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当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-23 |
scSurvival: Single-Cell Survival Analysis of Clinical Cancer Cohort Data at Cellular Resolution
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0965
PMID:42013315
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研究论文 | 提出scSurvival框架，通过注意力机制的多实例Cox回归模型，直接从单细胞数据建模生存结局，实现患者和单细胞水平的预测 | 首次提出直接从单细胞数据建模生存结局的策略，利用注意力多实例学习和变分自编码器处理高维度、稀疏性和批次效应 | 方法在模拟和两个癌症队列中验证，但未提及在更大规模、多中心数据上的泛化能力或计算效率评估 | 开发能够利用单细胞测序数据预测癌症患者生存结局的计算框架 | 肿瘤单细胞RNA测序样本（黑色素瘤和肝癌队列） | 机器学习 | 黑色素瘤, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 注意力多实例Cox回归, 变分自编码器 | 单细胞RNA测序表达数据 | 黑色素瘤和肝癌单细胞RNA测序队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-06-23 |
Integrated Single-Cell Whole-Genome Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal Intratumoral Heterogeneity in Ovarian Cancer
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0795
PMID:42007974
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研究论文 | 通过单细胞全基因组测序和空间转录组学揭示卵巢癌的瘤内异质性 | 首次整合单细胞全基因组测序与空间转录组学，在晚期原发性卵巢癌中描绘克隆进化、拷贝数变异及功能后果，并发现克隆持久性与二次突变的功能逆转 | 样本量较小（仅5例），且仅包含晚期初治患者，未涵盖复发或转移样本 | 揭示卵巢癌瘤内异质性的基因组基础及其对疾病进展和治疗的潜在影响 | 5例晚期初治原发性上皮性卵巢癌（包括高级别浆液性和透明细胞亚型） | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据，空间转录组数据 | 5例卵巢癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2026-06-23 |
Revealing the Heterogeneity of Renal Tubular Epithelial Cell Senescence and Its Impact on Renal Fibrosis via Single-Cell Sequencing and Spatial Omics Technologies
2026-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504960R
PMID:41996177
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综述 | 通过单细胞测序和空间组学技术揭示肾小管上皮细胞衰老的异质性及其对肾纤维化的影响 | 利用单细胞测序和空间组学技术分析肾小管上皮细胞衰老的异质性特征、空间分布模式及其与纤维化的因果关系 | 未提及具体局限性 | 系统综述单细胞测序和空间组学技术在揭示肾小管上皮细胞衰老异质性及其对肾纤维化影响中的应用 | 肾小管上皮细胞的衰老亚群及其在肾纤维化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肾脏病、肾纤维化 | 单细胞测序、空间组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2026-06-23 |
The intestinal microbiota impacts nutritional immunity and resistance to Acinetobacter baumannii pneumonia
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2534432123
PMID:42012958
|
research paper | 研究抗生素治疗引起的肠道菌群失调如何增加宿主对鲍曼不动杆菌肺炎的易感性，并揭示相关免疫机制 | 首次通过单细胞RNA测序和动物模型，证明肠道菌群失调通过损害吞噬细胞的营养免疫功能（如脂质运载蛋白-2和钙卫蛋白途径）加剧肺部感染，并指出粪便微生物移植可恢复对感染的抵抗能力 | 研究主要基于小鼠模型和少量临床患者队列，未在更大规模人群中验证；单细胞RNA测序仅分析肺组织，未全面评估其他组织的免疫应答变化 | 阐明抗生素诱导的肠道菌群失调如何影响宿主对鲍曼不动杆菌肺炎的防御机制 | 住院患者队列和小鼠模型 | machine learning | pneumonia | single-cell RNA-seq, 抗生素治疗, 粪便微生物移植 | NA | scRNA-seq data, 临床数据 | 住院患者队列（具体数量未提供）和小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-06-23 |
Hypoxia inducible factor network reflects kidney disease progression in diabetes and sodium-glucose co-transporters inhibition
2026-Apr-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02653-0
PMID:42009641
|
研究论文 | 利用单细胞转录组和空间转录组学分析，构建缺氧诱导因子（HIF）调控网络，揭示其在糖尿病肾病进展中的作用以及SGLT2抑制剂的保护效应 | 构建了启动子锚定的HIF调控网络，包含237个基因和7个相互连接的调控通路，可作为多组分读出来捕捉疾病进展和治疗反应 | 未明确提及 | 研究缺氧诱导因子网络在糖尿病肾病进展中的反映以及SGLT2抑制剂的治疗效果 | 2型糖尿病青少年肾组织、晚期糖尿病肾病患者肾组织（来自KPMP项目）、缺氧人器官样模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学、类器官模型 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 2型糖尿病青少年患者肾组织、晚期糖尿病肾病患者肾组织（KPMP项目）、缺氧人器官样模型 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2026-06-23 |
Poor sleep impairs immune responses and influenza vaccine protection
2026-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72212-2
PMID:42014403
|
研究论文 | 慢性睡眠碎片化会严重损害流感疫苗诱导的免疫反应，降低抗体水平和保护效果 | 通过小鼠模型和大型临床数据分析，首次揭示了慢性睡眠碎片化通过干扰B细胞成熟、生发中心程序以及浆细胞应激反应来损害疫苗免疫应答的机制 | 小鼠模型与人类睡眠障碍的差异可能影响结论的普适性；临床部分为回顾性分析，无法完全排除混杂因素 | 探究睡眠碎片化影响流感疫苗效力的免疫机制及其临床意义 | 小鼠模型及916307名接种流感疫苗的成年人 | 机器学习 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型未具体说明数量；临床数据含916307名受试者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 127 | 2026-06-23 |
Chromosome-level genome assembly of the sponge Halisarca dujardinii
2026-Apr-21, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-07161-y
PMID:42014710
|
研究论文 | 首次染色体级别的多氏海绵基因组组装，结合Oxford Nanopore长读长、Illumina短读长和Hi-C数据 | 首次实现多氏海绵的染色体级别基因组组装，并完成线粒体基因组组装和全面注释 | 未提及相关局限性 | 提供多氏海绵染色体级别基因组资源，用于研究其再生机制及海绵进化比较 | 多氏海绵（Halisarca dujardinii） | 基因组学 | NA | Oxford Nanopore长读长测序、Illumina短读长测序、Hi-C测序、RNA-seq | NA | 测序数据（基因组、转录组） | 单个海绵样本（具体数量未明确） | Oxford Nanopore, Illumina | 长读长测序、短读长测序、Hi-C、单细胞RNA-seq | Oxford Nanopore测序仪、Illumina测序平台（未具体说明型号） | 使用Oxford Nanopore长读长、Illumina短读长和Hi-C数据进行基因组组装，并利用体细胞和单细胞RNA-seq数据优化转录模型 |
| 128 | 2026-06-23 |
Identifying omic biomarkers for chronic inflammatory diseases associated with periodontitis using percolation on multi-disease gene co-expression networks
2026-Apr-21, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01591-w
PMID:42014834
|
研究论文 | 开发了PMGCN框架，利用多疾病基因共表达网络上的渗流理论识别与牙周炎相关的慢性炎症疾病的组学生物标志物 | 首次利用多疾病关联性来识别组学生物标志物，通过多疾病基因共表达网络上的最优渗流实现，提高了预测性能 | 未明确说明局限性，但可能受限于已有数据集和炎症信号通路分析的细胞类型覆盖 | 识别与牙周炎相关的慢性炎症疾病（如溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病、帕金森病）的组学生物标志物 | 慢性炎症疾病包括溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病和帕金森病 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎, 克罗恩病, 阿尔茨海默病, 帕金森病 | RNA-seq | 渗流模型 | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-06-23 |
Exploring the CeRNA landscape in plants: advances, methods, and challenges
2026-Apr-20, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-025-05135-z
PMID:42008014
|
综述 | 探讨植物中竞争性内源RNA的研究进展、方法及挑战，揭示植物与动物ceRNA的差异及其在胁迫响应和信号转导中的作用 | 系统总结了植物ceRNA与动物ceRNA在序列特征、相互作用模式及功能上的关键差异，并提出了将单细胞测序和空间转录组学等前沿技术与多组学工具结合的综合研究方法 | 现有生物信息学工具预测准确性有限，且在复杂植物组织中进行功能验证存在困难 | 梳理植物ceRNA研究现状，提出未来应优先开发植物优化的预测模型并整合空间分辨多组学数据 | 植物ceRNA网络及其在生长发育、胁迫响应和信号转导中的调控作用 | 机器学习 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞测序系统, 10x Visium空间转录组平台 |
| 130 | 2026-06-23 |
A high-resolution spatial map of cilia-associated proteins in the human fallopian tube
2026-Apr-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71692-6
PMID:42010243
|
研究论文 | 利用整合转录组学和蛋白质组学方法，绘制了人类输卵管中纤毛相关蛋白的高分辨率空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下结合转录组和蛋白质组数据，对输卵管中的纤毛相关蛋白进行空间定位，并验证了多个之前仅在转录水平研究的蛋白质 | 研究主要基于输卵管的RNA-seq数据分析，蛋白质验证限于特定组织和患者样本，可能未覆盖所有相关蛋白质或疾病状态 | 揭示输卵管在蛋白质水平的分子特征，为不孕症和纤毛相关疾病提供新见解 | 人类输卵管及其他含运动纤毛的组织中的纤毛相关蛋白 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | RNA-seq | NA | 图像 | 包括输卵管组织样本、其他运动纤毛组织样本，以及一名输卵管积水患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-06-23 |
Unveiling DEFB1 as a novel driver and promising therapeutic target in lung adenocarcinoma
2026-Apr-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08748-4
PMID:42009648
|
research paper | 本研究通过全基因组CRISPR/Cas9筛选和单细胞测序等技术，发现DEFB1是肺腺癌的一个新驱动因子，并开发了抗DEFB1单克隆抗体mAb-5作为潜在治疗靶点 | 首次发现DEFB1作为肺腺癌新驱动因子，并开发抗DEFB1单克隆抗体mAb-5，在多种模型中显示治疗潜力 | 未明确提及研究局限性 | 鉴定肺腺癌中与增殖和预后相关的新基因并开发靶向疗法 | 肺腺癌细胞系、类器官、异种移植模型和自发肺癌模型 | machine learning | lung cancer | CRISPR/Cas9筛选、单细胞测序、多重免疫组化、免疫共沉淀联合质谱分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 涉及多种细胞系、类器官、小鼠模型及TCGA和GEO公共数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-06-23 |
Subcellular mRNA localization patterns across tissues resolved with spatial transcriptomics
2026-Apr-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72156-7
PMID:42009650
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学系统解析哺乳动物不同组织中亚细胞mRNA定位模式 | 开发了一种利用图像特征从空间数据提取亚细胞信息的计算方法，并量化转录本定位模式，首次在完整组织切片中实现高通量mRNA定位研究 | 仅分析了胃肠道上皮和肝细胞等特定组织，其他组织的定位模式尚待验证 | 解析亚细胞RNA定位在组织切片中的分布规律及其在健康与疾病组织中的差异 | 哺乳动物的胃肠道上皮和肝细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 多种哺乳动物组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率空间转录组学技术 |
| 133 | 2026-06-23 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the heterogeneity of ossification of the posterior longitudinal ligament (OPLL) and its immune microenvironment
2026-Apr-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10193-0
PMID:42000969
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示后纵韧带骨化（OPLL）及其免疫微环境的细胞异质性 | 首次构建OPLL病变组织的单细胞转录组图谱，鉴定了软骨细胞谱系的多个亚群并描绘其分化轨迹，发现SPP1-CD44信号在骨化后期富集且与免疫-基质相互作用相关 | 样本量较小（4,683个细胞），属于探索性研究，结论需进一步验证 | 阐明后纵韧带骨化的细胞异质性和发病机制 | 从人类患者手术切除的颈椎OPLL病变组织 | 数字病理学 | 后纵韧带骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4,683个来自人类OPLL病变组织的细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 134 | 2026-06-23 |
The B7 family subgroup reflects tumor cell heterogeneity and patient post-operative prognosis in gallbladder cancer
2026-Apr-18, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00802-7
PMID:42001193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析胆囊癌细胞异质性，并基于B7家族分子（CD276、VTCN1、HHLA2）表达构建术后预后风险分层模型 | 首次在单细胞分辨率下揭示了B7家族分子（CD276、VTCN1、HHLA2）在胆囊癌细胞异质性和术后预后评估中的作用，并证实HHLA2通过RAC1/CDC42-PAK1-Cofilin信号通路促进上皮-间质转化 | 样本量有限，仅来自7例原发肿瘤的单细胞数据；未报道外部独立验证集的结果 | 阐明胆囊癌细胞生物异质性并优化术后风险分层 | 胆囊癌肿瘤细胞及其异质性亚群 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序、慢病毒操作、药理学抑制、皮下异种移植 | 梯度提升机、非负矩阵分解、七个机器学习生存算法 | 单细胞转录组数据、临床生存数据 | 7个原发肿瘤用于单细胞测序，188例手术治疗的胆囊癌患者用于生存建模 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2026-06-23 |
Dedifferentiation-driven oncogenic stemness promotes tumor-sustaining adaptability in the intestinal epithelium
2026-Apr-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08669-2
PMID:41997917
|
研究论文 | 该研究通过Smad4功能丧失和β-catenin功能获得的小鼠模型，揭示了去分化驱动的癌性干性促进肠道肿瘤维持适应性的机制 | 发现去分化衍生的癌性干细胞比内源性突变干细胞更有效地维持肿瘤发生，并阐明Notch信号异常和代谢可塑性在自上而下肠道肿瘤发生中的协同作用 | 未明确提及 | 探究去分化驱动的癌性干性在肠道肿瘤发生中的作用及其生物学决定因素 | Smad4:β-catenin小鼠模型的肠上皮细胞，包括绒毛上皮细胞和Lgr5+干细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 136 | 2026-06-23 |
Roles of mitophagy and immune infiltration in Parkinson's disease: new perspectives from bioinformatics analysis and A53T transgenic mice
2026-Apr-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02243-4
PMID:41998308
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研究论文 | 通过生物信息学分析和A53T转基因小鼠模型，研究线粒体自噬和免疫浸润在帕金森病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和A53T转基因小鼠模型，鉴定出五个关键线粒体自噬相关差异表达基因，并发现它们在中枢神经系统和免疫细胞中均有异常表达 | 未提及具体局限性 | 阐明线粒体自噬在帕金森病发病和进展中的精确机制 | 帕金森病患者样本和α-突触核蛋白A53T转基因小鼠 | 数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE178265和PRJNA1145007），以及A53T转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-06-23 |
18-β-glycyrrhetinic acid facilitates nuclear-mitochondrial communications to alleviate oxidative stress through HMGB1-cGAS-Mul1 axis in tendinopathy
2026-Apr-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08091-4
PMID:41998635
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研究论文 | 本研究探讨了18-β-甘草次酸通过HMGB1-cGAS-Mul1轴减轻肌腱病中氧化应激的机制 | 首次揭示了GA通过诱导HMGB1甲基化（由甲基转移酶DOT1L催化）促进cGAS与线粒体E3泛素连接酶Mul1相互作用，从而降解cGAS，调控核-线粒体通讯减轻氧化应激的新机制 | 未提及具体局限性 | 阐明18-β-甘草次酸缓解肌腱病的分子机制，重点关注其对氧化应激下HMGB1-cGAS-STING轴和NLRP3炎症小体活化的调控 | 肌腱病大鼠模型、H₂O₂诱导的肌腱干细胞氧化应激模型 | 机器学习和数字病理 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 临床样本（具体数量未提及）、大鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 138 | 2026-06-23 |
Biomimetic KeMA hydrogel encapsulating CAP-EVs-MEF2C for inhibiting inflammation and senescence in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04416-z
PMID:41998644
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研究论文 | 开发一种封装MEF2C过表达巨噬细胞来源的软骨亲和肽修饰细胞外囊泡的KeMA水凝胶，用于通过调控MEF2C/P21/CDK2轴抑制椎间盘退变中的炎症和衰老 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定MEF2C为关键调控因子，并设计CAP修饰的EVs结合KeMA水凝胶实现靶向递送和缓释，同时调控软骨终板软骨细胞炎症和髓核细胞衰老 | 未提及具体局限性 | 开发一种仿生系统以抑制椎间盘退变中的炎症和细胞衰老 | 软骨终板软骨细胞和髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2026-06-23 |
PIM1 kinase-regulated cellular metabolism sustains differentiation and function of effector CD8+ T cells during chronic viral infection
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag062
PMID:42001517
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研究论文 | 研究PIM1激酶调控的细胞代谢如何维持慢性病毒感染期间效应CD8+ T细胞的分化和功能 | 利用Compass算法基于单细胞RNA测序数据揭示慢性感染中CD8+ T细胞亚群的代谢异质性，并发现IL-21-PIM1轴通过氧化和糖酵解代谢调节效应CD8+ T细胞分化和功能 | 未明确说明具体局限性 | 探究慢性病毒感染期间CD8+ T细胞代谢调控与分化的关系 | 慢性病毒感染小鼠模型中的病毒特异性CD8+ T细胞亚群（前体、效应和耗竭细胞） | 机器学习, 数字病理学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | Compass算法 | 单细胞转录组数据 | 基于慢性感染小鼠模型的细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 利用Compass算法基于单细胞RNA测序数据进行代谢状态预测 |
| 140 | 2026-06-23 |
Transcriptional programming of early-forming memory B cells arises independently of cognate CD4+ T-cell interactions
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag054
PMID:42001515
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研究论文 | 通过MHCII敲除小鼠模型，研究早期记忆B细胞在缺乏CD4+ T细胞相互作用下的转录编程机制 | 首次揭示早期记忆B细胞的转录编程独立于CD4+ T细胞相互作用，证明其在无T细胞辅助下仍可形成多样化群体 | 未分析T细胞非依赖记忆B细胞在长期免疫记忆维持中的功能差异 | 探究CD4+ T细胞相互作用对T细胞非依赖记忆B细胞分子编程和多样性的影响 | 流感病毒感染后形成的记忆B细胞 | 免疫学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | MHCII敲除小鼠与野生型小鼠的B细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |