单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-11-16 |
Unveiling tissue heterogeneity through genomic interaction-encoded image representation of RNA-sequencing data
2025-Nov-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.08.021
PMID:40967222
|
研究论文 | 提出一种基于基因组交互编码图像表示的RNA测序数据分析框架，用于改进组织异质性分析 | 利用基因组交互编码的图像表示方法，结合样本特异性基因表达变异性，通过卷积变分自编码器和高斯混合模型推导特征模式 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病中的适用性限制 | 开发改进的细胞组分分析方法，用于组织异质性研究和下游生物医学应用 | RNA测序数据，特别是批量RNA测序样本 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序，单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 卷积变分自编码器，高斯混合模型 | 基因表达数据，图像表示 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model
2025-Nov, Kidney research and clinical practice
IF:2.9Q1
DOI:10.23876/j.krcp.23.317
PMID:38934039
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Th17通路在高度致敏小鼠模型中抗人类白细胞抗原抗体发展中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序技术和HLA转基因小鼠模型，系统揭示了Th17细胞及其细胞因子IL-17在HLA致敏过程中的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 探究人类白细胞抗原致敏过程中的特异性信号通路 | HLA.A2转基因小鼠和野生型C57BL/6小鼠的脾细胞 | 单细胞组学 | 免疫排斥反应 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | ALLO组9,190个细胞，SYN组8,890个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2025-11-16 |
Single-cell transcriptomic atlas of human retina from Chinese donors reveals population-specific cellular diversity
2025-Nov, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110623
PMID:40914339
|
研究论文 | 构建了首个来自中国供体的人类视网膜单细胞转录组图谱，揭示了种群特异性细胞多样性 | 首次针对中国人群构建全面的人类视网膜单细胞转录组图谱，填补了亚洲人群视网膜转录组数据的空白 | 样本量相对有限（18个视网膜标本），仅代表中国人群特征 | 揭示中国人群视网膜细胞多样性及种群特异性生物学特征 | 人类视网膜组织 | 单细胞转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约290,000个活细胞，来自18个新鲜视网膜标本（包括活体供体和死后标本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高通量单细胞RNA测序 |
| 324 | 2025-11-16 |
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02064-4
PMID:41044343
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤如何导致颅骨骨异常并改变颅骨骨髓免疫景观 | 首次发现脑肿瘤会诱导颅骨骨异常并改变颅骨骨髓免疫环境，揭示了骨吸收抑制对肿瘤进展和免疫治疗效果的复杂影响 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；骨吸收抑制治疗在不同肿瘤亚型中效果存在差异 | 探究脑肿瘤对颅骨骨结构和骨髓免疫环境的影响机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和胶质母细胞瘤患者 | 癌症生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 325 | 2025-11-16 |
Integrating multi-modal omics to identify therapeutic atherosclerosis pathways for coronary heart disease
2025-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105966
PMID:41101252
|
研究论文 | 通过整合尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织和单细胞表达数据，识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路 | 首次将多组学数据（尿液代谢产物、血浆蛋白、斑块组织、单细胞表达）整合用于识别冠状动脉心脏病的治疗靶点 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制结果的普适性 | 识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路和潜在治疗靶点 | 冠状动脉心脏病患者及相关生物样本 | 生物信息学 | 冠状动脉心脏病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞表达数据 | 181,522例冠状动脉心脏病病例，954种尿液代谢产物，1,562种独特蛋白质 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2025-11-16 |
Pancreatic hypersecretion of amyloid-forming human amylin dysregulates the neuro-immune axis and B cell development in a model of type-2 diabetes
2025-Nov, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107153
PMID:41135632
|
研究论文 | 本研究探讨2型糖尿病中胰腺人胰淀素过度分泌如何通过CXCL12/CXCR4信号轴导致外周和神经免疫失调及B细胞发育缺陷 | 首次揭示胰腺人胰淀素沉积通过调控CXCL12/CXCR4信号轴导致B细胞发育缺陷和神经免疫失调的新机制 | 动物模型与人类疾病存在差异，慢性暴露效应的具体机制仍需进一步验证 | 阐明2型糖尿病中胰腺人胰淀素过度分泌对免疫系统和神经系统的影响机制 | 转基因大鼠和小鼠模型、野生型大鼠、2型糖尿病患者单细胞测序数据 | 免疫学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | 转基因动物模型 | 基因表达数据、免疫细胞计数数据 | 转基因大鼠和小鼠、野生型大鼠、2型糖尿病患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-11-16 |
Spatiotemporal dynamics of the cardioimmune niche during lesion repair
2025-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00739-6
PMID:41184578
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组学，重建小鼠心脏损伤后纤维化微环境的时空动态 | 首次揭示Trem2巨噬细胞通过沉默成纤维细胞增殖来防止过度纤维化的复杂多细胞网络，并发现损伤后罕见的祖细胞样心肌细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，人类心脏组织的验证仍需进一步研究 | 理解心脏伤口愈合过程中的细胞和分子过程，以改善心肌组织损伤后的心脏功能 | 成年小鼠心脏组织、人类心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 328 | 2025-11-16 |
Decoding heart failure subtypes with neural networks via differential explanation analysis
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf581
PMID:41222558
|
研究论文 | 提出一种基于神经网络和可解释AI的新方法，用于识别心力衰竭亚型特异性基因 | 开发了基于重要性评分的差异解释基因(DXGs)识别方法，能更有效识别心力衰竭亚型特异性通路 | 未提及具体样本量和数据来源限制 | 解码心力衰竭亚型并识别差异调控基因 | 心力衰竭患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 深度神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2025-11-16 |
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013667
PMID:41223185
|
研究论文 | 提出一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的空间转录组空间域识别方法 | 使用多视图加权融合图卷积网络自适应整合空间信息和基因特征，结合数据增强和对比学习提取关键基因表达 | NA | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 | 空间转录组数据中的细胞空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络(GCN), 多视图学习, 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 330 | 2025-11-16 |
Determining a Stability Prognostic Panel for 636 Patients With Melanoma Using a Machine Learning Computational Framework
2025-Nov, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70174
PMID:41229385
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的14基因预后特征模型，用于黑色素瘤患者的精准预后评估 | 首次系统整合101种机器学习算法开发共识预后特征，并在多个独立队列中验证其优于现有19种预后模型 | 研究样本量相对有限，且主要基于公共数据库数据 | 建立黑色素瘤精准预后评估框架并识别关键生物标志物 | 636例黑色素瘤患者的基因表达数据 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | LASSO, RSF | 基因表达数据 | 636例黑色素瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2025-11-16 |
D-dimer drives immune dysregulation in COVID-19 via chemokine modulation and inflammatory signaling
2025-Nov, Virus research
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.virusres.2025.199641
PMID:41083108
|
研究论文 | 本研究探讨了D-二聚体通过调节趋化因子和炎症信号通路在COVID-19中驱动免疫失调的机制 | 首次揭示D-二聚体不仅是血栓形成的生物标志物，还能通过调节趋化因子介导的细胞募集和炎症信号通路直接参与免疫调节 | 体外实验未能在THP-1细胞中诱导IL-6表达，机制研究仍需深入 | 探究D-二聚体在COVID-19免疫调节中的作用机制 | COVID-19患者和SARS-CoV-2阴性对照人群 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 体外细胞刺激实验 | NA | 临床数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | 356名来自上海的参与者，包括轻度和重度COVID-19患者及阴性对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2025-11-16 |
Brain abundant membrane attached signal protein 1 regulates macrophage polarization through EGFR/PI3K/AKT signaling in renal cell carcinoma
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148268
PMID:41093214
|
研究论文 | 本研究揭示了BASP1通过激活EGFR/PI3K/AKT信号通路促进巨噬细胞向M2表型极化，从而推动肾细胞癌进展的机制 | 首次发现BASP1在肾癌巨噬细胞中的特异性表达及其通过EGFR/PI3K/AKT通路调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于数据库分析和动物模型，缺乏临床样本验证 | 探究BASP1在肾细胞癌免疫微环境中调控巨噬细胞极化的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序,WB,qRT-PCR,流式细胞术,AAV基因沉默 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | TCGA数据库样本,小鼠颅内同种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2025-11-16 |
Mixed Molecular Subtypes Coexist in Estrogen Receptor Heterogeneous Primary Breast Cancers
2025-Nov, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00529
PMID:41237360
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析雌激素受体异质性乳腺癌，揭示不同分子亚型在肿瘤内共存的现象 | 首次在ER中等阳性乳腺癌中发现Luminal A和Luminal B分子亚型混合共存，并揭示ER阴性区域具有内分泌耐药但化疗敏感的表型特征 | 样本量较小（20例），仅针对ER中等阳性乳腺癌，未包含其他分子亚型 | 理解乳腺癌中雌激素受体表达的肿瘤内异质性，探索不同分子亚型在同一肿瘤中共存的可能性 | 20例原发性乳腺癌（10例ER异质性，10例ER高表达） | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 数字空间分析，空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 20例原发性乳腺癌样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx平台 | NanoString GeoMx平台配合人类全转录组图谱探针组 |
| 334 | 2025-11-16 |
Integrated bulk sequencing and single-cell transcriptomic profiling implicates neutrophil-driven hypoxia in atrial fibrillation development
2025-Oct-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1066
PMID:41229788
|
研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞转录组分析揭示了中性粒细胞驱动的缺氧在房颤发病机制中的作用 | 首次结合批量测序和单细胞转录组数据系统分析房颤中的炎症细胞浸润特征，并建立了基于中性粒细胞相关基因的机器学习诊断模型 | 研究结果需要通过体内、体外实验和外部验证研究进一步确认 | 阐明炎症细胞在房颤发病机制中的具体作用，并建立基于机器学习的诊断模型 | 房颤患者和窦性心律患者的心脏组织样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 46个房颤样本和18个窦性心律样本 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 335 | 2025-11-16 |
Integrating transcriptomics, single-cell omics, and deep learning-based histopathological features to identify OLFML3 in bladder cancer
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-365
PMID:41230137
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、单细胞组学和深度学习技术，识别OLFML3作为膀胱癌1年内复发的关键基因，并构建预测模型 | 首次结合多组学数据与深度学习病理特征识别OLFML3在膀胱癌复发中的作用，并开发基于ResNet50的OLFML3表达预测模型 | 需要进一步研究阐明OLFML3在膀胱癌1年内复发的具体作用机制 | 提高膀胱癌复发预测准确性并改善临床管理 | 膀胱癌患者 | 数字病理 | 膀胱癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,深度学习 | ResNet50,随机森林,Cox回归 | 基因表达数据,临床信息,病理图像 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌患者数据，以及广东省第二人民医院的单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq,scRNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2025-11-16 |
Single-cell multi-omics and spatial transcriptomics reveal the transcriptional regulatory landscape of clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-328
PMID:41230160
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示透明细胞肾细胞癌的转录调控景观 | 首次整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学全面解析ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络 | 研究样本量有限，功能验证仅针对YBX3基因 | 全面表征ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络，识别具有预后和治疗意义的关键基因 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 伪时间分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 337 | 2025-11-16 |
Cell-cell fusion and immunostimulatory cytokines significantly impact oncolytic vaccinia virus immunotherapeutic potential
2025-Oct-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.055
PMID:41174883
|
研究论文 | 本研究开发了一种携带IL-12和CCL21细胞因子的融合性溶瘤痘苗病毒，显著增强了系统性抗肿瘤免疫反应 | 首次将细胞融合特性与双免疫刺激细胞因子(IL-12和CCL21)结合于溶瘤病毒，通过单细胞转录组分析揭示了其对效应记忆CD8 T细胞的增强作用 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 提高溶瘤病毒对远端转移瘤的治疗效果 | 溶瘤痘苗病毒和鼠肿瘤模型 | 免疫治疗 | 转移性肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2025-11-15 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并证实其与免疫检查点抑制剂治疗反应不良相关 | 样本量相对较小，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例，ICB队列4例，验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-11-16 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
|
研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度(HVP)的遗传基础及其调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HVP相关黑色素细胞群体，发现DCT基因在HVP中过度表达并确定其多态性可作为遗传选择标记 | 研究样本量有限，功能验证实验主要在细胞水平进行，需要进一步体内验证 | 阐明鸡内脏腹膜色素沉着异常的遗传原因和分子机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物信息学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2025-11-16 |
Identification of two distinct uveal melanoma subtypes based on the immune cell infiltration of the primary tumour
2025-Oct-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04198-7
PMID:41128887
|
研究论文 | 本研究基于原发性葡萄膜黑色素瘤的免疫细胞浸润特征，识别出两种不同的肿瘤亚型 | 首次在单细胞水平揭示葡萄膜黑色素瘤的免疫异质性，发现具有特定染色体变异和信号通路活性的侵袭性黑色素细胞亚群 | 样本量有限（8例肿瘤活检），仅使用二次数据分析 | 表征葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 原发性葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |