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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-03 |
Comprehensive analysis of the single-cell and transcriptomics uncovers the pathogenic network and potential biomarkers related to hypoxia, metabolic reprogramming and atherosclerosis in obstructive sleep apnoea
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2026.2730116
PMID:42821729
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研究论文 | 该研究通过综合分析批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集,识别阻塞性睡眠呼吸暂停的关键生物标志物,并揭示与缺氧、代谢重编程和动脉粥样硬化相关的致病网络 | 结合WGCNA与多种机器学习方法(随机森林、SVM-RFE、LASSO)识别出四个枢纽基因(C17ORF91、HBEGF、PGBD2、ZNF616)作为候选生物标志物,并通过单细胞RNA-seq揭示cMonocytes在OSA进展中的核心作用及其在缺氧、代谢功能障碍和动脉粥样硬化风险中的最高评分 | 研究结果为假设生成性,枢纽基因的诊断性能为探索性(AUC > 0.7),列线图仅在发现队列中显示良好的内部性能,需要独立外部验证和功能验证 | 识别阻塞性睡眠呼吸暂停的关键生物标志物,并探索与缺氧、代谢重编程和动脉粥样硬化相关的致病网络 | 阻塞性睡眠呼吸暂停患者与对照组的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | 随机森林,SVM-RFE,LASSO | 文本 | RNA-seq数据集GSE75097包含6例对照和42例OSA;单细胞RNA-seq数据集GSE214865包含11例对照和11例OSA | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-10-03 |
Chaenomeles speciosa-derived extracellular vesicles accelerate fracture healing via orchestrating immuno-angiogenic coupling
2026-Dec, Bone reports
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.bonr.2026.101951
PMID:42824352
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研究论文 | 本研究探讨了来源于皱皮木瓜的细胞外囊泡通过重塑骨免疫微环境和促进免疫-血管生成偶联来加速骨折愈合的作用及机制 | 首次发现皱皮木瓜来源的细胞外囊泡能够通过调控巨噬细胞极化、促进免疫-血管生成偶联来加速骨折愈合,并提出了一种基于植物来源细胞外囊泡的多靶点治疗策略 | 研究主要基于大鼠股骨骨折模型和体外细胞实验,尚未进行临床验证;细胞外囊泡的具体活性成分和作用分子机制仍需进一步深入解析 | 探究皱皮木瓜来源的细胞外囊泡是否能通过重塑免疫微环境促进骨折愈合,并阐明其潜在分子机制 | 人骨不连组织、RAW 264.7巨噬细胞、人脐静脉内皮细胞、大鼠股骨骨折模型 | 数字病理, 机器学习 | 骨折不愈合, 骨科疾病 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接, 超速离心, 透射电子显微镜, 微计算机断层扫描, 组织学 | NA | 图像, 文本 | 人骨不连组织样本(具体数量未提及)、RAW 264.7巨噬细胞、人脐静脉内皮细胞及大鼠股骨骨折模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-10-03 |
PD-L1 antibody-induced cardiac dysfunction is regulated by CCR5-positive macrophages
2026-Nov-10, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179333
PMID:42762914
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研究论文 | 该研究通过小鼠模型揭示PD-L1抗体通过CCL5/CCR5轴诱导CCR5阳性巨噬细胞浸润和增殖,导致心脏功能障碍,而CCR5拮抗剂maraviroc可保护心脏而不影响抗肿瘤疗效 | 首次阐明CCL5/CCR5轴是PD-L1抗体诱导早期心脏毒性的核心机制,并证明maraviroc通过免疫调节、代谢重编程和凋亡控制等多效性保护作用预防免疫治疗相关心脏并发症 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证maraviroc对PD-L1抗体相关心脏毒性的保护效果 | 系统研究PD-L1抑制的早期心脏毒性效应及其机制,并探索CCR5阻断作为预防免疫治疗相关心脏并发症的策略 | PD-L1抗体治疗的小鼠模型及黑色素瘤荷瘤小鼠 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-10-03 |
Targeting the Snail1-ATGL-ferroptosis-EMT axis via AKT-GSK3β signaling: Low-dose colchicine attenuates idiopathic pulmonary fibrosis
2026-Nov-10, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179372
PMID:42785459
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研究论文 | 该研究揭示了低剂量秋水仙碱通过AKT-GSK3β-Snail1信号轴恢复ATGL表达,从而抑制铁死亡驱动的EMT,减轻特发性肺纤维化的新机制 | 首次发现ATGL是调节铁死亡易感性和EMT的上皮检查点,揭示了Snail1通过招募HDAC1/HDAC2抑制ATGL转录的非经典EMT调控机制,并阐明了低剂量秋水仙碱通过AKT-GSK3β-Snail1轴恢复ATGL表达的抗纤维化新机制 | 研究主要基于公共转录组和单细胞RNA测序数据集分析以及博来霉素诱导的小鼠模型和细胞模型,缺乏临床试验数据验证 | 阐明低剂量秋水仙碱对特发性肺纤维化中铁死亡驱动的EMT的影响及其机制,重点研究Snail1-ATGL轴作为调节氧化还原平衡和铁死亡易感性的新通路 | 特发性肺纤维化患者的肺组织及肺泡上皮细胞、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型、TGF-β刺激的小鼠肺上皮细胞(MLE-12)和人支气管上皮细胞(BEAS-2B) | 机器学习 | 肺纤维化 | 转录组测序,单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀,蛋白质相互作用实验 | NA | 文本,图像 | 公共转录组和单细胞RNA测序数据集、博来霉素诱导的小鼠模型、TGF-β刺激的MLE-12和BEAS-2B细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-10-03 |
Patient-derived surgical samples reveal the cellular and molecular signatures of glioblastoma infiltration in distinct radiological zones
2026-Nov, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70106
PMID:42083511
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研究论文 | 本文通过对45例胶质母细胞瘤患者的161份活检样本进行影像学分区、组织学和转录组分析,揭示了不同放射学区域中肿瘤浸润的细胞和分子特征及其与临床预后的关联 | 首次系统地在不同MRI放射学区域(增强肿瘤、非增强肿瘤、血管源性水肿和放射学正常组织)中结合组织学和转录组学分析胶质母细胞瘤的浸润特征,并发现水肿区域中存在被低估的肿瘤浸润,同时揭示了外周细胞密度和免疫相关表型与切除范围和预后的关联 | 样本量相对有限(45例患者),且研究为前瞻性观察性研究,需要更大规模的多中心验证;转录组分析仅选取了免疫、胶质和血管标志物,可能未全面覆盖肿瘤微环境的复杂性 | 定义胶质母细胞瘤周边的细胞景观及其临床相关性,以改进手术和治疗决策 | 45例胶质母细胞瘤患者的161份手术活检样本 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学(MIB1染色)、转录组分析、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 图像、文本 | 161份活检样本来自45例胶质母细胞瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-10-03 |
Spatial multi‑omics identifies an SPP1+ macrophage‑driven anti‑apoptotic niche in osteoarthritis synovium via the SPP1‑CD44 axis
2026-Nov, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.6005
PMID:42825366
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学、单细胞RNA测序和凋亡模型,揭示了骨关节炎滑膜中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动抗凋亡微环境,从而维持慢性滑膜炎 | 首次通过空间多组学揭示骨关节炎滑膜中TGF-β富集微环境内SPP1+巨噬细胞与衰老滑膜成纤维细胞相邻扩增,并发现SPP1+巨噬细胞不同于已知的促纤维化作用,而是通过SPP1-CD44信号轴直接抑制炎性巨噬细胞凋亡,同时通过CCL3分泌招募更多髓系细胞 | SPP1介导的凋亡调控网络通过虚拟敲除模型推断,候选化合物的验证仍需未来实验确认 | 研究骨关节炎发病过程中调控凋亡通路的滑膜巨噬细胞功能亚群及其空间微环境 | 骨关节炎滑膜组织中的巨噬细胞亚群及其空间微环境,以及小鼠骨关节炎模型 | 空间多组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 虚拟敲除模型 | 图像,文本 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-10-03 |
Spatiotemporal development of sparse excitatory neuronal types within the deep mouse cortex
2026-Oct-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117558
PMID:42824119
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组学技术,在四个发育时间点对小鼠大脑进行时空图谱绘制,重点研究深层皮层中稀疏兴奋性神经元类型(板下区和屏状核)的发育差异 | 首次通过单细胞空间转录组学揭示板下区和屏状核在发育过程中具有不同的起源、转录组演化轨迹和时空成熟模式,颠覆了传统认为二者发育模式相似的观念 | 研究仅针对小鼠大脑,未验证人类大脑中是否存在类似机制,且样本时间点有限,可能遗漏部分发育阶段的动态变化 | 揭示小鼠大脑发育过程中细胞类型在时空上的组织规律,重点解析深层皮层中稀疏兴奋性神经元类型的发育差异 | 发育中的小鼠大脑,包括胚胎期和出生后多个时间点,重点关注板下区和屏状核的深层皮层神经元 | 空间转录组学、发育神经生物学 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 超过150万个脑细胞,涵盖胚胎期和出生后四个发育时间点,包含雌雄两性 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-10-03 |
Comprehensive Multi-Omic Profiling of Desmoplastic Small Round Cell Tumors Identifies Targetable Pathways with Therapeutic Opportunities
2026-Oct-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-25-1134
PMID:42312950
|
研究论文 | 本研究通过对五名患者的九份肿瘤活检样本进行多组学分析,全面揭示了促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤的可靶向通路及治疗机会 | 首次对促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤进行综合性多组学分析,整合了批量与单细胞RNA测序、蛋白质分析、免疫组化、免疫分析及功能性同源重组缺陷检测,发现了缺乏基因组HRD瘢痕特征但具有功能性HRD的肿瘤亚群,并揭示了治疗依赖性的表达和活性变化 | 样本量较小(仅五名患者的九份活检样本),可能限制了研究结果的普遍性;研究为观察性分析,未进行临床试验验证靶向治疗的实际疗效 | 对促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤进行深入的多组学表征,识别可靶向的分子特征和患者特异性弱点,为生物标志物指导的治疗策略奠定基础 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤患者来源的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质分析、免疫组化、免疫分析、功能性同源重组缺陷检测 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、图像 | 五名患者的九份患者来源肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-10-03 |
Macrophage-Induced Senescent Cancer-Associated Fibroblasts Promote SASP-Mediated Chemoresistance in Colorectal Cancer
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4870
PMID:42418705
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研究论文 | 该研究基于单细胞RNA测序数据构建机器学习预测模型识别衰老癌症相关成纤维细胞(sCAF),揭示巨噬细胞来源的IL1B通过IL1B-IL1R1轴诱导CAF衰老,进而通过SASP介导结直肠癌化疗耐药 | 开发了基于机器学习的细胞衰老预测模型用于准确识别sCAF,首次揭示巨噬细胞来源的IL1B通过IL1B-IL1R1相互作用触发CAF衰老,阐明sCAF通过SASP(IL6和CXCL12)介导结直肠癌化疗耐药的新机制 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发机器学习预测模型识别衰老CAF,探究sCAF在结直肠癌化疗耐药中的作用及其诱导机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAF)、巨噬细胞及患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 | 机器学习预测模型 | 单细胞RNA测序数据,图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-10-03 |
High-Risk Rhabdomyosarcomas Feature a Convergent Cell State
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4403
PMID:42446905
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研究论文 | 通过单细胞转录组等多组学技术揭示了高风险横纹肌肉瘤癌细胞趋同于一种共同的细胞状态,该状态独立于FOXO1融合状态,并具有神经特征 | 发现了高风险横纹肌肉瘤中超越传统分子和组织学边界的一种趋同细胞状态,该状态与FOXO1融合的转录效应仅部分重叠,且意外表现出神经特征 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探索横纹肌肉瘤中与致死性疾病相关的癌细胞状态,超越传统FOXO1融合状态的预后分类 | 横纹肌肉瘤(RMS)患者的癌细胞,包括不同FOXO1融合状态的致死性疾病样本 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞转录组测序、核转录组学、染色质可及性测序、空间转录组学、扰动研究 | NA | 图像、文本、单细胞转录组数据、空间转录组数据、染色质可及性数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 11 | 2026-10-03 |
Targeting Cystine Addiction Suppresses Breast Cancer Lung Metastasis
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3883
PMID:42412619
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研究论文 | 该研究通过体内外模型揭示MYC驱动的乳腺癌肺转移细胞依赖胱氨酸摄取以增加谷胱甘肽合成,并证明胱氨酸酶联合放疗可有效抑制肺转移 | 首次发现乳腺癌肺转移细胞通过下调转硫途径并增加胱氨酸摄取来增强谷胱甘肽合成,从而产生对胱氨酸/半胱氨酸的代谢依赖性,并证明胱氨酸酶可作为放疗增敏剂 | 研究主要基于MYC驱动的乳腺癌模型,结论是否适用于其他亚型或人类患者尚需进一步验证;胱氨酸酶联合放疗的长期疗效和安全性需更多临床前及临床研究 | 探索乳腺癌肺转移过程中的关键代谢变化及相应治疗脆弱性,以开发更有效的抗转移疗法 | MYC驱动的乳腺癌小鼠模型及其肺转移细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 稳定同位素分辨代谢组学、质谱成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-10-03 |
Multiomics Dissection Reveals Natural Killer Cell-CD8+ T-cell Cooperation in Shaping an Immunostimulatory Tumor Microenvironment
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4957
PMID:42545372
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研究论文 | 该研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和高维流式细胞术,揭示了在低T细胞浸润肿瘤中自然杀伤细胞与CD8+ T细胞之间的时空协同作用,以及疫苗接种如何重塑肿瘤微环境 | 首次揭示了IRF8+KLRG1+自然杀伤细胞与抗原致敏CXCR3+细胞毒性T淋巴细胞之间的协同程序,发现了CCR5-CCL5和CXCR3-CXCL9信号通路在协调先天性和适应性免疫区室通讯中的作用 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 揭示自然杀伤细胞与CD8+ T细胞在塑造免疫刺激性肿瘤微环境中的协同作用机制 | 低T细胞浸润肿瘤中的免疫细胞(自然杀伤细胞、细胞毒性T淋巴细胞、髓系细胞、树突状细胞等) | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,高维流式细胞术 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-10-03 |
Methyl eugenol increases neural microcirculation to promote nerve repair by regulating endothelial cell and Schwann cell communication via Ptn/Sdc4
2026-Oct-02, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-026-00617-z
PMID:42823554
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研究论文 | 本研究揭示了甲基丁香酚通过调控内皮细胞与施万细胞间Ptn/Sdc4通讯增强神经微循环,从而促进神经修复 | 首次发现甲基丁香酚通过Ptn/Sdc4轴增强内皮细胞与施万细胞通讯,进而改善神经微循环并促进神经修复 | 未明确说明 | 证明甲基丁香酚可以增强神经微循环并促进神经修复 | SD大鼠、大鼠主动脉内皮细胞、大鼠施万细胞(RSC96) | 单细胞测序、转录组学、神经科学 | 神经损伤、慢性疼痛 | 单细胞测序、mRNA测序 | NA | 单细胞测序数据、mRNA测序数据、图像 | 32只大鼠用于CCI时间点评估,32只SD大鼠用于药物实验,以及体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-10-03 |
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals a Fibroblast-Associated Extracellular Matrix Niche in KRAS G12C-Mutant Lung Adenocarcinoma Primary Tumors From Patients With Metastasis
2026-Oct-02, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70764
PMID:42823844
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研究论文 | 该研究利用10x Visium空间转录组技术对4例KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤(2例无转移、2例有转移)进行空间转录组分析,发现与转移相关的成纤维细胞相关细胞外基质生态位 | 首次在KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤中利用空间转录组揭示与转移状态相关的成纤维细胞相关细胞外基质重塑生态位,并鉴定出由COL1A1、COL1A2、COL3A1、SPARC、POSTN和VCAN组成的基因模块 | 样本量极小(仅4例患者),属于探索性初步研究,TCGA验证和体外功能实验仅提供初步支持,需要在更大规模的空间转录组队列和机制模型中进行验证 | 探究KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤中伴随转移发生的空间转录组程序 | 4例KRAS G12C突变肺腺癌患者的原发肿瘤组织,其中2例无转移、2例有转移 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 4例KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤样本,共14,351个空间斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组,结合已发表的NSCLC单细胞图谱进行RCTD解卷积分析 |
| 15 | 2026-10-03 |
stPularity: Spatial Domain Identification via Purity-Constrained Louvain Clustering on Spatially Smoothed Cell Type Proportions
2026-Oct-02, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261491611
PMID:42825456
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研究论文 | 提出stPularity,一种在空间平滑的细胞类型比例上施加纯度约束的Louvain聚类方法,用于空间域识别 | 直接利用反卷积产生的完整细胞类型比例向量,而非仅使用argmax主导细胞类型;在Louvain目标函数中引入归一化熵纯度项,并自动确定聚类数;对反卷积方法无依赖,输入维度低(4-38种细胞类型) | 在四个基准数据集中的三个上优于argmax基线,但未在所有数据集上超越;基于表达的空间方法通过处理完整转录组可获得更高的绝对ARI;性能可能受反卷积质量影响 | 从空间转录组反卷积得到的细胞类型比例向量中识别空间域,避免仅使用主导细胞类型造成的信息丢失 | 空间转录组数据中的每个空间点(spot)及其细胞类型比例向量和空间坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | Louvain聚类(改进的),贝叶斯优化,k近邻图 | 细胞类型比例向量、空间坐标 | 四个基准数据集(具体样本量未提供) | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-10-03 |
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001716
PMID:41678777
|
综述 | 本文综述了空间组学技术(空间转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观基因组学、代谢组学)在肝细胞癌研究中的应用,重点阐述了这些技术如何揭示肿瘤微环境的空间组织及其对预后、免疫逃逸和治疗反应的影响 | 强调了空间分辨分析能够揭示传统bulk或单细胞分子分析无法发现的新型癌细胞与基质细胞及实质细胞群体之间的通讯轴,以及空间映射的配体-受体网络所定义的协调信号回路 | 作为一篇综述,本文未提供原始实验数据,且未对现有空间组学技术在肝细胞癌中的具体技术局限性和标准化问题进行深入讨论 | 总结空间组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨空间生物学如何改变对肝癌生物学的理解并推动空间信息指导的精准肿瘤学发展 | 肝细胞癌及其肿瘤微环境 | 空间生物学 | 肝癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-10-03 |
Mechanotransduction unifies healthy nondiabetic wound healing over time by promoting a Cd14+/C1qa+ fibroblast subpopulation
2026-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.02.027
PMID:41997300
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序表征了糖尿病小鼠伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性,发现机械转导通过促进Cd14+/C1qa+成纤维细胞亚群来统一健康非糖尿病伤口愈合 | 首次在遗传诱导和病理生理性糖尿病小鼠模型中全面表征伤口愈合各阶段成纤维细胞异质性,发现Cd14+/C1qa+血管生成成纤维细胞在非糖尿病伤口愈合中特异性表达,并揭示机械转导通路(FAK和MAPK)在糖尿病中被选择性耗竭 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类糖尿病伤口中验证;样本量有限;单细胞RNA测序时间点仅涵盖术后第0、2、7和30天 | 表征糖尿病小鼠伤口愈合过程中成纤维细胞异质性,探究机械转导在伤口愈合中的作用机制 | C57BL/6非糖尿病野生型小鼠、高脂饮食诱导的病理生理性糖尿病小鼠、瘦素受体缺陷的遗传诱导糖尿病小鼠的全层切除伤口组织 | 单细胞转录组学 | 糖尿病伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种小鼠模型(非糖尿病野生型、高脂饮食诱导糖尿病、瘦素受体缺陷糖尿病)在术后第0、2、7、30天的伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-10-03 |
A Spatial Atlas of Muscle-Invasive Bladder Cancer Reveals Lineage-Specific Vulnerabilities and Immune Architecture
2026-Oct-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-26-0099
PMID:42126225
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研究论文 | 该研究通过整合22个肿瘤的空间转录组学与匹配的批量RNA和全外显子测序数据,构建了肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,揭示了腔面-基底轴的空间组织及其与染色体不稳定、免疫结构和治疗脆弱性的关联 | 首次构建肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,识别出肿瘤内连续的腔面-基底空间轴,揭示该轴与染色体不稳定性、转录可塑性、免疫浸润及化疗敏感性的关联,并发现三级淋巴结构状态的谱系和位置相关差异 | 样本量相对有限(22个肿瘤的空间转录组数据),需要在更大队列中进一步验证空间轴的普遍性及临床转化价值 | 构建肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,解析肿瘤状态的空间组织、微环境背景、免疫结构及治疗脆弱性 | 肌层浸润性膀胱癌肿瘤样本(22个空间转录组肿瘤及超过3000个泛队列肿瘤) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学, 批量RNA测序, 全外显子测序 | NA | 图像, 文本 | 22个肿瘤的空间转录组数据及超过3000个肿瘤的泛队列分析 | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-10-03 |
Senescent-Like Neutrophils Shape Angiogenic Immunosuppressive Niches in Colorectal Cancer Liver Metastasis
2026-Oct-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0820
PMID:42154581
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序,揭示了结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录景观,并发现一个终末分化的促肿瘤中性粒细胞亚群(TAN1)在肝转移中富集且与不良预后相关 | 首次在结直肠癌肝转移中系统描绘肿瘤相关中性粒细胞的转录图谱,发现BHLHE40驱动的衰老样中性粒细胞亚群TAN1,并揭示其通过VEGFA促进血管生成及通过CCL3L1-CCR1招募免疫抑制性巨噬细胞来塑造血管生成免疫抑制生态位的新机制 | 摘要中未提及具体局限性,但研究主要基于测序数据和鼠模型,需进一步在更大队列和临床样本中验证 | 全面解析结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的异质性、功能及其在免疫抑制微环境中的作用机制 | 结直肠癌肝转移患者的肿瘤组织及小鼠模型中的肿瘤相关中性粒细胞 | 单细胞组学, 空间组学, 肿瘤免疫学 | 结直肠癌, 肝转移 | 单细胞RNA测序, 空间增强分辨率组学测序, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-10-03 |
Granulocyte heterogeneity in immune-mediated and inflammatory diseases: insights from single-cell transcriptomic analyses
2026-Oct-01, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxag026
PMID:42186818
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析在免疫介导和炎症性疾病中揭示的粒细胞异质性,涵盖中性粒细胞和嗜酸性粒细胞的疾病相关亚群及其潜在临床意义 | 系统整合了单细胞RNA测序在多种免疫介导和炎症性疾病中揭示的粒细胞转录组异质性,提出超越传统密度和表面标志物分类的粒细胞亚群新视角,并探讨了整合性单细胞方法在生物标志物开发和靶向治疗策略中的潜力 | 这些疾病相关粒细胞群体是否因果性参与疾病病理生理仍 largely 不清楚,缺乏实验验证的功能和临床可用的替代标志物(如表面标志物或循环蛋白) | 总结免疫介导和炎症性疾病中粒细胞异质性研究的最新进展和当前局限,探讨整合性单细胞方法如何支持临床相关生物标志物和靶向治疗策略的开发 | 免疫介导和炎症性疾病中的粒细胞(中性粒细胞和嗜酸性粒细胞),包括显微镜下多血管炎、COVID-19、脓毒症、心血管疾病和过敏性疾病 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |