单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-05-16 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2025-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序数据分析了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其对疾病进展的影响 | 揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的八种亚型，特别是效应记忆T细胞（Tem）和耗竭T细胞（Tex），并发现CXCL13+ Tex细胞与疾病严重程度和预后不良相关 | 研究未涉及这些细胞亚型在肝硬化治疗中的具体应用 | 阐明CD8+ T细胞在肝硬化中的分子机制及其对疾病进展的影响 | 肝硬化患者的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 肝硬化 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | RNA-seq数据、单细胞数据 | 未明确说明样本数量 |
| 222 | 2025-05-16 |
PERK+ Macrophages Drive Immunotherapy Resistance in Lymph Node Metastases of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3135
PMID:40036693
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研究论文 | 本研究评估了口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者淋巴结转移的病理反应率，并发现PERK+巨噬细胞在免疫治疗抵抗中的作用 | 首次系统评估了OSCC患者淋巴结转移的病理反应率，并发现PERK信号通路在巨噬细胞中的激活是免疫治疗抵抗的新机制 | 研究样本来自单一临床试验，且小鼠模型的结果需要进一步临床验证 | 评估OSCC患者淋巴结转移的病理反应率并寻找改善治疗效果的新靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者及其淋巴结转移灶 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 临床数据、转录组数据、免疫组化数据 | 来自NCT04649476临床试验的OSCC患者样本及小鼠模型 |
| 223 | 2025-05-16 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features
2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群，包括间充质细胞和周细胞，并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序，转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据，组织学数据 | 转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞 |
| 224 | 2025-05-16 |
IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening
2025-May-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027171
PMID:39869826
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研究论文 | 通过高通量药物筛选发现T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）对IAP抑制剂的依赖性 | 首次报道T-PLL对自噬靶向药物、核输出抑制剂和IAP抑制剂的敏感性，并揭示IAP抑制剂诱导的细胞死亡主要为坏死性凋亡且依赖TNF-α | 研究样本量较小（30例原代患者样本），且仅限于体外实验 | 发现T-PLL的新治疗靶点 | T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）细胞 | 血液肿瘤学 | T细胞前淋巴细胞白血病 | 高通量药物筛选、RNA测序（bulk和单细胞）、光谱流式细胞术 | NA | 药物敏感性数据、RNA测序数据、流式细胞术数据 | 30例原代T-PLL患者样本 |
| 225 | 2025-05-16 |
Zn-Based Multi-Active Framework Nanoparticles TSA-CAN-Zn Inhibit Skin Glycation via Dual Blockade of HMGB1/RAGE and AGEs/RAGE Pathways
2025-May-15, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500664
PMID:40370206
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研究论文 | 本研究设计了一种基于锌的多活性框架纳米颗粒TSA-CAN-Zn，通过双重阻断HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE通路来抑制皮肤糖基化损伤 | 首次将Theasinensin A (TSA)和L-肌肽(CAN)结合到锌基纳米颗粒中，同时抑制HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE两条通路 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型纳米材料来减轻糖基化引起的皮肤损伤 | 皮肤糖基化损伤机制及治疗 | 纳米医学 | 皮肤疾病 | 分子对接、单细胞RNA测序 | 小鼠皮肤糖基化模型 | 体外实验数据、测序数据 | HaCaT细胞系和小鼠模型 |
| 226 | 2025-05-16 |
Single-Cell Transcriptomics and Lineage Tracing Unveil Parallels in Lymphatic Muscle and Venous Smooth Muscle Development, Identity, and Function
2025-May-15, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322567
PMID:40371470
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学和谱系追踪揭示了淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs）在发育、特性和功能上的相似性 | 首次揭示了LMCs和静脉SMCs在转录组和功能上的高度相似性，并确定了它们共同的WT1+中胚层祖细胞来源 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究淋巴肌肉细胞独特的收缩特性的细胞和分子基础 | 淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs） | 细胞生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、遗传谱系追踪、全组织免疫染色、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据、影像数据 | 小鼠后肢和腹股沟-腋窝区域的LMCs和SMCs |
| 227 | 2025-05-16 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-May-15, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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research paper | 该研究探讨了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的作用及其在淋巴系统疾病中的病理生理学意义 | 揭示了TRPV4表达髓系细胞（包括LYVE1+巨噬细胞）与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间相互作用介导的淋巴收缩失调新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 探究TRPV4通道在淋巴管功能调控中的作用及其与淋巴系统疾病的关联 | 小鼠收集淋巴管及乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织 | 分子生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序、共聚焦显微镜、细胞内钙活性测量 | Trpv4fx/fx转基因小鼠 | 基因表达数据、图像数据、生理功能数据 | 小鼠收集淋巴管样本及乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织 |
| 228 | 2025-05-16 |
SM22α-Lineage Perivascular Stromal Cells Contribute to Abdominal Aortic Aneurysm
2025-May-15, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325750
PMID:40371535
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research paper | 该研究探讨了SM22α谱系血管周围基质细胞在腹主动脉瘤（AAA）中的作用及其机制 | 揭示了SM22α谱系基质细胞中PGC-1α通过调节YAP信号通路影响血管周围脂肪组织（PVAT）的成脂和成肌纤维分化平衡，进而促进动脉瘤发展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究血管周围基质细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用 | 年轻和老年小鼠的血管周围基质细胞，人类动脉瘤样本 | 血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，功能获得和缺失实验，转录组分析 | Ang II诱导和脱氧皮质酮乙酸酯/盐诱导的AAA小鼠模型 | RNA测序数据，影像数据 | 年轻（2-3月龄）和老年（18-20月龄）小鼠，人类动脉瘤样本 |
| 229 | 2025-05-16 |
Evidence of secondary Notch signaling within the rat small intestine
2025-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204277
PMID:40371707
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research paper | 该研究探讨了大鼠小肠中一种罕见的上皮细胞群体CFTR高表达细胞（CHEs）的特定形成机制 | 揭示了CHEs通过Notch信号通路的二次激活从其他分泌细胞中分化出来的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，未在小鼠中发现CHEs，可能限制结果的普遍性 | 理解小肠分泌细胞谱系的多样性形成机制 | 大鼠小肠中的CFTR高表达细胞（CHEs） | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），假时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 230 | 2025-05-16 |
Microglia Single-Cell RNA-Seq Enables Robust and Applicable Markers of Biological Aging
2025-May-15, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70095
PMID:40371813
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术开发了基于小胶质细胞的生物年龄标记物 | 利用单细胞RNA测序数据开发了新的生物年龄计算模型，相比传统批量分析方法能更精确地反映个体生物年龄 | 研究主要基于小鼠和人类的小胶质细胞数据，可能不适用于其他细胞类型 | 开发基于小胶质细胞单细胞转录组数据的生物年龄预测模型 | 人类和小鼠的小胶质细胞 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 无监督频率汇总模型 | 单细胞转录组数据 | 三个不同的单细胞数据集 |
| 231 | 2025-05-16 |
ARHGDIB as a prognostic biomarker and modulator of the immunosuppressive microenvironment in glioma
2025-May-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04063-7
PMID:40372473
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research paper | 研究ARHGDIB作为胶质瘤预后生物标志物及其在免疫抑制微环境中的调控作用 | 首次揭示ARHGDIB在胶质瘤免疫抑制微环境中的关键作用，并证明其可作为新型肿瘤相关巨噬细胞标志物 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 探索ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控机制及其预后价值 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | digital pathology | glioma | qPCR, IHC, 单细胞测序, 免疫荧光 | LASSO-Cox回归 | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 公共数据库数据+自建队列样本 |
| 232 | 2025-05-16 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in aortic tissue from patients with Behçet's syndrome
2025-May-15, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf252
PMID:40372706
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了白塞氏综合征患者主动脉组织中细胞和分子的变化 | 首次在单细胞水平上分析了白塞氏综合征患者主动脉组织的转录组特征，揭示了细胞亚群分布、功能及细胞间通讯的差异 | 样本量较小（仅6例参与者），且仅来自单一医疗中心 | 分析白塞氏综合征患者主动脉组织中不同细胞亚群的表达谱、表型、功能及细胞间通讯 | 白塞氏综合征患者和动脉粥样硬化患者的主动脉组织 | 数字病理学 | 白塞氏综合征 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Harmony, CellChat v1.6.1 | 转录组数据 | 6例参与者（3例白塞氏综合征患者和3例动脉粥样硬化患者） |
| 233 | 2025-05-16 |
Sequence diversity and encoded enzymatic differences of monocistronic L1 ORF2 mRNA variants in the aged normal and Alzheimer's disease brain
2025-May-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2298-24.2025
PMID:40368603
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research paper | 该研究通过酶功能测定、靶向PacBio HiFi长读长测序和定量空间转录组学，评估了31名阿尔茨海默病（AD）和非疾病（ND）大脑（两性）的皮质样本中的内源性逆转录酶（RT）活性和L1 mRNA多样性 | 研究发现大脑中存在大量单顺反子ORF2 mRNA变体，其序列多样性远超人类参考基因组（hg38），并揭示了这些变体在RT和核酸内切酶（EN）活性上的功能差异 | 研究样本量相对较小（31个大脑），且未涵盖其他神经退行性疾病或更广泛的人群 | 探究正常衰老和阿尔茨海默病大脑中内源性逆转录酶活性的来源及其与L1 mRNA变体的关系 | 31名阿尔茨海默病和非疾病人类大脑的皮质样本 | 分子生物学 | 阿尔茨海默病 | 酶功能测定、PacBio HiFi长读长测序、定量空间转录组学 | NA | RNA序列数据、酶活性数据 | 31个大脑样本（包括AD和ND） |
| 234 | 2025-05-16 |
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification
2025-May-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09010-1
PMID:40369074
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research paper | 该研究利用MERFISH技术和深度学习核分割，揭示了人类胎儿大脑皮层的分子、细胞和结构发育，构建了一个包含1800多万个单细胞的空间图谱 | 发现了两种不同的皮层区域特化模式，并挑战了关于中期妊娠皮层区域化仅涉及梯度样转变的观点 | 研究仅涵盖胎儿发育阶段，未涉及成人皮层 | 探索人类大脑皮层的分子特化和发育过程 | 人类胎儿大脑皮层 | digital pathology | NA | MERFISH, 单核RNA测序 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 超过1800万个单细胞，涵盖7个发育时间点的8个皮层区域 |
| 235 | 2025-05-16 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2025-May-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09002-1
PMID:40369080
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research paper | 该研究探讨了人类特异性增强子HARE5如何通过调节神经祖细胞的增殖和神经发生能力，精细调控大脑皮层的发育和连接 | 揭示了人类特异性增强子HARE5通过放大经典WNT信号通路促进祖细胞增殖的新机制，为理解人类大脑皮层扩展和复杂性提供了新视角 | 研究主要依赖基因编辑小鼠和灵长类模型，人类大脑发育的完全模拟仍存在挑战 | 探索人类加速区域(HARs)在物种特异性大脑皮层发育中的功能贡献 | 人类特异性增强子HARE5及其对神经祖细胞和大脑皮层发育的影响 | 神经科学 | NA | 基因编辑、单细胞RNA测序、固定和活体成像、谱系分析 | 基因编辑小鼠(Mus musculus)和灵长类模型(人类和黑猩猩神经祖细胞及皮层类器官) | 基因组数据、RNA测序数据、成像数据 | 基因编辑小鼠模型、人类和黑猩猩(Pan troglodytes)神经祖细胞及皮层类器官 |
| 236 | 2025-05-16 |
Taurine from tumour niche drives glycolysis to promote leukaemogenesis
2025-May-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09018-7
PMID:40369079
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了骨髓基质微环境中的牛磺酸-牛磺酸转运体(TAUT)轴在促进白血病干细胞(LSCs)生长和白血病发生中的关键作用 | 首次系统描绘了白血病进展过程中基质细胞信号的时间动态变化，并鉴定出牛磺酸作为骨髓恶性肿瘤的关键调控因子 | 研究主要聚焦于髓系白血病，对其他类型白血病的适用性尚不明确 | 探究骨髓微环境信号在白血病发生发展中的作用机制 | 白血病干细胞(LSCs)和骨髓基质细胞 | 肿瘤微环境研究 | 急性髓系白血病(AML) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), CRISPR筛选, 多组学分析 | TAUT基因功能缺失小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 患者来源的AML细胞和小鼠模型 |
| 237 | 2025-05-16 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes epithelial-mesenchymal transition in diffuse-type gastric cancer via cAMP response element-binding protein pathway, showing poor prognosis
2025-May-14, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01447-8
PMID:40369121
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研究论文 | 本研究通过构建大规模信号网络和实验验证，揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的fibulin-5通过CREB通路促进弥漫型胃癌的上皮-间质转化，并与患者不良预后相关 | 首次发现CAFs分泌的fibulin-5通过CREB通路促进DGC的EMT过程，并证实其作为预后标志物的潜力 | 研究主要基于体外实验和回顾性数据分析，需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 寻找弥漫型胃癌的特异性生物标志物和治疗靶点 | 弥漫型胃癌(DGC)及其微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 胃癌 | RNA测序、免疫组化染色、单细胞RNA测序、类器官培养、共培养系统 | 数学模型 | 基因组数据、组织微阵列、单细胞数据 | 三个基因组数据库(TCGA、GSE62254和GSE26253)的数据，以及组织微阵列和患者血液样本 |
| 238 | 2025-05-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-May-14, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
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review | 本文综述了空间转录组学中细胞类型解卷积方法的多样性，对比了它们的能力，并总结在一个基于网络的交互式表格中以促进更高效的方法选择 | 提供了一个基于网络的交互式表格，便于研究者选择和对比不同的细胞类型解卷积方法 | NA | 探讨空间转录组学中细胞类型解卷积方法的应用和发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型解卷积方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 239 | 2025-05-16 |
Derlin-3 manipulates the endoplasmic reticulum stress and IgG4 secretion of plasma cells in lung adenocarcinoma
2025-May-14, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03435-8
PMID:40369338
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研究论文 | 本研究探讨了Derlin-3在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其通过内质网应激调控浆细胞IgG4分泌的机制 | 首次揭示了Derlin-3通过Hrd1/p38/PRDM1通路调控浆细胞内质网应激和IgG4分泌的机制，并发现其可作为肺腺癌免疫治疗的新靶点 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明Derlin-3在肺腺癌肿瘤微环境中的生物学机制及其免疫调控功能 | 肺腺癌组织、B淋巴细胞（特别是浆细胞）、巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 基因表达数据、组织样本 | NA（未明确说明样本数量） |
| 240 | 2025-05-16 |
Canonical Wnt Pathway Enhanced Dental Pulp Mesenchymal Stem Cells-Mediated Cementum Regeneration
2025-May-14, Journal of oral rehabilitation
IF:3.1Q1
DOI:10.1111/joor.14001
PMID:40369784
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研究论文 | 本研究探讨了Wnt信号通路在牙骨质、牙髓和牙周韧带中的表达差异，并阐明了Wnt3a在促进牙髓间充质干细胞（DPSCs）牙骨质再生中的作用 | 揭示了DPSCs中非经典Wnt信号通路限制牙骨质再生效率的现象，并发现Wnt3a可通过激活经典Wnt通路提高DPSCs介导的牙骨质再生效果 | 研究未涉及Wnt3a在其他类型干细胞或组织再生中的作用 | 阐明Wnt信号通路在牙骨质再生中的分子机制，提高DPSCs介导的牙骨质再生效率 | 牙髓间充质干细胞（DPSCs） | 组织工程与再生医学 | 牙周疾病 | RNA Smart转录组测序、单细胞RNA测序、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确说明样本数量 |