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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-13
Immunotherapy impact of macrophage glycosylation on cholangiocarcinoma and its prognostic and immune microenvironment significance
2026-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics IF:4.1Q2
研究论文 本研究基于糖基化相关基因构建了胆管癌预后模型,并探讨了巨噬细胞糖基化在免疫治疗中的影响 首次通过单细胞RNA测序分析胆管癌巨噬细胞亚群的糖基化模式,并构建了包含五个基因的糖基化相关风险模型,同时验证了PGK1在促进糖基化终末产物积累和巨噬细胞M2极化中的作用 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 开发基于糖基化相关基因的预后模型,以预测胆管癌的预后和免疫治疗反应 胆管癌肿瘤微环境中的巨噬细胞糖基化模式 生物信息学 胆管癌 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,差异表达基因分析,LASSO Cox回归 风险评分模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-13
Exploring the molecular mechanisms underlying the inflammation-cancer transformation in Hashimoto thyroiditis using single-cell transcriptomics
2026-Dec-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 本研究利用单细胞转录组学探索了桥本甲状腺炎向甲状腺乳头状癌转化的分子机制 首次在单细胞水平揭示了桥本甲状腺炎相关恶性滤泡上皮细胞通过FN1/CD44轴招募肥大细胞,并通过IL-8激活PI3K/AKT通路驱动癌变的机制 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验,缺乏体内模型的验证,且样本来源和数量可能有限 阐明桥本甲状腺炎向甲状腺乳头状癌转化的肿瘤免疫微环境和分子机制 桥本甲状腺炎和甲状腺乳头状癌组织样本,以及TPC-1细胞、Nthy-ori 3-1细胞和肥大细胞 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,差异基因表达筛选,功能富集分析,细胞间通讯分析,Transwell共培养模型 NA 单细胞转录组数据,体外实验数据 未明确说明具体样本数量,但包括HT相关和PTC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-03-13
PPRC1 is a prognostic biomarker and key regulator of mitochondrial oxidative phosphorylation in multiple myeloma
2026-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究探讨了PPRC1在多发性骨髓瘤中的临床和生物学意义,发现其作为预后生物标志物和代谢调节剂的作用 首次将PPRC1鉴定为多发性骨髓瘤的独立预后因子,并揭示其通过维持线粒体氧化磷酸化促进肿瘤进展的机制 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的功能性验证 探索PPRC1在多发性骨髓瘤中的预后价值和生物学功能 多发性骨髓瘤患者样本和MM细胞系 生物信息学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,siRNA沉默,Kaplan-Meier分析,Cox回归分析 NA 基因表达数据,临床数据 公共数据库数据及独立本地队列样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-03-13
Machine learning reveals sex-biased platelet-associated molecular signatures in systemic lupus erythematosus
2026-Jun, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本研究利用机器学习方法揭示了系统性红斑狼疮中性别偏倚的血小板相关分子特征 首次通过整合多个转录组数据集和机器学习算法,系统性识别了SLE中性别特异性的候选基因,特别是发现了血小板糖蛋白VI(GP6)在男性SLE患者中的差异表达及其与PTCRA的关联 研究基于公共数据库的转录组数据,可能受样本异质性和批次效应影响;未进行实验验证;样本量相对有限 探究系统性红斑狼疮中性别差异的分子基础,特别是血小板相关基因的表达模式 338名个体(175名正常对照和163名SLE患者)的转录组数据 机器学习 系统性红斑狼疮 转录组学分析、差异基因表达分析、机器学习算法、单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习算法(未指定具体模型) 转录组数据 338个样本(来自6个SLE研究) NA 单细胞RNA-seq, 转录组分析 NA NA
5 2026-03-13
FOXN1 immunodeficiency detected by TREC-based newborn screening - A challenge of management?
2026-Jun, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本文通过TREC新生儿筛查识别出三名携带四种新型FOXN1突变的新生儿,详细描述了其临床病程,并利用先进流式细胞术和高分辨率单细胞RNA测序进行免疫表征 首次报道了四种新型FOXN1突变,并利用单细胞RNA测序技术揭示了FOXN1缺陷患者中独特的B细胞群体和HLA-II mRNA水平降低 研究仅基于三名新生儿的小样本队列,可能限制了结果的普遍性,且基因型-表型相关性不完全 探讨非SCID FOXN1免疫缺陷的管理挑战,并通过免疫表征理解其异质性临床病程 三名携带FOXN1突变的新生儿患者 数字病理学 免疫缺陷病 TREC新生儿筛查、流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 基因测序数据、流式细胞数据、临床数据 三名新生儿患者及健康脐带血对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-03-13
The underlying mechanism of cardiac injury in exertional heat stroke rats based on the scRNA-seq analysis
2026-Apr-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序分析,探讨了运动性热射病大鼠心脏损伤的潜在机制 首次在运动性热射病模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地识别了心脏损伤相关的差异表达基因和细胞信号通路,并验证了Hspa8、Hspe1、Id1、Ndufa4和Cd36等关键基因的表达变化 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人体样本中验证;样本量未明确说明;单细胞测序数据的分析深度和细胞类型注释可能受技术限制 阐明运动性热射病导致心脏损伤的分子机制,为早期识别心脏损伤生物标志物提供理论依据 运动性热射病大鼠模型的心脏组织 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据,组织切片图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-03-13
Protoplast-Based Functional Genomics and Genome Editing: Progress, Challenges and Applications
2026-Apr, Plant, cell & environment
综述 本文综述了原生质体系统在植物功能基因组学和基因组编辑中的进展、挑战与应用 整合了1050篇文献的系统分析,并强调了单细胞转录组学在原生质体研究中的新应用,以及原生质体再生在作物改良中的实际价值 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且可能未涵盖所有最新技术进展 探讨原生质体系统在植物环境感应、信号传导、基因调控及作物改良中的应用 植物原生质体,涵盖模式物种和经济作物 植物功能基因组学 NA 原生质体分离、蛋白质/DNA/RNA递送、单细胞转录组学、CRISPR/Cas RNP编辑 NA 文献数据、转录组数据 基于1050篇已发表文章的分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-13
Strategies for resolving cellular phylogenies from sequential lineage tracing data
2026-Apr, Theoretical population biology IF:1.2Q4
研究论文 本文通过建模和分析顺序编辑的记录系统,探讨了在何种实验条件下能够高概率地精确重建细胞谱系,并提出了基于距离的重建方法在特定参数范围内准确解析细胞谱系树的有效性 首次对顺序编辑的分子记录系统进行建模,并理论分析了实现精确谱系重建的实验条件,为实验设计提供了理论指导 研究主要基于模拟和理论分析,缺乏实际实验数据的验证,且参数范围可能受限于模型假设 探究顺序编辑的分子记录系统在细胞谱系重建中的信息内容和可行性 细胞谱系树和顺序编辑的分子记录数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序和CRISPR-based分子记录技术 距离基于的重建方法 序列数据 数千个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-03-13
Inhibiting Endoplasmic Reticulum/Plasma Membrane contact ameliorates endometrial fibrosis by preventing senescence in endometrial epithelial cells
2026-Apr, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究首次将单细胞RNA测序应用于小鼠宫腔粘连模型,揭示了内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1钙通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老,从而驱动子宫内膜纤维化的新机制 首次在宫腔粘连模型中应用单细胞RNA测序技术,发现并验证了ER/PM接触-STIM1/Orai1钙通道-细胞衰老这一新的致病通路 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性仍需进一步验证 探究宫腔粘连的发病机制并寻找潜在治疗靶点 小鼠宫腔粘连模型中的子宫内膜上皮细胞 单细胞组学 宫腔粘连 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠IUA模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-03-13
Spatial transcriptomics of immune ecotypes for predicting immunotherapy outcomes in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 本研究开发并验证了EIRM-HN模型,通过整合单细胞状态、空间转录组生态位和批量转录组数据,定义了头颈鳞状细胞癌的免疫生态型,以预测免疫检查点抑制剂治疗结果 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,定义头颈鳞状细胞癌的免疫生态型,并构建了基于空间锚定的风险预测模型,超越了传统生物标志物如PD-L1和肿瘤突变负荷的预测能力 研究为回顾性多队列分析,样本量相对有限(370例),且外部验证仅在一个批量转录组队列(GSE65858)中进行,可能影响模型的普遍适用性 开发一个整合多组学数据的模型,以改善头颈鳞状细胞癌患者对免疫检查点抑制剂治疗反应的预测和分层 头颈鳞状细胞癌患者,包括接受免疫治疗和对照组的病例 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 惩罚Cox模型, 逻辑回归模型 转录组数据 370例头颈鳞状细胞癌病例(80例分子分析,210例免疫治疗,80例对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
11 2026-03-13
Sex specific genomic insights into type 1 diabetes through GWAS and single cell transcriptome analysis
2026-Apr, Diabetes research and clinical practice IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过性别分层全基因组关联研究和单细胞转录组分析,揭示了1型糖尿病遗传风险的性别特异性差异 首次在1型糖尿病研究中系统进行性别分层GWAS,并结合单细胞RNA-seq数据识别性别特异性基因,开发了性别特异性多基因风险评分 研究人群仅限于欧洲血统个体,样本量相对有限,且单细胞分析仅基于外周血单个核细胞 探究1型糖尿病遗传风险的性别差异,开发更精确的风险预测模型 1型糖尿病患者和健康对照个体 基因组学 1型糖尿病 GWAS, 单细胞RNA-seq 多基因风险评分 基因组数据, 单细胞转录组数据 GWAS: 6,599例T1D患者和12,350例对照;scRNA-seq: 9对匹配的儿科男女配对;验证队列: 471例T1D患者和2,300例对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-03-13
Spatial transcriptomics and single-cell analysis reveal GSTO2-mediated protective networks in oral squamous cell carcinoma tumor microenvironment
2026-Apr, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了GSTO2在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的保护性网络 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,识别出GSTO2作为OSCC的遗传验证保护因子,并阐明了其与免疫细胞的空间互作及分子结合机制 样本量相对有限,且功能验证主要基于体外实验,缺乏体内模型的进一步证实 探究口腔鳞状细胞癌的细胞异质性、代谢重编程及其分子机制,以寻找新的生物标志物和治疗靶点 口腔鳞状细胞癌(OSCC)样本 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 汇总数据孟德尔随机化分析, 功能富集分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 分子对接, 共免疫沉淀 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 50,667个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
13 2026-03-13
From Single-Cell Clusters to Causality: ITCH Engagement for CKD Uncovered by Integrative Analysis of MR and MAGMA
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合人类肾脏单细胞RNA测序数据与遗传关联及因果推断框架,识别并验证了ITCH作为慢性肾脏病(CKD)的潜在易感基因 采用供体感知的伪批量策略来缓解小供体单细胞RNA测序数据集中的细胞水平伪重复问题,并结合孟德尔随机化(MR)和MAGMA基因水平关联分析进行候选基因优先排序 研究主要基于假设生成方式探索药理调节,后续实验验证如hesperetin的测试仍需未来研究 优先排序慢性肾脏病(CKD)的易感基因并探索潜在药理靶点 人类肾脏组织及实验性肾损伤模型 数字病理学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)、MAGMA基因关联分析、免疫组织化学验证、分子对接和分子动力学模拟 NA 单细胞RNA测序数据、GWAS汇总统计数据、实验模型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-13
NPC2 suppresses osteolytic metastasis in lung adenocarcinoma via the AKT/mTOR pathway and tumor-osteoclast crosstalk
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了溶酶体相关蛋白NPC2通过AKT/mTOR信号通路和肿瘤-破骨细胞相互作用,抑制肺腺癌骨转移的作用 首次结合单细胞RNA测序数据,发现NPC2在肺腺癌骨转移中的保护作用,并阐明其通过AKT/mTOR通路和肿瘤-破骨细胞串扰发挥功能的机制 研究主要基于细胞实验和动物模型,尚未在临床样本中进行大规模验证;具体分子机制细节有待进一步深入探索 探究NPC2在肺腺癌骨转移中的作用及其分子机制 肺腺癌细胞(如PC9细胞系)、破骨细胞、动物模型 肿瘤生物学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-13
Directed differentiation of bovine trophoblast stem cells: A useful in vitro model for placenta development
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究开发了一种牛滋养层干细胞分化方案,用于体外模拟胎盘发育,并探索了GCM1在滋养层巨细胞分化中的调控机制 首次建立了牛滋养层干细胞向滋养层巨细胞分化的体外模型,并利用单细胞转录组分析和可诱导GCM1表达系统揭示了分化调控机制 研究未涉及体内验证,且分化系统的长期稳定性和功能完整性需进一步评估 探究牛胎盘发育中滋养层分化的细胞和分子机制 牛滋养层干细胞及其分化产生的滋养层巨细胞 发育生物学 NA 单细胞转录组分析、基因工程诱导表达 体外分化模型 转录组数据、基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及牛滋养层干细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2026-03-13
Single-cell analyses identify independent aging processes that compete to determine cellular fate in budding yeast
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和纵向荧光显微镜技术,系统解析了酵母衰老过程中的异质性,揭示了独立衰老过程的竞争机制 提出了“竞争风险模型”,挑战了rDNA不稳定性和线粒体功能障碍互斥的传统观点,表明它们可并行发生,并通过单细胞技术明确了环境应激反应(ESR)的诱因 研究主要基于酵母模型,结果在高等生物中的普适性需进一步验证,且单细胞技术可能受技术噪声影响 解析酵母衰老过程中表型异质性的分子驱动机制 芽殖酵母(Saccharomyces cerevisiae)的衰老细胞 单细胞组学 衰老相关疾病 单细胞转录组学,纵向荧光显微镜 竞争风险模型 转录组数据,图像数据 未明确指定样本数量,但涉及单细胞水平的酵母衰老细胞分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-13
Cytoskeletal remodeling promotes tunneling nanotube formation and drives cardiac resident cell mitochondrial transfer in sepsis
2026-Mar-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究揭示了脓毒症中驱动蛋白Drp1介导的细胞骨架重塑促进隧道纳米管形成,从而调控心脏驻留细胞间线粒体转移的纳米尺度机制 首次发现Drp1通过结合Filamin和Kinesin调控隧道纳米管生物发生,建立了纳米尺度细胞器通讯网络在脓毒症心脏重构中的关键作用 研究主要基于小鼠CLP模型,人类临床相关性仍需验证;单细胞测序样本量有限 阐明脓毒症诱导心脏功能障碍的纳米尺度细胞间通讯机制 小鼠心脏内皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞及其亚群 单细胞组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠CLP模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-03-13
miR-203 facilitates timely cell fate transitions via epigenetic modulation during early embryogenesis
2026-Mar-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了miR-203在小鼠早期胚胎植入前发育中作为关键调节因子,通过调控组蛋白乙酰化酶如EP300来促进细胞命运转变 首次在严格体内方法中识别miR-203为早期哺乳动物胚胎发生中发育过渡的关键调节因子,并阐明其通过表观遗传机制调控细胞命运 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他哺乳动物中的普适性未验证,且机制探索部分依赖于体外分析 探究microRNAs在早期哺乳动物胚胎发生中如何调节最早的发育过渡 小鼠早期胚胎,特别是植入前胚胎 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,表观遗传分析 NA RNA测序数据,表观遗传数据 未明确指定样本数量,但基于基因工程小鼠模型和单细胞研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-03-13
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型、三维显微镜和空间转录组学技术,揭示了肝脏纤维化过程中2型淋巴细胞(T2Ls)与3型淋巴细胞(T3Ls)在成纤维细胞微环境中的空间相互作用及其对肝脏修复和病理纤维化的调控机制 首次发现T2Ls(主要为ILC2s)在肝脏纤维化中通过空间定位限制T3Ls(主要为γδ T细胞)的活性,揭示了淋巴细胞与成纤维细胞微环境之间的空间交互对话在调节肝脏修复和病理纤维化中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝脏疾病中的直接适用性尚需进一步验证,且空间转录组学的分辨率可能限制了对细胞间相互作用的精细解析 探究肝脏纤维化过程中淋巴细胞与成纤维细胞微环境的空间相互作用及其对组织修复和病理纤维化的影响 小鼠肝脏损伤和纤维化模型中的2型淋巴细胞(T2Ls,主要为ILC2s)、3型淋巴细胞(T3Ls,主要为γδ T细胞)以及成纤维细胞微环境 空间转录组学 肝脏纤维化 三维显微镜、空间转录组学 NA 图像、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
20 2026-03-13
Molecular subtypes of vascular endothelial cell differentiation in keloid by single-cell sequencing
2026-Mar-12, Chinese medical journal IF:7.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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