单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 43135 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-07 |
Identification of CD55 as a downstream factor of EP4 receptor signaling in colorectal cancer cells
2026-Nov-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150339
PMID:42551717
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析和功能实验，识别CD55为结直肠癌细胞中EP4受体信号的下游因子，并阐明其调控机制。 | 首次整合转录组谱、癌症基因组数据库和毒物基因组学分析，发现CD55作为EP4受体新靶点，并揭示PGE/EP4受体/Gi蛋白/p38 MAPK信号轴调控CD55表达。 | 研究主要基于细胞系和数据库分析，临床样本验证有限，功能影响需进一步探索。 | 阐明EP4受体信号在结直肠癌中调节CD55表达的分子机制。 | 人结肠癌细胞系HCA-7，人结直肠癌组织的单细胞RNA-seq数据。 | 癌症生物学，基因组学 | 结直肠癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq，癌症基因组数据库分析 | NA（基于细胞系和数据分析，未使用AI模型） | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | HCA-7细胞系和来自公共数据库的结直肠癌组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-09-07 |
Integrative single‑cell and bulk transcriptomic profiling reveals MMP1 as a core effector and CTSB as a putative collaborator in ATBC‑aggravated pulmonary fibrosis
2026-Nov-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150347
PMID:42556761
|
研究论文 | 通过整合单细胞与批量转录组分析，揭示MMP1与CTSB在ATBC加重肺纤维化中的核心作用 | 首次整合化合物靶点预测、转录组筛选、Bootstrap LASSO稳定性选择和蛋白质互作网络分析，结合单细胞转录组学，揭示MMP1在气道club细胞中的'关闭-开启'调控模式及CTSB在巨噬细胞中的促纤维化通信作用 | 研究主要基于动物模型和转录组分析，需进一步验证在人类中的机制，且ATBC暴露的长期效应未充分探讨 | 阐明乙酰柠檬酸三丁酯（ATBC）经呼吸道暴露对肺部的毒性及分子机制，评估其对肺纤维化的影响 | ATBC暴露对肺纤维化的影响及相关分子机制 | 转录组学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学, 批量转录组, Bootstrap LASSO, 蛋白质互作网络分析, 动物模型 | 无特定模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 动物实验数据 | 动物模型（小鼠） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-07 |
Ultraviolet B-induced oxidative stress drives stromal remodeling and malignant transformation of actinic keratosis via a podoplanin-C-type lectin-like receptor 2 signaling axis
2026-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本文通过整合多组学分析揭示了紫外线B诱导的氧化应激通过PDPN-CLEC-2信号轴驱动光化性角化病的基质重塑和恶性转化 | 首次阐明PDPN-CLEC-2信号轴在紫外线B诱导的氧化应激与光化性角化病恶性转化中的关键作用，并鉴定出具有诊断和预后价值的12基因特征 | 未提及明显的限制，可能包括样本来源的局限性或功能实验的适用范围 | 探究紫外线B诱导的氧化应激如何通过分子机制促进光化性角化病的恶性转化 | 角质形成细胞、成纤维细胞、光化性角化病及皮肤鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 皮肤癌（光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌） | 批量RNA测序, 单细胞转录组学, 功能实验 | NA | 转录组数据, 图像 | 六个独立队列 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-07 |
Endocrine-disrupting chemical-induced gene networks confer coronary heart disease risk revealed by causal inference and single-cell analyses
2026-Nov, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116325
PMID:42556777
|
研究论文 | 通过因果推断和单细胞分析揭示内分泌干扰化学物质诱导的基因网络增加冠心病风险 | 结合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序，首次系统性评估内分泌干扰化学物质相关基因对冠心病的因果作用 | 未提及具体局限性 | 识别与内分泌干扰化学物质相关的基因，并评估其在冠心病中的因果作用 | 人类冠状动脉组织及基因表达数据 | 基因组学 | 冠心病 | 全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-07 |
CoQ10 ameliorates intermittent hypoxia-induced ferroptosis by suppressing HMGB1 acetylation and release
2026-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示辅酶Q10通过抑制HMGB1乙酰化及释放，减轻间歇性缺氧诱导的心肌细胞铁死亡，为阻塞性睡眠呼吸暂停相关心血管并发症提供潜在治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定FAP阳性心脏成纤维细胞为间歇性缺氧诱导HMGB1的主要细胞来源，并验证成纤维细胞-心肌细胞旁分泌通讯在心肌氧化损伤中的关键放大作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统阐明间歇性缺氧诱导心肌损伤的氧化还原依赖性信号级联，并探索辅酶Q10的保护机制 | AC16人心肌细胞、小鼠间歇性缺氧模型及心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Co-IP、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因实验 | NA | 单细胞转录组数据、细胞实验数据、动物模型数据 | 小鼠模型及细胞系样本，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 6 | 2026-09-07 |
Nicotine drives lung cancer progression by suppressing cuproptosis through the LIAS-DLAT axis and promoting M2 macrophage polarization
2026-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 该研究揭示尼古丁通过LIAS-DLAT轴抑制铜死亡并促进M2巨噬细胞极化，从而驱动肺癌进展的机制 | 首次阐明了尼古丁通过上调LIAS而不改变DLAT脂酰化水平，使肺癌细胞处于预先存在的铜死亡抵抗状态，并通过代谢重编程塑造免疫抑制微环境的新机制 | 摘要未提及局限性信息 | 探究肺癌细胞在尼古丁环境胁迫下逃避铜死亡的机制及其对肿瘤微环境的影响 | 肺腺癌（LUAD）细胞、正常肺上皮细胞、肺腺癌组织样本 | 转录组分析、单细胞RNA测序、组织微阵列 | 肺腺癌 | 转录组分析、组织微阵列、功能实验、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、组织微阵列图像、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-07 |
Lactate reprogramming hijacks BDNF neuroprotection to drive hippocampal injury after CO poisoning
2026-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 该研究通过临床前实验和单细胞RNA测序，揭示了CO中毒后海马损伤中乳酸重编程劫持BDNF神经保护的新机制 | 首次整合糖酵解代谢组学与单细胞RNA测序，识别出CO中毒后兴奋性神经元中LDHA-乳酸-溶酶体轴通过降解Sortilin干扰BDNF成熟的新机制，并提出了靶向该轴的治疗策略 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，临床样本仅限于血清乳酸水平，未对患者脑组织进行直接验证，且机制研究可能未涵盖所有细胞类型 | 阐明CO中毒后海马损伤的代谢-神经营养机制，并探索潜在治疗靶点 | CO中毒大鼠的海马组织及神经元和微胶质细胞，以及急性CO中毒患者的血清 | 神经科学 | 一氧化碳中毒 | 糖酵解代谢组学、单细胞RNA测序、体外实验 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据、实验图像 | CO中毒大鼠模型（具体数量未提供）及急性CO中毒患者（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-07 |
GPX3 downregulation in alveolar macrophages amplifies IL-17-dependent redox-inflammation crosstalk in ARDS
2026-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ARDS中肺泡巨噬细胞GPX3下调增强IL-17依赖性氧化还原-炎症串扰，并筛选候选治疗药物 | 首次通过单细胞测序鉴定肺泡巨噬细胞作为连接氧化应激和炎症的关键枢纽，并揭示GPX3与IL-17通路之间的功能关联及双向调控机制，同时运用网络药理学筛选潜在治疗化合物 | 未在临床试验中验证候选药物的疗效，且样本量可能有限，具体限制未在摘要中提及 | 阐明ARDS中氧化应激与炎症之间的关键细胞和分子机制，并优先筛选靶向该连接的候选小分子疗法 | ARDS患者和对照的肺组织、LPS处理的RAW 264.7细胞、LPS诱导的小鼠ARDS模型 | 单细胞转录组学、网络药理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、基因集富集分析、网络药理学、炎症模型验证 | 不适用 | 单细胞转录组数据、基因表达数据、细胞和动物模型数据 | ARDS患者和对照肺组织样本（数量未提及）、RAW 264.7细胞和小鼠模型 | 不适用（未提及具体公司） | 单细胞RNA-seq | 不适用（未提及具体产品） | 不适用（未提及具体平台配置） |
| 9 | 2026-09-07 |
Edaravone attenuates carbonyl-stress-driven ApoA-I carboxymethylation and macrophage cholesterol-handling dysfunction in diabetic atherosclerosis
2026-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了糖尿病动脉粥样硬化中羰基应激驱动的ApoA-I羧甲基化及其对巨噬细胞胆固醇处理功能的影响，并评估了依达拉奉的调节作用。 | 首次在临床队列和单细胞水平提供位点解析的多尺度证据，证明乙二醛相关的ApoA-I CML修饰导致巨噬细胞胆固醇处理障碍和炎症激活，并展示依达拉奉通过拦截羰基发挥保护作用。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，依达拉奉的临床疗效需进一步验证，且其机制涉及多种效应，需更深入探究。 | 阐明羰基应激在糖尿病动脉粥样硬化中损害HDL功能的机制，并评估依达拉奉作为羰基应激调节剂的潜力。 | 临床血浆样本、巨噬细胞、小鼠动脉粥样硬化模型和单细胞转录组数据。 | 分子生物学 | 糖尿病动脉粥样硬化 | 液相色谱-串联质谱、单细胞转录组学、Western blot、组织病理学 | NA | 质谱数据、单细胞基因表达数据、图像和临床数据 | 临床队列含对照组、无冠心病糖尿病组和伴冠心病糖尿病组；小鼠模型：雄性链脲佐菌素诱导的Ldlr小鼠（数量未明确）。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-07 |
Network pharmacology and molecular docking reveal the mechanisms of XOL in treating heart failure
2026-Nov, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2026.110977
PMID:42617930
|
研究论文 | 通过网络药理学和分子对接技术，揭示心通口服液在心力衰竭治疗中的作用机制 | 首次系统整合网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序技术，全面解析心通口服液多成分、多靶点、多通路治疗心力衰竭的分子机制 | 缺乏临床样本验证，且仅通过动物模型和生物信息学分析，未进行深入的实验验证 | 阐明心通口服液治疗心力衰竭的药理机制，为临床应用提供分子依据 | 心通口服液中的活性化合物及其靶基因、心力衰竭相关基因 | 网络药理学、分子对接、单细胞转录组学 | 心力衰竭 | 网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、超声心动图 | 分子对接模型、蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 药物成分数据、基因表达数据、蛋白质结构数据、单细胞转录组数据 | 使用横向主动脉缩窄小鼠模型，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-04-19 |
A Method for Imputing scRNA-seq Data Based on Mobile Graph Convolutional Generative Adversarial Networks
2026-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11380-8
PMID:41998476
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-09-07 |
Colchicine attenuates cardiac hypertrophy by targeting the macrophage-driven Interleukin-6 suppression
2026-Oct, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2026.08.005
PMID:42575041
|
研究论文 | 本研究通过建立携带高猝死风险相关突变的小鼠肥厚型心肌病模型，利用单细胞RNA测序揭示免疫激活与纤维化重塑，并验证秋水仙碱通过靶向巨噬细胞驱动的白细胞介素-6抑制来减轻心肌肥厚 | 首次提供临床前证据表明秋水仙碱可缓解肥厚型心肌病中的心肌炎症和纤维化，为降低猝死风险和治疗该疾病提供新策略 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探索秋水仙碱对肥厚型心肌病的治疗潜力及其潜在机制 | 携带高猝死风险相关突变的小鼠肥厚型心肌病模型 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病（肥厚型心肌病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-07 |
Preliminary exploration of effects of the JAK inhibitor tofacitinib on pyoderma gangrenosum: In vitro inhibition of NETs and Th17 differentiation
2026-Oct, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2026.08.009
PMID:42603447
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组化表征坏疽性脓皮病（PG）病变中JAK/STAT通路过度激活的细胞和分子特征，并评估托法替布对NETs形成和Th17分化的体外抑制作用 | 首次通过scRNA-seq和mIHC全面描绘PG中JAK/STAT通路过度激活的多轴细胞和分子景观，并初步证实托法替布在体外能抑制NETosis和Th17分化 | 研究仅基于体外实验和有限样本，缺乏体内验证及长期临床数据 | 探究托法替布对坏疽性脓皮病的潜在治疗作用及其作用机制 | 坏疽性脓皮病（PG）病变组织及细胞 | 数字病理学 | 坏疽性脓皮病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫组化（mIHC）、RT-qPCR、Western blot、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据及病理图像 | 未明确提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 具体平台配置信息未在标题和摘要中提供 |
| 14 | 2026-09-07 |
Twist1 Promotes Endothelial Phenotypic Transition and Unstable Plaque Phenotype During Atherosclerosis
2026-Sep-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324428
PMID:42689320
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪、原位分析和单细胞RNA测序，探讨了Twist1在动脉粥样硬化中促进内皮细胞表型转变和不稳定斑块表型的作用 | 首次结合内皮细胞谱系追踪与单细胞组学，揭示动脉粥样硬化中内皮细胞发生促炎和内皮-间质转化同时发生的单细胞命运转变，并识别出Twist1的关键下游靶点如CXCL12和E-selectin | 未提供明确的局限性信息 | 阐明Twist1在内皮细胞表型转变和动脉粥样硬化斑块生物学中的作用机制 | ApoE-/-小鼠、内皮细胞Twist1敲除小鼠模型、人冠状动脉内皮细胞以及人类单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、谱系追踪、原位分析 | NA | 单细胞基因表达数据、批量基因表达数据 | 涉及ApoE-/-小鼠模型（疾病前和16周高脂饮食后）、两种内皮细胞Twist1缺失小鼠模型及人冠状动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-07 |
Machine learning identifies ac4C-related prognostic signature and TUBA1C as therapeutic target in COAD
2026-Sep-03, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-026-10267-8
PMID:42693326
|
研究论文 | 本研究利用机器学习算法构建基于N4-乙酰胞苷相关基因的预后签名，并验证TUBA1C作为结肠腺癌的潜在治疗靶点 | 首次整合10种机器学习算法构建ac4C相关预后签名，并结合单细胞RNA测序和体外实验验证TUBA1C的功能 | 研究基于公共数据库数据，缺乏多中心独立验证和体内实验验证 | 探索ac4C相关基因在结肠腺癌中的作用，鉴定可靠的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 结肠腺癌患者及相关细胞系 | 机器学习 | 结肠腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验 | 机器学习算法（如LASSO、随机森林等整合模型） | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 基于TCGA-COAD、GSE39582、GSE17536多个数据集及单细胞测序数据，具体样本数未明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-09-07 |
Nrsn1-Smarcc1 Coupling Regulates Neural Stem Cell Differentiation and Chronic-phase Recovery After Ischemic Stroke
2026-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77547
PMID:42693582
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-09-07 |
AMD1 regulates cysteine metabolism and ferroptosis sensitivity in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2026-Sep-02, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了AMD1在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中调节半胱氨酸代谢和铁死亡敏感性的作用 | 首次揭示多胺代谢酶AMD1在RA-FLS中调控半胱氨酸代谢与铁死亡敏感性的新机制，并通过体内外实验验证其作为RA治疗靶点的潜力 | 未明确提及研究局限性 | 阐明AMD1在RA-FLS中调节半胱氨酸代谢和铁死亡敏感性的机制，评估其作为RA治疗靶点的价值 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞及胶原诱导关节炎小鼠模型 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO, 随机森林, SVM | 基因表达数据 | GSE89408、GSE200815、GSE246416数据集及CIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-07 |
Plasma apolipoprotein E protein attenuates pulmonary fibrosis through LRP1 and PLAU dual receptor-mediated TGF-β/Smad inhibition
2026-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.045
PMID:41475664
|
研究论文 | 该研究揭示了血浆载脂蛋白E通过LRP1和PLAU双受体介导的TGF-β/Smad抑制来减轻肺纤维化的机制，并验证了LXR激动剂RGX-104的治疗潜力 | 首次发现载脂蛋白E作为特发性肺纤维化的因果保护因子，通过双受体机制抑制TGF-β信号通路，并跨物种验证了RGX-104的潜在治疗价值 | 摘要未提及研究局限性 | 为肺纤维化寻找新的治疗靶点，并阐明血浆载脂蛋白E减轻该疾病的机制 | 特发性肺纤维化患者血浆样本、CRISPR工程化载脂蛋白E缺陷犬、Apoe基因敲除小鼠及人肺切片 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 转录组测序、表面等离子体共振 | NA | 转录组数据 | 七个血浆队列以及犬、小鼠和人肺切片样本 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-09-07 |
Nrf2 deficiency in myeloid cells accelerates atherosclerosis by promoting the inflammatory response and impairing efferocytosis
2026-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.005
PMID:41485574
|
研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中Nrf2缺陷如何通过促进炎症反应和抑制胞葬作用加速动脉粥样硬化发展 | 首次通过单细胞RNA测序和髓系特异性Nrf2敲除小鼠模型揭示Nrf2直接调控Myh9启动子并影响吞噬杯处肌球蛋白积累的机制，并验证了4-辛基衣康酸激活Nrf2的潜在治疗作用 | 主要基于小鼠模型，人类样本的分析仅限于公共数据库，且未进行人体临床试验 | 明确Nrf2在巨噬细胞中对动脉粥样硬化发展的具体作用及其分子机制 | 髓系特异性Nrf2敲除小鼠（ApoE基因敲除背景）、人类和小鼠动脉粥样硬化斑块、原代巨噬细胞及细胞系 | 多组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀PCR | 基因敲除小鼠模型、体外细胞模型 | RNA测序数据、蛋白质组数据、图像 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-07 |
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02948-0
PMID:41540123
|
研究论文 | 提出DBiTplus技术，在同一组织切片上整合基于成像和测序的空间组学方法，实现单细胞分辨率的转录组和蛋白质组同时分析 | 首创在同一组织切片上结合测序型空间转录组和多重蛋白质成像，通过RNase H介导的cDNA回收保留组织结构，实现成像引导的单细胞空间转录组图谱 | 摘要未提及明确限制 | 开发一种统一工作流，用于在单细胞分辨率下整合空间转录组和蛋白质组，以理解细胞异质性和功能，并探索疾病机制 | 冻存小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋的人类淋巴结和淋巴瘤组织 | 空间组学、数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组、蛋白质成像、空间条形码、RNase H介导cDNA回收 | 计算流程 | 空间基因表达数据、蛋白质成像数据 | 多种样本类型，包括小鼠胚胎、人类淋巴结和淋巴瘤组织 | NA | 空间转录组、蛋白质成像 | DBiTplus | DBiTplus-seq，结合测序型空间转录组和多重蛋白质成像，使用空间条形码和RNase H介导的cDNA回收 |