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当前共找到 44469 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-23 |
Glioblastoma immune landscape remodeling following treatment with CD70-targeted CAR-T cells
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2745295
PMID:42894313
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序解析CD70靶向CAR-T细胞治疗原位胶质母细胞瘤后小鼠脑肿瘤免疫微环境的重塑 | 首次揭示CD70靶向CAR-T细胞治疗后胶质母细胞瘤免疫景观向炎症消退和免疫抑制减弱方向重塑 | 研究基于小鼠同源原位胶质母细胞瘤模型，尚未在人类患者中验证 | 探究CD70靶向CAR-T细胞治疗后胶质母细胞瘤免疫微环境的变化 | 荷CD70胶质母细胞瘤的免疫健全小鼠 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-10-23 |
Single-cell transcriptomic atlas uncovers immune/structural lineage remodeling and fibrosis in Klebsiella pneumoniae-infected porcine lungs
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2747487
PMID:42862716
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、流式细胞术、RT-qPCR和免疫荧光技术，揭示耐多药高毒力肺炎克雷伯菌感染猪肺后免疫细胞与结构细胞谱系重塑及纤维化机制 | 首次在单细胞分辨率下刻画肺炎克雷伯菌感染猪肺的细胞动态变化，发现肺泡巨噬细胞异质性及感染特异性亚群（AM_MHCII、AM_CXCL2），并揭示KP通过ROS介导的TGF-β/SMAD通路、WNT通路和有氧糖酵解诱导肺成纤维细胞增殖活化 | 摘要未明确说明，仅基于猪模型，未在人类样本中验证，样本量未提及 | 阐明肺炎克雷伯菌感染后猪肺免疫细胞与结构细胞的响应动态及纤维化机制，为抗KP治疗开发提供框架 | 健康猪与耐多药高毒力肺炎克雷伯菌感染猪的肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎克雷伯菌感染、肺部感染、肺纤维化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、RT-qPCR、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-10-23 |
An intrascrotal bioadhesive nanoplatform for sustained hydrogen delivery ameliorates age-associated testicular dysfunction
2026-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.103732
PMID:42898181
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研究论文 | 开发一种阴囊内生物黏附纳米平台S-H/B，实现持续氢气释放，改善老年小鼠睾丸功能障碍 | 将氢化硅纳米片与醛基化聚乳酸-超支化聚甘油生物黏附聚合物结合，构建局部持续释氢系统，首次用于延缓睾丸衰老 | 仅在老年小鼠模型中验证，尚未开展人体临床试验，长期生物安全性有待评估 | 探究持续局部氢气递送对年龄相关睾丸功能障碍的治疗作用及其机制 | 老年小鼠睾丸及支持细胞 | NA | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-10-23 |
Integrating multiple omics approaches to identify AIF1 as a protective factor in IgA nephropathy
2026-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2026.100407
PMID:42898749
|
研究论文 | 该文整合多祖先孟德尔随机化、转录组、单细胞RNA测序及细胞间通讯分析，鉴定AIF1为IgA肾病的保护因子及潜在无创生物标志物和治疗靶点 | 采用多祖先孟德尔随机化框架结合贝叶斯共定位，并在独立队列中验证，首次将AIF1定位至树突状细胞介导的抗原呈递通路，且发现扁桃体切除后AIF1表达部分恢复 | 摘要未明确说明研究局限性，可能包括MR分析的因果推断局限、样本种族与队列来源有限以及缺乏功能实验验证 | 寻找IgA肾病的无创生物标志物和治疗靶点 | IgA肾病患者及冰岛、Fenland和英国队列人群 | 多组学与遗传流行病学 | IgA肾病 | 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位, 转录组分析, 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, ELISA | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 蛋白质组关联数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-10-23 |
Epitope-diverse autoantibodies induce neutrophil-epithelial niches driving kidney injury in ANCA-associated glomerulonephritis
2026-Nov-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20260506
PMID:42895484
|
研究论文 | 该研究通过单细胞空间转录组学揭示ANCA相关性肾小球肾炎中抗体诱导的中性粒细胞-上皮细胞生态位驱动肾损伤的机制 | 首次在治疗前患者肾活检中通过单细胞空间转录组学鉴定出早期炎症生态位，发现识别不同表位的抗MPO单克隆抗体组合可增强中性粒细胞活化并诱导小鼠寡免疫新月体性肾小球肾炎，且改造为单臂抗体减少FcγR结合可改善肾损伤 | 未明确说明样本量有限及动物模型与人体的种属差异可能影响结论外推 | 探究致病性自身抗体如何引发局部免疫活化及组织损伤，特别是MPO-ANCA相关性肾小球肾炎的发病机制 | 治疗前ANCA相关性肾小球肾炎患者的肾活检组织及小鼠模型 | 空间转录组学, 免疫学, 肾脏病学 | ANCA相关性肾小球肾炎, 自身免疫性疾病, 肾损伤 | 单细胞空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 小鼠模型构建, 单克隆抗体工程 | NA | 空间转录组数据, 图像, 文本 | 治疗前患者肾活检样本（数量未明确）及小鼠模型 | NA | 单细胞空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-10-23 |
Itaconate as the endogenous brake of proinflammatory macrophage activation alleviates inflammation in liver fibrogenesis
2026-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000001034
PMID:42900160
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研究论文 | 该研究发现ACOD1/衣康酸在慢性肝损伤中作为内源性刹车抑制BMDM促炎活化，从而缓解肝脏炎症和纤维化 | 首次揭示ACOD1/衣康酸与S1P通过同一信号通路（S1PR2/MAPK/NF-κB）形成负反馈环路，发挥内源性刹车功能，并通过两种嵌合小鼠模型验证了骨髓ACOD1在肝纤维化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；单细胞RNA测序数据仅作为发现性证据；衣康酸作为治疗策略的具体给药方式和剂量未涉及 | 探究ACOD1/衣康酸是否参与S1P诱导的BMDM活化，以及其在慢性肝损伤中对BMDM促炎活化和肝纤维化的调控作用 | 小鼠骨髓来源的单核/巨噬细胞（BMDMs）、骨髓嵌合小鼠、甲硫氨酸-胆碱缺乏联合高脂饮食诱导的肝损伤纤维化小鼠模型 | 单细胞组学、免疫学、肝病学 | 肝纤维化、肝脏炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（基因表达数据）、图像（组织学） | 两种类型的骨髓嵌合小鼠（BM Acod1缺陷型和BM Acod1独占表达型），具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-10-23 |
Cancer-associated fibroblasts-derived CAV1 promotes epithelial-mesenchymal transition and stemness in bladder cancer through activation of the LIF/STAT3 signaling pathway
2026-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103001
PMID:42691512
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和公共数据集整合，识别CAF驱动基因CAV1，并阐明其通过激活LIF/STAT3信号通路促进膀胱癌上皮-间质转化和干性的机制 | 首次识别CAV1作为CAF驱动基因，揭示CAF来源的CAV1通过LIF/STAT3信号轴促进膀胱癌进展，并提出靶向基质CAV1介导的STAT3信号作为膀胱癌治疗策略 | 研究主要基于体外共培养体系和皮下异种移植模型，缺乏更复杂的体内微环境验证；临床样本量未明确说明；CAV1在CAF亚群中的具体调控机制尚未完全阐明 | 识别CAF驱动基因并阐明CAV1在CAF介导的膀胱癌进展中的作用 | 膀胱癌细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）、临床膀胱癌样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-10-23 |
A chemoresistance-associated proliferation gene signature identified by single-cell and machine learning analysis predicts prognosis in high-grade serous ovarian carcinoma
2026-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103018
PMID:42696959
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和批量数据，通过机器学习鉴定化疗耐药相关的增殖基因特征，构建九基因预后模型并在耐药细胞系中验证 | 结合单细胞测序与117种算法机器学习框架，首次系统识别化疗耐药相关的增殖基因并构建HGSOC九基因预后特征，揭示肿瘤微环境中特定细胞类型的基因表达 | 摘要未明确说明，可能包括单细胞数据集有限、需更大规模临床队列验证、机制研究尚不深入 | 识别高级别浆液性卵巢癌化疗耐药相关的增殖基因特征并构建预后预测模型 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤组织及配对敏感和顺铂耐药细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, Western blot | 机器学习集成框架（117种算法组合） | 基因表达数据（文本/数值）, 图像（Western blot） | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-10-23 |
A multi-omics study integrating single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics, and mendelian randomization unveil the implication of TRDMT1 expression in T cells on the immunotherapeutic response and prognosis in breast cancer
2026-Oct-21, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02083-9
PMID:42901998
|
研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学、空间转录组学和孟德尔随机化，揭示TRDMT1在T细胞中的表达与乳腺癌免疫治疗反应和预后的关联 | 首次通过孟德尔随机化揭示m5C调控因子TRDMT1在血液中的表达与乳腺癌预后的因果关系，并结合单细胞和空间转录组学验证TRDMT1在CD8 T细胞中的功能及其对免疫治疗反应的影响 | 未明确说明研究的局限性 | 探究m5C调控与乳腺癌之间的因果关系，特别是TRDMT1表达在T细胞中对免疫治疗反应和预后的影响 | 乳腺癌患者和健康对照者的外周血单个核细胞、原发性乳腺癌组织、组织芯片（120例患者） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学, 孟德尔随机化, 流式细胞术, 免疫荧光分析 | NA | 图像, 文本 | 120例患者组织芯片，以及乳腺癌患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-10-23 |
ROS and Drp1-mediated mitochondrial fission contributes to the hyposalivation caused by Sjögren's disease
2026-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003727
PMID:40908878
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研究论文 | 本研究探讨了ROS和Drp1介导的线粒体分裂在干燥综合征相关口干症中的作用，并探索了靶向线粒体分裂的治疗效果 | 首次揭示ROS通过Drp1及其Ser616位点促进线粒体分裂，导致腺体上皮细胞线粒体功能障碍，进而参与干燥综合征口干症的发生，并证明Mdivi-1导管内灌注可显著改善口干症状 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类患者中验证；样本量有限；Mdivi-1的长期安全性和临床转化潜力未充分评估 | 阐明ROS和线粒体动力学在干燥综合征相关口干症中的作用，并探索靶向线粒体分裂治疗口干症的效果 | 干燥综合征小鼠模型的颌下腺组织及腺体上皮细胞 | 单细胞测序、分子生物学、病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-10-23 |
A gut microbiota-metabolite-host gene score for subtyping and predicting the treatment response in rheumatoid arthritis: integrative analysis with in silico knockout validation
2026-Oct-20, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01149-7
PMID:42900335
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研究论文 | 本研究整合多套类风湿关节炎转录组数据，构建基于肠道菌群-代谢物-宿主基因调控轴的GMS评分，用于RA分子分型及生物制剂治疗反应预测，并通过scRNA-seq、in silico敲除与分子对接验证FOS/JUN的核心作用 | 首次提出并构建整合肠道菌群-代谢物-宿主基因轴的GMS评分，可量化该轴对RA分层与治疗反应的影响；结合scRNA-seq定位关键基因细胞来源，采用scTenifoldKnk in silico敲除模拟核心宿主基因功能缺失，并用分子对接验证关键蛋白与小分子的结合亲和力 | 研究基于公共转录组数据的生物信息学整合分析，缺乏湿实验验证；in silico敲除和分子对接均为计算模拟，结论需体内外实验进一步证实；未提及前瞻性临床队列验证GMS评分 | 构建基于肠道菌群-代谢物-宿主基因调控轴的综合生物标志物评分，用于RA分子亚型划分及抗TNF、利妥昔单抗等生物治疗反应预测 | 类风湿关节炎患者的多套转录组数据集及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 转录组分析, 单细胞RNA-seq, PCA, CIBERSORT免疫浸润分析, scTenifoldKnk in silico敲除, 分子对接 | PCA, scTenifoldKnk | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-10-23 |
Revisiting Ehrlich carcinoma in the era of precision oncology: bridging classical models with modern systems biology
2026-Oct-20, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03452-x
PMID:42900436
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综述 | 本文综述了Ehrlich癌（EC）及Ehrlich腹水癌（EAC）模型的研究现状及其在精准肿瘤学时代的潜在价值 | 提出将RISC为中心的调控网络与CRISPR、空间转录组学、代谢谱分析等新兴技术结合，以提升EC/EAC模型的转化价值 | EC/EAC研究主要集中于转录变化和单一信号通路，对转录后调控机制（尤其是RISC）探索不足，且缺乏多组学、单细胞和空间分析、功能基因组学、免疫检查点分析及系统层面整合研究 | 重新审视Ehrlich癌模型，探讨如何将其与现代表达系统生物学方法结合以研究肿瘤进展和治疗反应 | Ehrlich癌（EC）和Ehrlich腹水癌（EAC）实验肿瘤模型 | 肿瘤生物学、系统生物学 | 癌症（Ehrlich癌/腹水癌） | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-10-23 |
CYP1B1 is a potential target of kaempferol in renal fibrosis: a multi‑omics and single‑cell transcriptomics study
2026-Oct-20, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01135-z
PMID:42900454
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研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞转录组学探讨山奈酚改善肾纤维化的分子靶点与机制，重点关注CYP1B1 | 首次整合转录组分析、WGCNA、多算法机器学习、单细胞转录组学、SHAP分析、CIBERSORT免疫浸润评估、scTenifoldKnk虚拟基因敲除和分子对接，系统识别山奈酚干预肾纤维化的核心靶点并揭示CYP1B1的上游调控枢纽作用 | 研究结果仅为假设生成性，缺乏实验验证，诊断模型外部验证AUC较低（0.759），分子对接预测需后续实验证实 | 探索山奈酚改善肾纤维化的分子靶点和机制，重点研究CYP1B1的作用 | 肾纤维化相关的基因表达数据和单细胞转录组数据 | 多组学与单细胞转录组学 | 肾纤维化 | 转录组分析、WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序、CIBERSORT、scTenifoldKnk、分子对接 | LASSO、SVM-RFE、随机森林、SHAP、scTenifoldKnk | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-10-23 |
Epithelial NF-κB shapes protective Treg cell responses to restrain intestinal inflammation
2026-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-78796-z
PMID:42901926
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和分泌组分析，揭示肠道上皮细胞NF-κB通过促进Treg细胞募集来限制肠道炎症的保护性机制 | 发现上皮NF-κB驱动的促炎分泌组 Paradoxically 对炎症恢复至关重要，并揭示CCL22依赖的Treg细胞募集及GDPD3/CCR4相关的耐受性促修复细胞状态 | 摘要未明确说明 | 探究肠道上皮如何塑造其免疫微环境以及上皮-免疫通讯在结肠炎恢复中的作用 | 溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本及可实现NF-κB活性全组织可视化的小鼠模型 | 单细胞组学、免疫学 | 溃疡性结肠炎、肠道炎症 | 单细胞RNA测序、分泌组分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-10-23 |
The Characteristics of Tumor Microenvironment by the Single Cell Profile in Endometrial Cancer of no Specific Molecular Profile (NSMP) Subtype
2026-Oct-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78332
PMID:42902496
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研究论文 | 该研究整合单核RNA测序、空间转录组学和多重组免疫组化，揭示NSMP型子宫内膜癌的肿瘤微环境特征及复发机制 | 发现SPP1+巨噬细胞亚群可能通过SPP1-CD44轴促进CD4+ T细胞应激和维持上皮细胞干性，从而重塑肿瘤微环境并促进肿瘤细胞增殖和迁移 | 摘要未明确说明研究局限性 | 阐明NSMP型子宫内膜癌的肿瘤微环境特征及复发机制，为个性化治疗提供基础 | NSMP型子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 多重组免疫组化 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-10-23 |
Astrocytic Ketogenesis Protects Central Nervous System Injury via CPT1A Stabilization and Epigenetic Regulation
2026-Oct-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78393
PMID:42902976
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研究论文 | 该文通过单细胞和空间转录组学揭示了脊髓损伤后星形胶质细胞的脂质和酮体代谢重编程，并阐明星形胶质细胞酮体生成通过稳定CPT1A和表观遗传调控保护中枢神经系统损伤 | 首次发现脊髓损伤后星形胶质细胞亚群发生脂质和酮体代谢重编程，阐明β-羟基丁酸通过P300介导的CPT1A赖氨酸β-羟基丁酰化抑制其自噬降解，并揭示H3K9bhb依赖的表观遗传重塑正反馈环路，提出生酮饮食作为中枢神经系统损伤治疗策略 | 摘要未明确说明研究的具体局限性 | 探究中枢神经系统损伤后反应性星形胶质细胞的特定代谢特征及其在损伤修复中的作用机制 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞、中枢神经系统损伤模型及脊髓损伤患者 | 空间转录组学、单细胞转录组学、神经生物学 | 中枢神经系统损伤、脊髓损伤 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-10-23 |
Recovering CDR3 sequences from RNA-seq data: a critical assessment of computational and experimental strategies
2026-Oct-19, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-026-00084-5
PMID:42897688
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综述 | 综述了从RNA-seq数据中恢复CDR3序列的计算与实验策略，并评估AI能否克服现有障碍 | 系统整合已发表的配对RNA-seq与TCR-seq基准研究，量化评估RNA-seq恢复CDR3的能力，并批判性评估AI与湿实验策略的潜力 | 基于已发表研究的汇总分析而非原始实验，RNA-seq在克隆频率估计和α/β配对恢复方面准确性有限 | 评估从RNA-seq数据中恢复CDR3序列的计算和实验策略，探讨AI能否克服转录本稀缺等障碍 | T细胞受体CDR3序列及公开的配对RNA-seq与TCR-seq数据集 | 免疫信息学 | 癌症、自身免疫病、感染性疾病 | RNA-seq, TCR-seq | NA | 文本、序列数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, TCR-seq | MiXCR, TRUST4, FUME-TCRseq, rhTCRseq | NA |
| 18 | 2026-10-23 |
CellDiffusion: Enhancing scRNA-seq data integration with accurate inference of cell-cell association
2026-Oct-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed4155
PMID:42886809
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研究论文 | 提出一种基于无监督图扩散的模型CellDiffusion，通过增强细胞间关联实现单细胞转录组数据的准确整合 | 利用图扩散过程传播细胞特征，学习细胞间注意力网络自适应识别跨批次对应细胞群，实现细胞特异性校正并保留内在细胞类型与发育轨迹 | 摘要中未明确说明模型的计算复杂度、可扩展性及潜在局限性 | 解决跨实验室、条件和技术的单细胞转录组数据整合中细胞类型特异性批次效应和异质性生物组成带来的挑战 | 单细胞转录组数据集，包括人类子宫内膜等复杂组织 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | 基于图的扩散模型 | 基因表达矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-10-23 |
Comprehensive benchmarking of somatic mutation detection by the SMaHT Network
2026-Oct-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.09.037
PMID:42880231
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研究论文 | SMaHT Network对体细胞突变检测进行了全面基准测试，评估了测序技术、实验方法和计算方法，并生成了大规模社区资源 | 首次大规模系统性比较短读长与长读长测序、六种双链测序技术及单细胞测序在体细胞突变检测中的表现，并证明供体特异性和泛基因组推断的二倍体组装可改善突变检测 | 仅分析了九个样本，样本量有限；未明确涵盖所有类型的体细胞突变和组织类型 | 评估和确定检测不同类型体细胞突变的有效测序技术、实验策略和计算方法，为精准的基因组全体细胞突变分析提供路线图 | 细胞系和供体组织样本 | 基因组学 | NA | 短读长测序, 长读长测序, 双链测序, 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 9个样本（细胞系和供体组织），短读长数据>1000×，长读长数据100-400× | NA | bulk DNA-seq, 单细胞测序, 双链测序 | NA | 短读长测序>1000×覆盖度，长读长测序100-400×覆盖度，六种双链测序技术 |
| 20 | 2026-10-23 |
Spatial transcriptomics unveils the in situ cellular and molecular hallmarks of the lung in fatal COVID-19
2026-10-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-78188-3
PMID:42881179
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研究论文 | 利用Visium空间转录组学揭示致命性COVID-19肺部原位细胞和分子特征 | 首次利用空间转录组学揭示COVID-19诱导的弥漫性肺泡损伤中细胞和分子事件的空间组织，包括配体-受体相互作用、转录因子活性富集和时空轨迹分析 | 摘要中未明确说明样本量和其他潜在限制 | 解析致命性COVID-19的细胞和分子事件，特别是弥漫性肺泡损伤的驱动机制 | COVID-19患者和对照组的肺组织样本 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学 |