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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-18 |
Integrative Mendelian randomization and spatial transcriptomics analysis reveals causal links between plasma lipidome and non-small cell lung cancer
2025-Nov-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03823-2
PMID:41239138
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和空间转录组学分析,揭示血浆脂质组与非小细胞肺癌之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化与空间转录组学,发现PVT1作为脂质相关关键基因在肿瘤密集区域高表达 | 基于汇总级GWAS数据,无法完全排除多效性偏倚 | 探讨血浆脂质组与非小细胞肺癌之间的潜在因果关系 | 非小细胞肺癌患者和健康人群 | 生物信息学 | 肺癌 | 孟德尔随机化, 空间转录组学, 机器学习基因优先排序 | 逆方差加权, MR-Egger, 加权中位数, MR-PRESSO | 基因组关联研究汇总数据, 空间转录组数据 | 基于GeneRISK和FinnGen GWAS的大规模样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-16 |
Correction: Single-cell RNA sequencing unveils Lrg1's role in cerebral ischemia‒reperfusion injury by modulating various cells
2025-Nov-14, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03610-4
PMID:41239358
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-11-18 |
Aldolase a in pan-cancer and lung squamous cell carcinoma: prognostic value and macrophage-driven immune suppression unveiled by multi-omics and cohort validation
2025-Nov-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04043-y
PMID:41239433
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和队列验证揭示了醛缩酶A在泛癌和肺鳞癌中的预后价值及其通过巨噬细胞驱动的免疫抑制机制 | 首次系统评估ALDOA在肺鳞癌中的预后价值,并通过空间转录组学和免疫荧光证实其与肿瘤相关巨噬细胞的共定位关系 | 机制研究仍需进一步深入,治疗干预策略需要更多实验验证 | 探究ALDOA在肺鳞癌中的预后价值和其在巨噬细胞介导的免疫抑制中的作用 | 泛癌数据集和肺鳞癌患者组织样本 | 生物信息学 | 肺鳞癌 | 免疫组织化学染色,单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光染色 | 生物信息学算法 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,临床数据 | 多个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | TISCH2数据库 |
| 24 | 2025-11-18 |
Pan-cancer analysis identifies LMBR1L as a prognostic and immunological biomarker with validation in colorectal cancer
2025-Nov-14, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03404-7
PMID:41239456
|
研究论文 | 通过泛癌分析鉴定LMBR1L作为预后和免疫生物标志物,并在结直肠癌中进行实验验证 | 首次系统揭示LMBR1L在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗预测标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和结直肠癌模型,需要在更多癌种中进一步验证 | 探索LMBR1L在肿瘤免疫微环境中的功能及其临床意义 | 多种癌症组织和结直肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,生存分析,GSEA,GSVA,免疫浸润分析,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,临床样本数据 | 公共数据库中的多种癌症数据及结直肠癌临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-11-18 |
Intermediate filaments promote glioblastoma cell invasion by controlling nuclear deformations and mechanosensitive expression of MMP14
2025-Nov-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116553
PMID:41241939
|
研究论文 | 本研究揭示中间丝通过调控核变形和机械敏感性MMP14表达促进胶质母细胞瘤细胞侵袭的机制 | 首次发现中间丝通过缓冲压缩应力下的核变形来促进前导细胞侵袭,并揭示其与MMP14表达的机械敏感性调控关系 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探究中间丝在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-11-18 |
Dissecting macrophage heterogeneity in ulcerative colitis: Single-cell analysis and functional validation of S100A4 as a therapeutic target
2025-Nov-14, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115819
PMID:41242266
|
研究论文 | 通过单细胞分析结合功能验证,解析溃疡性结肠炎中巨噬细胞异质性并确定S100A4作为治疗靶点 | 首次在溃疡性结肠炎中系统鉴定五种巨噬细胞亚群,发现S100A8+和IL1B+巨噬细胞的非经典极化模式,并通过多算法机器学习验证S100A4的诊断和治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库和动物模型,需要进一步临床验证 | 解析溃疡性结肠炎中巨噬细胞异质性并验证潜在治疗靶点 | 健康对照、非炎症性溃疡性结肠炎和炎症性溃疡性结肠炎患者的结肠组织,DSS诱导结肠炎小鼠模型,RAW264.7巨噬细胞系 | 单细胞分析 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析,细胞间通讯分析,高维加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | 随机森林,其他八种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集,独立批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-11-18 |
Transcriptional and temporal heterogeneity of developing α cells revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152996
PMID:41242298
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示发育中α细胞的转录和时间异质性 | 使用时间分辨报告小鼠品系首次系统揭示α细胞发育过程中的转录动态和细胞异质性 | 研究主要基于小鼠模型,人类α细胞发育的异质性仍需验证 | 探索胰腺α细胞发育过程中的转录动态和细胞异质性 | 小鼠胰腺发育中的α细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Gcg-Timer胚胎细胞及两个独立发育阶段数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-11-18 |
Renal tubular-derived retinoic acid drives renal fibrosis via a RAI14-TRIOBP-YAP mechanotransduction axis
2025-Nov-14, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112246
PMID:41242366
|
研究论文 | 本研究揭示了肾小管来源的视黄酸通过RAI14-TRIOBP-YAP机械转导轴驱动肾纤维化的机制 | 首次发现肾小管损伤通过视黄酸信号激活间质成纤维细胞的机械转导通路,揭示了上皮-间质通讯的新机制 | 研究主要聚焦于肾纤维化模型,其他器官纤维化中的适用性需要进一步验证 | 探究视黄酸在肾纤维化中的作用机制及上皮-间质通讯的分子基础 | 肾小管上皮细胞和间质成纤维细胞 | 细胞生物学 | 肾纤维化疾病 | 空间代谢组学、单细胞转录组学、基因敲除 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-18 |
ATP6V1E1 and NDUFB5 identified as potential biomarkers for Alzheimer's disease through integrative analysis
2025-Nov-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148733
PMID:41242442
|
研究论文 | 通过整合分析识别ATP6V1E1和NDUFB5作为阿尔茨海默病的潜在生物标志物 | 首次通过整合分析发现ATP6V1E1和NDUFB5与AD发病机制相关,并揭示其与线粒体和溶酶体系统协同功能障碍的关联 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要在更大规模的人类队列中进一步验证 | 识别与氧化磷酸化相关的阿尔茨海默病生物标志物以实现早期干预 | 阿尔茨海默病患者颞叶和外周血样本、AD小鼠模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 多元逻辑回归, LASSO回归 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 多个独立队列的人类样本和AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-18 |
Transcriptomic profiling confirms microRNA-140 is more functional in joint development than in disease
2025-Nov-14, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.11.005
PMID:41242538
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析确认microRNA-140在关节发育中的功能比在骨关节炎疾病中更为重要 | 首次使用空间转录组学技术揭示miR-140-5p在静息软骨细胞和软骨膜中的特异性功能 | 研究仅使用小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;骨关节炎模型中miR-140-5p的影响较为有限 | 探究miR-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用,并识别新的miR-140-5p靶点 | Mir140基因敲除小鼠模型,包括骨骼发育和骨关节炎诱导模型 | 转录组学 | 骨关节炎 | RNA测序,空间转录组学,CRISPR-Cas9基因编辑,组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,空间基因表达数据,组织学图像 | 7日龄小鼠的肋软骨细胞和下肢生长板组织 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-18 |
Temporal single-cell landscape suggests infection-induced IgM plasma cells as a correlate of durable influenza immunity
2025-Nov-14, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.ijid.2025.108227
PMID:41242688
|
研究论文 | 通过单细胞技术比较自然感染与疫苗接种诱导的B细胞免疫应答差异 | 首次在单细胞层面系统比较流感自然感染与疫苗接种的B细胞应答差异,发现感染特异性诱导的IgM+浆细胞群体 | 样本量较小(7名受试者),仅针对H3N2流感病毒 | 探究自然感染相比疫苗接种能产生更持久流感免疫保护的细胞机制 | 人类B细胞 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞转录组测序,BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,BCR序列数据 | 150,131个B细胞,来自7名受试者(3名自然感染,4名疫苗接种) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-11-18 |
Glutamine metabolism reprogramming promotes bladder cancer progression via PYCR1: a multi-omics and functional validation study
2025-Nov-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07386-2
PMID:41233804
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能验证揭示了谷氨酰胺代谢重编程通过PYCR1促进膀胱癌进展的机制 | 首次构建基于谷氨酰胺代谢的预后模型GMscore,并发现PYCR1作为关键调控基因通过P5CS促进脯氨酸合成并激活PI3K/AKT/mTOR信号通路 | 未明确说明样本规模,研究主要聚焦于PYCR1机制,可能忽略其他代谢调控因子 | 探索谷氨酰胺代谢在膀胱癌中的临床意义及其与免疫治疗反应的关系 | 膀胱癌细胞系、患者队列数据、异种移植模型 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、批量转录组分析、随机森林分析、PCA | 预后模型GMscore、随机森林 | 代谢组数据、RNA测序数据、功能实验数据 | 多个患者队列(包括IMvigor210和GSE91061免疫治疗队列) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-18 |
The influence of oxygen concentration on the fate determination of retinal ganglion cells
2025-Nov-13, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110751
PMID:41241340
|
综述 | 本文综述了氧气浓度对视网膜神经节细胞命运决定的影响及其机制 | 系统比较了动物模型与人源类器官模型在模拟视网膜发育中的效能,并强调微流控等新技术在精确调控氧浓度中的应用 | NA | 探讨氧气浓度在视网膜神经节细胞发育和疾病中的作用机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 发育生物学 | 视神经疾病 | 微流控技术、类器官芯片、遗传扰动、细胞成像、单细胞转录组学、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-11-18 |
scRNA-sequencing Reveals Bu-Shen-Yi-Qi formula (BSYQF) ameliorates airway remodeling via regulating imbalanced M1/M2 macrophage subtypes in chronic asthmatic mice
2025-Nov-12, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120883
PMID:41237867
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示补肾益气方通过调节M1/M2巨噬细胞亚型失衡改善慢性哮喘小鼠气道重塑的作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统揭示补肾益气方通过调节巨噬细胞极化平衡改善哮喘气道重塑的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究补肾益气方治疗慢性哮喘的分子作用机制 | 慢性哮喘小鼠模型 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 组织图像数据 | 8个小鼠肺组织样本,超过60,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-18 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示骨髓细胞介导的干扰素信号传导导致肾细胞癌对免疫检查点阻断治疗的耐药机制 | 开发了推断性建模方法解析肿瘤微环境中细胞因子信号效应,首次发现骨髓细胞而非肿瘤细胞是干扰素驱动免疫治疗耐药的关键介质 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 研究干扰素信号在肾细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗疗效的影响 | 肾细胞癌患者的肿瘤免疫微环境 | 单细胞基因组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床试验队列的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-18 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Nov-11, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148990
PMID:41232892
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序分析,揭示克罗恩病中铜死亡相关蛋白的作用 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序数据系统分析铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用 | 需要进一步的实验验证这些关联性,并探索标记物作为治疗靶点的潜力 | 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用 | 克罗恩病炎症组织和对照组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序,RT-qPCR | 诊断模型 | 基因表达数据 | 494例组织样本和25,121个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-18 |
Atractylenolide III regulates Vitamin K1 metabolism to activate effector chondrocytes for ameliorating cartilage degeneration in KOA
2025-Nov-11, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157537
PMID:41242311
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示了白术内酯III通过调节维生素K1代谢激活效应软骨细胞,从而改善膝骨关节炎软骨退变的机制 | 首次发现白术内酯III通过调控ESR2/VK1/MMP9代谢轴改善软骨退变,并确认维生素K1代谢在软骨修复中的关键作用 | 研究主要聚焦早期膝骨关节炎,对晚期病变的适用性需进一步验证 | 探索白术内酯III治疗膝骨关节炎的潜在治疗机制 | 膝骨关节炎模型小鼠和体外培养的软骨细胞 | 多组学分析 | 膝骨关节炎 | 单细胞转录组学,非靶向代谢组学,分子对接,分子动力学模拟,流式细胞术 | NA | 转录组数据,代谢组数据,影像数据,组织染色数据 | 膝骨关节炎模型小鼠和体外软骨细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq,代谢组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-18 |
Genetic and Cellular Architecture of Breast Cancer Risk in Multi-Ancestry Studies of 159,297 Cases and 212,102 Controls
2025-Nov-07, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.20.25334075
PMID:40909829
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研究论文 | 本研究通过多祖先群体的全基因组关联分析,探索了乳腺癌的遗传结构和细胞特征 | 迄今为止规模最大的多祖先乳腺癌GWAS研究,整合单细胞RNA-seq图谱识别跨祖先共享的细胞类型关联 | 样本量在不同祖先群体间分布不均,某些群体间的遗传相关性估计存在较大标准误 | 探索乳腺癌在多祖先群体中的遗传结构和细胞基础 | 159,297例乳腺癌患者和212,102例对照,涵盖非洲、东亚、欧洲和西班牙/拉丁裔祖先群体 | 基因组学 | 乳腺癌 | GWAS, 单细胞RNA-seq | 稀疏正态混合效应模型 | 基因组关联汇总统计数据 | 159,297病例和212,102对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens单细胞RNA-seq图谱 |
| 39 | 2025-11-18 |
Single-cell resolution mapping of the immune modulation landscape induced by Chinese herb sanguisorbae radix
2025-Nov-07, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157528
PMID:41242310
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了中药地榆对人类免疫细胞的调节作用及其潜在机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示地榆对多种免疫细胞的异质性调节作用,并发现其通过增强线粒体自噬和抑制NF-κB信号通路发挥免疫调节功能 | 样本来源单一(仅人类PBMCs),未涉及动物模型验证;机制研究主要基于转录组数据,需要进一步功能实验验证 | 探究地榆对人类免疫系统的调节作用及分子机制 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 免疫调节相关疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, UPLC-MS/MS, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 同一人类受试者SR干预前后的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-11-18 |
Rs61731397-C in OR2A25 increases the risk of chronic rhinosinusitis in the Chinese population
2025-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.032
PMID:40669566
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析发现OR2A25基因中的rs61731397-C变异会增加中国人群慢性鼻窦炎的发病风险 | 首次在中国人群中鉴定出OR2A25基因变异与慢性鼻窦炎的关联,并通过功能实验证实该变异通过降低蛋白稳定性影响疾病发生 | 研究主要聚焦于中国人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别中国人群慢性鼻窦炎的遗传风险变异并阐明其作用机制 | 中国人群(昆山队列和北京队列) | 遗传学 | 慢性鼻窦炎 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序、结构预测、体外表达研究、Western blot分析 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 两个独立队列(昆山队列和北京队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |