单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40810 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-06-22
EZH2-Mediated Epigenetic Modifications Induce Pyroptosis in Dental Pulp Endothelial Cells via Activation of NLRP6 Inflammasome During Pulpitis Development
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究探索牙髓炎过程中牙髓组织的细胞组成变化和细胞焦亡通路,并初步验证EZH2通过NLRP6在脂多糖诱导的血管内皮细胞焦亡中的调控作用 首次揭示EZH2/NLRP6轴在牙髓炎内皮细胞焦亡中的关键调控作用,并提出其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于细胞和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,EZH2/NLRP6轴的临床相关性需进一步确认 阐明牙髓炎中内皮细胞焦亡的分子机制及EZH2的调控作用 牙髓组织中的血管内皮细胞(包括EOMA细胞系) 机器学习 牙髓炎 单细胞RNA测序,RNA测序,微阵列分析 NA 基因表达数据 公开单细胞RNA测序和微阵列数据,以及EZH2fl/fl;Tie2-Cre+/-小鼠牙髓组织 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
202 2026-06-22
Single-cell analysis of inhibitory efferent neurons of the zebrafish lateral line
2026, PloS one IF:2.9Q1
research paper 对斑马鱼侧线系统中抑制性传出神经元的单细胞分析 首次对斑马鱼侧线中三种抑制性传出神经元(REN、ROLE和RELL)进行单细胞RNA测序,揭示其转录组和神经支配模式的差异 转录分析未发现内在分子差异,功能差异需进一步通过逆行追踪等方法验证 探究斑马鱼侧线抑制性传出神经元的功能差异 斑马鱼幼虫的抑制性传出神经元(REN、ROLE和RELL) machine learning NA RNA-seq NA 基因表达数据 5日龄斑马鱼幼虫 NA single-cell RNA-seq NA NA
203 2026-06-22
A murine model of sepsis induces age- and sex-specific chromatin remodeling in myeloid-derived suppressor cells
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过高分辨率单分子技术MAPit-FENGC,构建小鼠脓毒症模型中髓源性抑制细胞的年龄和性别特异性染色质量塑图谱 首次采用单分子方法同时分析DNA甲基化和染色质可及性,揭示脓毒症后髓源性抑制细胞中年龄和性别依赖的启动子表观遗传类别 研究仅针对小鼠模型,且聚焦于特定靶基因启动子区域,可能无法完全反映人类脓毒症的复杂性 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制,特别是年龄和性别对髓源性抑制细胞染色质状态的影响 年轻和老年成年雄性及雌性小鼠的脾脏髓源性抑制细胞 表观遗传学 脓毒症 MAPit-FENGC,单细胞RNA测序 无监督聚类 DNA甲基化数据,染色质可及性数据,转录组数据 包括年轻和老年成年雄性及雌性小鼠,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA MAPit-FENGC用于单分子DNA甲基化和染色质可及性分析,单细胞RNA测序用于转录组分析
204 2026-06-22
Interrogation of glioma immune microenvironment identifies a non-canonical role for microglial Galectin-9 in tumor cell adhesion and phagocytosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和配体-受体相互作用分析,揭示小胶质细胞Galectin-9在胶质瘤免疫微环境中调控肿瘤细胞粘附和吞噬的非经典功能 首次发现小胶质细胞中的Galectin-9具有促进胶质瘤细胞粘附和吞噬的非经典作用,而非传统认知中的免疫抑制功能 基于体外共培养系统,缺乏体内实验验证;样本量有限且未涵盖所有IDH突变亚型 识别具有抗胶质瘤功能的髓系效应细胞并阐明其分子机制 胶质瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞(GAMs) 机器学习 胶质瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 18例IDH分型胶质瘤患者的肿瘤脑组织CD45+白细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
205 2026-06-22
Identification of non-cardiomyocytes marker genes in patients with diabetes and cardiomyopathy through single-cell analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,识别糖尿病和心肌病患者的非心肌细胞标志基因 首次通过单细胞RNA测序揭示非心肌细胞在糖尿病心肌病中的代谢、炎症和纤维化机制异质性,并发现PTPRC作为潜在治疗靶点 未提及该研究的局限性 探索非心肌细胞如何通过代谢、炎症和纤维化机制驱动糖尿病心肌病,并揭示新的治疗靶点 2型糖尿病患者的心脏组织中的非心肌细胞 生物信息学 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
206 2026-06-22
Sphingolipid metabolic enzyme GLA expression in gliomas: prognostic implications and therapeutic potential
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 分析GLA在胶质瘤中的表达及其预后意义和治疗潜力 首次系统评估鞘脂代谢酶GLA在胶质瘤中的表达模式及其与预后、治疗抵抗和代谢通路的关系 主要基于数据库分析,功能验证仅在细胞系层面,缺乏体内实验和临床样本验证 探索GLA作为胶质瘤预后生物标志物的可能性及其生物学功能 胶质瘤患者肿瘤组织和胶质瘤细胞系 机器学习 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 基因敲低 NA 基因表达数据, 临床数据 TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本,具体数量未提及 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina测序平台 NA
207 2026-06-22
Hypobaric hypoxia can lead to an increase in lung dendritic cells and promote T-cell immunosuppression, thereby preventing the excessive progression of high-altitude pulmonary edema
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究探讨了低压低氧环境下肺部树突状细胞增加及T细胞免疫抑制在高原肺水肿发展中的调控作用 首次揭示低压低氧诱导的肺部树突状细胞招募通过促进CD4+ T细胞免疫抑制来延缓高原肺水肿进展,并发现TNF-α在其中的负向调控作用 未提及具体局限性 阐明低压低氧条件下肺部树突状细胞对T细胞免疫抑制的影响及其在高原肺水肿发展中的保护机制 大鼠和小鼠的高原肺水肿模型,包括TNF-α缺陷小鼠和CD4中和抗体处理小鼠 机器学习 高原肺水肿 单细胞测序,流式细胞术,体外共培养 NA 单细胞测序数据,流式细胞数据 大鼠和小鼠的高原肺水肿模型样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
208 2026-06-22
Bioinformatics combined with machine learning for the identification of malignant transformation markers in colorectal polyps
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 利用生物信息学与机器学习方法,鉴定结直肠息肉恶变的标志物,并构建高精度诊断模型 结合单细胞RNA测序数据与多种机器学习算法(Boruta、LASSO、XGBoost)筛选出六个核心基因,并建立脊回归诊断模型,为结直肠癌早期诊断提供新标志物 未提及外部验证队列的多样性或模型在临床实践中的适用性限制 筛选调控结直肠肿瘤发生的核心基因,构建可靠的结直肠癌诊断模型 结直肠息肉恶变过程中的关键基因和诊断标志物 机器学习 结直肠癌 RNA-seq、单细胞RNA测序、qRT-PCR 脊回归、LASSO、XGBoost、Boruta算法 基因表达数据 GSE209741数据集(样本量未明确)、GSE161277单细胞RNA测序数据集、TCGA-COADREAD队列、GSE41258队列、CRC细胞系SW480和HCT116、正常结直肠上皮细胞系NCM460 NA 单细胞RNA-seq NA NA
209 2026-06-22
FCGR2B + Macrophages as a Critical Node Linking Ferroptosis and Immunosuppression: A Multiomics Framework for Prognosis and Therapy in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过多组学分析发现FCGR2B+巨噬细胞连接铁死亡与免疫抑制,并构建了高级别浆液性卵巢癌预后和治疗的多组学框架 首次将FCGR2B+肿瘤相关巨噬细胞作为连接铁死亡和免疫抑制的关键节点,并基于此构建四基因预后风险模型 未在更大规模或不同种族队列中验证模型,且缺乏对FCGR2B+巨噬细胞功能的进一步实验验证 探索FCGR2B+巨噬细胞在高级别浆液性卵巢癌中的预后意义及治疗潜力 FCGR2B+肿瘤相关巨噬细胞亚群及高级别浆液性卵巢癌患者 数字病理学 高级别浆液性卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
210 2026-06-21
Unraveling the role of non-coding RNAs in Parkinson's disease: Molecular mechanisms and therapeutic insights
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
综述 该文章揭示了非编码RNA在帕金森病发病机制中的分子调控作用及其治疗潜力 系统整合了miRNA、lncRNA和circRNA三类非编码RNA在帕金森病中调控α-突触核蛋白稳态、线粒体功能、自噬及神经炎症的多层次机制,并引入单细胞测序和多组学数据揭示细胞特异性失调模式 仅基于现有文献综述,缺乏原始实验验证;未深入讨论非编码RNA作为治疗靶点的临床转化障碍(如递送系统、脱靶效应) 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制并探索治疗前景 帕金森病相关的非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA)及其调控网络 机器学习 神经退行性疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
211 2026-06-21
Blood IL-6 is a critical trigger of depressive symptoms in a mouse model for human atopic dermatitis
2026-Jun-20, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 探究特应性皮炎小鼠模型中血液IL-6如何触发抑郁样行为 首次发现外周血IL-6和sIL-6Rα通过破坏血脑屏障并激活海马IL-6Rβ信号抑制未成熟神经元生成,从而驱动特应性皮炎相关抑郁症状 研究仅在NC/Tnd小鼠模型中进行,未在人类受试者中验证临床相关性 阐明特应性皮炎导致抑郁的分子机制,特别是IL-6在海马神经发生中的角色 NC/Tnd自发特应性皮炎小鼠及IL-6缺陷小鼠 自然语言处理 特应性皮炎、抑郁症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NC/Tnd小鼠、IL-6缺陷小鼠以及联体共生小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
212 2026-06-21
Glucocorticoid and mitophagy signaling-based molecular subtyping reveals HMGA1 as a prognostic and immunotherapy biomarker in lung adenocarcinoma
2026-Jun-20, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究整合批量转录组和空间转录组数据,基于糖皮质激素与线粒体自噬信号通路对肺腺癌进行分子分型,并发现HMGA1作为预后和免疫治疗生物标志物 首次将糖皮质激素与线粒体自噬信号通路结合进行肺腺癌分子分型,并通过空间转录组学验证HMGA1在肿瘤上皮细胞中的富集及其与不良预后的关联 基于公开数据库的分析可能需要更多独立队列进行验证,功能性实验主要在体外和动物模型中进行,临床转化尚需进一步研究 探索肺腺癌的分子异质性并识别新的预后和免疫治疗生物标志物 肺腺癌患者的肿瘤组织和细胞系 数字病理学 肺癌 RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,空间转录组数据 TCGA和多个多中心队列的批量转录组数据,空间转录组样本用于原位验证 NA 批量RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
213 2026-06-21
ChatMDV: Reducing Technical Barriers in Bioinformatics Analysis using Large Language Models
2026-Jun-19, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 提出ChatMDV系统,通过自然语言界面与大型语言模型结合,降低生物信息学分析的技术门槛 将检索增强生成(RAG)流水线与大型语言模型集成到多维可视化工具MDV中,实现自然语言指令直接生成可执行Python代码和交互式可视化输出 未提及具体限制,可能依赖高质量语言表达和数据集兼容性 降低生物信息学可视化分析的技术壁垒,提升数据探索的可及性和可重复性 三个单细胞RNA测序数据集:PBMC3K、人类细胞图谱肺癌数据集和TAURUS纵向研究数据集 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大型语言模型 文本 三个单细胞RNA测序数据集 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序平台
214 2026-06-21
Respiratory syncytial viral load drives ciliated cell dedifferentiation and suppresses antiviral immunity
2026-Jun-19, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析RSV感染人气道上皮细胞后病毒载量驱动的纤毛细胞去分化及抗病毒免疫抑制机制 揭示了RSV病毒载量依赖性地关闭纤毛细胞中纤毛形成、抗原呈递和先天免疫相关基因,并发现IRF1作为不被RSV抑制的抗病毒转录因子具有治疗潜力 未提及具体局限性 探究RSV如何重塑气道上皮细胞并逃避先天免疫的机制 成年原代人气道上皮细胞培养物及RSV感染后细胞 单细胞转录组学 呼吸道合胞病毒感染相关疾病 单细胞RNA测序、成像 NA 单细胞转录组数据、成像数据 成年原代人气道上皮细胞培养物,未明确样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
215 2026-06-21
Tumor-associated epilepsy at diagnosis in glioblastoma patients reveals an inflammatory molecular signature and is associated with better overall survival
2026-Jun-19, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 分析胶质母细胞瘤患者诊断期肿瘤相关癫痫的预后意义及其分子特征 首次揭示诊断期肿瘤相关癫痫是胶质母细胞瘤的独立预后良好标志,并明确其与炎症性分子亚型(RTK II亚型、分化的细胞状态和炎症微环境)的关联,同时发现癫痫状态可改变手术切除的预后效果 回顾性研究设计可能引入选择偏倚,且未能区分癫痫亚型(如局灶性 vs 全面性发作)对预后的影响 评估胶质母细胞瘤诊断期肿瘤相关癫痫的预后价值并解析其分子基础 1199例胶质母细胞瘤患者(回顾性测试集855例,前瞻性验证集344例) 机器学习 胶质母细胞瘤 甲基化测序、表观遗传学解卷积、空间转录组学 多变量Cox回归、倾向性评分匹配、交互作用模型 临床数据、基因表达数据、空间转录组数据 1199例患者(855例回顾性队列 + 344例前瞻性队列) NA 空间转录组学 NA NA
216 2026-06-21
Single-cell and spatial transcriptomics reveal lactate-active epithelial-immune cell crosstalk that reprograms the immune microenvironment in colorectal cancer
2026-Jun-19, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 整合单细胞转录组学和空间转录组学揭示结直肠癌中乳酸活跃的上皮-免疫细胞交互作用及其对免疫微环境的重编程 首次通过单细胞和空间转录组学描绘结直肠癌肿瘤生态系统中的乳酸代谢景观,开发了基于四个核心基因的乳酸代谢评分(LMscore),并揭示了COX15作为乳酸代谢失调的关键调节因子及其与免疫抑制微环境形成的机制 未提及具体限制 阐明结直肠癌中乳酸代谢失调对免疫微环境的影响及开发预后和免疫治疗响应的生物标志物 结直肠癌肿瘤微环境中的上皮细胞、髓系细胞、成纤维细胞和免疫细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量测序 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量测序数据 多个队列的样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学
217 2026-06-21
Osr1-expressing mesoderm contributes to lymphatic vessel assembly and complexity in the mammalian kidney
2026-Jun-19, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠遗传谱系追踪,揭示了肾脏淋巴管来源于Osr1中胚层和Tie2内皮细胞两个起源,并发现Osr1来源的淋巴管对网络形成和肾脏健康至关重要 首次发现Osr1中胚层是肾脏淋巴管的一个独特起源,不参与心脏、肠系膜和皮肤淋巴管生成,并证明其通过从头组装形成淋巴簇,对淋巴网络复杂性和肾小球数量有影响 结果主要基于小鼠模型,人类肾脏中Osr1中胚层来源淋巴管的功能和具体机制仍需进一步验证 探讨哺乳动物肾脏淋巴管的细胞起源及其对肾脏健康和疾病的影响 小鼠和人类的肾脏淋巴管系统 机器学习 NA 遗传谱系追踪、单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠(具体数量未提供)和人类样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
218 2026-06-21
In situ graphene-seq: spatial transcriptomics and chronic electrophysiological characterization of tissue microenvironments
2026-Jun-19, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 介绍一种整合慢性电生理记录与空间转录组的原位石墨烯测序平台 首次将可拉伸网状纳米电子学与石墨烯/聚(3,4-乙撑二氧噻吩)聚苯乙烯磺酸盐透明电极结合,实现长期单细胞级电生理记录与成像式空间转录组学的无缝集成 NA 开发能够同时捕获组织微环境中细胞功能动态与分子身份的多模态分析平台 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞与内皮细胞共培养体系 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学、原位测序、电生理学 NA 图像、电生理信号、基因表达数据 NA NA 空间转录组学、电生理学 原位石墨烯测序平台 可拉伸网状纳米电子学与石墨烯/聚(3,4-乙撑二氧噻吩)聚苯乙烯磺酸盐透明电极结合,整合电生理记录与高吞吐量成像式原位测序
219 2026-06-21
Single-cell RNA sequencing profiles drug activity within spatially engineered 3D cultures
2026-Jun-19, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种基于转染的逐层构建方法,利用DNA条码编码细胞空间位置,实现空间编码三维培养物的单细胞RNA测序,揭示药物活性和基因表达的空间异质性 首次将DNA条码空间编码技术与单细胞RNA测序结合,实现三维细胞培养物的多重空间转录组分析,并融合成像技术定位细胞和测量组织弹性 方法依赖于转染构建,可能影响细胞生理状态;空间编码分辨率受限于层厚;仅验证HeLa模型,泛化性需更多研究 开发一种能够对三维细胞培养物进行空间转录组分析的方法,以揭示基因表达和药物响应的空间异质性 工程化三维球体(HeLa细胞模型) 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基于转染的DNA条码空间编码方法
220 2026-06-21
Regenerative repair is connected to early and specific structural, immune, and metabolic MSC signatures in adult mammals
2026-Jun-19, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析成年小鼠组织损伤后早期修复过程中间充质干细胞/基质细胞的异质性,发现再生修复与非再生修复间存在特定的结构、免疫和代谢特征差异 首次在具有相同发育阶段和遗传背景的成年哺乳动物模型中系统比较再生与非再生修复的早期MSC异质性变化,并提出SIM(结构、免疫、代谢)整合框架来诠释MSC的协调性组织修复功能 基于小鼠模型的研究结果可能需在更大规模或人类样本中验证,SIM框架的普适性和因果机制仍需进一步探索 研究成年哺乳动物组织再生修复与非再生修复早期过程中间充质干细胞/基质细胞的异质性变化及其对修复结果的调控作用 成年小鼠的间充质干细胞/基质细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠组织损伤模型的早期修复阶段样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部