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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-08
Fibroblast-derived versican exacerbates periodontitis progression by regulating macrophage migration and inflammatory cytokine secretion
2025-07, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨成纤维细胞来源的versican蛋白通过调控巨噬细胞迁移和炎症因子分泌加重牙周炎进展的机制 首次揭示牙周炎中versican主要由成纤维细胞产生,并阐明其通过促进巨噬细胞M1极化和MAPK信号通路激活来加剧牙周组织破坏的新机制 文章未提及具体研究局限性 探究versican在牙周炎中的表达来源及调节巨噬细胞功能以加重炎症的病理机制 牙周炎患者和动物模型中的组织样本,以及L929成纤维细胞和RAW264.7巨噬细胞系 机器学习 牙周炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序、实时定量聚合酶链反应、免疫组织化学染色、免疫荧光染色、体外共培养 NA 基因表达数据、图像 NA NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-09-08
Single-Cell Transcriptomics and Lineage Tracing Unveil Parallels in Lymphatic Muscle and Venous Smooth Muscle Development, Identity, and Function
2025-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过单细胞转录组学和谱系追踪研究淋巴管肌细胞与静脉平滑肌细胞在发育、身份和功能上的相似性 首次揭示淋巴管肌细胞与静脉平滑肌细胞共享相似的转录组特征,并证明其来源于WT1+中胚层祖细胞,而非先前认为的平滑肌或心肌祖细胞 研究主要在鼠类模型中进行,可能不完全代表人类淋巴系统;仅聚焦于后肢和腹股沟-腋窝区域,未涵盖所有淋巴床 阐明淋巴管肌细胞独特收缩特性的细胞和分子基础,并探索其与血管平滑肌细胞的关系 小鼠淋巴管肌细胞、静脉平滑肌细胞和小动脉平滑肌细胞 单细胞转录组学、发育生物学 淋巴水肿 单细胞RNA测序、遗传谱系追踪、全组织免疫染色、活体成像 NA 单细胞转录组数据、图像 使用小鼠后肢和腹股沟-腋窝区域的细胞和血管样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-09-08
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学鉴定了脂肪酸结合蛋白在肺动脉高压中控制内皮糖酵解和动脉编程的作用 首次阐明了内皮FABP4/5在肺动脉高压发病机制中的直接作用,并利用多种转录组学技术揭示了其调控内皮糖酵解和动脉编程的机制 摘要中未提及研究的局限性 阐明内皮FABP4/5在肺动脉高压发病机制中的作用 特发性肺动脉高压患者、肺动脉高压大鼠模型、Egln1Tie2Cre小鼠和Egln1Tie2Cre/Fabp4/5-/-小鼠 转录组学 肺动脉高压 RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学、血浆蛋白质组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、影像数据 包括人类患者样本、大鼠模型和小鼠模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
4 2026-09-08
Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型和人类样本,证明脾脏CD169+Tim4+边缘金属嗜巨噬细胞在心肌梗死后的伤口愈合中发挥关键作用,并探讨其治疗潜力 首次揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属嗜巨噬细胞在心肌梗死后心脏修复中的关键作用,并表明其可通过肝脏X受体α激动剂扩增以改善心脏重构 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅通过流式细胞术检测循环细胞,未进行功能验证 确定脾脏CD169+Tim4+边缘金属嗜巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的作用及其潜在治疗价值 小鼠脾脏CD169+Tim4+边缘金属嗜巨噬细胞、心脏巨噬细胞、人类循环CD169+Tim4+单核细胞 免疫学、心血管研究 心肌梗死、心力衰竭 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪、细胞追踪、脾切除术、异种共生、细胞过继转移 NA 基因表达数据、细胞表型数据 小鼠模型(具体数量未明确);人类ST段抬高型心肌梗死患者及稳定型冠心病对照参与者(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-09-08
Tracking HIV persistence across T cell lineages during early ART-treated HIV-1-infection using a reservoir-marking humanized mouse model
2025-Mar-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究介绍了一种HIV-1诱导谱系追踪模型,用于追踪早期抗逆转录病毒治疗期间HIV在不同T细胞谱系中的持续存在 开发了HILT系统,一种在人类化小鼠模型中不可逆标记受感染细胞的新方法,能够检测罕见的潜伏感染细胞,并结合单细胞RNA测序分析不同感染状态的转录谱 基于人类化小鼠模型,可能不完全模拟人类HIV感染过程;样本量和临床相关性有限 探究抗逆转录病毒治疗期间HIV在不同CD4+ T细胞谱系中的持续存在机制 人类化小鼠模型中感染HIV的CD4+ T细胞 数字病理学 HIV感染 单细胞RNA测序 人类化小鼠模型 单细胞转录组数据 涉及人类化小鼠模型,具体样本数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-09-08
Progressive T cell exhaustion and predominance of aging tissue associated macrophages with advancing disease stage in penile squamous cell carcinoma
2025-Mar-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析阴茎鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境,揭示了从局部到晚期疾病进展中T细胞耗竭和衰老相关巨噬细胞 predominance 的现象 首次系统描绘阴茎鳞状细胞癌从局部到晚期及不同HPV状态的免疫微环境动态变化,并鉴定出晚期肿瘤中终末耗竭CD8 T细胞和M2样巨噬细胞为主的免疫逃逸特征 样本量较小(仅10例肿瘤组织),且未包含非病变正常组织作为对照,可能影响结果普适性 评估阴茎鳞状细胞癌从局部到晚期疾病以及HPV阳性与阴性肿瘤间的免疫微环境变化,以识别晚期肿瘤的免疫逃逸潜在机制 阴茎鳞状细胞癌肿瘤组织,包括阴茎原发灶、淋巴结及远处转移灶样本 单细胞转录组学 阴茎鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10例阴茎鳞状细胞癌组织样本,其中4例匹配的阴茎和淋巴结样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-09-08
Using Callus as an Ex Vivo System for Chromatin Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 该综述讨论了用于染色质分析的外植体系统,特别是使用子叶来源的愈伤组织作为简单、易得且稳健的平台,以支持高通量多组学分析。 提出使用子叶来源的愈伤组织作为外植体系统进行染色质分析,作为传统方法(如细胞类型特异性富集或单细胞测序)的替代方案,以简化操作并降低技术门槛。 未详细说明具体实验数据或结果,可能缺乏实证支持。 评估不同方法在减少细胞异质性方面的优缺点,并强调愈伤组织系统在多组学研究中的应用潜力。 用于染色质分析的植物组织样本(如子叶来源的愈伤组织)。 分子生物学 NA 下一代测序、单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
8 2026-09-08
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Small-Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025-01, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 通过单细胞 RNA 测序和全外显子测序,揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞组成、起源和演化轨迹 首次在单细胞分辨率下全面描述宫颈 SCNEC 的细胞组成、HPV 感染相关特征和基因表达谱,并发现其可能起源于鳞状上皮细胞,提出高危 HPV 感染和 SOX2 扩增可能促进肿瘤发生的假设 仅基于两名患者样本,样本量小,可能限制结果的普遍性;验证使用外部数据,未进行功能实验确认机制 阐明宫颈 SCNEC 的细胞异质性、起源和肿瘤发生轨迹 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和邻近正常宫颈组织 单细胞测序 宫颈小细胞神经内分泌癌 单细胞 RNA 测序、全外显子测序、bulk RNA-seq NA 单细胞转录组、全外显子组、bulk 转录组 2 名宫颈 SCNEC 患者的肿瘤组织和相邻正常宫颈组织 NA 单细胞 RNA 测序、全外显子测序 NA NA
9 2026-09-08
The multifaceted role of mitochondria in cardiac function: insights and approaches
2024-10-29, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
综述 本文综述了心脏线粒体的起源、异质性及其在心脏功能和疾病相关重塑中的作用,并探讨了利用计算方法与单细胞测序技术研究线粒体与心血管疾病关联的潜力 强调线粒体具有善恶双重功能,并整合了线粒体亚群(如闰盘间、肌膜下、核周和核内线粒体)在心脏中的独特角色以及线粒体向核的逆行通讯,提出结合GWAS和单细胞测序技术来识别异质性和致病基因的新途径 本文为综述,未提供原始实验数据;线粒体功能障碍在其他并存疾病中的复杂角色可能限制靶向治疗的直接应用 探讨心脏线粒体在心血管疾病中的作用,并评估计算与单细胞技术用于遗传筛查的可行性 心脏线粒体亚群、线粒体异质性及其与细胞核的通讯机制 计算生物学与单细胞测序 心血管疾病 单细胞测序、全基因组关联分析 NA 基因组和单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2026-09-08
Spatial-transcriptomic profiling: a new lens for understanding myelofibrosis pathophysiology
2024-10-21, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
综述 本文综述了空间转录组学技术在骨髓纤维化病理生理学研究中的应用,探讨了其如何揭示骨髓和脾脏中的细胞异质性、空间基因调控及微环境相互作用 首次系统阐述空间分辨转录组学(SRT)作为新工具,通过高分辨率基因表达图谱揭示骨髓纤维化中骨髓和脾脏的病理微环境及“肿瘤替代”作用,为发现新治疗靶点和生物标志物提供新视角 当前研究主要基于综述视角,未包含原始实验数据或具体方法验证,可能缺乏定量证据支持 探讨空间转录组学如何增进对骨髓纤维化病理生理的理解,并促进诊断和治疗创新 骨髓纤维化患者骨髓和脾脏组织的空间转录组特征 空间转录组学 骨髓纤维化 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
11 2026-09-08
Iron chelation as a new therapeutic approach to prevent senescence and liver fibrosis progression
2024-09-17, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了铁螯合剂(去铁酮)通过减少肝细胞衰老来预防肝纤维化进展的作用机制,基于小鼠慢性肝损伤模型和体外细胞实验。 首次揭示铁积累与肝细胞衰老在肝纤维化中的机制联系,并证明铁螯合剂可通过改变衰老相关分泌表型(SASP)向抗炎方向转化来减轻纤维化。 铁螯合剂未能显著影响肝星状细胞(LX-2)中由不同试剂诱导的衰老,表明其效果可能具有细胞类型特异性。 评估铁螯合剂能否通过降低肝细胞衰老来预防肝纤维化进展。 小鼠肝纤维化模型中的肝细胞和肝星状细胞,以及人类肝细胞系HH4和肝星状细胞系LX-2。 病理学 肝纤维化 RNA-seq NA 基因表达数据 使用了从CCl处理小鼠分离的肝细胞,分析了已发表的单细胞RNA-seq数据集;在体外实验中使用了HH4和LX-2细胞系;涉及不同病因的患者转录组数据。 NA 单细胞RNA-seq NA 使用了来自CCl处理肝脏的单细胞RNA-seq数据集(具体平台未在标题和摘要中提供)
12 2026-09-08
Single-cell sequencing analysis of multiple myeloma heterogeneity and identification of new theranostic targets
2024-09-14, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞测序分析多发性骨髓瘤的异质性,并识别新的治疗诊断靶点,发现WNK1作为潜在治疗靶点 利用单细胞转录组图谱揭示多发性骨髓瘤中B淋巴细胞谱系的异质性,发现骨髓瘤与健康供体间的细胞通讯异常及血浆细胞亚群特异性,提出WNK1作为新的治疗靶点 该研究基于有限样本量和单细胞转录组数据,可能未涉及蛋白水平的功能验证,且需更多实验验证WNK1的临床实用性 阐明多发性骨髓瘤的细胞异质性并识别新的治疗诊断靶点 多发性骨髓瘤患者和健康供体的骨髓细胞 单细胞测序 多发性骨髓瘤 单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 48,293个骨髓细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-09-08
A spatiotemporal comparative analysis on tumor immune microenvironment characteristics between neoadjuvant chemotherapy and preoperative immunotherapy for ESCC
2024-09-10, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组技术,从时间和空间维度比较新辅助化疗与术前免疫治疗对食管鳞状细胞癌肿瘤免疫微环境的影响 首次在空间水平上对比化疗和免疫治疗对ESCC肿瘤微环境的影响,揭示免疫治疗联合化疗能促进T细胞增殖、部分恢复耗竭T细胞功能、诱导特定耗竭CD8 T细胞扩增,并增加树突状细胞产生,支持免疫热微环境 未明确提及研究的局限性 比较新辅助化疗和术前免疫治疗对ESCC肿瘤免疫微环境的时空影响,探索潜在机制,并为个性化新辅助治疗提供基础 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的肿瘤微环境 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 未明确提及 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
14 2026-09-08
Targeting POLRMT by IMT1 inhibits colorectal cancer cell growth
2024-09-03, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了新型特异性POLRMT抑制剂IMT1对结直肠癌的抗肿瘤活性,发现其通过靶向POLRMT抑制癌细胞生长、迁移和转移 首次揭示IMT1作为POLRMT特异性抑制剂在结直肠癌中的潜在抗肿瘤作用,并通过单细胞RNA测序确认POLRMT在CRC细胞中过表达 NA 探究IMT1靶向POLRMT抑制结直肠癌细胞生长的机制和效果 结直肠癌细胞(原代和永生化),以及异种移植瘤小鼠模型 数字病理学与癌症研究 结直肠癌 单细胞RNA测序、靶向shRNA沉默、慢病毒过表达、异种移植 NA 基因表达数据和细胞实验数据 涉及结直肠癌组织、细胞系及小鼠模型的样本 10x Genomics(推测基于单细胞RNA测序) 单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-09-08
circADAMTS6 via stabilizing CAMK2A is involved in smoking-induced emphysema through driving M2 macrophage polarization
2024-08, Environment international IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了circADAMTS6通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化,从而参与吸烟诱导的肺气肿发病的机制 首次阐明circADAMTS6通过形成RNA-蛋白质三元复合物稳定CAMK2A mRNA的分子机制,并证明其在吸烟相关肺气肿中促进M2巨噬细胞极化的新功能 未提及:可能需要更多临床样本验证circADAMTS6作为生物标志物的特异性 探究吸烟诱导肺气肿中circADAMTS6促进M2巨噬细胞极化的分子机制及其作为诊断和治疗靶点的潜力 人类和小鼠的肺组织、巨噬细胞、肺类器官模型 数字病理学 肺气肿(慢性阻塞性肺疾病) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人类和小鼠肺组织样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
16 2026-09-08
G0 arrest gene patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with lung adenocarcinoma
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究基于G0期停滞相关基因构建了肺腺癌患者的预后和药物敏感性预测模型,并验证了其与肿瘤微环境和治疗反应的关系 首次开发了基于G0A相关基因的六基因特征,用于预测肺腺癌患者的生存预后和药物敏感性,并通过多种数据集和实验验证了其可靠性 未提及具体局限性,但可能受限于回顾性数据分析和外部验证数据集的异质性 开发并验证一种基于G0A相关基因的预后信号,以改善肺腺癌患者的预后预测和个性化治疗策略 肺腺癌患者,涉及TCGA-LUAD队列及多个公共转录组数据集(GSE50081, GSE72094, GSE127465, GSE131907, EMTAB6149)中的肿瘤样本和细胞系 基因组学、生物信息学 肺腺癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、实时定量PCR Cox回归模型、Lasso回归模型、列线图 基因表达数据、临床数据、单细胞转录组数据 TCGA-LUAD队列及多个外部数据集,涉及数百至上千例患者样本,具体数量未提及 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-09-08
CRISPRi screens in human iPSC-derived astrocytes elucidate regulators of distinct inflammatory reactive states
2022-11, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究利用CRISPR干扰筛选技术结合单细胞转录组学,系统探究人诱导多能干细胞来源的星形胶质细胞中炎症反应状态的不同调控机制。 将CRISPR干扰筛选与单细胞转录组学相结合应用于人iPSC来源的星形胶质细胞,首次系统揭示了细胞因子诱导的炎症性星形胶质细胞反应中STAT3介导的两种不同炎症反应特征。 文中未提及明显的局限性。 系统研究星形胶质细胞炎症反应状态的分子机制,以指导开发选择性调节炎症反应的疗法。 人诱导多能干细胞来源的星形胶质细胞及小鼠神经炎症模型。 基因组学, 单细胞转录组学 阿尔茨海默病, 缺氧缺血性脑病 CRISPR干扰筛选, 单细胞RNA测序 CRISPR干扰筛选模型 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量。 NA NA NA NA
18 2026-09-07
Identification of CD55 as a downstream factor of EP4 receptor signaling in colorectal cancer cells
2026-Nov-20, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过转录组分析和功能实验,识别CD55为结直肠癌细胞中EP4受体信号的下游因子,并阐明其调控机制。 首次整合转录组谱、癌症基因组数据库和毒物基因组学分析,发现CD55作为EP4受体新靶点,并揭示PGE/EP4受体/Gi蛋白/p38 MAPK信号轴调控CD55表达。 研究主要基于细胞系和数据库分析,临床样本验证有限,功能影响需进一步探索。 阐明EP4受体信号在结直肠癌中调节CD55表达的分子机制。 人结肠癌细胞系HCA-7,人结直肠癌组织的单细胞RNA-seq数据。 癌症生物学,基因组学 结直肠癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq,癌症基因组数据库分析 NA(基于细胞系和数据分析,未使用AI模型) 基因表达数据,单细胞转录组数据 HCA-7细胞系和来自公共数据库的结直肠癌组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-09-07
Integrative single‑cell and bulk transcriptomic profiling reveals MMP1 as a core effector and CTSB as a putative collaborator in ATBC‑aggravated pulmonary fibrosis
2026-Nov-20, Gene IF:2.6Q2
研究论文 通过整合单细胞与批量转录组分析,揭示MMP1与CTSB在ATBC加重肺纤维化中的核心作用 首次整合化合物靶点预测、转录组筛选、Bootstrap LASSO稳定性选择和蛋白质互作网络分析,结合单细胞转录组学,揭示MMP1在气道club细胞中的'关闭-开启'调控模式及CTSB在巨噬细胞中的促纤维化通信作用 研究主要基于动物模型和转录组分析,需进一步验证在人类中的机制,且ATBC暴露的长期效应未充分探讨 阐明乙酰柠檬酸三丁酯(ATBC)经呼吸道暴露对肺部的毒性及分子机制,评估其对肺纤维化的影响 ATBC暴露对肺纤维化的影响及相关分子机制 转录组学 肺纤维化 单细胞转录组学, 批量转录组, Bootstrap LASSO, 蛋白质互作网络分析, 动物模型 无特定模型 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 动物实验数据 动物模型(小鼠) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
20 2026-09-07
Ultraviolet B-induced oxidative stress drives stromal remodeling and malignant transformation of actinic keratosis via a podoplanin-C-type lectin-like receptor 2 signaling axis
2026-Nov, Free radical biology & medicine
研究论文 本文通过整合多组学分析揭示了紫外线B诱导的氧化应激通过PDPN-CLEC-2信号轴驱动光化性角化病的基质重塑和恶性转化 首次阐明PDPN-CLEC-2信号轴在紫外线B诱导的氧化应激与光化性角化病恶性转化中的关键作用,并鉴定出具有诊断和预后价值的12基因特征 未提及明显的限制,可能包括样本来源的局限性或功能实验的适用范围 探究紫外线B诱导的氧化应激如何通过分子机制促进光化性角化病的恶性转化 角质形成细胞、成纤维细胞、光化性角化病及皮肤鳞状细胞癌组织样本 数字病理学 皮肤癌(光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌) 批量RNA测序, 单细胞转录组学, 功能实验 NA 转录组数据, 图像 六个独立队列 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
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