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当前共找到 32755 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2025-11-18
CELLama: Foundation Model for Single Cell and Spatial Transcriptomics by Cell Embedding Leveraging Language Model Abilities
2025-Nov-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一个名为CELLama的基础模型,利用语言模型能力将单细胞和空间转录组数据转换为句子表示,实现通用细胞嵌入 首次将语言模型应用于单细胞和空间转录组数据分析,通过将细胞数据转化为句子形式实现通用细胞嵌入 NA 解决单细胞RNA测序和空间转录组数据分析中的复杂性挑战,包括细胞分型、数据整合和空间关系理解 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 自然语言处理,数字病理 NA 单细胞RNA测序,空间转录组 语言模型 基因表达数据,元数据 大规模细胞图谱 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组 NA NA
142 2025-11-18
Mechanistic Insights Into Recurrent Implantation Failure: The Lactate-H3K18la-SLC7A11 Axis Explored via Endometrial Organoid and Blastoid-Endometrial Cell Implantation Models
2025-Nov-16, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究通过子宫内膜类器官和胚泡-子宫内膜细胞植入模型,揭示了乳酸-H3K18la-SLC7A11轴在调控子宫内膜容受性中的新机制 首次发现乳酸通过H3K18la表观遗传修饰调控SLC7A11表达,进而促进上皮-间质转化和胚胎植入的新机制 NA 探索复发性植入失败的分子机制 人类子宫内膜类器官和胚泡-子宫内膜细胞植入模型 生殖医学 复发性植入失败 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序,多组学分析 NA 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
143 2025-11-18
Deciphering the nexus of aging and pan-cancer: Single-cell sequencing reveals microenvironmental remodeling and cellular drivers
2025-Nov-15, Bioscience trends IF:5.7Q1
综述 通过单细胞测序技术解析衰老与泛癌发展的关联机制及肿瘤微环境重塑 整合单细胞测序数据揭示衰老细胞通过分泌SASP因子重塑肿瘤微环境的具体机制 单细胞测序数据存在批次效应,衰老细胞丰度低(<5%)影响分析灵敏度 探讨衰老作为泛癌发展风险因素的生物学机制 衰老细胞亚群(如CDKN2A/LMNB1细胞)及肿瘤微环境组成细胞 生物信息学 泛癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多组学整合分析 深度学习 单细胞转录组数据 基于TCGA和GEO等公共数据库的泛癌分析 NA 单细胞RNA测序 NA NA
144 2025-11-18
Bisphenol S disrupts human sertoli cell function through NR1H3 degradation: Mechanistic insights from integrated bulk and single-cell transcriptomics
2025-Nov-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组学揭示了双酚S通过降解NR1H3破坏人类支持细胞功能的分子机制 首次证明BPS通过靶向NR1H3损害人类支持细胞功能,揭示了NR1H3在支持细胞存活中的关键作用 使用永生化人类支持细胞系,可能与原代细胞存在差异;研究集中于NR1H3通路,可能存在其他作用机制 探究双酚S对人类支持细胞功能的分子作用机制及其与男性不育的关联 永生化人类支持细胞和非梗阻性无精子症睾丸组织 单细胞转录组学 男性不育 bulk RNA测序, 单细胞转录组测序, 分子对接, 分子动力学模拟, MM/GBSA结合自由能计算, 荧光素酶报告基因分析, Western blot NA 转录组数据, 分子对接数据, 蛋白质表达数据 永生化人类支持细胞系和非梗阻性无精子症睾丸单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
145 2025-11-18
Metastasis-Initiating Osteosarcoma Subpopulations Establish Paracrine Interactions with Lung and Tumor Cells to Create a Metastatic Niche
2025-Nov-14, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了骨肉瘤中具有转移启动能力的亚群通过IL1信号通路与肺上皮细胞建立旁分泌相互作用促进转移灶形成的机制 首次发现低增殖骨肉瘤亚群能持续产生IL6和CXCL8等转移促进因子,并阐明其对肺上皮细胞来源IL1α的响应机制 研究主要基于实验模型,临床转化效果需进一步验证 探索骨肉瘤肺转移的细胞分子机制并开发靶向治疗策略 骨肉瘤细胞、肺上皮细胞、人源异种移植模型和免疫健全小鼠模型 癌症生物学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、体外器官型转移模型 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
146 2025-11-18
PIEZO1 gain-of-function mutation drives cardiomyopathy by disrupting myocardial lipid homeostasis besides iron overload
2025-Nov-14, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究揭示了PIEZO1功能获得性突变通过破坏心肌脂质代谢导致心肌病的机制 首次发现PIEZO1功能获得性突变除铁超载外,还通过钙信号-CaMKII-FOXO3轴破坏脂质代谢导致心肌病 研究样本量有限,仅基于一名患者和动物模型数据 探究PIEZO1突变与心肌病发展的关系及其分子机制 31岁男性先证者、PIEZO1 D674Y突变小鼠模型、心肌细胞 心血管疾病研究 心肌病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 1名患者和转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
147 2025-11-18
Integrating machine learning and experimental validation identifies a post-translational modification gene signature for prognosis and treatment response in breast cancer
2025-Nov-14, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合机器学习与实验验证,开发了乳腺癌预后和治疗响应的翻译后修饰基因特征 首次系统整合多种翻译后修饰(PTM)信息,从117个机器学习模型中筛选最优组合构建PTM相关基因特征(PTMRS),并在单细胞和空间转录组水平验证基因表达模式 研究样本量未明确说明,验证主要依赖公共数据集和有限实验验证 阐明多种翻译后修饰与乳腺癌预后的关联,开发预后预测模型 乳腺癌患者和肿瘤组织 机器学习 乳腺癌 GSVA、PCR、单细胞RNA-seq、空间转录组 机器学习集成模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组 NA NA
148 2025-11-18
Exploring mitochondrial ribosomal protein S12 as a novel target for non-small cell lung cancer
2025-Nov-14, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究探讨线粒体核糖体蛋白S12(MRPS12)在非小细胞肺癌发病机制中的表达和功能意义 首次将MRPS12确定为非小细胞肺癌的新型治疗靶点,并系统验证其通过调控线粒体功能促进肿瘤恶性进展的机制 未涉及MRPS12靶向治疗的临床转化研究,缺乏在更广泛肺癌亚型中的验证 探索MRPS12作为非小细胞肺癌新型治疗靶点的潜力 非小细胞肺癌细胞系、患者组织样本和裸鼠移植瘤模型 癌症生物学 肺癌 单细胞RNA测序, shRNA基因沉默, CRISPR-Cas9基因敲除, 线粒体功能分析 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 功能实验数据 癌症基因组图谱数据集, 多种NSCLC细胞类型, 裸鼠移植瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
149 2025-11-18
STPath: a generative foundation model for integrating spatial transcriptomics and whole-slide images
2025-Nov-14, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
研究论文 提出STPath生成式基础模型,通过整合空间转录组学和全切片图像来预测基因表达 首次开发能够直接预测38,984个基因在17个器官中表达的基础模型,无需下游微调 NA 开发可扩展的空间转录组学病理应用 空间转录组数据和全切片图像 数字病理学 肿瘤 空间转录组学,全切片图像分析 几何感知Transformer 图像,基因表达数据 23个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
150 2025-11-18
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA sequencing uncover tumor microenvironment diversity in invasive Retinoblastoma
2025-Nov-14, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析揭示了侵袭性视网膜母细胞瘤肿瘤微环境的异质性特征 首次在视网膜母细胞瘤中发现锥体前体细胞亚群的功能多样性,并鉴定出DOK7作为侵袭关键基因 样本量较小(仅10例患者),且使用公开数据可能限制实验设计的灵活性 探索视网膜母细胞瘤肿瘤微环境异质性及其与肿瘤侵袭的关系 10例视网膜母细胞瘤患者的原发肿瘤组织 单细胞测序分析 视网膜母细胞瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA RNA测序数据 10例视网膜母细胞瘤患者 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
151 2025-11-18
Exploration of the roles of CAFs in melanoma based on single-cell transcriptomics and spatial transcriptomics
2025-Nov-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 基于单细胞转录组学和空间转录组学探索癌症相关成纤维细胞在黑色素瘤中的作用 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq数据系统解析黑色素瘤中CAF的分子程序,并构建CAF中心的免疫排斥网络 NA 探索癌症相关成纤维细胞在黑色素瘤中的功能异质性和空间生态作用 黑色素瘤中的癌症相关成纤维细胞及其与免疫细胞的相互作用 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA-seq,WGCNA,CellChat分析 风险评分模型 转录组数据,空间分布数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
152 2025-11-18
Integrative Mendelian randomization and spatial transcriptomics analysis reveals causal links between plasma lipidome and non-small cell lung cancer
2025-Nov-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化和空间转录组学分析,揭示血浆脂质组与非小细胞肺癌之间的因果关系 首次结合双向孟德尔随机化与空间转录组学,发现PVT1作为脂质相关关键基因在肿瘤密集区域高表达 基于汇总级GWAS数据,无法完全排除多效性偏倚 探讨血浆脂质组与非小细胞肺癌之间的潜在因果关系 非小细胞肺癌患者和健康人群 生物信息学 肺癌 孟德尔随机化, 空间转录组学, 机器学习基因优先排序 逆方差加权, MR-Egger, 加权中位数, MR-PRESSO 基因组关联研究汇总数据, 空间转录组数据 基于GeneRISK和FinnGen GWAS的大规模样本 NA 空间转录组学 NA NA
153 2025-11-16
Correction: Single-cell RNA sequencing unveils Lrg1's role in cerebral ischemia‒reperfusion injury by modulating various cells
2025-Nov-14, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
154 2025-11-18
Aldolase a in pan-cancer and lung squamous cell carcinoma: prognostic value and macrophage-driven immune suppression unveiled by multi-omics and cohort validation
2025-Nov-14, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和队列验证揭示了醛缩酶A在泛癌和肺鳞癌中的预后价值及其通过巨噬细胞驱动的免疫抑制机制 首次系统评估ALDOA在肺鳞癌中的预后价值,并通过空间转录组学和免疫荧光证实其与肿瘤相关巨噬细胞的共定位关系 机制研究仍需进一步深入,治疗干预策略需要更多实验验证 探究ALDOA在肺鳞癌中的预后价值和其在巨噬细胞介导的免疫抑制中的作用 泛癌数据集和肺鳞癌患者组织样本 生物信息学 肺鳞癌 免疫组织化学染色,单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光染色 生物信息学算法 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,临床数据 多个独立患者队列 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA TISCH2数据库
155 2025-11-18
Pan-cancer analysis identifies LMBR1L as a prognostic and immunological biomarker with validation in colorectal cancer
2025-Nov-14, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 通过泛癌分析鉴定LMBR1L作为预后和免疫生物标志物,并在结直肠癌中进行实验验证 首次系统揭示LMBR1L在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗预测标志物的潜力 研究主要基于公共数据库和结直肠癌模型,需要在更多癌种中进一步验证 探索LMBR1L在肿瘤免疫微环境中的功能及其临床意义 多种癌症组织和结直肠癌细胞系 生物信息学 结直肠癌 单细胞测序,生存分析,GSEA,GSVA,免疫浸润分析,体外实验,体内实验 NA 基因表达数据,临床样本数据 公共数据库中的多种癌症数据及结直肠癌临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
156 2025-11-18
Intermediate filaments promote glioblastoma cell invasion by controlling nuclear deformations and mechanosensitive expression of MMP14
2025-Nov-14, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示中间丝通过调控核变形和机械敏感性MMP14表达促进胶质母细胞瘤细胞侵袭的机制 首次发现中间丝通过缓冲压缩应力下的核变形来促进前导细胞侵袭,并揭示其与MMP14表达的机械敏感性调控关系 研究主要基于体外和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 探究中间丝在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的作用机制 胶质母细胞瘤细胞 癌症生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 胶质母细胞瘤患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
157 2025-11-18
Dissecting macrophage heterogeneity in ulcerative colitis: Single-cell analysis and functional validation of S100A4 as a therapeutic target
2025-Nov-14, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞分析结合功能验证,解析溃疡性结肠炎中巨噬细胞异质性并确定S100A4作为治疗靶点 首次在溃疡性结肠炎中系统鉴定五种巨噬细胞亚群,发现S100A8+和IL1B+巨噬细胞的非经典极化模式,并通过多算法机器学习验证S100A4的诊断和治疗潜力 研究主要基于公共数据库和动物模型,需要进一步临床验证 解析溃疡性结肠炎中巨噬细胞异质性并验证潜在治疗靶点 健康对照、非炎症性溃疡性结肠炎和炎症性溃疡性结肠炎患者的结肠组织,DSS诱导结肠炎小鼠模型,RAW264.7巨噬细胞系 单细胞分析 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析,细胞间通讯分析,高维加权基因共表达网络分析,机器学习算法 随机森林,其他八种机器学习算法 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据 公共单细胞RNA测序数据集,独立批量转录组队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
158 2025-11-18
Transcriptional and temporal heterogeneity of developing α cells revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示发育中α细胞的转录和时间异质性 使用时间分辨报告小鼠品系首次系统揭示α细胞发育过程中的转录动态和细胞异质性 研究主要基于小鼠模型,人类α细胞发育的异质性仍需验证 探索胰腺α细胞发育过程中的转录动态和细胞异质性 小鼠胰腺发育中的α细胞 单细胞转录组学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Gcg-Timer胚胎细胞及两个独立发育阶段数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
159 2025-11-18
Renal tubular-derived retinoic acid drives renal fibrosis via a RAI14-TRIOBP-YAP mechanotransduction axis
2025-Nov-14, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了肾小管来源的视黄酸通过RAI14-TRIOBP-YAP机械转导轴驱动肾纤维化的机制 首次发现肾小管损伤通过视黄酸信号激活间质成纤维细胞的机械转导通路,揭示了上皮-间质通讯的新机制 研究主要聚焦于肾纤维化模型,其他器官纤维化中的适用性需要进一步验证 探究视黄酸在肾纤维化中的作用机制及上皮-间质通讯的分子基础 肾小管上皮细胞和间质成纤维细胞 细胞生物学 肾纤维化疾病 空间代谢组学、单细胞转录组学、基因敲除 NA 代谢组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
160 2025-11-18
ATP6V1E1 and NDUFB5 identified as potential biomarkers for Alzheimer's disease through integrative analysis
2025-Nov-14, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过整合分析识别ATP6V1E1和NDUFB5作为阿尔茨海默病的潜在生物标志物 首次通过整合分析发现ATP6V1E1和NDUFB5与AD发病机制相关,并揭示其与线粒体和溶酶体系统协同功能障碍的关联 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要在更大规模的人类队列中进一步验证 识别与氧化磷酸化相关的阿尔茨海默病生物标志物以实现早期干预 阿尔茨海默病患者颞叶和外周血样本、AD小鼠模型 生物信息学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, Western blotting, 多元逻辑回归, LASSO回归 逻辑回归模型 基因表达数据, 蛋白质数据 多个独立队列的人类样本和AD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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