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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-19 |
The current landscape and emerging challenges of benchmarking single-cell methods
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf380
PMID:41045508
|
综述 | 本文系统评估了单细胞测序计算方法基准测试的研究现状与新兴挑战 | 提供了最全面的单细胞基准测试研究量化总结，涵盖282篇论文的系统分析 | 基于文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 评估单细胞计算方法基准测试领域现状并识别关键挑战 | 单细胞测序计算方法基准测试研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 282篇研究论文（130篇纯基准测试论文+152篇方法开发论文） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-11-19 |
Chronic Alcohol Consumption Enhances the Differentiation Capacity of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells into Osteoclast Precursors
2025-Jul-17, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.06.010
PMID:40683559
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研究论文 | 本研究通过恒河猴模型揭示慢性酒精摄入增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力 | 首次在灵长类动物模型中系统揭示慢性酒精摄入通过改变HSPCs的转录组和表观基因组增强其向破骨细胞分化的分子机制 | 研究仅限于恒河猴模型，尚未在人类中验证 | 探究慢性酒精摄入如何影响造血干细胞和祖细胞向破骨细胞的分化过程 | 恒河猴模型的造血干细胞和祖细胞及其分化的单核细胞/巨噬细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术,集落形成单位检测 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 恒河猴模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-11-19 |
A pair-rule-like transcription network coordinates neural tube closure in a proto-vertebrate
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.18.660479
PMID:40666853
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研究论文 | 本研究在尾索动物中发现了一个由转录因子组成的配对规则样网络，协调神经管闭合过程中的细胞行为 | 首次在原始脊椎动物中发现配对规则样转录网络调控神经管闭合，揭示了从神经模式建立到形态发生执行的转录转换机制 | 研究仅针对尾索动物模型，在更高等脊椎动物中的保守性需要进一步验证 | 揭示神经管闭合过程中转录程序如何协调细胞行为 | 尾索动物(Ciona)胚胎神经管闭合过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,HCR原位杂交,错误表达研究 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,空间表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-11-19 |
A multi-omics resource of B cell activation reveals genetic mechanisms for immune-mediated diseases
2025-Jun-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.22.25328104
PMID:40475139
|
研究论文 | 本研究构建了一个B细胞激活的多组学资源，揭示了免疫介导疾病的遗传机制 | 首次系统表征了26名健康女性供体B细胞在六种不同激活条件下的多组学响应，揭示了刺激特异性开放染色质区域与免疫疾病遗传风险的关联 | 样本仅来自健康女性供体，未包括男性或患者样本，且样本量相对有限 | 阐明B细胞激活状态在免疫介导疾病中的遗传机制 | 来自26名健康女性供体的B细胞 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 26名健康女性供体 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | CITE-seq（单细胞RNA-seq与表面蛋白标记联合检测） |
| 105 | 2025-11-19 |
Immune cell type divergence in a basal chordate
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.655184
PMID:40661343
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术定义了原始脊索动物血细胞状态的身份 | 更新了血细胞分类并扩展了脊索动物内免疫细胞的已知库 | 无脊椎动物免疫细胞分子特征研究有限，与脊椎动物免疫细胞类型的同源性仍不明确 | 研究细胞类型进化，特别是先天免疫细胞的进化 | 原始脊索动物的血细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，杂交技术，活体报告基因 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-11-19 |
Peptide Driven Identification of TCRs (PDI-TCR) reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2025-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652535
PMID:40654739
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法，用于识别抗原特异性T细胞受体，并应用于结核病患者分析CD4 T细胞的动态变化和表型特征 | 开发了PDI-TCR检测方法，能够通过比较非重叠肽池反应来区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | NA | 开发识别抗原特异性TCR的方法并研究结核病中T细胞的动态变化 | 结核病患者和结核分枝杆菌致敏健康个体的CD4 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 肽驱动TCR识别、单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 序列数据、基因表达数据 | 结核病患者和IGRA+健康个体 | NA | 单细胞RNA测序、bulk TCR测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-11-19 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646238
PMID:40236180
|
研究论文 | 提出名为Lloki的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组数据，无需共享基因面板 | 首次实现无需共享基因面板的跨平台空间转录组数据整合，通过最优传输引导的特征传播和批量对齐技术解决数据稀疏性和批次效应 | NA | 开发跨平台空间转录组数据整合方法，解决技术差异和基因面板不一致的问题 | 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT，图神经网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 五个不同技术平台的小鼠脑样本和五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-11-19 |
Transmembrane Serine Protease TMPRSS11B promotes an acidified tumor microenvironment and immune suppression in lung squamous cell carcinoma
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646727
PMID:40235980
|
研究论文 | 本研究揭示跨膜丝氨酸蛋白酶TMPRSS11B通过促进肿瘤微环境酸化和免疫抑制驱动肺鳞癌进展 | 首次发现TMPRSS11B在肺鳞癌中通过调节乳酸输出导致肿瘤微环境酸化并诱导M2样巨噬细胞富集的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步开展 | 探究TMPRSS11B对肿瘤微环境及免疫系统的影响机制 | 肺鳞状细胞癌模型和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | RNA FISH, 空间转录组学, 超pH敏感纳米颗粒成像, 代谢物分析 | 同系小鼠模型, SNL自体模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 代谢物数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2025-11-19 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
|
研究论文 | 本研究通过实验模型解析NFkappaB活性在造血衰老表型中的作用机制 | 建立了NFkappaB活性升高实验模型，首次揭示造血衰老三大表型由不同调控机制驱动 | 实验模型可能无法完全模拟自然衰老过程 | 解析造血衰老表型的分子机制 | 造血干细胞(HSC)和骨髓微环境 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,转录组学 | IkappaBminus实验模型 | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,转录组数据 | 老年小鼠和人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-11-19 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Adventitial Fibroblast Alterations during Mouse Atherosclerosis
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616802
PMID:39868275
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞功能中的关键作用 | 研究仅使用雄性Ldlr -/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每个样本由三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雄性Ldlr -/-小鼠，每组两个样本（每个样本由三只小鼠混合） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-11-19 |
<italic>PDIA5</italic> and <italic>ARFIP1</italic> as Immunogenetic Biomarkers and Therapeutic Targets in Pancreatic Neuroendocrine Neoplasms: A Multi-Omics Study Integrating MR, Gene Expression Microarray, and Single-Cell Transcriptomics
2025, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000548070
PMID:41129479
|
研究论文 | 通过多组学方法鉴定PDIA5和ARFIP1作为胰腺神经内分泌肿瘤的免疫遗传生物标志物和治疗靶点 | 整合孟德尔随机化、基因表达微阵列和单细胞转录组学数据，首次系统鉴定PDIA5和ARFIP1在胰腺神经内分泌肿瘤中的生物标志物价值 | 需要进一步验证和临床探索 | 识别胰腺神经内分泌肿瘤的可操作分子靶点和生物标志物 | 胰腺神经内分泌肿瘤（PanNENs） | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 孟德尔随机化,基因表达微阵列,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）,CIBERSORT | 蛋白质组数据,基因表达数据,单细胞转录组数据 | 多个公共数据集（GSE73338、GSE43795、GSE256136、TCGA、GTEx） | NA | 单细胞RNA-seq,基因表达微阵列 | NA | NA |
| 112 | 2025-11-19 |
Immune Microenvironmental Differences Between Obese and Healthy People in a High-Altitude Hypoxic Environment
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562386
PMID:41243986
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较肥胖与正常体重个体在急性低氧暴露后的免疫微环境差异 | 首次在高原低氧环境下揭示肥胖个体Treg细胞比例减少与疾病严重程度的关联 | 属于探索性研究，样本量有限，需要进一步验证 | 探索肥胖加剧高原低氧反应的发病机制并寻找潜在生物标志物 | 肥胖与正常体重个体及大鼠模型 | 单细胞组学 | 高原病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-11-19 |
The Role of Fibroblasts in Atopic Dermatitis: Establishing Proinflammatory Microenvironments and Mediating Cellular Crosstalk
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S558464
PMID:41243996
|
综述 | 本文总结了成纤维细胞在特应性皮炎中通过建立促炎微环境和介导细胞间通讯的作用机制 | 突破传统研究聚焦免疫细胞和角质形成细胞的局限，系统阐述成纤维细胞在AD中的主动免疫调节功能 | NA | 深入理解特应性皮炎的致病机制并为常规治疗反应不佳患者提供新治疗策略 | 成纤维细胞在特应性皮炎中的功能作用 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2025-11-19 |
1-stearoyl-2-arachidonoyl-driven B Cell metabolic dysregulation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: insights from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1719897
PMID:41244838
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序揭示了1-硬脂酰-2-花生四烯酰驱动的B细胞代谢失调在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用 | 首次整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和机器学习方法，发现HLA-DR+ B细胞亚群和脂质代谢物1-硬脂酰-2-花生四烯酰在CRSwNP中的关键作用 | 研究样本量未明确说明，疾病机制仍需进一步功能验证 | 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉的免疫代谢失调机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的免疫细胞和代谢物 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 机器学习, 基因集富集分析 | 机器学习, WGCNA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-11-19 |
Decoding the immune microenvironment in osteosarcoma: new insights into checkpoints, vaccines, and CAR-T cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1702219
PMID:41244900
|
综述 | 全面概述骨肉瘤免疫微环境特征及当前新兴免疫治疗策略 | 整合单细胞转录组学对骨肉瘤免疫微环境的新见解，系统分析检查点抑制剂、肿瘤疫苗和CAR-T细胞等联合策略 | NA | 改善骨肉瘤临床治疗效果 | 骨肉瘤免疫微环境及免疫治疗策略 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-11-19 |
Spatial transcriptomics reveals an unexpected impact of tau and tau pathology on the expression of transthyretin
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1656850
PMID:41245137
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了tau蛋白对甲状腺素运载蛋白(Ttr)表达的意外调控作用 | 首次发现tau蛋白对Ttr mRNA和蛋白表达的调控作用，揭示了tau病理可能通过影响TTR参与Aβ疾病进展的反馈循环 | 研究仅使用小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究tau蛋白如何改变大脑中mRNA表达，特别关注阿尔茨海默病早期改变的脑区 | THY-Tau22转基因小鼠（表达促聚集tau蛋白）和TauKO小鼠（tau基因敲除） | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 两种转基因小鼠模型（THY-Tau22和TauKO） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2025-11-19 |
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251391093
PMID:41245384
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素11（IL11）作为克罗恩病肠道纤维狭窄潜在生物标志物的价值 | 首次通过多组学方法系统揭示成纤维细胞来源的IL11在克罗恩病肠道纤维狭窄中的关键作用及其临床预后价值 | 观察性研究设计无法确定因果关系，样本量有限需进一步验证 | 研究白细胞介素在检测克罗恩病相关肠道纤维狭窄中的价值 | 克罗恩病患者的肠道组织样本和血清样本 | 生物标志物研究 | 克罗恩病 | RNA测序,实时聚合酶链反应,免疫组织化学,单细胞RNA测序,Luminex血清检测 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据,临床数据 | 克罗恩病患者手术切除的配对组织样本（受累和非受累段） | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-11-19 |
Functional analysis of TWIST1 domains regulating smooth muscle cell phenotype
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1659847
PMID:41246007
|
研究论文 | 本研究通过功能分析探讨TWIST1转录因子的不同结构域和 dimer 组成如何调控平滑肌细胞表型 | 首次系统分析TWIST1不同结构域和 dimer 组成对平滑肌细胞表型的独立调控作用，并揭示其与血管疾病相关信号通路的关联 | 研究仅使用人类冠状动脉平滑肌细胞系，未在体内模型中验证结果 | 阐明TWIST1在血管壁中的分子作用机制及其对平滑肌细胞表型的调控 | 人类冠状动脉平滑肌细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 增殖和迁移实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-11-19 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
|
综述 | 本文综述调节性T细胞疗法的临床进展与优化策略，重点探讨如何利用患者数据和先进技术改进治疗效果 | 整合临床样本数据与单细胞多组学技术，提出将调节性T细胞优化为能够建立免疫耐受的“活体药物” | NA | 改进调节性T细胞疗法，建立跨临床环境的免疫耐受 | 调节性T细胞疗法及其临床应用 | 免疫治疗 | 自身免疫疾病、移植物抗宿主病、器官移植排斥 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床样本数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学分析、空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2025-11-19 |
Cholesterol metabolism shapes immune low-response states in LUAD: a multi-omics cholesterol metabolism signature predicts immunotherapy benefit and identifies DHCR7 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1696360
PMID:41246332
|
研究论文 | 本研究开发了基于胆固醇代谢基因的签名(CMS)，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗获益，并鉴定DHCR7为潜在治疗靶点 | 首次在肺腺癌中系统研究胆固醇代谢的免疫调控作用，开发了具有更高预测准确性的多组学胆固醇代谢签名，并验证了DHCR7作为新治疗靶点的潜力 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要前瞻性研究进一步验证CMS的临床价值 | 探讨胆固醇代谢在肺腺癌免疫微环境中的作用，开发预测免疫治疗疗效的生物标志物 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析，单细胞转录组测序，免疫组化，流式细胞术，体外实验，动物模型 | 统计模型，机器学习模型 | 基因组数据，转录组数据，临床数据 | 1682个肺腺癌样本（包括7个初治队列和3个免疫治疗队列） | NA | 单细胞RNA测序，多重免疫组化，流式细胞术 | NA | NA |