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当前共找到 38157 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-09 |
Neutrophils have altered response to acute respiratory viral infection in sputum of patients with rheumatoid arthritis
2026-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2026.100665
PMID:41852854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者与健康对照者在呼吸道感染前后痰液中的免疫细胞转录组差异 | 首次在类风湿关节炎患者痰液中应用单细胞RNA测序技术，揭示中性粒细胞在感染后30天内持续存在的转录组差异 | 样本量较小（仅5名女性捐赠者），且缺乏长期随访数据 | 探究类风湿关节炎患者肺部免疫细胞在急性呼吸道病毒感染前后的转录组变化 | 类风湿关节炎患者和健康对照者的痰液样本 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名女性捐赠者（2名健康，3名类风湿关节炎），共23,094个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Flex | 10x Flex单细胞RNA测序协议 |
| 2 | 2026-04-09 |
Guanylate-binding proteins balance iNOS/Arg-1 in myeloid cells during L. major infection and promote host defense to infection
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02825-25
PMID:41805192
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白（Gbps）在利什曼原虫感染期间对宿主巨噬细胞免疫反应的调控作用 | 揭示了Gbps在感染期间通过平衡iNOS/Arg-1表达来调节巨噬细胞激活状态的新机制，且这种保护作用不依赖于Gbps定位于寄生虫 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；Gbps的具体作用通路仍需进一步阐明 | 探究Gbps在皮肤利什曼病感染期间对宿主免疫防御的贡献 | C57BL/6小鼠、骨髓来源巨噬细胞、单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量，使用Gbp敲除和C57BL/6对照小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-09 |
Comprehensive immune profiling reveals IFN-γ signaling in T cells mediates parasite phagocytosis in a rodent malaria model
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03938-25
PMID:41810957
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研究论文 | 本研究通过啮齿动物疟疾模型和全面的转录组学分析，揭示了IFN-γ信号在T细胞中通过调节T细胞-单核细胞相互作用，影响疟疾相关肺病理中寄生虫吞噬的关键作用 | 首次在疟疾相关肺病理模型中，系统揭示了IFN-γ信号在T细胞中调控T细胞-单核细胞相互作用，并鉴定出具有高吞噬能力的CD8+促炎单核细胞亚群 | 研究基于啮齿动物模型，结果在人类疟疾中的适用性需要进一步验证 | 阐明疟疾相关肺病理的免疫机制 | 疟疾感染小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术、时间序列批量转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-09 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-Apr-08, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为GatorST的新型空间转录组数据分析框架，该框架通过结合图建模和元学习策略，有效整合局部和全局空间信息以生成具有生物学意义的表示 | GatorST创新性地将基于图的建模与高级元学习策略相结合，通过局部点-点图和全局基因表达聚类伪标签，以及受元学习启发的分集训练策略，显著提升了空间表示学习的鲁棒性和泛化能力 | NA | 开发一个能够有效整合空间和转录组信息以提升空间转录组数据分析性能的框架 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 元学习 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-04-09 |
Shear stress-induced endothelial HEG1 signalling regulates vascular tone and blood pressure
2026-Apr-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf742
PMID:40986512
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞中HEG1蛋白在血流剪切应力感应和血压调节中的关键作用及其分子机制 | 首次发现内皮HEG1通过CUL3介导的PHACTR1降解调控eNOS转录和NO产生，从而影响血管舒张和血压 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限，且未探讨HEG1信号通路在其他心血管疾病中的潜在作用 | 阐明内皮HEG1在血压调节中的作用及其分子机制 | 内皮细胞、小鼠模型、人类动脉和血浆样本 | 心血管生物学 | 高血压 | 单细胞RNA测序、计算流体动力学分析、蛋白质组学、转录组学、泛素化分析 | 内皮特异性Heg1敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、血流动力学数据 | 多个独立队列的人类动脉和血浆样本，以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-09 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2026-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
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研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病中成纤维细胞代谢重编程在肠道纤维化中的作用，揭示了circPLCE1通过调控戊糖磷酸途径影响纤维化的新机制 | 首次发现circPLCE1通过直接结合XYLB酶并竞争性抑制其活性来调控戊糖磷酸途径，从而影响肠道纤维化进程 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩大样本量 | 探索克罗恩病肠道纤维化过程中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制 | 人类肠道肌成纤维细胞、小鼠肠道纤维化模型、克罗恩病患者肠道组织 | 单细胞组学与空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、空间转录组、代谢组学、circRNA转录组、代谢流分析、海马分析、RNA pull-down | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、代谢组数据、转录组数据 | 配对的狭窄和非狭窄肠道组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-09 |
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281001.125
PMID:41633767
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架，利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补，以提高数据质量和下游分析效果 | spRefine首次结合基因组语言模型，以无参考框架联合处理空间转录组数据的去噪和插补问题，并展示了在模型预训练和新型生物信号发现方面的潜力 | 未在摘要中明确提及 | 解决空间转录组数据中高噪声和基因测量缺失的问题，以提升数据整合和分析能力 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | 深度学习框架，基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-09 |
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281113.125
PMID:41781332
|
研究论文 | 本研究利用单核多组学测序技术，描绘了小鼠黑质随年龄变化的转录组和表观基因组图谱，揭示了与帕金森病相关的保守基因改变 | 首次在小鼠黑质中应用单核多组学测序进行全生命周期分析，并整合多个公共PD单细胞RNA-seq数据集，系统性地揭示了衰老与帕金森病在细胞类型特异性层面的共同基因调控网络变化 | 研究基于小鼠模型，其发现向人类帕金森病的直接转化需进一步验证；样本量相对有限，且主要关注黑质区域 | 探究衰老作为帕金森病主要风险因素的具体分子机制，并识别潜在的疾病相关基因和通路 | 小鼠黑质区域的细胞 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单核多组学测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 40,125个细胞 | NA | 单核多组学测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-04-09 |
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281171.125
PMID:41786602
|
研究论文 | 本文介绍了NeighbourNet（NNet）方法，用于构建细胞特异性共表达网络，以发现单细胞RNA测序数据中的精细调控模式 | NNet通过主成分分析和局部回归在K近邻内量化共表达，提高了计算效率并稳定了估计，克服了传统方法依赖预定义集群的局限，支持可扩展的下游分析 | NA | 开发一种可扩展的方法来构建细胞特异性共表达网络，以揭示单细胞水平的动态调控变化 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA）、K近邻回归（KNN） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-09 |
High-fidelity bidirectional translation between single-cell transcriptomes and DNA methylomes with scBOND
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281350.125
PMID:41887797
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scBOND的双向跨模态翻译框架，用于在单细胞转录组和DNA甲基化组之间进行高保真转换 | scBOND利用混合专家块捕获上下文依赖的调控模式，结合自注意力机制和特征重校准模块增强生物信号保真度，并提出了scBOND-Aug变体以在配对数据稀缺场景中提升模型泛化能力 | 现有方法在单细胞RNA测序和单细胞DNA甲基化数据之间的跨模态翻译存在单向性、对上下文特异性DNA甲基化-表达关联建模不足、评估中忽视生物相关性以及在有限配对训练数据中性能差等限制 | 开发一个计算框架，用于在单细胞转录组和DNA甲基化组之间进行双向跨模态翻译，以克服多组学测序技术的技术挑战和高成本限制 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞DNA甲基化（scDNAm）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 混合专家块、自注意力机制、特征重校准模块 | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞DNA甲基化 | NA | NA |
| 11 | 2026-04-09 |
Single-cell RNA-seq reveals trans-sialidase-like superfamily gene expression heterogeneity in Trypanosoma cruzi populations
2026-Apr-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.105822
PMID:41945382
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析克氏锥虫在哺乳动物感染期间不同发育阶段的表面蛋白表达异质性 | 首次在单细胞水平揭示了克氏锥虫种群中转唾液酸酶样超家族基因表达的异质性，并发现每个细胞具有独特的TcS表达谱 | 研究仅关注了amastigote和trypomastigote阶段，未涵盖寄生虫完整生命周期；单细胞测序技术可能受技术噪音影响 | 探究克氏锥虫在哺乳动物感染期间表面蛋白表达的异质性及其在感染策略中的作用 | 克氏锥虫的amastigote和trypomastigote细胞 | 单细胞转录组学 | 恰加斯病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，涉及amastigote和trypomastigote细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-04-09 |
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Apr-07, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3679727
PMID:41945837
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研究论文 | 本文提出了一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架，用于直接分解多维不规则张量数据（即“不规则张量”） | 引入了一种针对不规则张量数据的CP分解框架，通过二元加权张量建模有效域，并将全局目标解耦为独立的、良态子问题，实现了高效可扩展的求解 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够直接处理多维不规则张量数据的分解方法 | 不规则张量数据 | 机器学习 | NA | 张量分解 | CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 | 多维数据、图像、空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-09 |
Img2Gene: Debiased Spatially Resolved Transcriptomics with Biological Context from Pathology Images
2026-Apr-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3681769
PMID:41945845
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研究论文 | 提出一个名为Img2Gene的去偏框架，用于从病理全切片图像中预测基因表达水平，通过整合生物学上下文信息来解决数据稀疏性和模态异质性问题 | 首次将因果分析整合到基因表达预测任务中，以缓解数据稀疏性并实现无偏预测；利用基因集富集分析识别高度相关的通路信息作为生物学上下文；引入跨模态一致性损失来对齐不同模态的数据 | 未明确说明模型在临床样本或更大规模数据集上的泛化能力，也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够从病理图像中准确、无偏地预测空间分辨转录组基因表达水平的计算框架 | 空间转录组数据与病理全切片图像的整合分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架（具体架构未明确说明，但涉及因果分析和跨模态对齐） | 图像（病理全切片图像）与基因表达数据 | 四个公共数据集（具体样本数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-09 |
Androgen Receptor-Induced Lactoferrin Accelerates Prostate Tumorigenesis Through Modulating Ferroptosis
2026-Apr-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520109
PMID:41945871
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研究论文 | 本文揭示了乳铁蛋白在雄激素受体调控下，通过抑制铁死亡促进前列腺癌发生发展的新机制 | 首次发现乳铁蛋白在前列腺癌中具有促癌功能，并阐明了其通过AR-LF-铁死亡轴调控铁代谢和细胞死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，临床转化仍需进一步验证 | 探究乳铁蛋白在前列腺癌发生发展中的作用机制 | 前列腺癌细胞、TRAMP小鼠模型、临床样本数据 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、基因敲除模型 | TRAMP小鼠遗传模型、异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞转录组数据 | TRAMP小鼠模型、TCGA-PARD临床数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-09 |
Prostaglandin E2-driven dedifferentiation of Schwann cells leads to perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-07, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02648-x
PMID:41946682
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中前列腺素E2通过驱动雪旺细胞去分化，进而促进神经周围侵袭的新机制 | 首次阐明了PDAC来源的PGE2通过驱动雪旺细胞去分化，并促使其分泌LIF和ADAMTS-1等促侵袭因子，从而建立有利于神经周围侵袭微环境的旁分泌轴 | 研究主要基于体外共培养模型和临床样本分析，体内动物模型的验证可能有限 | 阐明胰腺导管腺癌中神经周围侵袭的分子机制，并探索潜在的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌组织、雪旺细胞、胰腺癌细胞系（PANC-1和BxPC-3） | 肿瘤生物学，分子病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq，空间转录组学，单细胞分析，共培养实验，3D共培养模型，功能实验 | 共培养模型，3D共培养模型 | 转录组数据，空间转录组数据，单细胞数据，细胞表型数据 | 临床样本（具体数量未明确说明），两种胰腺癌细胞系 | NA | RNA-seq，空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-09 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
|
研究论文 | 本研究揭示了SIRT1通过调控KU70在精原干细胞中维持基因组稳定性的机制，涉及非同源末端连接修复通路 | 首次在精原干细胞中阐明SIRT1通过去乙酰化KU70调控NHEJ修复通路，从而维持基因组稳定性和干细胞稳态 | 研究主要基于体外模型和临床样本分析，体内功能验证和长期效应仍需进一步探索 | 探究SIRT1在精原干细胞DNA损伤应答和基因组稳定性维持中的作用机制 | 人类睾丸组织、精原干细胞、非梗阻性无精子症患者 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blotting、免疫共沉淀、流式细胞术、NHEJ报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、临床组织样本、体外细胞模型数据 | 非梗阻性无精子症患者和梗阻性无精子症对照的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-04-09 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Reveals the Spatiotemporal Trajectory of the Small Peptide TAP4 in Delaying Postharvest Fruit Senescence
2026-Apr-07, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101846
PMID:41947460
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了胰蛋白酶自解肽TAP4延缓火龙果采后衰老的时空轨迹与分子机制 | 首次在火龙果中鉴定出具有最强生物活性的抗衰老肽TAP4，并利用单细胞及空间转录组学解析了其在果皮细胞（尤其是内果皮）中的特异性免疫激活与抗性重建机制 | 研究主要聚焦于火龙果模型，其机制在其他果实中的普适性有待验证；体内功能验证虽通过VIGS等方法进行，但缺乏转基因植株的长期表型数据 | 探究胰蛋白酶自解肽TAP4延缓果实采后衰老的分子机制 | 火龙果果实及其果皮细胞 | 单细胞组学与空间转录组学 | 果实采后衰老 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、VIGS、胼胝质沉积分析、抗病性测定、RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据、空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及火龙果果皮的单细胞及空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-09 |
Single-cell transcriptome analysis indicated that immune-related programmed cell death modification features could predict the clinical outcomes of patients with ovarian cancer
2026-Apr-06, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102752
PMID:41946148
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了免疫相关程序性细胞死亡特征，构建了IPCDS模型以预测卵巢癌患者的临床结局 | 开发了基于免疫相关程序性细胞死亡特征的新型预后模型IPCDS，并验证了PDGFRA作为卵巢癌预后生物标志物的预测性能 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏大规模前瞻性临床验证，且模型在长期预测中的稳定性有待进一步确认 | 识别卵巢癌的免疫相关程序性细胞死亡特征，并构建预测模型以改善预后评估 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析，Western blot，免疫荧光分析 | IPCDS模型（基于101种算法组合构建） | 单细胞转录组数据，临床数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的多个卵巢癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-04-09 |
SLC28A1 inhibits clear cell renal cell carcinoma progression by affecting arachidonic acid metabolism: A novel nucleoside transporter-based targeted therapy strategy
2026-Apr-06, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218481
PMID:41946263
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研究论文 | 本研究阐明了SLC28A1通过影响花生四烯酸代谢抑制透明细胞肾细胞癌进展的机制，并提出了一种基于靶向纳米递送的潜在治疗策略 | 首次将SLC28A1鉴定为ccRCC的关键预后标志物，揭示了其通过调节PLA2G12A介导的花生四烯酸代谢和铁死亡来抑制肿瘤的机制，并开发了基于靶向纳米递送sapitinib的新型治疗策略 | 研究主要基于TCGA数据库和体外/体内模型，缺乏大规模临床队列验证；纳米递送系统的长期生物安全性需进一步评估 | 评估核苷酸转运蛋白在ccRCC中的预后价值，阐明关键NT的作用机制，并开发靶向治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞系、组织样本及动物模型 | 癌症生物学与靶向治疗 | 肾细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、细胞功能实验（敲低/过表达）、动物模型、药物筛选 | LASSO回归模型、Cox回归模型、预后列线图 | 基因组数据、单细胞测序数据、细胞实验数据、动物实验数据 | 基于TCGA数据库的ccRCC样本（具体数量未明确说明），以及体外和体内实验模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-09 |
Patient-derived kidney organoids recapitulate ADPKD and facilitate the identification of Rho pathway inhibitors as candidate therapeutics
2026-Apr-06, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102720
PMID:41946363
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研究论文 | 本研究建立了来自ADPKD患者手术标本的可扩展、多谱系成人肾类器官，用于模拟疾病并筛选候选治疗药物 | 首次直接从ADPKD患者手术标本创建三维高内涵筛选平台，揭示了纤毛依赖性囊肿激活机制，并通过高通量药物筛选鉴定出Rho GTPase抑制剂作为跨基因型的有效囊肿减少剂 | 未明确提及样本量大小或长期治疗效果验证 | 开发模拟ADPKD病理的人类模型并识别潜在治疗策略 | ADPKD患者和健康捐赠者的手术标本衍生的肾类器官 | 数字病理 | 多囊肾病 | 单细胞转录组学、微流体灌注、高通量药物筛选 | NA | 转录组数据、三维类器官图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |