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当前共找到 36793 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-27
Emerging roles of non-coding RNAs in the tumor microenvironment of pancreatic cancer: Focusing on current challenges and future directions
2026-Apr-20, Gene IF:2.6Q2
综述 本文综述了非编码RNA在胰腺癌肿瘤微环境中的多重作用,并探讨了当前挑战与未来方向 聚焦于非编码RNA作为肿瘤微环境中细胞通讯和功能重塑的关键介质,并讨论了单细胞与空间转录组学等新兴策略 非编码RNA的多效性及肿瘤微环境的异质性阻碍了机制解释和临床转化 总结非编码RNA在胰腺癌肿瘤微环境中的作用,并探索其诊断和治疗潜力 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境中的非编码RNA 数字病理学 胰腺癌 NA NA NA NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
2 2026-02-27
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2026-Mar, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了EGFR阳性肺腺癌患者在福莫替尼治疗前后的细胞和分子变化 整合公共和内部数据集,系统分析了福莫替尼治疗对肿瘤微环境的重塑、转录组适应及细胞间通讯网络的重新编程 未明确说明样本量是否足够大以覆盖所有亚型,且可能未考虑长期耐药机制 探究福莫替尼治疗在EGFR阳性肺腺癌中的响应和适应机制,特别是肿瘤微环境内的变化 EGFR阳性肺腺癌患者的肿瘤及配对癌旁组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及患者治疗前后的配对组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-02-27
Single-Cell Multimodal Profiling Highlights Persistent Aortic Smooth Muscle Cell Changes in Diabetic Mice Despite Glycemic Control
2026-Mar, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究利用单细胞多组学技术,探究了血糖正常化对2型糖尿病小鼠血管平滑肌细胞表型转变相关的转录组和表观基因组变化的影响 首次在2型糖尿病模型中,结合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学,系统揭示了血糖控制后血管平滑肌细胞表观遗传记忆的持续存在 研究仅在糖尿病小鼠模型中进行,未在人体样本中验证;观察时间窗口为6周,长期效应未知 阐明2型糖尿病中血糖控制后血管平滑肌细胞功能障碍持续存在的分子机制 2型糖尿病db/db小鼠的主动脉组织 单细胞多组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 空间基因表达数据 db/db小鼠(达格列净或载体处理)及db/+对照小鼠,处理6周 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Xenium 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序使用10x Chromium平台,空间转录组学使用10x Xenium平台
4 2026-02-27
Circulating tumor cells in myeloma are a compound biomarker for bone marrow high-risk genomic alterations and tumor load
2026-Feb-26, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和全基因组测序分析,揭示了多发性骨髓瘤中循环肿瘤细胞(CTC)水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷的关联机制 首次在单克隆水平上证明CTC与配对骨髓细胞转录相似,并发现CTC水平受原发性易位、高风险次级基因组事件(如1q扩增、TP53双等位基因突变)和肿瘤负荷共同驱动,构建了预测模型 研究主要基于新诊断患者样本,未涵盖复发或难治性病例;单细胞测序样本量有限,可能影响克隆异质性分析的全面性 探究CTC水平与多发性骨髓瘤基因组改变及肿瘤负荷的机制关联 新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞转录组学、全基因组测序、全外显子组测序、bulk RNA测序 预测模型(未指定具体算法) 单细胞转录组数据、基因组测序数据、RNA测序数据 未明确样本数量,包含患者配对骨髓与血液样本及公共数据集(CoMMpass) NA 单细胞RNA-seq、全基因组测序、全外显子组测序、bulk RNA-seq NA NA
5 2026-02-27
scDBic: A novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-26, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法,专门用于分析单细胞RNA测序数据,以改善细胞聚类性能并识别关键基因 结合深度自编码器与反向策略,首次将深度学习应用于scRNA-seq数据的双聚类,解决了传统方法在局部一致性、细胞丢失和高维数据适应性方面的不足 未在摘要中明确说明算法的具体局限性 开发一种能更有效分析单细胞RNA测序数据、发现细胞群并识别其关键基因的算法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度自编码器 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-02-27
Unraveling the Phylogenetic Signal of Gene Expression from Single-cell RNA-seq Data
2026-Feb-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究评估了从单细胞RNA测序数据中调用单核苷酸变异的六种策略,并分析了推断基因型和细胞系统发育的质量 首次系统比较了多种从scRNA-seq数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法,揭示了scAllele、Monopogen和Monovar在提供系统发育信息方面的优势 研究仅基于5名癌症患者的381个单细胞转录组,样本量有限,且基因表达的系统发育信号仅在部分患者中显著 评估从单细胞RNA测序数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法性能 5名癌症患者的381个单细胞转录组 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 381个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-02-27
Multi-Scale Mapping of Gene Expression from Whole-slide Images for Identifying Phenotype-Associated Subpopulations
2026-Feb-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究提出了一个名为BiSCALE的深度学习框架,能够从全切片图像中预测组织和近细胞水平的基因表达,并将其与临床表型关联 开发了首个能够同时预测组织(批量)和近细胞(点)水平基因表达的多尺度深度学习框架,并引入了Vision-Mamba融合模块和两阶段训练策略来桥接不同尺度数据间的差异 研究仅在三种癌症类型上进行了训练和验证,模型的普适性在其他癌症类型中尚未得到充分验证 从常规病理全切片图像中进行多尺度基因分析和表型相关特征发现,以识别与表型相关的细胞亚群 肿瘤样本和空间转录组学数据点 数字病理学 癌症 空间转录组学,深度学习 Vision-Mamba融合模块,WSI基础编码器 图像(全切片图像),基因表达数据 2109个批量肿瘤样本和141,000个空间转录组学数据点 NA 空间转录组学 NA NA
8 2026-02-27
Loss of miR-29a/b1 cluster reprograms the tumor microenvironment and contributes to immunosuppression in lung cancer
2026-Feb-25, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了miR-29a/b1簇的缺失通过调控Enpp2/ATX表达重塑肺癌肿瘤微环境并导致免疫抑制,从而影响免疫检查点抑制剂的疗效 首次在Kras/p53驱动的肺癌模型中,利用单细胞RNA测序技术,将miR-29的缺失与肿瘤微环境重塑、免疫抑制及抗PD-1耐药性直接联系起来,并发现其通过调控ATX等靶基因发挥作用 研究主要基于小鼠模型,虽然结合了公共人类肺癌RNA测序数据进行验证,但直接的人类样本实验数据有限,且具体调控机制(如miR-29如何精确调控ATX及其他靶基因)的细节有待进一步阐明 探究肺癌对抗PD-1免疫检查点抑制剂产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药性的潜在靶点 Kras/p53驱动的小鼠肺癌模型(具有获得性或内在性抗PD-1耐药性)以及公共数据库中的肺腺癌患者肿瘤样本 肿瘤免疫学, 单细胞组学 肺癌(非小细胞肺癌, 肺腺癌) 单细胞RNA测序, RNA测序数据分析 NA 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 未明确说明具体样本数量, 涉及抗PD-1耐药的小鼠肺癌模型及公共数据库中的肺腺癌患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-02-27
Intra-tumoral tertiary lymphoid structures characterized by a B cell-related signature elicit antitumor effect through HAPLN3 in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-25, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的B细胞相关特征及其通过HAPLN3介导的抗肿瘤效应 首次在肝细胞癌中系统阐明了三级淋巴结构的细胞特征、驱动机制及其与免疫治疗反应的关系,并鉴定出HAPLN3作为关键的B细胞激活因子 研究队列主要基于回顾性样本,需要前瞻性临床研究验证HAPLN3的治疗潜力 探究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的细胞特征、形成机制及其对预后的影响 339名肝细胞癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 肝细胞癌 全外显子组测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 339名肝细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
10 2026-02-27
A systems immunology approach reveals divergent immune profiles of RSV and SARS-CoV-2 infections in infants
2026-Feb-25, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究采用系统免疫学方法,通过细胞因子分析、单细胞转录组学和表观基因组学,揭示了婴儿感染RSV和SARS-CoV-2后免疫反应的显著差异 首次在婴儿群体中系统比较了RSV和SARS-CoV-2感染的免疫特征,揭示了疾病特异性的细胞类型特征和表观遗传变化 样本量相对较小(RSV感染19例,SARS-CoV-2感染30例,健康对照17例),且仅分析了血液样本,未涉及呼吸道局部免疫反应 揭示RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中临床差异的免疫机制 婴儿(中位年龄2.3个月)的血液样本,包括RSV感染、SARS-CoV-2感染和健康对照组 系统免疫学 呼吸道感染 细胞因子分析,单细胞转录组学,表观基因组学 NA 血液样本的分子和细胞数据 RSV感染婴儿19例,SARS-CoV-2感染婴儿30例,健康对照婴儿17例 NA 单细胞转录组学,表观基因组学 NA NA
11 2026-02-27
The vaccine platform used for COVID-19 primary immunization shapes the quality of the human B cell response to a vaccine boost
2026-Feb-25, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了不同COVID-19疫苗平台(腺病毒载体和mRNA)在人类B细胞反应中的免疫学差异 首次在人类中系统比较了腺病毒载体和mRNA疫苗平台在同源和异源加强接种方案中对B细胞反应质量的影响 研究主要关注短期B细胞反应,长期保护效果的评估可能不足 比较不同疫苗平台在引发B细胞免疫反应方面的差异,以优化疫苗接种策略 人类B细胞对SARS-CoV-2疫苗的反应 免疫学 COVID-19 流式细胞术,单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-02-27
Fibroblast Activation Protein-Based Radio-Theranostics Attenuates Postinfarction Myocardial Fibrosis
2026-Feb-25, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本研究开发了一种基于成纤维细胞激活蛋白的放射性诊疗平台,用于心肌梗死后心肌纤维化的精准诊断和治疗 开发了基于FAP二聚体的成像/治疗平台,利用Ga-DOTA-2P(FAPI)进行无创可视化,Lu-DOTA-2P(FAPI)进行放射性核素治疗,实现了对心肌梗死后纤维化的靶向诊疗 治疗后的毒性评估仅进行了7天,长期安全性需进一步验证 开发一种靶向诊疗策略,以减轻心肌梗死后过度纤维化导致的不良重塑 心肌梗死后的心肌纤维化区域,特别是成纤维细胞激活区域 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 图像、序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-02-27
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
2026-Feb-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内调节性T细胞是限制TIGIT阻断疗法疗效的主要障碍,并开发了一种具有增强ADCC活性的抗TIGIT抗体,可特异性清除该Treg亚群,从而显著提升抗肿瘤效果 首次鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内Tregs是TIGIT阻断疗法的主要障碍,并设计了一种能特异性清除该亚群、同时保留效应细胞功能的抗TIGIT抗体(αTIGIT-IgG1-ADCC),为克服现有TIGIT靶向免疫疗法的局限性提供了新策略 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,其临床转化效果和长期安全性仍需在更大规模的临床试验中验证 探究TIGIT阻断疗法临床疗效不足的原因,并开发新的策略以提升基于抗TIGIT的免疫疗法的抗肿瘤活性 肿瘤微环境中的T细胞,特别是调节性T细胞和效应T细胞 免疫肿瘤学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, TCGA bulk RNA-seq, 流式细胞术, 生物层干涉技术, 体外ADCC实验 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 批量RNA-seq数据, 流式细胞术数据 小鼠模型(人源化TIGIT敲入小鼠)及患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, bulk RNA-seq NA NA
14 2026-02-27
Comparing the impact of sample multiplexing approaches for single-cell RNA-sequencing on downstream analysis using cerebellar organoids
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究比较了Parse Biosciences组合条形码和10x Genomics CellPlex两种单细胞RNA测序多重化技术在分析小脑类器官时的表现 首次系统比较了两种商业单细胞RNA测序多重化技术在小脑类器官这一复杂组织模型中的应用效果 研究仅针对小脑类器官模型,未涵盖其他组织类型;样本规模可能有限 评估不同单细胞RNA测序多重化技术对下游分析的影响 小脑类器官 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定,但涉及小脑类器官样本 Parse Biosciences, 10x Genomics 单细胞RNA-seq Parse Biosciences组合条形码, 10x Genomics CellPlex Parse Biosciences组合条形码技术,10x Genomics CellPlex微流控捕获技术
15 2026-02-27
Single cell transcriptomic atlas reveals macrophage polarization dynamics and intercellular communication networks in gingival tissue of periodontitis patients undergoing orthodontic treatment
2026-Feb-19, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了牙周炎患者正畸治疗期间牙龈组织中巨噬细胞的极化动态和细胞间通讯网络 首次在牙周炎合并正畸治疗的临床背景下,系统描绘了巨噬细胞的异质性、极化轨迹及其作为细胞通讯枢纽的功能 研究样本量有限,且为横断面设计,未能动态追踪治疗过程中的变化 探究牙周炎患者正畸治疗期间牙龈组织中巨噬细胞的亚型、极化动态及细胞间相互作用 接受正畸治疗的牙周炎患者的牙龈组织样本 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 降维分析、伪时间轨迹分析、RNA速率分析、细胞通讯推断 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,仅提及来自患者的牙龈组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2026-02-27
Wnt5a Regulates Embryonic Müllerian Duct Development Through the Non-Canonical Wnt PCP Pathway
2026-Feb-17, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序研究了Wnt5a在胚胎Müllerian管发育中的作用,揭示了其通过非经典Wnt PCP通路调控发育过程 首次使用单细胞RNA测序技术分析Wnt5a缺失小鼠的Müllerian管发育,发现非经典Wnt PCP通路失调及前部子宫角向输卵管转化的现象 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;样本规模可能有限 探究Wnt5a在胚胎Müllerian管发育中的分子机制及其与Müllerian异常的关系 小鼠胚胎Müllerian管 发育生物学 Müllerian异常 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未明确指定样本数量,但涉及Wnt5a缺失小鼠和野生型对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-02-27
Ion channel gene signature for diagnosis and antifibrotic therapy in liver fibrosis
2026-Feb-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组转录组数据集,识别了肝纤维化中差异表达的人类离子通道基因,并确定了AQP1、GJA1和KCNN2作为关键基因,具有诊断和治疗潜力 首次系统性地分析了人类离子通道基因在肝纤维化中的表达谱,结合单细胞RNA测序和分子对接模拟,识别了与纤维化进展和免疫重塑相关的关键基因及潜在治疗药物 研究主要基于转录组数据,缺乏直接的体内功能验证,且候选药物的疗效需进一步实验确认 旨在分析人类离子通道基因在肝纤维化中的表达特征,并识别具有诊断和治疗相关性的关键基因 肝纤维化患者样本、胆管结扎小鼠模型以及相关的转录组数据集 生物信息学 肝纤维化 转录组分析、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组化、分子对接模拟 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 多个转录组数据集、人类肝硬化组织样本、胆管结扎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
18 2026-02-27
EZH2 Inhibition Restores Tumor Suppressor SFRP1 Activity by Reprogramming Extrachromosomal Circular DNA Dynamics in Ovarian Cancer
2026-Feb-15, Biology
研究论文 本研究揭示了EZH2抑制剂Tazemetostat通过重编程卵巢癌中的染色体外环状DNA动态,从而恢复肿瘤抑制因子SFRP1活性的新机制 首次发现了EZH2抑制与eccDNA动态重编程之间的关联,并整合多组学与空间单细胞转录组学揭示了一个新的表观遗传-eccDNA轴 研究主要基于体外实验和测序数据分析,体内功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 探究EZH2抑制剂对卵巢癌中染色体外环状DNA动态及转录程序的影响 卵巢癌细胞 表观遗传学与癌症生物学 卵巢癌 Circle-seq, RNA测序, 空间单细胞转录组学 NA 基因组测序数据, 转录组数据, 空间转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
19 2026-02-27
Multi-Modal Metabolomics Deciphers Pan-Cancer Metabolic Landscapes and Spatial-Niche-Specific Alternations
2026-Feb-13, Metabolites IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合bulk代谢组学与空间代谢组学,揭示了跨癌症类型的代谢特征及其在肿瘤微环境中的空间异质性 首次结合bulk和空间代谢组学进行泛癌分析,识别了癌症类型特异性和空间结构特异性的代谢模块,并验证了跨分析层面一致的代谢物变化 研究可能受限于样本数量和空间分辨率,未涵盖所有癌症类型,且代谢组学数据的动态变化需进一步验证 系统解析癌症代谢重编程的泛癌特征和空间异质性,识别潜在的代谢生物标志物 多种癌症类型的肿瘤组织、正常组织及血液样本 代谢组学 泛癌 bulk代谢组学、空间代谢组学、空间转录组学 两步聚类框架 代谢组学数据、转录组学数据 多种癌症类型的肿瘤组织切片及血液样本 NA bulk代谢组学、空间代谢组学、空间转录组学 NA NA
20 2026-02-27
Time-Dependent Effects of Rapid-Acting Antidepressants in iPSC-Derived Neurons from Treatment-Resistant Depression and Healthy Volunteers
2026-Feb-12, Research square
研究论文 本研究利用iPSC来源的神经元模型,评估了多种快速起效抗抑郁药物在治疗抵抗性抑郁症患者和健康志愿者中的时间依赖性分子效应 首次使用iPSC来源的神经元模型并行评估多种快速起效抗抑郁药物,揭示了药物间共享的下游效应和细胞类型特异性变化 模型可能无法完全模拟体内复杂环境,样本量未明确说明,且仅关注了短期药物效应 探究快速起效抗抑郁药物在治疗抵抗性抑郁症中的分子机制 iPSC来源的成熟皮质样神经元,来自治疗抵抗性抑郁症患者和健康志愿者 神经科学 抑郁症 iPSC分化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫细胞化学、CSF蛋白质组学 iPSC来源的神经元模型 转录组数据、蛋白质数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
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