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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-12 |
The prognostic factors and immune microenvironment of primary plasma cell leukemia: the KMMWP-2204 study
2026-Jun-11, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2026.300772
PMID:42273949
|
研究论文 | 基于韩国多中心队列,分析原发性浆细胞白血病的预后因素及免疫微环境特征,并结合单细胞RNA测序探索其生物学机制 | 确认了2021年国际骨髓瘤工作组5%循环浆细胞诊断阈值的临床一致性,并首次通过scRNA-seq揭示pPCL中免疫分化异常和骨髓源性免疫调节信号特征 | 回顾性研究设计存在基线风险差异偏倚,scRNA-seq样本量较小(仅4例pPCL),发现需在大规模队列和正交功能研究中验证 | 明确原发性浆细胞白血病的预后因素、治疗结局及其免疫微环境特征 | 127例新诊断pPCL患者(韩国20个中心),4例pPCL、2例多发性骨髓瘤和3例健康供者的骨髓样本 | 数字病理学 | 浆细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 医学数据 | 127例患者临床数据(其中9例骨髓样本用于单细胞测序:4例pPCL、2例多发性骨髓瘤、3例健康供者) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2 | 2026-06-12 |
In vitro ibuprofen has gene regulatory and anti-inflammatory properties in peripheral blood mononuclear cells of individuals with infection-provoked neurodevelopmental disorders
2026-Jun-11, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02282-7
PMID:42274981
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研究论文 | 研究布洛芬对感染诱发的神经发育障碍患者外周血单个核细胞的基因调控和抗炎作用 | 首次通过单细胞RNA测序在体外研究布洛芬对感染诱发的神经发育障碍患者的转录和抗炎效应 | 样本量小(仅2例患者),需进一步验证 | 探讨布洛芬对感染诱发的神经发育障碍的治疗机制 | 18名伴有感染诱发症状的神经发育障碍儿童(PANS或自闭症退行)及其外周血单个核细胞 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 45,134个细胞(来自2例患者及对应的年龄、性别匹配对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3 | 2026-06-12 |
Effects of Ripasudil on Mouse Subconjunctival Immune Cell Motility Activated by Monocyte Chemoattractant Protein-1
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.6.20
PMID:42274198
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研究论文 | 研究Rho激酶抑制剂ripasudil对单核细胞趋化蛋白-1激活的小鼠结膜下免疫细胞运动性的影响 | 首次在体内和体外实验中证明ripasudil可抑制MCP-1激活的巨噬细胞运动,为青光眼滤过术后伤口愈合提供了新的治疗靶点 | 仅使用小鼠模型,未涉及人类样本;仅观察了MCP-1激活效应,未探索其他趋化因子 | 探究ripasudil对MCP-1激活的免疫细胞运动性的影响及其在青光眼滤过术后伤口愈合中的潜在治疗作用 | 小鼠结膜下LysM阳性免疫细胞(鉴定为巨噬细胞)、THP-1和RAW264.7细胞系 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序, 免疫细胞化学, 多光子显微镜, Boyden小室实验 | NA | 图像 | LysM-eGFP基因敲入小鼠(具体数量未报告)、THP-1和RAW264.7细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-12 |
Single-Cell and Bulk Transcriptomics Uncover the Cellular Ecosystem of Vascular Invasion in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2026-May-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111016
PMID:42274609
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学揭示肝内胆管癌血管侵犯的细胞生态系统 | 首次定义了一种肿瘤样癌症相关成纤维细胞(tCAFs),并通过多组学整合分析揭示了缺氧-tCAFs-内皮细胞轴在肝内胆管癌血管侵犯中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探索肝内胆管癌中血管侵犯相关的肿瘤微环境驱动因素和分子机制 | 肝内胆管癌患者的肿瘤样本 | 机器学习和数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 25个肝内胆管癌样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-06-12 |
Transcriptomic Signature of PDGF-BB Control of Annulus Fibrosus Reveals Modulation of Inflammatory and Neurogenic Pathways
2026-May-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111007
PMID:42274599
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研究论文 | 本研究探讨PDGF-BB对人纤维环细胞的转录组影响,揭示其在调节炎症和神经源性通路中的作用 | 首次通过批量RNA测序和公共单细胞RNA-seq数据,揭示PDGF-BB在健康和退变纤维环细胞中诱导的共同和背景依赖性转录反应,并验证其抗炎效果 | 未明确说明局限性 | 探究PDGF-BB对纤维环细胞生物学的调控机制及其在椎间盘退变中的潜在作用 | 健康和退变的人纤维环细胞 | 转录组学 | 椎间盘退变相关腰痛 | 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 未明确说明 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未明确说明 | 未明确说明 |
| 6 | 2026-06-12 |
Sinomenine Regulates PSMB9 to Mediate Therapeutic Effects in Rheumatoid Arthritis
2026-May-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111005
PMID:42274598
|
research paper | 本研究通过整合差异表达基因分析和加权基因共表达网络分析,鉴定PSMB9为类风湿关节炎的枢纽基因,并探讨青藤碱通过调控PSMB9发挥治疗作用的分子机制 | 首次发现PSMB9作为类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物和治疗靶点,并揭示青藤碱可直接结合PSMB9并下调其表达,为青藤碱抗炎作用提供了新的分子靶点 | NA | 鉴定类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物,并探讨其与免疫浸润的关系及青藤碱的治疗机制 | 类风湿关节炎相关基因PSMB9及青藤碱 | machine learning | rheumatoid arthritis | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-06-12 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Developmental Dynamics of Goose Satellite Cells During Embryogenesis
2026-May-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15110983
PMID:42274576
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鹅胚胎发育过程中骨骼肌卫星细胞的细胞异质性和发育动态 | 首次在禽类胚胎发育中构建高分辨率单细胞图谱,解析卫星细胞亚群状态转变与信号通路动态互作 | 未探讨不同性别或品种间的差异,且缺乏功能验证实验 | 解析鹅胚胎发育中骨骼肌卫星细胞的异质性、转录动态及细胞间通讯机制 | 鹅胚胎腿部肌肉组织中的卫星细胞及其微环境细胞类型 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 4个胚胎阶段(E13、E15、E18、E23)共42,886个细胞,每个阶段为4只雌性胚胎的混合组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' v3 |
| 8 | 2026-06-12 |
Case Report: dynamic monocyte reprogramming during ALSS therapy in type B HBV-ACLF revealed by single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1801893
PMID:42273678
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病例报告 | 通过单细胞转录组学揭示乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者在接受人工肝支持系统治疗过程中单核细胞的动态重编程 | 首次利用单细胞RNA测序在个体患者层面动态监测ALSS治疗前后单核细胞的转录组变化,发现并表征了一个促炎性单核细胞亚群Mono4,并揭示其分化轨迹与治疗反应的关系 | 单一病例报告,样本量有限,结果可能不具有普适性,需要更大规模研究验证 | 研究ALSS治疗对乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者单核细胞免疫状态的影响 | 一名B型乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 聚类分析, 伪时序轨迹推断 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 1名患者,采集ALSS治疗前后外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-12 |
Peripheral CD4+ naïve T cell remodeling and MMP1-associated inflammatory signatures in acute gouty arthritis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1828679
PMID:42273695
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研究论文 | 通过多维免疫分析揭示急性痛风性关节炎中外周CD4+初始T细胞重塑及MMP1相关炎症特征 | 首次整合孟德尔随机化、质谱流式、单细胞转录组、血浆蛋白质组及前瞻性随访分析,系统阐明适应性免疫重塑在急性痛风中的角色,并发现MMP1作为连接血清尿酸、系统性炎症和CD4+初始T细胞丰度的统计中介因子 | 机制性作用仍需进一步功能验证,且样本量较小,需在更大队列中确认 | 探究急性痛风性关节炎中适应性免疫重塑的特征及复发相关炎症标志物 | 急性痛风患者外周血CD4+初始T细胞及血浆炎症蛋白MMP1 | 机器学习, 数字病理 | 痛风性关节炎 | 质谱流式, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组学数据, 免疫表型数据, 遗传关联数据 | 中国队列中GA-A组25例、GA-R组22例、健康对照9例(CyTOF分析);独立训练队列40例、验证队列64例(蛋白质组学分析) | Olink | 蛋白质组学 | Olink平台 | 使用Olink平台进行血浆炎症蛋白定量分析 |
| 10 | 2026-06-12 |
Precision immunopharmacology in peri-implantitis management: from molecular mechanisms to advanced therapeutic strategies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1748582
PMID:42273687
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综述 | 综述种植体周围炎研究从传统机械清创向宿主调节和免疫药理概念的转变,聚焦分子发病机制、候选治疗靶点和先进给药系统 | 将免疫药理学、纳米递送系统和人工智能整合到种植体周围炎管理策略中,提出基于单细胞测序的免疫细胞互作模式(如CXCL13+成纤维细胞-CXCR2+中性粒细胞轴) | 大多数治疗策略仍处于临床前或早期转化阶段,机器学习模型缺乏前瞻性临床验证 | 探讨种植体周围炎的分子机制和免疫药理管理策略 | 种植体周围炎的分子发病机制、宿主调节疗法、纳米技术递送平台 | 机器学习 | 种植体周围炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 文本 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 11 | 2026-06-12 |
The immune-cardiovascular metabolic circuitry in myocardial ischemia-reperfusion injury: from metabolic signal release to spatiotemporal reprogramming
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1848067
PMID:42273702
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综述 | 本文综述了心肌缺血再灌注损伤中免疫-心血管代谢环路的时空重编程机制 | 将MIRI重新定义为免疫-心脏代谢通信的时空组织失衡,而非氧化应激和炎症的简单叠加 | 未提供具体的实验验证数据,主要基于现有文献的整合与推断 | 阐明MIRI中代谢信号释放与免疫细胞代谢重编程的时空调控机制 | 心肌细胞、冠状动脉微血管内皮细胞、成纤维细胞、驻留心脏巨噬细胞、中性粒细胞、单核/巨噬细胞、淋巴细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞组学、空间转录组学、空间代谢组学、代谢通量分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞组学, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-11 |
A 4-guanidinobutanoic acid-SLC36A1 axis drives a microbiota‒host feedback loop to regulate intestinal homeostasis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2639216
PMID:41782409
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物4-胍基丁酸通过SLC36A1轴驱动微生物-宿主反馈回路,调控肠道稳态 | 首次发现4-胍基丁酸作为关键调节因子,通过SLC36A1与Hedgehog信号通路增强肠道干细胞功能和杯状细胞分化,形成微生物-宿主反馈循环,并揭示其在溃疡性结肠炎中的诊断和治疗潜力 | NA(摘要未提供明确局限性信息) | 探究肠道微生物代谢物4-胍基丁酸在调节肠道稳态中的作用机制 | 肠道干细胞、杯状细胞、肠道屏障功能 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、类器官共培养、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据 | NA(未明确样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-11 |
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762
PMID:41775092
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研究论文 | 提出了一种通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络的方法 | 首次结合一阶和二阶邻近性捕获复杂拓扑,并利用对抗训练策略对基因表达数据进行先验分布正则化 | 未明确提及,但可能依赖于特定类型的先验分布假设或数据规模限制 | 开发一种能处理基因调控网络复杂拓扑且考虑基因表达数据非相同分布特性的推断方法 | 基因调控网络及其推断方法 | 机器学习 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 图自编码器,对抗正则化 | 基因表达数据 | DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-06-11 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出了scMAG算法,一种通过多阶段深度融合与流形感知门控策略整合单细胞多组学数据的方法 | 创新性地提出了多阶段特征深度融合形式化方法,结合多核心流形保持与引导门控优化策略,实现了自适应对齐多组学潜在空间并优化数据分布 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞多组学数据的聚类精度和可视化效果,同时实现多组学潜在空间的自适应对齐并抑制生物噪声与测量误差 | 单细胞多组学数据集,包括scRNA-seq、scATAC-seq和ADT数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度融合网络 | 单细胞多组学数据 | 配对数据集(scRNA-seq与scATAC-seq和ADT) | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-11 |
Silencing Adamts2 attenuates fibroblast-mediated fibrosis and promotes axonal regeneration in an in vitro model
2026-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112450
PMID:41785981
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研究论文 | 通过沉默Adamts2减轻成纤维细胞介导的纤维化并促进轴突再生 | 首次利用单细胞测序数据分析脊髓损伤后成纤维细胞的变化,筛选出特异性高表达基因Adamts2,并通过体外模型验证其作为靶点抑制纤维化、促进轴突再生的效果 | 研究基于体外模型,缺乏体内验证;未探讨Adamts2在其他细胞类型或信号通路中的作用 | 探究沉默Adamts2是否能减轻成纤维细胞介导的纤维化并促进轴突再生 | 小鼠脊髓成纤维细胞和运动神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序、RNA干扰 | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠脊髓损伤后的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-11 |
Unveiling the impact of electroacupuncture on retinal cells in myopic guinea pigs via single-cell sequencing
2026-Jun, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110954
PMID:41780836
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术系统揭示电针干预对近视豚鼠视网膜各类细胞功能特征的影响 | 首次通过单细胞测序技术全面解析电针调控近视豚鼠视网膜中Müller胶质细胞、视锥细胞和小胶质细胞的具体分子机制 | 未提及具体局限性 | 阐明电针干预通过调节视网膜细胞功能抑制近视进展的细胞机制 | 近视豚鼠的视网膜细胞,包括Müller胶质细胞、视锥细胞和小胶质细胞 | 生物信息学 | 近视 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、scMetabolism代谢差异分析、基因集富集分析(GSEA)、高维加权共表达网络分析(Hd-WGCNA)、伪时间轨迹分析、实时荧光定量PCR(qPCR)、Western blotting | NA | 单细胞转录组数据 | 近视豚鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 17 | 2026-06-11 |
High MAP3K6 expression in spinal cord injury tissues enhances neuronal apoptosis: insights from multi-omics data integrating WGCNA, machine learning and experimental validation
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2639364
PMID:41782555
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研究论文 | 通过多组学数据整合WGCNA、机器学习和实验验证,揭示MAP3K6在脊髓损伤组织中高表达并促进神经元凋亡 | 首次结合多组学分析、共表达网络、机器学习及体外实验,鉴定MAP3K6为脊髓损伤的关键调控因子,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 基于公共数据集分析,样本量有限,且体外实验仅在小鼠脊髓神经元细胞中进行,未在动物模型或人体组织进一步验证 | 探索脊髓损伤的分子机制及关键生物标志物 | 脊髓损伤组织样本和对照样本的基因表达数据,以及小鼠脊髓神经元细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, 随机森林 | WGCNA, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE226238数据集(具体样本数未明确),外部验证集GSE151371,及小鼠脊髓神经元细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-06-11 |
Locus-Specific Human Endogenous Retrovirus ERVK18 Expression Indicates an Inflamed Microenvironment and Favorable Immunotherapy Outcome in Small Cell Lung Cancer
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3302
PMID:41784525
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研究论文 | 本研究鉴定出位点特异性人内源性逆转录病毒ERVK18在小细胞肺癌中与炎症微环境和良好免疫治疗结果相关 | 首次发现特异性ERVK18转录本作为小细胞肺癌免疫治疗的双重预后和预测生物标志物,揭示其与免疫激活通路和T细胞细胞毒性的关联 | 未明确说明局限性 | 探究人内源性逆转录病毒HERV-K在小细胞肺癌中的功能角色,特别是与炎症微环境和免疫治疗结果的关联 | 小细胞肺癌患者肿瘤样本及免疫微环境 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq,单细胞RNA测序,多重免疫组化,PhenoCycler-Fusion | NA | 图像,文本 | IMpower133队列271例,PKUPH队列40例,组织微阵列48例 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Chromium,PhenoCycler-Fusion | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,PhenoCycler-Fusion用于多重免疫组化 |
| 19 | 2026-06-11 |
Dynamic Reprogramming of PDGFRA-Expressing Stromal Cells Facilitates WNT-Driven Transformation by Promoting a Fetal-Like State in the Intestinal Epithelium
2026-Jun-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0101
PMID:41784677
|
研究论文 | 本研究揭示PDGFRA表达的成纤维细胞通过分泌配体促进肠上皮进入胎儿样状态,从而驱动WNT介导的肿瘤转化 | 首次阐明PDGFRA+成纤维细胞在WNT驱动的肿瘤发生早期动态重编程并促进肠上皮胎儿样状态,发现TGFβ信号在此过程中的关键作用 | 主要基于小鼠模型和体外类器官实验,缺乏人体组织样本验证;胎儿样状态与肿瘤形成的因果关系需进一步确认 | 探究PDGFRA+基质成纤维细胞在WNT介导的肠道肿瘤发生中的动态变化及其对上皮细胞状态的影响 | PDGFRA表达的成纤维细胞、WNT驱动的肿瘤上皮细胞、肠隐窝绒毛轴 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 20 | 2026-06-11 |
Multi-omics profiling reveals cholic acid-mediated immunosuppression driven by peritumoral ductular reactions in hepatocellular carcinoma
2026-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218393
PMID:41780844
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研究论文 | 通过多组学分析揭示肝细胞癌中导管反应介导的免疫抑制机制 | 首次整合人工智能病理学、单核多组学、空间转录组学和代谢组学,系统表征肝细胞癌瘤周导管反应,并发现胆酸通过NR1H4依赖性PD1上调诱导CD8 T细胞功能障碍 | 文章摘要未明确指出研究局限性 | 阐明肝细胞癌瘤周导管反应在疾病进展中的作用及其免疫抑制机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | 多组学分析、人工智能病理学、单核多组学、空间转录组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单核多组学、空间转录组学 | NA | NA |