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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-11 |
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195104
PMID:40966415
|
研究论文 | 本研究揭示了基质金属蛋白酶在面肩肱型肌营养不良症中的生物标志物作用和治疗靶点价值 | 首次通过单细胞RNA测序确定FAPs和巨噬细胞是MMPs的主要来源,并证明泛MMP抑制剂batimastat可改善肌肉退化和纤维脂肪生成 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MMPs在FSHD疾病进展中的作用机制和治疗潜力 | 面肩肱型肌营养不良症患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 | 生物医学研究 | 肌肉营养不良症 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-11-11 |
Platelets impair the resolution of inflammation in atherosclerotic plaques in insulin-resistant mice after lipid lowering
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193593
PMID:41066197
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研究论文 | 本研究揭示血小板通过阻碍炎症消退过程削弱胰岛素抵抗小鼠降脂治疗对动脉粥样硬化斑块的改善效果 | 首次证明血小板会阻碍降脂治疗期间动脉粥样硬化斑块的炎症消退过程,并发现Fcgr4+巨噬细胞亚群在炎症消退中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床数据的验证相对有限 | 探究血小板在降脂治疗期间对动脉粥样硬化斑块炎症消退过程的影响 | 肥胖和胰岛素抵抗小鼠的动脉粥样硬化斑块,以及人类临床数据中的循环非经典单核细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,临床数据 | 胰岛素抵抗小鼠模型及人类患者临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-11-11 |
Single Cell Transcriptomics of Traditional Chinese Medicine Bioactives: Mapping Immune, Neural and Hepatic Responses
2025-Nov-10, Zhongguo ying yong sheng li xue za zhi = Zhongguo yingyong shenglixue zazhi = Chinese journal of applied physiology
DOI:10.62958/j.cjap.2025.028
PMID:41207694
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术解析中药活性成分对免疫、神经和肝脏系统的细胞特异性反应 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示中药活性成分的细胞类型特异性药效动力学,发现传统批量转录组学研究无法观测的细胞特异性反应 | 研究仅使用小鼠模型,样本来源相对有限 | 阐明中药活性成分在细胞特异性水平上的药理作用机制 | 小鼠脾脏、海马体和肝脏组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫荧光 | Seurat, CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过42,000个高质量细胞,包含15种免疫亚型、12种神经亚型和10种肝脏亚型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 104 | 2025-11-11 |
Descendants of hypertrophic chondrocytes promote angiogenesis by secreting THBS4 during bone growth and injury repair
2025-Nov-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00469-2
PMID:41207902
|
研究论文 | 本研究揭示了肥大软骨细胞后代通过分泌THBS4促进血管生成在骨骼生长和损伤修复中的关键作用 | 首次发现肥大软骨细胞后代中特定细胞亚群(PADs)通过分泌THBS4调控血管生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肥大软骨细胞谱系在骨骼发育和修复中的功能机制 | 小鼠肥大软骨细胞及其后代细胞 | 骨骼生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 组织透明化, 体外细胞培养 | 转基因小鼠模型(Col10a1-Cre; R26) | 基因表达数据, 图像数据 | 转基因小鼠和对照小鼠的股骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-11-11 |
Unveiling prognostic biomarkers and immunotherapeutic insights in prostate cancer through multi-omics and machine learning
2025-Nov-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03363-z
PMID:41207909
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法揭示前列腺癌预后生物标志物和免疫治疗见解 | 整合单细胞和批量转录组数据,开发包含14种算法和162种算法组合的机器学习框架构建共识免疫预后特征 | NA | 评估前列腺癌相关基因的临床相关性和预后潜力 | 前列腺癌肿瘤微环境中的基因和细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,多组学分析 | 集成机器学习算法 | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-11-11 |
Harnessing Arginase-2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive Cutaneous T cell Lymphoma
2025-Nov-10, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf450
PMID:41208405
|
研究论文 | 本研究证明ARG2特异性CD8⁺ T细胞能够靶向识别并杀伤表达ARG2的皮肤T细胞淋巴瘤细胞 | 首次发现ARG2特异性CD8⁺ T细胞可靶向识别恶性CTCL细胞,揭示了ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的潜力 | 研究仅使用了8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集,样本量有限 | 探索ARG2特异性CD8⁺ T细胞靶向治疗皮肤T细胞淋巴瘤的新免疫治疗策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤细胞系和患者病灶中的恶性T细胞 | 免疫治疗 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | western blotting, 单细胞RNA测序, IFN-γ ELISPOT, CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 蛋白质印迹数据, 单细胞RNA测序数据, 细胞因子分泌数据 | 8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集中的CTCL患者病灶 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-11-11 |
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2025-Nov-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003561
PMID:41208796
|
研究论文 | 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴调控线粒体生物合成抑制铁死亡,从而缓解主动脉夹层的机制 | 首次揭示硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴调控线粒体生物合成抑制铁死亡的新机制 | 动物模型和细胞实验仍需临床验证 | 探究硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其分子机制 | 小鼠主动脉夹层模型和血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,转录组分析,siRNA敲低 | 动物模型,细胞模型 | 基因表达数据,病理数据 | 小鼠模型和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-11-11 |
STAT3 regulates NK and NKT cell differentiation through C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1) in hyper-IgE syndrome
2025-Nov-10, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00323-1
PMID:41212476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了STAT3突变通过CX3CR1调控NK和NKT细胞分化在高IgE综合征中的作用机制 | 首次发现STAT3突变导致CX3CR1CD57 NK和NKT细胞群体增加,并通过CUT&Tag分析证实突变STAT3增强与IL-4转录起始位点的结合 | 研究样本量有限,STAT3突变在HIES中的复杂分子机制仍需进一步阐明 | 阐明STAT3突变在高IgE综合征中导致免疫失调的分子机制 | STAT3突变患者、STAT3条件性敲除小鼠的免疫细胞(NK细胞、NKT细胞、CD4 T细胞) | 免疫学 | 高IgE综合征 | 单细胞测序, 流式细胞术, CUT&Tag分析 | 条件性敲除小鼠模型 | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 表观遗传数据 | STAT3突变患者和STAT3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-11-11 |
LMO7 Suppresses Tumor-Associated Macrophage Phagocytosis of Tumor Cells Through Degradation of LRP1
2025-Nov-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511162
PMID:41208232
|
研究论文 | 本研究揭示了LMO7通过降解LRP1抑制肿瘤相关巨噬细胞吞噬肿瘤细胞的机制 | 首次发现LMO7通过促进LRP1的K48连接多聚泛素化降解来抑制巨噬细胞吞噬功能,并证明LMO7缺失与SIRPα阻断联合治疗的协同抗肿瘤效果 | NA | 探究LMO7在肿瘤相关巨噬细胞功能调控中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-11-11 |
A cell-type-specific regulon controlling monoterpene indole alkaloid biosynthesis with feedback and feedforward activation loops
2025-Nov-09, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70712
PMID:41208325
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了两种星形植物中单萜吲哚生物碱生物合成的细胞类型特异性调控网络 | 发现了控制单萜吲哚生物碱生物合成的细胞类型特异性调控子,包含反馈和前馈激活回路,并证明了两物种间转录因子的共同选择 | 研究聚焦于特定细胞类型,可能不适用于其他生物碱生物合成系统 | 研究植物次生代谢产物生物合成的细胞类型特异性调控机制 | 长春花和喜树的单萜吲哚生物碱生物合成系统 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | RNA测序数据 | 两种星形植物物种的干细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-11-11 |
Spatial transcriptomics reveals unique inflammatory signatures across all anatomic locations in postoperative Crohn's disease
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf180
PMID:41092315
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了克罗恩病术后患者不同解剖位置共有的炎症特征 | 首次在克罗恩病术后患者中应用空间转录组学技术,发现结肠、新末端回肠和吻合口三个解剖位置存在共同的炎症特征 | 样本仅来自PREDICT-OR研究,可能无法代表所有克罗恩病术后患者群体 | 探究克罗恩病术后患者胃肠道炎症的分子基础 | 克罗恩病术后患者的结肠、新末端回肠和吻合口活检组织 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | PREDICT-OR研究中的患者活检样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium CytAssist system V2.0 |
| 112 | 2025-11-11 |
Integrative SMR and single cell & spatial analysis reveals the spatial heterogeneity and prognostic value of CASP9-mediated apoptotic pathways in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03798-0
PMID:41201629
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析,揭示了CASP9介导的凋亡通路在透明细胞肾细胞癌中的空间异质性及其预后价值 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学与孟德尔随机化方法结合,系统解析了CASP9驱动的凋亡程序在肾癌中的空间组织和免疫抑制功能 | 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步实验验证CASP9在肿瘤-巨噬细胞相互作用中的具体机制 | 阐明凋亡相关基因程序在透明细胞肾细胞癌中的空间动态、转录异质性和预后相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织中的恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 | LASSO Cox回归, DeepSurv | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组数据 | TCGA和E-MTAB-1980队列的透明细胞肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2025-11-11 |
EGR4 transcriptionally upregulates GDF15 to promote gastric cancer metastasis
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08095-w
PMID:41203604
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现EGR4通过转录上调GDF15促进胃癌转移的新机制 | 首次发现EGR4/GDF15轴在胃癌转移中的关键作用,并揭示了其通过ErbB受体异源二聚化和CAF激活的双重促转移机制 | 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证 | 探究胃癌转移的分子驱动机制 | 胃癌患者原发肿瘤和匹配的转移淋巴结 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, ChIP-seq数据 | 6例胃癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-11-11 |
Targeting the ac4C 'Writer' NAT10 enhances pancreatic cancer immunotherapy via dual modulation of CD8+ T cells and tumor cells
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08156-0
PMID:41203621
|
研究论文 | 本研究探索了NAT10介导的ac4C RNA修饰在胰腺癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 首次揭示NAT10通过ac4C乙酰化稳定ETS2和KRT8 mRNA,形成正反馈环上调PD-L1表达,促进胰腺癌免疫逃逸 | NA | 探索NAT10在胰腺癌免疫治疗耐药中的作用机制及治疗潜力 | 胰腺癌细胞、CD8+T细胞、肿瘤微环境 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-11-11 |
The transcription factor ZEB2 mediates the antitumor efficacy of tumor-infiltrating lymphocytes in non-small cell lung cancer
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08112-y
PMID:41203628
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现转录因子ZEB2在非小细胞肺癌中驱动CD8+T细胞向细胞毒性效应轨迹分化 | 首次通过metaVIPER单细胞RNA测序分析揭示ZEB2作为主调节子在CD8+T细胞分化中的关键作用,并发现T-bet/ZEB2轴在肺癌免疫治疗中的新机制 | 研究样本量较小(14例初治患者),且动物模型结果需要进一步临床验证 | 探索非小细胞肺癌中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能调节机制,寻找改善免疫检查点阻断治疗效果的策略 | 非小细胞肺癌患者CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、小鼠肺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,metaVIPER分析,体外细胞实验,动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 14例初治非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2025-11-11 |
Single-cell analysis unravels divergent gene signatures shaping seminoma stemness and metastasis
2025-Nov-07, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02802-4
PMID:41203637
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示精原细胞瘤干性与转移的分子特征 | 首次整合单细胞RNA测序、TCGA数据挖掘和细胞生物学实验,发现DPPA4/PSMA7高表达细胞具有高干性和转移特性,而PAGE5/SAT1高表达细胞特性相反 | 研究样本量有限,主要基于Tcam-2和NCCIT细胞系,需要更多临床样本验证 | 探索精原细胞瘤转移机制并开发转移风险分层工具 | 精原细胞瘤肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序, TCGA数据挖掘, 细胞生物学实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 细胞实验数据 | Tcam-2和NCCIT两种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-11-11 |
Single-cell RNA sequencing identifies potential critical prognostic biomarkers in bladder carcinoma
2025-Nov-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23975-z
PMID:41203683
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌的潜在关键预后生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据识别膀胱癌预后相关基因,并发现IGFBP5、KRT14和SERPINF1与不良生存结局相关 | 研究样本来源于公共数据库,需要进一步实验验证和临床队列验证 | 识别能够预测膀胱癌患者预后的遗传标志物 | 膀胱癌患者样本和膀胱癌细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据, 基因表达数据 | GSA-Human数据库中的膀胱癌样本和6种膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-11-11 |
Laminar CD34+ membranous cells with mechanosensitive properties in subcutaneous fascia of the abdominal midline
2025-Nov-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25651-8
PMID:41203776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在腹部中线皮下筋膜中发现了一种新型CD34+膜性细胞群 | 首次识别出具有机械敏感特性的CD34+膜性细胞群,揭示了其在筋膜中作为机械装置和信号枢纽的新功能 | 研究仅限于大鼠腹部中线皮下筋膜,人类样本和其他解剖部位尚未验证 | 探索筋膜精细结构和细胞组成,揭示新型细胞群的功能特性 | 大鼠腹部中线皮下筋膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,形态学验证,超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据,显微图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-11-11 |
Cucurbitacin E inhibits M1 macrophage polarization and attenuates rheumatoid arthritis: a multi-omics analysis and experimental validation
2025-Nov-07, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06332-8
PMID:41204223
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证探讨葫芦素E通过抑制M1巨噬细胞极化缓解类风湿性关节炎的作用机制 | 首次整合转录组学、单细胞测序和网络药理学多组学方法系统研究葫芦素E在类风湿性关节炎中的作用机制 | 需要进一步临床研究验证葫芦素E的治疗效果 | 探索葫芦素E在类风湿性关节炎中的治疗机制 | 类风湿性关节炎患者样本和巨噬细胞极化过程 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 转录组学, 单细胞测序, 网络药理学, 流式细胞术 | 机器学习, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-11-11 |
Multi-omics analyses identify mannose phosphate isomerase-centered hypoxia-induced angiogenesis signature in colorectal cancer
2025-Nov-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07291-8
PMID:41204349
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中缺氧诱导血管生成的转录调控机制,并鉴定出甘露糖磷酸异构酶(MPI)在这一过程中的关键作用 | 首次系统识别了12个HIFs转录激活的HIA相关基因,构建了HIAscore预后评分系统,并发现MPI通过LDHA相互作用激活JAK2/STAT3信号通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外实验验证,需要更多临床样本和机制研究进一步证实 | 探索结直肠癌中缺氧诱导血管生成的调控网络、分子机制和预后价值 | 结直肠癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微阵列, RT-qPCR, Co-IP, western blot, 集落形成实验, 管形成实验, 皮下异种移植瘤模型 | ssGSEA, SRGA, 共识聚类 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |