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当前共找到 41875 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-31 |
Human lungs maintain tissue-resident memory T cells against a broad spectrum of pathogens
2026-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02592-6
PMID:42521848
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研究论文 | 对人类肺部组织驻留记忆T细胞及其对多种病原体的免疫保护作用进行了全面分析 | 首次通过整合单细胞转录组与配对T细胞受体谱分析，大规模绘制人类肺部T细胞的病原体特异性图谱，并证实人类肺部T细胞可长期稳定存在，与小鼠模型显著不同 | 未明确提及，可能包括样本量有限或跨个体变异等潜在限制 | 探究人类肺部组织驻留记忆T细胞的性质、持久性及其对广谱病原体的反应 | 来自40名个体的超过87,000个肺T细胞 | 单细胞转录组学，免疫学 | 肺部感染相关疾病 | 单细胞RNA测序，配对T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体谱数据 | 40名个体的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-07-31 |
USF1-mediated transcription of PARP1 contributes to sevoflurane-induced pyroptosis in perioperative neurocognitive disorders
2026-Jul-29, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01991-0
PMID:42521865
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研究论文 | 本文研究了USF1介导的PARP1转录在七氟烷诱导的围术期神经认知障碍中的焦亡作用 | 首次揭示USF1作为转录因子调控PARP1表达，促进七氟烷诱导的神经元焦亡，为围术期神经认知障碍的机制提供新见解 | 未明确说明研究局限性，但单细胞RNA测序数据来源于公共数据集，可能缺乏临床样本验证 | 探究七氟烷诱导的神经元焦亡中USF1和PARP1的分子机制 | C57BL/6J小鼠和海马神经元细胞系（CP-H120和HT22） | 机器学习 | 围术期神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公共数据集GSE267933和实验小鼠细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-31 |
Neuroinflammation in Alzheimer's and Parkinson's diseases: pathogenic mechanisms and therapeutic strategies
2026-Jul-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-026-00571-3
PMID:42522048
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和帕金森病中神经炎症的致病机制及治疗策略 | 强调了少突胶质细胞前体细胞和少突胶质细胞在神经免疫交互中未被充分认识的作用，并评估了新兴免疫调节治疗策略 | 目前尚无针对神经炎症过程的特效疗法，综述内容可能受限于现有文献报道 | 总结并分析阿尔茨海默病和帕金森病中神经炎症的中枢及外周机制，评估靶向治疗新策略 | 阿尔茨海默病和帕金森病的中枢及外周炎症机制 | 机器学习 | 阿尔茨海默病、帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 涉及人诱导多能干细胞衍生类器官模型、胶质细胞成像等先进方法 |
| 4 | 2026-07-31 |
Paired mutation calling and spatial transcriptomics identify cellular neighborhoods associated with the neoplastic outcome of mouse colitis
2026-Jul-28, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02673-0
PMID:42521760
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研究论文 | 结合突变检测与空间转录组学，识别与小鼠结肠炎肿瘤结局相关的细胞邻域 | 首次将体内谱系追踪、计算机模拟、突变分析和空间转录组学相结合，揭示慢性炎症中克隆命运与细胞微环境的关联 | 未明确说明局限性 | 探究炎症性肠病向癌症进展过程中，突变克隆的普遍性与扩张如何受细胞环境影响并影响肿瘤结局 | 小鼠结肠炎相关肿瘤发生模型中的上皮和免疫细胞克隆 | 数字病理学 | 结肠炎相关癌症 | 空间转录组学、突变检测、体内谱系追踪 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠模型样品，未明确具体数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-07-31 |
scWeave: A deep learning model that bidirectionally translates between gene expression and chromatin structure at single-cell resolution
2026-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.13.738265
PMID:42523313
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研究论文 | scWeave是一种深度学习模型，能够在单细胞分辨率下双向转换基因表达与染色质结构 | 首次实现单细胞分辨率下基因表达与3D染色质结构的双向转换，采用双自编码器架构提取潜在表征并学习跨模态对齐 | 对完全未见的时间点和物种泛化能力有限，依赖公开的共检测数据集进行训练 | 建立单细胞水平上基因表达与染色质结构之间的关联模型，实现跨模态推断 | 小鼠胚胎发育、小鼠皮层、小鼠嗅觉上皮和人类骨髓的细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scHi-C, 共检测 | 双自编码器 | 基因表达数据, 染色质构象数据 | 六个公开的共检测数据集，涵盖小鼠和人类细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-07-31 |
Whole-body single-cell atlas of an adult vertebrate in homeostasis and regeneration
2026-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703562
PMID:42523349
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研究论文 | 构建成年脊椎动物全身单细胞图谱，揭示稳态与再生过程中的细胞类型和基因表达 | 首次通过区域分层单细胞RNA测序结合空间转录组学，构建了完整成年脊椎动物全身细胞类型图谱，发现了成体结缔组织中保守的体区和附肢特化程序，并通过比较分析揭示了保守的神经细胞类型 | 未提及具体限制，可能包括单细胞分辨率的覆盖完整性和再生数据集的深度 | 构建成年脊椎动物全身细胞类型转录组图谱，研究细胞类型组成、组织进化和再生机制 | 成年斑马鱼（Danio rerio）的全身细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年斑马鱼全身细胞样本，未提供具体数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-31 |
Targeting cellular senescence alleviates bone marrow aging
2026-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.16.736849
PMID:42523366
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研究论文 | 使用PROTAC化合物753b清除衰老细胞可逆转造血系统衰老特征，恢复骨髓造血功能 | 首次利用同时靶向BCL-xL和BCL-2的PROTAC化合物753b进行药理性衰老细胞清除，低毒且有效逆转造血衰老标志，并通过单细胞RNA测序揭示其对骨髓微环境的选择性作用 | 主要基于小鼠模型研究，未在人类中验证，且长期治疗效果和潜在副作用尚待探索 | 探究药理性清除衰老细胞是否能够缓解骨髓衰老，恢复造血干细胞的平衡功能和微环境稳态 | 衰老小鼠的骨髓造血干细胞、骨髓生态位细胞（包括基质和造血细胞） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 8 | 2026-07-31 |
IL-27 Signaling Protects Against Influenza-Associated Pulmonary Aspergillosis Through Inhibition of Type 2 Immunity and Enhanced Antifungal Immunity
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.10.737799
PMID:42523266
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-07-31 |
Single-cell multi-omic analyses resolve the cellular diversity of ALK/ROS1/MET/NTRK-fused gliomas in infants and older children
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.16.738862
PMID:42523284
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析，解析了携带ALK/ROS1/MET/NTRK基因融合的婴儿及较大儿童胶质瘤的细胞多样性 | 首次结合单细胞和单核RNA/ATAC-seq以及空间转录组学，全面描绘了融合阳性胶质瘤的细胞层次结构，发现了以放射状胶质细胞为顶点的肿瘤层次，并揭示了FOS/JUN驱动的致癌程序和髓系细胞亚群 | 未明确描述 | 解析婴儿型半球胶质瘤及其他受体酪氨酸激酶融合阳性胶质瘤的细胞状态和发展程序 | 24例融合阳性胶质瘤患者（涵盖婴儿至青少年）的肿瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq、单核ATAC-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组、单核染色质可及性、空间转录组数据 | 24例融合阳性胶质瘤患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium进行单细胞RNA-seq和单核ATAC-seq，10x Visium进行空间转录组学 |
| 10 | 2026-07-31 |
Enhanced BCMA Antigen Density Increases Trogocytosis and Attenuates CAR T cell Function
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.15.738803
PMID:42523297
|
研究论文 | 本文研究了γ-分泌酶抑制剂（GSI）增加BCMA抗原密度对CAR T细胞微胞饮作用及功能的影响，揭示了增强抗原密度带来的初始杀伤提升与功能耗竭之间的矛盾效应 | 首次系统阐明了GSI提升BCMA密度对CAR T细胞微胞饮作用的双重影响，并通过多组学分析和临床试验数据验证了微胞饮作用在抗原调控和免疫逃逸中的关键角色 | 研究主要依赖体外模型和有限临床试验样本，未完全阐明GSI在体内长期应用中微胞饮作用的动态变化及个体差异 | 探究BCMA抗原密度增加对CAR T细胞微胞饮作用、功能耗竭及治疗效果的调控机制 | 多发性骨髓瘤细胞系（H929、K562等）及来自两项I期临床试验（NCT03338972和NCT02577）的患者样品 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、蛋白质组学分析、共聚焦显微镜 | CAR T细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、临床数据 | 涉及两项I期临床试验患者样本及多种体外细胞系实验（具体数量未提及） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA-seq文库构建，Illumina NovaSeq用于测序 |
| 11 | 2026-07-31 |
Broad remodeling of the pulmonary immune landscape occurs during IAPA with specific functional deficits of neutrophil subsets
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.10.737810
PMID:42523365
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学和功能性中性粒细胞实验揭示了流感相关肺曲霉病（IAPA）中肺免疫景观的广泛重塑及中性粒细胞亚群的特异性功能缺陷 | 首次在单细胞水平全面描绘IAPA过程中肺免疫景观的变化，并鉴定出传统中性粒细胞和炎症性中性粒细胞在抗真菌效应功能上存在差异 | 未提及 | 表征IAPA过程中肺免疫景观的变化，并解析细胞类型特异的免疫机制 | 雄性C57BL/6小鼠的肺CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | 呼吸道感染（IAPA） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠分组：未感染对照组、甲型流感（H1N1）感染组、烟曲霉感染组和IAPA组 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-07-31 |
Reference Regulatory Element-Guided Gene Expression Analysis for Mechanistic Inference of Gene Regulatory Networks
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.10.737848
PMID:42523385
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研究论文 | 提出一种基于参考调控元件的可解释框架REGA，用于从基因表达数据推断调控网络 | REGA利用参考调控元件（RE）目录从纯基因表达数据中推断转录因子-RE-基因调控程序，无需额外多组学数据，弥合了调控基因组学中深度多组学与广泛表达数据集之间的深度-广度鸿沟 | 研究工作未明确提及，但可能依赖于参考RE目录的质量和完整性，以及在不同物种或条件下的适用性问题 | 开发一种可扩展且可解释的框架，从基因表达数据中进行基因调控网络（GRN）的机制推断 | 基因调控网络、转录因子、调控元件、基因表达程序 | 计算生物学与生物信息学 | NA | 基因表达数据分析、参考调控元件目录 | NA | 基因表达数据（包括snRNA-seq、空间转录组学、Perturb-seq数据） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-07-31 |
Ependymomas are cancers of the pre-neural crest/roof plate lineage
2026-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.13.736818
PMID:42523223
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、免疫组化和谱系追踪表明，室管膜瘤转录上类似于MSX1表达的前神经嵴/顶板谱系衍生物，并确定了共同的胚胎细胞起源 | 首次发现室管膜瘤的共同胚胎细胞起源为MSX1阳性的前神经嵴/顶板谱系，解决了此前关于细胞起源的争议 | NA | 探究室管膜瘤的细胞起源并统一此前相互矛盾的理论模型 | 不同中枢神经系统部位的室管膜瘤样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 室管膜瘤 | 单细胞转录组学、免疫组化、谱系追踪 | NA | 转录组数据、图像 | 未明确提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-07-31 |
Transsulfuration links aspartate-asparagine metabolism and redox homeo-stasis to drive tumor growth
2026-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.10.737826
PMID:42523380
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研究论文 | 该论文揭示了转硫途径通过连接天冬酰胺代谢与氧化还原稳态来驱动肿瘤生长的机制 | 首次发现天冬酰胺作为细胞质NAD⁺/NADH平衡的调节因子，并揭示转硫途径在肿瘤氧化还原维持中的可靶向脆弱性 | NA | 探究天冬酰胺代谢与氧化还原稳态在肿瘤生长中的作用 | 缺乏GOT1和GOT2的肿瘤细胞及其衍生的肿瘤 | 机器学习 | 癌症 | CRISPR筛选、代谢物追踪、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-07-31 |
Regulatory T cells establish an IL-10-IL10Rα immunometabolic checkpoint that limits HSL activation and lipolysis
2026-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.12.738050
PMID:42523439
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研究论文 | 研究揭示调节性T细胞通过IL-10-IL10Rα免疫代谢检查点限制HSL激活和脂肪分解的机制 | 首次发现脂肪组织Tregs作为β-肾上腺素信号驱动脂肪分解程序的时程依赖性检查点，并阐明IL-10/IL-10Rα信号通过STAT3依赖的转录程序调节HSL活性的新机制 | 尚未完全明确Treg细胞积累与肾上腺素刺激的时序关系及在人类肥胖症中的相关性 | 探究Tregs是否作为免疫代谢检查点直接调控脂肪细胞的脂解程序 | 调节性T细胞（Tregs）和脂肪细胞 | 免疫代谢学 | 肥胖相关脂肪功能障碍 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、蛋白质磷酸化数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA-seq系统 |
| 16 | 2026-07-31 |
Functional Depth Biomarkers Distinguish Lung Squamous Cell Carcinoma from Lung Adenocarcinoma
2026-Jul-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9347794/v1
PMID:42523548
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学数据和功能深度分析，开发了一个从生物网络中提取可操作生物标志物的框架，用于区分肺鳞状细胞癌和肺腺癌 | 首次将Fraiman-Muniz深度统计应用于空间转录组学数据，提出双向交互模式分析并识别出五种新的LUSC富集交互作用，揭示了肿瘤亚型间通路协调架构的根本差异 | 新发现的交互作用机制尚未得到实验验证，存在关键知识空白 | 从空间转录组学数据中提取功能深度生物标志物，区分肺鳞状细胞癌和肺腺癌亚型 | 肺鳞状细胞癌和肺腺癌患者的肿瘤组织及相关的空间转录组学数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 随机森林分类 | 空间转录组学数据 | 996例TCGA患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-07-31 |
A spatially organized immune-stromal program drives the fissure-to-fistula continuum in Crohn's disease
2026-Jul-07, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjag107
PMID:42522256
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研究论文 | 通过空间转录组学研究克罗恩病中裂隙到瘘管连续的免疫-基质程序 | 首次将裂隙定义为活跃的免疫-基质微环境而非被动结构缺陷，并揭示了从裂隙到瘘管的渐进性细胞和分子重塑程序 | 研究样本来源有限，且主要基于克罗恩病患者的肠道手术标本，可能无法完全代表所有患者 | 阐明克罗恩病中裂隙形成并向瘘管进展的免疫-基质相互作用机制 | 克罗恩病患者的有炎症组织、不同深度裂隙和肠-肠瘘管的肠道手术标本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 配体-受体分析 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于肠道手术标本，整合单细胞参考数据 |
| 18 | 2026-07-30 |
Deciphering transcriptional plasticity in pancreatic ductal adenocarcinoma reveals alterations in sensory neuron innervation
2026-07, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70233
PMID:41847880
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析胰腺导管腺癌中感觉神经元的转录可塑性，发现肿瘤相关神经支配中神经元亚群变化及肿瘤来源RNA转移的新机制 | 首次对胰腺和胰腺导管腺癌感觉神经元进行详细的转录组学分析，识别出神经丝蛋白阳性神经元为优势亚型，并发现肿瘤来源RNA通过细胞外囊泡转移至感觉神经元的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结论向人类胰腺癌转化需进一步验证 | 揭示胰腺导管腺癌中感觉神经元的转录组特征及其在肿瘤进展中的作用 | 小鼠胰腺感觉神经元（背根神经节中Fast Blue阳性的感觉神经元） | 转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和KPC小鼠模型，具体数量未明确 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 未明确 | NA |
| 19 | 2026-07-30 |
LMTK3 regulates breast cancer angiogenesis via a context-dependent mesenchymal-epithelial transition program
2026-Jun, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01001-2
PMID:41577842
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研究论文 | 本研究揭示LMTK3通过情境依赖的上皮-间质转化程序调控乳腺癌血管生成 | 首次鉴定LMTK3为乳腺癌血管生成的情境依赖性驱动因子，并发现其在三阴性乳腺癌中通过部分EMT状态促进血管生成，在管腔样细胞中则抑制血管生成，揭示了辛普森悖论现象 | 未在体内模型中进一步验证LMTK3抑制对血管正常化的效果，且辛普森悖论的分子机制尚需更深层次解析 | 探究LMTK3在乳腺癌血管生成微环境中的具体作用和调控机制 | 乳腺癌细胞（间质样三阴性乳腺癌和管腔样细胞） | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 20 | 2026-07-30 |
Identifying clinically relevant cell state interactions in the tumor microenvironment of IDH-mutant gliomas using CSI-TME
2026-Jun, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-026-00201-0
PMID:41807578
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研究论文 | 提出了CSI-TME计算框架，用于从批量转录组数据推断IDH突变胶质瘤肿瘤微环境中的细胞状态相互作用 | 将基因相互作用概念（如合成致死）扩展到细胞状态，直接利用大规模批量转录组数据集推断预后相关的细胞状态互作 | 缺乏具有临床信息的单细胞RNA测序队列，且批量RNA测序队列缺少细胞背景 | 系统表征IDH突变胶质瘤肿瘤微环境中的功能细胞状态相互作用 | IDH突变胶质瘤患者肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞状态 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | 批量转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 多个批量转录组数据集队列 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、spatial transcriptomics | NA | NA |