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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-08-14
Identification of PGF+ endothelial cells associated with plaque instability in carotid atherosclerosis by scRNA-seq and RNA-seq analysis
2026-Dec, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序整合分析,识别与颈动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的PGF+内皮细胞亚群。 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据,识别出与颈动脉斑块不稳定性显著相关的三种内皮细胞亚群(亚群9、10和11),并发现它们高表达促炎细胞因子和激活PI3K-Akt等炎症相关通路。 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,可能需要进一步的功能实验和临床样本验证。 探究内皮细胞在动脉粥样硬化斑块不稳定性中的异质性及机制。 颈动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞。 生物信息学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、批量RNA测序 聚类分析、基因集变异分析、差异基因表达分析、KEGG通路富集分析 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 人类颈动脉斑块样本和ApoE缺陷小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
2 2026-08-14
Prognostic and diagnostic evaluation of HSPG2 gene expression in oral squamous cell carcinoma: A case-control study
2026-Oct, Archives of oral biology IF:2.2Q2
研究论文 本研究评估了口腔鳞状细胞癌中HSPG2基因的表达,并利用外部数据集验证其临床相关性,发现其在组织和血浆中高表达,且与不良预后相关 首次在口腔鳞状细胞癌中结合qRT-PCR、TCGA和单细胞RNA-seq数据,全面评估HSPG2的表达及其诊断和预后价值,特别关注了非洲裔美国患者中的预后差异 样本量较小(25例患者和25例对照),且唾液样本中的HSPG2表达无显著差异,可能限制了其作为非侵入性生物标志物的应用 评估HSPG2在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 口腔鳞状细胞癌患者和健康对照的组织、血浆和唾液样本 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 qRT-PCR, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据, 临床数据 25例口腔鳞状细胞癌患者和25例匹配健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-08-14
Dimethylglycine accelerate atherosclerosis by mediating macrophages ferroptosis via NRF2 pathway suppression
2026-Oct, Pathology, research and practice
研究论文 本研究通过病例对照研究、前瞻性队列研究及体内外实验,揭示二甲基甘氨酸通过抑制NRF2核转位介导巨噬细胞铁死亡,加速动脉粥样硬化进程 首次发现DMG通过结合NRF2蛋白的I559位点抑制其核转位和GPX4/xCT启动子富集,从而促进巨噬细胞铁死亡,加速动脉粥样硬化 未在更大规模人群中验证DMG与MACE的关联,且未探讨DMG对其他细胞类型或信号通路的影响 阐明DMG在动脉粥样硬化进展中对巨噬细胞的具体作用及分子机制 冠心病患者、ApoE敲除小鼠、THP-1巨噬细胞 数字病理学 冠心病 单细胞RNA测序、蛋白质组学、分子对接、定点突变 NA 基因表达、蛋白质、临床数据 冠心病患者(具体数量未提供)、ApoE敲除小鼠、THP-1细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
4 2026-08-14
Occlusal abnormalities and temporomandibular joint osteoarthritis: A narrative review of cross-scale mechanical-metabolic-immune mechanisms
2026-Oct, Archives of oral biology IF:2.2Q2
综述 本文综合近期多尺度证据,提出咬合异常在颞下颌关节骨关节炎发病机制中作用的统一机械-代谢-免疫框架。 提出一个统一的机械-代谢-免疫框架,整合了从分子(如Piezo1、整合素)到细胞(如巨噬细胞)再到组织器官(颞下颌关节)的多尺度机制,并强调性别差异在疾病发生中的潜在作用。 缺乏颞下颌关节特异性的验证,尤其是性别相关免疫调节机制在TMJ中的直接证据不足。 阐明咬合异常通过机械转导、代谢重编程和免疫重塑促进颞下颌关节骨关节炎的机制。 颞下颌关节骨关节炎相关的临床、影像、动物、细胞、组学和机制研究。 生物医学 颞下颌关节骨关节炎 文献综述、单细胞转录组学、谱系追踪 NA 文献数据、单细胞转录组数据 不适用(综述性文章) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
5 2026-08-14
Taraxerol targets the HIF1A-NEK6 axis to block TDE-mediated M2 macrophage polarization and inhibits NSCLC progression
2026-Oct, Pathology, research and practice
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和网络药理学等方法,揭示了Taraxerol通过靶向HIF1A-NEK6轴抑制肿瘤源性外泌体介导的M2巨噬细胞极化,从而抑制非小细胞肺癌进展的分子机制 首次阐明Taraxerol通过调控HIF1A-NEK6轴影响肿瘤微环境中M2巨噬细胞极化的机制,并利用单细胞RNA测序和分子动力学模拟等方法提供了多层次的证据 研究主要基于体外细胞实验和异种移植模型,缺乏临床样本验证,且未详细探讨HIF1A-NEK6轴在其他免疫细胞中的潜在作用 阐明Taraxerol在非小细胞肺癌中通过调控肿瘤微环境(特别是M2巨噬细胞极化)发挥抗肿瘤作用的分子机制 非小细胞肺癌细胞系A549/H1299、巨噬细胞、肿瘤源性外泌体、异种移植肿瘤模型 网络药理学、单细胞测序、分子生物学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、CCK-8、EdU、流式细胞术、Transwell、异种移植、透射电子显微镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot、qRT-PCR、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因 NA 单细胞基因表达数据、分子对接和动力学数据、细胞表型数据、肿瘤图像 涉及A549/H1299细胞系、巨噬细胞、肿瘤组织异种移植模型,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
6 2026-08-14
Key genes identified in ammonia-induced cell death during pediatric sepsis: Machine learning, single-cell, and virtual gene knockout approaches
2026-Sep-17, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
7 2026-08-14
Sulfhydrated TFEB alleviates blast-induced lung injury by maintaining epithelial barrier integrity through the IGF2R/MMP-2/9 pathway
2026-Sep, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了硫化修饰的TFEB通过IGF2R/MMP-2/9通路维持上皮屏障完整性,从而减轻爆炸致肺损伤的分子机制,并评估了释放硫化氢的纳米酶的治疗效果。 首次发现TFEB/IGF2R/MMP-2/9-自噬和溶酶体轴在爆炸致肺损伤发病机制中的作用,并利用HS释放纳米酶Pt@Pd-S通过促进TFEB Cys212位点S-硫化增强其转录活性,为肺创伤治疗提供了新策略。 该研究基于小鼠模型和体外实验,其发现需在人类样本中进一步验证;纳米酶的临床转化潜力尚需评估。 阐明爆炸致肺损伤中上皮屏障完整性的关键分子机制,并评估HS释放纳米酶的治疗效果。 爆炸致肺损伤小鼠模型和上皮细胞。 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-08-14
Spatiotemporal dynamics of epididymal epithelial cells uncover a novel KRT5⁺ATP6V1A⁺ subpopulation of basal cell in postnatal mouse development
2026-Sep, European journal of cell biology IF:4.5Q2
研究论文 通过共聚焦免疫染色和单细胞RNA测序,揭示了小鼠附睾上皮细胞出生后的发育轨迹,并发现了一种新的KRT5⁺ATP6V1A⁺基底细胞亚群 首次识别出KRT5⁺/ATP6V1A⁺的窄样基底细胞亚群,该亚群富含溶酶体,主要位于附睾头体和体部,可能参与管腔酸化和稳态维持 未提及具体限制 探究小鼠附睾中不同上皮细胞类型出生后的发育轨迹,并与大鼠进行比较 小鼠附睾上皮细胞,包括主细胞、基底细胞、亮细胞和窄细胞等 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和共聚焦免疫染色 不适用 单细胞基因表达数据和免疫染色图像 未明确提及样本数量,但涉及小鼠附睾不同节段和多个出生后时间点 未明确提及 单细胞RNA测序 未明确提及 未明确提及
9 2026-08-14
Longitudinal zone- and cell type-specific pattern-triggered immune responses in Arabidopsis roots
2026-Aug-12, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 利用拟南芥根的单细胞转录组学和活细胞成像,揭示了植物来源的植物细胞因子在不同细胞类型和纵向发育区引发比微生物来源的模式更强的免疫反应,并阐明了其与生长-防御权衡及病原体入侵位点的关联 首次在单细胞分辨率下系统描绘了拟南芥根对不同免疫激发子的转录反应图谱,并揭示了植物细胞因子在特定细胞类型和纵向区域中引发的更强的免疫反应及其对受体激酶基因表达的抑制机制 摘要中未明确提及局限性 解析拟南芥根中不同细胞类型和纵向发育区对植物来源和微生物来源免疫激发子的转录反应及其调控机制 拟南芥根的不同细胞类型和纵向发育区 单细胞转录组学 不适用 单细胞转录组测序、活细胞成像 不适用 单细胞转录组数据、活细胞成像数据 拟南芥根样本(具体数量未提供) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
10 2026-08-14
Multi-modal single-cell sequencing reveals network transition in circulating monocytes that aligns with faster recovery in patients with trauma and favours a response to M-CSF
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本文通过多模态单细胞测序揭示创伤患者循环单核细胞的网络转变,发现与快速恢复相关的特定细胞亚群及其对M-CSF的响应。 首次使用DOGMA-seq结合scRNA-seq,识别出与创伤后快速恢复相关的单核细胞亚群和基因共表达网络,挑战了恢复仅回归基线的传统观点。 样本量较小(每组8例),且未进行功能验证实验来证实发现的因果关系。 探究创伤后亚急性期免疫细胞特征与恢复速度的关联,并揭示潜在的分子机制。 创伤后第3天的外周血单核细胞(PBMCs),来自快速或缓慢恢复的患者(每组8例)及年龄性别匹配的健康对照。 单细胞组学 创伤 DOGMA-seq, scRNA-seq NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 24例外周血样本(16例患者,8例对照) 10x Genomics 单细胞多组学 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC+Gene Expression 单细胞多组学测序(DOGMA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)
11 2026-08-14
Foxs1-mediated transformation of CD34+ fibroblast to myCAFs promotes tumor growth
2026-Aug, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本研究利用谱系追踪、单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了CD34+成纤维细胞在Foxs1介导下分化为myCAFs并促进肿瘤生长的机制,并提出了靶向该分化过程的抗肿瘤策略 首次明确了Acta2 CAFs的发育起源,实验验证了Cd34到Acta2的转化过程,并通过药物数据库反查筛选出四种能抑制Foxs1上调的小分子化合物,提出靶向CAF谱系发育的新型抗肿瘤策略 研究主要在黑色素瘤和胃癌中进行,其普适性需进一步验证;药物候选仅通过数据库预测,缺乏体内实验验证 阐明癌症相关成纤维细胞的发育起源、分化轨迹及治疗潜力,并探索抑制肿瘤进展的新策略 黑色素瘤和胃癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其前体细胞 基因组学、肿瘤生物学 黑色素瘤、胃癌 可诱导遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学、CMap/LINCS L1000药物扰动数据库分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、药物扰动数据 未提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学
12 2026-08-14
Serum metabolomics profiling in head and neck squamous cell carcinoma: a multicentre diagnostic study
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 这项多中心诊断研究通过血清代谢组学分析,开发并验证了一个8代谢物诊断模型,用于头颈部鳞状细胞癌的检测和分子分层 该研究结合了LC-MS/MS血清代谢组学、机器学习特征选择和多组学分析,开发出高灵敏度和特异性的诊断模型,并识别了两种具有不同免疫特征的分子亚型 多中心外部验证中特异性较低(80.2%),且对于口腔潜在恶性疾病的区分能力仅为中等(AUC 0.710) 开发用于头颈部鳞状细胞癌检测的血清代谢组学生物标志物诊断模型,并探索分子异质性 938名参与者,包括457名HNSCC患者、451名对照和30名口腔潜在恶性疾病患者 机器学习 头颈部鳞状细胞癌 LC-MS/MS、转录组学 机器学习模型 血清代谢组学数据、转录组学数据、空间转录组学数据 938名参与者(457名HNSCC患者、451名对照、30名OPMD患者) NA LC-MS/MS、空间转录组学 NA NA
13 2026-08-14
One-carbon metabolism upregulated in lupus promotes the differentiation and effector functions of human B and T cells
2026-08-01, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过RT-qPCR和单细胞RNA测序分析,发现系统性红斑狼疮患者B细胞中一碳代谢网络上调,并抑制该网络可减少B和T细胞增殖及效应功能,提示其可能成为SLE治疗靶点。 首次在人类B和T细胞中揭示SGOC网络在SLE中的上调及其功能影响,特别是MTHFD2的表达增加,并验证了特定代谢抑制剂对细胞功能的作用。 研究主要基于体外实验,未进行体内验证;且样本量可能有限,未详细描述患者异质性。 探究SGOC网络在人类B和T细胞中及SLE中的表达和功能作用,评估其作为治疗靶点的潜力。 SLE患者和健康对照者的B细胞和T细胞,以及CD4 T细胞亚群。 免疫学 系统性红斑狼疮 RT-qPCR, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, ELISA NA 基因表达数据, 细胞功能数据 SLE患者和健康对照者的外周血样本,具体数量未给出 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
14 2026-08-14
Single-cell sequencing reveals NK cell dysregulation during chronic HIV infection and identifies transitional NK cell cytotoxicity related to HIV reservoir decay
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 通过单细胞测序揭示慢性HIV感染期间NK细胞失调,并识别与HIV储存库衰减相关的过渡性NK细胞毒性 首次在单细胞水平全面揭示HIV感染对NK细胞异质性的影响,并发现c5-过渡性NK亚群的细胞毒性评分与HIV-DNA下降相关,为NK细胞为基础的免疫治疗提供新见解 样本量较小,且未收集性别认同信息 探究HIV感染如何影响NK细胞的异质性及与HIV储存库衰减的关系 外周血NK细胞,来自5名健康对照和17名男性HIV感染者(治疗前后) 单细胞测序 HIV感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、O-link蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据、血浆炎症细胞因子数据、细胞相关HIV-DNA数据 5名健康对照和17名男性HIV感染者,共22名参与者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-08-14
Myokines in exercise‑mediated bone homeostasis: Molecular signaling mechanisms and therapeutic implications for bone disorders (Review)
2026-Aug, International journal of molecular medicine IF:5.7Q1
综述 本综述总结了运动诱导的肌因子在骨骼稳态中的分子信号机制,并提出了肌肉-骨骼-免疫三角轴概念,探讨其在骨疾病治疗中的潜力。 首次系统整合了肌肉-骨骼-免疫三角轴的概念,并强调多组学、单细胞和空间转录组学、器官芯片及人工智能等创新方法在加速该领域发现中的作用。 未提及具体局限性。 综合阐述肌因子介导的肌肉-骨骼串扰机制,并评估其对骨疾病(如骨质疏松和肌少症)的治疗意义。 运动诱导的肌因子,骨骼细胞(成骨细胞、破骨细胞、骨细胞),以及骨骼微环境中的免疫细胞。 生物信息学 骨质疏松、肌少症、骨疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
16 2026-08-14
Patient-derived resources for decoding and targeting brain metastases ecosystems
2026-Aug, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
观点文章 本文基于RISEbrain联盟的经验,探讨了用于解析和靶向脑转移生态系统的患者来源资源,包括临床队列、生物样本库、功能体外模型及多组学平台。 强调了快速尸检项目在捕获早期转移播种方面的未充分利用潜力,并提出了整合空间转录组学、蛋白质组学及新兴光子生物传感器等互补工具的策略。 未明确提及具体限制,但可推断其生成和整合面临显著的物流和技术障碍。 推进脑转移的早期检测、预防和精准治疗。 脑转移患者来源的资源,包括临床队列、生物样本库、器官型培养物、类器官模型及液体活检样本。 数字病理学 脑转移 NA NA 多组学数据,包括转录组学、蛋白质组学及液体活检数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 液体活检 NA NA
17 2026-08-14
Multi-omics profiling unveils biological and clinical insights into pulmonary sarcomatoid carcinoma
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过多组学分析揭示肺肉瘤样癌的生物学和临床见解 首次整合全外显子测序、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组及单细胞RNA测序数据,对肺肉瘤样癌进行全面的多组学特征描述,并发现铁死亡抑制特征及潜在治疗靶点 样本量较小,尤其是单细胞RNA测序仅来自3名患者,可能限制结果的普遍性 阐明肺肉瘤样癌的分子特征、免疫微环境及潜在治疗靶点 86名肺肉瘤样癌患者的肿瘤样本及3名接受新辅助化疗免疫治疗患者的单细胞样本 基因组学、蛋白质组学、单细胞测序 肺肉瘤样癌 全外显子测序、转录组测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 86名患者(多组学)和3名患者(单细胞RNA测序) NA 全外显子测序、转录组测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA NA
18 2026-08-14
Proteoform Detection Across 17,000 Single Nuclei From Differentiating Skin Keratinocytes
2026-Jul-14, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 利用单细胞蛋白质形式成像质谱技术对超过17,000个来自人表皮角质形成细胞分化过程的单核进行无标记蛋白质形式分析,生成表皮分化的单核蛋白质形式图谱 首次将单细胞蛋白质形式成像质谱技术应用于细胞核,实现了对完整蛋白质形式的单核水平无标记分析,能够解析组合性组蛋白蛋白质形式,揭示表皮分化过程中的连续染色质轨迹 未提供具体局限性信息 利用单核蛋白质形式成像质谱技术生成表皮分化的单核蛋白质形式图谱,并揭示分化过程中的染色质状态变化 人表皮角质形成细胞从未分化增殖状态到分化状态的单核 蛋白质组学 NA 单细胞蛋白质形式成像质谱、鸟枪法自上而下液相色谱-串联质谱 无监督聚类 质谱数据 超过17,000个单核,来自超过10个人皮肤细胞 NA 单细胞蛋白质形式成像质谱 NA NA
19 2026-08-14
Extreme conservation of cnidarian stinging cell identity despite 600 million years of evolution
2026-Jul-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞RNA测序和转录谱系重建分析,研究珊瑚和海葵中刺胞细胞(刺细胞)的演化,发现FoxL2基因控制刺胞细胞多样性分化的关键开关,且缠绕细胞(螺旋细胞)在六亿年间高度保守,被视为“活化石”细胞。 揭示FoxL2基因在刺胞细胞分化中的关键调控作用,并首次发现缠绕细胞作为高度保守的细胞类型,其基因年龄比穿刺细胞更古老,挑战了对细胞演化多样性的传统理解。 研究仅基于珊瑚和海葵两种物种,可能未涵盖所有刺胞动物多样性;未对FoxL2下游的具体分子机制进行深入验证。 理解刺胞细胞(刺细胞)在刺胞动物中如何特化并演化,特别是控制细胞多样性分化的基因和细胞保守性。 刺胞动物(珊瑚和海葵)的刺胞细胞,包括穿刺细胞(nematocyte)和缠绕细胞(spirocyte)。 单细胞转录组学、演化发育生物学 NA 单细胞RNA测序,转录谱系重建(RNA-seq) NA 单细胞基因表达数据 两种刺胞动物物种(一种珊瑚和一种海葵)的细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-08-14
Ectomesenchyme contributes to epidermal stem cell formation through mesenchymal-to-epithelial transition
2026-Jul-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过谱系追踪、单细胞转录组和表观基因组分析,揭示了小鼠皮肤中间滤泡表皮主要由间充质谱系细胞构成,这些细胞源自外胚间充质,并通过间充质-上皮转化过程形成表皮干细胞 首次发现外胚间充质细胞通过间充质-上皮转化过程对正常皮肤表皮形成做出重要贡献,并建立了人诱导多能干细胞来源的外胚间充质生成角质形成细胞的模型 未提及 探讨间充质细胞是否参与生理性正常皮肤中角质形成细胞的形成及其机制 小鼠胚胎皮肤、人诱导多能干细胞来源的外胚间充质 发育生物学, 干细胞生物学 皮肤疾病(涉及表皮镶嵌症) 谱系追踪, 单细胞转录组, 单细胞表观基因组, 活体成像 NA 基因表达数据, 表观遗传数据, 图像 小鼠胚胎(多个时间点),人诱导多能干细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序
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