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当前共找到 36146 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-10 |
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
DOI:10.1080/10641963.2026.2627352
PMID:41655191
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学数据和机器学习方法，识别了四个内皮细胞相关生物标志物（ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST），这些标志物连接了动脉粥样硬化进展与免疫微环境失调 | 首次结合高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）和机器学习（LASSO回归、SVM-RFE）从单细胞数据中筛选内皮细胞特异性诊断标志物，并探索其与免疫细胞浸润的关联及潜在治疗药物的结合能力 | 研究基于生物信息学分析，缺乏体内或体外实验验证；样本来源和数量未明确说明；药物结合预测仅通过分子对接模拟，需实验验证 | 识别动脉粥样硬化的内皮细胞相关诊断生物标志物，并阐明其与免疫微环境失调的关联 | 动脉粥样硬化患者的内皮细胞及免疫微环境 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、差异表达分析、LASSO回归、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、CIBERSORT算法、分子对接模拟 | LASSO回归、SVM-RFE | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-10 |
Cutting-Edge Technologies to Decode Tumor Microenvironment in Multiple Myeloma
2026-Mar, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70171
PMID:41655245
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综述 | 本文综述了利用单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术和先进成像等技术解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境的最新进展 | 整合了多种前沿技术来高分辨率映射肿瘤微环境，并强调人工智能在数据整合和预测中的应用，以推动精准医疗 | 技术复杂性高、资源需求大且缺乏稳健的标准化，限制了其立即的临床应用 | 解析多发性骨髓瘤的肿瘤微环境以推动精准医疗发展 | 多发性骨髓瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术、先进成像、机器学习 | 机器学习 | 单细胞数据、批量数据、空间数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3 | 2026-02-10 |
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114397
PMID:41660258
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，识别并验证了一个用于颈动脉狭窄诊断的细胞死亡相关基因标志物 | 首次将10种机器学习算法组合成105种模型配置，通过共识学习策略从1258个细胞死亡相关基因中筛选出跨队列一致的诊断标志物，并整合了单细胞测序与功能实验验证 | 研究样本量相对有限（696个样本），且部分验证实验仅在细胞水平进行，缺乏大规模前瞻性临床验证 | 开发用于颈动脉狭窄早期诊断的分子工具 | 颈动脉狭窄患者与对照样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 | 逻辑回归与10种机器学习算法的组合模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | 696个样本（包含一个内部队列和八个公共数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-10 |
Single-cell analysis reveals the diversity of human fetal membrane and adjacent placental cells with preterm premature rupture of membranes
2026-Feb-09, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf143
PMID:41319021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早产胎膜早破（PPROM）患者胎膜及邻近胎盘组织的细胞类型多样性和相互作用差异 | 首次识别出一种名为FABP7+Tb的滋养层细胞新亚型，并发现MMP11在EVT-1中的上调表达可能作为PPROM的诊断生物标志物 | 研究样本仅来源于脐带周围约两厘米的组织，可能无法完全代表整个胎膜及胎盘区域的细胞多样性 | 探索PPROM的细胞组成和遗传变化机制，以寻找早期预测靶点 | 来自足月分娩、早产无胎膜早破及PPROM患者的胎膜及邻近胎盘组织 | 数字病理学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 来自三组患者（FTIL、PPWROM、PPROM）的胎膜及邻近胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-10 |
PTEN variant and genetic backgrounds combine to modify cerebellar neuronal differentiation in autism spectrum disorder
2026-Feb-09, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf185
PMID:41370235
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研究论文 | 本研究利用人源iPSC系和小脑类器官模型，探究PTEN基因变异及其遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑神经元的分化 | 首次在人类小脑类器官模型中，结合等基因iPSC系和单细胞RNA测序，揭示了PTEN p.Ile135Leu变异在不同遗传背景下对小脑细胞类型特异性分化和浦肯野细胞电活动的差异影响 | 研究主要关注分化22周前的早期发育阶段，未涵盖小脑成熟的后期过程；类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的细胞相互作用和环路形成 | 探究PTEN基因变异与遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑的分化、发育和神经元网络活动 | 携带PTEN p.Ile135Leu变异或PTEN敲除的等基因人诱导多能干细胞系及其衍生的小脑类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，小脑类器官培养，电生理记录 | 类器官模型 | 基因表达数据，电生理数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了等基因iPSC系（包括对照、PTEN变异、PTEN敲除及PTEN校正的患者来源系） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-10 |
Epithelial HO-1 regulates iron availability and promotes colonic tumorigenesis in a context-dependent manner
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181032
PMID:41410530
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研究论文 | 本研究探讨了结肠上皮细胞中血红素加氧酶-1（HO-1）在结肠炎相关肿瘤发生中的双重作用，揭示了其在急性毒性保护与慢性炎症中促进肿瘤发展的机制 | 首次系统性地揭示了HO-1在结肠肿瘤发生中的背景依赖性作用，即其在急性血红素毒性中具有保护作用，但在慢性炎症环境中却通过铁依赖性氧化损伤促进肿瘤增殖 | 研究主要基于小鼠模型和类器官实验，人类临床样本的直接验证相对有限，且HO-1调控的具体分子通路仍需进一步阐明 | 阐明结肠上皮细胞HO-1在结肠炎相关肿瘤发生中的功能及其机制 | 小鼠结肠上皮细胞、人类结肠上皮类器官、结肠肿瘤组织 | 肿瘤生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、类器官培养、组织学分析 | NA | RNA测序数据、组织图像、生化指标 | 小鼠模型及人类类器官样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-02-10 |
CD8+ T cells cross-restricted by HLA-B*57 and HLA-E*01 recognize HIV Gag with different functional profiles
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189909
PMID:41411059
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研究论文 | 本研究评估了针对HIV Gag表位KF11的CD8+ T细胞在HLA-E和HLA-B57限制下的功能特性差异 | 首次揭示了HIV特异性CD8+ T细胞可同时受HLA-B*57和HLA-E*01:03双重限制，并展示出不同的功能谱 | 样本量较小（仅8名HIV感染者），且仅针对单一表位KF11进行研究 | 探究HIV特异性CD8+ T细胞在非经典HLA-E和经典HLA-B57限制下的功能差异 | HIV感染者的CD8+ T细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，TCR测序，可溶性蛋白分析，HLA-I多聚体技术 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，蛋白质表达数据 | 8名HIV感染者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-10 |
Insights into KIF11 pathogenesis in microcephaly-lymphedema-chorioretinopathy syndrome from a lymphatic perspective
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177656
PMID:41427784
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研究论文 | 本文从淋巴系统角度探讨KIF11基因在微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征中的致病机制 | 首次揭示KIF11基因与淋巴管生成关键因子PROX1和VEGFR3之间的直接联系，并利用患者来源细胞和斑马鱼单细胞RNA测序技术验证其在淋巴系统发育中的作用 | 研究样本量有限，仅基于少数患者和细胞模型，且部分发现（如肠道淋巴管扩张）仅在一名患者中观察到 | 探究KIF11基因突变如何导致淋巴系统功能障碍和淋巴水肿 | 患者来源的淋巴母细胞、人类和小鼠发育组织、斑马鱼胚胎、人类淋巴管内皮细胞 | 分子生物学与遗传学 | 微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征 | 单细胞RNA测序、淋巴闪烁扫描术、免疫印迹、细胞迁移和球体萌发实验 | NA | 基因表达数据、影像数据、细胞功能数据 | 患者来源细胞、斑马鱼胚胎、人类和小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-02-10 |
Intranasal booster drives class switching and homing of memory B cells for mucosal IgA response
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198045
PMID:41433108
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研究论文 | 本研究探讨了鼻内加强免疫如何通过诱导记忆B细胞的IgA类别转换和归巢，促进黏膜sIgA反应，以增强对上呼吸道病原体的免疫保护 | 首次结合MS Ig-seq和scBCR-seq技术鉴定鼻内加强免疫后黏膜特异性sIgA单克隆抗体，并揭示其增强的中和活性及B细胞动态变化机制 | 研究主要基于SARS-CoV-2模型，结果在其他呼吸道病原体中的普适性需进一步验证，样本量相对有限 | 探究鼻内加强免疫诱导人类黏膜sIgA反应的机制 | 人类B细胞，特别是黏膜特异性sIgA单克隆抗体和记忆B细胞 | 免疫学 | 呼吸道感染 | 液相色谱-串联质谱（MS Ig-seq）、单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质组学数据、单细胞测序数据 | 鉴定出42种黏膜特异性sIgA单克隆抗体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞B细胞受体测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-10 |
scII: Dual-Threshold Adaptive Integration of Single-Cell Multiomics Data Driven by Imputation
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02396
PMID:41537610
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研究论文 | 本文提出了一种名为scII的自适应框架，用于整合单细胞多组学数据，特别是基因表达（scRNA-seq）和染色质可及性（scATAC-seq）数据 | 该框架引入了多项关键创新：1) 基于scRNA-seq引导的信号插补以增强scATAC-seq的信息完整性；2) 使用带Maxout激活函数的多层感知器来建模复杂非线性关系并缓解梯度消失问题；3) 动态双阈值自适应选择机制，联合评估跨模态特征相似性和分类可靠性以筛选高质量细胞；4) 基于贝叶斯信息准则（BIC）的优化，根据数据分布动态确定高斯混合模型组件数量，无需手动预设参数 | NA | 开发一种能够高效整合未配对单细胞多组学数据并实现细胞类型注释准确迁移的方法 | 单细胞多组学数据，特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 多层感知器，高斯混合模型 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-10 |
scACAN: An Adaptive Learning Framework Aggregating Local Graph Structure Context for Rare Cell Type Identification
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02735
PMID:41572727
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scACAN的自适应图构建框架，用于增强单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的识别能力 | scACAN通过聚合局部图结构上下文信息设计正样本选择策略，结合自适应采样和基于聚类结果的迭代优化，有效提升了主要和稀有细胞类型的识别性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型分布不均和稀有细胞群体识别困难的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型，特别是稀有细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自适应图构建框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-02-10 |
First-in-child phase I trial of p-STAT3 inhibitor WP1066 in pediatric brain tumor patients
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194823
PMID:41379553
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研究论文 | 本文报告了口服p-STAT3抑制剂WP1066在儿童脑肿瘤患者中的首次儿童I期临床试验，评估其安全性、最大可行剂量及抗肿瘤免疫反应 | 首次在儿童脑肿瘤患者中进行WP1066的I期临床试验，并利用单细胞RNA测序分析外周血单核细胞以验证STAT3活性的系统性抑制 | 样本量较小（10名患者），为单中心、单臂试验设计，可能限制结果的普遍性 | 评估WP1066在儿童脑肿瘤患者中的安全性、最大耐受剂量/最大可行剂量，并探索其抗肿瘤免疫效应 | 儿童脑肿瘤患者，包括H3.3G34R/V突变高级别胶质瘤患者 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 10名患者参与临床试验，另加3名同情使用患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-02-10 |
CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39168-1
PMID:41656346
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-02-10 |
Spatial transcriptomics identifies differentiation, lipid metabolism, and retinoid pathway alterations in acne vulgaris
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198021
PMID:41657309
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了痤疮（包括粉刺型和脓疱型）中皮脂腺分化、脂质代谢和视黄醇信号通路的基因表达变化 | 开发了专门的分割流程以改进空间复杂皮脂腺中的转录本分配，并首次在皮脂细胞中识别出PPARG+过渡性基底细胞状态 | 研究样本量有限，且主要基于定制面板靶向特定通路，可能未覆盖所有相关基因 | 探究痤疮（包括炎症性和非炎症性病变）的发病机制及潜在治疗靶点 | 健康皮肤、非病变皮肤、粉刺型痤疮皮肤和脓疱型痤疮皮肤 | 数字病理学 | 痤疮 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但包括健康、非病变、粉刺型和脓疱型痤疮皮肤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-02-10 |
Mouse skeletal muscle satellite cells co-opt the tenogenic gene Scleraxis to instruct regeneration
2026-Feb-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95854
PMID:41660703
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠骨骼肌卫星细胞在再生过程中利用肌腱基因Scleraxis来指导肌肉修复 | 发现Scleraxis在成年肌肉干细胞中的表达模式及其对肌肉再生的关键作用，揭示了再生与发育过程中该基因的不同调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 探究骨骼肌再生过程中转录因子Scleraxis的功能与机制 | 成年小鼠骨骼肌卫星细胞 | 发育生物学 | 肌肉损伤 | 单细胞RNA测序, CUT&RUN | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-02-10 |
LncRNAs at the Frontline of Neuroimmune Crosstalk in Oral Cancer
2026-Feb-09, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxag007
PMID:41660801
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综述 | 本综述探讨了长链非编码RNA（lncRNA）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）神经-免疫-癌症轴中的关键调控作用 | 不同于以往孤立探讨神经元或免疫机制的研究，本文聚焦于lncRNA可能调控的神经免疫交汇通路，并提出了可验证的假设 | 缺乏OSCC特异性的功能研究、lncRNA活性的空间或单细胞分辨率数据，以及评估lncRNA驱动神经周围侵袭的体内模型有限 | 阐明lncRNA在OSCC神经免疫串扰中的调控机制，以识别新的生物标志物和治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC） | 自然语言处理 | 口腔癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-02-10 |
Single-cell RNA sequencing unveils CCDC86-driven immune modulation and antigen-presenting cell dynamics in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04134-2
PMID:41661401
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，揭示了CCDC86基因在头颈部鳞状细胞癌免疫微环境中的表达模式及其在抗原呈递细胞动态和免疫调节中的关键作用 | 首次在HNSCC中表征了CCDC86基因的表达模式，并揭示了其在抗原呈递细胞中的特异性表达及其通过调控转录活性、代谢重编程和配体-受体网络来调节APC-T细胞相互作用的双重免疫调节潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于FaDu细胞系的qPCR，缺乏体内功能验证和临床样本的直接验证 | 阐明CCDC86基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达模式及其免疫学功能 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是抗原呈递细胞（APCs） | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，qPCR | NA | RNA测序数据，单细胞转录组数据 | 来自TCGA的bulk RNA-seq数据和GEO数据库的单细胞RNA-seq数据（GSE139324），以及FaDu细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-02-10 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics with pan-cancer bulk sequencing identifies OSR2 as a multifaceted biomarker for prognosis and tumor immunity
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04595-z
PMID:41661456
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-02-10 |
Integrating Spatial Proteogenomics in Cancer Research
2026-Feb-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520744
PMID:41655216
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综述 | 本文综述了空间蛋白质组学在癌症研究中的整合应用，包括其演变、关键进展及未来方向 | 整合空间蛋白质组学与其他数据模态（如空间转录组学、代谢组学），利用AI驱动框架揭示肿瘤异质性和微环境动态变化，并探索低丰度“暗蛋白质组” | 面临分辨率、标准化和数据复杂性等挑战 | 推动癌症诊断、个性化免疫治疗和药物开发的突破 | 肿瘤组织及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间蛋白质组学、空间转录组学、空间代谢组学、AI分析 | 传统机器学习算法、AI驱动框架（如KRONOS、HEIST） | 蛋白质、RNA、代谢物等多模态空间数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学、空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-02-10 |
A Comprehensive Benchmarking Study on Computational Tools for Cross-omics Label Transfer from Single-cell RNA to ATAC Data
2026-Feb-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag026
PMID:41655240
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研究论文 | 本研究对27种用于从单细胞RNA数据向ATAC数据跨组学标签转移的计算工具进行了全面基准测试 | 首次系统评估多种跨组学标签转移方法，特别关注scRNA-seq到scATAC-seq的数据转换，并识别了最佳性能工具 | 研究可能受限于所选数据集和评估指标，未涵盖所有潜在应用场景 | 评估和比较计算工具在单细胞RNA到ATAC数据标签转移中的性能 | 人类和小鼠组织的单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 深度学习, 分类器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |