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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-04-22
Organelle symphony: Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 and nuclear factor-kappa B in stroke pathobiology
2026-Apr-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文综述了核因子红细胞2相关因子2和核因子κB在缺血性和出血性中风病理生物学中的作用机制,重点关注它们在氧化应激、炎症和神经保护中的功能 强调了Nrf2和NF-κB在细胞器间相互作用中的潜在串扰,并指出单细胞测序和空间转录组学技术为理解中风发病机制和开发靶向治疗提供了新视角 NA 探讨Nrf2和NF-κB在中风病理生理学中的核心作用及其在氧化应激、炎症和神经保护中的机制 中风(包括缺血性中风和出血性中风)的病理生物学过程 NA 中风 单细胞测序,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2 2026-04-22
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于最优传输的轨迹推断方法SOCS,用于时间序列空间转录组学数据,以保持生物结构单元的完整性 SOCS方法在时间序列空间转录组学中引入结构约束,确保生物结构单元在时间上的空间连贯性,这是现有方法所缺乏的 NA 开发一种能够准确推断时间序列空间转录组学数据中发育轨迹的方法 时间序列空间转录组学数据,特别是卵巢滤泡和肾小管等空间连续区域 空间转录组学 NA 空间转录组学 最优传输 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3 2026-04-22
Mathematical Modeling Predicts Optimal Immune Checkpoint Inhibitor and Radiotherapy Combinations and Timing of Administration
2025-Mar-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析食管癌患者放疗期间的淋巴细胞动态,构建数学模型预测免疫检查点抑制剂与放疗的最佳组合和给药时机 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和数学建模,系统分析放疗过程中免疫检查点分子动态变化,并预测五种免疫检查点抑制剂在四个不同时间点的疗效 研究基于食管癌患者样本,结果可能不直接适用于其他癌症类型;数学模型依赖于实验数据假设,需临床验证 确定放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的最佳给药时机和药物组合,以提高癌症治疗效果 食管癌患者的组织样本,重点关注淋巴细胞介导的分子相互作用动态 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 数学建模 数学模型 RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
4 2026-04-22
The forkhead transcription factor FKH-7/FOXP acts in chemosensory neurons to regulate developmental decision-making
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了叉头转录因子FKH-7/FOXP在化学感应神经元中调控发育决策的功能,并建立了连接自闭症相关基因的分子病理研究框架 首次发现FKH-7/FOXP在化学感应神经元中调控幼虫进入发育停滞期(dauer阶段)的决策功能,并证明人类FOXP1可在该功能上替代FKH-7 研究基于线虫模型,在哺乳动物系统中的直接适用性需要进一步验证 探究自闭症相关转录因子FOXP1及其同源物在发育决策中的分子机制 线虫(C. elegans)的化学感应神经元及发育决策过程 神经科学 自闭症 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-04-22
TimeFlies: an snRNA-seq aging clock for the fruit fly head sheds light on sex-biased aging
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了TimeFlies,一种基于单细胞RNA测序的果蝇头部衰老时钟,利用深度学习预测供体年龄并揭示性别差异 开发了首个基于全基因组基因表达谱的泛细胞类型单细胞转录组衰老时钟,并应用于探究性别差异在衰老中的机制 研究局限于果蝇头部,未涉及其他组织或物种,且单细胞测序技术可能存在技术偏差 构建一个稳健的单细胞转录组衰老时钟,以识别年龄相关基因并探究性别特异性衰老途径 果蝇头部细胞 自然语言处理 老年疾病 单细胞RNA测序 深度学习 基因表达数据 未指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-04-22
Spatial proteomics and transcriptomics characterization of tissue and multiple cancer types including decalcified marrow
2025-Jan, Cancer biomarkers : section A of Disease markers IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过优化空间生物学技术方法,包括开发多癌组织微阵列和分子与蛋白质友好的脱钙方案,评估了PhenoCycler-Fusion和Xenium平台在多种肿瘤类型(包括脱钙骨髓)中的空间蛋白质组学和转录组学应用 开发了分子与蛋白质友好的脱钙方案,用于处理FFPE骨髓核心样本,以保留核酸用于有效的空间蛋白质组学和转录组学分析,并建立了系统性的组织质量、标记物完整性和数据可重复性评估方法 未明确提及样本量限制或技术适用范围的具体局限性 优化空间生物学技术方法,解决不同组织和肿瘤类型的预分析挑战,以支持下游空间生物学研究 多癌组织微阵列(TMA)和脱钙处理的FFPE骨髓核心样本 空间生物学 多癌种 空间蛋白质组学、空间转录组学、高重免疫组织化学(IHC)、单细胞分析 NA 图像、转录组数据、蛋白质表达数据 NA 10x Genomics, Akoya Biosciences 空间转录组学, 空间蛋白质组学 Xenium, PhenoCycler-Fusion Xenium用于空间转录组学分析,PhenoCycler-Fusion用于高重空间蛋白质组学分析
7 2026-04-22
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-11, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究采用单细胞RNA测序技术,探讨了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值及其对疾病进展的影响 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRAF和RAS基因在甲状腺乳头状癌中的上调表达模式,并阐明了这些突变与肿瘤微环境中免疫相关通路改变的复杂相互作用 未明确说明样本的具体数量及临床随访数据,可能限制了预后评估的统计学效力 评估BRAF和RAS突变对甲状腺乳头状癌患者预后的影响,探索其分子机制 甲状腺乳头状癌组织样本及正常对照样本 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2024-08-07
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-11, Science China. Life sciences
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9 2026-04-22
Annexin A1: a key regulator of T cell function and bone marrow adiposity in aplastic anaemia
2024-11, The Journal of physiology
研究论文 本研究探讨了Annexin A1(ANXA1)在调节T细胞功能中的作用及其在再生障碍性贫血(AA)中骨髓脂肪化的意义 首次通过单细胞测序分析揭示了ANXA1在AA中下调如何驱动CD8 T细胞过度激活,进而通过IFN-γ分泌促进骨髓脂肪化,并证明ANXA1过表达可抑制该过程 未明确说明样本量大小,且研究主要基于相关性分析,需要进一步的功能性实验验证ANXA1的治疗效果 阐明ANXA1在再生障碍性贫血免疫微环境和骨髓脂肪化中的调控机制 再生障碍性贫血患者和健康个体的骨髓组织,重点关注T细胞亚群和骨髓间充质干细胞 单细胞测序分析 再生障碍性贫血 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-04-22
Single-Cell View of Tumor Microenvironment Gradients in Pleural Mesothelioma
2024-Nov-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,首次构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的全面细胞图谱,并识别出与不良预后相关的癌症内在程序、胎儿样内皮细胞群以及NKG2A:HLA-E相互作用作为新的治疗靶点 首次创建胸膜间皮瘤的单细胞RNA测序图谱,发现与生存预测相关的基因程序、新型胎儿样内皮细胞群,并验证NKG2A阻断作为免疫治疗新策略 NA 改善对胸膜间皮瘤肿瘤微环境的理解,以提升免疫治疗反应 胸膜间皮瘤的肿瘤微环境细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-04-22
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-Oct-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了一种通过初免-加强疫苗接种策略,诱导源自中央记忆T细胞的肺驻留记忆CD8+ T细胞,从而预防肿瘤肺转移的机制 首次确定了中央记忆T细胞是疫苗诱导的保护性肺驻留记忆CD8+ T细胞的主要前体,并阐明了鼻内LAIV加强疫苗通过重塑黏膜微环境和CXCR3依赖性趋化作用招募并重编程这些细胞的机制 NA 探究预防肿瘤肺转移的疫苗策略,并明确肺驻留记忆CD8+ T细胞的来源 小鼠模型中的记忆T细胞,特别是肺驻留记忆CD8+ T细胞和中央记忆T细胞 NA 黑色素瘤、间皮瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-04-22
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究提出了一种名为STGAT的新方法,利用图注意力网络整合空间转录组学和bulk RNA-seq数据,以预测乳腺癌组织中的基因表达和肿瘤/非肿瘤区域 STGAT首次结合图注意力网络来捕捉spots之间的空间依赖性,从WSI和bulk RNA-seq数据中估计spot级基因表达,并在TCGA数据中验证了其在乳腺癌亚型和分期预测中的优越性 方法依赖于有限的乳腺癌空间转录组学数据进行训练,可能在其他癌症类型或更大规模数据中的泛化能力未充分验证 开发一种从WSI和bulk RNA-seq数据预测spot级基因表达的方法,以弥补大规模癌症研究中空间转录组学数据不足的缺口 乳腺癌组织样本,包括空间转录组学数据集和TCGA项目中的bulk RNA-seq与WSI数据 计算生物学 乳腺癌 空间转录组学,bulk RNA-seq,全切片成像 GAT 图像,基因表达数据 两个乳腺癌空间转录组学数据集和TCGA乳腺癌数据集 NA 空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
13 2026-04-22
ScRNA-seq revealed targeting regulator of G protein signaling 1 to mediate regulatory T cells in Hepatocellular carcinoma
2023, Cancer biomarkers : section A of Disease markers IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,发现RGS1在肝细胞癌的调节性T细胞中高表达,并与不良预后相关,提示RGS1可能通过CXCR4信号通路调节Treg功能,是潜在的免疫治疗靶点 首次在肝细胞癌中利用单细胞RNA测序数据揭示RGS1在调节性T细胞中的特异性高表达及其与CXCR4信号通路的关联,并发现其与患者临床预后的相关性 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析和免疫荧光验证,缺乏直接的体内外功能实验验证RGS1的具体调控机制 识别肝细胞癌中调节性T细胞的靶向基因,以改善免疫治疗效果 肝细胞癌患者的CD4+ T细胞,特别是调节性T细胞 单细胞转录组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光分析,转录因子活性推断,基因共表达网络分析,生存分析 NA 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,免疫荧光图像数据 基于两个独立的公共单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-04-22
Single-cell transcriptome and accessible chromatin dynamics during endocrine pancreas development
2022-06-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和染色质可及性分析,揭示了小鼠胰腺内分泌细胞分化过程中的基因调控网络 首次结合单细胞转录组学、染色质可及性分析和遗传标记技术,在单细胞分辨率下解析胰腺内分泌细胞谱系分化的转录因子网络,并提出Neurog3可能作为先驱转录因子的新见解 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;单细胞分析可能受技术噪音影响;未深入探讨其他胰腺细胞类型 解析胰腺内分泌细胞发育过程中的基因调控网络和谱系分化机制 小鼠胰腺内分泌细胞(包括β细胞、α细胞和δ细胞) 发育生物学 糖尿病 单细胞转录组学、染色质可及性分析、遗传标记、流式细胞分选 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠胰腺内分泌细胞群体 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
15 2026-04-22
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过分析胰腺中SARS-CoV-2进入因子ACE2的表达,探讨COVID-19与糖尿病之间的潜在关联 结合公共单细胞RNA测序数据和实验验证,首次系统评估了正常人群和COVID-19患者胰腺中ACE2的表达模式 样本量有限,且主要依赖体外分析,未能直接证明病毒感染内分泌细胞的机制 探究SARS-CoV-2感染是否通过ACE2直接侵袭胰腺内分泌细胞导致糖尿病 正常器官捐献者和COVID-19患者的胰腺组织 数字病理学 糖尿病 scRNA-seq, 荧光原位杂交, Western blotting, 免疫定位 NA 单细胞RNA测序数据, 组织图像 多个公共数据集和实验样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2026-04-21
Ion channel/Stat6-driven nano-immune programming of tissue-resident macrophages by amide-functionalized nanocellulose
2026-Aug, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本文通过多组学方法研究了酰胺功能化纳米纤维素对组织驻留巨噬细胞的免疫重编程机制 揭示了酰胺功能化纳米纤维素通过激活电压门控离子通道和Stat6信号通路驱动巨噬细胞向M2极化,而非引发炎症反应 研究仅基于14天亚急性窗口和28天脾细胞分析,长期效应和更广泛器官特异性影响未完全阐明 阐明纳米纤维素表面化学介导的免疫重编程机制 原始纤维素纳米晶体和酰胺功能化纤维素纳米晶体及其与组织驻留巨噬细胞的相互作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 药理学抑制, 组织学分析 NA RNA测序数据, 组织学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
17 2026-04-21
A circRNA neoantigen vaccine elicits potent antitumor immunity and synergizes with checkpoint blockade in melanoma
2026-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究开发了一种基于环状RNA的黑色素瘤新抗原疫苗,并系统阐明了其在小鼠模型中的抗肿瘤疗效、免疫机制以及与检查点阻断疗法的协同作用 首次将环状RNA作为新型载体用于编码多个黑色素瘤新抗原,构建了circRNA疫苗,并利用单细胞RNA测序技术系统揭示了其重塑肿瘤及免疫微环境、增强T细胞抗肿瘤反应的详细机制,同时发现与抗TIGIT/PD1阻断疗法具有协同效应 研究目前仅限于小鼠黑色素瘤模型,尚未在人体中进行验证;circRNA疫苗的长期安全性、免疫持久性及在其它肿瘤类型中的普适性仍需进一步探索 开发一种新型的基于环状RNA的肿瘤新抗原疫苗,并探究其在黑色素瘤治疗中的疗效、免疫作用机制以及与免疫检查点抑制剂的联合治疗潜力 黑色素瘤小鼠模型、肿瘤新抗原、环状RNA疫苗、肿瘤微环境中的免疫细胞(如髓系细胞、T细胞) 肿瘤免疫学、单细胞组学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但使用了预防性和治疗性小鼠黑色素瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-04-21
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过分析HOX基因表达模式(HOX代码)来分层癌症中的谱系约束和谱系可塑性状态,并发现RUNX1T1-HDAC轴作为癌症谱系可塑性的可靶向驱动机制 首次利用HOX代码作为跨癌症的可扩展标记来识别谱系可塑性亚型,并揭示了RUNX1T1通过招募NCOR/HDAC3复合物重塑染色质、驱动谱系可塑性的新机制 研究主要基于回顾性数据分析,且HOX代码在部分癌症类型中的普适性仍需进一步验证 识别癌症谱系可塑性的跨癌症驱动机制并探索其治疗靶点 23种癌症类型中的114个癌症亚型,包括前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病(AML) 生物信息学 多种癌症 RNA-seq、单细胞RNA-seq、CUT&RUN、共免疫沉淀、AI结构建模 AI结构模型 转录组数据、染色质图谱数据 超过80,000个RNA-seq样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
19 2026-04-21
PRMT1 regulates glioblastoma stemness and immunosuppression via nitric oxide metabolism: Multi-cohort analysis and experimental validation
2026-Jun, Nitric oxide : biology and chemistry
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示了PRMT1通过调控一氧化氮代谢,连接胶质母细胞瘤的干性和免疫抑制机制 首次将PRMT1确立为一氧化氮代谢的关键调控因子,并阐明其通过NO依赖机制协调胶质瘤干性和免疫抑制微环境的新功能 研究主要基于回顾性队列和体外/小鼠模型,缺乏前瞻性临床验证;PRMT1调控NO代谢的具体分子机制仍需进一步阐明 探究一氧化氮代谢在胶质母细胞瘤干性和免疫抑制微环境中的作用机制,并寻找潜在治疗靶点 胶质母细胞瘤患者样本(多队列数据)、胶质瘤细胞系、患者来源的胶质瘤干细胞、原位小鼠模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、多组学分析、Cox回归、LASSO建模 统计模型(Cox回归、LASSO) 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 多队列数据集(n=1500例患者)、单细胞RNA测序(65,655个细胞) NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-04-21
Unveiling the impact of electroacupuncture on retinal cells in myopic guinea pigs via single-cell sequencing
2026-Jun, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,系统探索了电针对近视豚鼠视网膜细胞功能特征的影响 首次利用单细胞测序技术系统揭示电针调控近视豚鼠视网膜细胞功能的分子机制,特别是对光感受器锥细胞、Müller胶质细胞和小胶质细胞的作用 研究仅基于豚鼠模型,结果向人类临床应用的转化需进一步验证 阐明电针干预抑制近视进展的细胞机制 近视豚鼠的视网膜细胞 数字病理学 近视 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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