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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-31 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to reveal prognostic and immune significance of lactylation in breast cancer
2027-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2026.102099
PMID:42959965
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2026-11-01 |
Injectable bioactive glass hydrogels orchestrate metalloimmunotherapy by depleting pathogenic B cells and rescuing bone in rheumatoid arthritis
2027-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.08.057
PMID:42959986
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研究论文 | 本文开发了一种负载Cu/Zn掺杂生物活性玻璃颗粒的可注射温敏水凝胶(BG@HPCH),用于类风湿关节炎的局部金属免疫治疗,通过清除致病性B细胞并促进骨修复 | 首次将Cu/Zn掺杂生物活性玻璃颗粒与羟丙基壳聚糖温敏水凝胶结合,实现局部金属免疫治疗,选择性清除致病性B细胞同时保护间充质干细胞活性,并协调骨再生 | 仅在TNF转基因小鼠模型中验证,缺乏临床数据;单细胞测序仅涉及23,921个关节细胞;长期体内降解和代谢途径未充分阐明 | 开发一种可注射温敏水凝胶用于类风湿关节炎的局部金属免疫治疗,同时实现致病性B细胞清除和骨修复 | 类风湿关节炎(TNF转基因小鼠模型及体外细胞实验) | 生物材料与免疫治疗 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 微CT分析, 流式细胞术, 转录组分析 | NA | 图像, 文本(基因表达数据) | 23,921个关节细胞(单细胞RNA测序);TNF转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-01 |
Targeted insertion of partial CFTR cDNA replicates native CFTR expression with restored channel function in CF airway epithelium
2026-Dec-08, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.103123
PMID:42959355
|
研究论文 | 该研究开发了一种针对囊性纤维化的通用基因编辑疗法,通过靶向整合部分CFTR cDNA到内含子1,恢复CFTR通道功能 | 利用靶向整合部分CFTR cDNA到内含子1的策略,实现几乎不依赖突变类型的治疗,并证明整合后CFTR表达具有细胞类型特异性且染色质结构未受影响 | 研究仅在体外原代气道基底干细胞模型中验证,尚未进行体内实验或临床试验 | 开发一种适用于多种CFTR突变的通用基因编辑疗法 | 囊性纤维化患者原代气道基底干细胞及分化后的气道上皮 | 基因治疗 | 囊性纤维化 | CRISPR/Cas9基因编辑, 慢病毒载体递送, ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-11-01 |
DSSMST: A Deterministic State Space Model for Self-Supervised Spatial Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Dec, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11441-y
PMID:42507063
|
研究论文 | 提出了一种名为DSSMST的自监督学习框架,结合确定性状态空间模型、图神经网络和对比学习,用于空间转录组数据中的空间域识别 | 引入确定性状态空间模型(DSSM)模块,利用其动态建模能力捕获空间梯度变化和连续依赖关系,克服了静态图方法的局限性,并结合定制化的自监督对比学习机制优化潜在嵌入空间 | 摘要中未明确提及 | 准确识别空间转录组数据中的功能区域(空间域) | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 确定性状态空间模型(DSSM)、图神经网络(GNN)、对比学习 | 空间转录组数据 | 多个代表性空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-11-01 |
Transcription factors in liver fibrosis: Mechanistic insights and nanotechnology‑driven therapeutic strategies (Review)
2026-Dec, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.6020
PMID:42924606
|
综述 | 本文综述了转录因子在肝纤维化中的调控机制以及纳米技术驱动的治疗策略 | 系统整合了单细胞组学、空间转录组学和表观基因组学揭示的细胞类型特异性转录因子网络,并探讨了纳米载体递送核酸、通路抑制剂和表观遗传调节剂以实现精准抗纤维化治疗 | 纳米递送系统仍面临生物相容性、靶向效率和临床转化方面的挑战 | 总结转录因子介导的肝纤维化调控机制和基于纳米技术的治疗策略,并展望精准抗纤维化治疗的未来方向 | 肝纤维化及其相关肝细胞和非实质细胞(肝星状细胞、Kupffer细胞、肝窦内皮细胞和胆管上皮细胞) | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞组学, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞组学, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-11-01 |
T-cell states in aortic dissection: from molecular immune profiling toward causal and translational validation
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2753327
PMID:42956058
|
综述 | 该综述评估了人类与实验证据,按疾病阶段、组织区室、功能验证、T细胞特异性和干预时机,区分描述性分析与支持因果及转化推断的证据 | 系统性地按疾病阶段、组织区室、功能验证、T细胞特异性和干预时机对证据进行分层评估,明确提出单细胞与TCR分析仅能识别候选T细胞状态和克隆型而非因果证明,并指出亚急性期可能是研究持续损伤放大性T细胞反应的窗口 | 大多数证据为横断面研究且在临床发病后获取,抗原特异性、直接主动脉壁细胞毒性、Treg抑制功能受损及T细胞介导的主动脉壁损伤均未被证实,现有干预多为非T细胞限制性且在疾病诱导前或期间启动 | 评估T细胞状态在主动脉夹层中的作用,区分描述性免疫分析与支持因果和转化推断的证据 | 主动脉夹层患者及实验模型中的T细胞 | 数字病理, 免疫学, 心血管疾病 | 主动脉夹层, 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, T细胞受体谱分析 | NA | 文本, 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-11-01 |
YTHDF1 aggravates the progression of atherosclerosis by enhancing BRD4 mRNA stability and promoting EndMT transition in an m6A-Dependent manner
2026-Dec, Atherosclerosis plus
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.athplu.2026.100619
PMID:42960007
|
研究论文 | 本研究揭示YTHDF1通过识别METTL3介导的BRD4 mRNA m6A修饰增强其稳定性,促进内皮-间质转化(EndMT),从而加剧动脉粥样硬化进展 | 首次发现YTHDF1-m6A-BRD4轴在动脉粥样硬化相关EndMT中的致病作用,阐明METTL3/YTHDF1/BRD4分子机制 | 结论仍需进一步的临床前验证 | 探究m6A阅读蛋白YTHDF1在动脉粥样硬化进展中的作用,特别是其对BRD4的调控及对EndMT的促进作用 | 人动脉粥样硬化斑块样本、Apoe-/-小鼠、YTHDF1-/-Apoe-/-小鼠、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 分子生物学、表观转录组学 | 心血管疾病、动脉粥样硬化 | MeRIP、RIP、定点突变、单细胞RNA测序、功能实验(Transwell、划痕愈合) | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、图像 | 人类数据集GSE97210(6例临床样本)和GSE100927(104例临床样本),Apoe-/-小鼠单细胞RNA测序(n=3),YTHDF1-/-Apoe-/-小鼠(n=5) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-11-01 |
Biotin-dependent metabolism controls germinal center fate and vaccine-induced antibody diversification
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117999
PMID:42959688
|
研究论文 | 该研究利用模拟人类SLC5A6功能缺失突变的杂合M60K小鼠,揭示生物素依赖性代谢调控生发中心B细胞命运及疫苗诱导的抗体多样化 | 首次将生物素转运蛋白SLC5A6缺陷与生发中心B细胞分化命运及疫苗诱导的抗体多样化联系起来,发现生物素依赖性线粒体代谢是连接微量营养素可用性与生发中心B细胞分化及疫苗应答的重要检查点 | 研究基于杂合M60K小鼠模型,可能无法完全反映人类纯合突变表型;机制研究主要聚焦于生物素转运缺陷,其他微量营养素的协同作用未充分探讨 | 探究营养可用性在调控生发中心B细胞分化的代谢检查点中的作用,特别是生物素依赖性代谢对生发中心命运和疫苗诱导抗体多样化的影响 | 杂合M60K小鼠(模拟人类SLC5A6功能缺失突变)及其生发中心B细胞、B细胞受体库、疫苗诱导的抗体应答 | 免疫学、代谢生物学 | NA | 单细胞转录组测序、RNA速率分析、B细胞受体库分析、空间多重成像、流式细胞术、假病毒中和实验 | NA | 单细胞转录组数据、BCR序列数据、空间成像数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-11-01 |
Single-cell transcriptomics reveals reversible microglia/macrophage activation after human retinal neuron transplantation into mouse retina
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117232
PMID:42960285
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学分析了人视网膜神经元移植到小鼠视网膜后宿主小胶质细胞/巨噬细胞的激活动态 | 揭示了移植诱导的宿主髓系细胞激活是一个动态且部分可逆的过程,发现了从稳态到激活以及从激活回到稳态的两条独立轨迹 | 研究仅观察了移植后3天的早期反应,样本量有限,且仅在小鼠模型中进行验证 | 探究视网膜神经元移植后宿主小胶质细胞和巨噬细胞的细胞机制及其激活动态 | 移植了人胚胎干细胞来源视网膜神经节细胞的小鼠视网膜中的宿主髓系细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 移植后3天分选的GFP阳性宿主髓系细胞(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10×单细胞RNA测序 |
| 10 | 2026-11-01 |
USP22 Facilitates Cervical Cancer Progression via Deubiquitinating and Stabilizing IRAK1 to Activate NF-κB Signaling
2026-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603200R
PMID:42963964
|
研究论文 | 本研究探讨了USP22在宫颈癌中的生物学功能及其通过去泛素化稳定IRAK1激活NF-κB信号通路调控宫颈癌进展的机制 | 首次揭示USP22通过去泛素化并稳定IRAK1激活NF-κB信号通路促进宫颈癌进展,提出USP22/IRAK1/NF-κB轴作为宫颈癌治疗的新靶点 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究USP22在宫颈癌进展中的生物学意义及其调控机制 | 宫颈癌细胞及宫颈癌组织样本 | 肿瘤生物学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-11-01 |
Spatially restricted antigen expression by an ionizable lipid nanoparticle enhances mRNA vaccine immunity against Pseudomonas aeruginosa
2026-Nov-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.115306
PMID:42641929
|
研究论文 | 本文开发了一种新型可电离脂质LC3,利用其构建的mRNA-LNP疫苗可在肌内注射后实现空间受限的抗原表达,并增强针对铜绿假单胞菌的免疫保护效果 | 开发了新型可电离脂质LC3,实现注射部位和引流淋巴结的局部抗原表达并减少肝脏表达;揭示了细胞摄取与有效基因表达之间的解耦,表明细胞内加工而非摄取效率决定功能性表达 | 摘要未明确说明具体的局限性 | 开发空间受限抗原表达的mRNA-LNP疫苗平台,增强抗铜绿假单胞菌免疫应答并提高安全性 | 铜绿假单胞菌疫苗、mRNA-LNP疫苗、小鼠模型(由体内实验推断) | 疫苗学、免疫学、药物递送 | 铜绿假单胞菌感染、医院获得性感染 | mRNA-LNP疫苗、单细胞RNA测序 | NA | 文本(序列)、图像(推断)、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-11-01 |
Urinary single-cell transcriptomics in kidney transplantation: Elucidation of donor-recipient cellular dynamics and fibrogenic stress
2026-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.05.007
PMID:42134416
|
研究论文 | 该研究建立了高质量尿液单细胞RNA测序流程,并对12名不同临床状态的肾移植受者进行分析,以揭示供受体细胞动态和纤维化应激 | 建立了高质量的尿液scRNA-seq工作流程,并通过基于基因型的反卷积方法与已发表组织数据集进行基准比较,验证了尿液中供体和受体细胞来源的准确分配;首次系统揭示尿液中大多数细胞来源于受体,并发现供体来源巨噬细胞可在尿液中检测到 | 样本量较小(12名肾移植受者),尿液scRNA-seq存在低投入挑战,未提及长期随访验证 | 利用尿液单细胞转录组学非侵入性地研究肾同种异体移植生物学,阐明供受体细胞动态、上皮损伤、免疫激活和移植物适应机制 | 12名不同临床状态的肾移植受者及其尿液样本 | 数字病理学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本(单细胞转录组数据) | 12名肾移植受者的尿液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-06-17 |
Spatial transcriptomics identifies cytotoxic and fibrotic immune-stromal niches in morphea and eosinophilic fasciitis
2026-Nov, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.05.030
PMID:42297130
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-09-05 |
Can urinary single-cell transcriptomics reveal new dimensions of allograft biology?
2026-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.06.017
PMID:42392365
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-09-28 |
Corrigendum to "a scRNA-seq-guided gelsolin-functionalized gelatin Methacryloyl platform integrating structural support and immunomodulation for osteoarthritis repair" [Int. J. Biol. Macromol. 381 (2026) 154162 1-16]
2026-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154485
PMID:42800764
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-11-01 |
Mendelian randomization and single-cell transcriptomics prioritize CD7 and LAPTM5 in primary Sjögren's disease: an integrative multi-omics analysis
2026-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08438-8
PMID:42821046
|
研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组和批量转录组数据,识别出CD7和LAPTM5作为原发性干燥综合征的候选基因,并探索了乳酸化修饰的潜在作用 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组学整合用于原发性干燥综合征研究,结合乳酸化相关基因集评分这一探索性分析,并刻画了外周血中巨核细胞/血小板样细胞群体 | 乳酸化相关转录组评分为替代指标,需直接实验验证;RT-qPCR结果未达统计学显著;需要疾病相关组织的研究;乳酸化评分在文库复杂度校正后未显示稳健的细胞类型特异性 | 识别原发性干燥综合征的候选基因并探究乳酸化修饰在其发病机制中的潜在作用 | 原发性干燥综合征患者及对照者的外周血样本、全血转录组数据及电子健康记录中的干燥综合征表型 | 多组学整合分析、遗传学、单细胞转录组学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、全血eQTL、孟德尔随机化、共定位分析、RT-qPCR | 孟德尔随机化模型、共定位分析模型、五种基因集评分算法 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、遗传变异数据、电子健康记录表型数据、RT-qPCR数据 | 单细胞数据10名供者;批量转录组GSE51092队列190例患者和32例对照;RT-qPCR 10例患者和10例对照;乳酸化基因集332条文献条目代表330个独特基因 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-11-01 |
Global landscape of clinical trials and therapeutic targets in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: an integrative multi-omics analysis
2026-Nov, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-026-02991-4
PMID:42645756
|
研究论文 | 整合全球临床试验数据与多组学证据,分析MASLD治疗策略、靶点分布、组织特异性安全性及不同疾病阶段的表达模式。 | 将全球MASLD临床试验格局与多组学靶点表征相结合,基于组织特异性、疾病相关表达变化、蛋白表达证据、可成药性和转化证据对候选靶点进行优先级排序。 | 研究主要基于公开数据库的回顾性数据整合,缺乏前瞻性实验验证;靶点优先级排序依赖于现有数据集的覆盖度和质量。 | 评估MASLD治疗策略、靶点分布、组织特异性安全性及疾病各阶段的表达模式,为靶点优先级排序、安全性评估和精准治疗开发提供框架。 | 1998年至2025年5月注册的MASLD相关临床试验,以及GEO中的bulk转录组和单细胞RNA测序数据集。 | 多组学分析 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-11-01 |
Single-cell transcriptome atlas reveals a WRKY33-HSP81 regulatory module that orchestrates phenylpropanoid-mediated defense against Sclerotium rolfsii in Dendrobium officinale
2026-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.71190
PMID:42958626
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研究论文 | 本研究构建了铁皮石斛茎基部在齐整小核菌侵染后的单细胞转录组图谱,揭示了WRKY33-HSP81调控模块通过苯丙烷代谢介导防御的机制 | 首次在药用兰科植物铁皮石斛中构建单细胞转录组图谱解析病原侵染后的细胞异质性免疫响应,发现WRKY33直接结合木质素合成基因C4H和HCT的W-box基序促进木质素沉积增强抗病性,并揭示HSP81通过与WRKY33互作及辅因子隔离负调控防御的新机制 | 研究仅涵盖侵染后12小时和24小时两个时间点,未进行功能验证的遗传转化实验,单细胞转录组未结合空间转录组验证 | 解析铁皮石斛响应齐整小核菌侵染的细胞类型特异性免疫转录程序,鉴定调控苯丙烷代谢介导防御的关键调控模块 | 铁皮石斛茎基部组织及齐整小核菌侵染后的植物细胞 | 植物单细胞转录组学 | 植物真菌病害(白绢病) | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | 超过20000个细胞,涵盖侵染后12小时和24小时两个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-11-01 |
Fibroblast-specific deletion of Yap/Taz impairs mouse postnatal dermal development by diminishing collagenous matrix
2026-Nov, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.05.034
PMID:42314933
|
研究论文 | 研究了成纤维细胞特异性敲除Yap/Taz通过抑制TGF-β/Smad信号通路减少胶原基质,从而损害小鼠出生后真皮发育 | 首次揭示YAP/TAZ在出生后真皮细胞外基质生理性稳态维持中的关键作用,而非仅局限于上皮癌和纤维化中的已知功能 | 仅在小鼠模型中进行,未验证人类皮肤中的相关性;机制上TGF-β/Smad通路仅部分解释表型,可能存在其他未探索的通路 | 探究YAP/TAZ在出生后真皮细胞外基质发育和稳态中的生理功能及机制 | 小鼠皮肤真皮成纤维细胞及真皮细胞外基质 | 分子生物学与发育生物学 | NA | RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-11-01 |
The genomic and spatial transcriptomic landscape of seborrheic keratoses
2026-Nov, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.048
PMID:42413572
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研究论文 | 该研究对脂溢性角化病和日光性黑子病变进行了全外显子组测序和空间转录组分析,揭示了其基因组和空间转录组景观 | 结合全外显子组测序和空间转录组技术,首次全面揭示了脂溢性角化病的突变负荷、空间异质性以及Wnt信号通路失调在其发病机制中的关键作用 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究脂溢性角化病和日光性黑子的分子机制及其发生发展过程 | 脂溢性角化病和日光性黑子病变组织 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 全外显子组测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |