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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-23
Accurate classification of ependymomas and medulloblastomas using Raman spectroscopy and pilot transcriptomic profiling
2026-May-05, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy
研究论文 本研究利用拉曼光谱准确区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤,并通过初步空间转录组分析提供生物学背景 首次将拉曼光谱与空间转录组分析结合,用于区分室管膜瘤和髓母细胞瘤,揭示了与脂质代谢和血管生成相关的生化差异 患者层面的性能需在更大队列中进一步验证,研究为回顾性设计且样本量有限 评估拉曼光谱在区分室管膜瘤和髓母细胞瘤中的准确性,并探索其作为无标记辅助诊断技术的潜力 后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤的冷冻及FFPE组织样本 数字病理学 脑肿瘤 拉曼光谱,空间转录组学 PCA-SVM分类器 光谱数据,转录组数据 34个样本(21个冷冻,13个FFPE) 10x Genomics 空间转录组学 10x Genomics Xenium In Situ 10x Genomics Xenium In Situ v2 FFPE工作流程
2 2026-02-23
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了缺血性中风后单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进视网膜损伤 首次结合单细胞RNA测序、Cx3cr1Ccr2报告小鼠和CCL2中和抗体干预,明确了中风后浸润的单核细胞来源巨噬细胞在视网膜中的扩增和促炎表型,并通过IL-1β中和抗体及Nlrp3缺陷小鼠证实了其IL-1β依赖的损伤机制 研究基于小鼠MCAO模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;未详细探讨其他炎症因子或细胞类型的潜在作用 探究缺血性中风后视网膜损伤的炎症机制,特别是单核细胞来源巨噬细胞的作用 小鼠(包括Cx3cr1Ccr2报告小鼠和Nlrp3缺陷小鼠)的视网膜组织及其中风后变化 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 视网膜bulk RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测, 视网膜电图, TUNEL染色, 苏木精-伊红染色 NA RNA测序数据, 图像数据, 电生理数据 未明确样本数量,但涉及多种小鼠模型和实验方法 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3 2026-02-23
Single-cell RNA-seq reveals cellular dynamics and emergency hematopoiesis in banana shrimp Penaeus merguiensis hemocytes upon Yellow Head Virus infection
2026-Apr, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了香蕉虾在黄头病毒感染下的血细胞动态变化和紧急造血反应 首次整合香蕉虾13种主要组织数据建立参考转录组,并利用单细胞RNA测序解析YHV感染下的血细胞景观变化,强调了单细胞分析在准确解读宿主-病原体相互作用中的必要性 研究主要关注血细胞,未涉及其他免疫组织或长期感染动态,且样本量相对有限 探究香蕉虾对黄头病毒感染的细胞免疫反应机制 香蕉虾(Penaeus merguiensis)的血细胞 单细胞组学 病毒感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 未明确具体样本数量,但涉及正常和YHV感染条件下的血细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-02-23
Clusterin Drives Fiber Endocytosis by Mesothelial Cells to Resolve Liver Fibrosis
2026-Mar, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了簇集蛋白(CLU)通过其受体LRP2驱动间皮细胞增殖、迁移并内吞纤维,从而缓解肝纤维化的机制,并设计了一种模拟CLU的肽段CLUtide,展示了其治疗潜力 首次发现CLU通过LRP2受体激活间皮细胞的内吞作用来清除纤维,并设计出具有治疗潜力的模拟肽CLUtide 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和安全性仍需进一步验证 探究CLU在肝纤维化中的作用机制及其治疗潜力 肝纤维化患者和小鼠模型中的CLU、LRP2及间皮细胞 数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序、免疫荧光、基因敲除小鼠模型 NA 基因表达数据、图像数据 患者和小鼠样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-02-23
Therapeutic reprogramming of circulating myeloid cells via signal regulatory protein α extracellular vesicles in acute kidney injury
2026-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文探讨了通过表达高亲和力信号调节蛋白α变体的细胞外囊泡靶向CD47,以治疗急性肾损伤 开发了表达高亲和力SIRPα变体的细胞外囊泡,用于系统性靶向循环髓系细胞中的CD47,提供了一种新型免疫调节策略 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性未充分评估 研究靶向CD47的细胞外囊泡在急性肾损伤中的治疗潜力 人类急性肾损伤样本和小鼠模型(顺铂和双侧缺血/再灌注) 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序,CD47蛋白染色 NA RNA测序数据,蛋白质染色图像 人类急性肾损伤标本和两种小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-02-23
Mechanistic insights from transcript analysis of long-term pig to non-human primate kidney xenografts
2026-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文通过转录分析探讨了猪到非人灵长类动物肾脏异种移植物的长期机制,揭示了稳定移植物中转录升高、VEGFA损失与血栓性微血管病相关,以及异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录获得的新颖过程 研究发现异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录及蛋白的意外获得,这是一种在异种移植物中检测到的新过程,与同种异体移植中的抗体介导排斥反应形成对比 研究基于非人灵长类动物模型,可能不完全适用于人类临床环境,样本数量有限(58个样本),且依赖于转录分析,需要进一步功能验证 研究猪肾脏异种移植物在非人灵长类动物中的长期转录机制,以了解异种移植与同种异体移植的不同机制 eGenesis猪肾脏异种移植物在猕猴中的样本,包括供体、灌注后、协议和终末样本 数字病理学 肾脏疾病 转录分析、空间转录组学、抗体检测 NA 转录数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 58个样本来自猕猴中的猪肾脏异种移植物 NA 空间转录组学 NA NA
7 2026-02-23
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 研究主要基于转录组数据,功能验证仅限于细胞系实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 肝内胆管癌恶性细胞 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
8 2026-02-23
Pancancer Fine-Mapping of Mutational Intolerance Identifies CHEK1 as an Immunosuppressive Driver in Lung Adenocarcinoma
2026-Feb-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了miDriver计算框架,通过泛癌-正常组织突变对比识别了1,020个突变不耐受基因,并揭示了CHEK1作为肺腺癌中免疫抑制驱动因子的作用机制 提出了基于泛癌-正常组织突变对比的计算框架miDriver,首次系统识别了1,020个突变不耐受基因,并发现CHEK1通过调控MIF表达驱动M2样巨噬细胞极化的新机制 研究基于13种癌症类型的8,096个肿瘤样本,可能未覆盖所有癌症类型;体内实验的临床转化潜力需进一步验证 识别癌症中突变不耐受基因的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 13种癌症类型的8,096个肿瘤样本,重点关注肺腺癌中的CHEK1基因 计算生物学 肺腺癌 CRISPR筛选、单细胞转录组学、多重免疫荧光 计算框架miDriver 基因组突变数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像数据 8,096个肿瘤样本(涵盖13种癌症类型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-02-23
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群中Parvimonas micra的富集及其通过代谢产物p-甲酚促进调节性T细胞分化,从而驱动肿瘤生长的机制 首次在ESCC中系统揭示了肿瘤内微生物Parvimonas micra通过代谢产物p-甲酚调控肿瘤免疫微环境(诱导Treg分化)的具体分子机制,建立了微生物-代谢物-免疫抑制-肿瘤生长的完整因果链条 样本量相对有限(119对肿瘤-正常组织),且机制研究主要基于细胞和动物实验,在人体内的直接验证尚需进一步研究 探究食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群的组成、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用机制 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的肿瘤组织及配对正常组织 肿瘤微生物组学 食管鳞状细胞癌 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 119对肿瘤-正常组织用于宏基因组测序;45个样本用于单细胞RNA测序 NA 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-02-23
Intracellular bacteria modulate the immune microenvironment of oral squamous cell carcinoma
2026-Feb-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用INVADEseq技术探索口腔鳞状细胞癌中细胞内细菌如何调节肿瘤免疫微环境及其对免疫检查点阻断疗法的影响 首次应用INVADEseq技术同时捕获宿主单细胞RNA测序数据和细菌特征,揭示了细胞内细菌通过抑制PDCD1表达、增强感染反应、促进抗原呈递和巨噬细胞激活来影响免疫治疗疗效 研究未明确细胞内细菌的具体作用机制,且样本类型和数量可能限制结论的普适性 探究细胞内细菌在口腔鳞状细胞癌免疫微环境中的作用及其对免疫检查点阻断疗法疗效的影响 口腔鳞状细胞癌患者样本 单细胞测序 口腔鳞状细胞癌 INVADEseq(入侵-粘附定向表达测序) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-02-23
SELE is associated with reduced breast cancer susceptibility: Evidence from Mendelian randomization and single-cell transcriptome
2026-Feb-20, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞转录组分析,探索循环蛋白与乳腺癌风险的因果关系,并识别出SELE、CDH1和ALPI作为降低乳腺癌风险的潜在生物标志物 采用多组学整合方法(包括孟德尔随机化、单细胞转录组和分子对接),首次系统性地验证了SELE等循环蛋白在乳腺癌中的因果作用,并通过大规模数据增强了因果推断的稳健性 研究主要基于遗传预测和观察性数据,需进一步临床实验验证这些蛋白的生物标志物和治疗靶点潜力 识别与乳腺癌风险相关的循环蛋白生物标志物,并探索其致病机制 乳腺癌患者及健康对照的遗传和转录组数据 生物信息学 乳腺癌 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、全基因组关联研究 孟德尔随机化框架(包括MR-Egger、MR-PRESSO) 遗传数据、转录组数据、蛋白质数据 大规模pQTL和GWAS数据(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
12 2026-02-23
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-Feb-19, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究开发了一个名为SCMO的深度学习模型,通过整合单细胞分辨率下的肿瘤微环境生态系统特征和多组学数据,用于结直肠癌患者的生存预测 首次将单细胞分辨率下的肿瘤微环境生态系统特征与多组学数据整合到一个深度学习模型中,用于生存预测,并利用集成梯度算法和空间转录组数据增强模型可解释性 模型在测试集中的1年预测AUC相对较低(0.639),且样本量(213个单细胞样本)可能限制其泛化能力 提高结直肠癌患者生存预测的准确性,并识别潜在的药物靶点 结直肠癌患者 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 自归一化神经网络 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,临床数据,基因组数据,转录组数据,微生物数据 213个结直肠癌单细胞RNA测序样本(包含339,060个细胞),以及来自TCGA-CRC队列的批量RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
13 2026-02-23
Radiotherapy disrupts ferroptosis tolerance by reducing DNMT1 levels and uncouples STING silencing in LKB1-deficient lung tumors
2026-Feb-19, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了LKB1缺陷通过DNMT1-OSGIN1轴促进肺癌细胞铁死亡耐受,而放疗能同时破坏这种耐受并激活STING通路,从而逆转免疫检查点抑制剂耐药性 首次发现LKB1缺陷通过DNMT1-OSGIN1轴促进肺癌细胞铁死亡耐受,并证明放疗能同时破坏铁死亡耐受和激活STING通路,为LKB1缺陷肺癌的联合治疗提供了新策略 研究主要基于基因工程小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 探究LKB1缺陷导致免疫检查点抑制剂耐药的机制,并开发针对性治疗策略 LKB1缺陷的非小细胞肺癌 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 RNA测序数据 多个临床队列及基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-02-23
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L orchestrates alternative splicing critical for primordial follicle formation
2026-Feb-19, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了异质核核糖核蛋白L(hnRNPL)通过调控选择性剪接在原始卵泡形成中的关键作用 首次鉴定hnRNPL作为调控原始卵泡形成的关键剪接因子,并阐明其与PTBP1和SRSF10相互作用的分子机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 阐明从原始生殖细胞到原始卵泡形成过程中选择性剪接的动态变化和功能意义 小鼠生殖细胞发育过程 生殖生物学 卵巢功能不全 单细胞RNA测序,批量RNA测序,RIP-seq,IP-MS,免疫荧光 条件性基因敲除小鼠模型 RNA测序数据,蛋白质互作数据 小鼠胚胎期E16.5-E18.5及出生后P1时间点的卵巢组织 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
15 2026-02-23
Gut-brain axis-mediated mechanisms and immune regulatory pathways in vascular dementia: insights into microbiota-derived metabolites and novel therapeutic strategies
2026-Feb-19, Behavioural brain research IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过整合多组学分析和机器学习方法,识别了血管性痴呆的关键致病基因PIK3CG,并探索了肠道菌群代谢物通过肠脑轴调控神经炎症的潜在治疗策略 首次将肠道菌群代谢物与血管性痴呆的致病基因PIK3CG通过分子对接验证结合可行性,并提出基于肠脑轴的微生物干预新策略 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证;样本来源和规模未明确说明 阐明血管性痴呆的分子机制并探索基于肠道菌群的创新治疗方法 血管性痴呆患者相关基因表达数据、肠道菌群代谢物 生物信息学 血管性痴呆 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接 LASSO、神经网络、SVM-RFE 基因表达数据、代谢物结构数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-02-23
Spatial transcriptomics maps early B-cell and T-cell activation in hidradenitis suppurativa
2026-Feb-19, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学分析,揭示了化脓性汗腺炎早期阶段B细胞和T细胞活化的时空序列 首次在化脓性汗腺炎中展示了早期免疫激活(包括B细胞富集、T17通路活化和中性粒细胞浸润)先于隧道或三级淋巴结构形成,并识别了表达促炎细胞因子、抗原呈递机制和免疫球蛋白的多功能B细胞 研究未明确这些早期免疫激活事件是否直接导致晚期结构形成,且样本量相对有限,需要进一步验证 旨在阐明化脓性汗腺炎中免疫激活的时间序列及其与疾病进展的关系 早期和晚期化脓性汗腺炎病变组织,并与聚合性痤疮和银屑病进行比较 数字病理学 皮肤炎症性疾病 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 156个感兴趣区域 NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-02-23
CD68 Identified as a Regulator of Human Melanocyte Development and Function
2026-Feb-19, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了传统巨噬细胞标记物CD68在人类黑素细胞发育和功能调控中的新作用 首次将CD68确立为黑素细胞生物学的调控因子,超越了其作为免疫细胞标记物的传统认知 研究基于人类胚胎干细胞分化模型,可能无法完全反映体内黑素细胞发育的复杂性 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18 2026-02-23
From laboratory bench to surgical room: Molecular profiling and single-cell technologies in precision surgery for colorectal cancer patients
2026-Feb-18, Surgical oncology
综述 本文综述了结直肠癌精准手术中分子分型和单细胞技术的最新进展及其在围手术期策略中的应用 整合了单细胞测序、空间多组学、液体活检和类器官平台等前沿技术,将分子特征与外科手术决策相结合,推动精准外科概念 NA 探讨分子分型和单细胞技术在结直肠癌精准手术中的转化应用,以优化患者分层和治疗策略 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序, 空间多组学, 液体活检, 类器官培养, 全基因组测序 NA 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
19 2026-02-23
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究首次绘制了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)的碱基分辨率转录组图谱,揭示了m5C通过稳定SERPINB5 mRNA促进宫颈癌进展和化疗耐药的机制 首次在宫颈癌中生成碱基分辨率的m5C转录组图谱,并结合空间转录组学和单细胞RNA-seq技术,鉴定出SERPINB5作为m5C调控的新型致癌效应因子 NA 阐明m5C在宫颈癌中的功能机制和治疗相关性 宫颈癌 数字病理学 宫颈癌 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-02-23
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular and Molecular Differences Between Myxofibrosarcoma and Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-Feb-10, Medical sciences (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的细胞与分子差异 首次在单细胞水平上揭示了这两种肉瘤亚型在细胞组成、通路活性和细胞间配体-受体相互作用方面的差异 样本量较小(仅5个肿瘤样本),需要进一步验证 阐明黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤之间的细胞和转录组差异,以改善其鉴别诊断 黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的肿瘤样本 单细胞组学 肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 5个肿瘤样本(包含两种亚型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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