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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-06-07 |
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for the treatment of chronic active Epstein-Barr virus infection
2026 Jan-Dec, Cell transplantation
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/09636897251414206
PMID:41618712
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综述 | 探讨异基因造血干细胞移植治疗慢性活动性EB病毒感染的现状与未来方向 | 通过单细胞测序和嵌合体研究证实EB病毒感染造血干细胞是CAEBV的“种子”细胞,强调allo-HSCT是唯一能根除病毒库并恢复免疫的治愈性疗法 | 移植时机、供者匹配、预处理强度及移植相关并发症对长期预后有显著影响,临床决策需高度个体化 | 为CAEBV患者提供基于allo-HSCT的综合治疗策略,并展望未来降低移植死亡率及改善生存结局的途径 | 慢性活动性EB病毒感染患者 | 机器学习 | EB病毒感染 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 262 | 2026-06-07 |
B3GNT6-Linked Multimodal Signatures Integrate Tissue Morphology and PTM-Related Transcriptomics to Stratify Tumor
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.134004
PMID:42212317
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研究论文 | 开发了一种基于翻译后修饰(PTM)的多模态框架,整合组织形态学和转录组学数据,用于结肠腺癌的预后分层和机制分析 | 首次将PTM相关的转录组学与组织病理形态特征通过自编码器潜在空间融合,构建多模态风险模型,并识别出B3GNT6作为关键预后因子和潜在治疗靶点 | 单中心TCGA数据验证,缺乏独立大型外部队列验证;多模态融合依赖于特定数据集和特征选择方法,泛化性待验证 | 开发基于PTM的多模态预后分层模型并解析结肠腺癌的分子机制 | 结肠腺癌(COAD)患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 自编码器 | 自编码器 | 图像, 文本 | TCGA-COAD队列(训练集+验证集),单细胞RNA-seq GSE132465,空间转录组GSE225857 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 263 | 2026-06-07 |
Primary Cilium Forces Neuroendocrine Shift in Prostate Cancer through YAP1 Repression and Reduced Mitochondrial Activity
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.126688
PMID:42244995
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研究论文 | 本文研究原发纤毛通过抑制YAP1和降低线粒体活性驱动前列腺癌神经内分泌转变的机制 | 首次揭示原发纤毛与前列腺癌神经内分泌转变的直接关联,并提出了结构-代谢轴作为生物标志物和治疗靶点的可能性 | 未明确阐述原发纤毛在体内模型中的功能验证及因果关系的直接证据 | 探究原发纤毛在前列腺癌神经内分泌转变中的作用及其分子机制 | 前列腺癌神经内分泌样细胞、去势抵抗性前列腺癌(CRPC)样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | CRPC肿瘤样本及细胞系样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 264 | 2026-06-07 |
Pathogenomic analysis reveals clinically relevant epithelial-mesenchymal plasticity in esophageal squamous cell carcinoma
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125381
PMID:41608573
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研究论文 | 通过整合病理图像、批量RNA测序、单细胞和空间转录组学数据,揭示了食管鳞状细胞癌中与临床相关的上皮间质可塑性 | 首次揭示上皮间质转化在食管鳞状细胞癌中的三种宏观状态及其空间分布,并通过病理图像深度学习模型预测基因空间表达分布,提出靶向干预新策略 | 未明确提及研究局限性,但可能涉及样本量有限或模型临床验证不充分 | 研究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的机制、异质性及临床诊断与干预策略 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本及相关基因、细胞类型 | 数字病理学 | 食管癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 深度学习模型(基于病理图像) | 病理图像、批量RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,可能涉及多个ESCC患者样本 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 265 | 2026-06-07 |
Targeting CDC42 Protects Mitochondrial Function through KLF2/HIF-1α/PINK1 Signaling in Acute Kidney Injury
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.125930
PMID:41608633
|
研究论文 | 本研究揭示CDC42通过KLF2/HIF-1α/PINK1信号通路保护线粒体功能在急性肾损伤中的作用 | 首次发现CDC42在急性肾损伤中的关键作用,并阐明其通过KLF2/HIF-1α/PINK1转录级联调控线粒体自噬和氧化应激的新机制 | 未明确提及具体局限性,可能包括临床转化验证不足或样本量有限 | 探索CDC42在急性肾损伤中的功能及其分子机制,为治疗提供新靶点 | 肾小管上皮细胞(RTECs)及小鼠急性肾损伤模型(顺铂和缺血再灌注诱导) | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组分析,ChIP实验,双荧光素酶报告基因实验 | NA | 单细胞基因表达数据,转录组数据 | 人类scRNA-seq数据集(未具体说明数量);小鼠模型(顺铂和缺血再灌注诱导组) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 266 | 2026-06-07 |
Multi-Omics and Single-Cell Dissection Reveals EXT1 as a Glycosylation-Linked Therapeutic Target in Cancer
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.070445
PMID:42232599
|
研究论文 | 通过多组学和单细胞分析揭示EXT1作为糖基化相关的癌症治疗靶点 | 首次发现EXT1是连接糖基化和炎症的新桥梁,并鉴定其为基质激活、免疫检查点参与和肿瘤进展的驱动因子 | 未明确说明 | 研究EXT1在炎症驱动癌症中作为糖基化相关治疗靶点的作用机制 | 胰腺腺癌和肺腺癌的组织微阵列、TCGA泛癌队列数据 | 数字病理学 | 胰腺腺癌, 肺腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 甲基化测序, 分子对接, 免疫组化 | LASSO Cox回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 甲基化数据, 图像数据 | TCGA泛癌队列(样本量未明确),PAAD和LUAD组织微阵列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2026-06-07 |
Identification of immunosuppressive neutrophils using multi-omics: why functional testing remains key
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1814355
PMID:42233007
|
研究论文 | 本文探讨了利用多组学方法鉴定免疫抑制性中性粒细胞的重要性,并强调功能性测试在其中的关键作用 | 指出了单细胞RNA测序在鉴定PMN-MDSC亚型中的潜力,同时强调了结合多组学技术(如蛋白质组学)和功能性验证的必要性 | 单细胞RNA测序尚未实现PMN-MDSC的明确免疫表型特征,且缺乏通过功能性测试验证的临床相关性 | 了解免疫抑制性中性粒细胞(PMN-MDSC)的鉴定现状,并提出未来研究方向 | 多形核中性粒细胞(PMN)和髓系来源的抑制细胞(MDSC)亚型 | 机器学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | NA |
| 268 | 2026-06-07 |
Identification of non-cardiomyocytes marker genes in patients with diabetes and cardiomyopathy through single-cell analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0351057
PMID:42247398
|
研究论文 | 通过单细胞分析识别糖尿病和心肌病患者的非心肌细胞标志基因 | 首次通过单细胞RNA测序系统揭示非心肌细胞(如NK细胞、平滑肌细胞)在糖尿病性心肌病中的代谢异质性和细胞间通讯网络,并发现PTPRC作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 探索非心肌细胞在糖尿病性心肌病中的代谢、炎症和纤维化机制,以发现新的治疗靶点 | 2型糖尿病合并心肌病患者的心脏组织非心肌细胞 | 单细胞分析 | 糖尿病性心肌病 | 单细胞RNA测序 | 无 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量(数据来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2026-06-07 |
Characterizing malignant prognostic signatures in primary glioma based on single-cell and bulk transcriptome sequencing
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349749
PMID:42247404
|
研究论文 | 基于单细胞和批量转录组测序,识别了原发性胶质瘤中的恶性预后特征并探索其与药物反应和免疫细胞浸润的相关性 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,利用Cox回归和LASSO方法识别出三个新的恶性预后标志物(IGFBP2、MDK和RARRES2),并在多个队列中验证其预测准确性 | 未明确提及研究局限性 | 识别原发性胶质瘤的恶性预后特征,并评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 原发性胶质瘤中的恶性预后基因标志物(IGFBP2、MDK和RARRES2) | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | Cox回归, LASSO | 基因表达数据 | TCGA和CGGA队列(具体样本数未提供) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2026-06-07 |
iPSC-derived MSCs alleviate arthritis in collagen-induced arthritis mice by reducing synovial CD86h iIL1βhi macrophage
2025-09-28, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf045
PMID:41101946
|
研究论文 | 利用诱导多能干细胞来源的间充质干细胞治疗胶原诱导关节炎小鼠,通过减少滑膜CD86hiIL1βhi巨噬细胞缓解关节炎 | 首次揭示iMSCs在RA治疗中通过调节巨噬细胞亚群从促炎型向抗炎型转变的机制,并验证其能同时减轻炎症和骨损伤 | 未提及具体局限性 | 探索iMSCs在类风湿性关节炎治疗中的潜力及其对滑膜巨噬细胞亚群的影响 | 胶原诱导关节炎小鼠模型及滑膜巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未说明具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 271 | 2026-06-07 |
Obesity hinders the efficacy of adipose-derived stem cells for knee osteoarthritis by reducing the proportion of DPP4+ stem cells
2025-07-24, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf004
PMID:40913785
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研究论文 | 本研究探讨肥胖如何通过降低DPP4+干细胞比例来削弱脂肪干细胞治疗膝骨关节炎的效果 | 首次揭示了肥胖通过减少DPP4+脂肪干细胞亚群比例来降低ASC治疗OA疗效,并指出DPP4+ ASCs是细胞治疗中有潜力的候选者 | 未明确说明,但可能包括样本仅限于小鼠模型、未探讨人体中的验证以及DPP4+细胞的具体作用机制尚需进一步研究 | 研究肥胖对脂肪干细胞治疗膝骨关节炎疗效的影响及其分子机制 | 野生型和肥胖小鼠(ob/ob)的脂肪干细胞,以及从小鼠皮下脂肪组织中分离的基质血管组分 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术分选 | NA | 基因表达数据,行为学数据,组织学数据 | 使用野生型和ob/ob小鼠,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 272 | 2026-06-07 |
Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection
2025-06-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf025
PMID:40659357
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研究论文 | 间充质干细胞疗法在猫严重冠状病毒感染模型中改善免疫恢复 | 首次在猫传染性腹膜炎自然感染模型中评估间充质干细胞联合抗病毒治疗对免疫恢复的影响,并通过单细胞RNA测序揭示免疫恢复的转录组学机制 | 研究中残余细胞因子升高持续存在,表明慢性免疫失调的部分特征未完全恢复;结果需要在更大样本和人类临床试验中验证 | 评估间充质干细胞疗法联合抗病毒治疗对猫严重冠状病毒感染免疫功能障碍的改善作用 | 患有渗出型猫传染性腹膜炎的猫 | 机器学习 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 单细胞转录组数据、血清细胞因子数据 | 未具体说明样本数量,涉及猫传染性腹膜炎猫模型及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对肠系膜淋巴结进行单细胞RNA测序 |
| 273 | 2026-06-07 |
Identification and Mapping of Human Lymph Node Stromal Cell Subsets by Combining Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics
2025-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451218
PMID:40498289
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学鉴定并定位人类淋巴结基质细胞亚群 | 首次在人类淋巴结中通过单细胞RNA测序全面定义了10种成纤维细胞亚型的基因特征,并利用空间转录组学数据预测了它们在淋巴结组织中的空间位置 | 仅使用一个淋巴结样本进行单细胞RNA测序,且空间转录组数据来自公共数据集而非实验验证 | 阐明人类淋巴结基质细胞的异质性及其空间分布与免疫调节功能的关系 | 从人类淋巴结分离的基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 13个淋巴结捐赠者(其中1个用于scRNA-seq,其余用于验证) | 10x Genomics, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学 |
| 274 | 2026-06-07 |
Narrowing Down Key Players in Autoimmunity via Single-Cell Multiomics
2025-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451233
PMID:40534591
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在自身免疫性疾病研究中的应用,探讨如何通过识别疾病相关细胞状态和细胞通讯网络来揭示自身免疫机制 | 系统总结了单细胞多组学技术在自身免疫研究中的最新进展,特别是在绘制自身反应性淋巴细胞图谱方面达到前所未有的分辨率 | 未提供具体的实验数据或定量分析结果 | 探讨单细胞多组学技术如何阐明自身免疫性疾病的分子机制 | 健康人和患者组织中的T细胞和B细胞 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 275 | 2026-06-07 |
NKG7 is a Stable Marker of Cytotoxicity Across Immune Contexts and Within the Tumor Microenvironment
2025-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202551885
PMID:40538191
|
研究论文 | 该研究利用公开的单细胞RNA测序数据集,全面分析了免疫亚群和组织中的细胞毒性特征,发现NKG7作为细胞毒性标志物具有更高的稳定性和可靠性 | 首次证明NKG7作为细胞毒性标志物在多种免疫环境和肿瘤微环境中的表达稳定性优于传统标志物颗粒酶B和穿孔素,并且与整体细胞毒性活性高度相关 | 主要依赖公共单细胞RNA测序数据集,可能无法涵盖所有免疫环境;NKG7的具体功能机制尚不明确 | 评估NKG7作为细胞毒性标志物在不同免疫环境中的表达模式和可靠性 | 人类免疫细胞亚群和组织中的细胞毒性成分 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-06-07 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-03-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
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研究论文 | 研究脾脏TNF-α信号在病毒感染期间促进NK细胞从先天到适应性转变的机制 | 首次揭示脾脏微环境通过TNF-α/TNFR2信号轴和NF-κB双通路调控NK细胞适应性分化,为生成适应性NK细胞免疫提供新见解 | 未涉及其他组织器官中NK细胞适应性转变的比较,以及长期记忆反应维持机制尚未阐明 | 探究病毒感染期间脾脏TNF-α信号如何调控NK细胞从先天免疫向适应性免疫的转变 | 小鼠脾脏NK细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 巨细胞病毒感染后小鼠脾脏NK细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序 |
| 277 | 2026-06-07 |
A creatine efflux transporter in oligodendrocytes
2025-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17382
PMID:39792585
|
研究论文 | 本研究揭示了少突胶质细胞中肌酸外排转运蛋白SLC22A15的功能,填补了脑肌酸代谢关键环节 | 首次鉴定SLC22A15为少突胶质细胞中受控肌酸释放的关键转运蛋白,并发现其通过一对一交换机制实现肌酸释放,区别于其他永久性外排转运蛋白 | 研究主要基于体外293细胞和mRNA表达谱分析,缺乏体内功能验证和动物模型数据 | 探究少突胶质细胞中肌酸从产生细胞释放的分子机制 | 人源和大鼠SLC22A15转运蛋白及其在293细胞中的异源表达 | 分子生物学、神经科学 | 神经发育障碍(肌酸缺乏相关) | 质谱分析、单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、单细胞RNA测序数据、mRNA表达谱 | 人类和小鼠组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2026-06-07 |
Everything everywhere all at once: Unraveling the waves of aging
2025-02-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.01.015
PMID:39938481
|
研究论文 | 使用单细胞转录组学解码十三个器官中多种细胞群体在衰老过程中的动态变化,并识别出四个不同的动态波 | 首次通过单细胞转录组学揭示跨多个器官的细胞群体衰老过程中的动态变化模式,并识别出四个不同的动态波 | 未提供具体局限性信息 | 解码衰老过程中多个器官细胞群体的动态变化 | 十三个器官中的多种细胞群体 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 十三种器官样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2026-06-07 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-01-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
|
research paper | 通过对人类、小鼠和斑马鱼的胸腺模仿细胞进行单细胞RNA测序,揭示了其进化上的古老起源以及保守和物种特异性特征 | 首次对多个物种(人类、小鼠、斑马鱼)的胸腺模仿细胞进行跨物种单细胞分析,发现其进化保守性和物种特异性适应,并揭示了人类模仿细胞中神经内分泌亚型的多样化和肌肉亚型的扩张 | 当前知识主要来自小鼠模型,人类样本仅限于儿科供体,可能无法完全代表成年或病理状态 | 探索胸腺模仿细胞的进化起源、跨物种保守性及其在自身免疫中的潜在作用 | 人类儿科供体、小鼠和斑马鱼的胸腺模仿细胞 | digital pathology | autoimmunity | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | 人类儿科供体(具体数量未提及)、小鼠和斑马鱼的胸腺模仿细胞样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 280 | 2026-06-07 |
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606650
PMID:41550933
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示儿童哮喘的免疫相关表达异质性和淋巴细胞发育失调 | 首次通过单细胞RNA测序分析儿童哮喘患者外周血单个核细胞,发现造血干细胞和祖细胞免疫基因的早期表达倾向,以及淋巴细胞发育的普遍失调,并识别出潜在治疗靶点SQSTM1、HSPA5和A2M | 样本量较小(仅3例患者和4例对照),且未发现所有患者间完全一致的异常模式,可能限制发现的外推性 | 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 | 儿童哮喘患者和年龄匹配健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 儿童哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |