单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-03-17	Spatial transcriptomics combined with single-nucleus RNA sequencing reveals glial cell heterogeneity in the human spinal cord 2025-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01876 PMID:38934400	研究论文	本文通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了人类脊髓中胶质细胞的异质性	首次在人类脊髓中应用高吞吐量单核RNA测序和空间转录组学技术，详细描绘了星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞的分子异质性，并与小鼠数据进行了跨物种比较	研究主要局限于人类和小鼠的脊髓胶质细胞，未涉及其他物种或神经系统的其他部分	探索人类脊髓中胶质细胞的分子异质性及其在疾病中的作用	人类和小鼠脊髓中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞	数字病理	神经退行性疾病	单核RNA测序, 空间转录组学	NA	RNA序列数据	人类和小鼠的脊髓样本
2	2025-03-17	Exosomes originating from neural stem cells undergoing necroptosis participate in cellular communication by inducing TSC2 upregulation of recipient cells following spinal cord injury 2025-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00068 PMID:38993124	研究论文	本文研究了脊髓损伤后神经干细胞坏死性凋亡产生的外泌体在细胞通讯中的作用，并发现这些外泌体通过诱导受体细胞中TSC2的上调参与细胞通讯	首次揭示了神经干细胞坏死性凋亡产生的外泌体在脊髓损伤后细胞通讯中的具体机制，特别是TSC2的上调作用	研究主要基于体外模型，尚未在体内模型中验证这些发现	探讨脊髓损伤后神经干细胞坏死性凋亡产生的外泌体在细胞通讯中的作用	神经干细胞及其外泌体	细胞生物学	脊髓损伤	单细胞RNA测序、转录组测序	体外坏死性凋亡模型	RNA测序数据	16-17天胚胎小鼠的神经干细胞
3	2025-03-17	Oligodendroglial heterogeneity in health, disease, and recovery: deeper insights into myelin dynamics 2025-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00694 PMID:39665821	研究论文	本文探讨了少突胶质细胞在健康、疾病和恢复过程中的异质性，特别是通过单细胞RNA测序技术揭示了新的细胞状态，并提出了新的分类系统	通过单细胞RNA测序技术发现了少突胶质细胞谱系中的五种新细胞状态，并提出了新的分类系统，有助于更深入地理解少突胶质细胞在生理和病理环境中的作用	需要进一步的研究来验证这些新发现的细胞状态在不同疾病模型中的具体作用	研究少突胶质细胞在健康和疾病状态下的异质性，以及其在脱髓鞘疾病中的作用	少突胶质细胞谱系	生物医学	多发性硬化症、阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化症	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4	2025-03-17	Lactate drives senescence-resistant lineages in hepatocellular carcinoma via histone H2B lactylation of NDRG1 2025-Apr-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217567 PMID:39978571	研究论文	本文通过单细胞RNA测序轨迹分析重建了肝细胞癌（HCC）的克隆进化，揭示了LDHA-NDRG1轴在癌症进展中的关键作用，并提出了针对乳酸化介导的表观遗传调控的精准医学策略	揭示了LDHA-NDRG1轴通过乳酸化组蛋白H2B在K58位点的表观遗传机制，连接代谢重编程与衰老逃逸，为HCC异质性提供了新的分子机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索肝细胞癌的克隆进化及其与肿瘤异质性和衰老抵抗的关系	肝细胞癌（HCC）	癌症研究	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
5	2025-03-17	Spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing revealed dendritic cell-mediated inflammation in keratoconus 2025-Apr, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2025.01.008 PMID:39837422	研究论文	本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术揭示了树突状细胞介导的炎症在圆锥角膜中的作用	首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，全面揭示了圆锥角膜的炎症特征及其空间分布	研究中未详细探讨其他可能的炎症通路及其在圆锥角膜中的作用	研究圆锥角膜的分子和细胞变化，特别是炎症反应的作用	圆锥角膜患者的角膜组织	数字病理学	圆锥角膜	空间转录组学, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
6	2025-03-17	Network-based analysis of Alzheimer's Disease genes using multi-omics network integration with graph diffusion 2025-Apr, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbi.2025.104797 PMID:39993589	研究论文	本文通过整合多组学网络，利用图扩散方法构建高质量网络，分析阿尔茨海默病（AD）基因的网络特性	挑战了AD基因主要是网络中枢纽基因的传统观点，揭示了AD基因在网络中的分布特性及其调控机制	需要进一步验证多组学网络整合方法的普适性及其在不同疾病中的应用	研究阿尔茨海默病基因在网络中的特性及其调控机制	阿尔茨海默病基因	生物信息学	阿尔茨海默病	微阵列、单细胞RNA测序、单核RNA测序、蛋白质相互作用、基因本体信息	图扩散	基因表达数据	NA
7	2025-03-17	Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma† 2025-Mar-15, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6420 PMID:40088426	研究论文	本文探讨了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤进展中的作用	通过单细胞和空间转录组学技术，定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型（iCAF），并揭示了其与不良预后和肿瘤侵袭的关联	在CAF调控肿瘤表型中，相关性与因果关系的分离仍然是一个重大挑战	研究脊索瘤中CAFs的异质性及其在肿瘤进展中的作用	脊索瘤中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	脊索瘤	单细胞转录组学、空间转录组学	NA	转录组数据	NA
8	2025-03-17	Single-cell and chromatin accessibility profiling reveals regulatory programs of pathogenic Th2 cells in allergic asthma 2025-Mar-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57590-3 PMID:40089475	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析，揭示了过敏性哮喘中致病性Th2细胞的调控程序	发现了肺致病性Th2细胞的两个高度促炎亚群，并揭示了TSLP和TNFRSF成员在体外生成pTh2细胞中的重要作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究过敏性哮喘中致病性Th2细胞的异质性和表观遗传调控机制	小鼠肺致病性Th2细胞	免疫学	过敏性哮喘	单细胞RNA测序，染色质可及性分析	NA	RNA测序数据，染色质可及性数据	NA
9	2025-03-17	Novel immune drug combination induces tumour microenvironment remodelling and reduces the dosage of anti-PD-1 antibody 2025-Mar-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87344-6 PMID:40089538	研究论文	本文研究了一种新型免疫药物组合，通过调节肿瘤微环境（TME）来减少抗PD-1抗体的剂量，同时保持抗肿瘤效果	提出了一种新的免疫药物组合（Comb），能够增强低剂量抗PD-1抗体的疗效，并通过调节TME实现抗肿瘤效果	研究仅在鼠类结直肠癌模型中进行，尚未在人类临床试验中验证	探索减少抗PD-1抗体剂量同时保持抗肿瘤效果的新策略	鼠类结直肠癌模型（MC38细胞系）	肿瘤免疫治疗	结直肠癌	流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体库分析	鼠类结直肠癌模型	单细胞RNA测序数据、流式细胞数据	鼠类结直肠癌模型样本
10	2025-03-17	LINC02363: a potential biomarker for early diagnosis and treatment of sepsis 2025-Mar-15, BMC immunology IF:2.9Q3 DOI:10.1186/s12865-025-00702-x PMID:40089725	研究论文	本研究通过转录组数据分析，识别出与脓毒症相关的关键基因LINC02363，并探讨其作为诊断和治疗脓毒症潜在生物标志物的可能性	首次发现LINC02363在脓毒症中的关键作用，并验证其作为新型生物标志物的潜力	研究样本来源单一，且未进行大规模临床验证	识别与脓毒症相关的lncRNAs，为脓毒症的诊断和治疗提供潜在生物标志物	脓毒症患者	生物信息学	脓毒症	转录组数据分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、基因集富集分析(GSEA)、单细胞测序、qPCR	NA	转录组数据	从中国国家基因库(CNGBdb)检索的脓毒症患者数据
11	2025-03-17	Comparative Single-Cell Transcriptomics of Human Neuroblastoma and Preclinical Models Reveals Conservation of an Adrenergic Cell State 2025-Mar-14, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1507 PMID:39808065	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了人类神经母细胞瘤与临床前模型的转录组特征，揭示了肾上腺素能细胞状态的保守性	开发了一种体外肿瘤模型，该模型保持了关键的肾上腺素能细胞状态，增强了其在神经母细胞瘤研究中的转化潜力	需要进一步验证这些临床前模型在重现神经母细胞瘤等异质性恶性肿瘤细胞特性方面的准确性	验证转基因小鼠和体外肿瘤模型在重现神经母细胞瘤细胞特性方面的准确性，并探索潜在的治疗策略	人类神经母细胞瘤、TH-MYCN小鼠肿瘤、体外肿瘤模型	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	TH-MYCN小鼠肿瘤、体外肿瘤模型、人类神经母细胞瘤样本
12	2025-03-17	Functional and molecular single-cell analyses implicate PRDM14 in the initiation of B cell leukemia in mice 2025-Mar-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93043-z PMID:40087379	研究论文	本文通过单细胞功能与分子分析，探讨了PRDM14在小鼠B细胞白血病起始中的作用	揭示了PRDM14通过混杂DNA结合激活致癌途径并偏向自我更新的B-1样表型来启动癌症的分子机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨PRDM14在B细胞白血病起始中的分子机制	小鼠模型中的Prdm14表达细胞	分子生物学	白血病	质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据、质谱流式细胞术数据	小鼠骨髓样本
13	2025-03-17	Macrophage-derived SPP1 exacerbate myocardial injury by interacting with fibroblasts in viral myocarditis 2025-Mar-14, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-025-00621-2 PMID:40087693	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和体外共培养实验，揭示了巨噬细胞来源的SPP1在病毒性心肌炎（VMC）中通过与成纤维细胞相互作用加剧心肌损伤的机制	首次发现并验证了Spp1+巨噬细胞在VMC急性期通过促进成纤维细胞向炎症表型转化，进而加剧心肌免疫损伤的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究病毒性心肌炎（VMC）的免疫病理机制，特别是巨噬细胞和成纤维细胞在其中的作用	小鼠心脏组织及巨噬细胞和成纤维细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、体外共培养实验	NA	RNA测序数据、细胞培养数据	小鼠心脏组织样本
14	2025-03-17	Combination therapy with Chicoric acid and PD-1/PD-L1 blockade improves the immunotherapy response in patient-derived ovarian cancer xenograft model 2025-Mar-14, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02146-7 PMID:40087780	研究论文	本研究探讨了菊苣酸（CA）与PD-1/PD-L1阻断免疫疗法联合治疗在难治性卵巢癌患者来源的异种移植模型中的疗效	首次将CA与PD-1/PD-L1阻断免疫疗法结合，用于难治性卵巢癌的治疗，并发现CA能增强免疫细胞对卵巢癌细胞的抗肿瘤能力	研究仅限于患者来源的异种移植模型，尚未进行临床试验	开发新的有效治疗策略，提高难治性卵巢癌对免疫疗法的反应	难治性卵巢癌患者来源的异种移植模型	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，免疫组织化学	患者来源的异种移植模型（PDX）	单细胞RNA测序数据，免疫组织化学数据	15个样本，158,734个细胞
15	2025-03-17	Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury 2025-Mar-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413253 PMID:40087815	研究论文	本文研究了PAD2介导的蛋白质瓜氨酸化在急性肺损伤（ALI）中巨噬细胞极化的作用，并开发了一种基于纳米颗粒的靶向治疗策略	发现了PAD2在NF-κB p65上的新瓜氨酸化位点R171，并开发了一种基于金纳米颗粒的靶向治疗策略，用于选择性递送PAD2抑制剂到M1极化巨噬细胞	研究主要针对PA诱导的急性肺损伤，可能不适用于其他类型的肺损伤	研究PAD2在急性肺损伤中巨噬细胞极化的机制，并开发一种新的治疗策略	巨噬细胞和急性肺损伤模型	生物医学工程	急性肺损伤	单细胞RNA测序和质谱蛋白质组学	NA	RNA和蛋白质数据	NA
16	2025-03-17	Leveraging machine learning for integrative analysis of T-cell receptor repertoires in colorectal cancer: Insights into MAIT cell dynamics and risk assessment 2025-Mar-14, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102358 PMID:40088748	研究论文	本研究通过分析结直肠癌患者的T细胞受体（TCR）库，探讨了MAIT细胞的动态变化及其在疾病风险评估中的潜力	首次在结直肠癌患者中观察到MAIT细胞的显著存在，并识别出多个在单细胞和批量数据中重复出现的TCR序列，这些序列与疾病阶段和风险相关	样本量相对较小，尤其是单细胞数据集仅有10和12名患者，且数据来源的时间跨度较大	探讨结直肠癌患者TCR库的特征及其在疾病风险评估中的应用	结直肠癌患者	机器学习	结直肠癌	批量测序、单细胞测序	NA	测序数据	205名患者的批量测序数据，10名和12名患者的单细胞测序数据
17	2025-03-17	Exosome-mediated effects of BRCA1 on cardiovascular artery disease 2025-Mar-13, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-09996-4 PMID:40080209	研究论文	本研究探讨了M1巨噬细胞来源的外泌体（Exo）中BRCA1对冠状动脉疾病（CAD）的影响	揭示了BRCA1通过外泌体介导的机制在CAD进展中的作用，为CAD治疗提供了新的分子靶点	研究主要基于体外实验和单细胞RNA-seq数据分析，需要进一步的临床验证	研究BRCA1在M1巨噬细胞来源的外泌体中对CAD进展的影响	巨噬细胞、心肌细胞和平滑肌细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	RNA-seq数据	NA
18	2025-03-17	Single-cell spatial transcriptomics unravels cell states and ecosystems associated with clinical response to immunotherapy 2025-Mar-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011308 PMID:40081939	研究论文	本文利用单细胞空间转录组学技术，系统地解析了肿瘤微环境的复杂性，特别是细胞异质性和空间相互作用，并研究了它们对免疫治疗效果的集体影响	首次在单一患者群体中应用单细胞空间转录组学技术，揭示了肿瘤微环境中细胞组成和空间组织对免疫治疗临床反应的双重重要性	研究样本量较小，仅包括20个预处理vHSIL病变，且结果需要在更广泛的肿瘤类型中进一步验证	研究肿瘤微环境对免疫治疗反应的影响	外阴高级别鳞状上皮内病变（vHSIL）患者	数字病理学	外阴癌	单细胞空间转录组学	NA	单细胞转录组数据	20个预处理vHSIL病变
19	2025-03-17	Artificial intelligence-driven integration of single-cell RNA sequencing and transcriptome analysis to decipher APOE's role in gastric cancer prognosis and therapy 2025-Mar-13, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02100-6 PMID:40082390	研究论文	本研究利用人工智能驱动的单细胞RNA测序和转录组分析，探索了APOE在胃癌预后和治疗中的作用	结合人工智能技术，首次揭示了APOE通过M2巨噬细胞极化在胃癌中的免疫抑制作用	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仍需进一步扩展	探索胃癌肿瘤微环境中的关键基因及其在预后和治疗中的作用	胃癌患者的单细胞RNA测序和转录组数据	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	AI驱动的分析方法	RNA测序数据	胃癌患者的单细胞RNA测序和转录组数据集
20	2025-03-17	TIMM23 overexpression drives NSCLC cell growth and survival by enhancing mitochondrial function 2025-Mar-13, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07505-3 PMID:40082395	研究论文	本文研究了TIMM23在非小细胞肺癌（NSCLC）中的过表达如何通过增强线粒体功能促进癌细胞生长和存活	首次揭示了TIMM23在NSCLC中的过表达与不良临床结果之间的强相关性，并通过实验验证了TIMM23在NSCLC细胞中的关键作用	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证TIMM23作为治疗靶点的有效性	探讨TIMM23在NSCLC中的表达及其对癌细胞生长和存活的影响	非小细胞肺癌（NSCLC）细胞和组织	癌症研究	肺癌	单细胞RNA测序、shRNA、CRISPR/Cas9	NA	RNA测序数据、蛋白质表达数据	多个原代/已建立的NSCLC细胞系和局部治疗的NSCLC组织样本