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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-14
Engineering functional ventral midbrain dopaminergic neurons in human organoids through WNT modulation and bioreactor culture
2026-Oct, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 该研究通过三相WNT调控结合动态生物反应器培养,建立了生成富含黑质致密部样多巴胺能神经元的人中脑类器官的分化策略 将三相WNT调控与动态生物反应器培养相结合,显著提高了TH⁺/GIRK2⁺和TH⁺/ALDH1A1⁺多巴胺能神经元的产量,促进了突触成熟、电生理活动和多巴胺释放,并通过单细胞转录组学揭示了SOX6/GIRK2黑质致密部样神经元的出现 摘要中未明确提及该研究的局限性 建立一种可扩展且具有生理相关性的方法,用于研究神经退行性变的分子机制和多巴胺相关疾病 人诱导多能干细胞衍生的人中脑类器官 数字病理学 帕金森病 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-09-14
Effects of SSRIs on the spatial transcriptome of dorsal raphe serotonin neurons
2026-Oct, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本文通过空间转录组学研究了SSRI(选择性5-羟色胺再摄取抑制剂)给药对小鼠背侧中缝核5-羟色胺神经元空间转录组的影响 揭示了背侧中缝核中六种不同的5-羟色胺能亚群及其独特的分子特征和空间分布,并发现了SSRI治疗对基因表达的空间和细胞类型特异性影响 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;样本量未明确说明;仅关注背侧中缝核区域 探究SSRI给药对5-羟色胺神经元的分子和转录效应 小鼠背侧中缝核及邻近中脑结构的5-羟色胺神经元 空间转录组学 抑郁症 空间转录组学 NA 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
3 2026-09-14
Spatial Transcriptomics Delineates the Inflammatory Landscape of Human Dental Pulp: Regional Crosstalk and Therapeutic Implications
2026-Oct, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 本研究利用Visium HD空间转录组技术,绘制了健康与炎症牙髓的空间细胞图谱及细胞间通讯网络,揭示了牙髓炎的病理机制及潜在治疗靶点 首次利用空间转录组测序技术鉴定牙髓中九种细胞群体的空间定位及其细胞间串扰,并绘制了牙髓的炎症图谱 样本量较小(仅2例健康个体和2例牙髓炎患者),结论仍需更大样本验证 利用空间转录组技术研究健康和炎症牙髓的空间细胞结构及分子互作,阐明牙髓炎的病理机制并确定活髓治疗的潜在治疗靶点 健康和炎症的人牙髓组织 空间转录组学 牙髓炎 空间转录组测序 Seurat聚类、细胞轨迹推断、CellphoneDB互作网络建模、PROGENy通路活性评估 空间转录组数据 4例牙髓组织样本(2例健康个体和2例牙髓炎患者) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium HD 10x Genomics Visium HD空间转录组测序平台
4 2026-09-14
Unveiling the Diagnostic Value and Potential Therapeutic Targets of Phenylalanine Metabolism in Pancreatic Cancer via Integrated Multi-Omics and Machine Learning
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合代谢组学、孟德尔随机化和机器学习算法,探讨了苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的作用,并构建了高精度诊断模型 首次将代谢组学、孟德尔随机化与113种机器学习算法组合相结合,构建了高生物学可解释性的胰腺癌诊断模型,并利用SHAP值指导单细胞RNA测序分析和分子对接验证 未明确提及 探究苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的诊断价值及潜在治疗靶点,开发高精度诊断模型 胰腺癌患者、55种血浆代谢物、胰腺癌细胞系 机器学习 胰腺癌 代谢组学, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 定量实时PCR, 分子对接, 分子动力学模拟 机器学习算法组合, SHAP 代谢物数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像(分子对接结构) 55种血浆代谢物, 胰腺癌细胞系 NA 单细胞RNA测序, 代谢组学 NA NA
5 2026-09-14
Identifying JAK2 and ANXA5 as Key Genes Linking Obstructive Sleep Apnea and Oxidative Stress via Machine Learning and Multilayer Transcriptomic Integration With Functional Validation
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 整合多层转录组学与机器学习识别并验证JAK2和ANXA5为连接阻塞性睡眠呼吸暂停与氧化应激的关键基因 结合limma、WGCNA、PPI、Lasso回归、随机森林和SVM-RFE等多种机器学习方法筛选关键基因,并整合单细胞RNA测序、拟时序轨迹推断、细胞间通讯分析和免疫浸润解卷积揭示单核细胞亚型重塑,同时通过虚拟基因敲除和临床样本RT-qPCR及Western blotting验证 未明确说明 通过生物信息学方法识别和验证与阻塞性睡眠呼吸暂停相关的氧化应激相关潜在基因 阻塞性睡眠呼吸暂停患者及相关的氧化应激相关基因 机器学习 阻塞性睡眠呼吸暂停 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting Lasso回归, 随机森林, SVM-RFE 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 图像 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-09-14
Single-Cell Transcriptomics Uncovers β-Elemene-Induced Macrophage Reprogramming as a Mechanism to Suppress Osteosarcoma Stemness via the CCL2-Akt Axis
2026-Sep-12, Immunological investigations IF:2.9Q3
研究论文 该研究结合单细胞RNA测序与功能验证,揭示β-榄香烯通过重编程肿瘤相关巨噬细胞、抑制CCL2-Akt信号轴来抑制骨肉瘤干性的机制 首次通过单细胞转录组学揭示β-榄香烯诱导巨噬细胞由M2向M1表型极化,并通过下调M2巨噬细胞分泌的CCL2、抑制Akt/β-catenin通路来削弱骨肉瘤干细胞特性,提出了一种新的免疫代谢治疗机制 研究主要基于小鼠骨肉瘤模型,缺乏人体临床样本验证;单细胞测序的样本量及具体平台信息未在摘要中明确;机制验证主要集中于CCL2-Akt轴,可能遗漏其他协同通路 探究β-榄香烯如何重编程肿瘤相关巨噬细胞以抑制骨肉瘤进展及干性维持 小鼠骨肉瘤模型中的肿瘤相关巨噬细胞及骨肉瘤干细胞样细胞 单细胞转录组学、肿瘤免疫学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、巨噬细胞极化实验、共培养体系、Western blot、RT-PCR、ELISA、肿瘤球形成实验、挽救实验 NA 单细胞转录组数据、文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-09-14
Elucidating the beneficial effects of gut microbiota-derived metabolites in treating hepatocellular carcinoma: an integrated network pharmacology, molecular docking, and single-cell sequencing analysis
2026-Sep-12, Bioresources and bioprocessing IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合网络药理学、分子对接和单细胞测序分析,阐明肠道微生物群衍生代谢物治疗肝细胞癌的潜在机制 首次整合网络药理学、分子对接和单细胞测序分析,系统揭示了肠道微生物群衍生代谢物通过多靶点、多通路抑制肝细胞癌的作用机制,并构建了微生物群-代谢物-靶点-疾病(M-M-T-D)网络 研究主要基于生物信息学分析和分子对接预测,缺乏体内和体外实验验证;未涉及代谢物的具体剂量效应关系和临床转化应用 阐明肠道微生物群衍生代谢物治疗肝细胞癌的潜在分子机制和核心靶点 肠道微生物群衍生代谢物、肝细胞癌相关靶点、肝细胞癌患者基因表达数据和单细胞转录组数据 机器学习, 数字病理学 肝癌 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-09-14
The spatial architecture of tumor immunity: Emerging predictive biomarkers across cancer
2026-Sep-12, Immunologic research IF:3.3Q3
综述 本文系统总结了空间肿瘤免疫学的最新进展,提出从细胞组成到细胞邻域解读肿瘤免疫的概念框架,并讨论空间结构如何影响肿瘤异质性、治疗反应和耐药,以及如何转化为可操作的生物标志物 提出从组成到细胞邻域的概念框架来解读肿瘤免疫,系统归纳了免疫支持性微结构(成熟三级淋巴结构、树突状细胞中心免疫三联体、高内皮微静脉相关招募走廊、效应-肿瘤界面)和排除/抑制性结构(CAF介导的基质屏障、SPP1+巨噬细胞-CAF生态位、停滞T细胞区、Treg富集抑制性生态位、NLRP3+巨噬细胞富集区域),并将空间读数作为跨癌种稳健生物标志物 作为综述文章,未提供原始实验数据,所提出的概念框架和空间生物标志物的临床转化仍需前瞻性验证 总结空间肿瘤免疫学进展,提出从细胞组成到细胞邻域解读肿瘤免疫的概念框架,探讨空间结构作为预测性生物标志物在患者分层、治疗监测和下一代精准免疫治疗中的应用 肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞及其空间组织结构,涵盖多种癌症类型 数字病理学 泛癌种 多重成像,空间蛋白质组学,空间转录组学,AI辅助组织分析 NA 图像,文本 NA NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
9 2026-09-14
Spatiotemporal Optogenetic Engineered MSCs for the Treatment of ConA-Induced Liver Injury
2026-Sep-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 该研究开发了一种基于光遗传学的策略,通过紫外光或近红外光控制间充质干细胞(MSC)的时空工程化,以增强其归巢能力并促进ConA诱导的肝损伤修复 将光敏蛋白UVR8与趋化因子受体CXCR4整合,构建时空光遗传学系统;利用上转换纳米颗粒(UCNPs)将近红外光转换为紫外光,解决紫外光组织穿透深度有限的问题;首次将光遗传学工程化MSC用于肝损伤治疗 仅在小鼠模型中验证了治疗效果,未进行人体临床试验;UCNPs的长期生物安全性及潜在毒性尚未评估;光遗传学系统的长期稳定性和可控性需要进一步研究 开发一种时空光遗传学策略,工程化改造间充质干细胞以增强其向肝损伤部位的归巢能力,并探究其对ConA诱导肝损伤的治疗效果及机制 ConA诱导肝损伤小鼠模型、间充质干细胞(MSCs)、肝内巨噬细胞、肝细胞 机器学习, 数字病理学 肝损伤 单细胞测序, 光遗传学, 上转换纳米颗粒(UCNPs)技术 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2026-09-14
Preserving the Pineal Gland in Perinatal Mouse Brain Preparations
2026-Sep-11, Journal of visualized experiments : JoVE
研究方法论文 本文介绍了一种在围产期小鼠脑部解剖中保留松果体完整性的创新解剖方法 提出了一种创新的解剖程序,能够在胚胎期至出生后第7天的大脑分离过程中保持松果体的结构完整性及其与间脑顶部的连接 文中未明确提及研究限制 解决因松果体体积小且在胚胎期大脑解剖中难以保留而导致的早期发育和信号机制研究困难 围产期小鼠大脑中的松果体 神经生物学 不适用 解剖学技术、原位杂交、免疫组织化学、空间转录组学 不适用 组织图像、分子数据 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用
11 2026-09-14
Polyethylene terephthalate micro-/nanoplastics suppress SAT1-dependent ferroptosis in triple-negative breast cancer
2026-Sep-09, Environment international IF:10.3Q1
研究论文 该研究通过扫描电镜、显微拉曼光谱和热裂解-气相色谱-质谱联用技术表征乳腺癌组织中的微/纳米塑料,并结合空间转录组学分析揭示聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)微/纳米塑料通过抑制SAT1依赖性铁死亡促进三阴性乳腺癌进展 首次在乳腺癌组织中系统表征微/纳米塑料,并首次揭示PET微/纳米塑料通过下调SAT1抑制铁死亡从而促进三阴性乳腺癌进展的分子机制,同时发现PET微/纳米塑料可通过颗粒内吞或表面吸附与乳腺癌细胞相互作用 研究主要聚焦于PET微/纳米塑料与TNBC的关联性,其他类型微/纳米塑料的作用未充分探讨,且具体分子调控机制仍需进一步深入研究 探究微/纳米塑料暴露对三阴性乳腺癌进展的潜在关联效应及其分子机制 人类乳腺癌组织样本及三阴性乳腺癌细胞系和异种移植小鼠模型 数字病理学, 机器学习 乳腺癌 扫描电子显微镜, 显微拉曼光谱, 热裂解-气相色谱-质谱联用, 空间转录组学 NA 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
12 2026-09-14
Cancer-associated fibroblast-derived POSTN as a metabolic "switch" shapes lipid-stressed macrophage polarization in gastric cancer
2026-Sep-09, Redox biology IF:10.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
13 2026-09-14
Single-cell RNA sequencing reveals clonally expanded CD4+ tissue-resident memory T cells in histidyl-tRNA synthetase-induced myositis
2026-Sep-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该文通过单细胞RNA测序分析了组氨酰-tRNA合成酶诱导的肌炎小鼠模型中炎症骨骼肌的CD4+组织驻留记忆T细胞的特征 首次在组氨酰-tRNA合成酶诱导的肌炎小鼠模型中鉴定出显著的CD4+组织驻留记忆T细胞群体,并揭示其克隆扩增特征及与人类肌肉组织转录组的验证 研究基于小鼠模型,结果外推至人类特发性炎症性肌病需谨慎;样本量有限;未进行功能验证实验 探究CD4+组织驻留记忆T细胞在特发性炎症性肌病发病机制中的潜在作用 组氨酰-tRNA合成酶诱导的肌炎小鼠模型及人类肌肉组织转录组数据 单细胞转录组学 特发性炎症性肌病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-09-14
Human pericardial macrophages suppress cardiac fibrosis through cystatin C signaling after myocardial infarction
2026-Sep-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过患者心包样本和单细胞RNA测序,揭示人心包巨噬细胞通过胱抑素C信号抑制心肌梗死后心脏纤维化的机制 首次在人体样本中证实心包免疫细胞直接抑制心脏成纤维细胞纤维化活性,并鉴定出两种心肌梗死后特异改变的心包巨噬细胞亚群,明确纤连蛋白表达巨噬细胞通过释放胱抑素C发挥抗纤维化作用 未明确说明样本量及单细胞测序的具体平台信息,体内模型验证可能受物种差异限制 探究人心包巨噬细胞在心肌梗死后调控心脏重塑的分子机制 患者心包样本、心包液细胞、心脏成纤维细胞及心肌梗死体内模型 单细胞组学、免疫学、心血管研究 心血管疾病、心肌梗死 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-09-14
A cross-model single-cell atlas reveals conserved involvement of osteopontin in polycystic kidney disease
2026-Sep-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究构建了跨多囊肾病小鼠模型的整合单细胞RNA测序图谱,揭示骨桥蛋白(Spp1)在多囊肾病中的保守参与作用 首次构建跨多种多囊肾病小鼠模型的整合单细胞RNA测序图谱,系统比较不同模型间细胞类型组成、基因表达和细胞间信号网络的差异,发现Spp1(骨桥蛋白)在PKD富集簇中表达和信号传导增强,并通过基因敲除实验验证其功能,同时建立了可公开检索的网站 Spp1全局敲除仅导致囊肿严重程度适度减轻和肾功能轻度改善,说明骨桥蛋白并非唯一关键驱动因素 阐明多囊肾病中遗传和环境修饰因素导致的细胞和分子层面异质性,寻找新的治疗靶点 多囊肾病小鼠模型(包括Pkd1RC/RC等多种模型)及Pkd1RC/RC小鼠的肾脏组织 单细胞组学 多囊肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-09-14
Estrogen promotes tumor phenotypes in ER+ and ER- breast cancer through UGDH-GPR30
2026-Sep-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了雌激素通过UGDH-GPR30通路促进ER+和ER-乳腺癌肿瘤表型的作用机制 揭示了UGDH在ER+和ER-乳腺癌中通过非经典雌激素通路(GPR30)介导肿瘤进展的作用,并证实ER-乳腺癌细胞也具有雌激素响应性 未明确说明 探究雌激素刺激对ER+和ER-乳腺癌细胞模型肿瘤表型的影响,以及UGDH在其中的作用机制 ER+和ER-乳腺癌细胞系及患者标本 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-09-14
HIF1A+CSF3R+ neutrophils-dominated hypoxic niche induced metabolic reprogramming for neoadjuvant therapy resistance in NSCLC
2026-Sep-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多中心、多队列的非小细胞肺癌空间转录组、单细胞转录组、T细胞受体测序、bulk RNA转录组、磷酸化蛋白质组、基因组突变及临床数据,全面评估HIF1A+CSF3R+中性粒细胞在NSCLC新辅助治疗耐药中的作用,并通过体外实验、梯度提升机建模和计算机辅助药物设计验证靶向治疗策略 首次揭示HIF1A+CSF3R+中性粒细胞主导的缺氧生态位通过代谢重编程诱导NSCLC新辅助治疗耐药,构建了以该细胞亚群为中心的微环境免疫失调网络,并通过CADD鉴定出platycodin-D2特异性靶向CSF3R的小分子药物 摘要中未明确提及研究局限性 探索导致NSCLC患者新辅助治疗耐药的具体微环境细胞及其机制,并寻找靶向治疗策略 接受新辅助治疗的NSCLC患者肿瘤样本及小鼠模型 数字病理学 肺癌 空间转录组学, 单细胞转录组测序, T细胞受体库测序, bulk RNA转录组测序, 磷酸化蛋白质组学, 基因组突变分析 梯度提升机(GBM), 计算机辅助药物设计(CADD) 图像, 文本, 基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
18 2026-09-14
Transcriptomic analysis of a phase 1 trial for intraperitoneal monocytes plus IFNs in ovarian cancer reveals support and recruitment of cell-mediated immunity
2026-Sep-07, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 该研究通过对接受腹腔注射自体单核细胞联合干扰素治疗(AMIGA)的卵巢癌患者循环免疫细胞进行转录组分析,揭示了长期应答者中细胞介导免疫应答增强及T细胞募集相关趋化因子的上调 首次对腹腔注射自体单核细胞联合IFNγ和IFNα(AMIGA)治疗卵巢癌的1期临床试验进行转录组学分析,发现长期应答者存在增强的细胞介导免疫应答,T细胞中独特特异性TCRβ链基因上调,以及CXCL10和CCL2趋化因子上调,并通过体外模型验证了这些趋化因子对T细胞趋化的不同效应 摘要中未明确提及研究的局限性 深入了解和改善腹腔注射自体单核细胞联合干扰素(AMIGA)治疗复发性铂耐药卵巢癌的疗效机制,特别是对免疫应答的转录组学影响 接受AMIGA治疗的复发性铂耐药卵巢癌患者的循环免疫细胞、健康供者来源的原代人单核细胞和T细胞,以及卵巢癌细胞系 digital pathology 卵巢癌 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 转录组数据(RNA-seq数据), 文本 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
19 2026-09-14
Anti-CTLA-4 antibody potentiates the antitumor effect of armed oncolytic virus OVM18 via enhancing intratumoral IL-18R1+CD8+ T cells
2026-Sep-07, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过整合免疫分析揭示了瘤内IL-18R1+CD8+ T细胞是OVM18溶瘤病毒治疗效果的关键效应群体,并证明抗CTLA-4抗体可通过增强该细胞群来克服治疗耐药 首次鉴定瘤内IL-18R1+CD8+ T细胞为OVM18溶瘤病毒治疗的关键效应群体,阐明其依赖于cDC1的致敏和肿瘤转运机制,并提出OVM18联合抗CTLA-4抗体可克服治疗耐药 摘要中未明确提及研究局限性 阐明影响OVM18溶瘤病毒治疗效果的宿主免疫决定因素,并探索联合免疫检查点阻断的协同治疗策略 荷瘤小鼠模型及肿瘤微环境中的免疫细胞群体 肿瘤免疫学 癌症 bulk转录组学、单细胞转录组学、流式细胞术、TCR repertoire分析 NA 转录组数据、流式细胞数据、TCR序列数据 NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
20 2026-09-14
Single-cell RNA-seq analysis revealed that BHLHE40 and its binding protein THBS1 are involved in diabetic corneal epitheliopathy
2026-Sep-04, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术解析糖尿病角膜上皮病变的细胞和分子机制,并确定BHLHE40及其结合蛋白THBS1为潜在治疗靶点 首次在单细胞水平揭示糖尿病角膜上皮中角膜缘干细胞龛基底细胞的显著差异,并发现BHLHE40与THBS1的直接结合关系及其在糖尿病角膜上皮病变中的功能作用 需要进一步在体内模型中验证BHLHE40和THBS1作为治疗靶点的有效性,且样本来源和数量有限 阐明糖尿病角膜上皮病变的细胞和分子机制,并利用单细胞RNA测序确定潜在治疗靶点 人角膜上皮组织(糖尿病组和对照组) 单细胞组学 糖尿病角膜上皮病变 单细胞RNA-seq、CUT&Tag-qPCR NA 单细胞转录组数据、图像 40,976个单细胞(来自人角膜上皮) NA single-cell RNA-seq, CUT&Tag NA NA
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