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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞-足细胞交互失调 | 整合阳离子牛血清白蛋白诱导的小鼠膜性肾病模型与单细胞RNA测序,绘制肾脏细胞图谱,发现巨噬细胞-足细胞轴失衡(Spp1-整合素信号增强和胶原IV稳态信号减弱)是肾小球损伤的关键驱动因素 | 主要基于小鼠模型,人体样本验证有限 | 阐明膜性肾病中细胞网络驱动损伤的机制 | 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾脏细胞 | 机器学习和生物信息学 | 膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-06-18 |
From tarsal anatomy to tear-film homeostasis: A history-informed review of the meibomian gland in ocular surface biology
2026-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111052
PMID:42119841
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综述 | 回顾从解剖学到泪膜稳态的睑板腺研究历史,阐述其在眼表生物学中的核心作用及其功能障碍(MGD)的现代概念 | 提出“认识激活”作为分析术语,系统梳理睑板腺从解剖识别到因果疾病关联、量化测量和诊断框架整合的历史过程,并展望基于细胞状态、脂质相、免疫和计算表型的未来分类方向 | 未提及具体限制 | 综述睑板腺研究的历史演变,解释其从解剖结构到眼表疾病关键因素的转变,并为未来MGD分类提供历史视角 | 睑板腺及其功能障碍(MGD) | 眼科及眼表生物学 | 干眼症(蒸发过强型干眼)相关眼表疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型、人工智能图像分析、干细胞/再生研究 | NA | 文本(历史文献综述) | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-06-18 |
Deep Structure-Enhanced Cell Clustering Model for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Aug, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261453098
PMID:42261796
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研究论文 | 提出一种名为scDSEC的深度结构增强细胞聚类模型,用于单细胞RNA测序数据 | 通过整合细胞内部特征和外部结构语义,并采用逐层增强策略来学习增强的细胞表示,以解决表示学习不充分的问题 | 文中未明确提及局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-18 |
Deciphering MFAP5+ Fibroblasts in Pancreatic Cancer Progression via Multi-Regional Single-Cell RNA Sequencing With Experimental Validation
2026-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70114
PMID:41995689
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研究论文 | 通过多区域单细胞RNA测序和实验验证,解析MFAP5+成纤维细胞在胰腺癌进展中的作用机制 | 首次通过多区域单细胞RNA测序系统解析MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的空间分布和通讯动态,并发现其与FABP4+和VWF+内皮细胞通过TGF-β、VEGF、FGF等促癌通路相互作用,提出MFAP5+成纤维细胞-内皮细胞轴作为潜在治疗靶点 | 未提及明确局限性 | 探究MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的功能、空间分布和通讯动态及其促癌机制 | MFAP5+成纤维细胞及其与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像 | 59,829个细胞,整合了多个数据集 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 多区域单细胞RNA测序 |
| 5 | 2026-06-18 |
Comprehensive Multi-Omics Profiling of Tertiary Lymphoid Structures Reveals Immunogenetic Landscapes and Prognostic Subtypes in Lung Adenocarcinoma
2026-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70120
PMID:42070266
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研究论文 | 通过整合多组学策略构建三级淋巴结构相关预后模型,揭示肺腺癌的免疫遗传学景观与预后亚型 | 首次通过孟德尔随机化鉴定与肺腺癌遗传关联的三级淋巴结构相关基因,结合机器学习构建预后模型,并整合scRNA-seq和药物敏感性分析 | 研究缺乏外部验证队列,且RT-qPCR验证仅在细胞系层面进行,未在临床样本中确认 | 构建基于三级淋巴结构的肺腺癌预后模型并阐明其免疫遗传学机制 | 三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的遗传关联与预后价值 | 机器学习 | 肺癌 | 孟德尔随机化, 机器学习, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-06-18 |
Characterization of T-Cell Ubiquitination in Melanoma and Development of a Risk Signature Using Single-Cell and Bulk RNA-Seq
2026-Jul, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70139
PMID:42012139
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research paper | 利用单细胞和 bulk RNA-seq 数据,开发黑色素瘤中与泛素化相关基因的风险特征,并探究其与免疫微环境的关系 | 整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,首次构建了基于六个泛素化相关基因的预后风险特征,揭示了URGs通过调节免疫细胞浸润影响黑色素瘤预后的新机制 | 未提及明确的局限性 | 开发基于泛素化相关基因的预后风险特征,并探讨其在黑色素瘤免疫调控中的作用 | 皮肤黑色素瘤患者 | machine learning | melanoma | RNA-seq, scRNA-seq | Cox regression | gene expression data | 未明确说明样本量,使用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-06-18 |
MelOD: The Melanoma Omics Dashboard for Multimodal Data Exploration
2026-Jul, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.70101
PMID:42304720
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research paper | 介绍了一个名为MelOD的免费网络交互式平台,整合了16项黑色素瘤研究的多模态数据,并提供可视化分析工具 | 首次将来自多个黑色素瘤研究的批量转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据整合到一个用户友好的网络平台中,支持实时假设生成和跨研究验证 | 仅整合了预处理的公开数据,可能遗漏最新研究;依赖RShiny性能和网络条件 | 降低多组学黑色素瘤研究门槛,促进免疫治疗反应探索和跨研究验证 | 黑色素瘤患者的多组学数据(包括转录组、单细胞和蛋白质组) | machine learning | melanoma | NA | NA | transcriptomics, single-cell RNA-seq, proteomics | 整合16项研究数据,具体样本量未明确 | NA | bulk transcriptomics, single-cell RNA-seq, proteomics | NA | NA |
| 8 | 2026-06-18 |
Dermal fibroblasts attenuate osteoarthritis by restoring synovial fibroblast homeostasis
2026-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2026.101138
PMID:42305141
|
研究论文 | 该研究验证了真皮成纤维细胞通过恢复滑膜成纤维细胞稳态来治疗骨关节炎的疗效和机制 | 首次验证真皮成纤维细胞作为细胞疗法的安全性和有效性,通过靶向滑膜成纤维细胞谱系稳态失调来缓解骨关节炎,并阐明了旁分泌载脂蛋白D的机制 | 文章未明确提及局限性 | 开发一种针对早期至中期骨关节炎的新型细胞疗法,通过恢复滑膜成纤维细胞稳态来改善滑膜炎和软骨退化 | 真皮成纤维细胞、滑膜成纤维细胞、大鼠骨关节炎模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞测序、转录组学、共培养系统、定量蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 大鼠样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 9 | 2026-06-18 |
Semaglutide targets muscle mitochondria to regulate glutamine metabolism and treat osteoarthritis
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116347
PMID:42305583
|
研究论文 | 该研究通过跨组织单细胞RNA测序分析,发现司美格鲁肽通过靶向肌肉线粒体调节谷氨酰胺代谢,从而治疗骨关节炎 | 首次揭示了司美格鲁肽通过肌肉-软骨轴中的线粒体调节机制治疗骨关节炎,并确认了谷氨酰胺在其中的关键作用 | 尚未明确提及具体局限性,但可能涉及动物模型向临床转化的挑战 | 探究司美格鲁肽治疗骨关节炎的潜在机制 | 高脂饮食和骨关节炎条件下的小鼠模型及C2C12细胞系 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本,具体数量未明确给出 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-06-18 |
LRP1 activated by AT2 cell-secreted MDK inhibits fibrotic ferroptosis in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116212
PMID:42305620
|
研究论文 | 本研究揭示了特发性肺纤维化中AT2细胞分泌的MDK通过激活LRP1受体抑制成纤维细胞铁死亡的分子机制 | 首次阐明AT2细胞分泌的MDK通过LRP1-OTUB1-SLC7A11轴抑制成纤维细胞铁死亡,发现LRP1信号上调去泛素酶OTUB1并稳定铁死亡抑制剂SLC7A11的新调控通路 | 未明确提及样本量及临床验证,部分结论基于细胞共培养模型和腺病毒介导的小鼠模型,需进一步在人体组织验证 | 研究特发性肺纤维化中肺泡损伤和成纤维细胞异常增殖的细胞间通讯机制 | 特发性肺纤维化患者肺组织及细胞,包括AT2细胞、CTHRC1成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序、细胞共培养、腺病毒介导的过表达和敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 未明确说明 | 单细胞RNA测序 | 未明确说明 | 数据来源于GEO数据库的单细胞测序结果 |
| 11 | 2026-06-18 |
Spatial and single-cell transcriptomics uncover brassinosteroid-mediated coordination of sepal elongation in Arabidopsis
2026-Jun-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04156-1
PMID:42304499
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示油菜素内酯介导的拟南芥萼片伸长协调机制 | 首次通过单细胞和空间RNA-seq分析发现DRMY1基因通过调控油菜素内酯信号通路协调拟南芥内外萼片的伸长,并利用遗传和化学干预验证其功能 | 仅聚焦于拟南芥萼片发育,可能不直接推广到其他植物器官或物种,且未深入探讨DRMY1的直接分子靶点 | 研究拟南芥萼片伸长协调的机制,特别是油菜素内酯信号在其中的作用 | 拟南芥萼片(特别是drmy1突变体) | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 图像 | 拟南芥花蕾样本(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 使用了单细胞RNA-seq和空间RNA-seq技术(具体平台未在摘要中说明) |
| 12 | 2026-06-18 |
Integrating cross-omics research through FAIR Digital Objects with DataPLANT
2026-Jun-17, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2025-0056
PMID:42307005
|
研究论文 | 通过FAIR数字对象和DataPLANT整合跨组学研究,展示了注释研究上下文在管理大麦单细胞RNA测序和空间转录组学数据中的应用 | 使用注释研究上下文框架整合单细胞和空间转录组学数据,通过ISA表格和本体注释提高机器可读性和可解释性,并使用通用工作流语言脚本确保结果可重复性 | 将分析脚本封装为CWL需要一定的技术知识,这可能成为入门障碍 | 展示如何通过FAIR数字对象提高植物科学中单细胞和空间转录组学数据的互操作性和可重复性 | 大麦单细胞RNA测序数据集和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 大麦单细胞RNA测序和空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-18 |
Siderophore sharing protects clonal Pseudomonas aeruginosa biofilms from colistin
2026-Jun-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00588-26
PMID:42307240
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示克隆铜绿假单胞菌生物膜中铁载体共享对粘菌素耐药性的保护机制 | 首次在单细胞层面阐明克隆细菌群体中自发产生铁载体生产者和非生产者亚群,并通过铁载体共享介导交叉保护抵抗粘菌素的策略,扩展了公共物品理论在克隆细菌种群中的应用 | NA | 研究克隆细菌群体中社会角色的出现及其在抗生素胁迫下的交叉保护机制 | 铜绿假单胞菌PAO1生物膜 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-18 |
Pulsed Electric Field Ablation Reprograms Tumor Immunity and Stimulates Germinal Center Formation in Tertiary Lymphoid Structures in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Jun-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3847
PMID:42307634
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研究论文 | 本研究探讨脉冲电场消融在早期非小细胞肺癌患者中重编程肿瘤免疫并刺激三级淋巴结构内生发中心形成 | 首次证明脉冲电场消融能诱导体外无法商业化的生发中心三级淋巴结构形成,增强肿瘤免疫微环境 | 该研究为早期探索性分析,样本量有限,且仅针对早期非小细胞肺癌,需进一步验证长期临床效益 | 评估脉冲电场消融调节早期非小细胞肺癌抗肿瘤免疫的潜力 | 早期非小细胞肺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | 脉冲电场消融 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 57例患者(治疗组与对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | Aliya系统 | 使用专有的Aliya电外科技术输送微秒级电脉冲至组织 |
| 15 | 2026-06-18 |
Single-nucleus sequencing reveals the developmental trajectory and transcriptional regulatory networks of trichome in Artemisia annua
2026-Jun-17, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag287
PMID:42307650
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研究论文 | 利用单细胞核RNA测序揭示了黄花蒿腺毛的发育轨迹及转录调控网络,并发现新基因WDR1通过反馈环路调节腺毛发育 | 首次构建了黄花蒿腺毛细胞的发育轨迹,鉴定出多个此前未知参与腺毛发育的基因(如TOE3、MYB1、WRKY10、ZNF),并发现WDR1与SPL9互作形成反馈环路调控腺毛发育 | 未明确提及,但可能限于10日龄幼苗样本及单一时间点分析 | 阐明黄花蒿腺毛发育的分子机制,特别是单细胞层面的基因表达和调控网络 | 黄花蒿(Artemisia annua)10日龄幼苗的叶腺毛细胞 | 机器学习和转录组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞核转录组数据 | 10日龄黄花蒿幼苗的叶组织样本 | 未明确说明 | 单细胞核RNA测序 | 未明确说明 | NA |
| 16 | 2026-06-18 |
Single-cell Transcriptomics Reveals that the SORBS1/FBXO22/BAG3 Axis Drives Astrocyte Senescence via Calcium Signaling and Affects Alzheimer's Disease-Related Neuronal Damage
2026-Jun-17, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-026-08937-6
PMID:42307825
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示SORBS1/FBXO22/BAG3轴通过钙信号驱动星形胶质细胞衰老并影响阿尔茨海默病相关神经元损伤 | 首次发现SORBS1/FBXO22/BAG3轴通过调节钙信号驱动星形胶质细胞衰老,为AD治疗提供了新靶点 | 主要基于体外模型和生物信息学分析,未在体内模型中验证 | 研究星形胶质细胞衰老在阿尔茨海默病中驱动神经元损伤的分子机制 | 阿尔茨海默病患者脑组织及淀粉样β处理的星形胶质细胞 | 机器学习和生物信息学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, Co-IP, 体外泛素化实验, 星形胶质细胞-神经元共培养模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的AD和对照脑组织scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-06-18 |
CXCL8 producing macrophages shape gastric cancer outcomes
2026-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05452-9
PMID:42307886
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研究论文 | 基于趋化因子构建预后模型并揭示CXCL8阳性巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的作用 | 首次构建基于六种差异表达趋化因子的预后模型,并结合单细胞RNA测序鉴定CXCL8主要来源于巨噬细胞,揭示其通过SPP1信号通路促进肿瘤的机制 | 未明确说明数据来源的潜在偏倚及模型的临床验证范围 | 开发基于趋化因子的胃癌预后签名并阐明其细胞基础 | 胃癌患者转录组数据及单细胞RNA测序样本 | 机器学习 | 胃癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 转录组数据,单细胞基因表达数据 | TCGA和GEO队列整合数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-18 |
Transient Interferon-Driven Natural Killer Cell Activation in Acute Hepatitis C
2026-Jun-16, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf654
PMID:41453396
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研究论文 | 通过流式细胞术和单细胞测序评估急性丙型肝炎患者中自然杀伤细胞的动态变化,发现干扰素驱动的激活细胞群在病毒清除后消失 | 首次在急性HCV感染中结合纵向采样与单细胞测序揭示干扰素驱动的NK细胞激活亚群及其在DAA治疗后消退的特征 | 未提供具体局限性信息 | 研究急性丙型肝炎中自然杀伤细胞的激活与恢复机制 | 急性HCV患者、慢性HCV患者及健康对照组 | 自然语言处理 | 丙型肝炎 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 纵向采样的急性HCV患者及慢性HCV患者与健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-18 |
Single-Cell Sequencing Reveals Varying Cell-Mediated Immunity Profiles in Individuals With Distinct Antibody Responses Following Ad5-nCoV Booster
2026-Jun-16, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiag078
PMID:41640352
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析Ad5-nCoV加强针后抗体反应不同个体中的细胞免疫谱差异 | 首次从单细胞层面揭示抗体高反应者与低反应者之间细胞免疫、转录组、免疫库及细胞通讯的差异,强调细胞免疫在疫苗评估中的关键作用 | 信息未提供 | 探究Ad5-nCoV加强针接种后抗体反应差异的细胞和分子机制,为疫苗全面评估提供新视角 | 接种Ad5-nCoV加强针后抗体滴度高和低的疫苗接受者 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组序列 | 144名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-06-18 |
Neuronal subtype-specific ribosomal protein mRNA expression
2026-Jun-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080954.126
PMID:41956739
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了小鼠大脑皮层和海马体中神经元亚型特异的核糖体蛋白mRNA表达图谱 | 首次在神经元亚型水平系统性地研究核糖体蛋白基因表达,发现了兴奋性与抑制性神经元之间以及不同神经元亚类中独特的RP表达谱 | 主要关注小鼠脑组织,且未深入探讨RP表达差异对翻译功能的具体影响 | 探究核糖体蛋白基因在神经元亚型间的表达组织模式及其生物学意义 | 小鼠大脑皮层和海马体中的神经元亚型(兴奋性、抑制性神经元及亚类) | 机器学习和单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个独立单细胞数据集(Smart-seq2和10x Genomics)覆盖小鼠大脑皮层和海马体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Smart-seq2 | 10x Chromium单细胞3'测序和Smart-seq2技术 |