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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 61 | 2025-11-19 |
BM-MSC-derived migrasomes reverse stroke-induced thymic atrophy and immunosuppression via Pin1 delivery to thymic epithelial cells
2025-Nov-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03604-2
PMID:41241718
|
研究论文 | 本研究揭示骨髓间充质干细胞通过分泌迁移体逆转中风诱导的胸腺萎缩和免疫抑制 | 首次发现BM-MSC通过迁移体递送Pin1蛋白促进胸腺上皮细胞增殖，实现神经保护与免疫调节双重功效 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在临床患者中验证 | 开发针对中风后免疫抑制的新型治疗策略 | 骨髓间充质干细胞、迁移体、胸腺上皮细胞、T细胞 | 细胞生物学 | 中风 | 单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱、体外实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 中风模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-19 |
Hypertension-induced neurovascular and cognitive dysfunction at single-cell resolution
2025-Nov-14, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.10.018
PMID:41240912
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高血压诱导的神经血管和认知功能障碍的细胞分子机制 | 首次在单细胞分辨率下发现高血压早期（3天）内皮细胞、少突胶质细胞和中间神经元的功能异常先于认知障碍出现 | 研究仅使用小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究高血压如何影响脑细胞功能并导致认知障碍 | 高血压小鼠模型的新皮质细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 高血压小鼠模型在不同时间点（3天和42天）的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-11-19 |
ANPEP as a potential mediator linking aspartame exposure to MAFLD: insights from network toxicology and multi-omics analyses
2025-Nov-14, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004068
PMID:41247865
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和多组学分析，揭示了ANPEP作为阿斯巴甜暴露与代谢相关脂肪性肝病之间的潜在介导因子 | 首次系统性地识别ANPEP作为阿斯巴甜与MAFLD关联的关键分子靶点，并采用多方法验证其在疾病进程中的作用 | 研究主要基于计算预测和动物模型，需要进一步临床研究验证 | 探索阿斯巴甜暴露与代谢相关脂肪性肝病之间的分子机制 | 阿斯巴甜、ANPEP基因、代谢相关脂肪性肝病 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪性肝病 | 网络毒理学,分子对接,分子动力学模拟,机器学习,RNA测序,单细胞转录组学,孟德尔随机化,免疫荧光 | 机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据,组织学数据 | 小鼠模型和人类肝组织样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-19 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Nov-13, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280803.125
PMID:41233159
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研究论文 | 提出LLOKI框架，实现跨平台空间转录组数据的统一整合 | 无需共享基因panel即可整合不同平台的空间转录组数据，通过最优传输引导的特征传播和批量对齐技术解决数据稀疏性和批次效应 | NA | 解决跨平台空间转录组数据整合的技术挑战 | 小鼠脑组织和卵巢癌组织样本 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT，图神经网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 五个不同技术平台的小鼠脑样本和五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-11-19 |
Divergence of immune cell types in chordate blood
2025-Nov-13, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.10.032
PMID:41237770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了海鞘血液中免疫细胞类型的分化层次和功能多样性 | 首次在尾索动物海鞘中系统定义血液细胞状态，发现至少五种主要谱系，扩展了脊索动物免疫细胞的已知类型 | 无脊椎动物免疫细胞分子特征研究有限，与脊椎动物免疫细胞类型的同源性仍不明确 | 研究脊索动物免疫细胞类型的进化与分化 | 海鞘(Ciona robusta)的循环血液细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交,活体报告基因 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-11-19 |
Pair-rule-like transcription patterns during neural tube closure in a proto-vertebrate
2025-Nov-11, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205064
PMID:41217384
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研究论文 | 本研究在尾索动物Ciona中揭示了Lmx1、Cdkn1b和Msx转录因子在神经管闭合过程中形成的配对规则样表达模式及其调控机制 | 首次在原始脊椎动物中发现神经管闭合过程中存在配对规则样转录模式，揭示了Lmx1和Cdkn1b在背侧中线形成互补交替表达的新机制 | 研究局限于单一模式生物Ciona，在更高等脊椎动物中的保守性需要进一步验证 | 探究神经管闭合过程中转录程序的调控机制 | 尾索动物Ciona的神经管闭合过程 | 发育生物学 | NA | HCR原位杂交，单细胞RNA测序，错误表达实验 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-11-19 |
ELLA: modeling subcellular spatial variation of gene expression within cells in high-resolution spatial transcriptomics
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64867-0
PMID:41219206
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研究论文 | 提出一种名为ELLA的统计框架，用于建模亚细胞mRNA定位并检测细胞内的空间变异基因 | 使用过度分散的非齐次泊松过程建模空间计数数据，并采用统一的细胞坐标系来锚定不同的细胞形态 | NA | 开发用于高分辨率空间转录组学中亚细胞空间表达分析的工具 | 亚细胞水平的基因表达空间变异 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 过度分散非齐次泊松过程 | 空间计数数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2025-11-19 |
TMPRSS11B promotes an acidified microenvironment and immune suppression in squamous lung cancer
2025-Nov-10, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00631-1
PMID:41214366
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研究论文 | 本研究揭示了TMPRSS11B通过促进乳酸输出和酸化微环境驱动肺鳞癌免疫抑制的新机制 | 首次发现TMPRSS11B在肺鳞癌中通过酸化肿瘤微环境诱导免疫抑制，并确定其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究TMPRSS11B对肿瘤微环境和免疫系统的影响 | 肺鳞状细胞癌(LUSC)肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA FISH, 空间转录组学, 超pH敏感纳米颗粒成像, 代谢物分析 | NA | 空间转录组数据, 代谢物数据, 成像数据 | 免疫活性小鼠模型和SNL自发肿瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-11-19 |
Characterization of Early Metastatic Subpopulations in Uveal Melanoma: Single-Cell Insights Into SPP1+ Cells and Their Interactions With Macrophages
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.37
PMID:41247132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了葡萄膜黑色素瘤中与早期转移相关的高侵袭性SPP1+肿瘤细胞亚群及其与巨噬细胞的相互作用 | 首次在单细胞水平识别了与葡萄膜黑色素瘤早期转移相关的SPP1+细胞亚群，并揭示了其与CCL3+巨噬细胞的相互作用机制 | 样本量相对较小（11例单细胞测序样本），需要更大规模的研究验证 | 识别葡萄膜黑色素瘤早期转移的高侵袭性肿瘤细胞亚群并分析其与免疫细胞的相互作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光, CCK8检测, Transwell实验, 流式细胞术, RT-qPCR | 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 实验数据 | 11例单细胞测序样本（11位患者），133例批量RNA测序验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-11-19 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
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研究论文 | 通过BARseq高通量原位测序技术研究小鼠大脑皮层神经元转录组特征与区域身份的关系 | 首次使用BARseq技术在完整大脑皮层范围内进行原位测序，揭示了输入依赖性皮层区域身份的形成机制 | 研究仅针对小鼠模型，尚未在其它物种验证；仅检测了104个细胞类型标记基因 | 探索大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中及其发育机制 | 小鼠前脑半球皮层神经元 | 神经科学 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 1030万细胞，其中4,194,658个皮层神经元，覆盖9个小鼠前脑半球 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | BARseq | 高通量原位测序技术，能够实现细胞分辨率的大规模基因表达分析 |
| 71 | 2025-11-19 |
Durable B-Cell Impairment While Sparing IgA B Cells After Ocrelizumab Therapy in Multiple Sclerosis
2025-Nov, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70135
PMID:40781066
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研究论文 | 本研究评估了奥瑞珠单抗治疗多发性硬化症患者前后B细胞谱系的变化 | 首次使用光谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析奥瑞珠单抗治疗期间及停药后B细胞亚群的动态变化，发现治疗期间IgA记忆B细胞相对保留，停药后重建的B细胞主要为具有炎症和迁移表型的幼稚B细胞 | 样本量较小（18名患者），停药后分析仅基于3名患者，需要更大规模研究验证 | 探究奥瑞珠单抗在多发性硬化症中的作用机制和疾病病理生理学 | 复发缓解型多发性硬化症患者和健康志愿者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 18名多发性硬化症患者和10名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 72 | 2025-11-19 |
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
PMID:41145665
|
研究论文 | 本研究开发了CytoTRACE 2深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜能 | 提出了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，在预测发育层次结构方面优于现有方法 | NA | 预测细胞的绝对发育潜能和分化能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-19 |
Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09644-1
PMID:41193844
|
研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育的高分辨率转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 通过密集采样构建了胚胎期到出生后发育阶段的单细胞转录组和Multiome数据集，重建了所有兴奋性、抑制性和非神经元细胞类型的发育轨迹图 | 研究仅限于小鼠视觉皮层，未涉及其他脑区或其他物种 | 揭示哺乳动物皮层细胞类型多样化的发育机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的细胞类型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，单核Multiome测序 | 发育轨迹重建分析 | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | 568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量细胞核 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单核Multiome测序平台 |
| 74 | 2025-11-19 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
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研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法，用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间，并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 开发计算方法来推断单细胞分辨率下的通路活性 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞ATAC测序 | 多重对应分析,线性回归 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-11-19 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了宫颈阴道微生物组与人类宫颈上皮和黏膜下组织空间特异性基因表达模式的关联 | 首次在空间分辨率上证明微生物组定植不仅影响腔表面，而且贯穿整个黏膜层，特别是在基底膜两侧产生最显著影响 | 样本量较小(n=21)，且研究对象仅限于肯尼亚女性性工作者群体 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈组织转录景观的影响及其与HIV易感性的潜在关联 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | 加权基因共表达分析 | 空间转录组数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA-sequencing reveals adventitial fibroblast alterations during mouse atherosclerosis
2025-Nov, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞中的差异表达及其功能影响 | 研究仅使用雄性Ldlr-/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每样本三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，GWAS分析，体外基因敲低实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 雄性Ldlr-/-小鼠，每组两个样本（每样本三只小鼠混合） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-19 |
ScRDAVis: An R shiny application for single-cell transcriptome data analysis and visualization
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013721
PMID:41231930
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研究论文 | 开发了一个基于R Shiny的单细胞转录组数据分析和可视化交互式网络应用 | 首个提供hdWGCNA用于单细胞RNA-seq数据共表达网络和转录因子调控网络分析的GUI平台 | NA | 为无编程经验的生物学家提供单细胞转录组数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-11-19 |
Comparative genomics, integrated with single-cell sequencing and genetic analyses, reveal roles of transcription factor AP2-M2 in asexual replication of Babesia parasite
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013699
PMID:41231960
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学、单细胞测序和遗传分析揭示了转录因子AP2-M2在巴贝斯虫无性繁殖阶段的关键调控作用 | 构建了新疆巴贝斯虫染色体级别参考基因组，首次应用单细胞RNA测序技术解析寄生虫无性繁殖阶段的转录异质性，发现BxAP2-M2在整个无性发育过程中持续表达并调控关键毒力因子 | 研究聚焦于单一巴贝斯虫物种，调控机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究巴贝斯虫无性繁殖阶段的分子调控机制 | 新疆巴贝斯虫及其无性繁殖阶段 | 寄生虫学 | 巴贝斯虫病 | 单细胞RNA测序, 比较基因组学, 系统发育分析, 伪时序分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-11-19 |
Library size-stabilized metacells construction enhances co-expression network analysis in single-cell data
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013697
PMID:41231963
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研究论文 | 提出一种通过稳定文库大小构建元细胞的算法框架LSMetacell，用于提高单细胞数据中共表达网络分析的准确性 | 首次在元细胞构建中显式稳定文库大小以消除组成性偏差，相比传统方法能更准确地识别生物共表达网络 | 未明确说明算法在不同单细胞技术平台和数据集规模下的普适性验证 | 解决单细胞RNA测序数据中的组成性偏差问题，提高共表达网络分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LSMetacell算法框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-11-19 |
Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration
2025-Nov, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001
PMID:41046113
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综述 | 本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新进展、工程策略和临床应用 | 整合材料科学、机器学习和单细胞RNA测序技术推动个性化与标准化的3D细胞球体生物制造 | 细胞球体长期稳定性有限、大规模生产困难以及体内植入后的免疫排斥问题 | 探讨3D细胞球体技术在软骨再生医学中的转化潜力 | 软骨细胞、软骨组织工程模型 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习(ML) | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |