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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-03 |
Glycolytic heterogeneity drives metabolic-targeted therapy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jan-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02546-8
PMID:41554705
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学、单细胞和批量RNA测序等技术,揭示胰腺导管腺癌的糖酵解异质性及其对代谢靶向治疗的影响 | 首次通过多组学方法(代谢组学、蛋白质组学、脂质组学)结合空间转录组学,系统描绘胰腺导管腺癌中糖酵解活性的空间异质性,并提出基于糖酵解分层的患者分层框架,指导个性化代谢治疗 | 未明确指出局限性,可能包括样本量有限、模型系统(离体标本和类器官)与体内环境的差异,以及多组学整合分析中的技术偏差 | 探究胰腺导管腺癌中糖酵解活性的表达模式异质性及其对代谢靶向治疗反应的指导意义 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本及患者来源的细胞模型(类器官) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 代谢组学, 蛋白质组学, 脂质组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 代谢组数据, 蛋白质组数据, 脂质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-06-03 |
ASB5 is a specific marker for muscle satellite cells but dispensable for skeletal muscle development and regeneration
2026-Jan-19, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-025-00409-y
PMID:41549311
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据确认ASB5为肌肉卫星细胞的特异性标记物,并通过CRISPR-Cas9基因敲除小鼠模型发现ASB5在骨骼肌发育和再生中是非必需的 | 首次通过单细胞RNA-seq数据识别ASB5作为肌肉卫星细胞的特异性标记,并利用CRISPR-Cas9技术生成Asb5敲除小鼠模型,系统评估其在骨骼肌发育和再生中的功能 | 仅在正常生理条件下评估Asb5功能,未研究其在病理或应激条件下的潜在作用 | 鉴定新的肌肉卫星细胞分子标记物并阐明其功能,以增进对肌肉发育和再生的理解 | 肌肉卫星细胞及其在骨骼肌发育和再生中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | CNN | 基因表达数据 | 小鼠模型,具体样本量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析Tabula Muris和GSE150366数据 |
| 103 | 2026-06-03 |
Targeting thymidylate synthase enhances CD8 + T-cell infiltration and inhibits tumor growth in cervical cancer
2026-Jan-19, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03250-5
PMID:41553654
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研究论文 | 通过多组学方法揭示胸苷酸合成酶在宫颈癌免疫代谢调控中的作用,靶向该酶可增强CD8+ T细胞浸润并抑制肿瘤生长 | 首次阐明胸苷酸合成酶作为免疫代谢调节因子在宫颈癌肿瘤微环境中的双重作用,并开发了包含TYMS、MYO6、SPINT1和ESD的T细胞相关预后标志物 | 免疫活性小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境的复杂性,且需要进一步验证临床样本中的靶向治疗效果 | 探索胸苷酸合成酶在宫颈癌免疫逃逸中的调控机制及其作为治疗靶点的潜力 | 宫颈癌患者肿瘤组织样本及免疫活性小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、功能实验、体内建模 | NA | 基因表达数据 | 47,589个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 104 | 2026-06-03 |
Thrombospondin 1 and 2 regulate mesenchymal progenitor cell fate and matrix organization
2026-Jan-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00493-2
PMID:41554713
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研究论文 | 研究揭示了血小板反应蛋白1和2在间充质祖细胞命运决定和细胞外基质组织中的调控作用,以及它们在创伤后异位骨化形成和进展中的关键角色 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了TSP1和TSP2在间充质祖细胞与细胞外基质相互作用及异位骨化形成中的不同表达模式和功能 | 未明确说明研究的不足之处 | 探究基质细胞蛋白TSP1和TSP2在间充质祖细胞与细胞外基质相互作用以及创伤后异位骨化形成和进展中的作用 | 创伤后异位骨化小鼠模型中的间充质祖细胞、组织重塑巨噬细胞及异位骨化前体周围的细胞 | 机器学习 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | TSP1/2双敲除小鼠及对照小鼠的损伤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | NA |
| 105 | 2026-06-03 |
Single-cell sequencing reveals that neutrophils mediate the inflammatory response in the placenta of women with GDM
2026-Jan-17, Journal of molecular histology
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s10735-025-10707-w
PMID:41546731
|
研究论文 | 利用单细胞测序揭示中性粒细胞在GDM胎盘炎症反应中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序构建GDM胎盘细胞图谱,鉴定出Neutrophil_1为促炎性亚群并阐明其分化路径与代谢调控机制 | 基于公共数据可能受批次效应影响,缺乏功能性验证实验 | 阐明妊娠期糖尿病(GDM)胎盘炎症的细胞机制 | GDM患者和对照组的胎盘组织细胞 | 单细胞组学 | 妊娠期糖尿病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 公共数据库中的GDM和对照胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-06-03 |
A dual-action core-shell microneedle system restores mitochondrial function and accelerates healing in diabetic wounds
2026-Jan-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04048-3
PMID:41547872
|
研究论文 | 开发了一种双重作用核壳微针系统,通过恢复线粒体功能加速糖尿病伤口愈合 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定VDAC1为糖尿病伤口的关键内皮靶点,并设计核壳微针系统实现活性氧响应性抗氧化和持续抑制VDAC1寡聚化的序贯治疗 | 未提及 | 开发一种序贯递送平台,通过恢复线粒体功能促进糖尿病伤口愈合 | 糖尿病小鼠和糖尿病猪模型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠模型和糖尿病猪模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 107 | 2026-06-03 |
Tissue-specific and sex-biased glycoproteomic landscape of Schistosoma mansoni
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68400-9
PMID:41545360
|
研究论文 | 该研究对曼氏血吸虫成年雄性和雌性进行了N-和O-糖蛋白组及完整糖肽分析,并结合单细胞转录组学揭示了组织特异性和性别偏倚的糖基化模式 | 首次建立曼氏血吸虫的组织特异性和性别偏倚糖蛋白组图谱,发现未分类聚糖和己糖醛酸修饰,并通过RNAi靶向糖基转移酶证明糖基化对寄生虫生存力的重要影响 | NA | 揭示曼氏血吸虫的糖蛋白组特征,为基于聚糖和糖蛋白的血吸虫病控制策略提供基础资源 | 曼氏血吸虫成年雄性和雌性 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 糖蛋白组学,单细胞转录组学,RNAi | NA | 糖肽数据,单细胞转录组数据 | 成年曼氏血吸虫雄性和雌性样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-03 |
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68487-0
PMID:41545411
|
研究论文 | 提出STimage模型套件,利用深度学习从标准H&E图像预测空间基因表达和细胞类型,提升数字病理学中的可解释性和鲁棒性 | 通过集成基础模型和集成方法估计基因表达分布并量化不确定性,结合单细胞分辨率的归因分析与组织病理注释实现可解释性 | 基于摘要未明确提及局限性可能包括模型对数据集的依赖性和计算成本,但需进一步查看全文 | 开发可解释且鲁棒的深度学习模型,从空间转录组学数据中预测基因标记和细胞类型,推动数字病理学发展 | 空间转录组学数据中的基因表达和细胞类型 | 数字病理学, 计算机视觉 | 泛癌种(根据多数据集验证推测) | 空间转录组学, 深度学习 | 基础模型, 集成方法 | 图像, 基因表达数据 | 多个公开数据集(具体数量未在摘要中提供) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-06-03 |
Identifying Crucial Genes Associated with Pyroptosis in Lupus Nephritis
2026-Jan-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02402-5
PMID:41545631
|
研究论文 | 利用GEO数据库数据集鉴定狼疮肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因,并构建预测模型及验证GBP2和EIF2AK2作为潜在治疗靶点的作用 | 首次通过整合WGCNA和单细胞RNA测序数据,鉴定GBP2和EIF2AK2为狼疮肾炎中与细胞焦亡相关的枢纽基因,并验证其可作为治疗靶点 | 摘要未明确提及研究局限性 | 鉴定狼疮肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 狼疮肾炎患者的肾小球、肾小管间质及全肾组织 | 机器学习 | 狼疮肾炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 基于GEO数据库数据集,具体样本数未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-06-03 |
Targeting the CCL7-STAT1 axis attenuates microglial neurotoxicity and photoreceptor degeneration in retinitis pigmentosa
2026-Jan-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03692-8
PMID:41545890
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定CCL7-STAT1轴在视网膜色素变性中介导小胶质细胞神经毒性和感光细胞退化的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序在rd10小鼠模型中识别出CCL7hi小胶质细胞亚群,并揭示CCL7-STAT1轴作为自我放大炎症级联反应的关键调控因子 | 主要基于小鼠模型,人类RP中的机制验证及临床转化可行性尚需进一步研究 | 阐明小胶质细胞介导的神经炎症在视网膜色素变性进展中的分子机制 | rd10小鼠模型的视网膜小胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | rd10小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-06-03 |
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8339668/v1
PMID:41646424
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研究论文 | 利用snRNA-seq、空间转录组学和基于机器学习的疾病预测,解码H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用 | 首次结合单核RNA测序和NanoString GeoMx空间转录组学,揭示长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的细胞类型特异性和空间解析机制,并开发了基于机器学习的细胞类型特异性疾病预测模型 | 研究基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;机器学习模型在人类数据集中的验证样本量有限 | 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性和空间解析机制 | 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除和双敲除(Mdr2/H19敲除)小鼠的肝组织 | 机器学习 | 胆汁淤积性肝病(原发性硬化性胆管炎) | 单核RNA测序(snRNA-seq),NanoString GeoMx空间转录组学 | 逻辑回归、XGBoost、神经网络、随机森林 | 基因表达数据 | 年龄和性别匹配的小鼠,具体数量未给出 | NanoString | 空间转录组学,单核RNA-seq | NanoString GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学用于组织切片分析 |
| 112 | 2026-06-03 |
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.699079
PMID:41648121
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research paper | 本研究使用急性木烟暴露加速卵巢功能衰竭的小鼠模型,探讨了围绝经期样激素状态如何影响海马体对空气污染的转录组反应 | 首次利用空间转录组学技术,在细胞类型分辨率下揭示了木烟暴露与卵巢激素下降联合作用下的海马体转录组变化 | NA | 探讨围绝经期样激素状态是否放大海马体对急性木烟暴露的反应 | 雌性C57BL/6小鼠的海马体组织切片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 每组4个组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium 空间转录组学平台 |
| 113 | 2026-06-03 |
Revealing hidden regulatory dependencies: multi-perspective graph learning for single-cell gene regulatory network inference
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf733
PMID:41554051
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研究论文 | 提出了一种名为ATFGRN的自适应拓扑特征融合图神经网络框架,用于从单细胞转录组数据中推断基因调控网络 | 通过多视角特征融合(子图结构、表达引导、相似性结构)以及自适应权重机制,实现了结构、表达和相似性特征的互补整合,显著提升了基因调控网络推断的准确性 | 未明确提及 | 提高从复杂高维单细胞转录组数据中准确推断基因调控网络的能力 | 基因调控关系及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络、图卷积网络、自注意力机制、图注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 未知 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 114 | 2026-06-03 |
Molecular Mechanisms of DBNL in Heart Failure: From Macrophage Immunometabolism to Therapeutic Implications
2026-Jan-02, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69756
PMID:41553874
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法,包括孟德尔随机化和单细胞RNA测序,揭示了DBNL在心力衰竭中的作用机制,从巨噬细胞免疫代谢角度探讨其治疗潜力 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序的多组学方法,鉴定DBNL为心力衰竭关键基因,并通过分子对接和动力学模拟发现吡啶酸可能调控DBNL | 治疗相关性仅来自计算预测,需要额外实验验证和临床前研究来证实DBNL作为治疗靶点的临床有效性 | 识别心力衰竭的潜在生物标志物和治疗靶点,阐明DBNL在疾病进展中的作用机制 | 心脏巨噬细胞中的DBNL基因 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-06-03 |
Sex in Immune Cells and Parasitic Diseases - A Complex Relationship
2026-Jan, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70097
PMID:41546136
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综述 | 综述了免疫细胞中性别差异对寄生性疾病影响的研究现状 | 结合经典免疫学与单细胞转录组学,揭示激素和染色体因素驱动先天性和适应性免疫细胞性别差异的新机制 | 许多寄生性疾病研究仍缺乏按性别分列的数据或应用最新免疫学分析 | 探讨免疫细胞性别差异对寄生性疾病的影响及其机制 | 免疫细胞(先天性和适应性)及寄生性疾病(利什曼病、恰加斯病、阿米巴病、血吸虫病、疟疾) | 数字病理学 | 寄生性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-06-03 |
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/nep.70165
PMID:41549440
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析探讨GSTO1与糖尿病肾病之间的潜在因果关系 | 首次利用孟德尔随机化方法结合多种组学数据(包括scRNA-seq)系统评估GSTO1与DN的因果关系 | MR分析中使用的遗传变异可能无法完全代表GSTO1的全部功能,且样本量有限,需进一步验证 | 探究GSTO1与糖尿病肾病风险之间的潜在因果关系 | GSTO1基因与糖尿病肾病 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、scRNA-seq、表达分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 来自Nephroseq数据库和GEO数据集的样本,以及scRNA-seq和HK-2细胞实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-06-03 |
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70469
PMID:41549547
|
研究论文 | 探索BioHEART-CT参与者外周血单核细胞中线粒体活性氧生成与冠状动脉疾病的关系 | 首次结合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序,系统评估PBMC中mROS水平与CAD及心血管风险因素的相关性 | 样本量较小(40例),且为横断面研究,无法确定因果关系;mROS与CAD关联不显著,亚组分析结果探索性强且不一致 | 评估PBMC中mROS生成是否可作为冠状动脉疾病的外周血生物标志物 | BioHEART-CT研究参与者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 冠状动脉疾病 | MitoSOX流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 流式细胞术数据, 单细胞基因表达数据 | 40例BioHEART-CT参与者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 118 | 2026-06-03 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎中通过增强破骨细胞生成促进牙槽骨吸收的机制 | 首次揭示了lncRNA ZFAS1作为双重通路调节因子,同时促进破骨细胞生成并抑制成骨细胞生成,且其表达受分化信号(RANKL)和炎症信号(LPS)协同诱导 | 未提供明显局限性信息 | 探究lncRNA ZFAS1在牙周炎微环境骨重塑失衡中的机制作用 | 健康和病变的牙周组织、RAW264.7和MC3T3-E1细胞系 | 数字病理学 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR, 组织学, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-06-03 |
MAPRE2 is associated with macrophage-enriched innate immune dysregulation and malignant phenotypes in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1849407
PMID:42220486
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research paper | 本研究整合多组学孟德尔随机化与肿瘤转录组学、免疫去卷积、DNA甲基化分析、单细胞RNA测序及功能缺失实验,发现MAPRE2在肝细胞癌中过表达,与巨噬细胞富集的先天免疫失调和恶性表型相关 | 首次通过多组学孟德尔随机化方法整合转录和蛋白质层面证据,系统识别MAPRE2作为肝癌风险一致性增加的候选基因,并揭示其与先天免疫微环境失调的关联 | 需要体内实验、移植队列和外部预后验证来确认MAPRE2作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 探索肝细胞癌恶性行为与先天免疫微环境之间的分子联系 | 肝细胞癌肿瘤组织及HepG2和MHCC97肝癌细胞系 | machine learning | lung cancer | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 甲基化测序 | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-06-03 |
Comprehensive analysis of fatty acid desaturase 3 in clear cell renal cell carcinoma: insights into tumor progression, immune microenvironment, and clinical outcomes
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1817492
PMID:42220493
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研究论文 | 全面分析脂肪酸去饱和酶3在肾透明细胞癌中的作用,包括肿瘤进展、免疫微环境和临床结果 | 首次系统性地研究了FADS3在ccRCC中与脂质代谢、肿瘤进展、免疫微环境重塑及预后相关的多重作用,并结合多种生物信息学方法和功能实验验证 | 主要基于公共数据库数据,缺乏大型前瞻性队列验证;功能实验局限于体外细胞系,未进行体内动物模型验证 | 阐明FADS3在ccRCC进展、预后及肿瘤免疫微环境调节中的作用 | 肾透明细胞癌肿瘤组织、肿瘤细胞及肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学,癌症生物学 | 肾透明细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据,转录组数据 | 使用来自TCGA、GEO和GTEx数据库的ccRCC转录组数据集,以及ccRCC细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |