单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-06-21	A dual-targeting strategy to inhibit colorectal cancer liver metastasis via tumor cell ferroptosis and cancer-associated fibroblast reprogramming 2025-Oct, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.025 PMID:40530415	研究论文	本文提出了一种双靶向策略，通过诱导肿瘤细胞铁死亡和重编程癌症相关成纤维细胞来抑制结直肠癌肝转移	利用单细胞转录组学鉴定关键驱动因素，并设计了一种双靶向纳米系统，同时诱导肿瘤细胞铁死亡和重编程CAFs	NA	克服结直肠癌肝转移的治疗挑战	结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞	肿瘤学	结直肠癌	单细胞转录组学	NA	NA	临床结直肠癌样本和患者来源的肿瘤异种移植人源化免疫小鼠模型
102	2025-06-21	Investigating the potential risk of cadmium exposure on Osteoporosis: An integrated multi-omics approach 2025-Aug, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118502 PMID:40517505	研究论文	本研究通过整合多组学方法探讨镉暴露对骨质疏松症的潜在风险	采用多组学数据分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化等多种方法，揭示了镉暴露与骨质疏松症的关系，并发现HMOX1作为潜在治疗靶点	研究主要基于NHANES的横断面分析，可能无法完全确定因果关系	探讨镉暴露在骨质疏松症发病机制中的作用	骨质疏松症患者及镉暴露相关基因	生物信息学	骨质疏松症	多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟	机器学习	多组学数据	NA
103	2025-06-21	Single-cell RNA sequencing analysis of intrahepatic cholangiocarcinoma reveals SPP1 facilitates disease progression via interaction with CD4+ T cells 2025-Aug, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2025.15135 PMID:40535101	研究论文	通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌，揭示SPP1通过与CD4+ T细胞相互作用促进疾病进展	首次使用单细胞RNA测序技术探索肝内胆管癌肿瘤微环境的异质性，并发现SPP1-CD44轴在肿瘤细胞与免疫细胞相互作用中的关键作用	研究未涉及SPP1-CD44轴的具体作用机制，且样本量有限	探究肝内胆管癌肿瘤微环境中CD4 T细胞的作用及其与肿瘤进展的关系	肝内胆管癌肿瘤微环境中的CD4 T细胞和肿瘤细胞	肿瘤免疫学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
104	2025-06-21	Molecular characterization of benign intracranial glioependymal and arachnoid cysts suggest heterogeneous mechanisms of action 2025-Jul-01, Journal of neuropathology and experimental neurology IF:3.2Q2 DOI:10.1093/jnen/nlaf029 PMID:40197611	研究论文	本研究对良性颅内胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿进行了分子特征分析，揭示了其不同的发病机制	首次通过单细胞测序和RNA表达谱比较，揭示了胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿具有不同的细胞特征和分子机制	样本量较小(仅16例患者)，且仅对部分样本进行了分子分析	探究良性颅内囊肿的形成和生长机制	16例接受手术治疗的良性颅内囊肿患者	神经病理学	颅内囊肿	H&E染色、免疫荧光染色、单细胞测序、RNA表达谱分析	NA	组织样本、囊肿液体、基因表达数据	16例患者(其中8例进行了病理分析，4例进行了囊肿液体分析)
105	2025-05-14	Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq 2025-Jul, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/s41576-025-00853-y PMID:40355601	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
106	2025-06-21	Comprehensive single-cell chromatin and transcriptomic profiling of peripheral immune cells in nonsegmental vitiligo 2025-Jun-20, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljaf041 PMID:39888372	研究论文	本研究通过单细胞多组学方法，分析了非节段性白癜风患者外周血免疫细胞的转录和染色质可及性，揭示了系统性免疫失调的机制	首次使用单细胞RNA测序和染色质可及性测序结合的方法，全面分析了非节段性白癜风患者的外周血免疫细胞	样本量相对较小（NSV患者11人，健康对照5人），且研究仅关注外周血免疫细胞，未直接研究皮肤病变	探究非节段性白癜风患者外周血免疫细胞的系统性免疫失调机制	非节段性白癜风患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）	免疫学	白癜风	scRNAseq, scATACseq, 光谱流式细胞术	NA	单细胞转录组数据, 染色质可及性数据	初始队列：NSV患者11人，健康对照5人；验证队列：NSV患者16人，健康对照9人
107	2025-06-21	MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173 PMID:40357547	研究论文	本研究探讨了间质巨噬细胞（iMΦ）浸润与肺动脉纤维化在肺动脉高压（PH）中的关联及其分子机制	首次发现MHCIIhiLYVE1loCCR2hi iMΦs通过WNT11/PCP通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化，导致肺动脉中膜纤维化	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证仍需进一步扩大	阐明肺动脉高压中肺动脉纤维化的细胞和分子机制	肺动脉高压患者和实验动物的肺组织样本、间质巨噬细胞和平滑肌细胞	病理生理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序、谱系追踪、组织学分析、共培养实验、转基因动物实验	Sugen-5416联合低氧-常氧刺激的PH动物模型	基因表达数据、组织学图像	未明确说明具体样本数量，包括人类患者和实验动物样本
108	2025-06-21	Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230 PMID:40365676	研究论文	通过创建一种新型的自发性主动脉夹层小鼠模型，研究内皮功能障碍和免疫浸润在主动脉夹层发病机制中的作用	首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者的FBN1基因错义变异引入小鼠模型，揭示了内皮细胞和单核/巨噬细胞在主动脉夹层起始中的相互作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	阐明主动脉夹层的分子机制	Fbn1G234D/G234D突变小鼠	心血管疾病研究	主动脉夹层	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、电子显微镜、同步辐射成像、Western blot分析	小鼠疾病模型	基因测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据	Fbn1G234D/G234D突变小鼠群体（50%在5周龄内死亡）
109	2025-06-21	SM22α-Lineage Perivascular Stromal Cells Contribute to Abdominal Aortic Aneurysm 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325750 PMID:40371535	研究论文	本文研究了SM22α谱系血管周围基质细胞在腹主动脉瘤中的作用及其机制	揭示了SM22α谱系血管周围基质细胞中PGC-1α缺乏通过调节YAP信号通路破坏脂肪生成和肌纤维生成平衡，从而促进腹主动脉瘤发展的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究血管周围脂肪组织在腹主动脉瘤发病中的作用机制	小鼠和人类血管周围基质细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序，功能获得和缺失实验，放射组学分析	Ang II诱导和DOCA/盐诱导的小鼠AAA模型	基因表达数据，影像数据	年轻(2-3月龄)和老年(18-20月龄)小鼠，人类动脉瘤样本
110	2025-06-21	Lineage-resolved analysis of embryonic gene expression evolution in C. elegans and C. briggsae 2025-Jun-19, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adu8249 PMID:40536976	研究论文	通过单细胞RNA测序比较秀丽隐杆线虫和布氏隐杆线虫胚胎发育过程中基因表达的进化差异	利用两种线虫保守不变的胚胎谱系，系统比较了细胞类型基因表达在进化中的变化，揭示了发育基因表达进化的可能约束	仅研究了两种线虫，结果可能不适用于其他物种	探究发育过程中基因表达模式进化的约束机制	秀丽隐杆线虫(C. elegans)和布氏隐杆线虫(C. briggsae)的胚胎发育过程	发育生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两种线虫的胚胎发育过程
111	2025-06-21	Macrophages-derived NRG-1 promotes angiogenesis after ischemic stroke via the Akt-mTOR pathway 2025-Jun-19, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01323 PMID:40537024	研究论文	本研究探讨了巨噬细胞来源的NRG-1在缺血性中风后通过Akt-mTOR通路促进血管生成的作用	首次发现外周巨噬细胞是中风后NRG-1的来源，并阐明NRG-1通过Akt/mTOR/VEGF信号通路促进血管生成的神经保护机制	NRG-1的具体作用机制尚未完全阐明，临床转化潜力有待进一步验证	探究NRG-1在缺血性中风中的来源及其神经保护作用的分子机制	急性缺血性中风患者和短暂性大脑中动脉闭塞小鼠模型	神经科学	缺血性中风	单细胞测序	小鼠大脑中动脉闭塞模型	血液样本和脑组织样本	急性缺血性中风患者的配对血栓和外周血样本，以及小鼠模型
112	2025-06-21	Multidimensional bioinformatics analysis of chondrosarcoma subtypes and TGF-β signaling networks using big data approaches 2025-Jun-17, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02931-3 PMID:40526169	研究论文	通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，研究软骨肉瘤的细胞亚型、信号网络和基因表达模式，以揭示潜在的治疗靶点	首次在软骨肉瘤中应用单细胞RNA测序技术，结合机器学习模型分析细胞亚型和信号网络	样本量相对较小，且仅针对软骨肉瘤进行研究，结果可能不适用于其他类型肿瘤	解析软骨肉瘤的分子机制并寻找新的治疗靶点	临床和实验性软骨肉瘤样本	数字病理学	软骨肉瘤	scRNA-seq, UMAP/t-SNE, GSEA	机器学习模型	基因表达数据	未明确说明具体数量，包括临床和实验样本
113	2025-06-21	Exploring genetic causal relationships between spinal cord injury and glioma: a Mendelian randomization study 2025-Jun-17, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02919-z PMID:40526188	研究论文	本研究利用孟德尔随机化方法探索脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系	首次应用多种孟德尔随机化统计方法结合RNA测序数据和机器学习风险分层分析这两种疾病的遗传关联	样本量有限且仅使用四个SNPs作为工具变量，可能影响统计效力	探究脊髓损伤与胶质瘤之间的潜在遗传因果关系	脊髓损伤患者与胶质瘤患者的遗传数据	遗传流行病学	胶质瘤/脊髓损伤	孟德尔随机化(MR)、RNA测序、单细胞RNA测序	MR Egger回归/逆方差加权(IVW)/加权模式	基因组数据/基因表达数据	FinnGen R11数据集和TCGA/GEO数据库样本（具体数量未明确说明）
114	2025-06-21	Roles of ACSL4/GPX4 and FSP1 in oxalate-induced acute kidney injury 2025-Jun-17, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-025-02557-y PMID:40527896	研究论文	本研究探讨了ACSL4/GPX4和FSP1在草酸盐诱导的急性肾损伤（AKI）中的作用及其调控机制	首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析揭示了草酸盐诱导的AKI小鼠模型中肾小管细胞的铁死亡现象，并明确了ACSL4和FSP1在其中的调控作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床样本中验证	探究草酸盐诱导的急性肾损伤中铁死亡的关键调控基因及其机制	草酸盐诱导的急性肾损伤小鼠模型和鼠肾小管上皮细胞系（MTECs）	生物医学	急性肾损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	基因表达数据	NA
115	2025-06-21	Pathway-based cancer transcriptome deciphers a high-resolution intrinsic heterogeneity within bladder cancer classification 2025-Jun-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06682-1 PMID:40528211	研究论文	本研究通过基于通路的癌症转录组分析，揭示了膀胱癌内在异质性，并识别出四种具有不同分子、功能和表型特征的内在亚型	首次在膀胱癌中识别出四种内在亚型，这些亚型与现有转录分类重叠有限，并展现出前所未有的预测和预后价值	研究主要基于转录组数据，可能忽略了其他层面的异质性（如表观遗传或蛋白质组）	探索癌症内在基因表达谱对膀胱癌分类和预后的贡献程度及机制	膀胱癌患者样本	数字病理学	膀胱癌	单细胞转录组测序	机器学习算法	转录组数据	GSE135337和TCGA BLCA数据集中的样本
116	2025-06-21	Decoding hippocampal subfield and glial responses in ischemia using single-cell transcriptomics 2025-Jun-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06738-2 PMID:40528218	研究论文	通过单细胞转录组学解码缺血条件下海马亚区和胶质细胞的反应	揭示了全球脑缺血条件下海马CA1和CA3-DG亚区胶质细胞和血管细胞的分子特征和功能差异，发现了一种在缺血后海马中出现的独特少突胶质细胞亚型	研究仅使用了Sprague-Dawley大鼠模型，结果可能不能完全反映人类中风的情况	了解缺血前后海马不同区域的细胞和分子变化，以深入理解中风病理和恢复机制	Sprague-Dawley大鼠的海马CA1和CA3-DG区域	神经科学	中风	单细胞RNA测序	四血管闭塞(4-VO)手术模型	RNA测序数据	Sprague-Dawley大鼠（具体数量未提及）
117	2025-06-21	Mechanical tension-induced Dalrd3 elevation enhances osteogenic differentiation of bone suture stem cells by upregulating Id3 translation 2025-Jun-17, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-025-04380-9 PMID:40528244	研究论文	本研究探讨了机械张力通过上调Dalrd3表达及其相关的tRNA m3C修饰，增强骨缝干细胞（SuSCs）成骨分化的机制	揭示了机械张力激活的SuSCs中Dalrd3通过上调Id3翻译促进成骨分化的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床中进行验证	探究机械张力如何通过Dalrd3调控SuSCs的成骨分化	骨缝干细胞（SuSCs）	骨生物学	颅面畸形	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠快速上颌扩张（RME）模型	RNA测序数据	NA
118	2025-06-21	Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal MAZ(+) NPC-like clusters as key role contributing to glioma recurrence and drug resistance 2025-Jun-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06706-w PMID:40524155	研究论文	通过单细胞和空间转录组分析揭示MAZ(+) NPC样簇在胶质瘤复发和耐药性中的关键作用	首次在单细胞和空间转录组水平上鉴定出MAZ(+) NPC样簇是胶质瘤耐药的关键因素，并提出了联合用药策略	研究样本量有限，且未进行体内实验验证	探索胶质瘤对替莫唑胺耐药的分子机制并寻找潜在治疗策略	胶质瘤细胞	数字病理学	胶质瘤	单细胞测序、空间转录组测序、批量RNA测序	NA	转录组数据	未明确说明样本数量
119	2025-06-21	The high efficacy of claudin18.2-targeted CAR-T cell therapy in advanced pancreatic cancer with an antibody-dependent safety strategy 2025-Jun-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.012 PMID:39797399	研究论文	本研究报道了使用表达tEGFR的claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗3例晚期胰腺癌患者的高效性及抗体依赖性安全策略	首次展示了claudin18.2靶向CAR-T细胞在胰腺癌中的强大抗肿瘤活性，并提出了使用抗体依赖性安全开关策略控制CAR-T细胞引起的脱靶毒性	研究样本量较小（仅3例患者），且观察到胃黏膜损伤等脱靶毒性	评估claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的疗效和安全性	晚期胰腺癌患者	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	CAR-T细胞疗法、单细胞转录组测序、T细胞受体测序	NA	临床数据、测序数据	3例晚期胰腺癌患者
120	2025-06-21	Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts Contribute to Microvascular Proliferation in Glioblastoma and are Correlated with Immunosuppression and Poor Outcome 2025-Jun-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0743 PMID:40131028	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了胶质母细胞瘤中微血管增殖（MVP）的机制及其与免疫抑制和不良预后的关联	揭示了PDGFRB作为引导间充质干细胞向更成熟的血管周围基质细胞分化的驱动基因，并发现了PDGFRB+血管周围基质细胞与免疫抑制性髓系细胞亚群之间的相互作用	样本量较小（16例原发性胶质瘤患者样本），且研究结果需要在更大样本中验证	阐明胶质母细胞瘤中微血管增殖的机制及其临床意义	胶质母细胞瘤患者的血管周围基质细胞和免疫细胞	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	16例原发性胶质瘤患者样本