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当前共找到 32431 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-12 |
PRTS: Predicting Single-Cell Spatial Transcriptomic Maps from Histological Images
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0961
PMID:41210658
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研究论文 | 提出PRTS框架，能够直接从组织学图像预测单细胞分辨率空间转录组数据 | 首次实现仅使用H&E染色组织图像就能准确预测细胞水平转录组数据，将分析单元数量提升约27倍 | NA | 开发从组织学图像预测空间转录组数据的方法，降低空间转录组技术的应用成本 | 组织切片中的细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，组织学图像分析 | NA | 图像，空间转录组数据 | 每个组织切片约60,000个可分析细胞区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-11-12 |
Exploring the Glycolytic Mechanisms in "Driver Gene-Negative" Lung Adenocarcinoma (LUAD): A Single-Cell RNA Sequencing Approach to Identify the MIF-HIF-1α Axis
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.119149
PMID:41210694
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索驱动基因阴性肺腺癌的糖酵解机制，发现MIF-HIF-1α轴在糖酵解过程中的关键作用 | 首次在驱动基因阴性LUAD中发现MIF-HIF-1α正反馈调控轴，揭示了该亚型肿瘤的糖代谢重编程机制 | 样本量相对有限（49例患者），需要更大规模研究验证 | 阐明驱动基因阴性肺腺癌中糖酵解通路的作用，识别关键基因和潜在治疗靶点 | 驱动基因阴性肺腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫印迹, 基因集富集分析 | 风险评分模型, Seurat分析流程 | RNA测序数据 | 49例驱动基因阴性肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-11-12 |
Identification and validation of the important role of tryptophan-related gene CYP1B1 in the development and progression of sepsis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335944
PMID:41212877
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，发现色氨酸代谢相关基因CYP1B1在脓毒症发展中起重要作用 | 首次揭示CYP1B1基因在脓毒症单核细胞中的关键作用及其通过色氨酸代谢促进疾病进展的机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验，需要更多临床样本和体内实验验证 | 探讨色氨酸代谢在脓毒症免疫特征中的功能 | 脓毒症患者血液样本RNA数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, RT-qPCR, transwell assays, western blot, immunofluorescence staining, 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE28750、GSE65682、GSE69528和GSE137342数据集的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-11-12 |
Integrative machine learning and multi-omics framework identifies shared biomarkers for rheumatoid arthritis and ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336243
PMID:41212891
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学方法识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享生物标志物 | 首次采用包含12种算法和交叉验证的机器学习框架识别RA和UC的共享生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证其细胞定位 | 使用公共数据集进行分析，样本来源可能有限；研究结果需要在更大样本中进一步验证 | 识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享诊断生物标志物 | 类风湿关节炎和溃疡性结肠炎患者基因表达数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 基因表达分析 | 机器学习集成框架 | 基因表达数据 | 公共基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-12 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Aberrant Expression of Immune-Related Genes and Transcriptional Regulation of NK Cells in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025, Critical reviews in immunology
IF:0.8Q4
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示慢性阻塞性肺疾病中NK细胞的免疫相关基因异常表达及转录调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统分析COPD患者NK细胞中免疫相关基因的表达特征及转录调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探究COPD患者NK细胞中免疫相关基因的表达模式及其转录调控机制 | COPD患者的肺组织样本和NK细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 生物信息学分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-12 |
Single cell deciphering of pruritic keloids: the interaction between fibroblasts and Schwann cells through the Midkine signaling
2025, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkaf057
PMID:41216187
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了瘢痕疙瘩中成纤维细胞与雪旺细胞通过Midkine信号通路的相互作用机制 | 首次发现Midkine在瘢痕疙瘩疼痛和瘙痒中的关键作用，并阐明其通过促进雪旺细胞修复表型转化导致神经轴突生成的机制 | 未明确说明样本数量和研究人群特征 | 探索成纤维细胞和雪旺细胞在瘙痒性和疼痛性瘢痕疙瘩中的潜在作用 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞和雪旺细胞 | 单细胞测序分析 | 皮肤纤维增生性疾病 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-11-12 |
Different metabolic paradigms and distribution of regulatory T cells between primary and lymph node metastasis prostate cancer
2025, CytoJournal
IF:2.5Q2
DOI:10.25259/Cytojournal_44_2025
PMID:41216232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析比较了原发性前列腺癌和淋巴结转移灶中调节性T细胞的代谢特征和分布差异 | 首次在单细胞水平揭示前列腺癌原发灶与转移灶中Treg细胞的代谢重编程差异及其与淋巴转移的关系 | 样本量有限，需要更大规模研究验证Treg作为转移风险生物标志物的可靠性 | 探究前列腺癌原发灶与淋巴结转移灶中调节性T细胞的代谢特征和分布差异 | 前列腺癌患者原发肿瘤组织和淋巴结转移组织 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | 未明确具体样本数量，包括原发前列腺癌和淋巴结转移样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2025-11-12 |
Development of a novel prognostic prediction model using mitochondrial-related genes and single-cell sequencing data for colorectal carcinoma
2025, Translational gastroenterology and hepatology
IF:3.8Q2
DOI:10.21037/tgh-25-89
PMID:41216283
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于线粒体相关基因和单细胞测序数据的结直肠癌预后预测模型 | 首次系统性评估线粒体基因在结直肠癌中的预后价值，并构建了基于五个关键线粒体基因的风险评分系统 | 需要在更广泛的患者队列中验证研究结果，并探索已识别线粒体基因的治疗潜力 | 系统研究线粒体基因在结直肠癌中的预后潜力，开发可靠的风险评分模型 | 结直肠癌患者及其组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，差异基因表达分析，基因集富集分析，通路分析，Cox比例风险回归分析 | Cox比例风险回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库结直肠癌组织数据，外部验证集GSE17536队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-11-12 |
Decoding the Prognosis-Related S100A9high Monocyte in Glioblastoma Using Single-Cell and Spatial Transcriptome Sequencing
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S553018
PMID:41216330
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组测序技术解析了胶质母细胞瘤中与预后相关的S100A9高表达单核细胞亚群 | 首次从配体-受体网络角度识别胶质母细胞瘤亚型，并发现预后不良的C3亚型富含S100A9high单核细胞，揭示了其空间分布特征和免疫抑制功能 | NA | 阐明胶质母细胞瘤中单核细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 胶质母细胞瘤中的单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,免疫荧光,T细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-11-12 |
BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences
2024-12-18, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01906-9
PMID:39696694
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研究论文 | 本研究探讨了利鲁唑通过增加BDNF水平逆转颅脑放疗诱导的认知衰退和神经退行性后果 | 首次证明FDA批准的ALS药物利鲁唑可通过增加BDNF水平逆转放疗诱导的认知功能障碍，并利用空间转录组学揭示其神经保护机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人体验证；未评估神经发生的影响 | 评估利鲁唑对放疗诱导认知功能障碍的治疗效果 | 成年小鼠模型（颅脑照射9 Gy） | 神经科学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学，双重免疫荧光染色，生化评估 | 动物模型 | 基因表达数据，免疫荧光图像，行为学数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-11-12 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中发现炎症-纤维化生态位，并证实IL-1β是疾病进展的关键驱动因子，为靶向治疗提供了新思路 | 研究样本量有限，主要基于患者心肌样本和基因工程小鼠模型 | 探究致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本、Desmoglein-2突变基因工程小鼠 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照供体的心肌样本，Desmoglein-2突变小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-11-12 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604718
PMID:39091743
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了心脏咽部祖细胞在细胞周期驱动下获得多谱系能力的转录组成熟过程 | 发现了细胞周期驱动的'转录组成熟'过程，揭示了G2期特异性基因表达与多谱系能力获得之间的耦合机制 | 研究主要基于海鞘模型，在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究多谱系能力的获得机制以及细胞命运决定与细胞周期进程的耦合关系 | 海鞘心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转基因样本条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-12 |
Structural and functional properties of mSWI/SNF chromatin remodeling complexes revealed through single-cell perturbation screens
2023-04-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.03.013
PMID:37028419
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研究论文 | 通过单细胞扰动筛选揭示mSWI/SNF染色质重塑复合物的结构和功能特性 | 首次结合Perturb-seq、CRISPR-Cas9敲除和单细胞多组学技术系统解析mSWI/SNF亚基功能 | NA | 解析mSWI/SNF染色质重塑复合物各亚基对基因表达的贡献 | 哺乳动物SWI/SNF染色质重塑复合物亚基 | 表观遗传学 | 癌症 | Perturb-seq, CRISPR-Cas9敲除, 单细胞RNA-seq, SHARE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-11 |
Computational identification of FOXP3-associated spatial prognostic markers in HCC via digital pathology
2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109119
PMID:41135296
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研究论文 | 通过数字病理学计算识别肝细胞癌中与FOXP3相关的空间预后标志物 | 首次在spot水平分辨率上计算识别空间差异基因，提供了一种经济高效且可扩展的空间生物标志物发现方法 | 样本量有限，统计功效可能不足，仅在白人患者亚组中验证了生存分析显著性 | 识别肝细胞癌中具有预后意义的空间标志物 | TCGA-LIHC队列的肝细胞癌患者数字病理切片 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，数字病理分析 | 计算流程，空间基因推断 | 数字病理图像，基因表达数据 | TCGA-LIHC队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-11 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
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研究论文 | 本研究揭示肠道微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控结肠上皮中兼具吸收和分泌特征的跨隐窝杯状细胞 | 首次发现非典型跨隐窝杯状细胞作为微生物响应性细胞群体，并阐明丁酸盐通过GPR109A受体调控该细胞数量的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞特性和功能 | 结肠上皮细胞、肠道微生物群、跨隐窝杯状细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序、抗生素微生物清除、无菌小鼠模型、定植实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-11-11 |
A Tertiary Lymphoid Structure-Related Gene Signature Predicts Prognosis and Treatment Response in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2646
PMID:41208844
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研究论文 | 开发并验证基于三级淋巴结构相关基因的特征用于预测肝细胞癌预后和治疗反应 | 首次建立六基因TLS特征评分系统，并在多个独立队列中验证其预测价值，结合单细胞RNA测序揭示免疫微环境机制 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要前瞻性研究验证 | 开发预测肝细胞癌预后和治疗反应的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，LASSO-Cox回归 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个独立肝细胞癌队列（包括接受TACE、PD-1/PD-L1抑制剂或乐伐替尼治疗的患者） | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-11 |
Analysis of the SH3-Domain Kinase Binding Protein 1 Predictive Model for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and CCCTC-Binding Factor Transcriptional Regulatory Study
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2668
PMID:41208840
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研究论文 | 通过多组学整合分析系统评估SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达模式、生物学功能及调控机制 | 首次通过机器学习算法结合多组学数据识别SH3KBP1作为胰腺癌关键预测生物标志物，并揭示CTCF转录因子对其的调控机制 | 样本量相对有限，需要更大规模验证研究 | 系统研究SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达特征、生物学功能及转录调控网络 | 胰腺导管腺癌肿瘤样本及癌旁正常组织 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR基因敲除,转录因子结合位点预测 | 支持向量机, LASSO回归, SHAP解释 | mRNA表达数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 | 179个PDAC肿瘤样本和171个癌旁样本（包括4个癌旁组织和167个正常对照），以及300对PDAC和非肿瘤样本的蛋白质组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学 | NA | 所有分析均在R平台上使用专业软件包进行 |
| 98 | 2025-11-11 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
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研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化框架结合神经病理学验证，探索外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关系及小胶质细胞相关调控网络 | 首次采用双向孟德尔随机化方法系统分析血浆、脑脊液和脑组织蛋白质与AD的因果关系，并通过单细胞转录组和神经病理学验证发现CTSH-GRN-TMEM106B和TREM2-IL-34小胶质细胞网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析，无法完全排除潜在混杂因素的影响 | 阐明外周生物标志物与中枢系统在阿尔茨海默病发生发展中的相互作用机制 | 阿尔茨海默病患者的外周生物标志物（血浆和脑脊液蛋白质）及人脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 单细胞转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 双向孟德尔随机化框架 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 神经病理学图像数据 | 734种血浆蛋白质, 151种脑脊液蛋白质, 1296种脑蛋白质, 人脑前额叶皮层单细胞转录组数据, AD尸检脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-11 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中paraptosis相关基因的景观及其与预后和免疫微环境的关联 | 首次系统描绘骨肉瘤中paraptosis相关基因景观，发现TNK2在paraptosis调控中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索paraptosis相关基因在骨肉瘤中的预后价值和免疫微环境特征 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,功能实验 | LASSO-Cox回归模型,共识聚类 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-11 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
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综述 | 探讨抗菌药物、双硫仑和二甲双胍在癌症治疗中的再利用潜力及RNA测序在机制研究中的作用 | 系统整合多类再利用药物并通过RNA测序技术揭示其抗癌机制，提出转录组学指导的精准用药策略 | 临床转化结果不一致，存在药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境等挑战 | 通过RNA测序技术填补抗癌药物再利用的机制空白 | 抗菌药物（阿奇霉素、克拉霉素等）、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |