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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-08-07
Proinflammatory immune cells disrupt angiogenesis and promote germinal matrix hemorrhage in prenatal human brain
2024-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究揭示了产前人类大脑中促炎免疫细胞破坏血管生成并促进生发基质出血的机制 首次揭示了小胶质细胞与新生血管的年龄依赖性相互作用,并确定了促炎性中性粒细胞和单核细胞亚群在生发基质出血中的作用 研究主要基于小鼠模型和人类样本的关联分析,因果验证主要在小鼠中进行,人类样本的机制验证有限 阐明生发基质出血的血管脆弱性机制,特别是免疫细胞在血管生成和出血中的作用 产前小鼠和人类大脑中的免疫细胞(小胶质细胞、CD45细胞)及血管系统 神经科学 生发基质出血 单细胞转录组学、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 对照早产儿和生发基质出血早产儿的CD45细胞样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
2 2026-08-07
Arabidopsis uses a molecular grounding mechanism and a biophysical circuit breaker to limit floral abscission signaling
2024-10-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,解析了拟南芥花器官脱落过程中HAE/HSL2信号通路的分子调控机制,并揭示了MKP1基因和IDL家族基因在其中的作用。 首次通过单细胞测序技术全面表征植物脱落信号通路的核心基因表达程序,并发现MKP1作为负调控因子在信号激活前建立阈值,以及IDL家族基因在远端脱落区细胞的表达形成的生物物理断路器机制。 本研究的发现可能仅限于拟南芥模型,其在不同植物物种中的普适性尚未验证。 旨在阐明拟南芥花器官脱落信号通路的调控机制,特别是识别新的调控因子并理解其作用机制。 拟南芥花器官脱落区细胞,包括近端和远端脱落区细胞亚群。 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包含脱落区细胞的拟南芥花组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
3 2026-08-07
Deciphering STAT3's negative regulation of LHPP in ESCC progression through single-cell transcriptomics analysis
2024-10-28, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 通过单细胞转录组分析,揭示STAT3负调控LHPP在食管鳞状细胞癌进展中的作用机制 首次通过单细胞转录组分析揭示STAT3直接抑制LHPP启动子,形成调控轴影响食管鳞状细胞癌进展 研究样本量有限,需要更大规模验证;未深入探讨STAT3-LHPP轴在其他癌症中的普适性 阐明食管鳞状细胞癌中细胞动态及分子机制,聚焦STAT3对LHPP的转录影响,寻找潜在治疗靶点 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤及癌旁组织细胞、ESCC细胞系 单细胞转录组学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、qPCR、实验测定 NA 单细胞转录组数据、临床样本基因表达数据 44,206个细胞来自ESCC患者肿瘤及癌旁组织,21例ESCC患者用于qPCR验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-08-07
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-10-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
综述 本文探讨表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的作用机制,涵盖DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA,并总结相关研究方法。 从表观遗传干预角度系统分析肥胖机制,整合多组学技术如单细胞测序和染色质免疫沉淀,提出针对表观遗传靶点的治疗干预策略。 未提供具体实验数据或临床验证,主要基于现有文献综述,缺乏实证支持。 阐明表观遗传修饰在肥胖发展中的关键作用,并探索表观遗传干预作为治疗靶点的潜力。 肥胖相关的表观遗传修饰、细胞编程和重编程过程,以及脂肪生成和代谢途径。 表观遗传学 肥胖 DNA甲基化分析、组蛋白修饰分析、非编码RNA分析、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合。 NA 基因组数据、单细胞转录组数据、表观遗传修饰数据。 NA NA 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀 NA NA
5 2026-08-07
Functional plasticity shapes neutrophil response to Leishmania major infection in susceptible and resistant strains of mice
2024-10, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究揭示了中性粒细胞在利什曼原虫感染中的功能可塑性,易感小鼠产生更多NETs,而抗性小鼠更倾向于吞噬作用 首次通过单细胞RNA测序和体内成像,发现NET形成与吞噬作用之间的平衡决定了宿主对利什曼原虫感染的易感性 未详细说明NET消化对寄生虫传播的长期影响及其在人类感染中的相关性 探究中性粒细胞效应功能(NET形成与吞噬作用)在利什曼原虫感染易感性和抗性小鼠中的差异及其机制 BALB/c(易感)和C57BL/6(抗性)小鼠的中性粒细胞,以及利什曼原虫感染模型 免疫学、单细胞转录组学 利什曼病 微阵列分析、单细胞RNA测序、体内成像 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、体内成像数据 两种小鼠品系(BALB/c和C57BL/6)的中性粒细胞,具体数量未在标题和摘要中提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'(推测,基于摘要中的scRNA-seq)
6 2026-08-07
Gene signatures for cancer research: A 25-year retrospective and future avenues
2024-10, PLoS computational biology IF:3.8Q1
观点文章 本文回顾了过去25年癌症研究中基因标签的发展,并探讨了提高其可靠性所面临的挑战和未来方向。 提出了通过多组学整合、机器学习和单细胞RNA-seq等技术提高基因标签可重复性的新见解。 作为观点文章,缺乏实证数据支持,主要基于作者的主观分析和文献回顾。 探讨基因标签在癌症研究中的挑战和改进策略,以提高其在精准医学中的应用可靠性。 癌症转录组研究中的基因标签及其跨队列一致性。 生物信息学 癌症 单细胞RNA-seq 机器学习 转录组数据 不适用 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
7 2026-08-07
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones
2024-10, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过成像和细胞条形码技术追踪食管上皮细胞的克隆生长,发现约10%的克隆呈指数增长,其余呈逻辑增长,并揭示非遗传因素导致的增殖差异与细胞状态相关 首次结合克隆追踪、数学建模和单细胞RNA测序,揭示食管上皮细胞克隆增殖差异的非遗传机制,并鉴定出与高增殖相关的WNT和PI3K通路基因 研究基于体外模型,可能无法完全反映体内复杂环境;克隆追踪仅覆盖四个倍增周期,长期行为未知 探究食管上皮细胞克隆增殖差异的动态和细胞状态基础 食管上皮细胞(EPC2-hTERT)克隆 数字病理学, 单细胞组学 食管疾病 细胞条形码, 单细胞RNA测序 数学模型(指数和逻辑增长模型) 图像, 测序数据 未明确,涉及体外培养的食管上皮细胞克隆和健康人食管上皮样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-08-07
Mcadet: A feature selection method for fine-resolution single-cell RNA-seq data based on multiple correspondence analysis and community detection
2024-10, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出Mcadet,一种基于多重对应分析和社区检测的特征选择方法,用于细分辨率单细胞RNA-seq数据。 创新地整合了多重对应分析、基于图的社区检测和一种新颖的统计检验方法,以解决现有高变基因选择方法在细分辨率数据集和少数细胞类型上准确性和可靠性不足的问题。 高变基因选择对不同下游分析的影响各异,需进一步研究。 开发一种特征选择框架,以提高细分辨率单细胞RNA-seq数据和少数细胞类型中高变基因选择的准确性和可靠性。 细分辨率单细胞RNA-seq数据集和包含少数细胞群的数据集。 机器学习 NA 单细胞RNA测序 多重对应分析、图社区检测、统计检验 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-08-07
scCaT: An explainable capsulating architecture for sepsis diagnosis transferring from single-cell RNA sequencing
2024-10, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种名为scCaT的可解释深度学习框架,结合胶囊架构与Transformer,利用单细胞RNA测序数据构建败血症诊断模型,并迁移至批量RNA数据。 将胶囊架构与Transformer融合,利用胶囊按生物学功能分组基因,提供基因表达编码的可解释性,并实现从单细胞到批量RNA数据的模型迁移。 未提及,但可能受限于单细胞数据质量及模型对批量数据的泛化性。 开发败血症诊断模型,提高诊断准确率并增强可解释性。 败血症患者和健康对照样本的基因表达数据(包括单细胞和批量RNA)。 机器学习 败血症 单细胞RNA测序和批量RNA测序 胶囊网络、Transformer 基因表达数据 单细胞测试集和七个批量RNA队列,具体样本数未提供 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
10 2026-08-07
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过生物信息学分析和实验验证,发现TRPC3通道在阿尔茨海默病中异常上调,并开发了抑制剂JW-65,可改善突触功能障碍和记忆缺陷。 首次揭示TRPC3在AD病理中对钙稳态失调的独特作用,并开发了靶向TRPC3的有效抑制剂JW-65,为AD治疗提供新靶点。 未提及明确的局限性。 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力。 AD患者脑组织、5xFAD小鼠模型、大鼠海马神经元。 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、RNA测序、药物筛选、电生理记录 NA 基因表达数据、电生理数据、行为数据 未明确样本数量;涉及AD患者队列、5xFAD小鼠、大鼠海马神经元培养。 10x Genomics 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq 10x Chromium 用于分析AD患者队列的单细胞RNA-seq数据;海马RNA-seq用于5xFAD小鼠。
11 2026-08-07
Early-stage lung cancer is driven by a transitional cell state dependent on a KRAS-ITGA3-SRC axis
2024-Jul, The EMBO journal
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期肺癌由依赖KRAS-ITGA3-SRC轴的过渡细胞状态驱动 首次在单细胞水平上解析了KRAS突变对肺泡二型祖细胞转录动态的影响,并识别出损伤/可塑性状态作为早期肺腺癌的驱动状态 研究主要基于体外类器官和小鼠模型,需要进一步在更大队列中验证 探究KRAS突变如何与肺稳态和细胞命运通路相互作用,驱动早期肺腺癌的发生 肺泡二型祖细胞及其间质类器官共培养体系、小鼠模型和IA期肺腺癌患者样本 单细胞转录组学 肺腺癌 单细胞RNA测序 类器官模型 单细胞基因表达数据 包含类器官、小鼠和患者样本(具体数量未提供) 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
12 2026-08-07
Tubular insulin-induced gene 1 deficiency promotes NAD+ consumption and exacerbates kidney fibrosis
2024-07, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现近端肾小管细胞中胰岛素诱导基因1(Insig1)缺陷会促进NAD+消耗并加剧肾纤维化,而Insig1过表达可抑制纤维化,并鉴定出尼卡地平作为潜在治疗药物 首次揭示肾小管而非成纤维细胞中Insig1缺陷在肾纤维化中的致病作用,并阐明其通过SREBP1-Aldh1a1轴调控NAD代谢和ER稳态的机制,同时提出尼卡地平作为选择性Aldh1a1抑制剂的新治疗策略 未提及明确的局限性,但可能包括体内外模型与人体病理差异、药物临床转化需进一步验证等 阐明Insig1在肾纤维化中的作用及其机制,探索潜在治疗靶点 近端肾小管细胞(PTCs)、肾纤维化模型(体内外) 数字病理学 肾脏纤维化、慢性肾脏病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、细胞图像 未提供具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
13 2026-08-07
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过靶向CMKLR1成像技术评估肺部炎症-纤维化轴,为非侵入性肺纤维化疾病的临床管理提供新的生物标志物 首次验证CMKLR1作为肺炎症-纤维化轴的影像生物标志物,能实现早期预测和空间映射炎症区域,并识别出炎症性内型的IPF患者不良预后 研究主要在动物模型和有限的患者样本中进行,尚需大规模临床验证 评估CMKLR1作为肺纤维化疾病炎症-纤维化轴的影像生物标志物的准确性,以改善风险分层和治疗监控 IPF患者样本和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 医学影像 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描(PET) NA 基因组数据, 影像数据, 临床数据 NA NA 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描(PET) NA NA
14 2026-08-07
Inhibition of the eukaryotic initiation factor-2α kinase PERK decreases risk of autoimmune diabetes in mice
2024-06-18, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文研究了抑制eIF2α激酶PERK对自身免疫性糖尿病小鼠模型的保护作用及其机制。 首次证明PERK抑制能通过增加PD-L1稳定性来降低β细胞免疫原性,从而延缓T1D发病,为T1D预防提供新策略。 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需人体临床试验验证其安全性和有效性。 探究PERK抑制在预防或延缓自身免疫性1型糖尿病中的潜在作用及机制。 自身免疫性糖尿病易感小鼠、人类胰岛、EndoC-βH1人β细胞 数字病理学 1型糖尿病 单细胞RNA测序,空间蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 未明确 10x Genomics, NA 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 10x Chromium, NA 10x Chromium单细胞RNA测序,空间蛋白质组学分析
15 2026-08-07
Spatially distinct epithelial and mesenchymal cell subsets along progressive lineage restriction in the branching embryonic mammary gland
2024-Jun, The EMBO journal
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,从胚胎第13.5天至出生,构建了小鼠乳腺上皮和间充质的图谱,追踪了多能干细胞向基底和腔上皮命运的分化轨迹,揭示了谱系定型的时间点和空间分布,并发现真皮间充质产生的FGF10对乳腺分支形态发生至关重要。 首次在分支形态发生前识别出小鼠乳腺多能干细胞谱系定型的关键时间点(E15.5),并确定了早期分子标记及其空间分布;同时发现胚胎乳腺间充质包含两个空间限制的细胞群体,并鉴定出FGF10作为关键信号分子。 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类;未提供功能性实验验证所有标记物和信号通路;单细胞测序可能受限于组织解离和样本异质性。 阐明乳腺发育中多能干细胞向基底和腔上皮命运分化的时空信号,并揭示间充质细胞在分支形态发生中的信号作用。 小鼠胚胎乳腺组织(从E13.5到出生)的上皮和间充质细胞。 发育生物学,单细胞转录组学 不适用(基础发育研究) 单细胞RNA测序 分化轨迹重建(如Monocle或类似工具) 单细胞转录组数据 从E13.5到出生多个时间点的小鼠胚胎乳腺样本(具体数量未提供)。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'试剂盒(推测,因未明确说明具体版本)
16 2026-08-07
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-May, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究探讨了SorLA在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能中的作用,发现其限制TNFα释放以塑造支持胶质瘤的脑微环境 首次揭示了SorLA通过限制小胶质细胞中TNFα的分泌来调节其炎症潜力,从而影响胶质瘤微环境的支持性表型 研究主要基于体外模型和小鼠模型,尚未在人体内进行验证,且未深入探讨SorLA调控TNFα分泌的具体分子机制 阐明SorLA对胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能的影响及其在胶质瘤进展中的作用 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞(GAMs) 神经科学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 重新分析了GBM患者的公开scRNA-seq数据,并使用了体外模型和小鼠胶质瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-08-07
Pericyte signaling via soluble guanylate cyclase shapes the vascular niche and microenvironment of tumors
2024-Apr, The EMBO journal
研究论文 本研究通过周细胞特异性敲除可溶性鸟苷酸环化酶,结合单细胞RNA测序,探讨周细胞如何影响肿瘤血管微环境及肿瘤微环境,发现其抑制肿瘤生长并增强抗血管生成疗法的效果 首次通过周细胞特异性敲除NO受体sGC,揭示周细胞在肿瘤血管微环境中的信号作用,并证明抑制周细胞sGC可提高肿瘤血管对常规抗血管生成治疗的敏感性 摘要未提及研究局限性,可能包括模型特异性及临床转化需进一步验证 阐明周细胞通过sGC信号调控肿瘤血管微环境及肿瘤微环境的作用,并评估靶向周细胞sGC作为抗血管生成治疗策略的潜力 周细胞、内皮细胞、肿瘤相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 单细胞测序 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-08-07
Identification of biomarkers related to angiogenesis in myocardial ischemia-reperfusion injury and prediction of potential drugs
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用GEO数据库的测序数据,通过WGCNA、Mfuzz聚类和蛋白质相互作用网络等方法,识别了与心肌缺血再灌注损伤中血管生成相关的关键基因(Stat3、Rela、Ubb),并预测了潜在的治疗药物 首次从血管生成角度,结合多种生物信息学分析和单细胞测序,系统识别了MIRI相关的核心基因,并通过分子对接验证了潜在药物的结合活性 研究主要基于公开数据库的二次分析,缺乏实验验证,且预测的药物需进一步临床前和临床研究证实 识别心肌缺血再灌注损伤中与血管生成相关的生物标志物,并预测潜在的治疗药物,为早期诊断和治疗提供依据 心肌缺血再灌注损伤相关的基因表达数据及单细胞数据 生物信息学 心肌缺血再灌注损伤 转录组测序、单细胞测序 WGCNA、Mfuzz聚类、蛋白质相互作用网络 基因表达数据、单细胞测序数据 未在标题和摘要中明确说明 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-08-07
SinglePointRNA, an user-friendly application implementing single cell RNA-seq analysis software
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 开发了一个基于Shiny的R应用SinglePointRNA,为单细胞RNA-seq数据分析提供图形界面,旨在帮助湿实验室研究人员自主进行详细和定制的数据分析。 提供了一个用户友好的图形界面,整合了多种公开可用的单细胞RNA-seq分析工具,并配有丰富的用户指南,以降低计算技能门槛。 摘要中未提及具体局限性。 缩小湿实验室与干实验室能力之间的差距,使研究人员无需深厚的编程知识即可进行单细胞RNA-seq数据分析。 单细胞RNA-seq数据。 生物信息学 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 不适用 单细胞转录组数据 不适用 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
20 2026-08-07
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究利用果蝇模型揭示脑肿瘤起始细胞在转变为肿瘤生长过程中通过HEATR1-MYC相互作用增强核糖体生物发生,并发现该机制在胶质母细胞瘤中具有临床相关性 首次提出脑肿瘤起始细胞在肿瘤生长之前即增强核糖体生物发生,并发现HEATR1与MYC的相互作用是此过程的关键调控机制 研究主要基于果蝇模型,其与人类肿瘤起始细胞的相关性需要进一步验证;未深入探讨HEATR1-MYC相互作用的分子细节 阐明脑肿瘤起始细胞向肿瘤生长转变过程中的早期事件及其调控机制 脑肿瘤起始细胞(基于果蝇brat神经干细胞模型)及患者来源的胶质母细胞瘤干细胞 单细胞转录组学 脑肿瘤(胶质母细胞瘤) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 果蝇模型及患者来源的胶质母细胞瘤干细胞(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
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