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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-11-18 |
Transcriptomic profiling confirms microRNA-140 is more functional in joint development than in disease
2025-Nov-14, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.11.005
PMID:41242538
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研究论文 | 本研究通过转录组分析确认microRNA-140在关节发育中的功能比在骨关节炎疾病中更为重要 | 首次使用空间转录组学技术揭示miR-140-5p在静息软骨细胞和软骨膜中的特异性功能 | 研究仅使用小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;骨关节炎模型中miR-140-5p的影响较为有限 | 探究miR-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用,并识别新的miR-140-5p靶点 | Mir140基因敲除小鼠模型,包括骨骼发育和骨关节炎诱导模型 | 转录组学 | 骨关节炎 | RNA测序,空间转录组学,CRISPR-Cas9基因编辑,组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,空间基因表达数据,组织学图像 | 7日龄小鼠的肋软骨细胞和下肢生长板组织 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-11-18 |
Temporal single-cell landscape suggests infection-induced IgM plasma cells as a correlate of durable influenza immunity
2025-Nov-14, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.ijid.2025.108227
PMID:41242688
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研究论文 | 通过单细胞技术比较自然感染与疫苗接种诱导的B细胞免疫应答差异 | 首次在单细胞层面系统比较流感自然感染与疫苗接种的B细胞应答差异,发现感染特异性诱导的IgM+浆细胞群体 | 样本量较小(7名受试者),仅针对H3N2流感病毒 | 探究自然感染相比疫苗接种能产生更持久流感免疫保护的细胞机制 | 人类B细胞 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞转录组测序,BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,BCR序列数据 | 150,131个B细胞,来自7名受试者(3名自然感染,4名疫苗接种) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2025-11-18 |
Glutamine metabolism reprogramming promotes bladder cancer progression via PYCR1: a multi-omics and functional validation study
2025-Nov-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07386-2
PMID:41233804
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能验证揭示了谷氨酰胺代谢重编程通过PYCR1促进膀胱癌进展的机制 | 首次构建基于谷氨酰胺代谢的预后模型GMscore,并发现PYCR1作为关键调控基因通过P5CS促进脯氨酸合成并激活PI3K/AKT/mTOR信号通路 | 未明确说明样本规模,研究主要聚焦于PYCR1机制,可能忽略其他代谢调控因子 | 探索谷氨酰胺代谢在膀胱癌中的临床意义及其与免疫治疗反应的关系 | 膀胱癌细胞系、患者队列数据、异种移植模型 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、批量转录组分析、随机森林分析、PCA | 预后模型GMscore、随机森林 | 代谢组数据、RNA测序数据、功能实验数据 | 多个患者队列(包括IMvigor210和GSE91061免疫治疗队列) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 164 | 2025-11-18 |
The influence of oxygen concentration on the fate determination of retinal ganglion cells
2025-Nov-13, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110751
PMID:41241340
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综述 | 本文综述了氧气浓度对视网膜神经节细胞命运决定的影响及其机制 | 系统比较了动物模型与人源类器官模型在模拟视网膜发育中的效能,并强调微流控等新技术在精确调控氧浓度中的应用 | NA | 探讨氧气浓度在视网膜神经节细胞发育和疾病中的作用机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 发育生物学 | 视神经疾病 | 微流控技术、类器官芯片、遗传扰动、细胞成像、单细胞转录组学、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2025-11-18 |
scRNA-sequencing Reveals Bu-Shen-Yi-Qi formula (BSYQF) ameliorates airway remodeling via regulating imbalanced M1/M2 macrophage subtypes in chronic asthmatic mice
2025-Nov-12, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120883
PMID:41237867
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示补肾益气方通过调节M1/M2巨噬细胞亚型失衡改善慢性哮喘小鼠气道重塑的作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统揭示补肾益气方通过调节巨噬细胞极化平衡改善哮喘气道重塑的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究补肾益气方治疗慢性哮喘的分子作用机制 | 慢性哮喘小鼠模型 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 组织图像数据 | 8个小鼠肺组织样本,超过60,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 166 | 2025-11-18 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示骨髓细胞介导的干扰素信号传导导致肾细胞癌对免疫检查点阻断治疗的耐药机制 | 开发了推断性建模方法解析肿瘤微环境中细胞因子信号效应,首次发现骨髓细胞而非肿瘤细胞是干扰素驱动免疫治疗耐药的关键介质 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 研究干扰素信号在肾细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗疗效的影响 | 肾细胞癌患者的肿瘤免疫微环境 | 单细胞基因组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床试验队列的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-11-18 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Nov-11, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148990
PMID:41232892
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序分析,揭示克罗恩病中铜死亡相关蛋白的作用 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序数据系统分析铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用 | 需要进一步的实验验证这些关联性,并探索标记物作为治疗靶点的潜力 | 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用 | 克罗恩病炎症组织和对照组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序,RT-qPCR | 诊断模型 | 基因表达数据 | 494例组织样本和25,121个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-11-18 |
Atractylenolide III regulates Vitamin K1 metabolism to activate effector chondrocytes for ameliorating cartilage degeneration in KOA
2025-Nov-11, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157537
PMID:41242311
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示了白术内酯III通过调节维生素K1代谢激活效应软骨细胞,从而改善膝骨关节炎软骨退变的机制 | 首次发现白术内酯III通过调控ESR2/VK1/MMP9代谢轴改善软骨退变,并确认维生素K1代谢在软骨修复中的关键作用 | 研究主要聚焦早期膝骨关节炎,对晚期病变的适用性需进一步验证 | 探索白术内酯III治疗膝骨关节炎的潜在治疗机制 | 膝骨关节炎模型小鼠和体外培养的软骨细胞 | 多组学分析 | 膝骨关节炎 | 单细胞转录组学,非靶向代谢组学,分子对接,分子动力学模拟,流式细胞术 | NA | 转录组数据,代谢组数据,影像数据,组织染色数据 | 膝骨关节炎模型小鼠和体外软骨细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq,代谢组学 | NA | NA |
| 169 | 2025-11-18 |
Genetic and Cellular Architecture of Breast Cancer Risk in Multi-Ancestry Studies of 159,297 Cases and 212,102 Controls
2025-Nov-07, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.20.25334075
PMID:40909829
|
研究论文 | 本研究通过多祖先群体的全基因组关联分析,探索了乳腺癌的遗传结构和细胞特征 | 迄今为止规模最大的多祖先乳腺癌GWAS研究,整合单细胞RNA-seq图谱识别跨祖先共享的细胞类型关联 | 样本量在不同祖先群体间分布不均,某些群体间的遗传相关性估计存在较大标准误 | 探索乳腺癌在多祖先群体中的遗传结构和细胞基础 | 159,297例乳腺癌患者和212,102例对照,涵盖非洲、东亚、欧洲和西班牙/拉丁裔祖先群体 | 基因组学 | 乳腺癌 | GWAS, 单细胞RNA-seq | 稀疏正态混合效应模型 | 基因组关联汇总统计数据 | 159,297病例和212,102对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens单细胞RNA-seq图谱 |
| 170 | 2025-11-18 |
Single-cell resolution mapping of the immune modulation landscape induced by Chinese herb sanguisorbae radix
2025-Nov-07, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157528
PMID:41242310
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了中药地榆对人类免疫细胞的调节作用及其潜在机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示地榆对多种免疫细胞的异质性调节作用,并发现其通过增强线粒体自噬和抑制NF-κB信号通路发挥免疫调节功能 | 样本来源单一(仅人类PBMCs),未涉及动物模型验证;机制研究主要基于转录组数据,需要进一步功能实验验证 | 探究地榆对人类免疫系统的调节作用及分子机制 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 免疫调节相关疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, UPLC-MS/MS, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 同一人类受试者SR干预前后的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-11-18 |
Rs61731397-C in OR2A25 increases the risk of chronic rhinosinusitis in the Chinese population
2025-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.032
PMID:40669566
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析发现OR2A25基因中的rs61731397-C变异会增加中国人群慢性鼻窦炎的发病风险 | 首次在中国人群中鉴定出OR2A25基因变异与慢性鼻窦炎的关联,并通过功能实验证实该变异通过降低蛋白稳定性影响疾病发生 | 研究主要聚焦于中国人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别中国人群慢性鼻窦炎的遗传风险变异并阐明其作用机制 | 中国人群(昆山队列和北京队列) | 遗传学 | 慢性鼻窦炎 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序、结构预测、体外表达研究、Western blot分析 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 两个独立队列(昆山队列和北京队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-11-18 |
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index
2025-Nov, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC
PMID:40938630
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析识别了非结核分枝杆菌肺病的新遗传位点,并发现体重指数可能具有保护作用 | 发现了两个新的NTM-PD相关遗传位点,并验证了一个已知位点,首次通过孟德尔随机化证明体重指数与NTM-PD存在潜在因果关系 | 研究样本主要来自亚洲人群,欧洲队列样本量相对较小 | 识别NTM-PD的遗传结构并探索其与风险因素的关联 | 非结核分枝杆菌肺病患者和健康对照者 | 基因组学 | 肺部疾病 | 全基因组关联研究, 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 韩国队列: 1,949例患者和2,955例对照; 日本队列: 1,137例患者和1,546例对照; 欧洲队列: 243例患者和570例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-11-18 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals neutrophil diversity and spatial heterogeneity in acute kidney injury
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148478
PMID:41135905
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 首次在AKI中鉴定出6个中性粒细胞亚群,其中3个为全新发现;发现了以中性粒细胞为中心的新型微环境单元 | NA | 阐明急性肾损伤中中性粒细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 急性肾损伤模型中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 174 | 2025-11-18 |
The cell as a token: high-dimensional geometry in language models and cell embeddings
2025-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf595
PMID:41165609
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综述 | 探讨自然语言嵌入结构理解如何为单细胞数据集分析提供启示 | 将语言模型中的标记概念与细胞嵌入相类比,提出高维几何结构的相似性分析 | NA | 探索语言模型分析方法在单细胞数据分析中的应用前景 | 单细胞测序数据和语言模型嵌入结构 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型, 语言模型 | 单细胞数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2025-11-18 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
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研究论文 | 本研究通过随机双盲安慰剂对照试验评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对中年健康成年人免疫系统的影响 | 首次在人体临床试验中证实尿石素A能够改善年龄相关的免疫衰退,并揭示了其对免疫细胞组成和功能的调节作用 | 样本量较小(50名参与者),干预时间较短(4周),研究对象仅限于健康中年成年人 | 评估尿石素A对年龄相关免疫衰退的干预效果 | 50名健康中年成年人 | 免疫学 | 老年性疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,代谢分析 | NA | 临床数据,分子数据,细胞表型数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | NA |
| 176 | 2025-11-18 |
Advancing Precision Medicine in Inflammatory Skin Disease
2025-Nov, American journal of clinical dermatology
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s40257-025-00963-7
PMID:40819342
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观点文章 | 本文探讨精准医学在慢性炎症性皮肤病治疗中的应用前景与挑战 | 提出将单细胞RNA测序和空间转录组学等精准技术整合到皮肤病诊疗框架中,通过分子表型分析提升治疗精准度 | 生物标志物验证有限、成本高昂、研究队列广度不足 | 推动精准医学在皮肤病学领域的临床应用 | 慢性炎症性皮肤病患者 | 精准医学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 分子表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 177 | 2025-11-18 |
Specificity of brassinosteroid perception and its integration at signaling crossroads in vascular development
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70570
PMID:41235729
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综述 | 本文综述了油菜素甾醇信号感知的特异性及其在维管发育信号交叉点的整合机制 | 揭示了BR感知主要具有细胞自主性和强烈环境依赖性,并作为模块化局部调节器通过典型和非典型途径协调植物发育 | NA | 探讨油菜素甾醇信号感知的特异性及其与其他信号通路的整合机制 | 植物维管发育系统 | 植物分子生物学 | NA | 组织特异性CRISPR、先进成像技术、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-11-18 |
CluVar: clustering of variants using autoencoder for inferring cancer subclones from single cell RNA sequencing data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf603
PMID:41240059
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研究论文 | 提出基于自编码器的CluVar框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断癌症亚克隆的系统发育关系 | 开发了针对scRNA-seq数据高缺失率特点的自定义损失函数和多隐藏层聚类优化方法 | 未明确说明样本规模和对不同癌症类型的普适性验证 | 从单细胞RNA测序数据重建癌症亚克隆的进化轨迹 | 肿瘤组织中的恶性亚克隆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-11-18 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human bladder cancer
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00947-z
PMID:40819112
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和空间代谢组技术,揭示了人类膀胱癌的代谢异质性 | 首次结合空间转录组学和空间代谢组学技术系统研究膀胱癌的分子机制 | NA | 探索膀胱癌恶性转化的分子机制 | 人类膀胱癌组织及癌旁正常组织 | 空间生物学 | 膀胱癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-11-18 |
Characterization of tertiary lymphoid structure identifies competitive binding of CD40 and STING with TRAF2 driving IRF4-mediated B cell activation in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00944-2
PMID:40855365
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌中三级淋巴结构的特征,揭示了CD40和STING与TRAF2竞争性结合驱动IRF4介导的B细胞活化机制 | 首次发现CD40和STING通过竞争性结合TRAF2调控IRF4表达和B细胞活化,并阐明CD40减少STING泛素化同时促进其磷酸化的新机制 | 研究主要基于体外实验和转录组数据分析,缺乏体内功能验证实验 | 探究三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌中的临床意义及其抗肿瘤作用的生物学机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和体外培养的B细胞 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体外实验 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |