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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-06
Parkin modulates the hepatocellular carcinoma microenvironment by regulating PD-1/PD-L1 signalling
2025-10, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨Parkin通过调控PD-1/PD-L1信号影响肝细胞癌的免疫微环境,并揭示其作为E3泛素连接酶促进PD-1泛素化降解的机制 首次揭示Parkin通过调节PD-1/PD-L1信号通路重塑肝细胞癌的免疫微环境,并提出通过重新引入Parkin或增强线粒体自噬来激活抗肿瘤免疫反应的新型治疗策略 研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏临床样本验证;PD-1降解机制在人类肝细胞癌中的适用性需进一步确认 探究Parkin在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其通过PD-1/PD-L1信号通路调节抗肿瘤免疫的潜在机制,以改善免疫治疗效果 Park2基因敲除小鼠及肝癌细胞模型中的免疫细胞(如CD8+ T细胞、髓系来源细胞)和PD-1分子 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、蛋白质印迹、免疫荧光、免疫共沉淀 NA 单细胞基因表达数据、蛋白质组学数据、图像数据 采用CCl4诱导的Park2-/-与野生型小鼠肝脏肿瘤模型,具体样本量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-09-06
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2025-06, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究首次在早期类风湿关节炎中检测内源性逆转录元件的表达,探讨其与干扰素-α产生及抗环瓜氨酸肽自身抗体的关联 首次在早期类风湿关节炎外周血和滑膜组织中检测内源性逆转录元件表达,发现其与干扰素-α及抗CCP抗体的潜在因果关系 NA 探讨内源性逆转录元件在早期类风湿关节炎中作为干扰素产生触发因素的可能性及其与自身抗体的关联 早期类风湿关节炎和早期银屑病关节炎患者的外周血样本、滑膜组织样本及B细胞亚群 免疫学 类风湿关节炎 逆转录聚合酶链反应、NanoString、流式细胞分选、单细胞测序再分析 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 滑膜组织样本22例,全血样本56例 NanoString, 10x Genomics 批量RNA测序、单细胞测序 NanoString平台、10x单细胞平台 NanoString基因表达分析、单细胞RNA测序(平台配置未知)
3 2026-09-06
Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia
2025-05, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过多组学空间图谱揭示了结肠发育不良中DMBT1糖蛋白的丢失,并探讨了细菌与结肠肿瘤发生之间的潜在机制联系。 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫荧光结合,构建结肠发育不良的分子空间组织图谱,并发现DMBT1在炎症与发育不良结肠中的二分法调控。 摘要中未明确说明研究的局限性。 理解结肠肿瘤发生过程中宿主-微生物相互作用,特别是DMBT1在结肠发育不良中的调控机制。 小鼠结肠发育不良模型(包括特定病原体自由和无菌环境)以及人类结肠腺瘤发育不良样本。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 NA 基因表达数据、空间转录数据、图像 多个小鼠模型和人样本,具体数量未明确。 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 用于单细胞RNA测序和空间转录组分析的平台
4 2026-09-06
Mathematical Modeling Predicts Optimal Immune Checkpoint Inhibitor and Radiotherapy Combinations and Timing of Administration
2025-03-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过数学建模预测放疗与免疫检查点抑制剂的最佳组合及给药时机,基于食管癌患者组织样本的单细胞RNA测序和空间转录组分析。 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组分析,动态展示放疗过程中免疫检查点分子相互作用的变化,并利用数学建模预测五种ICI在不同时间点的疗效。 研究基于有限的患者样本,预测结果需临床验证。 确定放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的最佳给药时间点和药物组合。 食管癌患者淋巴组织样本。 生物信息学 食管癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 数学模型 转录组数据 未明确 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
5 2024-10-04
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6 2026-09-06
Single-Cell Meta-Analysis Uncovers the Pancreatic Endothelial Cell Transcriptomic Signature and Reveals a Key Role for NKX2-3 in PLVAP Expression
2024-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 该研究通过单细胞元分析揭示了胰腺内皮细胞的转录组特征,并发现NKX2-3在PLVAP表达中的关键作用。 首次定义了跨物种和发育阶段保守的胰腺内皮细胞富集基因签名,并鉴定了一个特化的胰岛毛细血管亚群,同时发现NKX2-3转录因子作为上游调控因子促进PLVAP表达。 由于胰腺消化酶的干扰,难以分离和表征原代胰腺内皮细胞,可能影响验证的全面性;且未提供NKX2-3在体内的功能验证。 阐明胰腺内皮细胞的转录组特征和细胞异质性,并探索关键转录因子NKX2-3在调节内皮屏障基因表达中的作用。 人类和小鼠的胰腺内皮细胞(包括胰岛毛细血管亚群),以及HUVECs(人脐静脉内皮细胞)作为过表达模型。 数字病理学和单细胞转录组学 不适用 单核/单细胞RNA测序,批量RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,RNAscope,RT-qPCR 细胞模型(HUVECs过表达)和生物信息学分析 基因表达数据和图像数据 多个公开单细胞数据集(具体样本数量未在题目和摘要中说明) 不适用 单细胞RNA测序,空间转录组学 不适用 不适用
7 2026-09-06
Cross-tissue organization of myeloid cells in scleroderma and related fibrotic diseases
2024-Nov-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1
综述 本文通过单细胞RNA测序数据分析,提出跨组织统一髓系细胞命名法,并揭示DC3和SPP1巨噬细胞在不同纤维化疾病中的器官特异性富集模式 提出基于细胞类型定义基因特征的统一髓系细胞命名法,以解决scRNA-Seq研究在树突状细胞、单核细胞和巨噬细胞命名上的不一致性;发现DC3亚群在纤维化皮肤、肺和肝脏中富集,而SPP1巨噬细胞在肺、心和肾纤维化中富集 主要基于公开数据集的分析,缺乏实验验证;跨组织比较受限于不同研究的批次效应和样本异质性 建立跨组织的髓系细胞统一命名法,并阐明其在硬皮病及相关纤维化疾病中的富集模式 硬皮病及相关纤维化疾病(包括特发性肺纤维化、COVID-19肺纤维化、骨髓纤维化、肝、肾和心脏纤维化)中的髓系细胞 生物信息学 硬皮病, 纤维化疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个公开scRNA-Seq数据集,涵盖多种组织(皮肤、肺、肝、肾、心脏等) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-09-06
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-10-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究采用初免-加强疫苗接种策略,通过肌肉注射DNA疫苗初免和鼻内接种减毒流感病毒载体疫苗加强,诱导产生肺组织驻留记忆CD8+ T细胞,并发现其源于中枢记忆T细胞,可有效预防肿瘤肺转移 首次揭示中枢记忆T细胞是疫苗诱导的肺组织驻留记忆CD8+ T细胞的主要前体细胞,并阐明了鼻内加强免疫通过CXCR3依赖性趋化重塑黏膜微环境促进TCM细胞分化为TRM细胞的机制 未明确提及 识别疫苗诱导的肺组织驻留记忆T细胞的来源,以优化预防肿瘤肺转移的疫苗策略 肺CD8+ TRM细胞、中枢记忆T细胞、转移性黑色素瘤和间皮瘤模型 免疫学 肿瘤转移 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
9 2026-09-06
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨Trem2激动剂抗体(AL002a)对动脉粥样硬化小鼠模型中泡沫巨噬细胞的重编程作用及其对斑块稳定性的影响 首次评估Trem2激动剂抗体对动脉粥样硬化斑块稳定性的治疗潜力,并揭示其通过重编程泡沫巨噬细胞转录组(上调氧化磷酸化和胶原基因表达)促进胆固醇外流和胶原沉积的新机制 研究仅在动脉粥样硬化小鼠模型中进行,未涉及人类样本验证;且斑块面积增加可能带来潜在风险,需进一步评估长期安全性 验证Trem2激动剂抗体能否通过增强巨噬细胞存活和减少坏死核心形成来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 Ldlr-/-动脉粥样硬化小鼠及其主动脉斑块中的泡沫巨噬细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据,病理图像数据 未明确样本数量,涉及小鼠模型和多组比较 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于全主动脉悬液样本
10 2026-09-06
KRT17high/CXCL8+ Tumor Cells Display Both Classical and Basal Features and Regulate Myeloid Infiltration in the Pancreatic Cancer Microenvironment
2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序等多模态方法,鉴定出胰腺导管腺癌中KRT17高表达/CXCL8+的中间态肿瘤细胞亚型,并揭示其调控骨髓细胞浸润的作用。 首次在单细胞水平上鉴定出兼具经典和基底特征的KRT17high/CXCL8+中间态癌细胞亚型,并证明其通过CXCL8依赖性方式影响局部和系统性免疫微环境。 研究主要基于有限的样本和体外模型,患者来源类器官可能无法完全重现体内复杂的微环境,且纵向血液样本的追踪时间有限。 表征胰腺导管腺癌中中间态癌细胞亚型的特征及其在肿瘤微环境和系统免疫中的作用。 包含18个人类PDAC样本的单细胞RNA测序数据、患者来源的PDAC类器官、匹配的血液和肿瘤样本以及纵向血液样本。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、血液和肿瘤样本的配对单细胞数据、血浆蛋白质组数据 18个人类PDAC样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
11 2026-09-06
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-04, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了程序性死亡配体1(PD-L1)阳性巨噬细胞在关节炎中对关节的保护作用 首次阐明PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的保护作用,并发现其兼具促吞噬和抗炎特性,且在人体滑膜中也存在类似细胞 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型,结论是否完全适用于人类关节炎仍需更多验证 探究PD-L1在滑膜中的表达及PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的作用机制 胶原诱导性关节炎小鼠模型和人类滑膜组织中的PD-L1+巨噬细胞 免疫学 关节炎 基因敲除小鼠、单细胞RNA测序 NA 基因表达和细胞表型数据 小鼠和人类滑膜样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-09-06
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
评论 本文总结了2022年虚拟举行的第五届中美肝脏学会/华人生物学家协会 hepatology 分会年会上的报告,重点关注酒精相关肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌的基础与转化研究进展 总结了年会中关于非编码RNA、自噬、肝外信号、巨噬细胞等在肝脏疾病中的作用,以及单细胞RNA测序在肝病研究中的应用 因是会议亮点摘要,可能缺乏详细的方法学描述和具体数据 概述慢性肝病(包括病毒性肝炎、酒精相关肝病和非酒精性脂肪性肝病)的最新发病机制和治疗靶点研究进展 慢性肝病,包括病毒性肝炎、酒精相关肝病、非酒精性脂肪性肝病和肝癌 数字病理学 慢性肝病、酒精相关肝病、非酒精性脂肪性肝病、肝癌 NA NA 文本 不适用 NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-09-05
Bacteroides cellulosilyticus-derived 2-hydroxyphenylacetic acid rectifies hepatic lipid homeostasis in MASLD by targeting the PPARγ-CD36 axis
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过人类队列、宏基因组和代谢组学分析,发现纤维素降解拟杆菌及其代谢物2-羟基苯乙酸通过靶向PPARγ-CD36轴调节肝脏脂质稳态,缓解代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 首次揭示纤维素降解拟杆菌及其代谢物2HPAA通过双重调控CD36表达和棕榈酰化,靶向PPARγ-CD36轴来缓解MASLD的机制,为肠道微生物-宿主互作调控肝脏疾病提供了新视角 未提及 阐明肠道微生物及其代谢物在MASLD发生发展中的作用机制 MASLD患者及肠道微生物纤维素降解拟杆菌及其代谢物2-羟基苯乙酸 微生物组学、代谢组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 宏基因组测序、代谢组学分析、单细胞测序、脂质组学分析 NA 宏基因组数据、代谢组数据、单细胞测序数据、脂质组数据 人类队列样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
14 2026-09-05
Single-cell RNA sequencing uncovers an immunosuppressive program in PDAC mast cells: tumour-driven activation, proliferation, and association with Treg recruitment
2026-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了胰腺导管腺癌中肥大细胞的免疫抑制功能,发现其通过与调节性T细胞的MIF-CD74/CXCR4信号轴相互作用,促进免疫抑制微环境 首次通过多数据集整合分析,阐明PDAC中肥大细胞的异质性及其与Tregs的相互作用机制,提出靶向MC-Treg轴的新型免疫治疗策略 基于公共数据集的生信分析及体外共培养实验,需体内实验进一步验证 探索胰腺导管腺癌中肥大细胞的功能异质性及其免疫调节机制 胰腺导管腺癌组织中的肥大细胞亚群及调节性T细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光 NA 基因表达数据、组织图像 多个PDAC单细胞RNA测序数据集(具体样本数未报告) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
15 2026-09-05
Multifunctional nano-vaccines integrating lipid-conjugated tumor antigens with TLR/STING agonists enhance cancer immunotherapy
2026-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 开发了一种名为SPPA的聚合物纳米疫苗,共递送脂质偶联肿瘤抗原和TLR/STING激动剂,增强肿瘤免疫治疗。 提出了一种多价肽和佐剂的纳米平台SPPA,可高效封装并靶向递送脂质偶联肽,同时激活TLR7/8和STING通路,与抗PD-1联合治疗在多种肿瘤模型中效果显著。 摘要未提及具体局限性。 开发一种能克服现有肽疫苗缺陷并增强抗肿瘤免疫应答的纳米疫苗平台。 肿瘤相关新抗原肽、多种肿瘤小鼠模型(4T1、TUBO、LLC1、RENCA) 纳米医学、肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌、肺癌、肾细胞癌 脂质偶联、聚合物纳米技术 NA 空间转录组学数据 四种同基因小鼠模型:4T1、TUBO、LLC1、RENCA(具体数量未说明) NA 空间转录组学 NA NA
16 2026-09-05
Ultrasound-targeted nanodroplets destruction activates CAF_Pi16-CCL7 signalling to enhance NKG2D expression and overcome ICB resistance in MSS CRC
2026-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 开发了超声靶向纳米液滴破坏(UTND)策略联合表面修饰抗PD-L1的纳米液滴(PPP@P@map)以增强微卫星稳定(MSS)结直肠癌的免疫检查点阻断(ICB)响应性,并揭示了相关机制 首次提出UTND联合PPP@P@map策略增强MSS结直肠癌ICB响应性,并发现CAF_Pi16-CCL7信号轴通过上调NKG2D表达促进抗肿瘤免疫,为克服ICB耐药提供新机制 研究主要在免疫缺陷小鼠模型中进行,尚需临床验证;机制研究可能未涵盖所有免疫抑制途径 评估UTND联合PPP@P@map对MSS结直肠癌ICB响应性的增强效果,并阐明其免疫学机制 CT26和CMT93小鼠皮下MSS结直肠癌模型,肿瘤相关成纤维细胞亚群CAF_Pi16,CD8+ T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光,超声靶向纳米液滴破坏技术 NA 图像,文本序列数据 涉及两种小鼠模型(CT26和CMT93)及体外纯化的CD8+ T细胞,具体样本数未提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序
17 2026-09-05
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用离体和活体模型探讨维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 首次在离体和活体模型中证明维生素D缺乏比雄激素缺乏更严重地阻碍前列腺腔上皮细胞分化,并发现长期维生素D处理对人前列腺癌细胞的不同影响 未提及具体局限性 研究维生素D缺乏对前列腺生物学和癌症进展的作用机制 小鼠前列腺类器官、小鼠模型、人前列腺癌细胞系MDA-PCa-2b和22Rv1 机器学习和数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、RNA测序 类器官和异种移植模型 基因表达数据 小鼠前列腺类器官、小鼠、两种人前列腺癌细胞系 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
18 2026-09-05
GliomaDeconv maps glioma-specific cellular programs from bulk transcriptomic profiles and reveals spatiotemporal associations with progression and treatment response
2026-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 建立了GliomaDeconv,一种基于多亚型单细胞RNA测序数据、采用概率反卷积架构的胶质瘤特异性参考和解析框架,用于从批量转录组数据中绘制胶质瘤细胞程序,并揭示其与疾病进展和治疗反应的时空关联。 首次建立胶质瘤特异性的批量RNA测序反卷积参考框架,将单细胞分辨率与大队列转录组学相结合,系统解析恶性细胞状态和肿瘤相关巨噬细胞亚群,并揭示其空间组织和动态演变。 主要依赖转录组数据,尚未包含蛋白或表观遗传层面的信息,可能影响对细胞状态的全面刻画。 开发一种胶质瘤特异性的反卷积工具,以批量RNA测序数据解析肿瘤微环境中的细胞组成和空间组织,从而桥接单细胞分辨率与大队列转录组分析。 胶质瘤组织样本,包括多亚型单细胞RNA测序数据集、IVY GAP空间注释数据集和大型批量RNA测序队列,以及原位异种移植模型。 基因组学及生物信息学 胶质瘤 RNA-seq(批量RNA测序、单细胞RNA测序) 概率反卷积模型 转录组数据(单细胞测序和批量测序) 多亚型单细胞RNA测序数据集、IVY GAP空间注释数据集、大型批量RNA测序队列(具体样本数未在摘要中提及) NA RNA-seq(单细胞RNA-seq和批量RNA-seq) NA NA
19 2026-09-05
GSN liquid-liquid phase separation induces PANoptosis by inhibiting YAP-dependent glycolysis to alleviate the progression of clear cell renal cell carcinoma
2026-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究筛选了与PANoptosis相关的生物标志物基因,并探讨其在透明细胞肾细胞癌中的预后意义及潜在机制。 首次揭示GSN液-液相分离通过抑制YAP依赖性糖酵解直接诱导PANoptosis,为ccRCC提供新的治疗靶点。 研究可能受限于样本量和外部验证的缺乏,需要进一步的多中心研究确认。 筛选PANoptosis相关基因并构建预后模型,探讨GSN在ccRCC中的机制。 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本及细胞/动物模型。 生物信息学 透明细胞肾细胞癌 转录组测序,单细胞RNA测序,生存分析 Cox回归模型 基因表达数据,临床数据,单细胞数据 未明确提及具体样本数。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-09-05
Deciphering CD8+ T cell exhaustion in human cancers through single-cell and spatial transcriptomics
2026-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文综述了通过单细胞和空间转录组学技术解析人类癌症中CD8+ T细胞耗竭状态的最新进展,强调了这些技术在揭示Tex细胞异质性、功能特征及与其他细胞相互作用方面的价值 整合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统阐述Tex细胞亚群特异性标志基因、调控通路和空间分布,并强调其耗竭状态的可塑性和靶向治疗潜力 Tex细胞的基因组特征、表观遗传调控和空间互作机制仍需进一步探索 总结高分辨率组学技术在剖析Tex细胞异质性、功能特征及相互作用中的进展,为优化靶向Tex细胞的肿瘤免疫治疗策略提供理论基础和方向指导 人类癌症中的CD8+ T细胞耗竭亚群及其与其他免疫细胞、肿瘤细胞和基质细胞的相互作用 数字病理学 癌症 scRNA-seq、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
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