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当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-23 |
Mapping the Cell-Cell Interactions in Cardiovascular Diseases: A Single-Cell Atlas Perspective
2026-Apr-14, Korean circulation journal
IF:3.0Q2
DOI:10.4070/kcj.2026.0007
PMID:42324221
|
综述 | 基于单细胞图谱视角，综述心血管疾病中细胞间相互作用的改变及其发病机制 | 通过单细胞和空间转录组学技术系统构建人类心脏和血管细胞图谱，推断配体-受体分析介导的细胞间通讯，揭示疾病特异性信号通路改变 | 未提及具体局限性 | 总结心血管疾病中细胞间相互作用的主要变化，阐明失调信号网络在心肌病、心肌梗死和心力衰竭中的作用 | 心血管细胞（心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞和免疫细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 142 | 2026-06-23 |
A Protocol for Harvesting Single-cell Suspension from Mouse Corneas
2026-Apr-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69844
PMID:42008475
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研究论文 | 建立了一种从小鼠角膜中制备高质量单细胞悬液的稳健方案 | 提出了一种独特的通过胶原酶A和胰蛋白酶顺序消化从小鼠角膜组织制备单细胞悬液的方法，确保了高细胞数量和优良活性 | 未提及局限性 | 解决角膜组织因结构致密而难以制备高质量单细胞悬液的问题 | 小鼠角膜 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, 胶原酶A消化, 胰蛋白酶消化 | NA | 单细胞悬液 | 多只小鼠角膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-06-23 |
Mapping Infant Immunity with Minimal Input: Integrative Single-cell and Multiomic Profiling
2026-Apr-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70279
PMID:42008512
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研究论文 | 针对新生儿血量极少的限制，开发了优化方案，通过整合流式细胞术、蛋白质组学和单细胞RNA测序，从微量血液中获取高维度免疫数据，揭示早期生命免疫的独特轨迹 | 提出了利用极少量新生儿血液进行高维免疫分析的综合方案，实现了纵向采样和多组学整合，弥补了新生儿免疫研究中的关键空白 | 研究中提到的极低出生体重和极早早产儿的血液样本量限制仍然是挑战，且方案在更大人群中的验证可能受限于样本可获得性 | 建立从微量新生儿血液中进行高分辨率免疫分析的方法，揭示早期生命免疫系统的动态变化 | 新生儿血液中的循环免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2026-06-23 |
Fibroblast-Driven Fibroblast Growth Factor and Fibronectin 1 Signaling Orchestrates Extracellular Matrix Remodeling for Ovine Mammary Lactation Decline
2026-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70150
PMID:41998868
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研究论文 | 本研究整合了绵羊泌乳高峰和晚期单细胞RNA测序数据，揭示了成纤维细胞驱动的FGF和FN1信号通路在细胞外基质重塑和泌乳衰退中的作用 | 首次在绵羊乳腺中通过单细胞转录组学揭示成纤维细胞作为基质调控枢纽，通过FGF和FN1信号通路协调ECM重塑，并发现与人类保守的转录程序 | 未涉及功能验证实验，跨物种比较仅限于转录水平，缺乏对信号通路的直接干扰验证 | 阐明绵羊泌乳衰退过程中乳腺细胞外基质重塑的细胞和分子机制 | 泌乳高峰和晚期绵羊乳腺组织中的多种细胞类型，包括成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 未指定具体样本数量，但涉及泌乳高峰和晚期两个阶段的绵羊乳腺样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 145 | 2026-06-23 |
High ALG1 Expression Is Correlated With Poor Prognosis and the Immune Microenvironment in Glioma
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71142
PMID:42002825
|
研究论文 | 本研究探讨ALG1在胶质瘤中的表达及其临床意义，揭示其与预后和免疫微环境的关系 | 首次系统揭示ALG1在胶质瘤中过表达并通过调节免疫微环境（如IL10和CYPA通路）促进恶性进展，结合多数据库分析、单细胞RNA测序及体内外实验验证 | 未明确说明具体局限性，可能包括样本量有限、机制研究不够深入或缺乏多中心验证 | 评估ALG1在胶质瘤中的表达模式、预后价值及其对免疫微环境的影响 | 胶质瘤患者肿瘤组织及细胞，包括临床样本、TCGA和CGGA数据库数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RT-qPCR, Western blotting, 免疫组织化学/荧光, 单细胞RNA测序, siRNA敲除, 伤口愈合实验, 原位小鼠模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床样本数据 | TCGA和CGGA数据库样本（具体数量未提及），以及临床样本（具体数量未提及） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq（推测） | 单细胞RNA测序平台用于细胞状态转换分析 |
| 146 | 2026-06-23 |
Spatial and single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment of human ascending thoracic aortic aneurysms
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70650
PMID:42007493
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，构建了人升主动脉瘤的高分辨率免疫细胞图谱，揭示了免疫介导的血管重塑机制 | 首次构建人升主动脉瘤高分辨率免疫细胞图谱，结合Visium HD空间转录组学实现近单细胞分辨率的细胞定位，发现干扰素、AP1和NF-κB通路可作为治疗新靶点 | 未明确提及样本量对不同临床分期的代表性及功能验证实验的缺乏 | 探索人升主动脉瘤的免疫微环境特征及其与疾病进展相关的免疫介导血管重塑机制 | 人升主动脉组织（来自8名ATAA患者和9名对照） | 数字病理学 | 升主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 17份主动脉组织（8个ATAA患者，9个对照，其中6个来自GEO数据库） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序，Visium HD用于空间转录组学分析 |
| 147 | 2026-06-23 |
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of TNS1 gene in driving contractile VSMC transdifferentiation into macrophage-like SMC and atherosclerotic plaque instability
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70664
PMID:42007508
|
研究论文 | 通过重新分析单细胞转录组数据，揭示TNS1基因在收缩型血管平滑肌细胞向巨噬细胞样平滑肌细胞转分化及动脉粥样硬化斑块不稳定中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组重新分析及体内实验，明确TNS1基因缺失促进VSMC向MP样SMC转分化并加剧斑块不稳定 | 未提及具体局限性 | 探究VSMC表型转换亚型对动脉粥样硬化进展及斑块不稳定性的影响，并鉴定关键调控基因TNS1的作用 | 血管平滑肌细胞（VSMC）及巨噬细胞样平滑肌细胞（MP-like SMC） | 机器学习 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、细胞通讯分析 | NA | 转录组数据 | 三个不稳定斑块转录组数据集及两个scRNA-seq数据集（GSE155513和GSE253903）；人类动脉粥样硬化斑块及健康动脉样本；VSMC特异性Tns1敲除ApoE-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2026-06-23 |
The landscape of responses to neoadjuvant immunotherapy in resectable Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog-mutant lung adenocarcinoma: Clinical heterogeneity and correlative immunologic analysis
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70670
PMID:42011021
|
research paper | 本研究整合临床结果与单细胞RNA测序，描绘了可切除的KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应的景观，发现临床异质性与相关免疫学特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了KRAS突变肺腺癌中免疫抑制性Treg亚群（CD4T_Treg_TNFRSF4）与新型耗竭样B细胞（Bex）-Th1细胞协同网络在决定新辅助免疫治疗疗效中的对立作用 | NA | 阐明可切除的KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应差异的免疫决定因素 | KRAS突变与野生型肺腺癌患者的肿瘤微环境特征 | machine learning | lung cancer | RNA-seq | NA | gene expression | 143例可切除肺腺癌患者（106例KRAS野生型，37例KRAS突变型）；另有234例非小细胞肺癌患者肿瘤标本用于单细胞RNA测序，其中48例肺腺癌（13例KRAS突变，35例KRAS野生型） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 149 | 2026-06-23 |
Single-cell RNA sequencing and high-dimensional flow cytometry reveal distinct peripheral immune landscapes of type 1 autoimmune pancreatitis and pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70680
PMID:42011980
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示1型自身免疫性胰腺炎与胰腺导管腺癌的外周免疫图谱差异 | 首次整合单细胞RNA/BCR测序和流式细胞术，在AIP患者外周血中发现三种新型免疫细胞亚群，并基于这些亚群建立区分AIP与PDAC的诊断列线图 | 研究样本量相对较小，且未在更大的独立队列中进行验证 | 明确自身免疫性胰腺炎的外周免疫特征，找出其与胰腺癌的差异及用于疾病鉴别的生物标志物 | 1型自身免疫性胰腺炎患者、胰腺导管腺癌患者和健康志愿者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性胰腺炎, 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA/BCR测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | 10例1型AIP患者、13例PDAC患者和11名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA/BCR测序 | NA | NA |
| 150 | 2026-06-23 |
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014150
PMID:42008567
|
研究论文 | 该研究通过小鼠巨细胞病毒呼吸道感染模型和过继性T细胞转移，揭示了早期生命阶段CD8 T细胞毒性缺陷导致抗病毒保护不足的机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析早期生命阶段MCMV特异性CD8 T细胞的分化，发现新生儿期αβ T细胞普遍缺陷导致效应T细胞功能不全 | 研究基于小鼠模型，结果向人类CMV感染的转化需进一步验证 | 阐明早期生命阶段抗巨细胞病毒T细胞免疫的差异机制 | 新生和成年小鼠的呼吸道巨细胞病毒感染模型 | 数字病理学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 151 | 2026-06-23 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq profiling identifies NTN5 +LSAMP + myoblasts as mediators of impaired embryonic myogenesis
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq分析揭示了NTN5+LSAMP+成肌细胞作为胚胎肌生成受损的介质 | 首次在生长受限的胚胎中鉴定出共表达netrin-5和LSAMP的致病性成肌细胞亚群，并揭示了其分化阻滞的表观遗传和代谢机制 | 未提及具体局限性 | 研究生长受限胚胎中肌生成的调控机制，为发育性肌病和胎儿生长受限提供治疗靶点 | 生长受限和正常猪胚胎体节中的成肌细胞 | 机器学习和生物信息学 | 胎儿生长受限 | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 来自生长受限和正常猪胚胎体节的多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台用于单细胞RNA-seq和ATAC-seq |
| 152 | 2026-06-23 |
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag160
PMID:41996577
|
研究论文 | 提出scGPD框架，利用单细胞RNA-seq数据设计用于靶向空间转录组学的基因组合 | 采用基因-基因相关性感知的门控机制，可从数据中提取信息特征并消除基因冗余，优于现有方法 | 未提及具体限制 | 开发用于空间转录组学的紧凑且非冗余基因组合设计方法 | 多样单细胞数据集和空间转录组数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2026-06-23 |
Spatial-ZEDNet : a unified spatial transcriptomics framework for detecting differential gene activation and expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag166
PMID:42001470
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研究论文 | 提出Spatial-ZEDNet框架，统一检测空间转录组学中差异基因表达与激活 | 通过层级高斯随机场模型同时检测空间差异表达基因和差异激活基因，明确建模零膨胀问题，且无需空间坐标匹配即可对齐不同条件下的生物信号 | 模拟和实际应用中虽表现优异，但可能对复杂组织微环境的泛化性有限，且计算成本可能较高 | 开发一种统计严谨的方法，用于整合空间转录组学数据以检测暴露诱导的组织重塑中的差异基因调控 | 结肠炎和疟原虫感染数据集中的免疫基因表达与激活模式 | 数字病理学 | 结肠炎、疟疾 | 空间转录组学 | 高斯随机场 | 空间转录组数据 | 结肠炎和疟原虫感染数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-06-23 |
AICellType: a large language model-based platform for accurate cell type annotation
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag151
PMID:42001469
|
研究论文 | 基于大语言模型的细胞类型注释平台AICellType，通过系统性基准测试和平台开发，实现单细胞与空间转录组数据的准确注释 | 首次系统评估79种大语言模型在1130个单细胞和空间转录组数据集上的性能，并开发整合了本体结构和语义推理评估框架的开源平台AICellType | 未提及具体限制，但需考虑模型对罕见细胞类型注释的潜在偏差及计算资源需求 | 开发准确、可扩展且高效的细胞类型注释方法，解决现有方法依赖静态基因标记的局限性 | 79种大语言模型、1130个单细胞和空间转录组数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 大语言模型（LLM） | 单细胞与空间转录组数据 | 1130个数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 155 | 2026-06-23 |
Spatial multi-omics integration by cross-modal graph contrastive learning
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag192
PMID:42001472
|
研究论文 | 提出一个基于图的跨模态对比学习框架CoMo，用于整合空间转录组、蛋白质组和表观基因组等多组学数据，实现空间域识别和跨组学特征融合 | 通过交叉注意力机制实现多模态特征协同学习，并结合邻居感知对比损失和聚类感知对比损失进行双优化，有效克服了模态特异性技术偏差和生物复杂性 | 未提及具体局限性 | 开发一种稳健的计算工具，用于整合空间多组学数据并支持组织综合表征 | 空间多组学数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学 | 图神经网络、交叉注意力机制、对比学习 | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据、空间表观基因组数据 | 五个空间组学数据集 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学 | NA | NA |
| 156 | 2026-06-23 |
Causal modeling reveals cell-cell communication dynamics in the tumor microenvironment during anti-PD-1 therapy in breast cancer patients
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag139
PMID:42001468
|
研究论文 | 提出因果推断框架scIVCCC，利用单细胞数据分析抗PD-1治疗前后乳腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯的动态变化 | 首次将治疗作为工具变量进行因果推断，识别出真正的细胞间通讯网络，区分混杂关联，揭示T细胞与肿瘤相关巨噬细胞的双重角色 | 未提及具体局限性 | 揭示免疫检查点阻断治疗如何通过细胞间通讯重塑肿瘤微环境，并确定潜在联合治疗靶点 | 31名乳腺癌患者治疗前后的单细胞RNA测序数据 | 机器学习， 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 因果模型 | 基因表达数据 | 31名乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-06-23 |
GALA: a unified landmark-free framework for coarse-to-fine spatial alignment across resolutions and modalities in spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag181
PMID:42007518
|
研究论文 | 提出GALA框架，一种无需标记点的统一方法，用于空间转录组学中不同分辨率和模态的粗到细空间对齐 | 引入遗传算法引导的大变形对齐框架，通过单一优化耦合全局仿射变换和局部微分同胚变形，实现无需标记点的多模态对齐 | 未提及具体局限性 | 解决空间转录组学对齐中因技术变异、几何畸变和平台差异导致的挑战，提供高效准确的对齐方法 | 空间转录组学数据 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | 遗传算法、全局仿射变换、局部微分同胚变形 | 空间转录组学数据、组织学图像 | 多种人类和小鼠数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 158 | 2026-06-23 |
Evaluating reference-mixture matching in cell-type deconvolution with single-cell RNA-seq references
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag184
PMID:42007519
|
研究论文 | 系统评估基于单细胞RNA-seq参考的细胞类型反卷积方法在不同参考匹配条件下的性能 | 首次系统性评估不同临床匹配条件下scRNA-seq参考对反卷积方法性能的影响，并发现方法选择比参考匹配程度更重要 | 研究仅基于PBMC数据集和系统性红斑狼疮疾病，未涵盖其他组织类型或疾病状态 | 评估不同参考匹配条件对细胞类型反卷积方法准确性的影响 | 外周血单个核细胞（PBMCs）及来自系统性红斑狼疮患者和健康对照的scRNA-seq数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | scRNA-seq, 批量RNA-seq | CIBERSORTx, MuSiC2, InstaPrism, BLADE, DISSECT, Scaden | 基因表达数据 | 40例系统性红斑狼疮患者和40例健康对照的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2026-06-23 |
[Shared mechanisms of obesity and male infertility and prediction of natural therapeutics based on machine learning and single-cell sequencing]
2026-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 利用生物信息学和机器学习方法，结合单细胞测序数据，揭示肥胖与男性不育的共病机制，并预测具有治疗潜力的天然化合物及中药 | 首次整合多组学数据、三种机器学习算法（随机森林、LASSO回归、支持向量机）及单细胞测序，系统揭示肥胖与男性不育在免疫炎症调控和细胞分化功能障碍方面的共病机制，并基于CMap数据库和TCMSP平台构建“靶点-天然化合物-草药”网络，为精准中医药干预提供新思路 | 研究基于公共数据库分析，缺乏独立外部验证和体内外实验验证；预测的天然化合物和中药需进一步临床验证 | 探索肥胖与男性不育的共病分子机制，并预测天然化合物和中药的潜在治疗价值 | 肥胖患者脂肪组织和男性不育患者睾丸组织的单细胞测序数据，以及GEO数据库中的相关批量转录组数据 | 机器学习 | 男性不育 | 单细胞测序 | 随机森林, LASSO回归, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GEO数据库的批量转录组数据集及单细胞测序数据集，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2026-06-23 |
TIM-4+ skeletal muscle Resident Tissue Macrophages Ferroptosis mediated Rhabdomyolysis in Exertional Heatstroke
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.114815
PMID:42003910
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研究论文 | 揭示了TIM-4+骨骼肌驻留巨噬细胞铁死亡介导劳力性中暑相关横纹肌溶解的免疫代谢机制 | 首次发现TIM-4+骨骼肌驻留巨噬细胞通过HMOX1依赖的铁死亡途径驱动劳力性中暑时的横纹肌溶解，并阐明JunD-Olfr2-NLRP3-IL-1β信号轴的核心作用 | 未充分验证结果在人类中的可重复性，且对铁死亡与NLRP3炎症小体交互作用的机制细节尚未完全阐明 | 阐明骨骼肌驻留巨噬细胞在劳力性中暑相关横纹肌溶解中的功能机制 | 小鼠模型中的TIM-4+骨骼肌驻留巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、药理学调控、染色质分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |