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当前共找到 40490 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-16 |
Ligand-based directed differentiation to produce granulosa-like cells expressing steroidogenic enzyme genes
2026-Aug, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2026.103978
PMID:41966789
|
研究论文 | 报道一种基于配体的快速分化方案，将人类诱导多能干细胞分化为表达类固醇生成酶基因的颗粒样细胞 | 提出5天快速分化方案，通过配体诱导实现hiPSC向颗粒样细胞分化，并利用单细胞RNA测序鉴定细胞标志物和新基因 | HSD17B1表达水平低，表明产生的是未成熟颗粒细胞表型 | 生成颗粒样细胞以模拟人类性腺发育和测试药物对卵巢的影响 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-16 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞-足细胞相互作用的失调 | 整合小鼠膜性肾病模型与单细胞RNA测序，首次详细描绘肾细胞图谱并发现致病性巨噬细胞-足细胞轴的双重失衡（Spp1-整合素信号增益与胶原IV稳态信号丧失） | 基于小鼠模型，结果可能需要人体样本验证；单细胞测序样本量有限可能影响细胞类型比例的全面性 | 阐明膜性肾病的细胞驱动机制，特别是巨噬细胞与足细胞的相互作用 | 阳离子化牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型中的肾细胞 | 机器学习 | 膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、差异表达分析、通路富集分析、细胞通信推断 | 单细胞转录组数据 | cBSA诱导的MN小鼠模型（具体样本数未指明） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-06-16 |
Targeting keratin 6 A overcomes gemcitabine resistance by restoring equilibrative nucleoside transporter 1 and TAM-mediated metabolic compensation in pancreatic cancer
2026-Jul, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101404
PMID:42013581
|
研究论文 | 本研究发现角蛋白6A通过抑制ENT1介导的药物摄取和促进MIF-CD74/CD44轴驱动的TAM-M2极化及胞苷富集微环境，驱动胰腺癌吉西他滨耐药，并开发了靶向递送siKRT6A的脂质纳米载体以恢复化疗敏感性 | 首次揭示KRT6A通过调控ENT1和TAM介导的代谢补偿双重机制驱动吉西他滨耐药，并开发了cRGD修饰的脂质纳米载体实现肿瘤靶向siRNA递送 | TAM-M2或胞苷的拯救实验仅部分逆转抗肿瘤效果，提示可能存在其他耐药机制；临床样本量较小（n=90） | 鉴定胰腺癌吉西他滨耐药的关键驱动因子并开发靶向增敏策略 | 吉西他滨耐药胰腺癌细胞、胰腺癌患者组织样本（含90例吉西他滨治疗队列）、异种移植模型小鼠 | 机器学习 | 胰腺癌 | 空间转录组学,单细胞转录组学,RT-qPCR,组织芯片分析,多组学分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 90例吉西他滨治疗患者组织样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-06-16 |
Identification of PSMA4 as a Therapeutic Target for Atherosclerosis: A Comprehensive Multiomics Mendelian Randomization Analysis
2026-Jul, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70039
PMID:42032825
|
研究论文 | 通过综合多组学孟德尔随机化分析，发现PSMA4作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次利用整合多组学孟德尔随机化框架鉴定PSMA4为动脉粥样硬化的因果治疗靶点，并验证其遗传因果关系和药物重定位潜力 | 未提及具体局限性 | 鉴定新型、基因支持的动脉粥样硬化治疗靶点，促进有效药物开发 | 动脉粥样硬化患者样本及三个独立队列的血液顺式表达定量性状位点数据 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、顺式表达定量性状位点分析、共定位分析、连锁不平衡分数回归、顺式甲基化定量性状位点、顺式剪接定量性状位点、全表型组关联研究、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、剪接数据、单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-06-16 |
Sonodynamic Therapy Attenuates TLR4/NF-κB Signaling in Epicardial Adipose Tissue of Atrial Fibrillation: Insights From Animal Models, scRNA-seq, and Mendelian Randomization
2026-Jun-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001825
PMID:41955609
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研究论文 | 本研究通过动物模型、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，探讨了声动力疗法通过调节TLR4/NF-κB信号通路减轻心房颤动患者心外膜脂肪组织炎症的机制 | 首次将声动力疗法用于靶向心外膜脂肪组织炎症以治疗心房颤动，并结合单细胞测序和孟德尔随机化验证关键靶基因CXCL8与AF风险的因果关系 | NA | 探究声动力疗法通过减少巨噬细胞介导的心外膜脂肪组织炎症来缓解心房颤动的效果及临床转化潜力 | 兔心房颤动模型的心外膜脂肪组织以及人类心外膜脂肪和右心耳组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 兔模型（伪手术组、起搏组和声动力治疗组）及人类心外膜脂肪组织和右心耳样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 6 | 2026-06-16 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
|
研究论文 | 结合影像组学与计算病理学预测胰腺导管腺癌早期复发并揭示其肿瘤微环境中的生物学基础 | 首次整合术前CT影像组学特征与全切片图像计算病理学特征，结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，构建用于预测胰腺导管腺癌术后早期复发的高性能模型，并阐明细胞外基质重塑作为关键生物学机制 | 回顾性研究设计可能存在选择偏倚，且样本量有限（共225例），外部验证的种族多样性不足 | 开发并验证整合影像-病理模型用于预测胰腺导管腺癌术后早期复发，并揭示其潜在的生物学机制 | 225例行R0切除术的胰腺导管腺癌患者的术前CT图像和全切片图像 | 计算机视觉、计算病理学、机器学习 | 胰腺癌 | 影像组学、计算病理学、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 11种不同的机器学习模型（具体名称未详述） | 图像（CT图像和全切片图像）、转录组数据（单细胞RNA测序和空间转录组学数据） | 225例胰腺导管腺癌患者（回顾性队列） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-06-16 |
Single-cell transcriptomics and machine learning identify RNF144B and C5AR1 as immune-related molecular signatures and therapeutic targets in myocardial infarction
2026-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-026-01753-z
PMID:41984330
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research paper | 结合单细胞转录组学与机器学习，鉴定了心肌梗死中RNF144B和C5AR1作为免疫相关分子标志物及治疗靶点 | 通过整合多个转录组数据集与机器学习方法，识别出13个关键基因特征，并利用单细胞数据揭示髓系细胞在心肌梗死发病中的突出作用，以及分子对接预测CCX168为潜在靶向药物 | 转录组数据整合可能受批次效应影响，且动物模型验证结果向临床转化仍需更多验证 | 识别心肌梗死的关键调控基因，阐明其作用机制，并促进诊断和治疗应用 | 心肌梗死患者及小鼠模型的转录组数据和单细胞数据 | machine learning | cardiovascular disease | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个转录组数据集及11种心脏细胞类型，小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-06-16 |
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682296
PMID:41950130
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研究论文 | 提出基于动态图卷积网络的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE | 首次将动态图卷积神经网络用于多切片空间转录组学数据对齐和增强，通过K近邻和r半径构建混合图实现跨切片信息融合 | 未明确说明，但动态图结构可能增加计算复杂度和对超参数的敏感性 | 开发一种多切片空间转录组学数据对齐与增强的统一框架 | 多切片空间转录组学数据及其空间分布模式 | 机器学 | NA | 空间转录组学 | 动态图卷积神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-16 |
The crosstalk between epigenetics and metabolism in the malignant cell
2026-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05082-1
PMID:42043678
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-06-16 |
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08807-w
PMID:42034645
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境，鉴定与脑转移进展相关的候选调节因子 | 首次在单细胞分辨率下全面解析乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的异质性，并发现GABRB3和NRXN1基因突变与患者生存率降低相关 | 样本量较小（7例患者用于单细胞测序，47例用于批量DNA测序），且功能实验仅基于异种移植模型 | 阐明乳腺癌脑转移的分子机制，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌脑转移患者、异种移植小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 7例患者的脑转移组织、邻近肿瘤组织、脑脊液和循环肿瘤细胞；47例患者的原发乳腺肿瘤、外周血和脑转移组织；共131,880个单细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 11 | 2026-06-16 |
Establishment of a prognostic model for hepatocellular carcinoma patients based on bioinformatics analysis and exploration of prognostic biomarker EPPK1
2026-Apr-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-48984-4
PMID:42031825
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研究论文 | 基于生物信息学分析建立肝细胞癌预后模型并探索预后生物标志物EPPK1 | 通过整合转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，首次发现并验证EPPK1在肝细胞癌中的特异性高表达及其与免疫浸润和空间转录组学的关联 | 研究主要基于公开数据库（如TCGA-LIHC）进行生物信息学分析，体外功能实验验证相对有限，未涉及大规模临床样本的独立验证 | 利用生物信息学方法识别肝细胞癌预后相关基因EPPK1，并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜在价值 | 肝细胞癌患者，包括转录组、蛋白质组和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析, 单细胞测序, 空间转录组学, 免疫浸润分析, 虚拟扰动技术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 基于TCGA-LIHC数据集，具体样本数量未在摘要中明确给出 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-16 |
A tumor microenvironment integrated (TMI) staging system for pancreatic ductal adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblast and molecular consensus signatures
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05091-0
PMID:42033556
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研究论文 | 基于癌症相关成纤维细胞和分子共识特征，提出胰腺导管腺癌的肿瘤微环境整合分期系统 | 将肿瘤分子亚型、基质肌成纤维细胞CAF比例与临床分期整合，首次提出TMI分期系统，优于传统AJCC分期，并发现FN1是关键信号蛋白 | TMI分期在风险一致性上弱于AJCC分期，且可能需更大规模验证 | 改进胰腺导管腺癌预后预测系统的准确性 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本及相关分子数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、分子特征聚类 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 发现队列320例，验证队列156例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-06-16 |
CD71+ erythroid progenitor cells with mitochondrial retention were associated with inferior prognosis among patients with end-stage renal disease
2026-Apr-25, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05009-6
PMID:42035018
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研究论文 | 探索终末期肾病（ESRD）患者中CD71+红系祖细胞（EPC）与不良预后（包括心血管疾病和死亡率）的关联 | 首次揭示CD71+EPC在ESRD中通过线粒体滞留和功能障碍参与无效的代偿性髓外造血，并与不良预后相关 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型，需要进一步验证结果在更大人群中的适用性 | 阐明ESRD贫血的机制及其与不良预后的关联 | 终末期肾病患者、5/6部分肾切除（PNx）小鼠 | 数字病理学 | 终末期肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、病理影像 | ESRD患者与健康对照者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 14 | 2026-06-16 |
Identification and validation of an intratumor heterogeneity-related prognostic signature in triple-negative breast cancer: a study based on integrative machine learning and single-cell sequence
2026-Apr-25, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02291-y
PMID:42035196
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研究论文 | 基于整合机器学习和单细胞测序，构建并验证了三阴性乳腺癌瘤内异质性相关的预后标志物模型 | 通过整合十种机器学习算法和单细胞RNA测序数据，首次建立了基于瘤内异质性特征（IRS）的预后模型，并深入解析了核心基因在CD8+ T细胞和巨噬细胞中的特异性分布及信号通路交互网络 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏大型前瞻性临床队列的外部验证，且IRS模型在免疫治疗反应预测中的效果仍需更多独立队列证实 | 开发能定量评估三阴性乳腺癌瘤内异质性并预测预后及治疗反应的生物标志物模型 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习, 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、机器学习 | StepCox[backward] + GBM | 转录组数据、单细胞基因表达数据 | METABRIC训练集和多个GEO验证集（具体样本数量未在摘要中说明） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-16 |
Bibliometric analysis of single-cell RNA sequencing in tumor microenvironment
2026-Apr-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05073-2
PMID:42032150
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文献计量学分析 | 对单细胞RNA测序在肿瘤微环境研究中的文献进行计量学分析 | 首次对1999年至2024年间单细胞RNA测序在肿瘤微环境领域的187篇文献进行系统文献计量学分析，揭示了国家、机构和关键词的分布格局 | 仅基于Web of Science核心合集数据库，且数据截止至2024年7月，可能遗漏其他来源的新近文献 | 分析单细胞RNA测序在肿瘤微环境研究中的应用现状，识别研究热点和未来方向 | 187篇关于单细胞RNA测序在肿瘤微环境中应用的文献 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献元数据 | 187篇文献 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-16 |
A method for CRISPR/Cas9-induced genetic barcoding and lineage tracing in sheep
2026-Apr-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49093-y
PMID:42031935
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的绵羊遗传条形码与细胞谱系追踪方法 | 首次将PiggyBac转座子与CRISPR/Cas9基因编辑工具结合，在绵羊基因组中构建可遗传的条形码区域，实现多时间点细胞谱系追踪 | 未提及与单细胞测序技术的实际结合效果及在绵羊胚胎发育中的全面验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-06-16 |
IST: an ontology-guided attention-based autoencoder for interpretable analysis of single-cell transcriptomic data
2026-Apr-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50009-z
PMID:42032017
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研究论文 | 提出了一个名为IST的基于注意力机制的框架，用于整合基因本体知识以进行单细胞转录组数据的可解释分析 | 将基因本体结构直接融入模型架构，利用注意力机制捕获上下文相关的基因活动，并通过相关损失确保学习到的基因活动与已知基因功能关系对齐 | 未在文摘中明确提及具体局限性 | 实现单细胞转录组数据的生物学可解释分析，整合先验知识以提高下游洞察力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于注意力机制的自编码器 | 基因表达数据 | 三个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-16 |
Fludarabine disrupts the STAT1/AhR interaction to attenuate type 1 diabetes by inducing tolerogenic dendritic cells along with targeting effector T cells
2026-Apr-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01483-8
PMID:42026463
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研究论文 | 氟达拉滨通过破坏STAT1/AhR相互作用诱导耐受性树突状细胞并靶向效应T细胞，从而减轻1型糖尿病 | 首次发现氟达拉滨通过破坏STAT1与AhR的相互作用，促进AhR核转位，进而诱导耐受性树突状细胞，并靶向效应T细胞，恢复免疫耐受，为1型糖尿病提供新的免疫代谢治疗候选药物 | NA | 探究氟达拉滨在1型糖尿病中恢复免疫稳态的机制及其治疗效果 | 1型糖尿病患者和动物模型中的树突状细胞、CD4+效应T细胞和调节性T细胞 | 机器学习和免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、ChIP-qPCR、Co-IP/MS、CESTA、透射电子显微镜、Seahorse分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-06-16 |
Integrated in vitro and multi-cohort cross-omics analysis of HTLV-1-associated lung pathology reveals a RelA-dependent mechanism for monocyte recruitment and differentiation
2026-Apr-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01482-9
PMID:42026465
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研究论文 | 通过体外共培养和多队列跨组学分析，揭示HTLV-1相关肺病理中RelA依赖的单核细胞募集和分化机制 | 首次整合体外共培养模型与多队列跨组学数据（包括单细胞转录组、表观基因组、病毒互作组和多祖先全基因组关联研究），阐明NF-κB RelA/p65依赖的CSF-1诱导在HTLV-1相关肺病理中驱动单核细胞趋化和巨噬细胞分化的机制 | 体外模型可能无法完全复现体内复杂的微环境，且仅使用A549细胞系和特定T细胞株，未涵盖其他细胞类型和原代细胞 | 探究HTLV-1暴露如何通过上皮细胞信号通路引发肺部炎症，特别是单核细胞募集和分化的分子机制 | HTLV-1感染相关肺病理（如支气管扩张）中上皮-髓系炎症轴的作用机制 | 数字病理学 | HTLV-1相关肺病 | RNA-seq, CRISPR/Cas9, RT-qPCR, 单细胞RNA-seq, 表观基因组学, 病毒互作组学, 全基因组关联研究 | NA | 转录组、表观基因组、病毒互作组、基因变异 | 体外：A549细胞与MT-2/MT-4/Jurkat细胞共培养；体内：HTLV-1感染者、HAM/TSP患者和特发性肺纤维化患者的公开数据 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组关联研究 | NA | NA |
| 20 | 2026-06-16 |
The dynamic landscape of alternative splicing during silicosis progression
2026-Apr-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03683-6
PMID:42026633
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研究论文 | 本研究揭示了矽肺病进展过程中可变剪接的动态景观，并发现Clec4e-RI剪接异构体可能通过调节巨噬细胞相关炎症反应在疾病发病机制中发挥关键作用 | 首次系统描绘矽肺病进展中的可变剪接动态景观，发现大多数差异表达的可变剪接事件与基因表达变化无关，揭示了剪接调控作为独立于转录调控的病理调节关键层面 | 未提及具体研究限制 | 探究可变剪接在矽肺病发病机制中的动态变化及其功能意义 | 矽肺病小鼠模型中的RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 矽肺病 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本，具体数量未明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |