单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-11-18 |
Single-cell RNAseq analysis of spinal locomotor circuitry in larval zebrafish
2023-11-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89338
PMID:37975797
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析斑马鱼幼体脊髓运动神经元的分子特征及其在游泳行为中的功能差异 | 首次在斑马鱼脊髓运动神经元中发现特定电压依赖性离子通道和突触蛋白组合形成的功能'盒'，并揭示其与高速游泳行为的关系 | 研究主要聚焦于斑马鱼模型，结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 探究脊髓运动神经元在游泳行为中的功能差异的分子基础 | 斑马鱼幼体脊髓神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼幼体脊髓神经元单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-11-18 |
A single-cell atlas depicting the cellular and molecular features in human anterior cruciate ligamental degeneration: A single cell combined spatial transcriptomics study
2023-11-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85700
PMID:37970848
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学构建了人类前交叉韧带退变的细胞图谱 | 首次在单细胞和空间水平揭示了韧带退变过程中新的成纤维细胞亚群及其动态轨迹 | 样本量相对有限，需要进一步验证关键发现 | 系统识别人类韧带细胞类型，研究韧带退变过程中的细胞身份、功能和相互作用 | 人类前交叉韧带健康与退变组织 | 空间转录组学 | 韧带退行性疾病 | 单细胞RNA测序,空间RNA测序,免疫组织化学染色,免疫荧光染色 | 计算分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 约49,356个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 203 | 2025-11-18 |
Ruxolitinib improves hematopoietic regeneration by restoring mesenchymal stromal cell function in acute graft-versus-host disease
2023-08-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162201
PMID:37338986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现芦可替尼可通过JAK2/STAT1通路直接修复骨髓间充质基质细胞功能，从而改善急性移植物抗宿主病相关的造血功能障碍 | 首次揭示急性移植物抗宿主病中骨髓微环境损伤的具体机制，并发现芦可替尼对骨髓间充质基质细胞的直接保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，虽在患者样本中得到验证但样本量有限 | 探究急性移植物抗宿主病中骨髓微环境损伤机制及芦可替尼的治疗作用 | 小鼠模型和患者样本中的骨髓非造血细胞，特别是骨髓间充质基质细胞 | 单细胞测序分析 | 急性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单倍体MHC匹配移植急性移植物抗宿主病小鼠模型及患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-11-18 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-06-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80075
PMID:37284748
|
研究论文 | 开发结合谱系追踪和单细胞RNA测序的系统，揭示人iPSC分化过程中第一心区祖细胞占主导地位 | 首次建立TBX5/MYL2谱系追踪报告系统，结合单细胞RNA测序全面分析hiPSC心脏分化过程 | 研究基于体外iPSC分化模型，不能完全模拟体内胚胎发育环境 | 研究人诱导多能干细胞向心脏细胞分化的发育轨迹和细胞谱系 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的心脏祖细胞和心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2个独立iPSC细胞系，12个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于寡核苷酸样本多重分析的scRNA-seq技术 |
| 205 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals T cell heterogeneity and metabolic reprogramming in human immune-mediated glomerulonephritis
2025-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2582720
PMID:41241792
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类免疫介导性肾小球肾炎中T细胞的异质性和代谢重编程 | 首次构建人类免疫介导性肾小球肾炎T细胞的单细胞图谱，揭示疾病特异性T细胞状态、代谢特征和激活机制 | 研究局限于三种主要IMGN类型，样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 阐明T细胞在人类免疫介导性肾小球肾炎发病机制中的特征和功能作用 | 免疫介导性肾小球肾炎患者的肾脏T细胞 | 单细胞组学 | 肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序 | 基因共表达网络，细胞分化轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 三种主要IMGN类型（IgA肾病、狼疮性肾炎、膜性肾病）的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-11-17 |
Digital pathology and spatial omics in steatohepatitis: Clinical applications and discovery potentials
2025-Dec-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000866
PMID:38517078
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综述 | 本文综述了数字病理学和空间组学在脂肪性肝炎中的临床应用与发现潜力 | 整合数字病理学与空间生物学，通过机器学习算法增强组织学解读准确性，并探讨多模态整合的潜力 | 讨论了现有工具的局限性、知识缺口和技术前提条件 | 改善脂肪性肝炎的组织学解读准确性并探索疾病异质性 | 脂肪性肝炎患者的肝脏组织切片 | 数字病理学 | 脂肪性肝炎 | 线性与非线性显微镜、空间转录组学、空间蛋白质组学 | 机器学习算法 | 全切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 207 | 2025-11-17 |
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156280
PMID:41177096
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综述 | 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 | 系统梳理了NGS技术在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗等领域的广泛应用，并展望了多组学数据整合和单细胞测序的发展前景 | 作为综述文章，未涉及具体实验设计和数据验证 | 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 | 新一代测序技术及其产生的基因组数据 | 基因组学 | 癌症,罕见病 | 新一代测序(NGS) | NA | DNA序列数据,RNA序列数据 | NA | NA | 新一代测序,单细胞测序 | NA | NA |
| 208 | 2025-11-17 |
EMC8 expression in head and neck squamous cell carcinoma: Implications for poor prognosis and deficient CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156255
PMID:41072210
|
研究论文 | 本研究探讨EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与预后和CD8+ T细胞浸润的关系 | 首次揭示EMC8在HNSCC中高表达与不良预后和CD8+ T细胞浸润减少的关联 | EMC8促进免疫逃避和恶性肿瘤的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的临床意义和免疫功能 | 头颈部鳞状细胞癌组织和患者临床样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 临床生存数据, 单细胞测序数据 | HNSCC患者组织样本和临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2025-11-17 |
A newly developed Germlings Harvester (GEHA) in combination with metabarcoding analysis detected numerous plankton species, particularly HABs-causing species, from in-situ germination of resting stage cells
2025-Dec, Harmful algae
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.hal.2025.103002
PMID:41241549
|
研究论文 | 开发了新型Germlings Harvester (GEHA)设备并结合宏条形码技术，首次实现海洋沉积物中浮游生物休眠阶段细胞的原位萌发检测 | 首次开发GEHA设备实现原位检测浮游生物休眠细胞萌发，结合宏条形码技术发现128种新型休眠阶段细胞生产者，首次观测到9种有害藻华物种的原位萌发 | 未提及方法检测限和定量准确性，尚未进行大规模推广应用验证 | 研究浮游生物休眠阶段细胞萌发对群落组成和有害藻华形成的影响 | 海洋沉积物中的浮游生物休眠阶段细胞（包括甲藻孢囊、硅藻孢子等） | 环境微生物学 | NA | 宏条形码分析、单细胞测序、克隆培养 | NA | 基因序列数据、物种鉴定数据 | 从青岛湾沉积物中鉴定出220种浮游生物物种 | NA | 宏条形码测序、单细胞测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-11-17 |
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2025-Nov-15, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00364-0
PMID:41241671
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研究论文 | 本研究通过时空转录组学分析揭示了铁死亡在缺血再灌注急性肾损伤中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 整合单细胞和空间转录组学技术，首次系统揭示TFRC等铁死亡相关基因在肾小管细胞中的空间表达模式及其与巨噬浸润的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究铁死亡相关基因在急性肾损伤中的表达特征、空间分布及免疫相互作用，寻找潜在治疗靶点 | 小鼠缺血再灌注急性肾损伤模型、肾小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,共培养实验 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 211 | 2025-11-17 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现病毒反弹前CD16++单核细胞增加并表达抗病毒基因 | 首次在可检测的病毒反弹前观察到独特的转录特征，特别是具有抗病毒基因表达的CD16++单核细胞显著增加 | 研究样本量有限，仅关注外周血单核细胞，未涉及其他组织储库 | 表征HIV-1治疗停止后病毒反弹引发的免疫反应特征 | 人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）感染者的外周血单核细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 212 | 2025-11-17 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了胰腺中细胞群落的空间组织模式及其在功能组织架构形成中的作用 | 首次系统性地绘制了胰腺从胚胎发育到成年稳态的空间细胞图谱，发现了上皮-间质单元作为基本组织微环境，并揭示了间质谱系在发育过程中的多样化与成年后的简化过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析胰腺组织中细胞空间组织和相互作用的机制 | 小鼠和人类胰腺组织，从胚胎发育到成年阶段的细胞 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠胚胎发育到成年多个时间点的胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 213 | 2025-11-17 |
A single-cell multi-omics framework identifies immune cell drivers of migraine and repurposable therapeutics
2025-Nov-13, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02179-w
PMID:41233745
|
研究论文 | 本研究通过建立单细胞多组学分析框架，识别偏头痛的免疫细胞驱动因素和可重新利用的治疗药物 | 首次整合单细胞表达数量性状位点数据和单细胞孟德尔随机化分析，系统探索偏头痛的免疫介导调控机制 | 未在文中明确说明研究的具体局限性 | 探索偏头痛的免疫遗传学基础并识别潜在治疗靶点 | 14种免疫细胞类型和9,117个独特的sc-eQTL | 生物信息学 | 偏头痛 | 单细胞表达数量性状位点分析, 单细胞孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 全表型组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据, 表型数据 | 涉及9,117个sc-eQTL和14种免疫细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-11-17 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02130-6
PMID:41233852
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序分析，揭示机械刺激相关基因在乳腺癌中的特征并建立预后预测模型 | 首次建立基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型，并在单细胞分辨率上验证机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在乳腺肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, SCISSOR算法, 体外和体内实验 | 预后评分模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库乳腺癌样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-11-17 |
Technology-Enabled Integration of Single-Cell Transcriptomics and Microbiome Data Identifies RNA-Targetable Host-Microbiota Networks in Colorectal Adenoma
2025-Nov-13, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100365
PMID:41241214
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研究论文 | 本研究开发了一个可重复的计算流程，整合单细胞转录组和微生物组数据，识别结直肠腺瘤中RNA可靶向的宿主-微生物网络 | 首次将单细胞技术与微生物组分析相结合，系统识别宿主-微生物相互作用网络，并将其转化为RNA治疗靶点 | 研究依赖于现有数据库，样本来源有限，需要进一步实验验证 | 开发可重复的计算流程，识别结直肠腺瘤中RNA可靶向的宿主-微生物网络 | 结直肠腺瘤患者样本 | 生物信息学 | 结直肠腺瘤 | 单细胞RNA测序，微生物组分析 | MaAsLin2，QIIME2/DADA2，Seurat/Harmony | 单细胞RNA测序数据，微生物组数据 | 426,425个细胞（来自3个数据集），975个微生物组样本 | NA | 单细胞RNA-seq，微生物组测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice
2025-Nov-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01499-3
PMID:41225641
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中具有白血病前特征的髓系偏态造血干细胞祖细胞亚群的扩增机制 | 首次在骨质疏松模型中系统鉴定并表征了具有白血病前特征的髓系偏态HSPC亚群，并发现BRD4染色质重塑蛋白在此过程中的关键调控作用 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证；BRD4抑制剂仅部分恢复表型，可能存在其他调控机制 | 探究骨质疏松条件下髓系偏态造血的发生机制及其与白血病发生的关系 | 废用性骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2025-11-17 |
Microglial HMOX1 drives retinal angiogenesis via modulation of endothelial STAT3 signaling
2025-Nov-11, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞HMOX1通过调控内皮STAT3信号通路驱动视网膜血管生成的新机制 | 首次发现小胶质细胞HMOX1在缺氧条件下通过旁分泌信号激活内皮STAT3-VEGF轴驱动病理性血管生成 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究小胶质细胞HMOX1在视网膜血管生成中的作用机制 | 早产儿视网膜病变小鼠模型、小胶质细胞和内皮细胞 | 分子生物学 | 早产儿视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞共培养实验 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-11-17 |
Integrating computational pathology and multi-transcriptomics to characterize glioblastoma heterogeneity and identify prognostic biomarkers
2025-Nov-11, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2025.105982
PMID:41232838
|
研究论文 | 本研究整合计算病理学和多转录组学数据，表征胶质母细胞瘤异质性并识别预后生物标志物 | 首次将全切片图像病理特征与批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据相结合，识别BCL2A1+单核细胞作为血管生成和疾病进展的关键驱动因素 | 样本量有限，验证集C指数相对较低(0.616)，需要更大规模验证 | 开发胶质母细胞瘤预后模型并识别关键生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者样本 | 计算病理学 | 胶质母细胞瘤 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Lasso + plsRcox机器学习模型 | 图像, 转录组数据 | TCGA-GBM数据集，60%训练集和40%验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 219 | 2025-11-17 |
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Nov-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.09.011
PMID:41151577
|
研究论文 | 开发了一种人类心脏-巨噬细胞组装体模型，用于模拟免疫-心脏相互作用并研究心律失常疾病 | 首次通过将自体人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞整合到心脏类器官中，生成生理相关的心脏组织驻留巨噬细胞 | NA | 研究免疫-心脏相互作用机制并建立心律失常疾病模型 | 人类心脏-巨噬细胞组装体模型 | 疾病建模 | 心律失常 | 单细胞转录组学、实时成像、蛋白质组学 | 组装体模型 | 转录组数据、图像数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-11-17 |
Inhibition of microglial Slc2a5 attenuates ischemic brain injury
2025-Nov-06, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156429
PMID:41205649
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞Slc2a5介导的果糖代谢通路在急性缺血性脑卒中中的关键作用 | 首次发现小胶质细胞Slc2a5通过调控果糖代谢影响脑卒中进展，并阐明PKM2在此过程中的介导作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究小胶质细胞果糖代谢在急性缺血性脑卒中中的作用机制 | 小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 急性缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序，体外实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |