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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-08 |
Mechanical Strain-Programmed SDC1+ Sheath Fibroblasts Trigger CXCR4hi Neutrophil-Mediated Enthesitis in Ankylosing Spondylitis
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520617
PMID:41637585
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研究论文 | 通过构建机械应变相关的强直性脊柱炎小鼠模型,结合单细胞RNA测序图谱,揭示了SDC1+鞘成纤维细胞与CXCR4hi中性粒细胞在肌腱端炎发病中的关键作用及分子机制 | 首次在单细胞水平鉴定出机械应变诱导的疾病特异性SDC1+鞘成纤维细胞亚群,并阐明其通过CXCL5-CXCR4轴招募和激活中性粒细胞形成胞外诱捕网加剧肌腱端炎,同时发现SOX5增强子和超级增强子调控该细胞命运分支 | 研究主要基于SKG小鼠模型,结论在人体组织中的验证尚待进一步开展;机械应变的具体物理刺激参数及其下游信号转导的完整网络仍需深入解析 | 阐明机械应变相关强直性脊柱炎肌腱端炎的细胞互作和分子机制 | 实验性脊柱关节炎SKG小鼠及其后足加载/卸载模型中的滑膜组织细胞 | 计算生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序、慢病毒介导的基因沉默、中和抗体治疗 | NA | 单细胞转录组数据 | 实验性脊柱关节炎SKG小鼠后足组织样本(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台用于构建机械应变相关AS肌腱端炎的单细胞转录组图谱 |
| 42 | 2026-06-08 |
Decoding schizophrenia through postmortem human brain transcriptomics
2026-Apr, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102434
PMID:41637815
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综述 | 通过对死后人脑转录组分析,揭示精神分裂症的分子病理机制 | 整合大量死后脑组织转录组数据,从单细胞分辨率揭示精神分裂症中细胞类型特异性和个体异质性的基因表达变化,尤其发现上层层兴奋性神经元易受损伤 | 死后组织分析固有方法学挑战,如样本质量、降解等影响结论稳健性 | 阐明精神分裂症的分子特征和病理生理学机制 | 精神分裂症患者死后脑组织样本 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-06-08 |
Exosome-related lactylation gene signature defines diagnostic biomarkers of periodontitis through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Apr, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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research paper | 通过整合bulk和单细胞转录组数据建立了基于外泌体相关乳酸化修饰基因的牙周炎诊断模型 | 首次建立基于外泌体相关乳酸化修饰基因的牙周炎诊断模型,并利用单细胞RNA测序揭示乳酸化修饰在牙周炎不同细胞类型中的异质性和细胞特异性重构 | 未提及明显局限性 | 探索外泌体相关乳酸化修饰基因作为牙周炎的潜在诊断标志物 | 牙周炎患者与健康对照的组织样本和单细胞数据 | machine learning | geriatric disease | RNA-seq | CNN | image, text | 训练队列和两个独立验证队列,具体样本数未在摘要中提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-06-08 |
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1016
PMID:41638263
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研究论文 | 揭示胞葬作用缺陷在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中加剧局部炎症并预测复发 | 首次系统地表征慢性鼻窦炎中胞葬作用缺陷,并鉴定出5分子标志物面板用于预测鼻息肉复发 | NA | 探究胞葬作用在慢性鼻窦炎中的作用及其与炎症内型和临床结局的关联 | 慢性鼻窦炎患者鼻息肉组织与健康鼻黏膜组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 实时定量PCR,免疫组化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA测序数据 |
| 45 | 2026-06-08 |
Single-cell RNA-seq reveals cellular dynamics and emergency hematopoiesis in banana shrimp Penaeus merguiensis hemocytes upon Yellow Head Virus infection
2026-Apr, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111178
PMID:41638371
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示了香蕉虾血细胞在黄头病毒(YHV)感染下的细胞动态和应急造血过程 | 首次通过单细胞RNA测序构建了香蕉虾血细胞在YHV感染下的高分辨率转录组图谱,鉴定了8个血细胞簇,并揭示了病毒诱导的成熟免疫细胞耗竭和未成熟祖细胞簇扩增的应急造血机制 | 未在标题和摘要中明确提及局限性,可能缺乏对病毒-宿主相互作用下游机制的验证或实验重复 | 阐明香蕉虾血细胞在黄头病毒感染下的细胞免疫动态和应急造血应答机制 | 香蕉虾(Penaeus merguiensis)血细胞 | 单细胞转录组学 | 黄头病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13个主要组织整合参考转录组以及正常和YHV感染状态下的血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-06-08 |
Unraveling dengue virus-host interactions through transcriptomics: Insights into disease progression and severity signatures
2026-Apr, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108350
PMID:41638513
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综述 | 综述转录组学技术(包括微阵列、bulk RNA-seq、scRNA-seq、ViscRNA-seq和空间转录组学)在揭示登革病毒与宿主相互作用机制及疾病进展与严重性标志方面的研究进展 | 系统整合了多种转录组学技术(尤其是单细胞和空间转录组学)在登革病毒研究中的应用,强调了病毒-宿主相互作用的动态和空间特征 | 综述依赖已发表研究,可能缺乏最新数据整合;未深入探讨技术差异对结果一致性的影响 | 阐明转录组学如何揭示登革病毒调控宿主基因表达的机制,并识别与疾病进展和严重性相关的生物标志物及治疗靶点 | 登革病毒感染的宿主细胞及动物模型 | 自然语言处理 | 登革热 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-06-08 |
The CD74-MIF axis contributes to acute uveitic injury by upregulating proinflammatory cytokine secretion in murine cytomegalovirus intracameral infection mouse models
2026-Apr, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110907
PMID:41655503
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研究论文 | 本研究探讨了CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染模型中通过上调促炎细胞因子分泌加重急性葡萄膜炎损伤的机制 | 首次揭示CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染驱动的急性葡萄膜炎中的关键作用,并证明其通过促进促炎细胞因子分泌加剧眼内炎症 | NA | 阐明CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染诱导的急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 | 小鼠巨细胞病毒眼内感染模型中的C57BL/6和BALB/c小鼠 | NA | 急性葡萄膜炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠品系(C57BL/6和BALB/c) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-06-08 |
YTHDF2-orchestrated m6A methylation of BECN1 induces Scoparone-mediated hepatic stellate cell ferroptosis to attenuate liver fibrosis
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157912
PMID:41655543
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研究论文 | 该文章研究了Scoparone通过YTHDF2介导的BECN1 m6A甲基化诱导肝星状细胞铁死亡来减轻肝纤维化的分子机制 | 首次揭示了Scoparone通过m6A表观转录组调控肝星状细胞铁死亡来抗肝纤维化的新机制,特别是YTHDF2识别BECN1 mRNA的m6A甲基化位点促进其翻译的发现 | 未提及具体局限性 | 阐明Scoparone通过m6A表观转录组调控肝星状细胞铁死亡来改善肝纤维化的分子机制 | 小鼠肝纤维化模型和人类肝星状细胞 | 机器学习 | 肝纤维化 | 单细胞测序, 空间转录组测序, 转录组测序, 免疫沉淀, 激光共聚焦 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝纤维化模型和人类肝纤维化组织标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组测序 |
| 49 | 2026-06-08 |
Inhibiting Endoplasmic Reticulum/Plasma Membrane contact ameliorates endometrial fibrosis by preventing senescence in endometrial epithelial cells
2026-Apr, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 首次对小鼠宫腔粘连模型进行单细胞RNA测序,发现内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老,促进内膜纤维化 | 首次将单细胞RNA测序应用于小鼠宫腔粘连模型,揭示了内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1钙通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老的新机制 | 目前发病机制尚未完全阐明,缺乏有效疗法且复发率高 | 阐明宫腔粘连的发病机制并探索新治疗策略 | 小鼠宫腔粘连模型的子宫内膜上皮细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠宫腔粘连模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 或其他兼容试剂盒 |
| 50 | 2026-06-08 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Apr, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 整合多组学数据揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化及遗传支持候选基因 | 首次结合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和孟德尔随机化研究,多组学整合揭示CTEPH的免疫细胞组成变化、表观遗传调控异常及遗传支持的候选基因 | 未提及样本量及外部验证队列,部分发现需进一步功能验证 | 探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物和致病机制 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 机器学习和计算生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、遗传变异数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-06-08 |
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD25178
PMID:41630526
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研究论文 | 通过基因敲除小鼠模型研究了FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的作用 | 首次系统评估了睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在哺乳动物中的保守性及其对雄性生育功能的影响 | 仅在特定实验条件下评估了基因功能,未考虑其他生理过程或疾病状态下的潜在作用 | 探究睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的功能及潜在冗余机制 | FAM216A和CCDC166基因敲除小鼠模型 | 机器学习 | NA | 基因敲除、单细胞转录组测序、RT-PCR、组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 基因敲除小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-06-08 |
Comparison with Ezh2 reveals the PRC2-dependent functions of Jarid2 in hematopoietic stem Cell lineage commitment
2026-Mar-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102793
PMID:41650958
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研究论文 | 通过比较Jarid2和Ezh2的缺失效应,揭示Jarid2在造血干细胞谱系特化中的PRC2依赖功能 | 首次通过比较Jarid2与Ezh2遗传缺陷小鼠的干/祖细胞,系统解析Jarid2在造血中的PRC2依赖与非依赖功能,结合单细胞转录组学揭示其限制髓系分化潜力的核心PRC2依赖作用 | 未明确说明非PRC2依赖功能的具体机制,且研究仅限于小鼠模型,人类造血系统的适用性尚需验证 | 阐明Jarid2在造血干细胞谱系特化中PRC2依赖与非依赖功能的区分 | 小鼠多能祖细胞和造血干/祖细胞 | 机器学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | Jarid2和Ezh2基因缺陷小鼠的骨髓细胞,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-06-08 |
In situ spatial transcriptomics reveals novel markers of the limbal stem cell niche and ocular surface epithelia
2026-Mar-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102792
PMID:41650959
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研究论文 | 利用原位空间转录组学揭示角膜缘干细胞龛及眼表上皮的新标志物 | 首次通过组织原位空间转录组学技术,在保持细胞空间位置的情况下识别出Krt16和Nkiras1分别为角膜缘干细胞和中性粒细胞的新型标志物,克服了单细胞RNA测序丢失空间信息的局限性 | 未明确说明 | 利用空间转录组学技术鉴定角膜缘干细胞龛和眼表上皮的新型分子标志物,以改善角膜缘干细胞缺乏症的治疗 | 哺乳动物角膜缘干细胞龛和眼表上皮组织 | 空间转录组学 | 角膜缘干细胞缺乏症 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 组织原位空间转录组学技术 |
| 54 | 2026-06-08 |
Identification of a potential relationship between pigmented villonodular synovitis and atherosclerosis using comprehensive bioinformatics analyses
2026-Mar, Biomarkers : biochemical indicators of exposure, response, and susceptibility to chemicals
IF:2.0Q4
DOI:10.1080/1354750X.2026.2625237
PMID:41630435
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研究论文 | 通过综合生物信息学分析,探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎与动脉粥样硬化之间的潜在关系 | 首次利用生物信息学方法结合公共数据库,系统性地揭示了PVNS与AS之间的共享基因和免疫机制,并识别出CSF2RB作为关键诊断和治疗靶点 | 研究基于公共数据集,样本量有限,且缺乏独立的队列验证;机制分析依赖于生物信息学预测,需进一步实验验证 | 探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎的发病机制及其与动脉粥样硬化的潜在关联 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化患者 | 生物信息学 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化 | 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据(微阵列和scRNA-seq) | 基于多个公共数据集(GSE3698、GSE28829、GSE100927、GSE155527),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-06-08 |
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101276
PMID:41633116
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,发现肿瘤相关巨噬细胞来源的SPP1通过抑制CD8+ T细胞分化促进结直肠癌进展 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出高表达SPP1的TAM亚群,并揭示其通过CD44介导的信号抑制CD8+ T细胞分化为Tc1细胞的新机制 | 未说明,从摘要推断为NA | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫调节中的具体作用 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞、MC38细胞系和小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(MC38细胞和氯膦酸脂质体处理的巨噬细胞耗竭模型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 56 | 2026-06-08 |
WDR72 Is Required for Urinary Acidification and Normal H+-ATPase Activity in Intercalated Cells in Mice
2026-Mar, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70165
PMID:41636123
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研究论文 | 本研究探讨WDR72在肾脏酸化过程中的作用及其对H+-ATP酶活性的调控机制 | 首次发现WDR72是A型插入细胞依赖性尿液酸化的关键调控因子,并揭示了性别特异性代谢表型的新机制 | 未阐明WDR72调控H+-ATP酶活性的具体分子机制,且仅在小鼠模型中验证 | 研究WDR72在肾脏酸碱平衡中的作用及其表达定位 | 人类和小鼠肾脏组织、Wdr72基因敲除小鼠 | 机器学习 | 远端肾小管酸中毒 | 单细胞转录组测序、免疫组化、微灌注 | NA | 基因表达数据、蛋白定位数据 | 人肾组织样本(数量未说明)、小鼠(雌雄各若干) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据分析人类和鼠类肾脏细胞的WDR72表达 |
| 57 | 2026-06-08 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Feb-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
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综述 | 综述空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展,包括空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学,揭示其揭示疾病机制和指导治疗策略的潜力 | 系统整合空间组学(代谢、转录、蛋白质)在肺纤维化中的最新进展,强调其在保留组织架构下实现高通量可视化分析,为精准诊断和药物开发提供新框架 | 未具体说明空间组学技术的可及性、成本及标准化挑战,以及从研究到临床转化的潜在障碍 | 总结空间组学技术在肺纤维化发病机制、精准诊断和靶向治疗中的应用进展,推动更有效的临床策略 | 肺纤维化疾病模型和特发性肺纤维化(IPF)患者组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化, 特发性肺纤维化 | 空间组学, 空间代谢组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 组织图像, 转录数据, 蛋白质数据, 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-06-08 |
Attention-guided enhanced deconvolution enables reference-free cell type estimation in spatial transcriptomics
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39703-0
PMID:41667720
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研究论文 | 提出一种无需单细胞参考数据的空间转录组解码方法AGED,结合概率建模与注意力机制实现细胞类型自动估计 | 首次将线性复杂度注意力机制(Performer)与多重注意力引导相结合,实现空间转录组数据中细胞类型数量的自动选择和特征优化 | 未在更大规模或更复杂组织的空间转录组数据上进行充分验证,可能受限于组织类型和平台差异 | 开发无需单细胞参考图谱的空间转录组细胞类型解卷积方法 | 小鼠嗅球、人胰腺导管腺癌、人胸腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组测序 | Performer注意力网络、交叉注意力、空间注意力、协同注意力 | 空间转录组表达数据 | 三种组织样本(小鼠嗅球、人胰腺导管腺癌、人胸腺) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-06-08 |
Aerobic exercise facilitates p300 nuclear translocation via ADRB2-AMPKα signaling, leading to enhanced histone acetylation and mitigation of cognitive decline in APP/PS1 mice
2026-Feb-10, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-01983-z
PMID:41668187
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研究论文 | 探究有氧运动通过ADRB2-AMPKα信号通路促进p300核转位,增强组蛋白乙酰化,减轻APP/PS1小鼠认知衰退的机制 | 首次揭示有氧运动通过ADRB2-AMPKα-p300轴调控染色质重塑,对抗阿尔茨海默病突触退化和认知衰退的分子机制 | 基于APP/PS1小鼠模型,结果需在人类中验证;AMPKα抑制实验仅在小鼠中进行;样本量和运动方案的具体影响需进一步研究 | 阐明体育锻炼诱导的神经保护与表观遗传重塑之间的分子机制 | NHANES 2013-2014队列的1511名参与者、APP/PS1转基因小鼠 | 分子生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1511名人类参与者;APP/PS1小鼠接受8周跑步机运动 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-06-08 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
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研究论文 | 结合功能ADCC检测和单细胞转录组学,揭示干扰素刺激和NKG2D表达在增强自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性抗病毒反应中的关键作用 | 首次发现不同ADCC反应水平的COVID-19参与者中NK细胞具有不同的转录程序,低ADCC反应者NK细胞上调增殖通路,高ADCC反应者增强干扰素刺激基因和NKG2D表达,并揭示干扰素介导的NK细胞激活与抗体介导ADCC能力之间的调节性检查点机制 | 研究未明确阐述局限性 | 探究自然杀伤细胞内在因素和抗体在抗体依赖性细胞毒性反应中的相对贡献 | COVID-19参与者的外周血自然杀伤细胞 | 自然语言处理 | 病毒感染 | 单细胞转录组学,功能ADCC检测 | NA | 单细胞转录组数据,功能检测数据 | COVID-19参与者外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |