单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32431 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-12 |
Targeting bone marrow adipocyte-driven fatty acid metabolism to overcome drug resistance in lung cancer bone metastasis
2025-Nov-10, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03792-2
PMID:41214690
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研究论文 | 本研究探索骨髓脂肪细胞通过调节脂肪酸代谢促进肺癌骨转移耐药性的机制，并开发了一种靶向纳米颗粒治疗策略 | 首次揭示骨髓脂肪细胞驱动脂肪酸代谢重编程在肺癌骨转移耐药中的作用，并开发了具有骨靶向功能的酸性响应型纳米颗粒递送系统 | 研究主要基于体外共培养模型，需要进一步的体内实验验证 | 克服肺癌骨转移中的药物耐药性问题 | 肺癌骨转移微环境中的骨髓脂肪细胞和转移性肺癌细胞 | 癌症代谢研究 | 肺癌 | 单细胞测序, 体外共培养模型, 纳米颗粒递送系统 | NA | 单细胞测序数据, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-12 |
Analysis of the associations between DNA methylation and clinical features reveals the potential oncogenic effect of CFAP52 in esophageal squamous cell cancer
2025-Nov-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03934-4
PMID:41214700
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研究论文 | 本研究通过分析DNA甲基化与临床特征的关联，揭示了CFAP52在食管鳞癌中的潜在致癌作用 | 首次系统分析ESCC中DNA甲基化与性别、饮酒等临床特征的关联，并发现CFAP52作为新的癌基因通过影响花生四烯酸代谢促进ESCC进展 | 研究主要基于公共数据库和细胞实验，需要更多临床样本和体内实验验证 | 探索DNA甲基化在食管鳞癌发展中的潜在作用机制 | 食管鳞癌患者数据、ESCC细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | DNA甲基化分析,RNA-seq,单细胞RNA-seq,Western blot,UPLC-MS/MS,免疫组化 | Cox回归,共识聚类 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据,代谢组数据 | TCGA ESCA队列数据,多个GEO数据集(GSE53624,GSE160269,GSE203115) | Illumina | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-11-12 |
Hypoxia-induced regional heterogeneity in proliferative vitreoretinopathy: implications for targeted therapies
2025-Nov-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6494
PMID:41215615
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和免疫荧光染色揭示了增殖性玻璃体视网膜病变存在视网膜位置依赖的细胞病理学异质性 | 首次发现PVR病变存在视网膜区域异质性，不同位置由不同细胞类型主导且具有不同的缺氧通路选择 | 研究主要基于手术切除的PVR膜样本，动物模型为dispase诱导的视网膜损伤模型 | 探究增殖性玻璃体视网膜病变的病理机制并开发靶向治疗策略 | 手术切除的PVR膜样本和dispase诱导视网膜损伤的小鼠模型 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 手术切除的PVR膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-11-12 |
Identification and validation of stemness-related gene signatures to predict prognosis and immune infiltration in osteosarcoma reveals a critical role for S100A13
2025-Nov-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14939-7
PMID:41206435
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别骨肉瘤中高干性肿瘤细胞，建立预后模型并验证S100A13在骨肉瘤恶性进展中的关键作用 | 首次在骨肉瘤中识别高干性肿瘤细胞群并建立基于干性特征的预后模型，发现S100A13作为核心干性调控基因 | 研究主要基于细胞系验证，缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床样本验证 | 探索骨肉瘤细胞干性特征与预后及免疫浸润的关系，寻找潜在治疗靶点 | 骨肉瘤患者样本和骨肉瘤细胞系MG-63、HOS | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲降，集落形成实验，肿瘤球形成实验，伤口愈合实验，Transwell迁移和侵袭实验 | 预后风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 骨肉瘤患者样本和两种骨肉瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-12 |
Transcriptional and post-transcriptional convergence of HES1 and IGF2BP2 sustains CSF2-dependent metabolic adaptability in gastric Cancer
2025-Nov-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112234
PMID:41213416
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研究论文 | 本研究揭示了HES1-IGF2BP2-CSF2信号轴通过调控m6A修饰和糖酵解重编程促进胃癌进展的机制 | 首次发现HES1转录因子与IGF2BP2介导的m6A表观转录组学和代谢重编程的整合信号级联 | NA | 阐明驱动胃癌进展的层级信号轴机制 | 胃癌细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序,染色质免疫沉淀,双荧光素酶报告实验,RNA免疫沉淀 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-12 |
CPE/HYOU1 axis-activated Hippo-YAP signaling pathway suppresses PANoptosis to facilitate osteosarcoma progression
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218121
PMID:41213463
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组数据分析，鉴定出骨肉瘤中PANoptosis相关的预后生物标志物，并揭示了CPE/HYOU1轴通过激活Hippo-YAP信号通路抑制PANoptosis促进骨肉瘤进展的机制 | 首次发现CPE通过增强HYOU1蛋白稳定性并激活Hippo-YAP信号通路来抑制PANoptosis，从而促进骨肉瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 鉴定骨肉瘤中PANoptosis相关的预后生物标志物并阐明其下游调控机制 | 骨肉瘤细胞和肿瘤组织 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序，批量RNA测序，免疫荧光，流式细胞术，western blot，异种移植肿瘤实验 | 预后特征模型 | 转录组数据，实验数据 | 公共数据库中的骨肉瘤样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-12 |
Radiation-induced Glioblastoma Stem Cell-mediated T Cell Exhaustion via EGR1-Gal3-LAG3 Axis in Glioblastoma
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218125
PMID:41213464
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过EGR1-Gal3-LAG3轴诱导胶质母细胞瘤干细胞介导T细胞耗竭的新机制 | 首次发现放疗通过转录因子EGR1上调胶质瘤干细胞中Gal3表达，进而通过LAG3介导T细胞耗竭的分子轴 | 研究主要基于动物模型，临床转化仍需验证 | 探究放疗后胶质母细胞瘤干细胞与T细胞相互作用的演变机制 | 胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤浸润T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，动物模型实验 | 原位异种移植小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 复发和新诊断胶质母细胞瘤患者的T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-11-12 |
KLF7 as a biomarker in the pre-metastatic state promotes colorectal liver metastasis via TGFβ autocrine signaling
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218123
PMID:41213461
|
研究论文 | 本研究通过机器学习鉴定结直肠癌转移前状态细胞亚群，发现KLF7通过TGFβ自分泌信号促进肝转移 | 首次系统定义转移前状态细胞亚群PMS1和PMS2，并揭示KLF7作为关键生物标志物通过TGFβ自分泌信号驱动转移的机制 | 未明确说明样本规模和具体实验模型的局限性 | 鉴定结直肠癌转移前状态细胞的生物标志物并阐明其转移机制 | 结直肠癌细胞系、转移前状态细胞亚群 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 机器学习、生物信息学分析、双荧光素酶报告实验、体外和体内实验 | 机器学习模型 | RNA测序数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell sequencing, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 49 | 2025-11-12 |
Single-cell deconstruction of medulloblastoma microenvironment elucidates subtype-specific immune architectures and prognostic molecular signatures
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218126
PMID:41213462
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析髓母细胞瘤微环境的亚型特异性免疫结构特征 | 首次构建髓母细胞瘤亚型特异性肿瘤微环境综合图谱，揭示免疫抑制微环境形成机制 | 样本量相对有限（38例标本），需要更大队列验证 | 解析髓母细胞瘤肿瘤微环境的异质性特征 | 38例髓母细胞瘤标本 | 单细胞转录组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | 伪时间轨迹分析, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 38例髓母细胞瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-11-12 |
Oligo-CALL: A next-generation barcoding platform for studying resistance to targeted therapy
2025-Nov-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw9990
PMID:41202131
|
研究论文 | 开发了一种名为Oligo-CALL的新型细胞条形码平台，用于研究靶向治疗耐药性 | 开发了Oligo-CALL平台，实现了高效的谱系追踪、活克隆分离以及与单细胞RNA测序的无缝整合 | NA | 研究靶向治疗耐药性的分子机制和谱系演化 | 肺癌细胞 | 单细胞多组学 | 肺癌 | CRISPR-based cellular barcoding, single-cell RNA sequencing | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | Oligo-CALL | 寡核苷酸诱导的CRISPR转录激活因子辅助谱系标记平台 |
| 51 | 2025-11-12 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
|
研究论文 | 提出一种名为TransST的迁移学习框架，用于提升空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 通过迁移学习自适应利用外部细胞标记信息来改善空间转录组数据分析 | NA | 开发空间转录组数据分析方法以更可靠地提取生物信号 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-12 |
Multi-omics Mendelian randomization and single-cell analysis identify novel therapeutic targets for osteosarcopenia
2025-Nov-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf228
PMID:41071635
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化和单细胞分析识别骨肌减少症的新型治疗靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化与单细胞RNA测序技术系统识别骨肌减少症的因果分子靶点 | 需要进一步在特定组织和细胞环境中验证这些靶点的功能 | 识别骨肌减少症的潜在治疗靶点 | 骨肌减少症相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 老年疾病 | 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 基因组,转录组,蛋白质组数据 | eQTLgen、deCODE和Fenland三个大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-12 |
Multiplexed RNA imaging and in situ profiling in living cells
2025-Nov-06, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06220a
PMID:41210282
|
综述 | 本文探讨活细胞中多重RNA成像与原位分析技术的最新进展及其在RNA生物学研究中的应用 | 开发了能够在活细胞中进行多重RNA成像的先进荧光探针技术，实现RNA定位、相互作用和浓度变化的实时监测 | 传统空间转录组技术需要细胞固定和透化处理，只能提供静态快照 | 推进时空RNA分析技术，追踪RNA动态变化并揭示多种RNA物种间的时间关系 | 活细胞中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 多重RNA成像，荧光原位杂交，测序 | NA | RNA表达谱，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA分析，多重成像 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-12 |
CellSP enables module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Nov-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08891-2
PMID:41193576
|
研究论文 | 本文提出了CellSP计算框架，用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 | 引入了'基因-细胞模块'概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布的基因集 | NA | 开发能够识别和解释亚细胞转录空间分布功能模式的工具 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | 多种组织和技术的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-12 |
Multi-Omics Advances in Major Depressive Disorder for Molecular Insights, Biomarker Discovery, and Therapeutic Development
2025-Nov-05, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.1075
PMID:41213078
|
综述 | 本文综述了多组学技术在重度抑郁症研究中的最新进展，包括分子机制解析、生物标志物发现和治疗方法开发 | 整合多组学方法与计算系统生物学，将多组学信号转化为候选生物标志物和机制导向疗法 | 讨论了当前研究的局限性和转化优先事项 | 通过多组学方法解析重度抑郁症的多因素病因学并开发精准精神病学方法 | 重度抑郁症的分子机制、生物标志物和治疗方法 | 自然语言处理 | 精神疾病 | GWAS、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | AI驱动的网络建模 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-12 |
Serum response factor is essential for endometrial function and prevention of inflammatory fibrosis
2025-Nov-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2510060122
PMID:41150713
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研究论文 | 本研究揭示血清反应因子(SRF)对子宫内膜功能和防止炎症性纤维化的重要作用 | 首次发现SRF在子宫内膜中的关键功能及其在子宫内膜异位症中的失调机制 | 动物模型与人类疾病的差异可能限制结果的直接转化应用 | 探究SRF在子宫内膜功能和生殖成功中的分子机制 | 人类子宫内膜异位症患者组织、人子宫内膜基质细胞、条件性基因敲除小鼠 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 免疫组织化学分析、RNA干扰、单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、组织学图像 | 人类子宫内膜异位症患者组织样本和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-12 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
|
研究论文 | 提出了一种名为STORIES的新计算方法，通过最优传输学习空间转录组数据中的细胞命运景观 | 将最优传输扩展到空间转录组数据分析，学习空间感知的细胞分化潜能 | NA | 从多个时间点的空间转录组数据推断细胞命运轨迹 | 空间转录组数据，特别是蝾螈神经再生和小鼠胶质细胞生成过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输，神经网络 | 空间转录组数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 58 | 2025-11-12 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 通过连续去噪和语义特征整合，学习瞬态细胞状态并预测时间和条件下高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的反应，促进细胞命运决定调控原理的理解 | 细胞分化、基因扰动和药物反应预测，血管类器官发育，中子辐射和生长因子反应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-11-12 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Nov-03, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海鞘心脏咽部祖细胞在细胞周期进程中转录组成熟的动态过程及其对多谱系分化能力的调控机制 | 首次发现细胞周期驱动的转录组成熟过程赋予心脏咽部祖细胞多谱系分化能力，并提出'行为能力'新概念 | 研究基于海鞘模型，在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究心脏咽部祖细胞在发育过程中获得多谱系分化能力的分子机制 | 海鞘心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-12 |
MYEOV Is a Novel Marker of Differentiated Corneal Epithelium
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.7
PMID:41186354
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研究论文 | 本研究揭示了MYEOV作为角膜上皮分化标志物的特异性表达及其调控机制 | 首次发现MYEOV在KRT12阳性角膜上皮细胞中特异性高表达，且受PAX6和KLF4调控 | 研究主要基于体外实验和免疫染色分析，缺乏体内功能验证 | 表征MYEOV在人类眼表组织中的表达和调控机制 | 人类角膜上皮细胞和角膜组织 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | RNA测序，免疫染色，基因敲低，Western blot，细胞增殖检测 | NA | 图像，基因表达数据 | 人类角膜组织及体外培养的角膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |