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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-27 |
Immunopathophysiology of immune checkpoint inhibitor-related pneumonitis: insights from multi-omics and immune profiling
2026-Sep, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2026.2674327
PMID:42148869
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综述 | 本文综述了免疫检查点抑制剂相关肺炎的免疫病理生理学,通过多组学和免疫分析揭示了其发病机制 | 整合多组学数据,包括空间转录组学和成像质谱流式,提供对免疫细胞间复杂关系和肺组织损伤机制的详细见解 | 未提及具体局限性 | 总结免疫检查点抑制剂相关肺炎的免疫病理生理学最新研究进展,以改进风险评估和免疫治疗策略 | 免疫检查点抑制剂相关肺炎患者的外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织 | 免疫学、多组学 | 免疫检查点抑制剂相关肺炎(间质性肺炎) | 多组学分析、空间转录组学、成像质谱流式、免疫分析 | NA | 多组学数据(包括基因表达、蛋白质和细胞数据) | NA | NA | 空间转录组学、成像质谱流式 | NA | NA |
| 2 | 2026-08-27 |
Mapping malignant T-cell states and immune circuits in Sézary syndrome by single-cell analysis
2026-Sep, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70368
PMID:41773808
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研究论文 | 通过单细胞分析绘制Sézary综合征中恶性T细胞状态和免疫回路 | 首次在白血病期皮肤T细胞淋巴瘤中利用单细胞RNA测序识别出三种转录组学上不同的恶性T细胞亚型,并扩展了KIR表达谱,揭示了肿瘤诱导的免疫重编程机制 | 研究结果需要在更大规模的独立队列中进行验证 | 定义恶性T细胞内的转录异质性,识别塑造肿瘤微环境的免疫调节信号,并揭示Sézary综合征和白血病期蕈样肉芽肿中的可利用脆弱性 | Sézary综合征或白血病期蕈样肉芽肿患者的外周血单核细胞 | 单细胞测序 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, CITE-seq, TCR-seq | NA | 单细胞转录组和表面蛋白数据 | 22名患者和7名健康对照,共144,321个外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, CITE-seq, TCR-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-08-27 |
Novel protein biomarkers for risk stratification and personalized medicine
2026-Aug-25, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfag068
PMID:41874429
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研究论文 | 本研究评估了尿液中簇集蛋白和表皮生长因子作为慢性肾病治疗反应的新型药效学生物标志物,分别对应内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂的作用 | 首次验证尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为机制性药效学生物标志物,分别反映肾小管损伤和修复通路,补充白蛋白尿的局限性 | 基于已有临床试验的二次分析,可能存在选择偏倚;生物标志物在不同CKD病因中的异质性需进一步验证 | 评估尿液簇集蛋白和表皮生长因子在慢性肾病中作为药效学生物标志物的潜力,以改善风险分层和个性化治疗 | 慢性肾病患者,包括不同病因、糖尿病状态和血糖控制水平 | 自然语言处理 | 慢性肾病 | RNA-seq | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 两个随机临床试验人群(SONAR和DAPA-CKD),具体样本量未在摘要中提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-08-27 |
Spatial transcriptomics maps early B-cell and T-cell activation in hidradenitis suppurativa
2026-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.01.041
PMID:41722764
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞转录组学分析,揭示化脓性汗腺炎早期即发生B细胞和T细胞活化,先于隧道和三级淋巴结构形成 | 首次通过整合空间和单细胞转录组学,明确化脓性汗腺炎中免疫激活的时间顺序,发现早期免疫激活先于晚期结构形成,并识别出表达促炎细胞因子和抗原呈递机制的多功能B细胞 | 未提供具体局限性信息 | 阐明化脓性汗腺炎中免疫激活的时间序列,探究早期免疫反应是否先于晚期结构形成 | 化脓性汗腺炎早期和晚期病变组织,以及与聚合性痤疮和银屑病的比较 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 化脓性汗腺炎, 聚合性痤疮, 银屑病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 156个感兴趣区域,具体样本数未提供 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-08-27 |
Fibrosis as the Engine of Kidney Functional Decline: Donald W. Seldin Young Investigator Award Lecture
2026-Aug-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001154
PMID:42138991
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综述 | 本文综述了肾小管间质纤维化作为慢性肾病功能下降直接驱动因素的机制,并探讨单细胞和空间转录组学及肾脏类器官平台在抗纤维化药物发现中的应用 | 整合高分辨率转录组学与人类多能干细胞来源肾脏类器官,提出解析纤维化微环境并加速抗纤维化药物开发的新路径 | 未提及具体局限性 | 综合当前肾纤维化重塑机制见解,并讨论高分辨率转录组学和类器官平台如何加速抗纤维化药物发现 | 肾小管间质纤维化的病理过程及其细胞和分子机制 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-08-27 |
Integrative multi-omics analysis identifies a core ferroptosis signature and validates resveratrol as a novel inducer in pancreatic cancer
2026-Aug, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05385-8
PMID:42142137
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研究论文 | 综合多组学分析确定胰腺癌核心铁死亡标志物,并验证白藜芦醇作为新型铁死亡诱导剂 | 首次整合转录组和单细胞数据,结合机器学习筛选出胰腺癌核心铁死亡基因,并验证白藜芦醇通过靶向该网络诱导铁死亡,提供新生物标志物和治疗策略 | 研究基于公开数据集和体外实验,缺乏体内验证和临床前瞻性研究 | 识别胰腺导管腺癌中核心铁死亡相关基因,并评估白藜芦醇作为铁死亡诱导剂的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其相关的转录组和单细胞数据,以及白藜芦醇处理的肿瘤细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 分子对接, 蛋白质印迹 | LASSO, SVM-RFE | 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质表达数据, 分子对接数据 | GSE28735和GSE62452转录组数据集,GSE197177单细胞数据集,HPA和TCGA临床样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-08-27 |
Identification of potential targets of kaempferol for the treatment of intervertebral disc degeneration based on network pharmacology and multi-omics analysis
2026-Aug, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05567-4
PMID:42283840
|
研究论文 | 基于网络药理学和多组学分析,确定山柰酚治疗椎间盘退变的潜在分子靶点,并通过实验验证其在髓核细胞中的作用 | 首次结合网络药理学、分子对接、批量转录组学和单细胞转录组学全面识别山柰酚治疗椎间盘退变的多靶点机制,并通过实验验证核心靶基因的表达和功能 | 研究主要依赖生物信息学预测和体外实验,缺乏体内实验的进一步验证,且分子机制尚需更多探索 | 通过整合网络药理学和多组学分析,识别山柰酚治疗椎间盘退变的潜在分子靶点,并验证其治疗效果 | 椎间盘退变组织和IL-1β诱导的人髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 网络药理学、分子对接、批量RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 两个批量RNA-seq数据集(GSE70362和GSE147383)和一个单细胞RNA-seq数据集(GSE251686),以及体外培养的髓核细胞 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-08-27 |
Transcriptomic, Specific Marker, and Pathway Analysis of Smooth Muscle Cell Foam Cells Relative to Macrophage Foam Cells in Human Atherosclerosis
2026-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.27.728334
PMID:42282821
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类动脉粥样硬化中平滑肌细胞泡沫细胞与巨噬细胞泡沫细胞的转录组、特异性标志物及生物学通路差异 | 首次揭示了平滑肌细胞泡沫细胞(脂肌细胞)的独特转录组特征和特异性标记物(如SERPINE1和CFH),并阐明其与巨噬细胞泡沫细胞在动脉粥样硬化斑块中的生物学通路差异 | 未提及具体局限性 | 确定平滑肌细胞泡沫细胞相对于巨噬细胞泡沫细胞的转录组、特异性标志物和生物学途径 | 来自心脏移植受者的新鲜冠状动脉节段,具有早期至中期动脉粥样硬化 | 转录组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 来自心脏移植受者的新鲜冠状动脉节段(未提供具体数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Xenium | 10x Chromium单细胞RNA测序和Xenium空间转录组学用于验证 |
| 9 | 2026-08-27 |
Plasmodium falciparum leucine-rich repeat 5 disruption alters the transcription progression during asexual and sexual stage development
2026-Jul-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00186-26
PMID:42294623
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了恶性疟原虫LRR5蛋白缺失如何改变无性与有性发育阶段的转录进程,揭示LRR5在蛋白质稳态、宿主细胞重塑和发育时机调控中的关键作用 | 首次利用优化的单细胞RNA测序方法分析不受同步化培养影响的疟原虫,揭示了LRR5缺失导致转录组重编程,包括下调蛋白质折叠和输出通路、上调细胞质热休克蛋白,并提前激活配子体相关转录程序 | 研究基于体外培养的恶性疟原虫实验室株,可能无法完全反映体内感染的复杂性;LRR5缺失的分子机制及其与应激反应的直接联系仍需进一步验证 | 探究恶性疟原虫LRR5蛋白在应激反应和发育决策(如配子体生成)中的作用,以理解寄生虫如何协调无性复制与有性传播 | 恶性疟原虫野生型NF54株和LRR5缺失突变体(LRR5pB)的未同步化培养寄生虫 | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 野生型NF54和LRR5pB突变体各一个培养系,具体细胞数未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 优化的单细胞RNA测序方法,具体配置未详述 |
| 10 | 2026-08-27 |
Integrated Stress Response and Drug-Induced Acute Kidney Injury: Involvement of Activating ATF4-STAT1-GBP2 Signaling
2026-Jul-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000984
PMID:41563239
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研究论文 | 本文研究了整合应激反应在药物诱导急性肾损伤中的作用,发现激活转录因子ATF4通过ATF4-STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡,从而加剧肾损伤。 | 首次揭示ATF4通过激活STAT1-GBP2信号通路调控肾小管上皮细胞焦亡的机制,并验证了药理抑制剂ERMT1和纳米生物介导的ATF4沉默可有效减轻肾损伤,为药物诱导急性肾损伤提供了新的治疗策略。 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床验证相对有限;具体机制仍需进一步深入探究。 | 阐明药物诱导急性肾损伤中整合应激反应调控肾小管上皮细胞焦亡的机制,并评估潜在治疗干预的效果。 | 人源和鼠源的肾小管上皮细胞,以及药物诱导急性肾损伤的小鼠模型。 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、RNA测序、免疫组化、免疫荧光、荧光素酶报告基因检测、免疫共沉淀、蛋白质印迹 | NA | 测序数据、图像 | 涉及人源和鼠源肾小管上皮细胞及药物诱导急性肾损伤小鼠模型,具体样本量未在摘要中说明。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-08-27 |
Single-Cell Resolution Drug Effects of Renin-Angiotensin-Aldosterone Blockade in ZSF1 Rat Diabetic Kidney Disease
2026-Jul-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000995
PMID:41563360
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学解析了依那普利在ZSF1大鼠糖尿病肾病中的细胞特异性药物效应,揭示了组织蛋白酶D和巨噬细胞相互作用机制 | 首次在单细胞分辨率下阐明依那普利在远端肾单位的作用靶点,并发现组织蛋白酶D作为其效应调节因子,以及TREM2+巨噬细胞与远端肾小管细胞的串扰机制 | 主要基于大鼠模型,人类样本仅用于基因特征验证,未进行功能实验验证 | 阐明依那普利在糖尿病肾病中的确切细胞靶点和分子作用机制 | ZSF1大鼠肾脏细胞和人类肾脏样本 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ZSF1大鼠肾脏样本及人类肾脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组方案 |
| 12 | 2026-08-27 |
Beyond Weight: Systems Biology and Precision Medicine Redefine Obesity as a Multidimensional Disease
2026-07, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70724
PMID:41944002
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综述 | 本文通过系统生物学视角,整合分子、细胞、临床和环境信息,将肥胖重新定义为异质性、多维度疾病,并总结了相关研究进展和精准医疗策略。 | 突破传统以体重指数(BMI)为中心的分类模式,提出基于系统生物学的多维肥胖分型,强调细胞异质性和机制导向的精准干预。 | 作为综述,依赖于现有研究,可能未涵盖所有相关机制;且系统生物学方法在临床转化中仍面临数据整合和验证的挑战。 | 重新定义肥胖为多维疾病,推动从BMI分类向机制指导的预防和治疗转变。 | 肥胖相关的分子、细胞、临床和环境信息,包括脂肪组织、免疫代谢、免疫衰老及多系统损伤等。 | 系统生物学 | 肥胖 | 单细胞转录组学、代谢组学、表观基因组学、微生物组测序、计算建模 | 计算模型 | 分子数据(转录组、代谢组、表观基因组、微生物组)、临床数据 | 不适用(综述文章,未提及具体样本数量) | NA | 单细胞转录组学、代谢组学、表观基因组学、微生物组测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-08-27 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify SPP1 + trophoblast necroptosis as a potential contributor to late-onset preeclampsia via SPP1-CD44-mediated interaction with macrophages
2026-06-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08402-9
PMID:42289736
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析,鉴定SPP1+滋养层坏死性凋亡可能通过SPP1-CD44介导的与巨噬细胞的相互作用,参与晚期先兆子痫的发病机制 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学相结合,鉴定出与坏死性凋亡相关的SPP1+绒毛外滋养层亚型,并揭示SPP1-CD44信号轴在滋养层-巨噬细胞相互作用及胎盘炎症中的关键作用 | 尚未完全阐明坏死性凋亡在晚期先兆子痫中的具体分子机制,且研究主要基于胎盘组织及小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探索晚期先兆子痫中坏死性凋亡的作用,揭示SPP1+滋养层细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制,以及其作为治疗靶点和生物标志物的潜力 | 晚期先兆子痫胎盘组织及健康妊娠胎盘组织,L-NAME诱导的先兆子痫样小鼠模型 | 数字病理学 | 妊娠期疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 多重免疫荧光染色 | Mlkl基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像 | 人胎盘组织样本(具体数量未提供),以及L-NAME诱导的Mlkl敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-08-27 |
Gli1⁺ cell aggregates promote type H vessel formation and orchestrate bone defect regeneration
2026-Jun-14, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05109-y
PMID:42289723
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research paper | 本研究探讨了Gli1+细胞聚集体通过促进H型血管形成来协调骨缺损再生的机制 | 提出了“内源性SSPC亚群精准筛选结合靶向聚集体构建”的新策略,首次系统地研究了Gli1+细胞聚集体在骨再生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,其临床转化潜力仍需进一步验证 | 阐明Gli1+细胞聚集体促进骨缺损再生的功能及其潜在机制 | Gli1+骨骼基质/祖细胞(SSPCs)及其形成的细胞聚集体 | machine learning | 骨缺损 | single-cell RNA sequencing, flow cytometry, micro-CT, immunofluorescence staining | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 15 | 2026-08-27 |
USP20 as a key regulator of immunosuppression and a novel predictor of poor prognosis in lung adenocarcinoma
2026-Jun-13, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00852-x
PMID:42288924
|
研究论文 | 本研究系统分析了USP20在肺腺癌中的表达、遗传改变、预后价值及免疫相关性,并验证了其在肿瘤免疫微环境重塑中的作用 | 首次整合bulk和单细胞转录组分析,明确USP20在肺腺癌中的细胞来源,并揭示其作为免疫治疗靶点的潜在价值 | 未提及具体局限性 | 评估USP20作为肺腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者肿瘤样本及细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫组化图像, 多重免疫荧光图像 | 未提及具体样本量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-08-27 |
BAGE: a Bayesian framework for age prediction based on PBMC gene expression data
2026-Jun-13, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06519-8
PMID:42288737
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研究论文 | 提出一个基于PBMC基因表达数据的贝叶斯框架BAGE,用于预测年龄,并评估其性能。 | 首次专门针对外周血单个核细胞(PBMC)的大规模基因表达数据训练年龄预测模型,并采用贝叶斯线性混合模型明确建模研究层面的异质性。 | 需要外部和纵向验证,以确证所选基因集的普适性和预测准确性。 | 开发并评估一个基于PBMC基因表达数据的年龄预测框架,以改善对免疫衰老的预测。 | 174名健康个体的PBMC基因表达数据,年龄段4-81岁,性别均衡。 | 机器学习 | 老年疾病 | RNA测序(bulk RNA-seq) | 贝叶斯线性混合模型 | 基因表达数据 | 174名健康个体 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-08-27 |
CACNA2D1 promotes ovulation by regulating ovarian immune cell infiltration
2026-Jun-13, BMC veterinary research
IF:2.3Q1
DOI:10.1186/s12917-026-05617-2
PMID:42288857
|
研究论文 | 本研究旨在探讨CACNA2D1在排卵过程中通过调节卵巢免疫细胞浸润所发挥的功能 | 首次在体内和体外模型中系统研究了CACNA2D1在排卵期间对卵巢免疫细胞浸润,特别是巨噬细胞募集的调控作用,并揭示了其通过钙信号依赖的趋化因子产生机制 | 研究主要基于小鼠模型,未能直接在人类或其他家畜物种中验证;且对CACNA2D1在非颗粒细胞类型中的潜在作用未作深入探讨 | 明确CACNA2D1在排卵过程中对卵巢免疫细胞浸润的调节功能及其分子机制 | 小鼠排卵模型及卵巢颗粒细胞 | 基因组学, 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析, 药理学抑制, 转录组测序, 免疫细胞浸润评估, 钙信号检测, 蛋白印迹, 细胞迁移实验 | NA | 转录组数据, 图像(免疫组化/免疫荧光), 细胞迁移数据, 生物化学数据 | 小鼠模型;体外颗粒细胞实验(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于山羊排卵过程中的单细胞转录组分析,以识别CACNA2D1的表达模式 |
| 18 | 2026-08-27 |
CD49a+ NK cells promote M2 polarization and are associated with poor pathological response in NSCLC
2026-Jun-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57649-1
PMID:42286110
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中的NK细胞,发现CD49a+组织驻留NK细胞亚群与不良病理反应相关,并促进M2巨噬细胞极化。 | 首次在非小细胞肺癌中鉴定出CD49a+组织驻留NK细胞亚群,并揭示其通过CSF-1促进M2巨噬细胞极化及抑制三级淋巴结构形成的新机制。 | 研究基于手术标本,样本量有限,且未深入探讨CD49a+ NK细胞在体内的动态变化及与其他免疫细胞间更复杂的相互作用。 | 全面分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中的NK细胞,鉴定组织驻留亚群,评估其临床意义并探究其免疫抑制功能及机制。 | 非小细胞肺癌手术标本中的NK细胞亚群,特别是CD49a+组织驻留NK细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌手术标本,具体数量未在标题和摘要中提供。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 19 | 2026-08-27 |
Subgroup-Specific Associations of GRIA Genes Encoding AMPA Glutamate Receptor Subunits with Patient Survival in Medulloblastoma
2026-06-11, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-026-08935-8
PMID:42277445
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研究论文 | 本研究分析髓母细胞瘤中编码AMPA谷氨酸受体亚基的GRIA1-4基因表达,发现其在不同分子亚型中与患者生存期存在亚型特异性关联 | 首次系统揭示GRIA基因在髓母细胞瘤不同分子亚型中的差异表达及其与预后的亚型特异性关联,特别是GRIA3和GRIA4在SHH亚型中与生存期的相反关联 | 研究主要基于公开数据集和细胞系,缺乏功能实验验证;需进一步在更大临床队列中确认预后关联 | 探究AMPA受体亚基编码基因GRIA1-4在髓母细胞瘤中的表达模式及其与患者生存期的关联 | 髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 | 基因组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据(RNA-seq和qRT-PCR) | 包含公开数据集中的髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-08-27 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics with machine learning identify a Luminal-inflam malignant program and reveal an RPN1-PERK UPR vulnerability in triple-negative breast cancer
2026-Jun-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-56434-4
PMID:42270806
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研究论文 | 结合单细胞和空间转录组学与机器学习,识别三阴性乳腺癌中的Luminal_inflam恶性程序,并揭示RPN1-PERK未折叠蛋白反应脆弱性。 | 通过整合单细胞和空间转录组学、网络分析和机器学习,识别出特定的恶性上皮亚群Luminal_inflam,并构建12基因风险签名,揭示RPN1相关的蛋白质稳态脆弱性作为潜在治疗靶点。 | 研究结果需结合先前工作解释,RPN1耗竭诱导内质网应激依赖性凋亡并非全新机制,而是对现有观察的扩展。 | 表征三阴性乳腺癌中的恶性上皮程序并确定预后生物标志物,探索RPN1相关脆弱性的治疗潜力。 | 三阴性乳腺癌的恶性上皮细胞亚群,特别是Luminal_inflam亚群,以及MDA-MB-231细胞模型。 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型(具体类型未指定) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确样本数量,涉及生存队列和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |