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当前共找到 32684 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-11-18 |
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.06.018
PMID:40617259
|
研究论文 | 本研究通过克隆追踪和单细胞空间转录组学揭示了小鼠肝脏发育过程中肝细胞时空动态变化及其对体内基因工程的影响 | 发现新生儿肝脏中15-20%的克隆性肝细胞产生90%以上成年组织，并识别出支持克隆性肝细胞和造血祖细胞增殖的组织微环境 | 研究仅限于小鼠模型，人类肝脏可能存在差异 | 探索肝细胞异质性在肝脏生长过程中的演变及其对体内基因工程的影响 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 克隆追踪, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-18 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Dec, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中通过血脑屏障功能障碍和神经炎症的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用，并揭示其通过影响小胶质细胞、血脑屏障功能和IL-1β表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因，为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 基因表达数据、慢性不可预见应激小鼠模型的前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据 | 慢性不可预见应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-18 |
Multi-tissue spatial transcriptomics identified simultaneous responses to oxidative stress and apoptosis in parallel with tissue-specific reprogramming in modeled chronic kidney disease-mineral and bone disorder
2025-Dec, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf161
PMID:41216610
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研究论文 | 本研究通过多组织空间转录组学方法，揭示了慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱模型中氧化应激和凋亡的同步响应以及组织特异性重编程 | 首次采用多组织空间转录组学方法同时分析皮质骨、肌肉和骨髓中的基因组重编程，识别了组织特异性和共同性转录变化 | 研究仅使用雄性小鼠模型，样本量有限，且仅采用一种疾病诱导方法 | 识别和区分慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱中组织特异性和共同性基因组重编程 | 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱雄性小鼠的股骨-肌肉组织 | 空间转录组学 | 慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱 | 空间转录组学，qPCR | 均匀流形逼近与投影 | 空间转录组数据，基因表达数据 | 腺嘌呤饮食诱导CKD-MBD小鼠和酪蛋白对照饮食小鼠的股骨-肌肉组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术 |
| 5 | 2025-11-18 |
Claudin-1 is a mediator and therapeutic target in primary sclerosing cholangitis
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.005
PMID:40846184
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研究论文 | 本研究揭示Claudin-1在原发性硬化性胆管炎发病机制中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统证实CLDN1在PSC中的病理作用，并开发特异性单克隆抗体作为新型治疗策略 | 主要依赖临床前模型验证，需要进一步临床试验确认疗效 | 探究CLDN1在PSC发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的可行性 | PSC患者队列、小鼠模型和患者来源的细胞模型 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 五个PSC患者队列的肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-11-18 |
ZEB1 promotes chemoimmunotherapy resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
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研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫治疗耐药的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16和SPP1表达，同时影响肿瘤焦亡和CD8+T细胞耗竭的双重耐药机制 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索胰腺癌化疗免疫治疗耐药的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌模型（包括患者来源类器官、异种移植和原位模型） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 患者来源的胰腺癌模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-18 |
Biological and Therapeutic Potentials of MXenes in Tumor Microenvironment-Driven Oncology
2025-Nov-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00982
PMID:41200882
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综述 | 探讨MXenes二维纳米材料在肿瘤微环境驱动肿瘤学中的生物学和治疗潜力 | 首次系统阐述MXenes在直接肿瘤消融和肿瘤免疫微环境调控中的双重作用机制 | NA | 探索MXenes在精准肿瘤学中的治疗应用潜力 | MXenes二维纳米材料及其在肿瘤治疗中的应用 | 纳米医学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 高维免疫分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-18 |
Clonal expansion of alveolar fibroblast progeny drives pulmonary fibrosis in mouse models
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191826
PMID:40875468
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术揭示了肺泡成纤维细胞克隆性扩增在肺纤维化中的关键驱动作用 | 首次系统证明成纤维细胞增殖是肺纤维化的关键驱动因素，并发现成纤维细胞先分化为纤维化表型再进行克隆扩增的新机制 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究成纤维细胞增殖在肺纤维化发病机制中的功能重要性 | 小鼠肺成纤维细胞和人类纤维化肺组织 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | EdU标记, 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | 2种独立的小鼠肺纤维化模型和人类纤维化肺组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-11-18 |
Spatial Transcriptomic Characteristics of the Aging Human Ovary
2025-Nov-17, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70288
PMID:41243550
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术，构建了人类卵巢衰老的综合图谱 | 发现了一种新型内皮细胞亚型CLDN5血液EDCs，揭示了其在衰老过程中作为半专业抗原呈递细胞的独特功能特化 | 样本量相对有限（共12个样本），特别是青春期前样本仅1例 | 阐明人类卵巢衰老的时空动态变化机制 | 12个不同年龄段的人类卵巢组织（12-54岁） | 空间转录组学 | 卵巢衰老及相关生殖障碍 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 12个人类卵巢组织样本（青春期前1例，年轻4例，中年2例，老年5例） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-18 |
CELLama: Foundation Model for Single Cell and Spatial Transcriptomics by Cell Embedding Leveraging Language Model Abilities
2025-Nov-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513210
PMID:41243712
|
研究论文 | 开发了一个名为CELLama的基础模型，利用语言模型能力将单细胞和空间转录组数据转换为句子表示，实现通用细胞嵌入 | 首次将语言模型应用于单细胞和空间转录组数据分析，通过将细胞数据转化为句子形式实现通用细胞嵌入 | NA | 解决单细胞RNA测序和空间转录组数据分析中的复杂性挑战，包括细胞分型、数据整合和空间关系理解 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 自然语言处理,数字病理 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | 语言模型 | 基因表达数据,元数据 | 大规模细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-18 |
Mechanistic Insights Into Recurrent Implantation Failure: The Lactate-H3K18la-SLC7A11 Axis Explored via Endometrial Organoid and Blastoid-Endometrial Cell Implantation Models
2025-Nov-16, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70147
PMID:41242872
|
研究论文 | 本研究通过子宫内膜类器官和胚泡-子宫内膜细胞植入模型，揭示了乳酸-H3K18la-SLC7A11轴在调控子宫内膜容受性中的新机制 | 首次发现乳酸通过H3K18la表观遗传修饰调控SLC7A11表达，进而促进上皮-间质转化和胚胎植入的新机制 | NA | 探索复发性植入失败的分子机制 | 人类子宫内膜类器官和胚泡-子宫内膜细胞植入模型 | 生殖医学 | 复发性植入失败 | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | 蛋白质组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-11-18 |
Deciphering the nexus of aging and pan-cancer: Single-cell sequencing reveals microenvironmental remodeling and cellular drivers
2025-Nov-15, Bioscience trends
IF:5.7Q1
DOI:10.5582/bst.2025.01307
PMID:41139485
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综述 | 通过单细胞测序技术解析衰老与泛癌发展的关联机制及肿瘤微环境重塑 | 整合单细胞测序数据揭示衰老细胞通过分泌SASP因子重塑肿瘤微环境的具体机制 | 单细胞测序数据存在批次效应，衰老细胞丰度低（<5%）影响分析灵敏度 | 探讨衰老作为泛癌发展风险因素的生物学机制 | 衰老细胞亚群（如CDKN2A/LMNB1细胞）及肿瘤微环境组成细胞 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学整合分析 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 基于TCGA和GEO等公共数据库的泛癌分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-18 |
Bisphenol S disrupts human sertoli cell function through NR1H3 degradation: Mechanistic insights from integrated bulk and single-cell transcriptomics
2025-Nov-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119418
PMID:41241997
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组学揭示了双酚S通过降解NR1H3破坏人类支持细胞功能的分子机制 | 首次证明BPS通过靶向NR1H3损害人类支持细胞功能，揭示了NR1H3在支持细胞存活中的关键作用 | 使用永生化人类支持细胞系，可能与原代细胞存在差异；研究集中于NR1H3通路，可能存在其他作用机制 | 探究双酚S对人类支持细胞功能的分子作用机制及其与男性不育的关联 | 永生化人类支持细胞和非梗阻性无精子症睾丸组织 | 单细胞转录组学 | 男性不育 | bulk RNA测序, 单细胞转录组测序, 分子对接, 分子动力学模拟, MM/GBSA结合自由能计算, 荧光素酶报告基因分析, Western blot | NA | 转录组数据, 分子对接数据, 蛋白质表达数据 | 永生化人类支持细胞系和非梗阻性无精子症睾丸单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-18 |
Metastasis-Initiating Osteosarcoma Subpopulations Establish Paracrine Interactions with Lung and Tumor Cells to Create a Metastatic Niche
2025-Nov-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3360
PMID:40882022
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研究论文 | 本研究揭示了骨肉瘤中具有转移启动能力的亚群通过IL1信号通路与肺上皮细胞建立旁分泌相互作用促进转移灶形成的机制 | 首次发现低增殖骨肉瘤亚群能持续产生IL6和CXCL8等转移促进因子，并阐明其对肺上皮细胞来源IL1α的响应机制 | 研究主要基于实验模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索骨肉瘤肺转移的细胞分子机制并开发靶向治疗策略 | 骨肉瘤细胞、肺上皮细胞、人源异种移植模型和免疫健全小鼠模型 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、体外器官型转移模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-18 |
PIEZO1 gain-of-function mutation drives cardiomyopathy by disrupting myocardial lipid homeostasis besides iron overload
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady9242
PMID:41237237
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研究论文 | 本研究揭示了PIEZO1功能获得性突变通过破坏心肌脂质代谢导致心肌病的机制 | 首次发现PIEZO1功能获得性突变除铁超载外，还通过钙信号-CaMKII-FOXO3轴破坏脂质代谢导致心肌病 | 研究样本量有限，仅基于一名患者和动物模型数据 | 探究PIEZO1突变与心肌病发展的关系及其分子机制 | 31岁男性先证者、PIEZO1 D674Y突变小鼠模型、心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1名患者和转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-11-18 |
Integrating machine learning and experimental validation identifies a post-translational modification gene signature for prognosis and treatment response in breast cancer
2025-Nov-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23772-8
PMID:41238648
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习与实验验证，开发了乳腺癌预后和治疗响应的翻译后修饰基因特征 | 首次系统整合多种翻译后修饰(PTM)信息，从117个机器学习模型中筛选最优组合构建PTM相关基因特征(PTMRS)，并在单细胞和空间转录组水平验证基因表达模式 | 研究样本量未明确说明，验证主要依赖公共数据集和有限实验验证 | 阐明多种翻译后修饰与乳腺癌预后的关联，开发预后预测模型 | 乳腺癌患者和肿瘤组织 | 机器学习 | 乳腺癌 | GSVA、PCR、单细胞RNA-seq、空间转录组 | 机器学习集成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-18 |
Exploring mitochondrial ribosomal protein S12 as a novel target for non-small cell lung cancer
2025-Nov-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01128-9
PMID:41238733
|
研究论文 | 本研究探讨线粒体核糖体蛋白S12(MRPS12)在非小细胞肺癌发病机制中的表达和功能意义 | 首次将MRPS12确定为非小细胞肺癌的新型治疗靶点，并系统验证其通过调控线粒体功能促进肿瘤恶性进展的机制 | 未涉及MRPS12靶向治疗的临床转化研究，缺乏在更广泛肺癌亚型中的验证 | 探索MRPS12作为非小细胞肺癌新型治疗靶点的潜力 | 非小细胞肺癌细胞系、患者组织样本和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, shRNA基因沉默, CRISPR-Cas9基因敲除, 线粒体功能分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 功能实验数据 | 癌症基因组图谱数据集, 多种NSCLC细胞类型, 裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-11-18 |
STPath: a generative foundation model for integrating spatial transcriptomics and whole-slide images
2025-Nov-14, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02020-3
PMID:41238784
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研究论文 | 提出STPath生成式基础模型，通过整合空间转录组学和全切片图像来预测基因表达 | 首次开发能够直接预测38,984个基因在17个器官中表达的基础模型，无需下游微调 | NA | 开发可扩展的空间转录组学病理应用 | 空间转录组数据和全切片图像 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学，全切片图像分析 | 几何感知Transformer | 图像，基因表达数据 | 23个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-18 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA sequencing uncover tumor microenvironment diversity in invasive Retinoblastoma
2025-Nov-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23779-1
PMID:41238845
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析揭示了侵袭性视网膜母细胞瘤肿瘤微环境的异质性特征 | 首次在视网膜母细胞瘤中发现锥体前体细胞亚群的功能多样性，并鉴定出DOK7作为侵袭关键基因 | 样本量较小（仅10例患者），且使用公开数据可能限制实验设计的灵活性 | 探索视网膜母细胞瘤肿瘤微环境异质性及其与肿瘤侵袭的关系 | 10例视网膜母细胞瘤患者的原发肿瘤组织 | 单细胞测序分析 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 10例视网膜母细胞瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-18 |
Exploration of the roles of CAFs in melanoma based on single-cell transcriptomics and spatial transcriptomics
2025-Nov-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03868-3
PMID:41238964
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研究论文 | 基于单细胞转录组学和空间转录组学探索癌症相关成纤维细胞在黑色素瘤中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq数据系统解析黑色素瘤中CAF的分子程序，并构建CAF中心的免疫排斥网络 | NA | 探索癌症相关成纤维细胞在黑色素瘤中的功能异质性和空间生态作用 | 黑色素瘤中的癌症相关成纤维细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA-seq,WGCNA,CellChat分析 | 风险评分模型 | 转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |