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当前共找到 45642 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-11 |
Plcg2 Deficiency Leads to Sex-Associated Divergent Effects on Glial Transcriptomes
2027-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70252
PMID:43001663
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研究论文 | 对野生型、杂合子和纯合子Plcg2缺陷小鼠大脑进行单细胞RNA测序，构建跨基因型和性别的胶质细胞转录组图谱，揭示Plcg2缺失对神经退行性疾病相关通路和性别差异的调控 | 首次在无淀粉样蛋白或tau病理的情况下，系统解析Plcg2缺失对小鼠大脑胶质细胞转录组的生理影响，并揭示基因型与性别的交互作用及性别分层下的差异调控 | 研究基于小鼠模型，未涉及人类样本验证；且未在淀粉样或tau病理背景下进行，可能无法完全反映AD中的实际作用 | 探究Plcg2缺失在无病理条件下对小鼠大脑胶质细胞转录组的影响，并解析基因型与性别的交互作用 | 野生型、杂合子和纯合子Plcg2缺陷小鼠大脑 | 神经科学、单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病、神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型、杂合子和纯合子Plcg2缺陷小鼠大脑（具体样本数未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-11-11 |
Hepatic HSD17B6 promotes lipid accumulation and M1 macrophage polarization via the 9-cis-retinoic acid and RXRα axis
2026-Dec-02, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示肝细胞中HSD17B6通过9-顺式维甲酸和RXRα轴促进脂质积累及M1巨噬细胞极化，从而推动MASH进展 | 首次在MASH中功能性刻画HSD17B6，发现其通过9cRA-RXRα-CXCL10轴连接脂质代谢与炎症，并提出HSD17B6-RXRα作为潜在治疗靶点 | 机制主要基于PDCD4缺陷小鼠模型和体外实验，人体数据以表达验证为主，缺乏直接靶向HSD17B6的体内干预数据 | 探究HSD17B6在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）发病中的作用及分子机制 | PDCD4缺陷小鼠肝脏、人MASH肝样本、小鼠MASH模型及肝细胞模型 | 代谢疾病、肝脏病学、单细胞转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH） | 转录组分析、单细胞RNA测序、HPLC、siRNA沉默、药理学抑制 | PDCD4缺陷小鼠模型、肝细胞增益和缺失功能模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、转录组分析 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-11 |
Exploring the pathogenic mechanism of RNH1 in colorectal cancer based on eQTL, Multi-omics and deep learning
2026-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-01029-4
PMID:41366589
|
研究论文 | 该研究基于eQTL、多组学和深度学习探索RNH1在结直肠癌中的致病机制 | 首次结合SMR、单细胞RNA测序、空间转录组测序和DeepSurv深度学习模型，系统揭示RNH1通过二硫死亡影响结直肠癌肿瘤微环境、代谢通路和免疫逃逸的机制 | 摘要未明确说明样本量有限、qPCR验证样本数量及队列来源，机制结论仍需更大规模队列和功能实验验证 | 探索RNH1在结直肠癌中的致病机制，并评估其作为诊断标志物和潜在治疗靶点的价值 | 结直肠癌患者肿瘤组织和正常组织样本，以及结直肠癌相关多组学数据 | 数字病理、机器学习、多组学 | 结直肠癌 | eQTL、SMR、单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA测序、qPCR | DeepSurv | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-11-11 |
Polyamide-66 microplastics and early-onset ischemic stroke: a systems toxicology, multi-omics, and molecular dynamics simulation analysis
2026-Dec, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11672-6
PMID:42530798
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研究论文 | 该研究整合系统毒理学、多组学因果推断和分子动力学模拟，揭示聚酰胺-66微塑料通过星形胶质细胞EPHX2-鞘脂轴促进早发性缺血性卒中的潜在机制 | 首次将系统毒理学、多组学孟德尔随机化与分子动力学模拟相结合，提名星形胶质细胞EPHX2-鞘脂轴作为PA66微塑料促进早发性卒中的机制通路 | 研究主要基于计算机模拟和公共数据集的二次分析，缺乏直接的实验验证和临床队列验证 | 探究聚酰胺-66微塑料暴露与早发性缺血性卒中之间的分子机制和因果通路 | 聚酰胺-66微塑料、早发性缺血性卒中相关基因和蛋白质、脑组织表达数据、小鼠卒中模型数据 | 系统毒理学、多组学、分子流行病学 | 早发性缺血性卒中、心脑血管疾病 | 系统毒理学、多组学因果推断、孟德尔随机化、单细胞eQTL孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟、单细胞RNA-seq | 孟德尔随机化模型、分子对接模型、分子动力学模拟 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质QTL数据、代谢物数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-11-11 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals systemic immune dysregulation and identifies PLEK as a candidate hub gene associated with CD8+ T-cell activation in myasthenia gravis
2026-Dec, Journal of neuroimmunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jneuroim.2026.579077
PMID:42667813
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了重症肌无力患者外周血免疫系统的失调，并鉴定出PLEK是与CD8+ T细胞激活相关的候选枢纽基因 | 首次在单细胞水平系统描绘重症肌无力的免疫失调图谱，结合机器学习与WGCNA鉴定出PLEK作为与CD8+效应T细胞激活和疾病严重程度相关的枢纽基因 | 摘要未明确提及研究局限性 | 解析重症肌无力患者外周血的系统性免疫图谱及潜在分子机制 | 重症肌无力患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 206,472个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-11-11 |
Systems biology and single-cell transcriptome analysis identify potential therapeutic targets and impaired neurogenesis in human cortical development related to autism spectrum disorder
2026-Dec, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11612-4
PMID:42319587
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序和系统生物学方法分析人类皮层发育过程中的神经发生通路，以识别与自闭症谱系障碍相关的潜在治疗靶点 | 结合单细胞转录组分析与系统生物学方法，揭示了ASD相关皮层发育中受损的神经发生过程，并通过虚拟药物筛选、分子对接和分子动力学模拟发现维A酸与RACK1的稳定结合 | 研究基于体外人类皮层发育数据集，缺乏体内实验验证；药物靶点结合仅通过计算机模拟证实，未进行实验验证 | 探索与自闭症谱系障碍相关的人类皮层发育中的调控网络和细胞异质性，识别潜在治疗靶点和神经发育通路 | 人类皮层发育过程中的神经祖细胞和分化神经元群体 | 单细胞转录组学、系统生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序、系统生物学分析、轨迹推断、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、分子对接、分子动力学模拟 | Seurat聚类分析、轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-11-11 |
PFOS exposure is linked to immune-metabolic disruption in MASLD: integrated population, computational, and experimental evidence
2026-Dec, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11727-8
PMID:42701175
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研究论文 | 本文结合人群流行病学、网络毒理学、机器学习、转录组分析、单细胞映射、分子对接和实验验证，探究PFOS暴露与MASLD相关的免疫代谢紊乱及其分子机制 | 构建了整合人群、计算与实验证据的分析框架，首次用机器学习从PFOS-MASLD重叠基因中筛选出五个候选基因，并结合单细胞分析和分子对接揭示细胞类型特异性及PFOS-蛋白相互作用 | 研究结果属于假设生成性质，仍需前瞻性研究和直接机制验证；五基因模型在特定转录组数据集中表现出的AUC可能高估，缺乏外部验证 | 评估PFOS暴露与MASLD的关联，并揭示其潜在的分子机制和免疫代谢框架 | NHANES人群数据、转录组数据、单细胞数据、小鼠暴露模型 | 机器学习, 环境毒理学, 转录组学, 单细胞分析 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | NHANES流行病学分析, 网络毒理学, LASSO, SVM-RFE, 转录组分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, RT-qPCR, 动物实验 | LASSO, SVM-RFE, 机器学习模型 | 流行病学数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 分子对接结构数据, 实验数据 | NHANES n=1,834，874个PFOS-MASLD重叠基因，12周小鼠暴露模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 8 | 2026-11-11 |
Exploring the molecular mechanism of benzo[a]pyrene affecting prostate cancer based on network toxicology and external validation
2026-Dec, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11729-6
PMID:42776424
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研究论文 | 本研究结合网络毒理学、机器学习、转录组验证、免疫浸润评估、单细胞分析、分子对接及外部验证，系统探索苯并[a]芘暴露与前列腺癌关联的分子机制 | 首次综合运用网络毒理学、机器学习、单细胞分析和分子对接等多种方法系统揭示苯并[a]芘影响前列腺癌的分子机制，并通过外部验证确认核心基因表达变化 | 研究主要基于生物信息学分析和计算预测，缺乏大规模临床队列验证和体内外功能实验的直接证据 | 系统探索苯并[a]芘暴露与前列腺癌发生发展之间的分子机制 | 苯并[a]芘暴露相关的前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 网络毒理学, 机器学习, 转录组分析, 单细胞测序, 分子对接 | 机器学习 | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-11-11 |
CCND1 Mitigates Ischemia-Induced Pathological Cardiac Remodeling by Promoting Cardiac Monocyte-Derived Macrophage Transition to a Reparative Phenotype
2026-Nov-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究CCND1通过促进心脏单核细胞来源巨噬细胞向修复表型转变来减轻缺血诱导的病理性心脏重构 | 首次揭示CCND1-PDK4轴在心肌梗死后巨噬细胞代谢重编程和表型转变中的关键作用，独立于CCND1经典的细胞周期调控功能 | 未明确说明研究样本量及具体实验条件，缺乏长期临床随访数据 | 探究心肌梗死后募集单核细胞来源巨噬细胞获得修复表型的机制，并评估CCND1-PDK4轴作为治疗靶点的潜力 | 心肌梗死患者外周血单个核细胞、小鼠心脏单核细胞来源巨噬细胞、巨噬细胞特异性Ccnd1敲除小鼠 | 心血管疾病研究、免疫学 | 心血管疾病、心肌梗死 | 单细胞RNA测序、遗传谱系追踪、骨髓移植、代谢物 profiling、细胞表型分析、表观遗传学实验、慢病毒靶向治疗 | NA | 基因表达数据、代谢数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-11-11 |
Harnessing single-cell omics for farmed animal improvement and human health
2026-Nov-10, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01516-6
PMID:43004371
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术、参考细胞图谱项目及其与群体/数量遗传学的整合，并讨论了人工智能和预测性扰动建模如何重塑单细胞研究 | 系统总结了单细胞组学在农业动物改良和人类健康中的应用前景，提出了群体规模单细胞组学、AI驱动的虚拟细胞/组织以及基因型-细胞/组织-表型框架的未来方向 | 作为综述文章，未提供原始实验数据或新的分析结果 | 探讨单细胞组学技术如何推动农业动物改良和人类生物医学研究 | 多种物种的单细胞图谱及复杂性状和疾病 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | 人工智能模型、预测性扰动模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-11-11 |
miR-155 expression associates with pathogenic circulating follicular helper T-cell phenotype in myasthenia gravis
2026-Nov-10, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxag076
PMID:43004902
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研究论文 | 本研究探讨了重症肌无力（MG）患者外周血单个核细胞中miR-155和miR-146a的表达及其与致病性循环滤泡辅助性T细胞（cTfh）表型的关联 | 首次将PBMC水平的miRNA表达与ICOShighcTfh频率相关联，并结合公共scRNA-seq数据验证MIR155HG在Tfh样CD4+ T细胞簇中的高表达，同时发现免疫治疗后miR-155水平随ICOShighcTfh减少而下降 | 样本量较小（24例MG患者和12例健康对照），scRNA-seq分析基于公共数据而非本研究自产数据，未进行功能验证实验 | 探究miRNA（miR-146a和miR-155）是否影响MG中Tfh细胞的偏移及其与致病性cTfh表型的关系 | 24例抗乙酰胆碱受体抗体阳性的重症肌无力患者和12例健康对照的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 重症肌无力 | 实时荧光定量PCR，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 24例MG患者和12例健康对照的PBMC样本，以及公共MG患者PBMC的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RT-qPCR | NA | 实时PCR系统用于miRNA表达分析，公共scRNA-seq数据用于细胞类型特异性MIR155HG表达分析 |
| 12 | 2026-11-11 |
scGWAS-DB: an integrated database bridging GWAS to tissue-resolved single-cell contexts
2026-Nov-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1128
PMID:43006145
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研究论文 | 该论文介绍了一个整合数据库scGWAS-DB，将全基因组关联研究（GWAS）与单细胞RNA测序数据相结合，用于在组织分辨的细胞背景下解析复杂性状的遗传结构 | 首次构建了连接群体规模遗传学与单细胞生物学的整合数据库，能够识别性状-细胞类型关联中的枢纽基因、解析基因-基因互作拓扑结构，并检测跨多个性状的共享基因 | 摘要中未明确提及研究限制 | 构建一个整合数据库，将GWAS数据与单细胞图谱相结合，系统解释复杂性状的细胞基础， prioritization枢纽基因和细胞类型以支持药物靶点开发和疾病相关细胞回路发现 | 3,649个高质量GWAS数据集和涵盖74种人类组织和1,713种细胞类型的单细胞图谱 | 机器学习, 数字病理学, 基因组学 | 复杂疾病, 多种疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 基因表达数据 | 3,649个GWAS数据集，74种人类组织，1,713种细胞类型，213,992个显著三元组，821,480个基因-基因互作 | NA | 单细胞RNA-seq, GWAS | NA | NA |
| 13 | 2026-11-11 |
Gene Expression Nebulas 2.0: an updated resource of gene expression profiles by incorporating more datasets, annotations, and functionalities
2026-Nov-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1131
PMID:43006148
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研究论文 | 本文介绍了基因表达星云数据库2.0版本的更新，该数据库是一个开放获取的转录组数据资源，提供跨物种的标准化基因表达谱和人工整理的元数据 | 数据集从323个扩展到668个，样本从50500增加到102679，细胞从15540169增加到23461252，物种从30个扩展到100个；新增空间转录组数据和疾病相关表达注释，涵盖12个疾病系统的62个疾病类别；提供用于人工智能应用的高质量基因表达谱；新增基于网络的转录组数据提交服务和更新的在线分析工具，支持跨物种、组织和疾病的基因表达比较 | 摘要中未提及具体限制 | 构建一个全面、标准化的跨物种基因表达数据库，为揭示分子功能机制和解码复杂调控架构提供基础资源 | 跨物种转录组数据，包括668个数据集、102679个样本、23461252个细胞，涵盖100个物种 | 转录组学 | 多种疾病类别，涵盖62个疾病类别、12个疾病系统 | bulk RNA-seq、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因表达谱数据、转录组数据、文本（元数据） | 668个数据集，102679个样本，23461252个细胞，涵盖100个物种 | NA | bulk RNA-seq、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-11-11 |
iCellOmics: connecting multi-omics profiles and phenotype evidence across industrially relevant cell lines
2026-Nov-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1148
PMID:43006152
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研究论文 | 本文介绍了iCellOmics数据库，该数据库整合了工业相关细胞系的多组学数据和文献来源的表型信息，并提供在线分析工具 | 首次将工业相关细胞系的基因组、转录组、表观基因组等多组学数据与文献整理的表型信息整合到一个统一的数据和分析框架中，并提供在线GO和KEGG富集分析工具 | 当前版本仅涵盖17个细胞系和7个物种，表型关系来自文献整理，可能受文献覆盖度和标准化程度限制 | 构建一个开放获取的数据库，整合工业相关细胞系的多组学数据和表型证据，支持细胞系工程和改良生产细胞系的开发 | 工业相关细胞系，包括生物制品、疫苗和病毒载体的生产宿主以及生物医学模型 | 多组学数据库 | NA | 多组学数据整合，包括基因组、转录组、表观基因组、单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | 多组学数据（基因组变异、基因表达、单细胞转录组、ATAC-seq峰、文献表型关系） | 17个细胞系，7个参考基因组，144018个蛋白编码基因，170408888个基因组变异，673个差异表达比较，30个单细胞RNA-seq BioProjects包含1047274个细胞，287089415个ATAC-seq峰，37213个文献整理的基因-表型关系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-11-11 |
CDKN1A Mediates Regulated Cell Death in Osteoblasts and Exacerbates Periapical Bone Destruction in Apical Periodontitis
2026-Nov-10, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70304
PMID:43006281
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研究论文 | 本文研究CDKN1A如何介导成骨细胞的调节性细胞死亡，并加重根尖周炎中的根尖周骨破坏。 | 首次明确CDKN1A（p21）在根尖周炎成骨细胞损伤和调节性细胞死亡中的作用，并揭示其通过促进凋亡和焦亡、抑制坏死性凋亡和铁死亡而加重骨破坏的机制。 | 摘要未提及具体样本量及机制细节，研究主要基于P. gingivalis单菌感染模型，可能无法完全反映根尖周炎复杂的多微生物感染环境。 | 探讨CDKN1A在根尖周炎成骨细胞调节性细胞死亡及根尖周骨破坏中的作用与机制。 | 人根尖周病变组织、MG63和MC3T3-E1成骨细胞、P. gingivalis感染模型及大鼠根尖周炎模型。 | 数字病理, 单细胞组学, 骨生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, DIA蛋白质组学, Western blot, 慢病毒沉默, AAV介导过表达, micro-CT, 组织形态学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-11-11 |
Ruxolitinib improves outcomes in association with altered fibroblast immunobiology in mouse models of Sjögren's disease
2026-Nov-10, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keag619
PMID:43007319
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研究论文 | 该文研究JAK抑制剂鲁索替尼对舍格伦病模型小鼠的治疗效果及其对成纤维细胞免疫生物学的影响 | 揭示了鲁索替尼通过改变颌下腺成纤维细胞-免疫细胞相互作用改善疾病，并提示疗效可能依赖于舍格伦病亚群 | 仅在小鼠模型中进行，未在人类患者中验证；鲁索替尼对NOD.B10模型无效，疗效机制尚未完全阐明 | 探究鲁索替尼治疗舍格伦病模型小鼠的疗效及其对成纤维细胞免疫生物学的影响 | NOD.B10和Aec舍格伦病模型小鼠 | 免疫学、空间转录组学 | 舍格伦病 | 空间转录组测序、流式细胞术、免疫荧光、组织学 | NA | 图像、文本 | 两种舍格伦病模型小鼠（NOD.B10和Aec），分别接受载体或鲁索替尼治疗两周 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-11-11 |
Finding MES: A hidden cell state in neuroblastoma
2026-Nov-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.09.015
PMID:42933392
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评论 | 该文评论了Patel等人在《Cancer Cell》上发表的研究，该研究整合bulk和单细胞/单核RNA测序与空间转录组和空间蛋白质组，在神经母细胞瘤患者来源异种移植瘤和标注肿瘤中揭示肾上腺素能和间充质特征，识别体内不同的肿瘤细胞群体，并展示其与患者预后的关联。 | 整合bulk和单细胞/单核RNA测序与空间转录组和空间蛋白质组，跨神经母细胞瘤PDX和标注肿瘤发现隐藏的间充质细胞状态（MES），识别体内不同肿瘤细胞群体并关联患者预后。 | 作为评论文章，未提供原始数据或实验细节；原文研究可能受限于PDX模型与患者肿瘤的差异、样本量以及空间多组学技术的分辨率。 | 揭示神经母细胞瘤中肾上腺素能和间充质细胞状态，识别体内不同肿瘤细胞群体，并评估其与患者预后的关联。 | 神经母细胞瘤患者来源异种移植瘤（PDX）和标注肿瘤。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | bulk RNA-seq，单细胞/单核RNA-seq，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | 文本，图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-11-11 |
Spatial omics resolves adrenergic and mesenchymal cell states in neuroblastoma
2026-Nov-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.09.008
PMID:42849441
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研究论文 | 该研究利用单细胞/单核RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学分析54例神经母细胞瘤，揭示肾上腺素能（ADRN）和间充质（MES）细胞状态的空间分布及其与临床预后的关系 | 发现已建立的细胞系来源基因表达特征无法识别MES神经母细胞瘤细胞，转而从早期传代原位患者来源异种移植瘤中开发ADRN/MES特征，成功识别MES肿瘤细胞并经转录组、表观基因组、蛋白质组、超微结构和功能实验验证；同时揭示高MES基因表达与较差的无事件生存和总生存相关 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征神经母细胞瘤患者内和患者间的细胞异质性，明确ADRN和MES细胞状态在患者肿瘤中的存在及其临床相关性 | 54例神经母细胞瘤肿瘤样本，涵盖广泛的临床、遗传和组织学特征 | 空间组学、单细胞组学、肿瘤生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞/单核RNA测序（sc/snRNA-seq）、批量RNA测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、空间蛋白质组数据、图像 | 54例神经母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-11-11 |
Integrative Network Pharmacology and Transcriptomic Analysis Prioritizes CCR1 and C5AR1 as Candidate Thromboinflammatory Targets Shared by Panax notoginseng Saponins and Stroke-Relevant Drugs in Ischemic Stroke
2026-Nov-09, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02625-7
PMID:43002322
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研究论文 | 该文通过整合网络药理学、转录组数据和分子对接，筛选出CCR1和C5AR1作为三七皂苷与卒中相关药物共享的候选血栓炎症靶点 | 首次整合网络药理学、bulk转录组、单细胞RNA测序、调控网络分析和分子对接，系统识别三七皂苷与16种卒中相关药物共享的血栓炎症靶点，并优先排序CCR1和C5AR1 | 研究为假设生成性质，未验证药理协同作用、直接受体偶联或因果治疗机制 | 识别三七皂苷与卒中相关药物在缺血性卒中中共享的分子靶点，聚焦血栓炎症过程 | 缺血性卒中相关的差异表达基因、三七皂苷及16种卒中相关药物的预测靶点、髓系细胞亚群 | 网络药理学 | 缺血性卒中 | 网络药理学, bulk转录组分析, 单细胞RNA测序, 调控网络分析, 分子对接 | NA | 文本, 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-11-11 |
Single-cell and spatial transcriptomics define a C3-centred multicellular ecology in colorectal liver metastasis
2026-Nov-09, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02124-3
PMID:43002319
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研究论文 | 该研究整合单细胞图谱、空间转录组和bulk队列生存分析，定义了结直肠癌肝转移中以C3为中心的多细胞生态 | 整合136,995细胞单细胞图谱与四个空间转录组切片，利用cNMF解析三种复发性恶性程序（C1增殖-生物合成、C2 AP-1应激-炎症、C3分泌-侵袭免疫样），揭示C3为中心的 multicellular ecology 及INHBA-CST6-LBH-FSTL3评分与复发关联 | C3细胞整体稀少且丰度依赖供体，C1-to-C3排序为伪时间关联而非证实的时间进程，空间关联依赖C3测量方式，外部验证仅部分支持且未证明优于临床变量，虚拟敲除和LINCS筛选仅提名候选而无靶点结合证据 | 解析结直肠癌肝转移中上皮、基质、血管和髓系状态组装的空间原则，并提名复发相关特征和网络层面候选靶点 | 结直肠癌肝转移（CRLM）肿瘤组织及bulk队列 | 数字病理, 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 结直肠癌, 肝癌转移 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, cNMF, 空间去卷积, 伪时间分析, 虚拟敲除, LINCS筛选 | cNMF, 空间去卷积, 伪时间分析, 生存分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, bulk转录组数据, 临床生存数据, 图像 | 136,995个单细胞，4个空间转录组切片，TCGA和GSE39582 bulk队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |