单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32431 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-12 |
Investigating the Shared Genetic Architecture of 3 Age-Related Ocular Disorders
2026-Jan, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.100942
PMID:41211298
|
研究论文 | 本研究通过遗传关联分析和单细胞RNA测序探索了年龄相关性黄斑变性、白内障和原发性开角型青光眼三种年龄相关性眼病的共享遗传结构和因果关系 | 首次综合运用跨性状荟萃分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术系统揭示三种年龄相关性眼病的共享遗传机制和因果关系 | 依赖公开可用的GWAS数据库数据，可能存在样本选择偏差 | 探索年龄相关性眼病的共享遗传结构和分子机制 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)、白内障和原发性开角型青光眼(POAG)患者 | 生物信息学 | 年龄相关性眼病 | GWAS, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组关联数据, 单细胞转录组数据 | 来自公开GWAS数据库的三种眼病相关数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-11-12 |
Effects of esketamine on electrophysiology and metabolic reprogramming in brain organoids: insights into antidepressant mechanisms
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03198-4
PMID:40885845
|
研究论文 | 研究艾氯胺酮对脑类器官电生理和代谢重编程的影响，揭示其抗抑郁作用机制 | 首次使用人源脑类器官模型系统研究艾氯胺酮对电生理和代谢的浓度与时间依赖性影响，揭示其通过能量代谢途径调节NMDAR活性的新机制 | 研究仅使用脑类器官模型，尚未在完整生物体中进行验证 | 探究艾氯胺酮的抗抑郁作用机制 | 健康对照和抑郁症患者iPSC来源的脑类器官 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序，电生理记录，代谢分析 | 脑类器官模型 | 电生理数据，基因表达数据，代谢数据 | 健康对照和抑郁症患者iPSC来源的脑类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-12 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-Dec, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
|
研究论文 | 本研究通过小鼠股骨近端骨折模型探讨年龄对骨折愈合的影响 | 首次在年轻和中年小鼠中系统比较股骨近端骨折愈合差异，并发现衰老细胞和SASP因子在年龄相关骨折愈合延迟中的作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，结果可能不适用于雌性或其他品系小鼠 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折模型的影响，验证该模型用于研究年龄相关骨折愈合延迟分子机制的适用性 | 12周和52周龄雄性C57BL/6J小鼠 | 骨生物学 | 骨质疏松性骨折 | 多重细胞因子分析, μCT分析, 组织形态计量学, 免疫染色, 空间转录组学 | NA | 图像, 分子表达数据, 组织学数据 | 年轻和中年雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-12 |
Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain
2025-Dec, Orthodontics & craniofacial research
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/ocr.70036
PMID:41002069
|
研究论文 | 本研究通过时间序列转录组学分析鉴定出黄嘌呤脱氢酶(Xdh)在正畸疼痛损伤神经元中的表达及其作用机制 | 首次发现Xdh在Atf3+损伤神经元中的特异性表达与正畸疼痛峰值相关，并开发了用户友好的OTMPTGTA网络平台供研究人员探索差异表达基因 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类中的适用性 | 探索正畸牙齿移动疼痛的分子和细胞机制 | 小鼠三叉神经节组织和神经元 | 转录组学 | 疼痛疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-11-12 |
Bioinformatics driven in gene targeting platform for gold anticancer strategy delivery
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102438
PMID:41209699
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别TNBC关键基因SDC1，并开发了金纳米簇靶向核酸递送系统抑制肿瘤血管生成 | 首次构建基于SDC1 shRNA的自反应金纳米簇核酸递送系统，通过多维调控肿瘤微环境抑制TNBC进展 | 研究主要基于基因芯片和单细胞测序数据，需要进一步体内实验验证 | 发现新的靶向基因并开发核酸递送系统用于三阴性乳腺癌治疗 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 基因芯片分析, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-11-12 |
Probiotics derived sodium benzoate improves social behavior of offspring exposed in the maternal immune activation through regulation of histone lysine benzoylation in astrocytes
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03164-0
PMID:40855005
|
研究论文 | 本研究探讨益生菌衍生的苯甲酸钠通过调节星形胶质细胞中组蛋白赖氨酸苯甲酰化改善母体免疫激活所致自闭症模型子代社会行为的机制 | 首次揭示益生菌来源的苯甲酸钠通过表观遗传修饰H3K27苯甲酰化调控星形胶质细胞Cxcl16基因表达，改善自闭症社会行为的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化需要进一步验证 | 探究益生菌及其代谢产物在自闭症治疗中的作用机制 | 自闭症模型小鼠及其星形胶质细胞 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,Cut & Tag分析 | 母体免疫激活诱导的自闭症小鼠模型 | 基因表达数据,表观遗传数据 | 自闭症队列儿童和MIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,表观遗传分析 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-12 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食调控中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群，并揭示其在摄食调控中的急性作用 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型，在成年动物和更复杂行为中的验证仍需进一步研究 | 定义斑马鱼侧下丘脑神经元的分子和细胞特征，识别脊椎动物间保守的细胞类型，并研究其在食欲调控中的作用 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序，比较转录组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元（食物剥夺和旺盛摄食状态） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法（活性依赖性转录特征捕获） |
| 8 | 2025-11-12 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
|
研究论文 | 本研究探讨昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键分子连接，并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 基因工程小鼠模型中的侵袭性乳腺癌 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫染色图像,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-11-12 |
Multi-tissue spatial transcriptomics identified simultaneous responses to oxidative stress and apoptosis in parallel with tissue-specific reprogramming in modeled chronic kidney disease-mineral and bone disorder
2025-Dec, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf161
PMID:41216610
|
研究论文 | 本研究采用多组织空间转录组学方法，在慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱模型中识别了氧化应激和凋亡的同步响应以及组织特异性重编程 | 首次在CKD-MBD模型中应用多组织空间转录组学方法，同时分析皮质骨、肌肉和骨髓的组织特异性和共同基因组重编程 | 研究仅使用雄性小鼠模型，样本量有限，且为饮食诱导的CKD-MBD模型 | 识别慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱中的多组织转录组变化 | 雄性小鼠的股骨-肌肉组织切片（皮质骨、肌肉和骨髓） | 空间转录组学 | 慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱 | 空间转录组学，qPCR | 均匀流形逼近与投影分析 | 空间转录组数据，基因表达数据 | 腺嘌呤饮食诱导的CKD-MBD雄性小鼠和酪蛋白对照饮食组 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术 |
| 10 | 2025-11-12 |
Mapping atherogenesis mechanisms in smooth muscle cells by targeting genes linked to coronary artery disease
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113698
PMID:41210961
|
研究论文 | 本研究结合冠状动脉疾病GWAS与单细胞RNA测序，识别平滑肌细胞中20个风险基因，并通过扰动实验揭示其共同调控的转录程序 | 首次将CAD GWAS与动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序相结合，通过效应方向性分析揭示风险基因对胆固醇信号通路的差异化调控 | 研究主要聚焦于平滑肌细胞，未全面评估其他血管细胞类型的作用 | 解析冠状动脉疾病中平滑肌细胞的致病机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及SMC来源的间充质细胞 | 单细胞基因组学 | 冠状动脉疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-12 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CHD7通过SOX5介导的自我激活机制调控心脏神经嵴细胞分化的新机制 | 首次发现CHD7通过与SOX5在上游增强子相互作用实现自我激活，并证明SOX5过表达可挽救CHD7单倍体不足引起的心肌细胞分化缺陷 | 研究主要基于体外细胞培养模型，需要进一步在体内验证SOX5-CHD7轴的治疗潜力 | 探究CHARGE综合征相关先天性心脏缺陷的分子机制 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-11-12 |
Early female germline development in Xenopus laevis: Stem cells, nurse cells, and germline cysts
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2522343122
PMID:41213017
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术重建了非洲爪蟾早期雌性生殖系发育过程 | 首次在非哺乳动物脊椎动物中鉴定出具有神经元特征和转座子沉默基因的生殖系干细胞群体，并揭示了囊泡结构和功能的进化保守性 | 研究仅限于非洲爪蟾模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究非哺乳动物脊椎动物雌性生殖系发育过程中囊泡结构和功能的进化保守性 | 非洲爪蟾雌性生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，高分辨率成像 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-12 |
Periaortic lymphatic vessels protect against thoracic aortic dissection through mobilizing immune response
2025-Nov-11, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf215
PMID:41213294
|
研究论文 | 本研究揭示了主动脉周围淋巴管通过CXCL12-CXCR4信号通路招募免疫细胞，从而抑制胸主动脉夹层进展的保护机制 | 首次发现气管支气管淋巴结是胸主动脉的主要引流淋巴结，并阐明淋巴管通过CXCL12-CXCR4信号介导免疫反应在胸主动脉夹层中的保护作用 | NA | 探讨淋巴管在胸主动脉夹层发病机制中的作用 | 胸主动脉夹层患者组织样本和小鼠模型 | NA | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，组织透明化技术，荧光示踪剂 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-12 |
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516580
PMID:41216859
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，发现SLPI表达的AT2样细胞在肺腺癌侵袭边缘驱动肿瘤进展 | 首次识别出位于肿瘤侵袭边缘的SLPI表达AT2样细胞亚群，揭示了其通过Wnt通路激活和基质互作协调肺腺癌侵袭的空间机制 | NA | 阐明肺腺癌侵袭过程中的细胞类型、空间分布和功能互作机制 | 肺腺癌肿瘤微环境中的SLPI表达AT2样细胞、MRC1表达组织驻留巨噬细胞和癌症相关肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-11-12 |
Integrating Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Differentially Expressed Gene Analyses to Prioritize Dynamic Immune-Related Drug Targets for Cancers
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507451
PMID:41216857
|
研究论文 | 开发MR-DEG框架整合孟德尔随机化和差异表达基因分析，优先筛选癌症免疫相关动态药物靶点 | 首次将单细胞转录组孟德尔随机化与差异表达基因分析相结合，解决多效性偏倚问题 | 仅分析CD4+ T细胞活化过程中的基因表达，未涵盖其他免疫细胞类型 | 优先筛选癌症免疫相关药物靶点 | CD4+ T细胞活化过程中的11,021个动态基因表达谱与六种癌症类型的关联 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化分析 | MR-DEG框架 | 单细胞表达数量性状位点数据，基因表达数据 | 11,021个基因表达谱与六种癌症类型的关联分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-11-12 |
ZFPL1 Promotes Colorectal Cancer Progression by Stabilizing ASS1 to Drive the Urea Cycle and M2 Macrophage-Mediated Metastatic Colonization
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505291
PMID:41216870
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现ZFPL1通过稳定ASS1激活尿素循环并调控M2巨噬细胞介导的转移定植，从而促进结直肠癌进展 | 首次揭示ZFPL1通过直接结合ASS1防止其泛素化降解来激活尿素循环代谢的新机制，并发现Salvianolic acid B可作为ZFPL1抑制剂与免疫疗法协同作用 | NA | 探究ZFPL1在结直肠癌进展中的分子机制及治疗潜力 | 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,虚拟筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据,多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-12 |
Pair-rule-like transcription patterns during neural tube closure in a proto-vertebrate
2025-Nov-11, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205064
PMID:41217384
|
研究论文 | 本研究在尾索动物海鞘中发现Lmx1、Cdkn1b和Msx基因构成的转录调控网络通过配对规则样表达模式协调神经管闭合过程中的细胞增殖与融合 | 首次在脊椎动物近缘物种中发现神经管闭合过程中存在配对规则样转录模式，揭示了Lmx1-Cdkn1b-Msx转录回路调控背侧中线动力学的新机制 | 研究仅限于海鞘模型，在更高等脊椎动物中的保守性尚未验证 | 探究神经管闭合过程中转录程序的调控机制 | 尾索动物海鞘(Ciona)的神经管闭合过程 | 发育生物学 | NA | HCR原位杂交，单细胞RNA测序，错误表达实验 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-11-12 |
Unveiling the toxicological impact of cigarette smoke exposure on chronic obstructive pulmonary disease: integrated insights from network toxicology and multi-omics
2025-Nov-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04783-8
PMID:41217457
|
研究论文 | 本研究整合网络毒理学、多组学分析和实验验证，揭示香烟烟雾暴露通过特定化合物和枢纽基因导致慢性阻塞性肺疾病的发病机制 | 首次系统整合网络毒理学、多组学分析和实验验证，构建香烟烟雾诱导慢性阻塞性肺疾病的化合物-靶点-疾病网络 | 研究主要基于数据库预测和动物实验，需要进一步临床验证 | 阐明香烟烟雾暴露诱导慢性阻塞性肺疾病的系统毒理学机制 | 香烟烟雾中的有害化合物及其与慢性阻塞性肺疾病相关的基因靶点 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 网络毒理学, 多组学分析, 分子对接, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 随机森林(RF), 支持向量机递归特征消除(SVM-RFE), LASSO | 基因组数据, 转录组数据 | 涉及93种香烟有害化合物的筛选和28个致病基因的鉴定 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-12 |
Identification of plasma cell infiltration-related gene signatures as a novel prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01907-5
PMID:41217528
|
研究论文 | 本研究通过识别与浆细胞浸润相关的关键基因，构建了肾透明细胞癌的新型预后预测模型 | 首次发现9个与浆细胞浸润相关的枢纽基因，并基于此构建了PC评分预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 开发肾透明细胞癌的预后预测模型 | 肾透明细胞癌患者 | 机器学习 | 肾癌 | 机器学习，单细胞测序 | 预后预测模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和ArrayExpress数据库的KIRC患者数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-12 |
Platelet CKB as a potential contributor to serum creatine kinase abnormalities and metastasis in cancer patients
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01912-8
PMID:41217562
|
研究论文 | 本研究探讨了癌症患者血清肌酸激酶异常现象，发现血小板中的CKB可能促进癌症转移 | 首次揭示血小板CKB与癌症转移的潜在关联，并开发了整合CK-BB和线粒体CK的复合指数 | 研究主要基于回顾性队列和公共数据集，需要进一步实验验证机制 | 探究癌症患者血清肌酸激酶异常现象的分子机制及其与肿瘤生物学的关系 | 癌症患者（结直肠癌和肺癌）的血清样本、血小板样本及公共RNA测序数据集 | 癌症生物学 | 肺癌, 结直肠癌 | qRT-PCR, RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清CK同工酶电泳 | NA | RNA测序数据, 单细胞数据, 电泳数据, 临床数据 | 1,651例癌症患者回顾性队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |