单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 44139 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-09 |
Spatial multi‑omics identifies an SPP1+ macrophage‑driven anti‑apoptotic niche in osteoarthritis synovium via the SPP1‑CD44 axis
2026-11, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.6005
PMID:42825366
|
研究论文 | 该研究通过空间转录组学、单细胞RNA测序和凋亡模型，揭示了骨关节炎滑膜中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动抗凋亡微环境，从而维持持续性滑膜炎 | 首次通过空间多组学揭示了骨关节炎滑膜中TGF-β富集的微环境中SPP1+巨噬细胞在衰老滑膜成纤维细胞旁扩增，并发现SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44信号轴直接抑制炎症性巨噬细胞凋亡，同时通过CCL3分泌招募额外髓系细胞，这与既往报道的促纤维化作用不同 | 研究主要基于小鼠OA模型，人类骨关节炎滑膜中的验证尚不充分，SPP1-CD44轴的具体分子机制及候选化合物的临床转化仍需进一步验证 | 探究骨关节炎滑膜中调控凋亡通路的巨噬细胞功能亚群及其空间微环境，阐明持续性滑膜炎的机制 | 骨关节炎滑膜中的巨噬细胞亚群及其空间微环境 | 空间多组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-10-09 |
Mitochondrial transcript abundance in breast cancer circulating tumour cells may reflect both blood-derived transcripts and biological heterogeneity
2026-Oct-05, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10430-0
PMID:42831917
|
研究论文 | 该研究分析了349个乳腺癌循环肿瘤细胞和129个白细胞的RNA-Seq数据，评估线粒体转录本比例作为单细胞转录组质量指标的可靠性 | 首次系统评估循环肿瘤细胞中线粒体转录本含量的分布特征，揭示其受血液来源转录本污染和肿瘤细胞内在生物学过程双重影响 | 循环肿瘤细胞鉴定标准不统一，不同富集方法间存在显著差异，样本来源和方法学异质性可能影响结论的普适性 | 评估线粒体转录本比例是否可作为循环肿瘤细胞单细胞转录组质量的可靠独立指标 | 乳腺癌循环肿瘤细胞和白细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-Seq | NA | 文本 | 349个乳腺癌循环肿瘤细胞和129个白细胞 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-10-09 |
Discovery of the TGCB microprotein translated from the lncRNA CHASERR
2026-Oct-05, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.10.008
PMID:42833609
|
研究论文 | 该论文发现lncRNA CHASERR并非严格非编码，而是编码一个41个氨基酸的微蛋白TGCB，并通过多种证据支持其活跃翻译和进化保守性 | 首次报道CHASERR编码一个先前未注释的41氨基酸微蛋白TGCB，将CHASERR定位为双功能转录本，并揭示其编码序列位于临床相关的神经发育障碍缺失区域内 | 缺少对TGCB微蛋白功能的直接实验验证（如敲除或过表达功能实验），其与神经发育表型的因果关系尚属推测 | 探究lncRNA CHASERR是否编码功能性微蛋白，并评估其翻译活性、进化保守性及临床相关性 | lncRNA CHASERR及其编码的微蛋白TGCB，以及CHASERR-CHD2调控区域 | 机器学习 | 神经发育障碍 | Ribo-seq, 单细胞转录组, 质谱, 多物种比对 | NA | 文本, 序列 | 47个公开Ribo-seq数据集，以及公开质谱数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-10-09 |
METTL14-mediated m6A modification of CXCL9 mRNA regulates macrophage CS polarization to suppress OSCC growth and stemness
2026-Oct-02, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02053-1
PMID:42825844
|
研究论文 | 本研究揭示了METTL14通过介导CXCL9 mRNA的m6A修饰调控巨噬细胞CS极化，从而抑制口腔鳞状细胞癌生长和干性的新机制 | 首次发现METTL14通过m6A修饰CXCL9 mRNA并由阅读蛋白IGF2BP3识别和稳定，驱动肿瘤相关巨噬细胞向CXCL9⁺表型极化，进而抑制OSCC生长和干性；证实CXCL9/SPP1比值（CS比值）比传统M1/M2分类更可靠的预后生物标志物 | 未在摘要中明确说明 | 阐明METTL14调控肿瘤相关巨噬细胞CS极化并影响OSCC生长和干性的机制 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及正常样本、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、巨噬细胞特异性Mettl14敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组学分析、m6A修饰测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像 | 330例患者组织样本（三个独立批量转录组队列）及OSCC单细胞RNA测序样本和正常样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-10-09 |
Bisphenol A Exposure Perturbs the Immune Microenvironment in Alzheimer's Disease: Insights from Network Toxicology and Single-Cell Transcriptomics
2026-Oct-02, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02606-w
PMID:42825974
|
研究论文 | 该研究整合网络毒理学、批量转录组学、机器学习、免疫去卷积、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接和分子动力学模拟，探究双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子联系 | 整合了网络毒理学、批量转录组学、机器学习、免疫去卷积、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接及100 ns分子动力学模拟等多种方法，系统性地揭示双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子关联，并识别出GSK3B、BCL2、EGFR、APP和PPARD五个候选基因标志物 | 研究结果主要基于计算分析，属于假设生成性质；模型在验证队列中表现显著下降，提示泛化能力有限且可能存在过拟合；LM22参考矩阵不能直接代表脑内驻留免疫细胞群，免疫浸润结果需谨慎解读；需要实验研究来建立因果关系和机制联系 | 探究双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子联系及其对免疫微环境的影响 | 双酚A暴露相关的阿尔茨海默病分子靶点、免疫微环境及候选基因标志物 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 网络毒理学、批量转录组学、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习 | 基因表达数据、图像（分子结构）、文本 | NA | NA | 单核RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-10-09 |
Single-Cell Analysis of Cartilage-Derived Cells Identifies Diverse Populations and a Cholesterol/ER-Stress Chondrocyte Subset in Knee OA
2026-Oct, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70279
PMID:42811796
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膝骨关节炎软骨细胞群体，鉴定出一种与胆固醇代谢和内质网应激相关的新型软骨细胞亚群，并揭示其在骨关节炎发病机制中的作用 | 发现了一种新的应激响应代谢软骨细胞亚群（MetabCs），该亚群与血清总胆固醇水平相关，涉及胆固醇代谢和内质网应激通路；鉴定了新的骨关节炎相关基因HILPDA和AKR1C2；发现磨损软骨细胞呈现混合表型 | 样本量相对有限（共12例患者），未提及多中心验证或更大队列的验证 | 阐明膝骨关节炎发病的细胞和分子机制，分析软骨细胞群体及其空间分布 | 膝骨关节炎患者及非骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞基因表达数据 | 12例患者（9例骨关节炎，3例非骨关节炎），共104,951个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-10-09 |
Integrative transcriptomic and machine learning analysis identifies candidate biomarkers and immune features in diabetic ulcers
2026-Oct-01, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12862-z
PMID:42821160
|
研究论文 | 该研究整合公共转录组数据集与机器学习方法，筛选糖尿病溃疡相关候选生物标志物，并结合免疫分析、单细胞测序和动物模型验证其表达模式与免疫重塑及创面愈合的关系 | 从脂质代谢相关基因集中筛选糖尿病溃疡相关基因，构建包含ANGPTL4、BNIP3、EEF2K、EIF4EBP1、KLHDC1、KLK10、KLK8、NFIX、QSOX1和S100A8的十基因标志物组合，并将其与Th17细胞浸润、白细胞介素受体活性及创面相关细胞亚群定位相关联 | 仍需在更大规模的人类队列中进一步验证后才能应用于临床 | 识别能够区分糖尿病溃疡组织与非溃疡组织的稳健分子标志物，并阐明创面愈合受损的生物学基础 | 糖尿病溃疡患者公共转录组数据集、外部转录组验证队列、链脲佐菌素诱导的C57BL/6小鼠糖尿病创面模型 | 机器学习 | 糖尿病溃疡 | 转录组分析、差异表达分析、随机森林建模、ssGSEA、GSEA、GSVA、药物-基因互作分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、ELISA、western blotting | 随机森林 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像、文本 | 公共转录组数据集和外部转录组验证队列（具体样本数未在摘要中说明）、链脲佐菌素诱导的C57BL/6小鼠糖尿病创面模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-10-09 |
Resolving cell-cell interaction networks and their molecular logic in complex tissues
2026-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03237-0
PMID:42834226
|
研究论文 | 本文提出了CCI-seq，一种通过结合细胞团块组合索引和单细胞测序，在邻近连续体中无偏捕获细胞间相互作用的高通量方法，并在小鼠肾脏、肠道以及人类结直肠癌中解析了细胞间相互作用网络及其分子逻辑 | 开发了CCI-seq方法，将细胞团块组合索引与单细胞测序相结合，能够在邻近连续体中无偏、高通量地捕获细胞间相互作用，同时利用单细胞RNA测序骨架实现深度转录组覆盖，从而揭示相互作用引发的分子状态 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 在复杂组织中大规模解析细胞间相互作用网络及其分子逻辑 | 小鼠肾脏、小鼠肠道、Apc基因敲除小鼠肠道以及人类结直肠癌组织中的细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、组合索引 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-10-09 |
TGF-β/Smad-Associated Epithelial-Fibroblast Remodeling Underlies Collagen Deposition in Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2026-Oct, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70532
PMID:42836585
|
研究论文 | 本研究整合人类单细胞RNA测序数据与组织及蛋白水平验证，揭示CRSwNP中TGF-β/Smad3相关的上皮-成纤维细胞重塑程序驱动胶原沉积 | 整合两个独立人类队列的单细胞RNA测序数据，结合组织学和蛋白水平验证，首次系统刻画了CRSwNP中上皮-成纤维细胞协同重塑程序，并发现GPNMB表达巨噬细胞亚群是TGFB1的潜在来源 | 因果作用仍需空间转录组学和功能实验验证，地塞米松仅部分逆转重塑表型 | 探究EMT、成纤维细胞活化、胶原沉积和TGF-β/Smad信号在CRSwNP鼻黏膜重塑中是否协调作用 | CRSwNP患者的鼻息肉组织及对照鼻黏膜组织，以及OVA/SEB诱导的CRSwNP样小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Masson三色染色、PAS染色、Western blot | CellChat、拟时序分析 | 单细胞转录组数据、图像 | 两个独立人类队列的公开单细胞RNA测序数据集，CRSwNP患者及对照的鼻黏膜组织，以及OVA/SEB诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-10-09 |
Identification of SORT1 as a Key Regulator of Antigen Presentation in CD16+ Monocytes During Septic Shock via Multi-Omics and In Silico Gene Knockout Analysis
2026-Oct, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70548
PMID:42836580
|
研究论文 | 该研究通过整合批量转录组学、机器学习、WGCNA、单细胞转录组学和计算机基因敲除分析，识别出SORT1是脓毒性休克中CD16+单核细胞抗原呈递的关键调控因子 | 首次结合多种组学方法和计算机基因敲除技术，发现SORT1在脓毒性休克CD16+单核细胞中高表达，并通过调控抗原呈递相关基因（如B2M、CD74和MHC II类基因）参与免疫失调，为脓毒性休克的诊断和机制研究提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和计算机模拟，缺乏湿实验验证；单细胞数据仅来自一个数据集（GSE175453），样本量有限；未进行功能实验证实SORT1的具体调控机制 | 通过多组学整合分析和计算机基因敲除，筛选与脓毒性休克相关的核心基因，并深入解析其免疫调控机制 | 脓毒性休克患者 | 机器学习 | 脓毒性休克 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 随机森林, 支持向量机, 混合模型（RF+SVM） | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个批量转录组数据集（包括训练队列和独立外部验证队列GSE137340、GSE26440）和单细胞转录组数据集GSE175453 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-10-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the interaction of TREM2+ macrophages and Tc17 lymphocytes in scalp psoriasis
2026-Sep-29, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-026-09846-3
PMID:42806169
|
研究论文 | 该研究对头皮和躯干斑块型银屑病患者的CD45⁺免疫细胞进行单细胞RNA测序，揭示头皮银屑病中TREM2⁺巨噬细胞与Tc17淋巴细胞的相互作用 | 首次揭示头皮银屑病中富集的FATP2⁺ Tc17细胞与TREM2⁺巨噬细胞通过MHC-I介导的相互作用，并发现IL7R⁺ TRM向Tc17细胞转化优先发生于头皮 | 摘要中未明确说明样本量有限等具体局限性 | 表征头皮银屑病的免疫细胞异质性及部位相关细胞间相互作用，重点关注可能导致局部持续炎症的炎性T细胞和髓系细胞程序 | 银屑病患者头皮和躯干斑块病变及健康对照者的CD45⁺免疫细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | 41,438个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-10-09 |
Integrative analysis of m6A-related genetic variants and single-cell RNA sequencing identifies HLA-DQA1/HLA-DQB1-associated immune signatures in CAR-T-treated diffuse large B-cell lymphoma
2026-Sep-28, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103053
PMID:42805113
|
研究论文 | 该研究整合GWAS、m6A-SNP注释、eQTL注释和单细胞RNA测序数据，识别了m6A相关遗传变异及HLA-DQA1/HLA-DQB1相关的免疫特征，这些特征与CAR-T治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的响应相关 | 首次将m6A相关遗传变异、eQTL注释和单细胞RNA测序整合分析，揭示HLA-DQA1/HLA-DQB1为中心的免疫特征与CAR-T治疗DLBCL响应的关联 | 研究为关联水平，需要进一步的机制研究和前瞻性验证 | 探索m6A相关遗传变异、免疫细胞状态与CAR-T治疗DLBCL响应之间的关系 | 接受CAR-T治疗的难治性B细胞淋巴瘤患者，包括响应者（n=15）和非响应者（n=11） | 机器学习, 单细胞分析, 遗传学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | GWAS, 单细胞RNA测序, eQTL分析 | NA | 基因型数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 响应者15例，非响应者11例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-10-09 |
The inflammatory UPR-IFNG axis reveals LBP as a survival and immunotherapy-response marker in hepatocellular carcinoma
2026-Sep-28, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103039
PMID:42805112
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别出LBP作为肝细胞癌中与UPR和IFNG轴相关的预后和免疫治疗反应标志物 | 首次将UPR-IFNG炎症轴与LBP关联，并通过单细胞分辨率映射恶性细胞程序，结合多种机器学习方法筛选预后基因，发现LBP作为肝细胞癌预后和免疫治疗反应分层的新型候选生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性临床验证；体外实验仅初步验证LBP对细胞增殖的影响，未深入探讨其分子机制 | 识别与UPR和IFNG信号相关的临床可解释生物标志物，用于肝细胞癌的预后评估和免疫治疗反应分层 | 肝细胞癌（LIHC）患者样本及细胞系 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 随机生存森林, CoxBoost | 基因表达数据, 图像 | 278,337个细胞来自三个单细胞RNA测序数据集，以及多个批量转录组队列（GSE116174, GSE144269, GSE14520） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-10-09 |
VEGFA-Positive Macrophages Regulate Aqueous Humor Outflow in Aged Mice and Humans
2026-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.20.746006
PMID:42818326
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和成像技术揭示了衰老过程中VEGFA阳性巨噬细胞通过VEGFA-VEGFR信号通路维持房水外流稳态的补偿机制 | 首次发现Schlemm管周围巨噬细胞来源的VEGFA作为衰老和血管应激期间维持房水外流稳态的补偿机制，并提出TIE2激活作为保护Schlemm管功能和眼压调节的治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究衰老如何影响眼压调节以及房水外流稳态的补偿机制 | 小鼠眼部房角组织、老年小鼠和人类Schlemm管及周围巨噬细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、配体-受体分析、基因治疗 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-10-09 |
Reference-guided pseudotime inference across species and biological contexts
2026-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.04.749461
PMID:42818223
|
研究论文 | 提出Cavebear机器学习框架，利用参考物种或条件的scRNA-seq时间序列数据，引导查询物种或条件的伪时间推断 | 首次实现跨物种和跨生物条件的参考引导伪时间推断，能够将小鼠癌症发展模型的时间信息迁移到人类患者，研究细胞水平的疾病进展 | 依赖参考物种或条件的时间序列scRNA-seq数据，在缺乏合适参考时可能受限 | 解决现有伪时间推断方法在缺乏可靠时间标签的物种或条件下无法准确排序细胞的问题 | scRNA-seq时间序列数据，包括人类胚胎发育、疾病进展等生物过程 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-10-09 |
Kintsugi decides, gene by gene, where spatial transcriptomics borrows information
2026-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.30.748061
PMID:42818295
|
研究论文 | 提出Kintsugi方法，通过留出分子逐个基因决定从空间邻域和同一位置其他基因借用信息的程度，并在肺组织和肺纤维化队列中验证 | 摒弃固定平滑尺度、细胞轮廓或因子模型，让留出分子数据驱动地决定每个基因借用信息的量 | 摘要未明确提及 | 改进亚细胞空间转录组学中基因表达组成的估计，避免固定先验选择对结果的影响 | 肺组织切片、45核心肺纤维化队列 | 空间转录组学 | 肺纤维化、肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 一个肺切片（Xenium和Visium HD测量）、45核心肺纤维化队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium HD | NA |
| 17 | 2026-10-09 |
A comparative single-cell transcriptomic atlas for diverse populations of vertebrate hair cells
2026-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.02.748811
PMID:42818558
|
研究论文 | 该研究整合了人类、小鼠、鸡和斑马鱼的单细胞和单核RNA测序数据集，构建了一个跨物种、跨器官、跨发育阶段的脊椎动物毛细胞转录组比较图谱 | 首次构建了涵盖人类、小鼠、鸡和斑马鱼多个物种、多种器官（耳蜗、前庭、侧线）及不同发育阶段的脊椎动物毛细胞跨物种单细胞转录组图谱，定义了约5000个毛细胞富集基因和884个泛毛细胞富集基因，并基于AUC评分框架揭示了不同发育动态的毛细胞基因集 | 研究主要基于已公开的单细胞和单核RNA测序数据集进行整合分析，可能受限于原始数据集的采样偏差和技术差异；跨物种比较可能受到物种间基因注释质量和可比性的限制 | 研究脊椎动物毛细胞的转录组多样性，揭示不同物种、器官和发育阶段毛细胞的基因表达差异及其保守程序 | 人类、小鼠、鸡和斑马鱼的毛细胞（包括耳蜗、前庭和侧线毛细胞类型）及其支持细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 文本 | 29个毛细胞群体，涵盖人类、小鼠、鸡和斑马鱼的多个器官和发育阶段 | NA | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-10-09 |
Transcriptomic Characterization of Terminal Complement Complex-bound Cells in Human Choroid Using Single-Cell RNA Sequencing
2026-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.05.749603
PMID:42818647
|
研究论文 | 该研究利用基于条形码抗体的单细胞RNA测序技术，在单细胞水平上测量了老年人类供体眼RPE/脉络膜样本中膜攻击复合物（MAC）及其他表面蛋白的丰度，揭示了衰老人类脉络膜中MAC沉积和补体保护的模式 | 首次将基于条形码抗体的单细胞RNA测序方法应用于人类供体眼RPE/脉络膜组织，实现了在单细胞分辨率下同时分析基因表达和表面补体蛋白（包括MAC、CD55、CD59等），并发现MAC在脉络膜毛细血管周细胞上的沉积，为研究年龄相关性黄斑变性中补体介导的脉络膜损伤提供了新方法 | 样本量较小，仅使用了四个老年人类供体眼；摘要中未提及是否包含AMD患者样本与正常样本的对比；未详细说明测序深度和细胞捕获数量 | 开发一种新的单细胞分析方法来同时检测人类供体眼脉络膜细胞的基因表达和表面补体蛋白，并探究衰老人类脉络膜中MAC沉积和补体调控因子的分布模式 | 四个老年人类供体眼的RPE/脉络膜样本 | 单细胞组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序，基于条形码抗体的表面蛋白检测（CITE-seq） | NA | 单细胞转录组数据，表面蛋白表达数据 | 4个老年人类供体眼 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | NA | 基于条形码抗体的单细胞RNA测序方法，使用抗体检测MAC、CD34、CD45、CD55和CD59等表面蛋白 |
| 19 | 2026-10-09 |
Exosome-Mediated Bidirectional Signaling Regulates Glioma Stem-Cell Homeostasis and Radiation-Induced Plasticity
2026-Sep-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.02.748690
PMID:42818566
|
研究论文 | 本文研究了外泌体介导的胶质母细胞瘤干细胞与非干细胞群体之间的双向信号传递，揭示其在维持肿瘤细胞稳态及放疗后可塑性中的作用 | 首次揭示外泌体在胶质母细胞瘤中作为双向反馈信号载体，GIC来源外泌体抑制放疗诱导的非干细胞向GIC转化，而非干细胞来源外泌体则促进GIC维持与自我更新 | 外泌体IQGAP3是否参与GIC群体扩增尚未确定，机制仍需进一步验证 | 探究外泌体是否介导GIC与非干细胞群体之间的双向通讯，从而维持稳态及放疗后的平衡 | 患者来源的胶质母细胞瘤细胞系HK-374和HK-390，包括GIC富集的胶质瘤球和分化单层培养 | 数字病理学 | 脑癌 | 液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 两株患者来源的GBM细胞系（HK-374和HK-390），外泌体蛋白组鉴定出1796个蛋白 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-10-09 |
Maladaptive Piezo1 Mechanotransduction Drives Smooth Muscle Aging in the Gut
2026-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.02.748183
PMID:42818261
|
研究论文 | 该文章揭示了Piezo1机械转导在肠道平滑肌衰老中的关键作用，通过小鼠模型和人类细胞验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次证明Piezo1机械转导是驱动肠道平滑肌衰老的可靶向机制，将机械力感知与年龄相关的肠道运动障碍直接联系起来 | 人类数据仅为趋势性观察，样本量有限，且PIEZO1功能获得携带者的结肠转运延迟未达到统计学显著性 | 探究年龄相关性胃肠道平滑肌功能障碍的分子机制，特别是机械转导在其中的作用 | 小鼠肠道平滑肌细胞和人类肠道平滑肌细胞 | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞转录组学, RNA速率分析, 刚度控制的细胞和组织培养, 药理学研究 | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |