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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-06-07 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特性及绿原酸对免疫微环境的调控作用 | 首次通过单细胞转录组学解析绿原酸对骨髓来源单核巨噬细胞和小胶质细胞分化轨迹及功能的调控机制,并验证其与STAT1的高亲和力 | 仅基于小鼠模型和单例临床患者数据,缺乏大规模临床验证 | 揭示胶质瘤相关巨噬细胞亚群与功能特征,探索绿原酸对免疫微环境的调控作用及临床应用潜力 | 胶质瘤模型小鼠、一例胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, PPI蛋白互作网络, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据 | 胶质瘤模型小鼠及1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2026-06-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
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研究论文 | 鉴定并验证BATF在急性髓系白血病中作为预后生物标志物和免疫细胞浸润调节因子的作用 | 首次系统研究BATF在AML中的表达与预后关联、免疫调节作用及药物敏感性影响,结合生物信息学分析与实验验证 | 未提及具体局限性,可能包括样本量有限或机制研究深度不足 | 探索BATF在急性髓系白血病中的表达、预后价值及免疫调节机制 | 急性髓系白血病患者和细胞系(C1498小鼠模型) | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序, EdU试验, 集落形成试验, CCK-8试验 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据,以及C1498小鼠模型 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2026-06-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
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研究论文 | 本研究利用荧光激活细胞分选富集CD45+免疫细胞并进行单细胞RNA测序,构建了纤维化皮肤病的免疫细胞图谱,发现Th17细胞在瘢痕疙瘩中显著增加并促进成纤维细胞增殖、迁移和胶原表达 | 首次通过富集免疫细胞进行单细胞RNA测序,揭示了纤维化皮肤病中免疫细胞的精细图谱,并发现Th17细胞通过IL-17A促进成纤维细胞功能的广泛机制 | 未提及研究的具体局限性 | 探究纤维化皮肤病(以瘢痕疙瘩为代表)中免疫细胞的复杂细胞图谱及其在疾病发展中的作用 | 纤维化皮肤病(瘢痕疙瘩、增生性瘢痕和硬皮病)中的免疫细胞和成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 纤维化皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2026-06-07 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
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研究论文 | 该研究利用流式细胞术、单细胞RNA测序及染色质可及性分析,揭示了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型与功能多样性,并探讨了孕前肥胖对胎儿免疫及神经发育的影响 | 首次在足月期对胎盘绒毛免疫细胞进行深度表型分析,并整合转录组与染色质可及性数据,同时探索孕前肥胖对绒毛髓系细胞及胎儿小胶质细胞的影响 | 样本量可能有限,且研究仅聚焦于无并发症的足月妊娠,未涉及病理妊娠状态 | 阐明足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的组成、功能状态及其随妊娠期的变化,并评估孕前肥胖对免疫适应及胎儿神经发育的影响 | 足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞(包括胎儿Hofbauer细胞和母体来源的巨噬细胞)及体外模型中的脐血源性小胶质细胞 | 机器学习和生物信息学 | 无特定疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq、单核ATAC测序(snATAC-seq)、流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 | 人类足月妊娠胎盘绒毛组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq和CITE-seq;10x Chromium用于snATAC-seq |
| 305 | 2026-06-07 |
Transcriptomic landscape reveals germline potential of porcine skin-derived multipotent dermal fibroblast progenitors
2023-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04869-7
PMID:37480481
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示猪皮肤来源的多能真皮成纤维细胞祖细胞具有向原始生殖细胞样细胞分化的潜能,并探讨其转录调控机制 | 首次通过单细胞转录组分析确认猪皮肤干细胞主要来源于多能真皮成纤维祖细胞,并揭示其在体外分化成原始生殖细胞样细胞过程中受组蛋白修饰和MAPK信号通路调控,且与人类原始生殖细胞谱系具有保守性 | 研究主要基于体外实验,体内分化效果和临床转化潜力尚未验证;样本为猪模型,与人类直接相关性仍需进一步确认 | 阐明皮肤来源干细胞分化为原始生殖细胞样细胞的细胞起源及其转录组动态变化,为不孕症治疗提供新思路 | 猪皮肤来源的多能真皮成纤维祖细胞及其分化的原始生殖细胞样细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 猪皮肤细胞样本,具体数量未在标题和摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-06-07 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学阐明小鼠结肠炎模型中炎症消退的动态机制,发现Serpina3n在基质细胞中特异性表达并促进炎症消退 | 首次通过单细胞转录组学揭示基质细胞在结肠炎症消退中的关键作用,并发现Serpina3n作为丝氨酸蛋白酶抑制剂能通过靶向弹性蛋白酶促进炎症消退,提供了新的治疗靶点 | 研究基于化学诱导小鼠模型,可能无法完全代表人类炎症性肠病的复杂性;仅验证了Serpina3n的短期作用,长期效果尚需进一步研究 | 阐明结肠炎症过程中不同细胞类型及其相互作用的动态变化,探索炎症消退的潜在机制 | 化学诱导结肠炎小鼠模型的结肠组织细胞(包括基质细胞、免疫细胞等) | 生物信息学, 单细胞基因组学 | 炎症性肠病(结肠炎) | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA表达数据 | 小鼠结肠炎模型样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-06-07 |
Jointly Embedding Multiple Single-Cell Omics Measurements
2019-Sep-03, Algorithms in bioinformatics : ... International Workshop, WABI ..., proceedings. WABI (Workshop)
DOI:10.4230/LIPIcs.WABI.2019.10
PMID:34632462
|
研究论文 | 提出一种无监督流形对齐算法MMD-MA,用于整合不同单细胞测序技术测量的多个数据集 | MMD-MA无需任何数据模态间的对应信息,即可对齐不同单细胞测量数据,并允许整合异质性数据类型如基因表达、DNA可及性、染色质组织、甲基化和成像数据 | 未提供具体局限性信息 | 开发一种整合不同单细胞测量数据的方法,实现跨模态单细胞分析 | 单细胞基因表达和甲基化数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 无监督流形对齐算法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-06-06 |
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2624191
PMID:41606824
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对结核病患者肉芽肿性淋巴结进行细胞和通讯网络分析 | 首次通过细针抽吸物的单细胞RNA测序描述结核肉芽肿性淋巴结的细胞组成和通讯网络,并发现T细胞与NK细胞及巨噬细胞/树突状细胞群呈负相关关系,且可检测到结核分枝杆菌RNA并识别单个感染细胞 | NA | 描述结核病患者肉芽肿性淋巴结的细胞类型和通讯网络特征 | 结核病患者的外周淋巴结细针抽吸样本 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19名结核病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-06-06 |
Portulaca Oleracea polysaccharides attenuate zearalenone-induced macrophage activation and Leydig cell dysfunction in testis: A single-cell and multi-omics study
2026-Aug-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119481
PMID:42215139
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、睾丸和血清代谢组学以及肠道微生物组分析,鉴定玉米赤霉烯酮(ZEA)的睾丸靶细胞类型,并探讨马齿苋多糖(POP)在雄性昆明小鼠模型中的解毒作用和机制 | 首次通过多组学整合方法(单细胞转录组、代谢组和微生物组)揭示马齿苋多糖通过调节肠-血-睾丸轴缓解玉米赤霉烯酮诱导的睾丸毒性,并明确巨噬细胞M1极化和间质细胞功能障碍为关键靶点 | 未提供 | 研究马齿苋多糖对玉米赤霉烯酮诱导的雄性小鼠睾丸毒性的缓解作用及其分子机制 | 雄性昆明小鼠模型 | 机器学习和数字病理学(通过单细胞多组学分析细胞类型) | 男性生殖毒性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、代谢组学、肠道微生物组分析 | 未明确提及 | 单细胞转录组数据、代谢组数据(血清和睾丸)、微生物组数据 | 雄性昆明小鼠(具体数量未在摘要中提供) | 未在摘要中明确提及 | 单细胞RNA测序、代谢组学、肠道微生物组分析 | 未在摘要中明确提及 | 未在摘要中明确提及 |
| 310 | 2026-06-06 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序与实验验证,鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 整合单细胞RNA测序分析与体内外验证,首次发现COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2四个枢纽基因在IPAH中显著上调,并验证了其沉默可抑制PASMC增殖和迁移 | 未提及 | 鉴定特发性肺动脉高压中驱动肺动脉平滑肌细胞异常增殖和迁移的关键基因 | 特发性肺动脉高压患者及单侧气肿诱导的PAH大鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IPAH患者样本(具体数量未提及)及MCT诱导的PAH大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE169471数据集来自Gene Expression Omnibus |
| 311 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and in vivo investigation reveal the role of ANXA1 in intestinal barrier dysfunction during heat stroke by mediating neutrophil-monocyte interaction and regulating the TLR4/ERK/NF-κB pathway
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153873
PMID:42070539
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与体内实验,揭示ANXA1在中暑引起的肠屏障功能障碍中通过调控中性粒细胞-单核细胞相互作用及TLR4/ERK/NF-κB通路的作用 | 首次结合单细胞转录组学与体内实验阐明ANXA1-FPR2轴在中暑肠屏障功能障碍中的保护机制,发现中性粒细胞-单核细胞相互作用的关键角色 | 未提及研究局限性 | 探究ANXA1在中暑诱导的肠屏障功能障碍中的作用机制 | 中暑患者和炎症性肠病患者的结肠组织细胞,以及中暑小鼠模型 | 生物信息学 | 中暑 | 单细胞RNA测序, 组织染色, 流式细胞术, ELISA, 蛋白印迹, 免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白表达数据 | 中暑患者与健康对照的单细胞RNA测序数据,以及小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2026-06-06 |
Dissecting Pirtobrutinib Resistance in Mantle Cell Lymphoma Through Single-Cell Multi-Omics
2026-Jul, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70304
PMID:41998849
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示套细胞淋巴瘤中Pirtobrutinib耐药的分子机制 | 首次通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和DNA-seq的多组学分析,揭示了PBN耐药的遗传和非遗传双重机制,并识别出黏连蛋白复合体核心成分RAD21和SMC3作为潜在治疗靶点 | 未明确说明 | 阐明Pirtobrutinib在套细胞淋巴瘤中产生耐药的分子动态机制 | 套细胞淋巴瘤患者的纵向样本 | 单细胞多组学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, DNA测序数据 | 套细胞淋巴瘤患者纵向样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell multi-omics analysis identifies fibroblast-like smooth muscle cells as a key driving phenotypic switching during aortic aneurysm progression
2026-Jul, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.05.006
PMID:42140576
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研究论文 | 整合单细胞多组学分析发现成纤维细胞样平滑肌细胞是驱动主动脉瘤进展中表型转换的关键细胞 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,系统鉴定出成纤维细胞样平滑肌细胞作为祖细胞样群体,并通过KAT5介导的代谢-表观遗传调控轴驱动主动脉瘤中平滑肌细胞表型转换 | 研究主要基于人主动脉组织样本的体外和动物模型验证,可能无法完全模拟体内复杂微环境,且样本量有限 | 探索主动脉瘤进展中平滑肌细胞的异质性和表型转换的调控机制 | 健康和主动脉瘤患者的人主动脉组织,以及人主动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 主动脉瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光染色, 动物模型, 体外实验 | 轨迹推断模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 人主动脉组织样本(健康与患病)及多种细胞亚群 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC测序 |
| 314 | 2026-06-06 |
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-Jul, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103189
PMID:42214504
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综述 | 本文综述了空间转录组学在解析年龄相关的神经退行性疾病组织微环境中的应用 | 强调空间转录组学作为连接分子发现与临床应用的桥梁技术,整合多组学与临床影像建立综合特征,用于早期疾病检测和患者分层 | 未明确讨论技术局限性,但提及衰老特异性挑战 | 探讨空间转录组学在揭示衰老相关病理机制和开发精准治疗干预中的应用 | 年龄相关的神经退行性病变和小胶质细胞微环境 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2026-06-06 |
Benzene-induced myelosuppression confers a survival advantage to hematopoietic progenitors: Single-cell analysis of malignant transformation dynamics in a murine model
2026-07-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142337
PMID:42139775
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析苯诱导小鼠骨髓抑制向恶性转化的动态过程 | 首次通过单细胞分析揭示苯诱导骨髓抑制向白血病转化的关键时间窗及S100a8/S100a9相关转录程序作为早期分子特征 | 未在文献中明确提及 | 解析苯诱导骨髓抑制向快速恶性转化的演变机制 | Mll-Af9嵌合体小鼠模型及苯暴露后的造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mll-Af9嵌合体小鼠经慢性苯吸入暴露,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-06-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Proteomics to Unravel Stem Cell Heterogeneity: Implications for Precision Regenerative Medicine
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11116-6
PMID:41951880
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2026-06-06 |
Machine Learning-Based Identification of Molecular Signatures in PTOA Cell Subtypes via Single-Cell Transcriptomics in a Mouse Model
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11121-9
PMID:41979832
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2026-06-06 |
Hypoplastic Left Heart Syndrome Cardiomyocytes Exhibit Intrinsic Stress Vulnerabilities and Augmented Stress Responses in vitro
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11127-3
PMID:42089915
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研究论文 | 该论文研究了左心发育不全综合征(HLHS)心肌细胞在体外表现出的内在应激脆弱性和增强的应激反应 | 首次通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示HLHS患者诱导多能干细胞来源的心肌细胞在转录水平上的内在脆弱性和对特定应激源的敏感性增强,为理解基因-环境相互作用在HLHS发病机制中的角色提供了新见解 | 研究仅基于体外模型(hiPSC-CMs),可能无法完全复制体内复杂的微环境;且样本量有限,可能限制结果的普遍性 | 识别HLHS患者与健康对照者心肌细胞之间的分子和功能差异,以揭示可能导致HLHS表型的潜在脆弱性 | 来自HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs) | 数字病理学 | 先天性心脏病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 319 | 2026-06-06 |
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70726
PMID:42244441
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术,揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境并影响免疫治疗反应 | 首次确定TREM1+中性粒细胞亚群在肝细胞癌中作为关键免疫抑制细胞,通过CyTOF全面表征其功能表型,并证明靶向TREM1可增强抗PD-1抗体疗效 | 未在更大样本量或不同种族人群中验证,且TREM1抑制剂VJDT的具体作用机制需进一步阐明 | 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群并探索其免疫治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的中性粒细胞亚群,特别是TREM1+中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质组学数据 | 肝细胞癌患者队列(具体数量未在摘要中提及) | Fluidigm, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | 10x Chromium, CyTOF | 10x Chromium用于scRNA-seq, CyTOF用于质谱流式分析 |
| 320 | 2026-06-06 |
Integrative transcriptomics and single-cell analysis unravel the senescence-reversing mechanism of quercetin in osteoarthritic chondrocytes
2026-06-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153831
PMID:42030882
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研究论文 | 整合转录组学和单细胞分析揭示槲皮素在骨关节炎软骨细胞中逆转衰老的机制 | 首次整合转录组学和单细胞测序,分析p53介导的细胞周期阻滞和SASP驱动的炎症在骨关节炎软骨细胞衰老中的核心作用,并揭示槲皮素通过靶向p53信号通路调节氧化应激/炎症微环境从而发挥抗衰老效果 | 缺乏体内实验验证,尚不能断言槲皮素能延缓软骨退化或进行临床应用 | 研究槲皮素逆转骨关节炎软骨细胞衰老的机制 | 骨关节炎软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组学, 单细胞测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | GSE98918和GSE117999数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |