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当前共找到 43342 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-16 |
A multi-modal profiling workflow of transcriptomics and biomineralization demonstrated on a tooth-on-chip model
2026-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2026.104137
PMID:42733539
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研究论文 | 本文提出了一种适用于纤维蛋白水凝胶牙齿芯片模型的多模态分析工作流程，整合了整体RNA提取、细胞分选、空间转录组学和光谱/超微结构成像五种方法，用于表征牙上皮-间充质相互作用的转录程序和矿化形成 | 首次将五种成熟分析方法适配到纤维蛋白水凝胶牙齿芯片构建体上，建立了多模态分析工作流程，实现了对牙齿芯片共培养系统的转录组分析和生物矿化表征，并发现了纤维蛋白溶解与下游细胞分选之间的平台级不兼容性 | 空间转录组学所需的固定策略虽保留了组织形态但牺牲了RNA质量；拉曼光谱结合透射电镜虽能评估磷酸钙沉积但确认成熟羟基磷灰石仍需进一步验证；纤维蛋白溶解与下游分选存在平台级不兼容性 | 建立一种实用的多模态分析框架，用于基准测试纤维蛋白基牙齿芯片及相关器官芯片共培养系统中的分析读数 | 纤维蛋白水凝胶基牙齿芯片构建体中的牙上皮-间充质共培养系统 | 数字病理学 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 磁激活细胞分选, 拉曼光谱, 透射电子显微镜 | NA | RNA序列数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-16 |
From planktonic to biofilm states: single-cell transcriptomics reveals metabolic reprogramming and cellular heterogeneity in Acinetobacter baumannii
2026-Dec, Biofilm
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.bioflm.2026.100393
PMID:42733702
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，追踪鲍曼不动杆菌从浮游状态到生物膜状态的动态形成过程，揭示了生物膜发育过程中的代谢重编程和细胞异质性 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘鲍曼不动杆菌生物膜形成的转录景观，识别了从浮游状态到生物膜状态转变的关键分支点（Node 2），并揭示了各亚群特异性的代谢特征 | 研究仅基于转录组层面的分析，所揭示的潜在治疗靶点仍需通过靶向突变和功能实验进一步验证 | 在单细胞分辨率下阐明鲍曼不动杆菌生物膜形成的转录景观，探索潜在的治疗靶点 | 鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）生物膜形成过程中的不同状态亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 浮游状态（AB_0h）、12小时混合群体（M_12h）和48小时成熟生物膜（BF_48h）样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-16 |
Establishment of a dendritic cell differentiation system faithfully recapitulating multiple DC subsets in autoimmune disease
2026-Nov, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103658
PMID:42235377
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研究论文 | 该研究建立了无饲养层的体外培养体系，利用I型和II型干扰素诱导CD34⁺造血祖细胞分化为多种人类树突状细胞亚群，并通过单细胞RNA测序与狼疮患者数据比较，揭示干扰素信号在DC谱系分化与功能特化中的作用 | 构建了无饲养层、IFN富集的体外分化平台，可同时重建cDC1、cDC2、pDC、ASDC、mregDC和DC3样等主要人类DC亚群；发现pDC向经典pDC或ASDC样状态的分叉轨迹；证明体外转录组与自身免疫病相关DC群体高度相似 | 摘要未明确说明样本量有限、仅使用脐带血来源祖细胞、缺乏体内验证以及平台是否完全模拟体内复杂微环境等限制 | 建立生理相关的体外平台以重建人类主要DC亚群，并阐明干扰素信号如何影响DC谱系定向和功能特化 | 脐带血来源的CD34⁺造血祖细胞以及自身免疫病（狼疮）患者scRNA-seq数据集 | 单细胞组学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断 | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-16 |
Single-cell transcriptomic profiling identifies TIMP1 as a diagnostic marker linked to macrophage ferroptosis in ulcerative colitis
2026-Nov, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103743
PMID:42385606
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定TIMP1为溃疡性结肠炎中与巨噬细胞铁死亡相关的诊断标志物，并在体内外实验中验证其功能 | 首次利用单细胞转录组学揭示溃疡性结肠炎中巨噬细胞铁死亡的特征，并鉴定TIMP1作为与巨噬细胞铁死亡相关的候选诊断标志物，通过体内外实验验证了TIMP1在巨噬细胞铁死亡和炎症因子产生中的作用 | 研究主要在DSS诱导的小鼠模型和体外原代巨噬细胞中进行，尚未在人类临床样本中大规模验证TIMP1的诊断价值，且TIMP1调控巨噬细胞铁死亡的具体分子机制尚不完全清楚 | 探究溃疡性结肠炎中巨噬细胞铁死亡的特征，筛选与铁死亡相关的关键候选基因，并评估其在UC诊断和预测中的参考价值，进一步验证TIMP1在巨噬细胞铁死亡和炎症中的作用 | 溃疡性结肠炎中的巨噬细胞，DSS诱导的UC小鼠模型，以及原代巨噬细胞 | 数字病理学，机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-16 |
Aquaporin 1 deficiency drives diabetic cardiomyopathy via mediating myocardial edema
2026-Nov, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103709
PMID:42348966
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研究论文 | 该研究通过构建糖尿病心肌病小鼠模型和高糖心肌细胞模型，利用单细胞RNA测序技术揭示水通道蛋白1（AQP1）通过介导心肌水肿驱动糖尿病心肌病进展的机制 | 首次发现糖尿病心肌病中心肌水肿呈现早期出现并随疾病进展先增后减的模式；揭示了Aqp1基因在心肌细胞C0亚型中显著过表达而其蛋白水平反而降低的基因-蛋白表达错配现象，并提出ROS诱导的氧化应激或泛素-蛋白酶体途径可能介导AQP1蛋白的加速降解 | 摘要中未明确提及研究局限性，机制验证主要基于小鼠模型和细胞模型，尚需进一步在临床样本中验证AQP1基因-蛋白表达错配现象及ROS-泛素-蛋白酶体降解途径的具体分子机制 | 探究糖尿病心肌病中心肌水肿的特征及其具体分子机制 | 糖尿病心肌病小鼠模型及高糖条件下培养的心肌细胞模型 | 心血管疾病 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-16 |
Post-stroke endothelial cell plasticity: A transformational lineage from complete to partial EndoMT
2026-Nov, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103729
PMID:42364519
|
综述 | 本文综述了脑卒中后内皮细胞可塑性，特别是内皮-间质转化（EndoMT）从完全到部分的谱系转变，以及其在缺血性脑卒中发展中的关键作用。 | 文章创新性地提出EndoMT存在中间状态，其中部分EndoMT可在MEndT过程中可逆地转化为内皮细胞，并强调该阶段可能成为预防进一步脑损伤的关键靶点。 | 文章未提及具体的实验数据或原始研究结果，可能缺乏对EndoMT中间状态的具体分子机制和临床转化应用的深入探讨。 | 综述EndoMT的中间状态、关键信号通路及其在缺血性脑卒中发展中的重要作用。 | 脑卒中后内皮细胞，特别是经历EndoMT的内皮细胞。 | NA | 缺血性脑卒中、心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-16 |
Single-Cell Profiling Identifies Glial Transcriptional Remodeling in the Trigeminal Ganglion After Corneal Injury
2026-Nov, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70226
PMID:42717280
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研究论文 | 该研究结合bulk和单细胞RNA测序，描绘了小鼠角膜碱烧伤后三叉神经节的转录组景观，揭示了胶质细胞的转录重编程及神经元-胶质细胞通讯的动态变化 | 首次系统描绘角膜损伤后三叉神经节的单细胞转录组景观，发现胶质细胞（特别是髓鞘化施万细胞、非髓鞘化施万细胞和卫星胶质细胞）主导早期损伤响应，并揭示神经元-胶质细胞通讯从早期广泛交互向后期以神经元为中心转变的时间依赖性重组 | 研究仅使用小鼠模型，角膜损伤为中度碱烧伤，结论是否适用于其他损伤类型或人类尚需验证；未进行功能验证实验 | 填补角膜损伤后三叉神经节中细胞类型特异性转录响应尚不完全明确的空白 | 小鼠三叉神经节 | 单细胞转录组学 | 角膜损伤 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-09-16 |
Immune dysregulation in the prostates of C57BL/6Aire-/- mice mirrors that seen in human benign prostatic hyperplasia
2026-Oct, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70093
PMID:42420752
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研究论文 | 该研究表征了C57BL/6J背景下的Aire转录因子缺陷非消退性慢性炎症模型，并将其与人类良性前列腺增生（BPH）数据进行比较，发现该小鼠模型的前列腺炎症和白细胞-基质相互作用与人类BPH相似 | 首次在C57BL/6J背景下建立Aire转录因子缺陷的非消退性慢性前列腺炎症模型，该模型缺乏中枢耐受但保留完整功能性免疫系统；通过scRNA-seq鉴定出与人类BPH相似的Trem2巨噬细胞群体和衰老相关Cd8 GZMK hi GZMB low T细胞；发现小鼠前列腺成纤维细胞簇与人类BPH患者成纤维细胞相似并表达衰老相关标志物 | 该模型可能仅反映人类BPH的早期阶段，无法完全模拟BPH的完整疾病进程和异质性 | 建立并表征一种可用于研究BPH中前列腺炎症的慢性炎症小鼠模型，验证其与人类BPH的相似性 | C57BL/6J小鼠前列腺组织及人类BPH数据 | digital pathology | 前列腺癌 | single-cell RNA sequencing, flow cytometry, histology | NA | image, text | C57BL/6小鼠在21天和35天后收集全前列腺组织进行组织学、流式细胞术和scRNA-seq分析，并与人类BPH数据比较 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-09-16 |
Integrated Immunological Analysis of Interactions Between CXCL13+ T Cells and LAMP3+ DC in the Immunotherapy Response of Bladder Cancer
2026-Oct, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70162
PMID:42555166
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，刻画膀胱癌中CXCL13+ T细胞与LAMP3+ DC的异质性、分化轨迹及相互作用，并构建DTscore风险模型预测免疫治疗反应和总生存 | 首次在膀胱癌中系统解析CXCL13+ T细胞与LAMP3+ DC亚群的异质性、分化轨迹及通过CCR7-CCL19、CXCR5-CXCL13、PDCD1-CD274等受体-配体对在肿瘤三级淋巴结构内的功能互作，并基于8个标记基因构建DTscore模型，在IMvigor210和TCGA-BLCA队列中验证其稳健的预后和免疫治疗反应预测能力，甚至在“免疫荒漠”表型中仍有效 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析膀胱癌中CXCL13+ T细胞与LAMP3+ DC的异质性、分化轨迹和临床相关性，并构建风险模型预测免疫治疗反应和预后 | 膀胱癌患者（16例单细胞RNA测序样本）及IMvigor210（接受atezolizumab治疗的膀胱癌）和TCGA-BLCA队列 | 数字病理学, 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 受体-配体映射, Velocyto轨迹分析 | 风险模型（DTscore） | 图像, 文本 | 16例膀胱癌患者的113,905个质控后细胞，以及IMvigor210和TCGA-BLCA公共队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-16 |
Adipose-derived extracellular vesicles miR-423-5p targets SMAD3 to reverse endometrial fibrosis in a porcine model of intrauterine adhesion: insights from single-cell sequencing
2026-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.103574
PMID:42733683
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研究论文 | 本研究开发了温敏壳聚糖水凝胶（GelCT）作为脂肪间充质干细胞来源细胞外囊泡（MSC-EVs）的载体，在猪宫腔粘连模型中递送EVs，并通过单细胞测序揭示miR-423-5p靶向SMAD3抑制TGF-β/Smad信号通路从而逆转子宫内膜纤维化 | 首次在猪大动物模型中验证了自体脂肪MSC-EVs联合温敏壳聚糖水凝胶治疗宫腔粘连的有效性；通过单细胞转录组学揭示了EVs重塑成纤维细胞亚群的机制；整合miRNA分析鉴定出miR-423-5p作为功能性EV cargo直接靶向SMAD3 3'UTR | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发有效的宫腔粘连治疗方法，推动MSC-EVs从概念验证向临床转化 | 猪宫腔粘连模型 | 单细胞测序 | 宫腔粘连 | 单细胞转录组测序, miRNA profiling | NA | 单细胞转录组数据, miRNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-09-16 |
Unveiling the Diagnostic Value and Potential Therapeutic Targets of Phenylalanine Metabolism in Pancreatic Cancer via Integrated Multi-Omics and Machine Learning
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603069R
PMID:42730913
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研究论文 | 该研究整合代谢组学、孟德尔随机化和机器学习算法，揭示了苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的诊断价值和潜在治疗靶点 | 首次整合代谢组学、孟德尔随机化和机器学习算法研究苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的作用，利用113种机器学习算法组合筛选最优诊断模型，并结合SHAP值进行特征解释和单细胞RNA测序分析 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，缺乏大规模临床验证队列，诊断模型的临床转化应用仍需进一步验证 | 探索苯丙氨酸代谢在胰腺癌中的功能，开发高精度诊断模型并识别潜在治疗靶点和药物 | 胰腺癌患者、55种血浆代谢物、胰腺癌细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 代谢组学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、RT-qPCR、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习（12种算法，113种组合）、SHAP | 代谢组学数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像 | 55种血浆代谢物、8个差异表达基因、胰腺癌细胞系（具体数量未在摘要中说明） | NA | 代谢组学、单细胞RNA测序、转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-16 |
Identifying JAK2 and ANXA5 as Key Genes Linking Obstructive Sleep Apnea and Oxidative Stress via Machine Learning and Multilayer Transcriptomic Integration With Functional Validation
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202602273R
PMID:42730994
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研究论文 | 本研究通过整合多层转录组学数据与机器学习方法，识别并验证了连接阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）与氧化应激（OS）的关键基因JAK2和ANXA5，并进行了功能验证 | 首次通过整合差异表达分析、WGCNA、PPI网络、多种机器学习算法（Lasso回归、随机森林、SVM-RFE）、单细胞RNA测序、伪时间轨迹推断、细胞间通讯分析、免疫浸润解卷积以及虚拟基因敲除实验，系统性地识别并验证了JAK2和ANXA5作为连接OSA与氧化应激的关键基因，揭示了单核细胞亚型重塑在OSA中的作用 | 摘要中未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限、需要更大规模的临床队列验证、以及功能验证仅限于临床样本的RT-qPCR和Western blotting，缺乏深入的体内外功能机制研究 | 通过生物信息学方法识别并验证与阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）相关的氧化应激（OS）相关潜在基因 | 阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）相关的基因表达数据、人类单细胞RNA测序数据集以及临床样本 | 机器学习 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、生物信息学分析 | Lasso回归、随机森林、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）、scTenifoldKnk | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、图像（Western blot）、文本（临床信息） | 未明确说明具体样本数量，涉及公共基因表达数据集、人类单细胞RNA测序数据集以及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-09-16 |
Single-cell transcriptomics reveals that tenocyte-derived MIF contributes to tendon injury pathogenesis
2026-Sep-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117411
PMID:42733431
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肌腱损伤中肌腱细胞来源的MIF在发病机制中的作用，并验证F127@4-IPP水凝胶的治疗潜力 | 首次通过单细胞转录组解析肌腱愈合过程中的细胞异质性，发现肌腱细胞与髓系细胞间MIF相关通讯在急性损伤期增强，并开发了光交联F127DA水凝胶递送4-IPP的干预策略 | 研究主要基于小鼠模型和生物信息学预测，MIF信号的具体分子机制及F127@4-IPP在人体中的有效性仍需进一步验证 | 探究肌腱损伤修复过程中的细胞异质性和分子机制，并评估靶向MIF信号的治疗干预效果 | 肌腱损伤修复过程中的细胞群体（间充质细胞和免疫细胞）及小鼠肌腱损伤模型 | 单细胞转录组学、数字病理学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序、CellChat细胞通讯分析、光交联水凝胶递送 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-09-16 |
CoexpressDeconvolve enables reference-free single-cell-resolution deconvolution from spot-based spatial transcriptomics
2026-Sep-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116824
PMID:42733532
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研究论文 | 提出了一种名为CoexpressDeconvolve的无参比框架，用于从基于 spot 的空间转录组数据中恢复整数细胞计数和细胞类型特异性的转录组 | 结合了混合管家基因文库大小校准和空间基因共表达流形上的主题建模，无需外部单细胞参考，输出模仿标准Space Ranger输出的特征-条形码矩阵，可直接加载到标准单细胞下游分析流程中 | 摘要中未明确提及 | 解决基于 spot 的空间转录组数据中细胞类型信号模糊的问题，实现无参比的单细胞分辨率解卷积 | 人类乳腺癌和舌鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 舌鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 主题建模 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 基于 spot 的空间转录组技术 |
| 15 | 2026-09-16 |
SingleCellMQC: A comprehensive quality control workflow for single-cell multi-omics
2026-Sep-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117398
PMID:42733637
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研究论文 | 开发了一个开源R包SingleCellMQC，用于单细胞多组学数据的质量控制 | 提出了一个统一的多组学质量控制框架，涵盖样本、细胞、特征和批次四个层次，整合了经验阈值、组织特异性参考范围和数据驱动的异常值检测 | 未明确提及 | 为单细胞RNA测序、表面蛋白质组分析和免疫组库数据提供全面的质量控制 | 单细胞多组学数据，包括scRNA-seq、ADT和TCR/BCR数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 表面蛋白质组分析, 免疫组库测序 | NA | 文本 | 三个数据集：内部PBMC多组学数据集（28,498个细胞）、公共PBMC scRNA-seq数据集（137,214个细胞）和大型乳腺组织scRNA-seq数据集（超过100万个细胞） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-09-16 |
Transcriptomic landscape of microglia in mouse models of social dysfunction and oxytocin-mediated recovery
2026-Sep-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117412
PMID:42733638
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研究论文 | 该研究使用单细胞和空间转录组学技术，揭示了产前丙戊酸暴露小鼠模型中下丘脑室旁核小胶质细胞的转录组异常，以及催产素神经元刺激对小胶质细胞的恢复作用 | 首次揭示了VPA暴露对PVH小胶质细胞的转录异常及空间分布改变，并发现催产素神经元刺激可逆转部分小胶质细胞基因下调，同时小胶质细胞药理操控可正常化催产素神经元基因表达，支持双向交互作用 | 研究基于小鼠模型，结果向人类神经发育障碍的转化仍需进一步验证；对小胶质细胞亚型的功能验证尚不充分 | 探究产前VPA暴露及催产素神经元刺激对PVH非神经元细胞（小胶质细胞）的影响及其在社交功能障碍中的角色 | 小鼠模型PVH中的小胶质细胞和催产素神经元 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 神经发育障碍, 社交功能障碍 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 化学遗传学, 药理学操控 | NA | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-09-16 |
TGF-β serves as a critical signaling determinant of liver progenitor cell activation and function
2026-Sep-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199913
PMID:42518287
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和单细胞测序揭示了TGF-β在肝祖细胞静息状态维持和激活过程中的关键调控作用，并阐明了其在急性肝衰竭中的双重功能 | 首次阐明TGF-β在肝祖细胞中具有双重角色：既抑制LPC增殖（通过阻断G1到S期转变），又是HGF依赖的肝细胞基因程序诱导所必需的，揭示了TGF-β作为LPC激活和谱系特化的环境依赖性决定因子 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究肝祖细胞在生理条件下如何维持静息状态以及在大量肝坏死相关急性肝衰竭后如何被激活的分子机制 | 肝祖细胞（LPCs）、急性肝衰竭患者样本、斑马鱼模型、小鼠损伤模型 | 空间转录组学、单细胞测序 | 急性肝衰竭 | 空间转录组学、单细胞测序、免疫染色 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-16 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the spatiotemporal trajectory of the small peptide TAP4 in delaying postharvest fruit senescence
2026-Sep-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101846
PMID:41947460
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研究论文 | 该研究通过单细胞和空间转录组学揭示了小肽TAP4延缓采后果实衰老的时空轨迹 | 首次鉴定TAP4为Try自解肽中最具生物活性的肽，并利用单细胞转录组学揭示其通过激活转录因子HuWRKY21-1等重塑果皮细胞分化轨迹和免疫应答来延缓衰老 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究胰蛋白酶自解肽TAP4延缓采后果实衰老的分子机制 | 火龙果（Hylocereus undatus）果实及其果皮细胞 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、病毒诱导基因沉默、定量逆转录PCR | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-09-16 |
Tumor immune microenvironment remodeling predicts response to checkpoint inhibitor therapy
2026-Sep-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.08.007
PMID:42679812
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研究论文 | 该研究构建了跨十种癌症类型的纵向单细胞RNA测序图谱，揭示了肿瘤免疫微环境在免疫检查点抑制剂治疗中的重塑规律及其对疗效的预测价值 | 构建了大规模纵向单细胞RNA测序图谱，定义了77种免疫和基质细胞亚型及4种保守的TIME亚型，发现约40%的肿瘤在治疗过程中发生状态转变，且转变方向比基线状态更能预测疗效，并推导出59基因特征 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明免疫检查点抑制剂治疗中患者反应差异的机制，通过绘制肿瘤免疫微环境的重塑图谱来预测治疗反应 | 241名患者的441份样本，涵盖十种癌症类型 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序 | 分层参考引导的深度表型分析框架 | 单细胞转录组数据 | 441份样本来自241名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-16 |
Elucidating the beneficial effects of gut microbiota-derived metabolites in treating hepatocellular carcinoma: an integrated network pharmacology, molecular docking, and single-cell sequencing analysis
2026-Sep-12, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01129-x
PMID:42730784
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研究论文 | 本文通过整合网络药理学、分子对接和单细胞测序分析，阐明了肠道菌群衍生代谢物治疗肝细胞癌的有益效果及其潜在机制 | 首次整合网络药理学、分子对接和单细胞测序分析，系统揭示肠道菌群衍生代谢物通过多靶点、多通路抑制肝细胞癌的作用机制，并构建了微生物-代谢物-靶点-疾病网络 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接预测，缺乏体内外实验验证；单细胞数据来源于公共数据库，样本量和人群多样性有限 | 探究肠道菌群衍生代谢物治疗肝细胞癌的潜在作用机制和核心靶点 | 肠道菌群衍生代谢物、肝细胞癌相关靶点、肝细胞癌患者单细胞转录组数据 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |