单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39535 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-19 |
Aucan targets CDK2 to suppress glioblastoma progression by inhibiting PI3K/AKT pathway-mediated proliferation and inducing apoptosis
2026-07, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117893
PMID:41846012
|
研究论文 | 本研究评估了来自松萝的二苯并呋喃类似物Aucan（CHNO）的抗胶质母细胞瘤活性及其机制，发现Aucan通过靶向CDK2抑制PI3K/AKT通路介导的增殖并诱导凋亡 | 首次发现Aucan通过靶向CDK2抑制PI3K/AKT通路发挥抗胶质母细胞瘤作用，并整合网络药理学、孟德尔随机化和单细胞RNA-seq进行靶点鉴定 | 未提及 | 评估Aucan的抗胶质母细胞瘤活性并阐明其分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和皮下/颅内裸鼠模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 体外实验使用胶质瘤细胞系，体内实验使用裸鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-19 |
From inflammation to malignancy: the dynamic evolution of cancer-associated fibroblasts in IBD-CRC
2026-Jul, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101310
PMID:42019096
|
综述 | 提出炎症性肠病相关结直肠癌（IBD-CRC）中癌症相关成纤维细胞动态演化的概念框架，强调基质在恶性转化中的关键作用 | 提出‘基质炎症记忆’新概念，揭示PFKFB3介导的糖酵解转变、aPKC极性丧失驱动的上皮-基质互作及CAF亚群多样化在免疫逃逸中的作用 | 基于现有文献的理论框架构建，缺乏原始实验数据验证；‘基质炎症记忆’假设需进一步机制研究证实 | 阐明IBD-CRC中成纤维细胞从炎症到恶性肿瘤的动态演化机制，为靶向基质治疗提供新策略 | 炎症性肠病相关结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞及其微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-19 |
Extracellular vimentin promotes neutrophil-dominant granulomatous inflammation in progressive pulmonary sarcoidosis
2026-Jun-10, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20250651
PMID:42084847
|
研究论文 | 本研究阐明细胞外波形蛋白在进展性肺结节病中驱动中性粒细胞主导的肉芽肿性炎症 | 首次揭示细胞外波形蛋白通过激活中性粒细胞及其胞外陷阱促进肺损伤与纤维化，为进展性结节病提供治疗靶点 | 未明确波形蛋白触发中性粒细胞活化的具体受体机制，且主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究中性粒细胞及其效应分子在进展性肺结节病中的作用机制 | 进展性纤维化结节病患者肉芽肿组织及波形蛋白诱导的小鼠模型 | 机器学习 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫染色 | NA | 转录组数据, 图像 | 患者肉芽肿组织样本与波形蛋白诱导小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-19 |
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Jun, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2642341
PMID:41789512
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序发现SFRP2通过抑制PINK1介导的线粒体自噬起始增强肺肌成纤维细胞纤维化活性 | 首次揭示SFRP2通过自分泌方式激活FZD5介导的非经典WNT-Ca信号，促进PINK1从线粒体外膜转位至内膜并降解，从而抑制线粒体自噬的调控机制 | NA | 探究维持肺肌成纤维细胞持续激活的调控机制，寻找特发性肺纤维化的潜在治疗靶点 | IPF肺组织样本和小鼠肺纤维化模型中的肌成纤维细胞 | 机器学习 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 5 | 2026-05-19 |
Integrative assessment of gamete and embryo quality in porcine in vitro production: A comprehensive review
2026-Jun, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101207
PMID:41797246
|
综述 | 对猪体外生产中配子和胚胎质量评估方法的全面综述，整合了从其他哺乳动物模型获得的见解 | 提出整合先进成像、代谢组学和单细胞转录组学等新兴方法，以及多参数数据驱动框架用于胚胎质量评估，强调了非侵入性工具和物种特异性生物标志物的必要性 | 现有评估方法缺乏标准化和客观标准，跨实验室重复性差，新兴技术的常规应用需要进一步验证和标准化 | 系统总结猪体外生产中评估卵母细胞、精子和胚胎质量的方法，推动标准化和高效的人工辅助生殖技术 | 猪体外生产的配子（卵母细胞、精子）和胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学,代谢组学 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-Jun, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-05-19 |
Exploring the Role of Wt1/Spon2 Axis in Prostate Cancer Progression and Fibroblast Dynamics
2026-Jun, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70800
PMID:42145139
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCGA数据揭示了Wt1/Spon2轴在前列腺癌进展及成纤维细胞动态中的作用 | 首次发现Wt1通过转录激活Spon2促进正常成纤维细胞向肿瘤相关成纤维细胞的转化，并阐明其对前列腺癌进展的调控机制 | NA | 探讨Wt1/Spon2轴在前列腺癌进展及成纤维细胞动态中的作用 | 前列腺癌组织中的细胞类型及成纤维细胞转化 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-05-19 |
Crustacean cell culture: historical developments, methodological advances, and future directions
2026-Jun, Cytotechnology
IF:2.0Q4
DOI:10.1007/s10616-026-00992-y
PMID:42145841
|
综述 | 回顾甲壳类细胞培养的历史发展、方法学进展及未来方向 | 系统整合了干性细胞导向方法、组织特异性培养基优化和分子表征策略，并探讨了三维培养和细胞外基质支架等新兴技术 | 未能建立永生化的甲壳类细胞系，关键的技术空白尚未解决 | 推动甲壳类细胞培养技术的可控、可重复和可持续性发展 | 甲壳类动物细胞，特别是血细胞和造血祖细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞测序、转录组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-05-19 |
Association of Arylacetamide Deacetylase-Mediated Extracellular Matrix Remodeling With Immune Exclusion in Pancreatic Cancer
2026-Jun, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2727
PMID:42147260
|
研究论文 | 该论文研究芳基乙酰胺脱乙酰酶在胰腺癌中通过细胞外基质重塑与免疫排斥的关联 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示AADAC与ECM丰富和免疫限制性微环境在PDAC中的关联 | 未描述具体限制（基于提供的标题和摘要无相关信息） | 评估AADAC在PDAC中与ECM丰富和免疫限制性生态位的关联 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者样本及PANC-1细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 公共数据集GSE212966（单细胞RNA测序）和GSE235315（空间转录组学） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-05-19 |
Macrophage-Fibroblast Crosstalk Shapes Wound Repair Signaling In Vitro
2026-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601156R
PMID:42149092
|
研究论文 | 利用体外伤口愈合模型结合活细胞钙成像与单细胞RNA测序，揭示巨噬细胞与成纤维细胞通过接触依赖和旁分泌信号协同调控伤口修复 | 首次在体外2D和3D模型中整合钙成像与单细胞转录组，发现巨噬细胞-成纤维细胞接触通过连接蛋白43依赖的钙信号调控IL10分泌，并揭示伤口重塑细胞黏附分子和信号通路 | 文章未明确讨论体内复杂环境的影响及长时程信号动态，可能限制对体内伤口愈合过程的直接外推 | 阐明巨噬细胞与成纤维细胞在伤口愈合中接触依赖信号如何与旁分泌通路整合调控相互行为 | 骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）和成纤维细胞（小鼠细胞系或原代细胞） | 数字病理学 | 伤口愈合相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、活细胞钙成像 | NA | 转录组数据、钙成像图像 | NA（研究中未明确样本数量） | NA（未提及具体公司） | 单细胞RNA测序 | NA（未提及具体平台或试剂盒） | NA（未提供平台配置详情） |
| 11 | 2026-05-19 |
Platelet-neutrophil niches associate with epidermal immune activation and systemic inflammation in psoriatic disease
2026-May-18, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-026-02680-y
PMID:42144473
|
研究论文 | 利用空间转录组学绘制银屑病皮损中血小板-白细胞微环境（PLNi）的分布，揭示其选择性扩增及与免疫激活和全身性炎症的关联 | 首次通过空间转录组学系统描绘银屑病中血小板-中性粒细胞微环境（PLNi）的空间分布，发现其在表皮中与树突状细胞和T细胞活化程序协调，并关联疾病严重程度 | 未明确提及局限性 | 探究血小板-中性粒细胞微环境在银屑病皮损中的空间组织及其对免疫激活和全身性炎症的贡献 | 银屑病（PsO）和特应性皮炎（AD）患者的皮损组织及外周血样本 | 空间转录组学 | 银屑病、银屑病关节炎 | 空间转录组学、外周血多组学分析 | NA | 空间转录组数据、多组学数据 | 涉及银屑病和特应性皮炎患者的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-05-19 |
Eltrombopag restores T-cell homeostasis in aplastic anemia by regulating oxidative metabolism and reactive oxygen species levels
2026-May-18, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-07060-7
PMID:42144489
|
研究论文 | 艾曲泊帕通过调节氧化代谢和活性氧水平恢复再生障碍性贫血中T细胞稳态 | 该研究首次揭示了艾曲泊帕通过氧化代谢途径调节T细胞功能表型的新机制，证明其通过上调ENPP1和ENTPD5来降低T细胞中活性氧水平并重塑T细胞亚群组成，从而恢复T细胞稳态 | 研究仅基于小鼠模型，缺乏临床样本验证；单细胞RNA测序的样本量有限；具体信号通路及上游调控机制尚未完全阐明 | 探究艾曲泊帕是否通过氧化代谢途径调节T细胞功能表型及其在再生障碍性贫血中的免疫调节作用 | 再生障碍性贫血小鼠模型中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序、Western blot | NA | 基因表达数据 | 不同治疗方案的再生障碍性贫血小鼠模型，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-19 |
Depicting the dynamic transcriptional and epigenetic landscape of testis development in pubertal Simmental cattle
2026-May-18, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01406-x
PMID:42144636
|
研究论文 | 整合单细胞转录组与表观组图谱，揭示了青春期西门塔尔牛睾丸发育过程中生殖细胞命运转变的动态调控网络 | 首次利用scRNA-seq和sNucATAC-seq技术系统描绘了牛睾丸发育全过程（出生后、青春期前、青春期）的转录与表观遗传动态图谱，并鉴定出E2F1、BCLAF1、YY1等关键转录调控因子以及支持细胞的三种功能亚型 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、跨物种比较的保守性需进一步验证、功能验证实验尚不充分 | 阐明牛睾丸发育过程中生殖细胞命运转变的分子调控机制 | 西门塔尔牛的睾丸组织样本（涵盖出生后、青春期前、青春期三个阶段） | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 西门塔尔牛睾丸组织样本（出生后、青春期前、青春期各阶段），具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、单核ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序与单核ATAC测序平台 |
| 14 | 2026-05-19 |
Smart Microneedles Regulate Reactive Oxygen Species and Deliver Matrix Metalloproteinases for Pathological Scar Treatment
2026-May-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c00171
PMID:42148523
|
研究论文 | 该研究开发了一种智能微针，通过调节活性氧和递送基质金属蛋白酶来治疗病理瘢痕，并在兔和猪模型中验证了其疗效 | 首次将病理信号解码与靶向干预相结合，构建了闭环治疗策略；利用ROS响应性水凝胶实现MMP的按需释放 | 未提及长期疗效和安全性评估；仅在动物模型中验证，缺乏人体临床试验数据 | 开发一种能够调节氧化微环境并重塑细胞外基质的智能微针，用于病理瘢痕治疗 | 正常和瘢痕疙瘩组织样本、兔和猪的病理瘢痕模型 | 机器学习 | 皮肤瘢痕 | 单细胞测序、组织学染色 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 患者样本（具体数量未说明）；兔和猪模型样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-05-19 |
Immunopathophysiology of immune checkpoint inhibitor-related pneumonitis: insights from multi-omics and immune profiling
2026-May-18, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2026.2674327
PMID:42148869
|
综述 | 通过多组学和免疫分析揭示免疫检查点抑制剂相关肺炎的免疫病理生理机制 | 综合运用空间转录组学和成像质谱流式技术，深入解析ICI肺炎中免疫细胞互作和肺部损伤的复杂微环境 | 未提及具体局限性 | 综述免疫检查点抑制剂相关性肺炎的免疫病理生理学研究进展 | ICI肺炎患者的外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织 | 机器学习 | 间质性肺炎 | 空间转录组学、成像质谱流式 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-05-19 |
GLP1-E2 therapy delays autoimmune diabetes in late-stage prediabetic NOD mice and potentiates low-dose anti-CD3 therapy for enhanced disease protection
2026-May-18, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06750-1
PMID:42149241
|
研究论文 | 研究GLP1-E2疗法联合低剂量抗CD3抗体在晚期糖尿病前期NOD小鼠中延缓自身免疫性糖尿病的效果 | 首次证明GLP1-E2（胰高血糖素样肽-1-17β雌二醇偶联物）能增强低剂量抗CD3抗体的治疗效果，通过同时靶向免疫失调和β细胞脆弱性实现协同保护 | 研究仅在雌性NOD小鼠中进行，未在其他模型或人类中验证，且未探索最优给药方案及长期安全性 | 探究GLP1-E2联合低剂量抗CD3抗体能否通过保护β细胞和调节免疫延缓1型糖尿病进展 | 晚期糖尿病前期雌性NOD小鼠 | 机器学习 | 1型糖尿病 | 空间转录组学、免疫染色 | NA | 图像、基因表达数据 | 雌性NOD小鼠，分为四组：未治疗对照组、抗CD3单药组、GLP1-E2单药组及联合治疗组，每组具体数量未明确 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学用于胰腺组织分析 |
| 17 | 2026-05-19 |
Single-cell profiling and machine learning identify cuproptosis-related fibroblast subpopulations and fibrogenesis modulator AEBP1 in endometriosis
2026-May-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02342-x
PMID:42149287
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习，鉴定子宫内膜异位症中与铜死亡相关的成纤维细胞亚群及纤维化调节因子AEBP1 | 首次将铜死亡（铜依赖性细胞死亡）与子宫内膜异位症中成纤维细胞介导的纤维化进程联系起来，并利用单细胞转录组和机器学习方法鉴定了关键基因AEBP1 | 未在临床样本中进一步验证AEBP1的调控机制，且铜螯合剂TTM的治疗效果仅在动物模型中验证 | 探索铜死亡在子宫内膜异位症纤维化进展中的作用，并识别相关成纤维细胞亚群和关键调控基因 | 子宫内膜异位症患者的正常、原位和异位内膜组织样本，以及相关细胞和动物模型 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自正常、原位和异位内膜组织的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-19 |
PSD3 links autophagic flux to MHC-I-associated immune modulation in esophageal squamous cell carcinoma
2026-May-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02345-8
PMID:42149295
|
研究论文 | 揭示PSD3通过自噬流调控食管鳞癌中MHC-I相关免疫调节的作用机制 | 首次发现PSD3在食管鳞癌中高表达且与不良预后相关，并证明PSD3通过自噬流影响MHC-I蛋白水平和免疫细胞浸润，提供了一个新的免疫调节候选节点 | 需要进一步研究以明确通路层级和抗原呈递功能 | 阐明PSD3在食管鳞癌自噬与免疫调节中的分子联系 | 食管鳞癌组织和细胞系（包括小鼠和人源ESCC模型） | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫共沉淀、Western印迹、串联荧光LC3报告基因检测、免疫组化 | NA | 图像、文本 | NA（未提供具体样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-19 |
Basp1 Intensifies Neutrophil Migration and NETs Formation in Traumatic Brain Injury
2026-May-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05927-4
PMID:42149339
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型，揭示Basp1在创伤性脑损伤后促进中性粒细胞迁移和NETs形成的关键作用 | 首次发现Basp1特异性上调于TBI后中性粒细胞中，并通过与Vimentin直接相互作用调控细胞骨架重排，为TBI的神经炎症治疗提供新靶点 | 分子机制仍不完全明确，需进一步验证Basp1-Vimentin相互作用的详细通路；样本仅依赖小鼠模型和体外实验，临床转化需更多数据 | 阐明Basp1在中性粒细胞驱动的TBI炎症中的分子机制 | TBI患者外周血和中性粒细胞、小鼠TBI模型 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、谱系追踪、蛋白质对接、免疫共沉淀 | 条件敲除小鼠 | 基因表达数据 | TBI患者外周血样本（具体数量未明确）、小鼠模型（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-19 |
The ATF5-GPER1 axis drives female protection in hepatocellular carcinoma through dual tumor-suppressive and immune-modulatory mechanisms
2026-May-17, Bioscience trends
IF:5.7Q1
DOI:10.5582/bst.2026.01026
PMID:41850858
|
研究论文 | 本研究揭示了ATF5-GPER1轴通过肿瘤抑制和免疫调节双重机制驱动肝细胞癌女性保护作用 | 首次发现ATF5-GPER1轴作为女性特异性保护回路，通过肿瘤内在抑制和免疫重塑双重机制解释肝癌性别二态性 | 未在独立大样本中验证功能机制，缺乏体内动物模型验证 | 阐明肝细胞癌性别二态性的分子机制，识别女性保护基因 | 肝细胞癌患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 58名患者的238,982个单细胞，167例组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |