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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-14
Immune-related biomarkers for major depressive disorder identified via integrated bioinformatics and machine learning
2026-Dec, European journal of psychotraumatology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了与免疫相关的主要抑郁障碍(MDD)生物标志物 整合了多种机器学习算法(LASSO和SVM-RFE)进行稳健的生物标志物筛选,并结合单细胞RNA测序数据验证免疫相关性,最后通过动物模型进行实验验证 研究主要基于公共基因表达数据库,样本来源可能存在异质性;动物模型验证仅在大鼠中进行,需要进一步在人类样本中验证 发现可用于主要抑郁障碍早期和客观诊断的可靠生物标志物 主要抑郁障碍患者的基因表达数据以及慢性不可预知轻度应激大鼠模型 生物信息学 精神疾病 转录组学分析,单细胞RNA测序 LASSO,SVM-RFE 基因表达数据 未明确指定人类样本数量,使用了公共数据库中的多个数据集;动物模型使用了CUMS大鼠 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
2 2026-02-14
Single-cell transcriptome revealed the aberrant keratinocytes activation in antigen presentation in atopic dermatitis
2026-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究整合了健康对照、慢性活动性AD患者、自愈AD患者及卵清蛋白诱导AD小鼠模型的皮肤单细胞转录组数据,揭示了AD中角质形成细胞在抗原呈递方面的异常激活及其在慢性炎症中的关键作用 首次系统比较了人类AD不同阶段(包括自愈状态)与卵清蛋白诱导小鼠模型中角质形成细胞的转录组和细胞互作差异,并指出小鼠模型在模拟人类慢性AD机制上的局限性 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;样本量相对有限;小鼠模型与人类疾病的机制差异需进一步探究 探究特应性皮炎(AD)中角质形成细胞的异常激活机制及其在疾病慢性化中的作用 人类AD患者(慢性活动性、自愈)皮肤组织、健康对照皮肤组织、卵清蛋白诱导的AD小鼠模型皮肤组织 单细胞组学 特应性皮炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及健康对照、慢性活动性AD患者、自愈AD患者及AD小鼠模型的多组样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-02-14
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-Mar-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
综述 本文综述了单细胞测序技术在克罗恩病研究中识别的新型免疫细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 利用单细胞测序技术系统识别并总结了克罗恩病中多种新型免疫细胞亚群,如INFLARE细胞和CAITs,为理解疾病免疫机制提供了新视角 作为一篇综述,未涉及原始实验数据,且单细胞测序技术的应用仍存在样本异质性和技术偏差等潜在限制 总结克罗恩病中通过单细胞测序技术发现的免疫细胞亚群,并探讨其在疾病发病机制中的角色及治疗潜力 克罗恩病患者的免疫细胞,特别是通过单细胞测序识别的特定亚群 数字病理学 克罗恩病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-02-14
scRDiT: Generating Single-cell RNA-seq Data by Diffusion Transformers and Accelerating Sampling
2026-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本文提出了一种名为scRDiT的生成方法,通过扩散变换器生成单细胞RNA测序数据,并加速采样过程 结合去噪扩散概率模型和扩散变换器,首次将扩散变换器应用于单细胞RNA测序数据生成,并引入去噪扩散隐式模型以加速采样 仅基于两个不同的scRNA-seq数据集进行实验,未在更广泛的数据集上验证模型的泛化能力 开发一种生成虚拟单细胞RNA测序数据的方法,以捕获数据特征并生成具有类似统计属性的数据集 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 扩散变换器, 去噪扩散概率模型, 去噪扩散隐式模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-02-14
Spatial transcriptomics in bone research: navigating hype and hurdles
2026-Mar, Pathology IF:3.6Q1
综述 本文回顾了空间转录组学在骨骼研究中的应用,探讨了其优势、局限性及未来方向 系统总结了空间转录组学在骨骼研究中的独特挑战,如骨组织脱钙处理,并提出了未来应用潜力 空间转录组学平台存在固有局限性,工作流程瓶颈和分析复杂性限制了其广泛应用 评估空间转录组学技术在骨骼研究中的适用性,并探讨如何克服相关技术障碍 骨骼组织样本,包括不同肌肉骨骼组织和动物模型 数字病理学 骨骼疾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
6 2026-02-14
Spatial and single-cell multi-omics reveal pro-angiogenic THY1⁺ fibroblast subtypes predicting prognosis in prostate cancer
2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过空间和单细胞多组学分析,揭示了前列腺癌中促血管生成的THY1⁺成纤维细胞亚型及其与预后的关联 首次识别并验证了前列腺癌中一个独特的促血管生成THY1⁺癌症相关成纤维细胞亚型,并揭示了其通过CXCL6/CXCR2轴和THY1介导的VEGFA表达驱动肿瘤进展的机制 研究样本量相对有限(前瞻性队列n=84),且主要基于公共和单中心数据,需要更大规模的多中心验证 识别和验证与侵袭性前列腺癌相关的特定THY1⁺癌症相关成纤维细胞亚型 前列腺癌患者组织、癌症相关成纤维细胞、THY1⁺/THY1⁻成纤维细胞亚群、内皮细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、qPCR、多重免疫组化、ELISA、抗体阵列、管形成实验 LASSO Cox回归 多组学数据(转录组、蛋白质组)、图像数据、临床数据 公共队列(TCGA-PRAD, GEO)和前瞻性队列(FUSCC, n=84) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
7 2026-02-14
Tumor-stroma contributes to immunotherapeutic resistance in non-small cell lung cancer via SEMA3C-mediated immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了肿瘤-间质比例(TSP)作为非小细胞肺癌(NSCLC)免疫检查点阻断(ICB)耐药性的独立预后生物标志物,并鉴定出SEMA3C是介导免疫抑制性肿瘤微环境的关键分子 首次将TSP与NSCLC的ICB耐药性联系起来,并鉴定出SEMA3C作为TSP轴中的关键介质,通过调节癌症相关成纤维细胞(CAFs)功能促进免疫抑制性肿瘤微环境 研究主要基于TCGA队列和体外/体内实验,需要在更大的独立临床队列中进行验证,并且SEMA3C的具体下游信号通路尚未完全阐明 探究肿瘤-间质比例(TSP)在非小细胞肺癌(NSCLC)免疫治疗耐药性中的作用机制 非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肿瘤细胞、CD8⁺ T细胞 数字病理学 肺癌 H&E染色、转录组分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能验证实验 NA 图像数据、转录组数据、单细胞测序数据 TCGA-NSCLC队列患者(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-02-14
Integrated multi-omics analysis of prognostic model and immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,构建了肝内胆管癌的五基因预后模型,并揭示了MT1X在肿瘤进展和免疫抑制微环境中的作用 首次结合单细胞与空间转录组学分析肝内胆管癌,识别了上皮-成纤维细胞亚群互作,并通过机器学习构建了五基因预后特征,同时通过功能实验验证了MT1X的促癌作用 研究可能受限于样本量或特定队列的异质性,且功能实验主要在体外进行,需要进一步体内验证 阐明肝内胆管癌的免疫景观并指导精准免疫治疗 肝内胆管癌(iCCA) 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq 机器学习 RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
9 2026-02-14
POSTN⁺ cancer-associated fibroblast-CCL3⁺ macrophage crosstalk defines the immune-excluded tumor microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组数据,揭示了透明细胞肾细胞癌中POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与CCL3⁺巨噬细胞之间的相互作用,定义了驱动免疫排斥和免疫治疗抵抗的基质-免疫信号轴 首次在透明细胞肾细胞癌中识别出POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与CCL3⁺巨噬细胞的空间共定位,并揭示其通过TGF-β、SPP1和IL-6信号通路形成纤维化屏障,导致免疫排斥和免疫治疗抵抗 研究主要基于转录组数据,缺乏功能实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性;未涉及其他潜在免疫细胞亚型的影响 探究透明细胞肾细胞癌中免疫排斥肿瘤微环境的基质-免疫相互作用机制 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤微环境,特别是成纤维细胞亚型和巨噬细胞 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 聚类分析, 轨迹分析, 转录因子调控网络分析, 基因网络分析, CellChat, NicheNet, SpaGene 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 八个单细胞RNA测序数据集, 两个空间转录组数据集, TCGA-KIRC队列和ICB治疗队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
10 2026-02-14
Revealing the function and mechanism of piRNA-related genes in bladder cancer through single-cell sequencing and methylation analyses and construction of prognostic features based on consensus clustering
2026-Mar, Current urology IF:0.9Q4
研究论文 本研究通过单细胞测序和甲基化分析揭示了piRNA相关基因在膀胱癌中的功能和机制,并基于共识聚类构建了预后特征 首次结合单细胞测序、甲基化分析和共识聚类技术,系统探索piRNA相关基因在膀胱癌中的功能机制并构建三基因预后模型 研究主要基于公共数据库和体外验证,缺乏大规模临床队列验证和体内功能实验 探索PIWI-interacting RNA相关基因在膀胱癌发生发展中的功能机制并构建预后模型 膀胱癌细胞和组织、TCGA膀胱尿路上皮癌数据集 生物信息学 膀胱癌 单细胞测序, 甲基化测序, 差异甲基化位点测序, 定量PCR, 机器学习 共识聚类, 逻辑回归 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞数据 TCGA膀胱癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 甲基化测序 NA NA
11 2026-02-14
Novel association of NAV3 with dilated cardiomyopathy and its role in cardiac fibrosis
2026-Mar-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过GWAS发现NAV3基因与扩张型心肌病相关,并利用单细胞RNA-seq和体外实验揭示了NAV3在TGF-β1诱导的心脏成纤维细胞活化和纤维化中的新功能机制 首次将NAV3基因与扩张型心肌病的心肌恢复能力关联,并发现其在心脏纤维化中通过非经典信号通路(独立于SMAD2/3)调节细胞周期和成纤维细胞-肌成纤维细胞转化的新作用机制 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;机制研究尚未完全阐明NAV3调控的具体下游信号通路 探究NAV3基因在心脏病理生理学中的功能作用,特别是在扩张型心肌病相关心脏纤维化中的作用机制 人类心脏组织(来自已发表数据)、原代人类心室心脏成纤维细胞 基因组学与分子生物学 心血管疾病 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA-seq、RNA测序、Western blot、siRNA敲低 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 未明确样本数量(使用已发表的人类心脏单细胞RNA-seq数据) NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-02-14
Interpretable Aging Signatures in Human Retinal Cell Types Revealed by Single-Cell RNA Sequencing and Sparse Logistic Regression
2026-Mar, Ophthalmology science IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和稀疏逻辑回归,揭示了中国人群视网膜细胞类型中可解释的衰老特征 首次在中国人群中利用机器学习模型推导出细胞类型特异性的人类视网膜衰老特征,揭示了保守的分子标志和独特的细胞脆弱性 样本量较小(18个视网膜,12名捐赠者),且为横断面研究,无法追踪个体随时间的变化 表征人类视网膜衰老过程中的细胞类型特异性转录变化,并开发用于细胞年龄判别的机器学习模型 中国捐赠者的视网膜细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 稀疏逻辑回归(L1正则化逻辑回归加递归特征消除) 单细胞转录组数据 18个未冷冻视网膜,来自12名中国捐赠者(9名年轻,34-55岁;9名老年,68-92岁),共223,612个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' v3.1
13 2025-12-07
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14 2026-02-14
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其对免疫抑制微环境和患者预后的影响 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1-FPR1/2/S100A9信号轴介导的巨噬细胞-内皮细胞空间互作机制 研究样本量有限,空间成像验证需进一步扩展;机制研究主要基于相关性分析,需要更多功能实验验证 解析B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中单核吞噬细胞与血管内皮细胞的相互作用机制及其临床意义 弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤患者淋巴结样本,以及反应性次级淋巴器官对照样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间成像分析 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间定位数据 B细胞淋巴瘤淋巴结样本与对照样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 NA NA
15 2026-02-14
Circulating CD34+ Fibroblast Progenitors Engaged in Heart Fibrosis of Allograft
2026-Feb-13, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和遗传细胞谱系追踪技术,揭示了循环CD34+细胞作为心脏移植后纤维化中成纤维细胞前体的新来源 首次发现循环CD34+细胞可作为成纤维细胞前体参与心脏移植后纤维化,并揭示了CXCL12-ACKR3和MIF-ACKR3相互作用以及TGFβ/GFPT2/SMAD2/4轴的分化机制 研究主要基于小鼠模型和人类样本的体外实验,临床转化潜力需进一步验证 探索心脏移植后纤维化中成纤维细胞的来源及其机制 人类心脏移植样本、小鼠移植模型(包括C57BL/6J、Cd34-CreERT2等品系)以及从血液中培养的人类前体细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、Western印迹、定量PCR、免疫组化、三维重建全组织染色 NA RNA测序数据、图像数据 人类心脏移植样本和小鼠模型(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-02-14
Gut-Heart Axis in Myocardial Repair: Mechanisms, Cross-Organ Networks, and Therapeutic Opportunities
2026-Feb-13, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了肠道微生物群通过复杂的跨器官网络(如肠-脑-心轴、肠-肝-心轴和肠-肺-心轴)影响心肌损伤、修复和再生的机制,并探讨了其作为疾病驱动因素和潜在治疗靶点的前景 系统性地阐述了肠道微生物群在心肌修复与再生中的新兴作用,提出了“肠-心肌轴”作为心血管疾病精准医学新前沿的概念,并强调了将高分辨率多组学与机制模型结合的未来研究方向 本文为综述性文章,主要基于现有研究进行总结和展望,未提供新的原始实验数据或临床验证 阐明肠道微生物群与心肌修复、再生之间的双向对话机制,并探索其作为心血管疾病诊断和治疗新靶点的潜力 肠道微生物群及其代谢物、心肌组织、跨器官网络(如肠-脑-心、肠-肝-心、肠-肺-心轴) 心血管疾病 心血管疾病 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
17 2026-02-14
Macrophage SBK2 suppresses inflammation and atherosclerosis by NLRP3 phosphorylation
2026-Feb-13, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究探讨了巨噬细胞SH3结构域结合激酶2(SBK2)在动脉粥样硬化发病机制中的功能意义和治疗潜力,发现其通过磷酸化NLRP3并促进其自噬降解来抑制炎症和动脉粥样硬化 首次发现SBK2是唯一已知能够介导NLRP3选择性清除的蛋白激酶,并鉴定出小分子化合物rebaudioside N(RN)作为有效的SBK2激动剂,为靶向SBK2-NLRP3轴提供了精确的治疗策略 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其在人类患者中的直接疗效和长期安全性仍需进一步临床验证 阐明巨噬细胞SBK2在动脉粥样硬化中的功能机制并探索其作为治疗靶点的潜力 小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化病变组织、巨噬细胞 NA 心血管疾病 单细胞测序、免疫共沉淀、体外激酶活性测定、质谱分析、高通量小分子化合物筛选 NA 测序数据、蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-02-14
Single-Cell RNA Sequencing of Human Lung Tissues Reveals Metallothionein-Positive T Cells as a Novel Potential Marker of Susceptibility to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-Feb-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在人类肺组织中鉴定出一种高表达金属硫蛋白基因的新型T细胞亚群,并发现其在慢性阻塞性肺疾病进展过程中逐渐耗竭,具有作为疾病易感性和进展生物标志物的潜力 首次在人类肺组织中鉴定出以高表达金属硫蛋白基因为特征的新型T细胞亚群,并揭示了其在COPD进展中的动态变化和免疫调节功能 未明确MT-high T细胞耗竭的具体分子机制及其在疾病早期干预中的具体应用路径 探索慢性阻塞性肺疾病的新型生物标志物和免疫病理机制 从不吸烟的健康对照者、COPD前期患者和COPD患者的肺组织及外周血样本 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 包含健康对照、COPD前期和COPD患者的多组肺组织和外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-02-14
CCR8 Expression on Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation and Protects Against Myocardial Infarction-Induced Tissue Damage
2026-Feb-13, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了心肌梗死后心脏中调节性T细胞的组织适应轨迹,并发现CCL1-CCR8轴在招募CCR8+ Tregs以减轻组织损伤中的关键作用 通过单细胞RNA测序揭示了Tregs从纵隔淋巴结到心脏的分步分化轨迹,并首次确定CCL1-CCR8轴为心肌梗死后Treg招募和功能的核心通路 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且临床相关性需进一步大规模研究确认 探究心肌梗死后心脏特异性调节性T细胞的发育轨迹及其招募分子机制 小鼠心肌梗死模型中的调节性T细胞、巨噬细胞及人类心肌梗死患者的心脏组织和循环血液 免疫学 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、基因敲除小鼠模型 NA RNA测序数据、基因表达数据 包括多种基因工程小鼠模型及人类心肌梗死患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-02-14
Spatial transcriptomics reveals a key role of fibroblast-like vascular smooth muscle cells in human atherosclerotic cell crosstalk and stability
2026-Feb-13, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学和单细胞转录组学技术,揭示了人类动脉粥样硬化斑块中成纤维细胞样血管平滑肌细胞在细胞间通讯和斑块稳定性中的关键作用 首次提供了人类斑块微环境中细胞通讯的全面空间转录组学图谱,并识别出成纤维细胞样VSMC作为斑块内信号传导和稳定性的关键调节者 研究主要基于人类颈动脉斑块样本,可能无法完全代表其他血管区域的斑块特性 探索动脉粥样硬化斑块中细胞表型、空间分布及相互作用,以识别预防动脉粥样硬化事件的新靶点 人类颈动脉斑块样本、Apoe-/-小鼠模型及体外细胞培养 空间转录组学 心血管疾病 空间转录组学、单细胞转录组学、bulk RNA-seq、基因组关联研究分析、药物重定位分析 NA 转录组数据、组织学图像 13个颈动脉斑块(空间转录组学)、51,981个细胞(单细胞转录组学)、78个斑块bulk RNA-seq样本 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq Visium, 10x Chromium Visium空间转录组学平台用于斑块空间分析,10x Chromium用于单细胞转录组学
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