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当前共找到 41850 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-29 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2026-Aug, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析，揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫学作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子，通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 探究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值及其驱动恶性进展的分子机制，以识别新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本中的恶性单细胞亚群及空间转录组数据 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 低级别胶质瘤患者样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 2 | 2026-07-29 |
Intracerebral hemorrhage induces monocyte TNF signaling that is suppressed by Siponimod (BAF312): a single-cell transcriptomics study in patients
2026-Jan-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.22.26344292
PMID:41646803
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，发现脑出血后单核细胞TNF信号通路被Siponimod (BAF312)抑制 | 首次在脑出血患者中利用单细胞RNA测序揭示BAF312对单核细胞TNF信号通路的抑制作用，并发现单核细胞TNF信号增强与更好功能预后相关 | BAF312未影响血浆细胞因子或趋化因子浓度，提示其对免疫反应的抑制可能具有局限性 | 研究BAF312在脑出血后对单核细胞炎症反应的调节作用 | 脑出血患者的外周血样本 | 机器学习 | 脑出血 | 单细胞RNA测序, 血浆细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 细胞因子浓度数据 | 脑出血患者（治疗组和安慰剂组），分别在发病后第1、3、7天收集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-29 |
Microbiome-Derived Metabolites Shape CD4+ T-Cell Differentiation and Immune Aging in Chronic HIV-1 Infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699280
PMID:41648363
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研究论文 | 该论文研究了肠道微生物来源的芳香族代谢产物如何影响慢性HIV-1感染者CD4+ T细胞的分化与免疫老化 | 首次揭示细胞关联的肠道细菌代谢产物（特别是对甲酚硫酸盐）通过剂量依赖方式重塑CD4 T细胞分化、调控样特征和衰老程序，并与HIV-1潜伏库大小相关联 | 本研究主要基于体外和离体实验，需要体内验证及更大样本量确认 | 阐明肠道微生物代谢产物调控CD4 T细胞免疫代谢和功能，促进HIV-1感染者免疫老化的机制 | 慢性HIV-1感染者的CD4 T细胞 | 免疫学 | HIV-1感染 | 代谢组学, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 流式细胞数据 | 论文未明确样本量，涉及慢性HIV-1感染者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-29 |
YAP1 Depletion Enhances TAZ and its Complexation with TEAD4 and AP-1 Heterodimer C-JUN/FOSB to Promote Gastric Cancer Progression and Metastases
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.683933
PMID:41292957
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研究论文 | 本文研究了YAP1缺失如何通过增强TAZ与TEAD4及AP-1异二聚体c-JUN/FOSB的复合化，促进胃癌进展和转移 | 首次揭示了YAP1抑制后TAZ的代偿性上调机制及其与TEAD4和AP-1复合物的相互作用，并证明联合靶向YAP1和TAZ比单独抑制更有效 | 研究主要基于体外和体内模型，尚未在临床试验中验证联合抑制的治疗效果 | 评估YAP1和TAZ在胃癌腹膜转移中的表达及联合靶向的抗肿瘤活性 | 胃癌腹膜转移患者样本、细胞系及小鼠模型 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色、基因敲除、反义寡核苷酸抑制、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、图像 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 5 | 2026-07-29 |
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.23.593868
PMID:38853982
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研究论文 | 研究揭示胰腺导管腺癌中导管周成纤维细胞密度通过CD44依赖的基质检查点定义淋巴细胞排斥机制 | 首次建立以癌症相关成纤维细胞分层的导管空间结构作为胰腺癌免疫排斥的基本决定因素，并发现导管周成纤维细胞组织决定白细胞接近程度 | 未提及具体局限性 | 探究胰腺导管腺癌中基质-导管结构对免疫细胞定位的影响及其分子机制 | 治疗初治胰腺导管腺癌患者样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式、多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 三个独立队列的治疗初治患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-07-29 |
DAPK1-positve macrophages facilitate immunosuppressive microenvironment and determine immunotherapy efficacy in colorectal cancer
2025-11-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07268-7
PMID:41188869
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术，发现DAPK1阳性巨噬细胞促进结直肠癌免疫抑制微环境并影响免疫治疗效果 | 首次揭示DAPK1阳性巨噬细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制特性及其作为免疫检查点阻断治疗协同靶点的潜力 | 仅基于小鼠模型和临床样本，缺乏大规模前瞻性验证研究 | 鉴定结直肠癌中促进癌症进展和免疫治疗耐药的特定巨噬细胞亚群 | 结直肠癌患者及小鼠模型的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本、测序数据 | 多个临床队列及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 7 | 2026-07-29 |
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-11-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07174-y
PMID:41184884
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外陷阱（NETs）如何通过调节LDHA表达促进结直肠癌肝转移 | 首次揭示了NETs通过PI3K/AKT通路调控LDHA表达，进而促进结直肠癌肝转移的分子机制 | 主要基于体外实验和裸鼠异种移植模型，缺乏大规模临床样本验证 | 阐明NETs在结直肠癌肝转移中的作用及分子机制 | 结直肠癌组织和肝转移病灶 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 基于公开单细胞转录组数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-29 |
A novel palmitoylation-based molecular signature reveals COX6A1 as a key regulator in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-11-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07253-0
PMID:41185013
|
研究论文 | 开发了一种基于棕榈酰化的分子特征，揭示COX6A1在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的关键调控作用 | 首次构建基于棕榈酰化相关基因的分子分型，并利用机器学习和单细胞分析发现COX6A1作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 主要基于公共数据库分析，缺乏大规模临床队列验证；体外实验仅使用HepG2细胞系，未进行体内动物模型验证 | 探索棕榈酰化、线粒体功能和免疫重塑在MASLD中的分子联系 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 共识聚类, WGCNA, 机器学习（12种算法，113种模型组合） | 基因表达数据 | 4个GEO批量RNA-seq队列和1个单细胞RNA-seq队列 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-07-29 |
New perspectives in the treatment of liver cirrhosis: targeting macrophage regulatory mechanisms
2025-10-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07239-y
PMID:41174741
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化调控在肝硬化治疗中的核心作用与干预策略 | 首次系统阐述了巨噬细胞M1/M2极化平衡在肝纤维化逆转中的关键调控网络，并整合了从免疫调节、小分子靶向到基因工程巨噬细胞等三类前沿干预策略，提出基于单细胞测序技术的精准免疫调控新方向 | 策略临床转化仍面临极化状态动态变化和靶点特异性不足等挑战 | 探讨巨噬细胞靶向调控机制在肝硬化治疗中的应用前景，推动治疗模式从传统对症治疗向精准免疫调控转变 | 巨噬细胞极化调控机制及肝硬化治疗策略 | 机器学习和数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-07-29 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
|
研究论文 | 通过全基因组关联研究、单细胞与空间转录组学分析揭示STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用，并确定STK24为潜在治疗靶点 | 首次整合GWAS、单细胞转录组和空间转录组数据，发现凋亡相关基因STK24及其阳性上皮细胞在肺腺癌进展中的关键作用，并构建了基于STK24的预后模型 | STK24作为潜在治疗靶点的功能验证主要在体外细胞实验中进行，缺乏体内动物模型验证以及大规模临床队列的外部验证 | 探究肺腺癌的遗传变异和分子机制，寻找新的治疗靶点 | 肺腺癌患者的基因组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据以及LUAD细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、空间转录组学 | CNN, LSTM, GAN, SCENIC, Monocle, CellCall, RCTD, stlearn, CellChat, Commot, Misty, STK24SuperPC | 基因型数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、RNA-seq数据 | GWAS数据来自FinnGen、IEU OpenGWAS和GWAS Catalog数据库，单细胞和空间转录组数据来自GEO数据库，预后模型评估基于TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-29 |
Targeting lncRNA MALAT1 attenuates lenalidomide resistance via CD38 epigenetic modulation, oxidative stress-mediated cell death, and remodeling of the pro-tumor microenvironment in multiple myeloma
2025-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07252-1
PMID:41168832
|
研究论文 | 探讨长链非编码RNA MALAT1在多发性骨髓瘤来那度胺耐药中的作用及其机制 | 首次揭示MALAT1通过表观遗传调控CD38、氧化应激介导的细胞死亡及重塑促肿瘤微环境来促进来那度胺耐药 | 主要基于体外细胞实验和有限的患者样本，缺乏体内动物模型验证 | 阐明MALAT1在多发性骨髓瘤发病和来那度胺耐药中的功能及分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞系、患者来源样本（骨髓单个核细胞） | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序、反义寡核苷酸敲低、荧光显微镜、比色法和发光法检测、MILLIPLEX多重分析 | NA | 基因表达数据、测序数据、细胞成像数据、细胞代谢数据 | 多发性骨髓瘤细胞系及患者骨髓单个核细胞样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和批量RNA测序用于转录组分析 |
| 12 | 2026-07-29 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-10-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
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研究论文 | SpateCV通过条件变分自编码器正则化单细胞RNA测序与空间转录组数据的细胞类型对齐，提升空间基因插补性能 | 提出SpateCV模型，利用聚类损失显式正则化两种数据中相似细胞的嵌入对齐，从而在共享潜在空间中实现跨模态对齐 | NA | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，改善空间基因表达插补，揭示组织结构和细胞异质性 | 来自十二个数据集的细胞类型及组织切片中的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 包含十二个数据集的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-07-29 |
Panmim: a resource of pan-cancer metastasis immune microenvironment
2025-10-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06484-5
PMID:41152997
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研究论文 | 开发了一个名为Panmim的泛癌转移免疫微环境综合资源数据库 | 首次整合来自不同起源的转移性癌症单细胞RNA-seq数据集，覆盖14个转移部位和36种原发癌症类型，提供细胞水平比较分析 | 未明确说明局限性，但可能受限于已有公开数据集的质量和覆盖范围 | 研究转移性肿瘤的免疫微环境，促进对癌症转移分子机制和细胞异质性的理解 | 转移性癌症及其微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 90个单细胞RNA-seq数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 14 | 2026-07-29 |
Which dominates recurrence: tumor or microenvironment?
2025-10-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07193-9
PMID:41152880
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研究论文 | 本研究结合机器学习方法分析肺鳞状细胞癌复发中肿瘤内在因素和肿瘤微环境的作用 | 利用单细胞RNA测序和机器学习整合分析，识别出高MKI67 Tregs等免疫细胞亚型作为复发关键驱动因素，并首次将病理缓解率（PRR）和Treg_MKI67表达作为预后预测标志物 | 样本量有限（119例患者），且数据来源单一，可能限制结论的泛化性 | 探究肺鳞状细胞癌复发中肿瘤内在因素与肿瘤微环境的主导作用 | 119例肺鳞状细胞癌患者的生存元数据和51种免疫细胞亚型比例数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 数值型数据（免疫细胞比例和生存数据） | 119例肺鳞状细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-07-29 |
Epithelial-Mesenchymal Transition is Associated with Altered Immune Composition and Cytotoxic Function in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.683714
PMID:41280107
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研究论文 | 探究三阴性乳腺癌中上皮-间充质转化与免疫组成及细胞毒性功能改变的关系 | 首次利用单细胞克隆群体系统分析EMT连续谱中的免疫景观变化，揭示EMT与免疫细胞募集和功能的梯度关系 | 该结论基于小鼠模型，可能不完全适用于人类肿瘤；缺少直接验证中间EMT状态免疫特征的临床样本数据 | 表征部分或中间EMT状态相关的免疫景观及其在乳腺癌免疫抵抗中的作用 | 三阴性4T1小鼠乳腺肿瘤细胞系的五个单细胞衍生克隆群体及其形成的肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 五个单细胞衍生克隆群体，每个群体对应多个肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 16 | 2026-07-29 |
SpaDiff: Denoising for Sequence-based Spatial Transcriptomics via Diffusion Process
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681011
PMID:41280001
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研究论文 | 提出一种基于扩散过程的空间转录组数据去噪方法SpaDiff，用于恢复RNA分子的原始空间分布 | 首次将空间转录组中的spot-swapping噪声建模为扩散过程，并设计反向过程恢复原始空间分布，同时保留分子计数 | 仅在模拟和部分真实数据上验证，未讨论对不同组织类型或平台数据的泛化能力 | 开发用于空间转录组数据的去噪方法，提高基因表达的空间特异性和下游分析准确性 | 空间转录组数据中的基因表达空间分布 | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组测序 | 扩散模型 | 空间转录组表达矩阵 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 17 | 2026-07-29 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 利用TempO-LINC平台生成单细胞转录组图谱，解析化学物质暴露下HepaRG细胞的应激反应状态 | 首次使用TempO-LINC平台进行单细胞转录组分析，结合文献来源的应激反应基因特征对单个细胞评分，并利用广义Jaccard度量聚类揭示五个表型组，系统解析细胞状态动态变化 | 未提及明显的局限性 | 通过单细胞转录组学解码细胞应激状态，为毒理学研究提供见解 | 暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素的HepaRG细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | BioSpyder | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于单细胞转录组分析 |
| 18 | 2026-07-29 |
Single-cell map of the healthy human immune system across the lifespan reveals unique infant immune signatures
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.28.667181
PMID:40766403
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研究论文 | 绘制了从婴儿到老年人的健康人类免疫系统单细胞图谱，揭示了独特的婴儿免疫特征 | 首次通过scRNA-seq和snATAC-seq技术，对涵盖2个月至88岁年龄段的95名健康个体进行系统分析，揭示了MAIT和γδT细胞的“上升-下降”模式以及婴儿期独特的免疫细胞组成和基因表达特征 | 未提供具体局限性信息 | 描绘人类一生中免疫系统的动态变化轨迹，特别关注婴儿免疫系统的独特性 | 95名健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs），包括婴儿、儿童、成人和老年人 | 自然语言处理、机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据 | 95名健康个体，年龄从2个月到88岁，其中婴儿27人、儿童23人、成人18人、老年人27人 | 10x Genomics, Illumina, BGI, MGI | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ, MGI DNBSEQ | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、单核ATAC测序、Illumina NovaSeq测序平台、BGI MGISEQ系统、MGI DNBSEQ系统 |
| 19 | 2026-07-29 |
Mapping mesenchymal diversity in the developing human intestine and organoids
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.22.665939
PMID:40777494
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和Xenium空间转录组技术，构建了发育中人小肠的全面组织图谱，重点关注间充质细胞多样性，并评估了类器官模型 | 首次整合单细胞转录组与空间转录组数据，对发育中人小肠间充质细胞进行高分辨率时空图谱构建，揭示了5种间充质亚群的空间动态变化，并为评估多能干细胞来源的类器官提供了基准资源 | 未明确提及局限性，可能包括样本量小、仅聚焦于小肠、以及空间转录组检测基因数量有限等 | 解析发育中人小肠间充质细胞的空间组织动态，并利用此图谱验证类器官模型的代表性 | 发育中的人小肠组织及多能干细胞来源的人肠道类器官 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA-seq、Xenium空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据（单细胞与空间转录组） | 不适用（发育中人小肠组织，具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Xenium | 10x Chromium单细胞RNA测序与10x Xenium空间原位分析平台，定制化基因面板覆盖人类肠道细胞类型多样性 |
| 20 | 2026-07-29 |
Dynamics of zoosporic parasites in summer phytoplankton communities of the Baltic Sea
2025-Jul-14, FEMS microbiology ecology
IF:3.5Q2
DOI:10.1093/femsec/fiaf081
PMID:40795206
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研究论文 | 本研究通过DNA宏条形码、单细胞测序和显微镜技术，首次对波罗的海夏季浮游植物群落中的动物孢子寄生虫进行了群落水平定性和定量评估 | 首次在波罗的海夏季浮游植物中提供动物孢子寄生虫的群落水平定性和定量评估，结合多种技术揭示了宿主丰度与寄生虫相互作用的生态相关性 | 研究未深入探讨寄生虫在浮游植物水华动态中的具体作用机制，且样本仅限于波罗的海北部六个沿岸站点 | 探索波罗的海夏季浮游植物群落中微生物群落和寄生虫互作的生态特征 | 波罗的海北部六个沿岸站点的夏季浮游植物及动物孢子寄生虫 | 微生物生态学 | NA | DNA宏条形码、单细胞测序、显微镜观察 | NA | 测序数据、显微图像 | 六个沿岸站点 | NA | DNA宏条形码、单细胞测序 | NA | NA |