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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Single-cell sequencing-guided discovery of narciclasine as a dual VCAM-1/ICAM-1 inhibitor for atherosclerosis management
2027-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2026.102167
PMID:42763524
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研究论文 | 该研究通过分析人类动脉粥样硬化患者的单细胞RNA测序数据,结合连接性图谱分析、网络药理学、机器学习、分子对接、分子动力学模拟和表面等离子体共振等技术,发现narciclasine作为双重VCAM-1/ICAM-1抑制剂可用于动脉粥样硬化治疗 | 首次发现narciclasine作为靶向VCAM-1和ICAM-1的双重抑制剂用于动脉粥样硬化治疗,并整合了单细胞测序、网络药理学、机器学习、计算模拟和实验验证的多平台方法框架 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 发现用于动脉粥样硬化治疗的新型治疗药物,特别是能够修复受损内皮细胞的化合物 | 人类动脉粥样硬化患者单细胞RNA测序数据集、内皮细胞损伤模型、动脉粥样硬化小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、表面等离子体共振 | 机器学习 | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-21 |
Tubulointerstitial inflammation in glomerular diseases: mechanistic pathways, prognostic value, and translational therapeutic targets
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2646426
PMID:41876962
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综述 | 本文系统综述了肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后价值及转化治疗靶点,并提出从肾小球中心框架向肾小球-间质系统视角转变的概念 | 提出从肾小球中心框架向肾小球-间质系统视角的概念转变,强调标准化量化、整合建模和外部验证作为精准医学方法的前提,并整合AI增强数字病理学、空间转录组学、无创生物标志物和影像学等新兴进展 | 不同疾病和人群间TII的独立预后意义不一致,方法学差异(分母定义、评分系统、协变量调整)导致结果差异,肾小球中心治疗在部分患者中未能阻止疾病进展 | 系统综合肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后相关性和转化局限性,倡导标准化量化和整合建模以推进精准肾病学 | 肾小球疾病中的肾小管间质炎症及其与肾小球损伤、间质纤维化和肾功能下降的关系 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-21 |
Differential pathogenesis and antiviral treatment outcomes of MPXV clade Ib and clade IIb in a BALB/c mouse model
2026-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2026.2724633
PMID:42748357
|
研究论文 | 该研究建立了MPXV clade Ib鼻腔感染的BALB/c小鼠模型,并与clade IIb比较了致病性和抗病毒治疗效果 | 首次建立MPXV clade Ib感染的BALB/c小鼠模型,并通过单细胞转录组和细胞因子分析揭示了clade特异性的肺部免疫细胞景观差异 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 比较MPXV clade Ib和clade IIb的致病性差异并评估抗病毒治疗效果 | BALB/c小鼠模型及MPXV clade Ib和clade IIb病毒 | 数字病理学 | 猴痘 | 单细胞转录组测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-09-21 |
Multi-omics-guided identification of blood-entering bioactive components and candidate responsive targets of Shugan Jianpi Tiaochang Pill against colorectal adenoma
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158721
PMID:42607381
|
研究论文 | 本研究结合血清药物化学、蛋白质组学、网络药理学、转录组学、单细胞及空间转录组学等多组学方法,鉴定了舒肝健脾调肠丸抗结直肠腺瘤的入血活性成分及候选响应靶点 | 首次系统鉴定了舒肝健脾调肠丸的28种入血成分,并通过多组学整合策略优先筛选出EPHA7和LDHB作为候选响应靶点,结合分子对接、分子动力学模拟和SPR验证了Wogonoside和18β-Glycyrrhetinic acid与靶点的直接结合 | 研究结果仍需进一步的机制验证,靶点的功能参与有待更深入的实验证实 | 鉴定舒肝健脾调肠丸抗结直肠腺瘤的入血生物活性成分及候选响应靶点 | AOM/DSS诱导的结直肠腺瘤小鼠模型及HCT-116细胞 | 多组学 | 结直肠腺瘤 | 血清药物化学、蛋白质组学、网络药理学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学、分子对接、分子动力学模拟、表面等离子体共振(SPR) | AOM/DSS诱导小鼠模型、虚拟敲除分析 | 血清药物化学成分数据、蛋白质组数据、转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-21 |
The miRNA-virus axis in RNA virus infections: Mechanisms, therapeutic targeting, and systems biology approaches
2026-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108780
PMID:42607939
|
综述 | 本文综述了RNA病毒感染中miRNA-病毒轴的作用机制、治疗靶点及系统生物学方法,提出了miRNA功能分类及治疗决策框架 | 提出了超越传统抗病毒-促病毒二分法的miRNA功能分类,建立了连接miRNA功能分类与靶向抗病毒干预的治疗决策框架,并强调了系统生物学方法在识别调控性miRNA枢纽和精准抗病毒医学中的作用 | 未涉及具体实验验证,属于综述性文章;miRNA治疗面临递送效率、组织特异性和脱靶效应等挑战 | 全面概述RNA病毒感染中miRNA-病毒轴,探讨miRNA介导调控的机制基础,提出新的治疗策略和系统生物学方法 | RNA病毒与宿主miRNA的相互作用 | 机器学习 | NA | 多组学整合, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 网络分析, 人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-21 |
Preclinical evidence and multi-omics insights into the protective effects of epigallocatechin-3-gallate against high-fat diet-induced adverse health outcomes
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158750
PMID:42679470
|
研究论文 | 本研究通过整合荟萃分析、机器学习、体内实验、蛋白质组学和公共单细胞RNA测序数据,系统评估了表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对高脂饮食诱导的不良健康结局的保护作用 | 首次系统整合荟萃分析、机器学习和多组学数据评估EGCG对高脂饮食诱导不良健康结局的保护作用,并揭示了甘油磷脂代谢可能是EGCG保护肝脏和小肠的共同通路 | 研究主要基于临床前证据(啮齿动物模型),尚未在人体临床试验中验证;公共单细胞RNA测序数据仅提供潜在细胞亚型背景,缺乏直接实验验证 | 系统评估EGCG对高脂饮食诱导的不良健康结局(包括血脂异常、非酒精性脂肪肝和2型糖尿病)的治疗潜力 | 79项啮齿动物研究(荟萃分析)、C57BL/6小鼠(体内实验)、公共非酒精性脂肪肝单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝 | 荟萃分析, 机器学习, 蛋白质组学, 逆转录定量聚合酶链反应, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 文本, 图像, 基因表达数据 | 79项啮齿动物研究的荟萃分析数据,C57BL/6小鼠体内实验样本,公共NAFLD单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-21 |
Arglabin targets a non-canonical NLRP3/CCR2 axis to suppress MDSC infiltration and potentiates anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158749
PMID:42685565
|
研究论文 | 该研究揭示了Arglabin通过靶向NLRP3的Cys280位点,抑制其核转位及对CCR2的转录调控,从而阻断MDSC浸润并增强抗PD-1免疫治疗在肝细胞癌中的疗效 | 首次鉴定NLRP3为Arglabin的直接分子靶点且结合位点为Cys280;发现NLRP3通过非经典途径(核转位及转录调控CCR2)驱动MDSC浸润,而非依赖经典炎症小体/IL-1β通路;提出Arglabin联合PD-1阻断可逆转肝癌免疫抑制 | 研究主要基于小鼠同源移植模型,尚未在人体临床试验中验证;NLRP3核转位调控CCR2的具体分子机制仍需进一步解析 | 鉴定Arglabin的分子靶点并阐明其介导抗肝癌免疫的药理机制 | 肝细胞癌(HCC)及肿瘤免疫微环境中的髓源性抑制细胞(MDSC) | 肿瘤免疫学、分子药理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、多重免疫荧光、CETSA、SPR、LC-MS/MS、pull-down、ChIP-qPCR、流式细胞术、transwell迁移实验、CCK8、体内生物发光成像 | NA | 图像、文本、测序数据 | H22(BALB/c)和Hepa1-6(C57BL/6)小鼠肝癌细胞系及同源小鼠模型,Nlrp3-/-小鼠,以及GEO数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-21 |
Schisandrol A in Fufang Muniziqi Granules suppresses the abnormal expression of MHC-II in renal tubular epithelial cells to treat lupus nephritis through disrupting the interaction between STUB1 and PPARγ
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158778
PMID:42727458
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研究论文 | 该研究探讨了复方木尼孜其颗粒通过五味子醇甲干扰STUB1与PPARγ的相互作用,抑制肾小管上皮细胞异常MHC-II表达,从而治疗狼疮肾炎 | 首次发现复方木尼孜其颗粒及其活性成分五味子醇甲通过破坏STUB1与PPARγ的相互作用,抑制肾小管上皮细胞异常MHC-II抗原呈递样表型来治疗狼疮肾炎 | 研究主要基于MRL/lpr小鼠模型和HK-2细胞系,缺乏临床患者样本验证,五味子醇甲的具体临床转化潜力仍需进一步研究 | 评估复方木尼孜其颗粒对狼疮肾炎的治疗效果,确定其是否通过抑制肾小管上皮细胞异常MHC-II表达发挥作用,并鉴定其潜在靶点和分子机制 | MRL/lpr狼疮肾炎小鼠模型、HK-2人肾小管上皮细胞系、Jurkat T细胞系 | 机器学习 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据, 图像 | MRL/lpr小鼠分组给药实验、HK-2细胞体外实验及HK-2与Jurkat共培养体系 | NA | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-21 |
Licochalcone B inhibits Neuritin 1-driven perineural invasion and osteosarcoma progression via the Hedgehog signaling pathway
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158785
PMID:42727455
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研究论文 | 本文研究了NRN1在骨肉瘤中的致癌作用,并评估甘草查尔酮B(LCB)通过靶向NRN1治疗骨肉瘤的潜力 | 首次揭示NRN1通过Hedgehog信号通路驱动骨肉瘤恶性进展和神经周围侵犯,并发现LCB可直接结合并抑制NRN1,同时恢复自然杀伤细胞介导的抗肿瘤免疫 | 未明确提及 | 阐明NRN1的致癌特性并评估LCB作为靶向NRN1的骨肉瘤治疗药物 | 骨肉瘤细胞、背根神经节-骨肉瘤共培养体系、坐骨神经侵犯模型、原位骨肉瘤异种移植模型 | 数字病理学,机器学习 | 骨肉瘤 | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq,分子对接,细胞热位移分析,药物亲和响应靶稳定性分析,多光子显微镜 | NA | 图像,文本 | 多个临床队列的批量及单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-09-21 |
Reduning injection alleviated LPS-induced ARDS via multi-target regulation by modulating inflammation and immune responses based on target fishing technique and scRNA-seq analysis
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158716
PMID:42623948
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研究论文 | 该研究通过靶点垂钓技术和单细胞RNA测序分析,揭示热毒宁注射液通过多靶点调控Flcn、Itgav和Plcb3,抑制NLRP3、NF-κB和MAPK通路,从而减轻LPS诱导的急性呼吸窘迫综合征 | 首次结合热溶剂蛋白质组学和亲和色谱靶点垂钓技术,鉴定出Flcn、Itgav和Plcb3为热毒宁注射液的直接细胞内靶点,并通过单细胞RNA测序揭示其多靶点调控炎症和免疫反应的机制 | 研究基于LPS诱导的动物模型,尚未在临床试验中验证热毒宁注射液对ARDS患者的疗效 | 探究热毒宁注射液对急性呼吸窘迫综合征的多靶点保护作用及其潜在机制 | LPS诱导的ARDS动物模型 | 机器学习 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 热溶剂蛋白质组学, 亲和色谱, LC-MS/MS, 分子对接, 分子动力学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-09-21 |
Shaoyao decoction inhibits neutrophil migration and restores epithelial integrity in ulcerative colitis model mice: insights from single-cell sequencing
2026-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158737
PMID:42664590
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术,揭示芍药汤通过阿魏酸抑制RAC1介导的中性粒细胞迁移以及通过白杨素-7-O-葡萄糖醛酸苷经KLF4依赖机制增强肠上皮紧密连接完整性并抑制凋亡,从而改善溃疡性结肠炎 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统阐明芍药汤治疗溃疡性结肠炎的具体活性成分及其分子机制,发现阿魏酸靶向RAC1抑制中性粒细胞迁移,白杨素-7-O-葡萄糖醛酸苷通过KLF4保护肠上皮屏障 | 研究主要基于DSS诱导的小鼠模型和Caco-2细胞系,尚未在人体临床试验中验证;单细胞测序鉴定的细胞亚群和通路有待更深入的功能验证 | 阐明芍药汤及其活性成分改善溃疡性结肠炎的药理机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和Caco-2肠上皮细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-21 |
Single-cell gene regulatory networks characterize colonic stem and immune cell homeostasis in Nr4a1 knockout mice
2026-Oct-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117466
PMID:42756602
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学和差异基因网络分析,在野生型和Nr4a1敲除小鼠中探究了NR4A对结肠上皮、基质和免疫细胞稳态的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Nr4a1敲除导致结肠干细胞、免疫细胞和成纤维细胞之间细胞间通讯的广泛重塑,并发现其与细胞熵升高和类器官生长增强相关 | 研究基于小鼠模型,结论是否适用于人类结肠疾病仍需进一步验证;未提供具体样本数量,可能影响统计效力 | 探究NR4A在肠道上皮、基质和免疫细胞稳态中的调控作用,特别是对结肠干细胞和免疫微环境的影响 | 野生型和全身性Nr4a1敲除小鼠的结肠组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学、差异基因网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-09-21 |
Clemastine alleviates cognitive dysfunction after SAH by targeting neuronal CNTN1 to regulate the ADA-adenosine pathway
2026-Oct, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-026-01852-3
PMID:42337055
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组测序,揭示神经元CNTN1下调通过ADA-腺苷通路加剧蛛网膜下腔出血后脱髓鞘和认知功能障碍,并发现氯马斯汀可改善该认知障碍 | 首次发现CNTN1在SAH后特异性在神经元中下调而非少突胶质细胞,揭示了CNTN1-ADA-ADORA2B信号轴在SAH后脱髓鞘中的作用,并提出氯马斯汀作为潜在治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型,CNTN1-ADA-ADORA2B信号轴的直接分子互作机制尚未完全阐明,氯马斯汀的临床转化效果有待进一步验证 | 阐明SAH相关脱髓鞘的分子机制并寻找潜在治疗方法 | SAH患者脑脊液样本和SAH小鼠模型 | 机器学习, 数字病理学 | 蛛网膜下腔出血, 认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 腺相关病毒载体基因敲低和过表达 | NA | 文本, 图像 | SAH患者脑脊液样本(具体数量未提及)和SAH小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-09-21 |
Endothelial PARP1 orchestrates endothelial-to-mesenchymal transition via the PARylation of FHL2 in ischaemic heart failure
2026-Oct, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-026-01848-z
PMID:42362853
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞中PARP1通过PAR化修饰FHL2驱动内皮-间质转化,从而促进缺血性心力衰竭中的心脏纤维化和心功能障碍 | 首次发现内皮PARP1是缺血性心力衰竭中内皮-间质转化的关键驱动因子,并阐明其通过PAR化修饰FHL2的Asp50、Glu63和Asp77位点,促进FHL2核滞留、增强其与β-catenin的相互作用及β-catenin转录活性的新机制 | 摘要中未提及 | 探究PARP1在缺血性心力衰竭中驱动内皮-间质转化的作用及其分子机制,评估其作为治疗靶点的潜力 | 扩张型或缺血性心肌病患者、心肌梗死后发生心力衰竭的患者、小鼠缺血性心力衰竭模型、体外缺氧或TGF-β1/IL-1β诱导的内皮-间质转化模型 | 机器学习 | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 摘要中未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-21 |
Spatial Transcriptomics and Mechanisms of Immune Checkpoint Inhibitor-Associated Interstitial Nephritis
2026-Oct, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2026.107007
PMID:42756960
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研究论文 | 该研究利用亚细胞空间转录组学平台比较了免疫检查点抑制剂相关急性间质性肾炎(ICI-AIN)与ICI相关急性肾小管坏死(ICI-ATN)患者肾活检组织的细胞组成和分子机制 | 首次应用亚细胞分辨率空间转录组学平台(Xenium Prime 5K)系统比较ICI-AIN与ICI-ATN的肾脏组织,揭示了CD8+ T细胞来源的IFN-γ通过诱导髓系细胞促炎程序产生CXCL9/10/11从而驱动ICI-AIN的新机制 | 样本量较小,仅纳入8例肾活检标本(4例ICI-AIN,4例ICI-ATN),未涉及其他类型ICI相关肾损伤的对比,且空间转录组学结果需进一步功能验证 | 探索ICI-AIN的炎症机制,明确其与ICI-ATN在病理生理学上的关键差异 | 接受免疫检查点抑制剂治疗并发生急性肾损伤患者的肾活检组织,包括ICI-AIN患者和ICI-ATN患者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 8例肾活检标本(4例ICI-AIN,4例ICI-ATN),共分析332,000个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | 亚细胞分辨率空间转录组学平台Xenium Prime 5K,基于空间感知的细胞邻域分类方法分析肾脏实质细胞和浸润免疫细胞 |
| 16 | 2026-09-21 |
Integrating single-cell transcriptomics and network pharmacology identifies ADORA1 as a candidate receptor for gastrodin derivatives in lung adenocarcinoma
2026-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2026.119870
PMID:42659805
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学与网络药理学,鉴定ADORA1为肺腺癌中天麻素衍生物的候选受体,并通过分子对接、SPR及小鼠模型进行初步验证 | 首次整合五种单细胞分析框架(AUCell、scTenifoldNet/scTenifoldKnk、decoupleR、CellChat、MEBOCOST)系统解析天麻素在肺腺癌中的细胞类型特异性机制,并结合TOPSIS多准则决策与分子对接筛选天麻素衍生物,提名ADORA1为兼具受体和代谢传感器双重角色的核心靶点 | 证据属于假设生成性和生物物理学层面,分子对接亲和力适中(-4.18至-4.93 kcal/mol),原生天麻素SPR信号过弱无法可靠估算,衍生物对cleaved-PARP比值影响轻微(1.05-1.15倍),仍需在肺腺癌特异性模型中进行机制验证 | 阐明天麻素在肺腺癌中的细胞类型特异性抗肿瘤机制,筛选天麻素衍生物并鉴定其候选受体 | 肺腺癌单细胞RNA-seq数据(GSE131907)、十种天麻素衍生物、人源ADORA1蛋白(PDB: 5UEN)、昆明小鼠LPS诱导急性炎症模型 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 分子对接, 表面等离子共振(SPR), 网络药理学, 免疫组织化学, Western blot, ELISA | scTenifoldNet, scTenifoldKnk, AUCell, decoupleR, CellChat, MEBOCOST, TOPSIS | 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | 208,506个细胞,58个样本,44位患者(GSE131907);SPR验证3次运行;昆明小鼠LPS诱导急性炎症模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-09-21 |
Spatial atlas of upper tract urothelial carcinoma identifies SLC14A1 + and S100A8/9+ tumor cells as key determinants of malignant progression
2026-Oct, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108431
PMID:42692375
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和空间转录组测序,系统刻画了上尿路尿路上皮癌的细胞图谱、空间分子网络和细胞间通讯特征,鉴定了SLC14A1⁺和S100A8/9⁺肿瘤细胞亚群在恶性进展中的关键作用 | 首次整合scRNA-seq和ST-seq系统解析UTUC的空间肿瘤微环境异质性,鉴定出SLC14A1⁺肿瘤细胞为抑瘤亚群、S100A8/9⁺肿瘤细胞为促瘤亚群,并揭示了驱动高级别和肌层浸润进展的核心空间信号通路 | 摘要中未提及研究局限性 | 阐明上尿路尿路上皮癌肿瘤微环境中功能细胞群体的空间分布模式及其驱动高级别和肌层浸润进展的调控机制 | 上尿路尿路上皮癌组织样本 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-21 |
Single-Cell RNA Sequencing-Based Identification of Novel Podocyte Injury-Associated Genes From Isolated Glomeruli of Diabetic db/db Mice
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603735R
PMID:42762061
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研究论文 | 该研究通过对糖尿病db/db小鼠磁珠分离的肾小球进行单细胞RNA测序,结合体外棕榈酸诱导的人足细胞损伤模型,鉴定出与糖尿病足细胞损伤相关的新基因 | 采用磁珠分离肾小球策略克服全肾单细胞RNA测序中足细胞占比低的局限,生成高分辨率肾小球聚焦转录组数据集,并整合体内单细胞数据与体外脂毒性模型鉴定出OPCML、ADM、NELL2和DHRS3四个候选基因,首次发现OPCML、ADM和DHRS3是足细胞损伤的新型介导因子 | 研究主要基于db/db小鼠模型和体外培养的人足细胞,尚未在人类糖尿病肾病患者样本中验证,且候选基因的具体分子机制和信号通路仍需进一步阐明 | 克服全肾单细胞RNA测序中足细胞代表性不足的问题,鉴定糖尿病肾小球中足细胞损伤相关的新基因,为糖尿病肾病提供潜在治疗靶点 | 糖尿病db/db小鼠磁珠分离的肾小球以及体外培养的暴露于棕榈酸诱导脂毒性的人足细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、磁珠分离、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、图像 | 糖尿病db/db小鼠分离的肾小球样本以及体外培养的人足细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-09-21 |
Glioma microenvironment: Cellular crosstalk, immunosuppression, and novel therapeutic perspectives
2026-Sep-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004151
PMID:42299115
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综述 | 本文综述了胶质瘤肿瘤微环境中细胞间相互作用、免疫抑制机制以及基于单细胞和空间转录组学发现的新型治疗视角 | 整合了单细胞和空间转录组学的最新进展,揭示了胶质瘤肿瘤微环境的异质性结构和功能生态位,并强调了靶向肿瘤微环境以克服治疗耐药的治疗机会 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且未具体讨论各治疗策略的临床转化障碍和毒性问题 | 整合近期关于胶质瘤肿瘤微环境多维相互作用的研究进展,阐明其细胞和分子机制,并探讨靶向肿瘤微环境的治疗潜力 | 胶质瘤肿瘤微环境,包括胶质瘤细胞、招募的髓系细胞、适应性免疫细胞、内皮细胞、神经元和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-21 |
Identification of immune cell mitochondrial dysfunction characteristics and clinical predictive biomarkers in sepsis via multi-cohort machine learning and single-cell RNA sequencing
2026-Sep-19, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02366-8
PMID:42762293
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研究论文 | 该研究整合五个GEO数据集和单细胞RNA测序数据,通过多种机器学习算法鉴定脓毒症免疫细胞线粒体功能障碍特征,构建12基因诊断模型和线粒体功能障碍评分,并进行蛋白水平和临床验证 | 首次通过多队列机器学习和单细胞RNA测序系统鉴定脓毒症中线粒体功能障碍相关免疫细胞特征,构建了12基因诊断模型和线粒体功能障碍评分(MAS),并在蛋白水平验证了关键基因的表达,揭示了线粒体功能障碍与免疫的交互作用在脓毒症发病机制中的核心地位 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,样本来源和人群特征可能存在异质性;单细胞数据仅来自一个数据集(GSE167363),验证队列有限;蛋白水平验证仅涉及部分枢纽基因,未覆盖全部12基因特征 | 阐明脓毒症中免疫细胞线粒体功能障碍的景观及其临床效用,构建诊断模型和预测评分以支持临床脓毒症管理 | 脓毒症患者样本,包括外周血单个核细胞(PBMC)和全血样本 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA, NMF聚类, Western blotting | 弹性网络(Elastic net), 机器学习算法集成 | 基因表达数据, 图像, 文本 | 5个GEO数据集共1,256个样本(GSE65682, GSE95233, GSE54514, GSE26440, GSE26378),单细胞RNA测序数据包含59,731个细胞(GSE167363),PBMC样本用于Western blotting验证 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |