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当前共找到 32431 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-12 |
Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the roles of neutrophils in pediatric Crohn's disease
2025-Nov, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-03961-x
PMID:40121337
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序揭示了中性粒细胞在儿童克罗恩病中的关键作用 | 首次在儿童克罗恩病中系统揭示中性粒细胞数量、功能状态和细胞间相互作用的改变，并识别出中性粒细胞特异性表达的潜在生物标志物 | 研究样本来源仅限于回肠和结肠活检样本，未涉及其他肠道部位或更大规模验证 | 探索儿童克罗恩病的分子机制，识别诊断生物标志物和治疗靶点 | 儿童克罗恩病患者、溃疡性结肠炎患者和健康对照的肠道活检样本 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-12 |
Insulin signalling-associated cell fate promotes neoplastic invasiveness in non-functioning pituitary gonadotroph adenoma via cis-regulatory elements activation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03122-1
PMID:40935899
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据揭示了胰岛素信号通路通过顺式调控元件激活促进无功能性垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的机制 | 首次发现胰岛素信号相关细胞命运驱动肿瘤侵袭性，并鉴定出SREBF1和IGF2BP2相关的顺式调控元件在染色质互作重构中的关键作用 | 样本量相对有限（3例单细胞测序患者），需要在更大队列中验证发现 | 探究无功能性垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的分子机制 | 无功能性垂体促性腺激素腺瘤患者组织和原代细胞系 | 单细胞多组学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 临床数据 | 3例NFGA患者（单细胞测序）+ 210例患者队列验证 + 3个原代细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-11-12 |
Glycans on non-structural protein 1 prevent premature T-cell mediated dengue virus clearance
2025-Nov, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00311-6
PMID:40962941
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研究论文 | 本研究揭示了登革病毒非结构蛋白1上N207位点糖基化通过PD-L1/PD-1轴调控T细胞凋亡的新型免疫逃逸机制 | 首次发现NS1蛋白N207位点糖基化通过抑制早期炎症反应和PD-L1/PD-1轴介导的T细胞凋亡来实现免疫逃逸 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类系统中验证 | 探究登革病毒NS1蛋白糖基化的生物学功能及其在免疫逃逸中的作用机制 | 登革病毒非结构蛋白1的糖基化位点及其对免疫应答的影响 | 病毒免疫学 | 登革热 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,细胞因子检测,免疫表型分析 | NA | 基因表达数据,细胞因子数据,免疫表型数据 | 临床相关小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-12 |
HIF-1α-induced microglia-mediated neuroinflammation is involved in Alzheimer's disease: Evidence from single-cell transcriptomic analysis
2025-Nov, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251378007
PMID:40971318
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了HIF-1α调控的小胶质细胞亚群在阿尔茨海默病神经炎症中的作用机制 | 首次发现并鉴定了一个具有炎症-血管生成转录特征的小胶质细胞亚群microglia_2，并证实HIF-1α是其关键转录调控因子 | 研究主要基于5×FAD小鼠模型，在人类患者中的验证仍需进一步深入 | 探究阿尔茨海默病中小胶质细胞亚群的多样性及其致病活性的调控机制 | AD患者样本和5×FAD小鼠模型中的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，SCENIC分析，伪时间轨迹分析 | NA | RNA测序数据 | AD患者和5×FAD小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-11-12 |
Img2ST-Net: efficient high-resolution spatial omics prediction from whole-slide histology images via fully convolutional image-to-image learning
2025-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.)
DOI:10.1117/1.JMI.12.6.061410
PMID:41210922
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研究论文 | 提出Img2ST-Net框架，通过全卷积图像到图像学习从全切片组织学图像高效预测高分辨率空间转录组数据 | 将高分辨率空间转录组数据建模为超像素表示，将任务重新定义为具有数百或数千个输出通道的超内容图像生成问题，并提出了专门针对高分辨率ST分析的SSIM-ST评估指标 | 仅在两个公共Visium HD数据集上进行了评估，需要更多数据集验证通用性 | 开发高效准确的高分辨率空间转录组数据预测方法 | 乳腺癌和结直肠癌组织样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌,结直肠癌 | 空间转录组学 | 全卷积神经网络 | 组织学图像,基因表达数据 | 两个公共Visium HD数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 8μm和16μm分辨率的Visium HD平台 |
| 66 | 2025-11-12 |
Injury-induced connexin 43 expression regulates endothelial wound healing
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00153.2025
PMID:41060772
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研究论文 | 本研究探讨了损伤诱导的连接蛋白43表达在调节内皮伤口愈合中的作用 | 首次证明大动脉内皮机械损伤诱导间隙连接蛋白Cx43表达，并揭示其通过ERK/MAPK信号通路调控内皮细胞迁移和增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类组织中验证 | 阐明Cx43在内皮伤口愈合中的分子机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 10,829个细胞来自野生型和Cx43敲除小鼠颈动脉 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-11-12 |
Curcumin-chitosan microspheres inhibit epithelial cell PANoptosis: analysis of key PANoptosis gene distribution via single-cell RNA sequencing and in vivo validation in ulcerative colitis mice
2025-Nov, General physiology and biophysics
IF:1.3Q4
DOI:10.4149/gpb_2025030
PMID:41217223
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内实验验证姜黄素-壳聚糖微球通过抑制上皮细胞PANoptosis改善溃疡性结肠炎 | 首次揭示姜黄素-壳聚糖微球通过调节肠上皮细胞PANoptosis缓解溃疡性结肠炎的机制 | 研究主要基于小鼠模型和Caco-2细胞系，需要进一步人体试验验证 | 探究姜黄素-壳聚糖微球对溃疡性结肠炎的治疗作用机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和Caco-2人结肠癌细胞系 | 单细胞测序分析 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 细胞活力检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 组织病理学数据 | 小鼠模型和Caco-2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-11-12 |
Application of CTC-derived spheroid for drug screening toward personalized treatment in patients with breast cancer
2025-Oct-27, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102573
PMID:41151488
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于循环肿瘤细胞(CTC)衍生球体的药物筛选平台，用于乳腺癌个性化治疗 | 首次将CTC计数、CTC衍生球体培养与药物筛选整合到临床可行的工作流程中，克服了组织依赖性类器官模型的局限性 | 样本量相对较小(34例)，仅针对乳腺癌患者 | 建立临床可行的CTC衍生球体药物筛选工作流程，实现乳腺癌个性化治疗 | 34例新诊断乳腺癌患者，其中13例接受系统治疗和复发的患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控技术、球体培养、药物筛选、空间转录组学 | CTC衍生球体模型 | 细胞计数、基因表达、突变谱、药物敏感性 | 34例乳腺癌患者，其中13例进行CTC球体药物筛选 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium in situ | Xenium原位分析平台 |
| 69 | 2025-11-12 |
The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease
2025-Oct-25, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103973
PMID:41145025
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞在重度牙周炎中的调控机制，重点关注NF-κB信号通路的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合hdWGCNA分析发现Nrf2转录因子在牙周炎中性粒细胞中的特异性表达，并证实NF-κB信号通路的关键调控作用 | 研究主要基于GEO数据库分析，实验验证部分仅限于LPS刺激的牙龈中性粒细胞模型 | 探索中性粒细胞在重度牙周炎中的调控机制 | 牙周炎患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA转录组测序, 实时PCR, 共免疫染色 | hdWGCNA, pySCENIC, ClusterProfiler | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 来自GEO数据库的单细胞和bulk RNA转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-11-12 |
Uncovering the Molecular Networks of Extracellular Vesicles in the Pathogenesis of Periodontitis
2025-Oct-24, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103936
PMID:41138693
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研究论文 | 通过整合多种组学数据揭示牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和因果遗传分析来系统研究牙周炎中的EV相关基因网络 | 需要进一步的实验验证 | 探索牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 牙周炎患者组织、外周血和糖尿病共病牙周炎病例 | 生物信息学 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 因果遗传分析, 药物重定位, 分子对接 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-11-12 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-Oct-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
|
研究论文 | 本文提出了一种标准化方案，用于系统收集和处理体外受精患者卵泡液、卵泡体细胞及未成熟卵母细胞 | 开发了无需酶解脱颗粒细胞的微解剖技术保持转录组完整性，建立了从新鲜卵泡液制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | NA | 利用被丢弃的生殖组织开展人类生育和生殖生物学转化研究 | 接受取卵手术女性的卵泡内容物（卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞和体细胞） | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-11-12 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
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研究论文 | 本研究揭示了原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p抑制调节性T细胞免疫抑制功能的机制 | 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴削弱Tregs功能的新机制 | NA | 探索原发性免疫性血小板减少症中调节性T细胞功能减弱的机制 | 原发性免疫性血小板减少症患者的外泌体和调节性T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | Treg功能检测、细胞因子分析、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-12 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-cell/nucleus RNA Sequencing Data
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf077
PMID:40857558
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研究论文 | 本研究系统评估了单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确性 | 首次通过大规模数据集(23个数据集，3,682,576个细胞)系统评估sc/snRNA-seq的定量性能，建立了数据驱动的研究设计阈值，并开发了VICE工具评估数据质量 | 研究主要关注单核吞噬细胞，可能不适用于所有细胞类型；评估基于特定技术平台的数据 | 提高单细胞/单核RNA测序研究的可靠性和可重复性 | 单核吞噬细胞(来自四个物种) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞，来自339个样本，23个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-11-12 |
Squidiff: Predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.16.623974
PMID:40909548
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研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 利用连续去噪和语义特征整合技术，学习瞬态细胞状态并预测高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的响应，促进精准医学发展 | 细胞分化、基因扰动、药物反应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子响应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-11-10 |
Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease
2025-Jun, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-024-01109-8
PMID:39743564
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综述 | 本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病状态下的功能多样性、发育起源及其在心脏稳态和病理过程中的作用 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域 | NA | 探讨心脏巨噬细胞的发育起源、功能多样性及其在心脏疾病发病机制中的作用 | 心脏巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2025-11-12 |
CellSP: Module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.12.632553
PMID:39868198
|
研究论文 | 开发了用于亚细胞空间转录组数据分析的计算框架CellSP，能够识别、可视化和表征mRNA的亚细胞空间模式 | 提出了“基因-细胞模块”概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布的基因集，并提供直观的可视化和功能分析 | NA | 解决亚细胞空间转录组数据中功能相关空间模式识别和解释工具缺乏的问题 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-12 |
TransST: Transfer Learning Embedded Spatial Factor Modeling of Spatial Transcriptomics Data
2025-Apr-15, ArXiv
PMID:40321945
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研究论文 | 提出一种名为TransST的迁移学习框架，通过利用外部细胞标记信息来推断空间转录组数据中的细胞水平异质性 | 开发了首个将迁移学习嵌入空间因子建模的方法，能够自适应地利用外部细胞标记信息来提升空间转录组数据分析 | NA | 提高空间转录组数据分析的准确性和可靠性，识别细胞亚群和驱动生物标志物 | 空间转录组数据，特别是乳腺癌研究中的细胞异质性分析 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，迁移学习 | 空间因子模型，迁移学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-12 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-Cell/Nuclei RNA Sequencing Data
2025-Apr-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.12.589216
PMID:38659857
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研究论文 | 本研究系统评估了单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确性 | 建立了基于大量数据的数据驱动阈值来优化研究设计，并开发了VICE工具评估数据质量和估计差异表达真阳性率 | 研究主要关注单细胞水平的精确度和准确性，可能未涵盖所有技术变异来源 | 评估单细胞/单核RNA测序数据的定量测量性能并建立优化指南 | 单细胞和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞来自339个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-11-12 |
Microbial function in food fermentations: Current research and future directions
2025, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100491
PMID:41209716
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综述 | 概述食品发酵过程中微生物功能研究方法，涵盖传统到新兴技术，并总结近期相关研究进展 | 强调从微生物组成研究向功能研究的范式转变，提出稳定同位素探测和单细胞测序等新兴技术的应用前景 | 现有功能预测方法基于群体平均数据，掩盖功能异质性、稀有类群和低丰度种群的关键贡献者 | 指导复杂发酵系统中微生物功能的针对性研究 | 食品发酵过程中的微生物群落 | 微生物组学 | NA | 扩增子测序, 组学技术, 稳定同位素探测, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 功能数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-12 |
Ce -NeRV3D - a C. elegans Neuron RNA-seq Visualization tool in 3D
2025, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001830
PMID:41210177
|
研究论文 | 开发了一个用于在秀丽隐杆线虫3D神经系统中可视化基因表达模式的Blender插件工具 | 首次实现了在完整3D神经系统解剖结构中可视化无限数量基因的表达模式，并能交互式探索基因共表达空间分布 | NA | 开发神经转录组数据3D可视化工具，促进神经回路研究 | 秀丽隐杆线虫神经系统 | 生物信息学可视化 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、3D解剖结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |