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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-15 |
Metabolic-immune interactions in gastric cancer T cells: A single-cell atlas for prognostic biomarker identification
2026-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70027
PMID:41675596
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据,系统表征了胃癌肿瘤微环境中的代谢异质性,并识别出与T细胞分化相关的预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统描绘胃癌代谢-免疫相互作用图谱,并构建了一个基于6个T细胞分化特征的新型风险评分模型,该模型在预测预后方面优于传统临床病理因素 | 研究主要基于公共数据集进行回顾性分析,需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 揭示胃癌肿瘤微环境中代谢与免疫的相互作用,并开发用于预后分层和免疫治疗靶点识别的生物标志物 | 胃癌组织、恶性上皮细胞、T细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列、免疫组织化学 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、微阵列数据、临床生存数据 | 23例胃癌组织的35,633个细胞(单细胞数据),以及来自UCSC Xena的批量RNA-seq数据和两个独立微阵列队列(GSE26899, GSE62254) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-15 |
A protective role of ECSIT in chemotherapy-induced intestinal mucositis by maintaining Lgr5+ intestinal stem cells and gut homeostasis
2026-Mar-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124236
PMID:41611204
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研究论文 | 本研究揭示了ECSIT在化疗诱导的肠黏膜炎中通过维持Lgr5+肠干细胞和肠道稳态的保护作用 | 首次阐明ECSIT通过稳定β-catenin复合体调控Wnt信号通路,从而维持Lgr5+肠干细胞平衡和肠道免疫稳态的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本分析仅限于表达相关性,缺乏直接的人类干预实验验证 | 阐明ECSIT在化疗诱导肠黏膜炎中对肠干细胞平衡和黏膜修复的调控机制 | 肠上皮细胞、Lgr5+肠干细胞、肠道组织 | 分子生物学 | 肠黏膜炎 | 多组学分析、基因编辑、单细胞RNA测序、基因集富集分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,包含小鼠模型和临床组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-02-15 |
Mechanistic insights into nitric oxide signaling in shaping root architecture under challenging environments
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112903
PMID:41317792
|
综述 | 本文综述了一氧化氮(NO)在逆境条件下调控植物根系构型(RSA)的多重作用机制 | 整合了NO与ROS及植物激素信号网络的互作,并强调了单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器和高分辨率活细胞成像等新兴技术在解析NO-ROS互作中的潜力 | NO介导的RSA调控的生化与分子机制仍复杂且部分未知,存在关键知识缺口 | 理解作物如何适应环境胁迫,特别是通过根系构型可塑性来增强胁迫抗性 | 植物根系,特别是根系构型(RSA)及其在胁迫下的发育 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器、高分辨率活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-02-15 |
Systematic analyses uncover endocrine-disrupting chemical-responsive genes linked to endometriosis
2026-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2025.109148
PMID:41443441
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序,识别了与子宫内膜异位症风险相关的内分泌干扰物响应基因 | 首次系统性地整合了化学-基因相互作用数据库、eQTL数据、GWAS数据和scRNA-seq数据,以揭示内分泌干扰物通过特定基因影响子宫内膜异位症风险的分子通路,并建立了一个可扩展的研究基因-环境相互作用的框架 | 未在文中明确说明,但可能包括数据库的覆盖范围限制、统计方法的假设、以及需要后续功能实验验证候选基因的因果机制 | 识别内分泌干扰物响应基因,并阐明其如何影响子宫内膜异位症的风险 | 与子宫内膜异位症相关的基因和内分泌干扰物 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数量性状位点数据,全基因组关联研究数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-15 |
Probing cellular landscapes in plants via single-cell transcriptomics
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112964
PMID:41455555
|
综述 | 本文全面综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在植物研究中的应用,包括其在解析细胞异质性、发育轨迹、应激响应以及整合空间转录组学和多组学方法方面的进展 | 整合了跨植物物种和组织类型的见解,提供了关于植物发育和适应的交叉视角,并批判性地评估了关键技术挑战及潜在解决方案 | 植物系统中scRNA-seq与功能基因组学及空间技术的整合仍然有限,在理解基因调控、应激响应和细胞命运决定方面存在关键空白 | 综述单细胞转录组学如何推进植物组织发育和应激响应的高分辨率解析,从而促进基因发现和性状改良 | 多种植物组织 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,多组学方法(如整合染色质可及性或蛋白质表达数据),CRISPR/Cas9介导的基因组编辑 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录omics | NA | NA |
| 6 | 2026-02-15 |
Cross-scale causal inference integrated with single-cell profiling and molecular simulations reveals a macrophage CSF1R-CD68-LYZ axis linking benzo[a]pyrene to erectile dysfunction
2026-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109169
PMID:41548764
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟、单细胞RNA测序和虚拟基因敲除,揭示了苯并[a]芘通过巨噬细胞CSF1R-CD68-LYZ轴导致勃起功能障碍的分子机制 | 首次采用跨尺度因果推断方法,结合单细胞分析和分子模拟,识别出巨噬细胞特异性基因在环境毒素诱导勃起功能障碍中的核心作用 | 研究结果需要未来实验验证,且未涉及临床样本的直接验证 | 探索苯并[a]芘暴露与勃起功能障碍之间的分子联系及潜在治疗靶点 | 苯并[a]芘暴露与勃起功能障碍的关联机制,聚焦巨噬细胞介导的炎症通路 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 孟德尔随机化, 网络毒理学, 分子模拟, 单细胞RNA测序, 虚拟基因敲除 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-02-15 |
Integrating CAR-T therapy with PD-1/PD-L1 blockade: Mechanisms, synergy, and optimized strategies in NSCLC
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114607
PMID:41675056
|
综述 | 本文综述了CAR-T疗法与PD-1/PD-L1阻断在非小细胞肺癌(NSCLC)中的整合机制、协同效应及优化策略 | 提出了将CAR-T疗法与PD-1/PD-L1阻断相结合以克服NSCLC免疫治疗耐药性的新策略,并讨论了多靶点CAR构建、针对肿瘤微环境的工程策略以及计算建模和机器学习在优化个性化应用中的作用 | 本文为综述性文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和讨论,因此缺乏对新策略临床效果的实证评估 | 探讨如何整合CAR-T疗法与PD-1/PD-L1阻断以克服NSCLC免疫治疗中的耐药性并改善治疗效果 | 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤微环境(TME) | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-15 |
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2026-Feb-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf243
PMID:41252281
|
研究论文 | 本研究探讨了不同细胞类型中血栓反应蛋白-1(TSP1)缺失对小鼠腹主动脉瘤破裂的影响 | 通过细胞特异性基因敲除模型,首次揭示了髓系细胞来源的TSP1在抑制腹主动脉瘤破裂中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病 | 研究TSP1在不同细胞类型中对腹主动脉瘤破裂的贡献 | 高胆固醇血症小鼠模型中的腹主动脉瘤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-02-15 |
Advances in single-cell transcriptomics: unraveling the pathogenesis of calcific aortic valve disease
2026-Feb-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf255
PMID:41264422
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在钙化性主动脉瓣疾病研究中的应用,总结了关键发现并讨论了其转化潜力 | 利用单细胞RNA测序技术以前所未有的分辨率解析CAVD的细胞异质性、谱系分化和细胞间通讯,揭示了新的疾病机制和治疗靶点 | NA | 概述单细胞转录组学在钙化性主动脉瓣疾病研究中的最新进展和应用 | 钙化性主动脉瓣疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-02-15 |
Single-cell RNA sequencing combined with single-cell genome-wide association study identifies SF3B4 as a hub gene in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04501-7
PMID:41689695
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-02-15 |
Technological synergy and convergent innovation: evolutionary trajectories of AI-integrated multi-omics in cancer research and clinical translation (2015-2024)
2026-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04665-2
PMID:41689722
|
文献计量分析 | 本文通过文献计量分析,系统性地回顾了2015年至2024年间癌症研究中机器学习、多组学和人工智能驱动的进展 | 揭示了AI整合多组学在癌症研究中作为新兴焦点的演变轨迹,并识别了技术发展的三个阶段 | 研究结果主要基于文献计量分析,其临床或生物学相关性需要进一步的实证研究来评估 | 系统性地回顾癌症研究中AI整合多组学的进展与演变轨迹 | 2015年至2024年间的癌症研究文献 | 机器学习 | 癌症 | 文献计量分析,CiteSpace网络构建 | NA | 文献元数据 | NA | NA | 多组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-02-15 |
Integrative single-cell transcriptomic and multi-dimensional bioinformatic analysis reveals proliferation-associated gene expression signatures and cellular heterogeneity in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04660-7
PMID:41689757
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序和多维生物信息学分析,揭示了肝细胞癌中与增殖相关的基因表达特征和细胞异质性 | 结合单细胞RNA测序和多维生物信息学方法,系统分析了肝细胞癌的细胞异质性和增殖相关基因表达模式,并识别出STMN1和RRM2作为关键的增殖标志物 | 研究主要基于细胞系数据,缺乏临床样本验证,且样本数量有限(约30个样本) | 揭示肝细胞癌的分子异质性,识别新的生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌细胞系(MHCC97H、HepG2、Huh7)和正常肝细胞(LO2) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、实时定量PCR | UMAP、层次聚类、相关性矩阵 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 约30个样本,包括正常肝细胞和三种肝细胞癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-02-15 |
Mendelian randomization followed by single-cell RNA sequencing exploration identifies effector memory CD4+ T cells as a risk factor for myasthenia gravis
2026-Feb-13, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047588
PMID:41686610
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序,识别出效应记忆CD4+ T细胞是晚发型重症肌无力的风险因素 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据整合,系统性地探索了免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,并识别出效应记忆CD4+ T细胞作为关键风险因素 | 研究依赖于已有的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限,且需要进一步的功能研究来验证TGF-β和IL-4介导的具体机制 | 探究不同免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,特别是区分早发型和晚发型 | 重症肌无力患者,特别是早发型和晚发型患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 重症肌无力 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 731个外周免疫表型数据,以及来自重症肌无力患者外周血的现有单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-02-15 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-Feb-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 本文揭示了人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域如何独立于可变区抗原识别来调节激活强度,并影响细胞表型和功能 | 首次证明γδ T细胞受体中的γ恒定结构域(Cγ1和Cγ2)能独立于可变区调节激活强度,从而影响细胞表型、发育和肿瘤中的克隆扩增 | NA | 探究人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域对细胞激活、表型和功能的调节作用 | 人类γδ T细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-02-15 |
Integrative transcriptomic and machine learning framework reveals candidate genes and potential mechanisms of aflatoxin B1 exposure in breast cancer
2026-Feb-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39844-2
PMID:41688730
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和机器学习框架,探索黄曲霉毒素B1暴露在乳腺癌中的候选基因和潜在机制 | 结合多组学评估(包括转录组分析、共表达网络建模、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间和单细胞转录组学)与机器学习流程,识别AFB1暴露相关的生物标志物和机制 | 未明确说明样本大小或具体实验验证细节,可能依赖于计算分析,缺乏体内或体外功能验证 | 研究黄曲霉毒素B1如何影响乳腺癌肿瘤生物学,揭示其致癌潜力的分子途径 | 乳腺癌相关基因和生物标志物,特别是与AFB1暴露相关的候选基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组分析、共表达网络建模(WGCNA)、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间转录组学、单细胞转录组学 | glmBoost, StepGLM | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-02-15 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
2026-Feb-13, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01652-z
PMID:41688738
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研究论文 | 本研究利用PS19 tau转基因小鼠模型,通过空间转录组学分析揭示了在tau蛋白病出现前,易感脑区(如CA3区)的糖酵解通路基因(如Pgk1)已发生上调,并伴随代谢失调和胶质细胞激活 | 首次在可检测的tau缠结病理出现之前(2月龄),于易感脑区(CA3区)发现糖酵解通路基因(如Pgk1)的上调,并揭示了代谢应激和胶质细胞激活在tau蛋白病及区域易感性中的时空动态贡献 | 研究基于转基因小鼠模型(PS19),其结果向人类疾病的直接转化需谨慎;空间转录组学技术可能受限于分辨率 | 探究tau蛋白病进展中区域易感性与tau驱动转录组变化之间的关系,特别是代谢失调的作用 | PS19 tau P301S转基因小鼠模型的海马体和皮质区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | PS19转基因小鼠在选定疾病阶段的海马体和皮质区域样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-02-15 |
Cell Subtypes and Gene Dysfunction in Ovarian Endometriosis Before and After GnRHa Treatment Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb-13, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-026-02056-0
PMID:41688861
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了卵巢子宫内膜异位症患者在GnRHa治疗前后异位和正常子宫内膜的细胞亚型差异及基因功能障碍 | 首次在单细胞水平上系统比较了卵巢子宫内膜异位症患者GnRHa治疗前后异位和正常子宫内膜的细胞组成变化,并识别出ECM1高表达基质细胞亚群作为非纤维化状态的关键细胞群体 | 样本量较小(仅3名患者),且未包含长期随访数据,可能限制结果的普适性 | 探究子宫内膜异位症相关纤维化的病理特征及GnRHa治疗对细胞异质性的影响 | 卵巢子宫内膜异位症患者的异位和正常子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名患者的6个样本(包括异位病灶和正常子宫内膜) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-02-15 |
T7 peptide-engineered liposomal Irisin mitigates PND progression through AMPK/PGC-1α signaling: multi-omic evidence of metabolic and epigenetic modulation
2026-Feb-13, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04109-7
PMID:41689005
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研究论文 | 本研究探讨了T7肽修饰的脂质体鸢尾素通过调控AMPK/PGC-1α代谢通路缓解围术期神经认知障碍的分子机制 | 开发了T7肽修饰的脂质体鸢尾素纳米颗粒,并首次通过多组学整合分析揭示了其在代谢和表观遗传层面的调控网络 | 临床样本量较小(健康供体n=10,PND患者n=6),且为临床前研究,需进一步验证 | 探究T7@Lipo@Irisin缓解围术期神经认知障碍的分子机制 | 健康供体与PND患者的血清样本、Neuro-2a海马神经元细胞、PND小鼠模型 | NA | 围术期神经认知障碍 | 单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq,TMT蛋白质组学 | NA | 多组学数据(表观基因组、转录组、蛋白质组) | 临床样本:健康供体10人,PND患者6人;动物模型:PND小鼠 | NA | 单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-02-15 |
IL-5 CAR-T cell therapy induces effective remission in hypereosinophilic disorders
2026-Feb-13, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01782-x
PMID:41689037
|
研究论文 | 本文开发了一种以人白细胞介素-5为靶向结构域的首创CAR-T细胞疗法,用于治疗高嗜酸性粒细胞疾病 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定IL-5Rα作为关键治疗靶点,并开发了基于hIL-5配体的首创CAR-T疗法,能够靶向嗜酸性粒细胞及其前体细胞的所有发育阶段 | 研究主要基于临床前模型和小鼠实验,尚未进行人体临床试验,长期安全性和疗效有待验证 | 开发一种针对难治性高嗜酸性粒细胞疾病(如HES和CEL)的新型CAR-T细胞疗法 | 高嗜酸性粒细胞疾病患者的外周血和骨髓样本,以及高嗜酸性粒细胞白血病小鼠模型 | NA | 高嗜酸性粒细胞疾病,包括难治性高嗜酸性粒细胞综合征和慢性嗜酸性粒细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞疗法 | 单细胞RNA测序数据,体外细胞毒性数据,小鼠模型生存数据 | 健康个体和高嗜酸性粒细胞疾病患者的外周血及骨髓样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-02-15 |
uPAR deficiency triggers TGFβ1-mediated fibrotic remodeling in a cardiac perivascular-like microenvironment
2026-Feb-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04923-8
PMID:41689076
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研究论文 | 本研究探讨了uPAR缺失如何通过TGFβ1介导的机制促进心脏血管周围微环境的纤维化重塑 | 揭示了uPAR在心脏血管周围微环境中的表达及其缺失通过加剧TGFβ1介导的Akt信号通路和细胞外基质沉积来驱动纤维化重塑的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证,且具体信号通路的详细调控网络有待进一步阐明 | 探究uPAR缺失在心脏血管周围微环境纤维化重塑中的作用机制 | 小鼠心脏组织、心脏球体(CSs)、Plaur敲除的3T3成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR/Cas9基因编辑、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | 野生型和uPAR敲除小鼠的非心肌细胞来源的心脏球体、Plaur敲除的3T3成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |