动的镁掺杂压电纳米纤维,通过将关节载荷转化为局部电刺激并释放镁离子来中和酸性微环境,用于骨关节炎治疗 | 首次利用咀嚼产生的机械载荷激活内源性电敏感软骨祖细胞,提出变废为宝的骨关节炎治疗策略 | 仅在动物模型验证,缺乏人体临床试验数据;遗传消融Prg4细胞显示疗效减弱但未完全消除,可能存在其他补偿机制 | 开发利用关节生物力学信号治疗骨关节炎的新疗法 | 大鼠颞下颌关节骨关节炎模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠颞下颌关节组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 16 | 2026-05-20 |
Decoding circulating neutrophil phenotypes in triple-negative breast cancer via optimized single-cell RNA sequencing
2026-May-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04345-8
PMID:42154046
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研究论文 | 通过优化的单细胞RNA测序解码三阴性乳腺癌中循环中性粒细胞的表型 | 开发了基于两个中性粒细胞标记基因面板和排除非中性粒细胞标记基因的稳健分析框架,实现了对单细胞数据中中性粒细胞的精准鉴定与功能表征 | 研究样本量较小(仅6名TNBC患者和6名对照),且中性粒细胞分离数量有限(TNBC组84个,对照组128个),可能限制结果的普适性 | 表征三阴性乳腺癌患者循环中性粒细胞的转录组差异,探究肿瘤对免疫细胞的影响机制 | 三阴性乳腺癌患者和非恶性供体的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例样本(6例TNBC患者和6例非恶性供体),共分离212个中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-20 |
MICA and CYTH4 as immunological biomarkers of intracranial aneurysm: a study integrating RNA sequencing, single-cell sequencing and Mendelian randomization
2026-May-19, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01887-z
PMID:42154081
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研究论文 | 整合RNA测序、单细胞测序和孟德尔随机化分析,鉴定MICA和CYTH4为颅内动脉瘤免疫生物标志物 | 首次结合多数据集、单细胞测序和孟德尔随机化,发现MICA和CYTH4作为颅内动脉瘤破裂的免疫相关分子标志物,并验证其对内皮细胞增殖和凋亡的调控作用 | 样本量较小,仅包含34个非IA和93个IA样本,且主要基于小鼠模型单细胞数据和公开数据库分析,缺乏大规模临床验证 | 探索颅内动脉瘤发生和破裂的分子机制,发现预测性分子标志物 | 颅内动脉瘤患者样本及小鼠模型单细胞数据 | 生物信息学 | 颅内动脉瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 34个非IA样本和93个IA样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-05-20 |
Metabolic Checkpoints in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma: ACSL1 and PPARD Orchestrate Lipid-Ferroptosis Crosstalk via Keratinocyte Remodeling
2026-May-19, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05734-6
PMID:42154143
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研究论文 | 本研究整合生物信息学分析与单细胞RNA测序,鉴定皮肤鳞状细胞癌中与铁死亡和脂质代谢相关的生物标志物,发现ACSL1和PPARD通过角质形成细胞重塑调控脂质-铁死亡串扰 | 首次通过单细胞转录组学揭示ACSL1和PPARD在角质形成细胞分化中的动态表达模式,并提出其参与脂质-铁死亡串扰的新机制 | 研究仅建立关联性而未证实因果机制,且缺乏蛋白水平和功能性验证 | 阐明皮肤鳞状细胞癌中铁死亡与脂质代谢紊乱的分子机制 | 皮肤鳞状细胞癌组织样本及角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 临床皮肤鳞状细胞癌组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-20 |
Multiscale domain identification for spatial transcriptomics via persistent homology
2026-May-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101376
PMID:41916308
|
研究论文 | 利用持续同调方法对空间转录组数据进行多尺度域识别 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组的多尺度域识别,解决了传统聚类方法仅能识别单一形态尺度域、忽略多尺度交互的问题 | 未对计算效率进行详细评估,且方法在异构区域与同质域之间的边界识别能力有待进一步验证 | 开发一种基于持续同调的多尺度空间域识别方法,以捕捉跨形态尺度的组织结构 | 空间转录组数据中的空间域 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 持续同调 | 基因表达数据 | 多组织类型与空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-20 |
High-quality acinar cell isolation enables single-cell analysis of healthy and injured pancreas
2026-May-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101415
PMID:42013858
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研究论文 | 开发了一种高质量胰岛腺泡细胞分离方案,实现健康和受损胰腺的单细胞分析 | 提出一种快速消化胰腺以获得高质量单细胞的方法,克服了腺泡细胞分离的挑战,可在健康和急性胰腺炎组织中分析腺泡细胞异质性 | 主要基于小鼠模型,可能需进一步验证在人类组织中的适用性 | 改进胰腺腺泡细胞分离方法,用于单细胞RNA测序和免疫表型分析 | 小鼠胰腺组织(健康和雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型) | 单细胞生物学 | 急性胰腺炎、胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 无特定模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胰腺样本(健康与急性胰腺炎组织) | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 无详细信息 |