单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-05-16 |
VPS25 Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030323
PMID:40149859
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research paper | 该研究探讨了VPS25在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中促进免疫抑制微环境的作用及其临床意义 | 揭示了VPS25通过上调PVR表达激活PVR-TIGIT信号轴促进免疫逃逸的新机制，并提出了VPS25作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 研究主要基于TCGA数据集和体外实验，需要更多临床样本验证 | 探究ESCRT复合体成员VPS25在HNSCC肿瘤微环境免疫调节中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）组织和CAL27细胞系 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织微阵列数据 | TCGA数据集中的HNSCC样本及组织微阵列样本 |
| 342 | 2025-05-16 |
Identification and validation of m6A RNA methylation and ferroptosis-related biomarkers in sepsis: transcriptome combined with single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543517
PMID:40124361
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research paper | 该研究通过转录组和单细胞RNA测序技术，识别并验证了与脓毒症相关的m6A RNA甲基化和铁死亡相关生物标志物 | 首次结合m6A RNA甲基化和铁死亡相关基因，利用机器学习方法和单细胞分析技术识别脓毒症生物标志物，并探索其免疫浸润和治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库和有限临床样本，需要更大规模的临床验证 | 识别和验证脓毒症的潜在生物标志物，并探索其分子机制和治疗潜力 | 脓毒症患者和对照组的转录组数据及临床样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, RT-qPCR | 机器学习方法（未指定具体模型） | RNA-seq数据, 单细胞数据 | 公共数据库中的转录组数据集和临床样本（未明确数量） |
| 343 | 2025-05-16 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the oncogenic role of ANXA5 in gastric cancer and its association with drug resistance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562395
PMID:40124374
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了ANXA5在胃癌中的致癌作用及其与耐药性的关联 | 识别了MUC5AC+恶性上皮细胞簇在胃癌侵袭和上皮-间质转化中的关键作用，并建立了包含ANXA5和GABARAPL2的预后模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本选择和测序技术的限制 | 探索胃癌进展的分子机制及耐药性基础 | 胃癌组织和相关细胞群 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预后模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA、GEO和OMIX001073数据库的多个数据集 |
| 344 | 2025-05-16 |
TGF-β-mediated activation of fibroblasts in cervical cancer: implications for tumor microenvironment and prognosis
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19072
PMID:40124621
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号在宫颈癌相关成纤维细胞中的作用及其与免疫细胞的相互作用，旨在阐明其对宫颈癌进展的影响 | 通过单细胞RNA测序数据分析了宫颈癌患者的肿瘤微环境，并构建了一个基于三个基因（ITGA5、SHF和SNRPN）的预后模型，该模型在多个数据集中表现出良好的预测能力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内实验验证 | 阐明TGF-β信号在宫颈癌相关成纤维细胞中的作用及其对肿瘤微环境和预后的影响 | 宫颈癌患者的肿瘤微环境，特别是成纤维细胞和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 宫颈癌 | scRNA-seq, WGCNA, qRT-PCR, CCK-8, 划痕实验 | 预后基因模型（基于ITGA5、SHF和SNRPN） | 单细胞RNA测序数据, TCGA-CESC数据集 | NA |
| 345 | 2025-05-16 |
AQP1 Affects Necroptosis by Targeting RIPK1 in Endothelial Cells of Atherosclerosis
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S487327
PMID:40129682
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研究论文 | 本研究探讨了AQP1通过靶向RIPK1影响内皮细胞坏死性凋亡在动脉粥样硬化中的作用 | 首次揭示了AQP1通过抑制RIPK3和MLKL的表达来抑制动脉粥样硬化中的坏死性凋亡 | 研究主要基于体外实验和测序分析，缺乏体内实验验证 | 探究AQP1是否通过结合RIPK1并降低RIPK3和MLKL的表达来影响动脉粥样硬化中的坏死性凋亡 | 动脉粥样硬化患者和正常人的股动脉和主动脉样本，以及ox-LDL处理的内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、WGCNA、ssGSEA、Western Blot | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 动脉粥样硬化组织和正常组织的样本，具体数量未明确说明 |
| 346 | 2025-05-16 |
Hypoxia-associated genes as predictors of outcomes in gastric cancer: a genomic approach
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1553477
PMID:40129974
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研究论文 | 研究缺氧相关基因在胃腺癌中的作用并构建预后模型 | 构建了一个基于五个H1特异性转录因子的新型预后模型，用于预测胃腺癌患者的总体生存率 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 研究缺氧相关基因对胃腺癌的影响并开发预后模型 | 胃腺癌(STAD)患者和细胞系 | 基因组学 | 胃癌 | scRNA-seq, WGCNA, GO-BP/KEGG富集分析, LassoCox算法, qRT-PCR | LassoCox | RNA表达数据和临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃腺癌样本，以及GSE183904中的原发胃癌样本 |
| 347 | 2025-05-16 |
Interleukin-27-polarized HIV-resistant M2 macrophages are a novel subtype of macrophages that express distinct antiviral gene profiles in individual cells: implication for the antiviral effect via different mechanisms in the individual cell-dependent manner
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1550699
PMID:40129989
|
research paper | 该研究探讨了IL-27极化的HIV抗性M2巨噬细胞的生物学功能和基因表达谱，揭示了其作为一种新型巨噬细胞亚型的特性 | 发现IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）是一种新型的M2巨噬细胞亚型，具有独特的抗HIV机制和基因表达谱 | 研究仅使用健康供体的单核细胞，未考虑HIV感染者或免疫缺陷患者的样本 | 研究IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）的生物学特性和抗HIV机制 | IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）和M2d巨噬细胞亚型 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、p24抗原捕获试验、过氧化氢测定、吞噬试验、IsoPlexis系统 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 健康供体的单核细胞 |
| 348 | 2025-05-16 |
Myosin 1f and Proline-rich 13 are transcriptionally upregulated yet functionally redundant in CD4+ T cells during blood-stage Plasmodium infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320375
PMID:40132035
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研究论文 | 研究在实验性疟疾中，CD4+ T细胞分化为效应和记忆亚群时，Myo1f和Prr13基因的转录上调及其功能冗余性 | 首次在T辅助细胞中鉴定并研究了Myo1f和Prr13基因的功能，尽管这些基因在转录水平上上调，但在效应和记忆CD4+ T细胞反应中功能冗余 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类疟疾中进行验证 | 探究CD4+ T细胞在疟疾感染期间分化为效应和记忆亚群的分子机制 | CD4+ T细胞，特别是Plasmodium chabaudi chabaudi AS感染的小鼠模型中的T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | scRNA-seq, 条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的CD4+ T细胞 |
| 349 | 2025-05-16 |
Single-cell and transcriptome analyses revealed CTHRC1 a potential therapeutic target mediating invasion and tumor microenvironment in TNBC: experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534981
PMID:40134434
|
研究论文 | 研究CTHRC1在三阴性乳腺癌（TNBC）肿瘤微环境中的关键作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次系统性地分析了CTHRC1在TNBC中的表达特征及其与侵袭性基因、肿瘤免疫细胞浸润和免疫治疗的关系 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限 | 探究CTHRC1在TNBC肿瘤微环境中的作用机制及其治疗潜力 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者样本及相关基因数据 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | RNA转录组分析、单细胞测序、多重免疫荧光分析 | NA | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的TNBC患者样本数据 |
| 350 | 2025-05-16 |
Jing-Yin-Gu-Biao formula protects mice from postinfluenza Staphylococcus aureus infection by ameliorating acute lung injury and improving hypercoagulable state via inhibiting NETosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567522
PMID:40134435
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研究论文 | 研究精银固表方（JYGBF）对流感后金黄色葡萄球菌感染的保护作用及其机制 | 首次揭示JYGBF通过抑制NETosis改善急性肺损伤和高凝状态 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 探索JYGBF对流感后金黄色葡萄球菌感染的治疗效果及作用机制 | 流感后金黄色葡萄球菌感染的小鼠模型 | 医学研究 | 急性呼吸道感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠感染模型 | 实验数据 | NA |
| 351 | 2025-05-16 |
Differential neuropilin isoform expressions highlight plasticity in macrophages in the heterogenous TME through in-silico profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1547330
PMID:40134439
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了神经纤毛蛋白（NRP）异构体NRP1和NRP2在不同癌症类型中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的差异表达及其在肿瘤微环境（TME）中的作用 | 揭示了NRP1和NRP2在TAMs中的异构体特异性表达模式及其与肿瘤进展的不同机制，包括血管生成和肿瘤侵袭 | 研究仅针对ccRCC和SKCM两种癌症类型，可能无法推广到其他癌症 | 探讨NRP异构体在TAMs中的表达及其在肿瘤微环境中的作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）和皮肤黑色素瘤（SKCM）中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | digital pathology | renal cell carcinoma, melanoma | scRNA-seq, DEGA | NA | RNA sequencing data | ccRCC和SKCM肿瘤样本（具体数量未提及） |
| 352 | 2025-05-16 |
Application and Progression of Single-Cell RNA Sequencing in Diabetes Mellitus and Diabetes Complications
2025, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/3248350
PMID:40135071
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review | 综述了单细胞RNA测序在糖尿病及其并发症研究中的应用和进展 | 强调了单细胞RNA测序在识别糖尿病及其并发症的新型生物标志物和免疫治疗靶点方面的创新应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序在糖尿病及其并发症研究中的应用 | 糖尿病及其并发症 | 生物医学研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA |
| 353 | 2025-05-16 |
Programmed cell death-related prognostic genes mediate dysregulation of the immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1563630
PMID:40145099
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析三阴性乳腺癌中的程序性细胞死亡（PCD）相关基因，揭示了PCD如何通过肿瘤微环境（TME）调控免疫微环境的失调 | 首次全面分析了PCD在TNBC免疫微环境中的作用，并鉴定了CEBPB+ CAF亚型作为免疫治疗预后不良的预测因子 | 样本量较小（仅9个TNBC样本），且研究结果需要在更大规模的临床样本中验证 | 探究PCD介导的微环境失调在三阴性乳腺癌发病机制中的作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者样本和同源小鼠模型 | digital pathology | breast cancer | scRNA-seq, qRT-PCR, immunoblotting, immunohistochemical staining, multiplexed immunofluorescence | NMF, SCENIC, Monocle, CellChat, scMetabolism | RNA-seq数据, 临床样本数据 | 9个TNBC样本, 临床乳腺癌样本和TNBC模型小鼠 |
| 354 | 2025-05-16 |
High resolution tissue and cell type identification via single cell transcriptomic profiling
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318151
PMID:40138334
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研究论文 | 开发了一种高灵敏度的单细胞注释流程scTissueID，用于基于单细胞RNA测序数据准确评估单细胞图谱质量并精确确定细胞和组织类型 | 引入了独特的参考细胞质量区分阶段，仅针对高置信度细胞作为参考，显著提高了细胞和组织类型鉴定的准确性和一致性 | 未明确说明该方法在低质量或降解样本中的表现 | 提高法医调查中组织和细胞类型鉴定的准确性和效率 | 法医相关数据和人类细胞图谱(HCA)数据中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 大规模比较研究，涉及法医相关数据和人类细胞图谱数据 |
| 355 | 2025-05-16 |
Pig jejunal single-cell RNA landscapes revealing breed-specific immunology differentiation at various domestication stages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530214
PMID:40151618
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究猪空肠组织在不同驯化阶段的免疫细胞差异 | 首次构建了猪空肠组织的单细胞图谱，揭示了不同品种猪在免疫功能上的差异及其与驯化的关系 | 研究仅针对三种猪品种，可能无法全面反映所有驯化阶段的免疫变化 | 探究猪在驯化过程中空肠免疫功能的进化变化 | 野猪、金华猪和杜洛克猪的空肠组织 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 26,246个细胞 |
| 356 | 2025-05-16 |
Integrated analysis and single-cell sequencing of mitochondrial metabolism related gene molecular subtype and diagnostic model in ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320010
PMID:40153427
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research paper | 该研究通过公共数据库数据和单细胞测序技术，探索了线粒体代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的分子亚型和诊断模型 | 首次基于机器学习方法识别与线粒体代谢相关基因(MMRG)相关的生物标志物，并分析了MMRG分子亚型与免疫浸润特征的关系 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏大规模临床样本验证 | 探索溃疡性结肠炎的发病机制和潜在生物标志物 | 线粒体代谢相关基因(MMRG)在溃疡性结肠炎中的作用 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序, qRT-PCR, western blot | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 357 | 2025-05-16 |
A research protocol for a prospective, multicenter, cohort study on interferon therapy for chronic hepatitis B combined with metabolism-associated fatty liver disease to achieve clinical cure
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1546182
PMID:40161022
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研究论文 | 一项前瞻性、多中心、队列研究，探讨干扰素治疗慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病以实现临床治愈的效果 | 填补了慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病治疗策略的空白，并提供了重要的治疗指导 | 干扰素治疗常伴随副作用，可能导致患者依从性降低，影响长期随访和结果监测；代谢相关脂肪性肝病患者的异质性可能对干扰素治疗效果产生不同影响 | 评估聚乙二醇干扰素治疗的疗效和安全性，并阐明代谢相关脂肪性肝病对实现HBsAg清除的影响 | 慢性乙型肝炎患者和慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病患者 | 临床医学 | 慢性乙型肝炎, 代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组测序技术 | NA | 临床数据, 转录组数据 | 多中心设计，样本量未明确说明 |
| 358 | 2025-05-16 |
Harnessing single-cell and multi-omics insights: STING pathway-based predictive signature for immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575084
PMID:40308576
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序和大规模转录组数据，开发了一个基于STING通路的预测标志物（STINGsig），用于预测肺腺癌免疫治疗的响应 | 结合单细胞和多组学数据，开发了STING通路相关标志物，并通过小鼠模型验证了关键基因ERRFI1在增强抗肿瘤免疫和α-PD1治疗中的协同作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证其临床适用性 | 探究STING通路与肺腺癌免疫治疗响应的关系 | 肺腺癌患者和模型小鼠 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多色流式细胞术 | 101种机器学习框架 | 转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的公共数据，具体样本数量未明确说明 |
| 359 | 2025-05-16 |
Natural history, immunological and genetic characteristics of preclinical inflammatory bowel disease (EARLY): study protocol for a prospective cohort study
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251338647
PMID:40365077
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研究论文 | 本研究旨在探讨炎症性肠病(IBD)在临床前期的自然史、免疫学和遗传学特征，并通过前瞻性队列研究设计，整合多组学数据以预测疾病长期预后 | 首次系统研究IBD临床前期的特征，整合临床与多组学数据(基因组、蛋白质组、转录组、代谢组和微生物组)进行长期预后预测 | 研究周期长达10年，短期内无法获得完整结果；样本来源限于结直肠癌筛查项目中发现的无症状患者 | 描述IBD临床前期的特征并开发疾病长期预测工具 | 结直肠癌筛查中发现的无症状IBD患者、新诊断的有症状IBD患者和健康对照者 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、多组学分析(基因组/蛋白质组/转录组/代谢组/微生物组) | NA | 生物样本(血液/尿液/粪便/活检组织)和多组学数据 | 三组队列：无症状IBD患者、有症状IBD患者(<3月病程)和健康对照者，具体数量未说明 |
| 360 | 2025-05-16 |
Decoding the Tumor Microenvironment of Myoepithelial Cells in Triple-Negative Breast Cancer Through Single-Cell and Transcriptomic Sequencing and Establishing a Prognostic Model Based on Key Myoepithelial Cell Genes
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6454413
PMID:40365116
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组测序解码了三阴性乳腺癌中肌上皮细胞的肿瘤微环境，并基于关键肌上皮细胞基因建立了预后模型 | 揭示了肌上皮细胞在三阴性乳腺癌发展中的作用，开发了基于CoxBoost的预后模型，并鉴定出TPD52作为潜在的治疗靶点 | 研究样本量未明确说明，且模型验证仅基于20个生存队列 | 探索肌上皮细胞在三阴性乳腺癌中的作用并开发预后模型 | 三阴性乳腺癌中的肌上皮细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组测序，siRNA敲除 | CoxBoost | RNA测序数据 | NA |