单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 44722 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-26 |
Mapping intestinal microenvironment heterogeneity in Hirschsprung's disease by spatial transcriptomics: Role of THBS1 in macrophage polarization and neural stem cell regulation
2027-Feb, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2026.102254
PMID:42926789
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学绘制了先天性巨结肠症（HSCR）肠道微环境的首张综合空间转录组图谱，揭示了微环境异质性并发现THBS1在无神经节段中持续下调，进而通过细胞实验探讨其在巨噬细胞极化和神经干细胞调控中的作用 | 首次构建HSCR肠道微环境的综合空间转录组图谱，发现THBS1在无神经节段中持续下调，并揭示THBS1通过促进M2样极化及与SDC1相互作用调控巨噬细胞-神经相互作用 | 研究主要在THP-1和SH-SY5Y细胞系中进行，尚需在原代细胞中进一步验证 | 阐明HSCR肠道微环境的空间表达模式及分子机制，探索THBS1在巨噬细胞极化和神经干细胞调控中的作用 | HSCR患者肠道组织及THP-1、SH-SY5Y细胞系 | 空间转录组学 | 先天性巨结肠症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-10-26 |
Cell DiffErential Expression by Pooling (CellDEEP) highlights issues in differential gene expression in scRNA-seq
2026-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag128
PMID:42909367
|
研究论文 | 该文提出CellDEEP工具，采用细胞聚合（metacell）策略进行单细胞RNA测序数据的差异表达基因分析 | 提出基于metacell聚合的灵活框架，允许用户自定义聚合策略与参数化，在降低细胞水平噪声的同时保留生物学信号，并提供透明的验证框架 | 需要用户自行选择聚合策略和参数，缺乏自动化最优参数选择机制 | 解决scRNA-seq差异表达基因分析中单细胞方法假阳性率高、pseudobulk方法灵敏度低的问题 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟数据集以及COVID-19和类风湿关节炎真实数据集 | 机器学习 | COVID-19, 类风湿关节炎 | scRNA-seq | NA | 文本（基因表达计数矩阵） | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-10-26 |
Graph-Aware Latent Representation Learning for Multimodal Spatial Omics Integration
2026-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261480770
PMID:42657978
|
研究论文 | 提出一种名为mmspao的多模态空间组学融合方法，通过邻接图建模和潜在空间表示整合空间转录组、表观基因组和蛋白质组数据，在空间分辨率上获得融合结果 | 提出mmspao方法，利用邻接图建模和潜在空间表示实现跨模态交互特征提取，并与各模态特征结合，在共享空间域中对齐多组学模态，同时保留个体基因表达谱并生成全局整合融合图 | 摘要中未明确说明方法的局限性 | 开发多模态空间组学融合方法，以解码细胞功能和组织结构背后的层次调控机制 | 空间转录组学、表观基因组学和蛋白质组学等多模态空间组学数据 | 空间组学 | NA | 空间转录组学, 空间表观基因组学, 空间蛋白质组学 | 图感知潜在表示学习 | 多模态空间组学数据 | 模拟数据和真实多组学数据（具体样本量未提及） | NA | 空间转录组学, 空间表观基因组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-10-26 |
Transcription factors in liver fibrosis: Mechanistic insights and nanotechnology‑driven therapeutic strategies (Review)
2026-Dec, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.6020
PMID:42924606
|
综述 | 总结肝纤维化中转录因子介导的调控机制及纳米技术驱动的治疗策略 | 系统整合单细胞组学、空间转录组学和表观基因组学揭示的细胞类型特异性转录因子网络，并探讨纳米载体递送核酸、通路抑制剂和表观遗传调节剂以实现精准抗纤维化治疗 | 纳米递送系统仍面临生物相容性、靶向效率和临床转化等挑战 | 总结肝纤维化中转录因子介导的调控机制和基于纳米技术的治疗策略，并展望精准抗纤维化治疗的未来方向 | 肝纤维化及其相关肝细胞和非实质细胞（肝星状细胞、Kupffer细胞、肝窦内皮细胞和胆管上皮细胞） | 数字病理 | 肝纤维化 | 单细胞组学，空间转录组学，表观基因组学，纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞组学，空间转录组学，表观基因组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-10-26 |
PYGO2 ablation promotes lymphoid organization and STING-dependent antitumor immunity in prostate cancer
2026-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218862
PMID:42810571
|
研究论文 | 该研究揭示PYGO2缺失通过激活STING-干扰素轴促进前列腺癌三级淋巴结构形成并增强抗肿瘤免疫 | 首次发现PYGO2作为肿瘤内在调控因子，通过STING依赖机制调控前列腺癌淋巴组织形成和抗肿瘤免疫，并提出联合PYGO2靶向、雄激素剥夺、髓系抑制和免疫检查点阻断的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和RM1同系肿瘤，缺乏大规模临床样本验证；PYGO2调控STING通路的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究PYGO2是否调控前列腺癌中的淋巴组织形成和抗肿瘤免疫，以及其与STING通路的关联 | 前列腺特异性Pten/Smad4双敲除和Pten/Smad4/Pygo2三敲除小鼠、RM1同系肿瘤模型 | 肿瘤免疫学、分子生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、免疫组化染色、基因敲除小鼠模型 | 基因敲除小鼠模型、同系肿瘤移植模型 | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-10-26 |
Integrated multi-omics analyses decipher molecular subtype-associated tumor microenvironment patterns in glioma
2026-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218882
PMID:42843584
|
研究论文 | 该研究整合 bulk 和单细胞转录组、空间转录组和蛋白质组数据，刻画胶质瘤不同分子亚型（IDH-WT、IDH-MU、1p/19q 共缺失状态）的肿瘤微环境（TME）组成、亚型相关基因模式及预后相关性 | 首次系统整合 bulk 转录组、单细胞转录组、空间转录组和蛋白质组多组学数据，解析 IDH 相关胶质瘤 TME 的细胞和分子特征；从 TME 相关基因集中鉴定出四种亚型相关基因模式（WT-179、MU-68、M-N-30、M-C-83）；发现 POSTN、LTF、PLA2G2A 和 ANXA1 为与 IDH-WT TME 程序相关的候选蛋白标志物 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 阐明胶质瘤中 IDH 相关肿瘤微环境的组成、亚型相关分子模式及其预后意义，探索 TME 作为治疗靶点的潜力 | 胶质瘤组织和患者血液样本 | 数字病理学、机器学习 | 胶质瘤 | bulk 转录组测序、单细胞转录组测序、空间转录组测序、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、spatial transcriptomics、蛋白质组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-10-26 |
SPP1+ TAMs drive colorectal tumorigenesis through an ARG2-orchestrated metabolic-immune crosstalk
2026-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218890
PMID:42869126
|
研究论文 | 该研究揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-ARG2代谢-免疫串扰驱动结直肠癌进展的分子机制，并发现长双歧杆菌可下调CD44破坏该轴以抑制肿瘤 | 首次阐明SPP1+ TAMs通过SPP1-CD44-ARG2轴诱导c-Myc去泛素化稳定，进而激活HK2驱动Warburg代谢的机制，并揭示ARG2分泌回补TAMs形成正反馈环路，以及长双歧杆菌作为微生物精准辅助治疗的新策略 | 摘要未提及具体样本量及机制在人体中的验证程度，动物模型与细胞系结果向临床转化的有效性仍需进一步验证 | 阐明SPP1+ TAMs重编程结直肠癌进展的分子机制，并确定肠道微生物是否调控该过程 | 结直肠癌临床标本、小鼠模型及结直肠癌细胞系 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-10-26 |
MCM10 modulates lipid metabolic reprogramming via the USP7-FASN axis to accelerate renal cell carcinoma progression
2026-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218842
PMID:42777936
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和功能验证，揭示MCM10通过USP7-c-Myc-FASN轴调控脂质代谢重编程，促进ccRCC进展 | 首次发现MCM10是ccRCC脂质代谢的关键调节因子，并阐明MCM10通过增强USP7介导的去泛素化、抑制FBW7依赖的泛素化来稳定c-Myc，进而转录激活FASN，促进脂肪酸从头合成和脂质代谢重编程的分子机制 | 摘要未明确说明研究的局限性 | 探究ccRCC中脂质代谢重编程的上游调控因子及其分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞及肿瘤组织 | 数字病理学、单细胞组学、空间转录组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、功能验证 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-10-26 |
Single-cell transcriptomics reveals a complex cell-cell communication network driven by myofibroblast-derived collagen in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218839
PMID:42777934
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序构建了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境的高分辨率转录组图谱，鉴定出一个由肌成纤维细胞来源的胶原驱动的复杂细胞间通讯网络 | 鉴定出一个独特的胶原合成型肌成纤维细胞亚群Fibro_myo_C1，揭示其通过促进上皮间质转化、血管生成和免疫抑制驱动食管鳞癌进展，并与新辅助免疫治疗应答不良显著相关 | 样本量相对有限（8例患者、15份组织标本），缺乏体内外功能验证实验，Fibro_myo_C1促进食管鳞癌进展的具体分子机制尚未完全阐明 | 解析食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中成纤维细胞的功能多样性和细胞异质性，揭示其在肿瘤进展和免疫治疗耐药中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤组织标本及肿瘤微环境中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 8例食管鳞癌患者的15份组织标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-10-26 |
Low-frequency parasitized cells in bone marrow alter myelopoiesis following immunization with the live attenuated Leishmania major Cen -/- vaccine
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117816
PMID:42920902
|
研究论文 | 该文通过双单细胞RNA测序研究骨髓中潜伏寄生虫及免疫重塑现象，发现减毒L. major Cen-/-疫苗接种后低频寄生细胞改变骨髓髓系生成并诱导训练免疫 | 首次在减毒利什曼原虫疫苗接种模型中利用双单细胞RNA测序鉴定骨髓中的低频寄生细胞，揭示骨髓是抗利什曼原虫免疫编程的活跃位点，并提出granulin-Sort3信号通路为髓系生成增强的潜在驱动因素 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在犬或人类中验证；骨髓寄生细胞频率低，可能限制全面解析；granulin-Sort3信号的功能验证尚不充分 | 探究减毒利什曼原虫疫苗接种后骨髓中的潜伏寄生虫及免疫重塑机制，阐明骨髓在持久免疫保护中的作用 | 小鼠骨髓细胞（经皮内接种强毒L. major或减毒L. major Cen-/-疫苗后28天的小鼠） | 单细胞组学、免疫学 | 利什曼病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 小鼠骨髓细胞（接种后28天取样，具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 双单细胞RNA测序（dual single-cell RNA sequencing，具体平台未在摘要中说明） |
| 11 | 2026-10-26 |
Stable truncating mutations in plakophilin-2 induce arrhythmogenic cardiomyopathy-like phenotypes in adult zebrafish
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117755
PMID:42927219
|
研究论文 | 该研究建立了基于斑马鱼pkp2基因截短突变的致心律失常性心肌病模型，并揭示了其心脏表型及转录组改变 | 首次在成年斑马鱼中构建pkp2截短突变模型，并通过跨物种单细胞RNA-seq比较揭示pkp2及其同源基因的心脏表达模式差异 | 未在摘要中明确说明；斑马鱼模型与人类ACM在心脏结构和生理上存在物种差异，可能限制直接转化应用 | 建立pkp2突变相关致心律失常性心肌病的斑马鱼互补脊椎动物模型，研究基因-环境相互作用在疾病进展中的作用 | 斑马鱼（Danio rerio）及pkp2基因截短突变斑马鱼模型 | 心血管疾病模型、单细胞转录组学、遗传学 | 致心律失常性心肌病、心律失常、心力衰竭、心源性猝死 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA-seq、转录组分析 | CRISPR-Cas9敲除斑马鱼模型 | 单细胞转录组数据、影像/组织学数据、生理学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-10-26 |
StrokeTime: A comprehensive longitudinal scRNA-seq atlas of the ischemic mouse brain
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117938
PMID:42927268
|
研究论文 | 该研究整合了21项小鼠缺血性卒中scRNA-seq研究数据，构建了一个覆盖超急性期至慢性期的综合性小鼠脑单细胞转录组图谱，系统刻画了卒中后脑内各类细胞的动态变化 | 构建了目前覆盖卒中后多个时间阶段、大规模整合的小鼠脑单细胞图谱，包含17个主要细胞类别和120种精细转录状态，首次系统揭示了髓系细胞的可塑性、血管及壁细胞的时序转变以及淋巴细胞谱系约束内的激活特征 | 研究基于小鼠模型数据整合，跨物种外推到人类卒中仍需验证；图谱依赖于已有研究的样本覆盖度和批次效应校正方法；未涉及单核RNA-seq数据或空间信息 | 系统刻画缺血性卒中后小鼠脑细胞景观的动态变化，构建涵盖超急性期、急性期、亚急性期和慢性期的纵向单细胞转录组图谱 | 缺血性卒中后小鼠脑组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 文本 | 103个样本，414,359个细胞，来自21项小鼠卒中研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-10-26 |
Stage-associated remodeling of CD169 macrophage states is linked to immune regulation in colitis-associated colorectal cancer
2026-Nov, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02463-9
PMID:42342977
|
研究论文 | 该研究揭示了在结肠炎相关结直肠癌进展过程中，CD169相关巨噬细胞状态存在阶段相关性重塑，并具有不同的免疫调节功能 | 首次发现CD169标记了功能不同的巨噬细胞状态，CD169低表达巨噬细胞在结肠炎期占主导并促炎，而CD169中/高表达巨噬细胞在肿瘤期出现并具有免疫抑制特征，且CD169清除可抑制肿瘤生长并增强T细胞浸润 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探究结肠炎相关结直肠癌进展过程中巨噬细胞状态异质性的组织方式及其免疫调节作用 | 结肠炎相关结直肠癌小鼠模型及人类结肠炎相关结直肠癌标本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、基因敲除、药理干预 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-10-26 |
Hypoxia enhances follicle survival and ameliorates markers of metabolic function in human ovarian cortical tissue culture
2026-Nov, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2026.105918
PMID:42753296
|
研究论文 | 该研究分析了6天体外培养对人卵巢皮质组织基因表达和组织形态的影响，并测试了缺氧条件能否优化培养条件 | 首次使用单细胞转录组学系统刻画人卵巢皮质组织体外培养诱导的转录和代谢改变，并提出缺氧作为更生理性的培养条件可部分恢复代谢特征并改善卵泡存活 | 样本量较小（研究1仅3例，研究2为12例），缺氧仅部分恢复代谢标志物，培养条件仍需进一步优化以缓解代谢偏移 | 探究人卵巢皮质组织体外培养对基因表达和组织形态的影响，并优化培养条件 | 接受性别肯定手术或择期剖宫产供者的卵巢皮质组织 | 单细胞转录组学, 生殖医学 | NA | 单细胞转录组测序, 代谢标志物基因表达分析, 乳酸产量检测, 超微结构分析 | NA | 文本（基因表达数据）, 图像（组织形态与超微结构） | 研究1为3例新鲜与培养样本；研究2为12名供者的组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-10-26 |
HGF Endogenously Produced by Pancreatic Pericytes Regulates β-Cell Function
2026-Nov-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db26-0227
PMID:42616555
|
研究论文 | 该研究结合人类胰岛单细胞转录组学和小鼠胰腺细胞图谱，发现周细胞而非内皮细胞是健康胰岛中HGF的主要来源，并证明周细胞来源的HGF对β细胞功能和葡萄糖稳态至关重要 | 首次确定周细胞是胰岛中HGF的主要内源性来源，而非内皮细胞，并揭示了周细胞来源HGF在调节胰岛素产生和分泌以及支持β细胞扩增中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统，人类胰岛单细胞转录组学仅用于鉴定HGF来源，缺乏对人类胰岛中周细胞-HGF功能的直接验证 | 探究胰岛中HGF的内源性来源及其在β细胞功能和葡萄糖稳态中的生理作用 | 人类胰岛细胞、小鼠胰腺细胞、转基因小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-10-26 |
Multi-Omics Insights Into Circulating T-Cell Metabolic Reprogramming and Treg Dysfunction in Moyamoya Disease
2026-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.71088
PMID:42921569
|
研究论文 | 该研究整合质谱流式、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、代谢组学和流式细胞术等多组学方法，揭示烟雾病中T细胞代谢重编程与Treg功能障碍之间的代谢-免疫轴 | 首次在烟雾病中整合质谱流式、单细胞转录组、bulk转录组、代谢组和流式细胞术等多组学手段，系统揭示Treg代谢 inflexibility 及其向Th17转化，并提出恢复Treg代谢适应性作为治疗策略 | 摘要未明确说明样本量、对照组匹配细节及机制验证实验（如功能 rescue 实验）的深度 | 阐明烟雾病中T细胞代谢重编程和调节性T细胞（Treg）功能障碍的机制及其与临床特征的关系 | 烟雾病患者与健康对照的外周血T细胞（尤其是Treg和CD4FOXP3细胞） | 多组学、免疫学 | 烟雾病（脑血管病） | 质谱流式、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、代谢组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、代谢组学、质谱流式、流式细胞术 | NA | NA |
| 17 | 2026-10-26 |
Metabolic-epigenetic coupling links glycolysis to macrophage-mediated myelin clearance after peripheral nerve injury
2026-Oct-24, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRRONLINE-D-26-00965
PMID:42925517
|
研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序与功能实验，揭示周围神经损伤后巨噬细胞通过糖酵解-组蛋白乳酸化耦合调控髓鞘清除的机制 | 首次揭示SLC2A6介导的糖酵解通过组蛋白乳酸化调控巨噬细胞髓鞘清除能力，并提出乳酸补充可作为促进神经再生的代谢干预策略 | 未明确说明样本量及具体动物模型细节，代谢干预的长期安全性和临床转化潜力有待验证 | 探究周围神经损伤后巨噬细胞代谢重编程与髓鞘清除功能之间的关系及其表观遗传机制 | 周围神经损伤后的巨噬细胞 | 单细胞组学、免疫代谢 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（基因表达数据）、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-10-26 |
TACE and yttrium 90 based combination therapies are associated with distinct post-treatment tumor microenvironment profiles in unresectable hepatocellular carcinoma
2026-Oct-24, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117554
PMID:42925656
|
研究论文 | 本文直接比较了TACE联合系统治疗与Y-90联合系统治疗在不可切除肝细胞癌中的临床疗效及治疗后肿瘤微环境差异 | 首次直接比较TACE和Y-90联合系统治疗在不可切除HCC中的临床疗效，并结合单细胞RNA测序和多路免疫荧光揭示两种治疗方式后不同的肿瘤微环境特征 | Y-90联合治疗组样本量较小（n=51），研究为回顾性设计，结论需前瞻性大样本研究进一步验证 | 比较TACE联合系统治疗与Y-90联合系统治疗在不可切除肝细胞癌中的临床疗效及治疗后肿瘤微环境差异 | 不可切除肝细胞癌患者 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、多路免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 210例不可切除HCC患者（TACE+系统治疗组159例，Y-90+系统治疗组51例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-10-26 |
3D tissue model to patient atlas: dynamic network topology reveals PDAC chemoresistance bottlenecks
2026-Oct-23, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00830-z
PMID:42919864
|
研究论文 | 该研究通过3D PDAC组织模型结合单细胞RNA测序和动态网络拓扑分析，揭示PDAC在吉西他滨和TGF-β1处理下的化疗耐药瓶颈机制 | 首次将3D组织模型的动态假时间轨迹与蛋白质-蛋白质相互作用网络的介数中心性连续追踪相结合，识别出CDK1介数中心性在GEM与TGF-β1收敛处选择性激增的S期持续状态，并在大规模患者图谱中验证了三阳性细胞的转移富集 | 研究基于PANC-1细胞系的3D模型，可能无法完全反映患者肿瘤异质性；单细胞RNA测序仅覆盖四种处理条件，未涵盖其他化疗药物或微环境因素 | 解析PDAC化疗耐药过程中细胞状态转换的调控网络架构动态，识别耐药瓶颈节点 | PANC-1胰腺导管腺癌细胞系构建的3D组织模型及231例PDAC患者的726,107个单细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | 3D组织模型四种处理条件（对照、GEM、TGF-β1、联合）的单细胞RNA测序样本，以及231例患者的726,107个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-10-26 |
4D-atlas: a multi-species four-dimensional spatiotemporal transcriptomics database spanning development, regeneration, and disease
2026-Oct-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1039
PMID:42922375
|
研究论文 | 本文开发了首个多物种四维时空转录组数据库4D-atlas，整合了跨发育、再生和疾病过程的时空转录组数据 | 首个公开可访问的多物种四维时空转录组图谱数据库，整合三维空间架构和时间维度，提供七个交互式分析模块 | 摘要中未明确说明数据集的局限性 | 构建多物种四维时空转录组数据库，以系统研究组织形态发生和时空动态调控程序 | 六个物种的胚胎发育、组织再生和疾病进展过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 15个代表性数据集，1629个空间切片，88个时间点，超过2220万个细胞或空间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |