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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-08-30
Identification of marginal zone B cells in head and neck cancer with immunomodulatory characteristics
2026-Sep, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序,在头颈癌中鉴定出具有免疫调节特性的边缘区B细胞亚群,并探讨其在肿瘤发生和预后中的作用 首次在头颈癌中鉴定出肿瘤相关的边缘区B细胞,并发现其具有免疫调节功能,尤其是MZB-2亚群与CD4+ T细胞和抗原呈递细胞的相互作用,以及MZB-Tfh-GCB轴的存在 研究主要基于转录组分析,未进行功能实验验证;临床相关性仅限于早期头颈癌,晚期疾病中未见关联 验证头颈癌中边缘区B细胞的存在,并探究其在肿瘤发生和预后中的潜在作用 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和血液样本,以及健康供体的样本 数字病理学 头颈癌 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 118名头颈癌患者和6名健康供体 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
2 2026-08-30
BMP4 cocktail promotes utricular progenitor reprogramming and vestibular functional recovery in adult mice
2026-Sep, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 研究BMP4在成年小鼠耳石器毛细胞重编程和前庭功能恢复中的作用 发现BMP4通过c-Fos激活增强ENHC重编程,并协同Notch抑制和Wnt激活放大再生效果,小分子组合在成年小鼠中恢复前庭功能 未提及 探究BMP4在产后小鼠耳毒性损伤后耳石器毛细胞重编程中的作用 野生型和转基因小鼠(C57BL/6J背景),包括Notch1flox/flox, Pou4f3+/DTR, ROSA26tdTomato, Atoh1-eGFP; Sox9-CreERT2, 和Fos-CreERT2 数字病理学 前庭功能障碍 单细胞RNA测序,批量RNA测序,CUT&Tag测序 NA 基因表达数据,表观遗传数据,图像(免疫荧光染色) P30小鼠用于前庭功能评估,P2小鼠组织用于细胞实验 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序,CUT&Tag测序 NA NA
3 2026-08-30
Pericyte-myofibroblast transition: a novel mechanism in peritoneal fibrosis and the effect of Asiaticoside
2026-Sep, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现周细胞-肌成纤维细胞转化是腹膜纤维化的关键机制,并验证了积雪草苷通过抑制PDGFRβ信号传导发挥抗纤维化作用。 首次揭示周细胞-肌成纤维细胞转化作为腹膜纤维化的新机制,并发现积雪草苷能有效抑制PDGFRβ驱动的纤维化过程。 未提及具体局限性。 明确周细胞-肌成纤维细胞转化在腹膜纤维化中的关键作用,并评估积雪草苷的治疗潜力。 氯己定葡萄糖酸盐诱导的腹膜纤维化小鼠模型及小鼠腹膜微血管周细胞。 数字病理学 腹膜纤维化 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据 小鼠模型及细胞实验,具体样本数未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-08-30
Parabacteroides goldsteinii mitigates parkinsonism in LRRK2 mutant mice by reducing neuroinflammation through Gut-Brain axis
2026-Sep, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 该研究探讨了戈氏副拟杆菌定植在LRRK2突变小鼠中通过肠脑轴减轻神经炎症,从而缓解帕金森病样症状的作用 首次在疾病症状出现前进行戈氏副拟杆菌定植以评估其对帕金森病进展的影响,并揭示了非经典IL-12受体依赖性神经营养支持的新机制 研究主要在动物模型中进行,尚需临床验证,且机制研究可能未涵盖所有涉及的分子通路 探究早期肠道微生物调节是否能够减缓帕金森病的进展 携带LRRK2 G2019S突变的无菌帕金森病小鼠模型 神经科学、微生物组研究 帕金森病 空间和批量RNA转录组分析、单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、细胞生物能量分析、细胞因子谱分析 LRRK2 G2019S突变小鼠模型(无菌和定植模型) 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞术数据、细胞能量代谢数据、细胞因子数据 未明确,涉及无菌小鼠和定植小鼠组 未明确 空间转录组学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 未明确 未明确
5 2026-08-30
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2026-May, The European respiratory journal
研究论文 探索成纤维细胞活化蛋白作为慢性肺同种异体移植功能障碍的早期生物标志物 首次在慢性肺同种异体移植功能障碍中评估FAP表达,并利用单细胞RNA测序和免疫组化相结合的方法,确定了FAP阳性面积的最佳阈值用于早期风险分层 FAP的鉴别能力中等,需要在多中心队列中进行前瞻性验证 评估FAP表达在慢性肺同种异体移植功能障碍中是否升高,并探究其作为早期诊断标志物的潜力 两个小鼠原位肺移植模型和人类肺组织样本(五个对照和五个慢性肺同种异体移植功能障碍患者)及240名肺移植受者的经支气管活检 数字病理学 慢性肺同种异体移植功能障碍 单细胞RNA测序、免疫组化 Cox比例风险模型、Kaplan-Meier分析 基因表达数据、组织图像 小鼠模型两个,人类肺组织十个样本,240名肺移植受者(62例有慢性肺同种异体移植功能障碍,178例无) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-08-30
Integrated Multiomics Analysis Identifies CDO1 as a Novel Therapeutic Target for Osteoarthritis
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究通过整合多组学分析鉴定出CDO1作为骨关节炎的新型治疗靶点,并通过体内实验验证了其抑制作用。 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和WGCNA分析,结合孟德尔随机化分析,鉴定出CDO1为骨关节炎的因果风险基因和治疗靶点。 研究主要基于公开数据集和动物模型,缺乏大规模临床验证;CDO1的具体作用机制尚未完全阐明。 通过多组学整合分析识别骨关节炎进展中的关键基因和潜在治疗靶点。 骨关节炎患者和对照样本,以及大鼠骨关节炎模型。 基因组学、转录组学 骨关节炎 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化分析、siRNA敲低 WGCNA、孟德尔随机化 基因表达数据 7个公共骨关节炎数据集,以及大鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
7 2026-08-30
Single-Cell Profiling Identifies JUNB/SPI1-Driven Inflammatory Programs and Novel Communication Axes in Myeloid Cells of Sepsis
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者与健康对照的全血样本,鉴定出髓系细胞中的炎症程序和新的细胞通讯轴 首次在脓毒症髓系细胞中识别出JUNB/SPI1驱动的炎症程序,并发现MPZL1-MPZL1和FASL-FAS等新的细胞通讯轴作为潜在治疗靶点 样本量较小(4例脓毒症患者和5例健康对照),且数据来源于公共数据库,缺乏实验验证 表征脓毒症中的浸润细胞,为治疗提供新见解 脓毒症患者和健康对照的全血单细胞 单细胞转录组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4例脓毒症患者和5例健康对照的全血样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-08-30
A deep learning-based multiscale integration of spatial omics with tumor morphology
2025-11-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种基于深度学习的多尺度整合方法MISO,将空间转录组学与肿瘤形态学相结合,用于预测基因表达 MISO方法实现了近单细胞分辨率的空间基因表达预测,并在多个数据集上显著优于现有方法 未知 开发一种深度学习方法来整合空间转录组学与肿瘤形态学,以预测基因表达 空间转录组数据与H&E染色组织切片 深度学习 癌症 空间转录组学 深度学习模型 图像和空间转录组数据 72个10X Genomics Visium样本和348个来自MOSAIC联盟的样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Genomics Visium平台
9 2026-08-30
Extracellular matrix anchored neutrophils drive pulmonary fibrosis in mice
2025-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞外基质蛋白质组学,在矽肺小鼠模型中鉴定出一类反向跨内皮迁移的中性粒细胞亚群,其通过ICAM1介导的与细胞外基质的相互作用被保留在纤维化区域,并促进肺纤维化进展 首次鉴定出肺纤维化中发生反向跨内皮迁移的中性粒细胞亚群,并揭示其通过ICAM1与细胞外基质互作而被滞留,以及巨噬细胞来源的CTSC切割ICAM1为可溶形式进而激活成纤维细胞的机制 所有动物实验均使用雄性小鼠,可能无法完全代表雌性个体的疾病机制;研究仅在矽肺小鼠模型中进行,需进一步验证在其他肺纤维化病因中的适用性 探究中性粒细胞在肺纤维化中的作用机制,特别是反向跨内皮迁移中性粒细胞与细胞外基质的相互作用及其对纤维化的贡献 矽肺小鼠模型中的中性粒细胞、巨噬细胞、细胞外基质及成纤维细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、空间转录组学、细胞外基质蛋白质组学 不适用 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 未明确提及具体数量,涉及矽肺小鼠模型的肺组织样本 不适用 单细胞RNA测序、空间转录组学 不适用 不适用
10 2026-08-30
Uncovering the immune mechanisms underlying the emergence of immunotherapy-induced pneumonitis in lung cancer patients
2025-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞分析揭示肺癌患者免疫检查点抑制剂相关肺炎的免疫机制 首次结合scRNA-seq和scTCR/BCR-seq全面分析CIP组织及配对的非癌旁组织,揭示CD8⁺组织驻留记忆T细胞扩增、IFNG表达升高及TCR克隆共享增加等新型免疫病理机制 摘要中未提及研究局限性 阐明免疫检查点抑制剂相关肺炎的精确免疫发病机制,为干预提供策略 肺癌患者的CIP组织和匹配的非癌旁组织 单细胞分析 肺癌、免疫检查点抑制剂相关肺炎 scRNA-seq, scTCR/BCR-seq NA 单细胞转录组和免疫受体序列数据 未在摘要中明确样本数量 NA single-cell RNA-seq, single-cell TCR/BCR-seq NA NA
11 2026-08-30
Evidence from spatial transcriptomics for the mosaic hypothesis and pure cell types in the cortex
2025-Oct-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学数据,通过统计点过程分析框架,为大脑皮层中神经元的镶嵌假说和细胞类型纯度提供了证据 开发了一种统计点过程分析框架,用于空间转录组数据,首次在皮层中跨多种兴奋性和抑制性神经元类型展示空间回避现象,并提出一种评估细胞类型纯度的金标准指标 摘要中未提及具体局限性 验证皮层中神经元的镶嵌假说,并评估细胞类型的纯度 大脑皮层中的兴奋性和抑制性神经元类型 空间转录组学 NA 空间转录组学 统计点过程模型 空间转录组数据 未提及具体样本量 NA 空间转录组学 NA NA
12 2026-08-30
Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases
2025-Oct-01, Annals of surgery IF:7.5Q1
研究论文 本文介绍了一种结合体外和体内模型研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛活力和免疫调节作用的方法学框架,以期为免疫和外科疾病的精准医学提供新策略 提出将免疫调节和细胞再生策略相结合用于治疗免疫和外科疾病,并聚焦lacritin肽的多重功能,利用单细胞RNA测序和质谱流式等先进技术进行临床前评估 本文为方法学框架介绍,尚未提供完整的实验结果和临床验证数据 评估lacritin肽在免疫调节和细胞再生方面的治疗潜力,推动精准医学在免疫和外科疾病中的应用 lacritin肽对胰腺β细胞、胰岛以及免疫细胞的作用 精准医学 自身免疫性疾病、外科疾病(如1型糖尿病、克罗恩病、心力衰竭等) 单细胞RNA测序, 质谱流式, 成像质谱流式, 体外胰岛测试, 体内移植模型 NA 基因表达数据, 细胞图像 NA NA 单细胞RNA测序, 质谱流式 NA NA
13 2026-08-30
Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation
2025-Oct, Autophagy IF:14.6Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序与metaTF分析,解析小鼠造血干细胞发育六个连续阶段的转录调控,发现自噬相关转录因子在不同阶段特异性调控干细胞形成 首次结合单细胞RNA测序与metaTF分析,从转录因子活性而非仅表达量角度刻画自噬在造血干细胞发育中的动态调控,并构建阶段特异性自噬相关转录因子-靶基因网络 研究仅基于小鼠模型,且未深入验证转录因子与靶基因间的直接调控关系 阐明自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的阶段特异性调控机制 小鼠造血干细胞发育的六个连续阶段,包括胚胎期AGM区、胎肝及成年骨髓 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序 metaTF 单细胞基因表达数据 小鼠造血干细胞发育六个阶段(E10.5 AGM、E12.5/E14.5胎肝、成年骨髓) 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
14 2026-08-30
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-10, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过综合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾脏病进展中的作用,并鉴定了潜在的新型诊断生物标志物和治疗靶点。 首次整合GEO数据集分析、PPI网络、ceRNA网络预测、单细胞测序和体外实验,系统验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾脏病中的调控机制,并发现血清CCL2、miR-124-3p和NEAT1可作为疾病分期的诊断标志物。 生物信息学和临床队列的样本量适中,可能限制结果的普遍性。 识别慢性肾脏病的新型诊断生物标志物和治疗靶点,并探索其潜在调控机制。 慢性肾脏病患者及健康对照血清样本、TCMK1细胞(TGF-β1处理的EMT模型)、GEO数据集GSE137570。 生物信息学 慢性肾脏病 (未明确,但涉及)基因表达谱分析、单细胞测序、双荧光素酶报告基因实验、体外细胞实验 NA 基因表达数据、单细胞测序数据、临床样本数据、体外实验数据 64例慢性肾脏病患者,20例健康对照;GEO数据集GSE137570;TCMK1细胞 NA 单细胞测序、基因表达芯片(推测GEO数据集可能使用) NA NA
15 2026-08-30
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-10-01, Inflammatory bowel diseases IF:4.5Q1
研究论文 本研究描述了一名17岁男性患者因RELA单倍剂量不足而表现为非典型克罗恩病表型的临床、基因组和免疫学特征 首次将RELA单倍剂量不足与克罗恩病样表型、Th1/Th17极化和干扰素驱动的炎症联系起来,并利用多种组学技术(如CyTOF和单细胞RNA测序)进行深入免疫分析 未提及 表征由RELA单倍剂量不足驱动的非典型克罗恩样表型患者的临床、基因组和免疫学特征 一名17岁男性患者,患有全肠克罗恩病、肛周瘘管、慢性黏膜皮肤念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 基因组学、免疫学 克罗恩病 全外显子测序、Sanger测序、蛋白质建模、Western blot、免疫荧光、NF-κB激活实验、质谱流式细胞术(CyTOF)、单细胞RNA测序 NA 基因组和转录组数据、免疫表型数据 1例患者及对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-08-30
Glioblastoma exploits ATP from leading-edge astrocytes to fuel its infiltrative growth revealed by spatially resolved chimeric analysis
2025-09-26, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 介绍了一种名为SCAR的计算工具,用于解析空间转录组学中人-鼠嵌合癌症模型中的肿瘤-微环境基因表达,揭示了胶质母细胞瘤浸润性生长依赖星形胶质细胞提供ATP的机制 首次引入空间分辨嵌合分析工具SCAR,能够区分肿瘤细胞与微环境细胞,揭示胶质母细胞瘤浸润前沿的代谢重编程机制,并发现CKB在细胞外催化ATP和肌酸转化为磷酸肌酸的过程 摘要中未提及明显的局限性 开发SCAR工具并利用其解析胶质母细胞瘤与肿瘤微环境的空间相互作用,探索浸润性生长的代谢机制 人-鼠嵌合胶质母细胞瘤模型中的肿瘤细胞和星形胶质细胞 计算生物学、空间转录组学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 计算工具SCAR 空间转录组数据 未明确提及 NA 空间转录组学 NA NA
17 2026-08-30
A spatial transcriptomics dataset of pancreas sections in normal glucose tolerance and type 2 diabetic donors
2025-09-01, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 报告了来自三名2型糖尿病供体和三名正常葡萄糖耐量供体的胰腺切片空间转录组数据集,并识别和纠正了高表达基因的转录泄漏问题 首次提供了胰腺切片的空间转录组数据集,并引入概率模型对高丰度基因的转录泄漏进行计算校正 样本量较小(仅三名T2D和三名NGT供体),且转录泄漏校正方法可能需要进一步的验证 研究正常和2型糖尿病状态下胰腺基因表达的空间分布,并解决空间转录组数据处理中的技术挑战 人类胰腺组织切片 空间转录组学 2型糖尿病 空间转录组测序 概率模型 基因表达数据 6个胰腺样本(3个T2D供体,3个NGT供体) NA 空间转录组学 NA NA
18 2026-08-30
Splicing regulatory dynamics for precision analysis and treatment of heterogeneous leukemias
2025-05-07, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 开发了无监督计算流程OncoSplice,从剪接谱中定义肿瘤分子景观,识别白血病亚型并验证PRMT5作为治疗靶点 首次在没有剪接因子突变的条件下,利用剪接谱全面解析白血病遗传亚型,发现新的显性剪接亚型并验证PRMT5抑制剂的治疗潜力 未明确提及,但可能包括计算流程依赖数据质量及验证样本数量有限 从剪接谱中识别驱动遗传学,定义分子亚型,并验证治疗靶点 成人和儿童急性髓系白血病(AML)患者样本及细胞系 计算生物学、基因组学 白血病 长读长单细胞RNA测序 无监督计算流程(OncoSplice),未指定具体深度学习模型 RNA测序数据(短读长和长读长单细胞) 包括成人和儿童AML队列,具体样本数未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA 长读长单细胞RNA测序
19 2026-08-30
Patient-derived models of UBA5-associated encephalopathy identify defects in neurodevelopment and highlight potential therapeutic avenues
2025-05-07, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究开发了患者来源的皮质类器官模型,以研究UBA5相关脑病的神经发育缺陷,并评估了潜在的治疗方法 首次建立患者来源的皮质类器官模型来研究UBA5致病性变异,并结合单细胞RNA测序和电生理分析揭示GABA能中间神经元发育缺陷,同时评估了SINEUP和CRISPRa两种治疗策略 未明确提及,但可能包括样本量小(仅两名患者)和体外模型的局限性 阐明UBA5相关脑病的细胞和分子机制,并探索潜在的治疗途径 两名携带UBA5复合杂合变异患者的皮质类器官、工程化的U87-MG细胞 数字病理学 UBA5相关脑病 单细胞RNA测序、电生理记录、CRISPRa、SINEUP 类器官模型、细胞模型 单细胞转录组数据、电生理数据 2名患者来源的类器官和U87-MG细胞系 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序
20 2026-08-30
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-Apr-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型和临床样本分析,发现PKCδ基因的种系变异或缺失可通过调节髓系细胞增强抗肿瘤免疫,提高免疫检查点抑制剂的疗效 首次将PKCδ种系变异与肿瘤免疫基因签名关联,揭示PKCδ作为免疫治疗新靶点,并阐明其在髓系细胞中调控巨噬细胞M1/M2极化状态的机制 主要基于小鼠模型和临床样本的关联分析,尚需进一步的临床干预试验验证PKCδ靶向治疗的安全性和有效性 探究PKCδ在肿瘤免疫中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 小鼠模型(Prkcd基因敲除)、临床样本(PRKCD变异与巨噬细胞表型关联) 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、临床数据 小鼠模型及临床样本(具体数量未在摘要中给出) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序分析髓系细胞表达
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