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当前共找到 42205 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-11 |
M1 polarization accelerated bone aging through inflammatory signaling transduction regulated by cells crosstalk
2026-Oct-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117114
PMID:42419146
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老过程中骨免疫交叉对话的机制，发现M1巨噬细胞极化加速骨老化，并提出TREM2-DAP12-SYK信号通路作为治疗老年性骨质疏松的新靶点 | 首次在老年骨中发现M1巨噬细胞增多，并通过单细胞测序筛选出TREM2、TYROBP、SYK和PIK3CD四个共同差异表达基因，揭示TREM2-DAP12-SYK轴调控M1极化在骨老化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本的关联性分析，缺乏对信号通路的深入分子机制验证，且单细胞数据来源为公共数据库（GSE145477），可能存在样本异质性 | 阐明衰老过程中骨免疫细胞间相互作用的变化机制，并寻找老年性骨质疏松的潜在治疗靶点 | 老年骨组织、巨噬细胞、骨髓间充质干细胞及共培养系统 | 免疫学、细胞生物学 | 老年性骨质疏松 | 单细胞测序、转录组分析、共培养实验、条件培养基实验、药理学激活 | NA | 基因表达数据、临床数据、实验数据 | 临床样本为老年人群，动物样本为老年小鼠，具体数量未在摘要中提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用公共数据集GSE145477进行单细胞测序数据分析 |
| 2 | 2026-08-11 |
Targeting Grx1 by hyperoside regulates Ncf4 post-translational modification to enhance mitophagy and accelerate diabetic wound healing
2026-Oct-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117074
PMID:42361530
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研究论文 | 本研究旨在探讨金丝桃苷通过调节Grx1对Ncf4的翻译后修饰以增强线粒体自噬，从而加速糖尿病伤口愈合的疗效及其分子机制 | 首次发现金丝桃苷通过靶向Grx1/Ncf4/Bnip3l轴，将Ncf4的翻译后修饰从磷酸化转变为谷胱甘肽化，抑制NOX2激活并增强Bnip3l介导的线粒体自噬，逆转巨噬细胞功能障碍，从而促进糖尿病伤口愈合 | 研究主要基于2型糖尿病小鼠模型，未涉及人类样本验证；且未深入探讨金丝桃苷在不同糖尿病阶段或不同伤口类型中的效果差异 | 评估金丝桃苷对糖尿病伤口愈合的促进作用，并阐明其分子机制 | 2型糖尿病小鼠伤口模型及高糖刺激的骨髓来源巨噬细胞 | 分子生物学、蛋白质组学、单细胞转录组学 | 糖尿病伤口 | DIA定量蛋白质组学、单细胞RNA测序、分子动力学模拟、CETSA/DARTS、免疫共沉淀、Grx1功能获得/丧失实验 | 小鼠模型、细胞模型 | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、分子动力学模拟数据 | 未明确说明样本数量，但涉及2型糖尿病小鼠模型和高糖刺激的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-08-11 |
ANXA2+/TNR- glioblastoma subpopulation drives tumor progression through via Src-STAT3 axis and neutrophil remodeling
2026-Oct-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117075
PMID:42372585
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等手段鉴定ANXA2+/TNR-胶质母细胞瘤亚群，揭示其通过Src-STAT3轴和中性粒细胞重塑驱动肿瘤进展的机制 | 首次鉴定ANXA2+/TNR-胶质母细胞瘤亚群，并阐明其通过Src-STAT3信号轴和诱导中性粒细胞N2极化促进肿瘤干性和免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于体外实验和异种移植模型，需进一步在临床样本中验证其相关性和治疗潜力 | 探究胶质母细胞瘤中ANXA2+/TNR-亚群的功能作用及其驱动肿瘤进展的机制 | 胶质母细胞瘤细胞亚群ANXA2+/TNR-及其与中性粒细胞的相互作用 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能实验、转录组分析、药理学抑制、异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-08-11 |
GPR84 blockade in macrophages mitigates sepsis-induced liver injury via PPARα-driven metabolic reprogramming and M2 polarization
2026-09, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156673
PMID:42263844
|
研究论文 | 本研究探讨GPR84在脓毒症相关肝损伤中的作用机制，发现其通过调节巨噬细胞代谢重编程和M2极化减轻肝损伤 | 首次揭示GPR84-PPARα调控轴是脓毒症相关肝损伤的核心驱动因素，并验证GPR84作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明GPR84在脓毒症相关肝损伤发病机制中的功能作用及其分子机制 | 小鼠脓毒症相关肝损伤模型中的肝巨噬细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关肝损伤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 | NA | 基因表达数据、图像 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-08-11 |
SRLST: a unified multimodal representation learning framework for spatial transcriptomics analysis
2026-Aug-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag524
PMID:42478747
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研究论文 | 提出了SRLST，一种用于空间转录组分析的多模态表征学习框架 | 采用双图变分自编码策略，同时建模空间邻近性和形态学关系，并将基因表达嵌入融合到统一潜在空间 | NA | 精确划分空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 变分自编码器 | 图像和基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-08-11 |
Deciphering spatial heterogeneity by multimodal spatial transcriptomics modelling with SpatialModal
2026-Aug-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag540
PMID:42482153
|
研究论文 | 提出了一种名为SpatialModal的多模态图学习框架，通过层级表示策略和双层级对比学习机制，整合空间转录组数据和组织学图像，以解码复杂组织的空间异质性。 | SpatialModal采用层级表示策略和双层级对比学习机制，有效整合和协同建模多模态ST数据，优于现有方法，并在多种ST平台和数据上展现出鲁棒性和通用性。 | 未提及明确的局限性，但可能依赖于高质量的组织学图像，对无图像的单模态数据仍需保持高效。 | 开发一种能够有效整合空间转录组和图像数据的方法，以精确解析复杂组织中的空间异质性。 | 人类和小鼠的组织样本，包括大脑、乳腺癌、阿尔茨海默病组织以及胚胎心脏。 | 机器学习 | 乳腺癌、阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 图学习框架（可能基于图神经网络） | 图像和基因表达数据 | 未明确提及样本数量，但涵盖了多种组织和物种。 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-08-11 |
Nigrostriatal dopaminergic vulnerability in Parkinson's disease: Neuroprotective strategies
2026-Aug-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00380
PMID:40808403
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综述 | 本文综述了帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元的易损性机制，并评估了新兴的神经保护策略 | 整合单核RNA测序和空间转录组学揭示的特定多巴胺能亚型易损性，提出精准靶向疾病修饰治疗的潜力 | 未提供具体实验数据或临床验证，依赖已发表文献的汇总 | 阐明黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损的机制并评估神经保护策略 | 多巴胺能神经元亚型，如AGTR1+/SOX6+和RIT2+群体 | 神经科学 | 帕金森病 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达和空间转录数据 | NA | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-08-11 |
Single-cell and spatial omics in liver identify cell-cell communication regulators in aging and insulin resistance
2026-08, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156630
PMID:42114673
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学，研究年轻和老年小鼠肝脏细胞组成和分区，揭示衰老和胰岛素抵抗中细胞间通讯的调控机制 | 首次结合单细胞和空间多组学技术，系统解析了肝脏分区在衰老和胰岛素抵抗中的动态变化，并鉴定了HGF信号通路作为关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证；HGF治疗的长期效果和安全性未详细探讨 | 阐明肝脏在衰老过程中如何调节胰岛素抵抗，特别是细胞组成和空间结构的变化及其分子机制 | 年轻和老年小鼠的肝脏组织，包括肝细胞、肝星状细胞等细胞类型 | 单细胞组学、空间转录组学 | 衰老、胰岛素抵抗 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 年轻和老年小鼠，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'、10x Visium空间转录组 |
| 9 | 2026-08-11 |
Islet inflammatory macrophages drive MSC loss and multiple interactions involved in β-cell adaptation during diabetes
2026-08, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156636
PMID:42144182
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序，研究糖尿病进程中胰岛内巨噬细胞和间充质干细胞间的相互作用及其对β细胞适应性的影响 | 首次揭示了胰岛内巨噬细胞与间充质干细胞在糖尿病进展中的动态变化及复杂的旁分泌交互作用，并证明了靶向这一交互作用可恢复β细胞功能和血糖控制 | 未提及 | 探究非β胰岛细胞（特别是巨噬细胞和间充质干细胞）在2型糖尿病进展中对β细胞功能适应性的调控作用 | 2型糖尿病小鼠模型中的胰岛细胞，包括巨噬细胞、间充质干细胞和β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-08-11 |
Macrophage-derived SPP1 promotes subretinal fibrosis by YAP1 phase separation in retinal pigment epithelium
2026-08, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156648
PMID:42162902
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞来源的SPP1通过YAP1液相分离促进视网膜色素上皮细胞下纤维化，阐明了新生血管性年龄相关性黄斑变性向视网膜下纤维化转变的病理机制 | 首次发现SPP1通过CD44/RhoA通路诱导YAP1-2α亚型发生液-液相分离，并与TEAD4协同激活促纤维化基因转录，从而促进RPE细胞上皮间质转化，为SRF进展提供了新的病理机制 | 摘要中未提及研究的局限性 | 阐明脉络膜新生血管向视网膜下纤维化转变的病理机制，特别是巨噬细胞来源的SPP1在其中的作用 | 小鼠巨噬细胞、激光诱导的脉络膜新生血管和视网膜下纤维化模型、视网膜色素上皮细胞 | 分子生物学 | 新生血管性年龄相关性黄斑变性 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Co-IP, Western blotting, 荧光显微镜成像, ATAC-seq | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-08-11 |
One-carbon metabolism upregulated in lupus promotes the differentiation and effector functions of human B and T cells
2026-Aug-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keag381
PMID:42490203
|
研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮中一碳代谢上调对B和T细胞分化及效应功能的影响 | 首次揭示SGOC网络在人类B和T细胞中的上调及其在SLE发病机制中的作用，特别是MTHFD2的升高，为SLE治疗提供了新靶点 | 样本人群有限，未涉及体内实验验证，机制研究停留在体外细胞水平 | 探究SGOC网络在SLE中是否上调及其对人类B和T细胞功能的调控作用 | SLE患者和健康对照者的B和T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RT-qPCR, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, ELISA | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | SLE患者和健康对照者的血液样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 未提供具体平台细节 |
| 12 | 2026-08-11 |
Protocol to stress human primary pancreatic islets with diabetogenic factors for subsequent single-cell RNA sequencing
2026-Jul-30, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104752
PMID:42531125
|
研究论文 | 本文描述了一种用糖尿病致病因子处理人类原代胰岛并进行单细胞RNA测序的方案，以研究1型糖尿病的发病机制。 | 提供了一个详细的实验协议，用于在单细胞水平上分析糖尿病应激因子对人类胰岛细胞的影响。 | 文章仅描述了实验方案，未提供实际实验结果或数据分析。 | 为了解1型糖尿病的起始和进展提供实验方法，通过处理原代人胰岛并分析单细胞转录组。 | 人类尸体原代胰岛细胞，特别是胰岛素分泌的β细胞。 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-08-11 |
A single-nucleus transcriptomic characterization of EGFR G719X/S768I double-mutant lung adenocarcinoma identifies an immunosuppressive niche defined by COL4A3-CD44 interaction
2026-Jul-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102951
PMID:42531730
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研究论文 | 通过单核RNA测序和公共数据整合，表征EGFR G719X/S768I双突变肺腺癌的免疫抑制微环境，并发现由COL4A3-CD44相互作用定义的特殊生态位 | 首次在EGFR双突变肺腺癌中识别出独特的EMT样恶性亚群和COL4A3-CD44介导的恶性-髓系生态位，并揭示其代谢重编程和免疫抑制特征 | 样本量较小（6例双突变和5例无突变），且FFPE组织的snRNA-seq数据可能受固定影响，公共数据的整合可能存在批次效应 | 揭示EGFR G719X/S768I双突变肺腺癌的肿瘤微环境特征和细胞间通讯，以解释其治疗抵抗机制并寻找潜在治疗靶点 | 6例EGFR G719X/S768I双突变和5例无EGFR突变肺腺癌患者的FFPE组织，以及公共数据中的7例EGFR单突变和5例相邻正常组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | snRNA-seq, scRNA-seq, 多重免疫组化, 药物敏感性分析 | NA | 单核转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫组化图像 | 246,086个细胞，来自6例双突变、5例无突变、7例单突变和5例相邻正常样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单核3'试剂盒用于FFPE样本，Illumina NovaSeq用于测序 |
| 14 | 2026-08-11 |
A Multi-omics Regulated Cell Death Framework Defines Immune Phenotypes and Guides Precision Therapy in Colorectal Cancer
2026-Jul-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102948
PMID:42531731
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研究论文 | 构建了以调控性细胞死亡（RCD）为中心的多组学框架，用于结直肠癌（CRC）的分子分型、免疫表型鉴定和精准治疗指导 | 首次提出基于RCD的多组学分型框架，整合转录组、基因组、单细胞和空间转录组数据，并开发了用于免疫治疗反应和生存风险预测的机器学习模型，筛选出候选药物达沙替尼并验证了FSTL3的功能 | 体外实验为主，缺乏体内验证和临床前瞻性研究；分子对接和药物敏感性分析结果需进一步临床验证 | 建立RCD相关多组学分型框架，以改善结直肠癌的分子分层并生成治疗假设 | 结直肠癌样本及其转录组、基因组、单细胞和空间转录组数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | NMF、NNLS、RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组、基因组测序 | 机器学习模型（具体类型未指定，如逻辑回归、随机森林等） | 转录组、基因组、单细胞、空间转录组数据 | 多队列结直肠癌转录组数据，具体样本数未在标题和摘要中给出 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 15 | 2026-08-11 |
MZB1 marks a B-cell-associated stromal-immune microenvironment in cervical squamous cell carcinoma: a multi-omics analysis
2026-Jul-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102944
PMID:42531732
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研究论文 | 通过多组学整合分析，研究了MZB1在宫颈鳞状细胞癌中作为B细胞相关基质-免疫微环境标志物的作用及其与预后的关联 | 首次整合空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组学，全面表征MZB1在宫颈鳞状细胞癌肿瘤免疫微环境中的表达及功能 | 研究结果具有假设生成性质，需要前瞻性临床验证 | 阐明MZB1在宫颈鳞状细胞癌中的表达模式及其与肿瘤免疫微环境和患者预后的关联 | 宫颈鳞状细胞癌肿瘤组织及微环境中的细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、差异表达分析 | NA | 空间蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据、批量转录组学数据 | TCGA队列包含宫颈癌样本，具体数量未在标题和摘要中提供 | NA | 空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-08-11 |
Identification of Potential Biomarkers for Rheumatoid Arthritis Based on Integrated Bioinformatics and Single-Cell RNA-Seq
2026-07-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17070828
PMID:42510868
|
研究论文 | 基于整合生物信息学和单细胞RNA-seq分析，识别类风湿关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | 整合eQTL、pQTL和GWAS数据，通过孟德尔随机化识别可药物基因，并结合单细胞RNA-seq表征细胞类型特异性表达，筛选传统中药化合物 | 研究结果基于计算分析，需进一步实验验证 | 识别类风湿关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点，并探索中药活性化合物 | 类风湿关节炎患者相关基因表达和调控数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA-seq、组织转录组、孟德尔随机化 | 机器学习模型 | 基因表达数据、蛋白质定量数据、单细胞数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-08-11 |
Single-Cell Profiling Identifies a CCR2+ Neutrophil-like Population Associated with Colorectal Cancer Liver Metastasis in a Murine Model
2026-07-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17070831
PMID:42510872
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研究论文 | 使用小鼠模型通过单细胞RNA测序鉴定与结直肠癌肝转移相关的CCR2+中性粒细胞样群体 | 首次在结直肠癌肝转移小鼠模型中鉴定出CCR2+中性粒细胞样群体，挑战了CCR2+促转移髓系细胞仅存在于单核细胞中的观点 | 研究受限于脾切除后肝转移模型，可能不完全代表自然转移过程 | 明确骨髓来源髓系细胞在结直肠癌肝转移前微环境中的转录程序 | MC38脾注射结直肠癌肝转移小鼠模型中的骨髓CD11b+Gr1+髓系细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序、 bulk RNA测序 | 无特定深度学习模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体样本数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、 bulk RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-08-11 |
Whole-body single-cell atlas of an adult vertebrate in homeostasis and regeneration
2026-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703562
PMID:42523349
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研究论文 | 通过区域分层单细胞RNA测序和空间转录组学构建成年脊椎动物全身细胞类型图谱，并研究其稳态与再生过程 | 首次构建了成年脊椎动物的全身单细胞转录组图谱，结合空间转录组学绘制细胞类型和基因表达的空间分布，并揭示再生过程中的表达动态 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 构建成年脊椎动物全身细胞类型转录组图谱，以促进对动物细胞类型组成、组织和进化的理解，并研究再生机制 | 成年斑马鱼（一种小型、透明、可再生的硬骨鱼） | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 成年斑马鱼全身，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-08-11 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals the Immunoregulatory Role of MIF Signaling in Colorectal Cancer
2026-07-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17070817
PMID:42510857
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组数据，系统剖析了结直肠癌微环境的细胞异质性与空间组织特征，并揭示了MIF信号通路在肿瘤免疫调节中的关键作用 | 首次从多维度整合单细胞和空间转录组数据，全面解析了结直肠癌微环境中MIF信号通路的空间分布与细胞通讯机制，并鉴定出MIF-(CD74+CD44)和MIF-(CD74+CXCR4)为主要受体复合物，为结直肠癌治疗提供了潜在靶点 | 研究主要基于公共数据集的整合分析，缺乏实验验证，且样本量有限，结果需进一步在临床样本中验证 | 系统解析结直肠癌微环境的细胞异质性与空间组织特征，阐明MIF信号通路在肿瘤免疫调节中的作用机制 | 结直肠癌原发肿瘤的单细胞RNA测序及空间转录组数据 | 单细胞组学、空间转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-08-11 |
EssentCell: Discovering Essential Evolutionary Relations in Noisy Single-Cell Data
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3691222
PMID:42096398
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研究论文 | 本文提出一种基于整数线性规划的算法EssentCell，用于在噪声单细胞测序数据中确定所有最优系统发育树共有的关键进化关系 | 提出一种高效算法，通过限制假阳性数目，利用整数线性规划确定所有最优解决方案中共同存在的关键进化关系，而非仅重建单一最优树 | 未在文中明确提及局限性 | 研究噪声单细胞测序数据中，在存在多个最优系统发育树情况下，确定细胞间关键进化关系的问题 | 单细胞测序数据矩阵中的细胞及其突变关系 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 整数线性规划 | 二进制矩阵数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |