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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-06-03
Supervised deep learning with gene functional annotation for cell classification
2026-Jun-01, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 开发了SDAN方法,将基因功能注释信息与基因表达谱整合到图神经网络中,用于单细胞RNA-seq数据的细胞分类 首次将基因功能注释(如蛋白质-蛋白质相互作用)与图神经网络结合,实现了功能相关的基因集识别和准确的细胞分类 未提及明确局限性,但基于真实数据应用(COVID-19、痴呆症、癌症免疫治疗)可能样本数量有限 开发一种整合基因功能注释的监督深度学习方法,解决单细胞RNA-seq数据中大量差异表达基因但效应量微小的问题 单细胞RNA-seq数据中的细胞分类及相关的功能基因集 机器学习 COVID-19, 痴呆症, 癌症 单细胞RNA测序 图神经网络 基因表达数据 NA(未提供具体样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
42 2026-06-03
CeSpGRN: Inferring cell-specific gene regulatory networks from single cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出CeSpGRN方法,从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络 利用核加权高斯Copula图模型,在目标函数中整合单细胞分辨率区域信息和多组学或空间位置数据,实现细胞级别的基因调控网络推断 未明确提及局限性 开发能从单细胞RNA-seq、配对scRNA-seq和scATAC-seq或空间转录组数据推断细胞特异性基因调控网络的计算方法 模拟数据和真实单细胞多组学数据集 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 核加权高斯Copula图模型 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 模拟数据集和多个真实数据集 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
43 2026-06-03
Dual epitope anti-LILRB4 synthetic T-cell receptor and antigen receptor (STAR)-T-cell therapy for relapsed/refractory acute myeloid leukemia
2026-Jun-01, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 开发靶向LILRB4的双表位合成T细胞受体和抗原受体(STAR)-T细胞疗法,用于治疗复发/难治性急性髓系白血病,并进行了首次人体临床试验 首次开发双表位抗LILRB4 STAR-T细胞,在体外和体内表现出比单表位STAR-T或双表位CAR-T更强的肿瘤抑制作用,并完成了首次人体临床试验 样本量较小(9名患者),3例患者因实验室确认感染死亡,非应答者中单核细胞介导的自体T细胞功能抑制可能是治疗失败的主要原因 评估靶向LILRB4的STAR-T细胞疗法在复发/难治性急性髓系白血病中的安全性和疗效 LILRB4阳性的复发/难治性急性髓系白血病患者 数字病理学 急性髓系白血病 噬菌体展示文库筛选 NA 单细胞RNA测序数据 9名患者(6名完成安全性和疗效评估) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析STAR-T细胞治疗前后的免疫细胞变化
44 2026-06-03
Uncovering drug-associated risk signals for neovascular age-related macular degeneration: an integrative pharmacovigilance and proteogenomic study
2026-Jun-01, Eye (London, England)
研究论文 通过药效监测与蛋白质基因组学整合分析,揭示与新生血管性年龄相关性黄斑变性相关的药物风险信号 创新性地结合FDA不良事件报告系统分析、孟德尔随机化和共定位分析,以及单细胞RNA测序,从药物靶点与基因表达层面系统评估药物与nAMD的关联机制 仅基于FAERS数据可能存在报告偏倚,且药物与基因的因果关系需更多实验验证 识别与新生血管性年龄相关性黄斑变性相关的药物风险信号并探索其生物学基础 新生血管性年龄相关性黄斑变性(nAMD)患者及可能关联的药物 机器学习和生物信息学 年龄相关性黄斑变性 FAERS分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质互作分析 NA 文本数据(不良事件报告)、基因表达数据、蛋白质组数据 FAERS数据库包含大量报告,单细胞RNA测序来自nAMD患者样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2026-06-03
Slfn4-mediated Stat3 signaling promotes suppressive bone marrow monocytes in a murine second-hit sepsis model
2026-Jun-01, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
research paper 本研究通过小鼠二次感染败血症模型,发现Slfn4介导的Stat3信号通路促进骨髓单核细胞的免疫抑制功能 首次发现Slfn4标记骨髓中免疫抑制性M-MDSC样细胞亚群,并阐明Slfn4-Stat3轴在维持其抑制表型中的作用机制 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;具体分子机制仍需进一步深入解析 探讨败血症后期免疫抑制期骨髓免疫重塑的机制,特别是Slfn4对单核细胞免疫抑制功能的调控 小鼠骨髓中的单核细胞,特别是M-MDSC样细胞亚群 机器学习 败血症 流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠二次感染败血症模型中的骨髓样本,具体数量未详述 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 平台用于单细胞RNA测序
46 2026-06-03
Dexmedetomidine may alleviate severe acute pancreatitis-associated lung injury by targeting the AIM2 inflammasome in endothelial cells
2026-Jun-01, BMC anesthesiology IF:2.3Q2
研究论文 探讨右美托咪定通过靶向内皮细胞AIM2炎症小体缓解重症急性胰腺炎相关肺损伤的机制 首次发现右美托咪定通过靶向抑制AIM2炎症小体激活来缓解内皮细胞焦亡,从而改善重症急性胰腺炎相关肺损伤 该研究基于大鼠模型和细胞实验,其临床转化效果需进一步验证;AIM2敲低实验未显示右美托咪定的额外抑制作用,机制细节仍需深入 阐明右美托咪定在重症急性胰腺炎相关肺损伤中的保护作用及其分子机制 重症急性胰腺炎大鼠和脂多糖刺激的人脐静脉内皮细胞 NA 重症急性胰腺炎,肺损伤 转录组测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 大鼠模型(具体数目未在摘要中提及)和人脐静脉内皮细胞 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
47 2026-06-03
Lung Cancer Patients Display Increased Expression of Bovine Meat and Milk Factor (BMMF) Proteins in Peritumor Alveolar Macrophages
2026-Jun-01, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过免疫组化、共免疫荧光显微镜、免疫检测/质谱分析及基因组学/转录组学筛选,在肺癌患者的肿瘤/肿瘤周围组织中检测到牛乳和肉因子(BMMF)蛋白表达增加,尤其在肺泡巨噬细胞中,且表达与吸烟强度呈负相关,表明BMMF是一种新的、不依赖吸烟的肺癌生物标志物和潜在驱动因素 首次在肺癌患者中检测到BMMF蛋白表达,并发现其通过诱导促肿瘤M2样巨噬细胞表型驱动肺癌,且与吸烟强度负相关,为不吸烟相关性肺癌提供了新生物标志物和潜在治疗靶点 未明确提及BMMF与肺癌的因果机制细节,样本量较小(35例肺癌患者和19例对照),且未进行大规模验证或纵向研究来评估BMMF作为早期检测标志物的有效性 探究牛乳和肉因子(BMMF)在肺癌患者中的表达及其作为肺癌风险因素和生物标志物的可能性 肺癌患者(35例)的配对肿瘤/肿瘤周围组织以及癌症自由个体(19例)的良性错构瘤周围组织中的肺泡巨噬细胞 数字病理学 肺癌 免疫组化、共免疫荧光显微镜、免疫检测/质谱分析、基因组学/转录组学筛选、单细胞RNA测序 NA 组织样本图像、蛋白质和核酸序列数据 35例肺癌患者的配对肿瘤/肿瘤周围组织及19例对照的良性错构瘤周围组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2026-06-03
Engineered Pericyte-Targeted Extracellular Vesicles Protect Against Hypoperfusion-Induced Cognitive Impairment and Vascular Demyelination
2026-Jun, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 开发了一种靶向周细胞的工程化细胞外囊泡,用于减轻低灌注引起的认知障碍和血管性脱髓鞘 利用生物正交方法构建cNGR肽功能化的细胞外囊泡,实现对CD13阳性脑周细胞的特异性靶向,为血管性认知障碍提供新的治疗策略 未提及具体局限性 开发靶向周细胞的治疗策略,保护神经血管单元功能,预防认知衰退和髓鞘丢失 CD13阳性脑周细胞 计算机视觉 血管性认知障碍 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型(双侧颈总动脉狭窄模型) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
49 2026-06-03
Multi-omics insights for deciphering prognosis-related T cell subsets in hepatocellular carcinoma
2026-Jun, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过多组学分析揭示肝细胞癌中与预后相关的T细胞亚群及其分子机制 首次利用质谱流式、批量RNA-seq和单细胞RNA-seq等多组学数据系统描绘了与肝细胞癌预后相关的T细胞景观,并发现CD4+CD8+双阳性T细胞与不良预后相关,且内皮细胞来源的HBEGF-DPT轴可能是潜在治疗靶点 未提及具体局限性信息 解析肝细胞癌中与预后相关的T细胞亚群及其潜在机制 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本、小鼠模型及接受阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗治疗的患者 数字病理学 肝细胞癌 质谱流式、批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、流式细胞术、基因敲低、迁移实验、共培养实验、qPCR、伤口愈合实验 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据 多个肝细胞癌队列及同源小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
50 2026-06-03
CA9 targets ITGB1 to accelerate the progression of colorectal cancer by promoting the neutrophil extracellular traps formation
2026-May-31, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本文揭示了碳酸酐酶IX(CA9)通过促进中性粒细胞胞外陷阱形成来加速结直肠癌进展的机制 首次揭示CA9通过结合ITGB1激活NF-κB通路,上调CXCL8分泌,进而促进中性粒细胞胞外陷阱形成的新机制 该研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需更多临床样本验证 阐明CA9在结直肠癌免疫微环境中的作用机制,探索新的治疗靶点 结直肠癌细胞及肿瘤组织中的中性粒细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 分子对接, 免疫共沉淀, 细胞因子阵列 NA 基因表达数据, 图像数据 结直肠癌患者血清样本(对照非癌症样本),结直肠癌小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序系统用于公共单细胞RNA-seq数据分析
51 2026-06-03
Multi-ancestry transcriptome-wide association studies uncover insights into breast cancer genetics and biology
2026-May-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过多祖先转录组全关联研究揭示乳腺癌遗传与生物学新见解 首次利用多祖先数据构建基因表达、可变剪接和3'UTR可变多聚腺苷酸化的遗传预测模型,识别出103个此前未报道的乳腺癌易感基因 仅使用正常女性组织样本构建模型,可能无法完全代表肿瘤微环境中的基因调控模式 识别乳腺癌易感基因并阐明其遗传与生物学机制 正常女性乳腺组织样本及乳腺癌病例-对照样本 自然语言处理 乳腺癌 转录组全关联研究 NA 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 652个正常女性组织样本(模型构建);178,534例病例和248,300例对照(关联分析) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'测序, Illumina NovaSeq 批量RNA测序
52 2026-06-03
Decoding the role of H19 in cholestatic liver injury using snRNA-seq, spatial transcriptomics, and machine learning-based disease prediction
2026-May-29, Cell & bioscience
研究论文 利用snRNA-seq、空间转录组学和机器学习解码H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习预测模型,揭示H19缺失通过抑制致病性胆管细胞状态和SPP1信号通路减轻胆汁淤积性肝损伤的机制,并鉴定出跨物种保守的胆管细胞标志物 未提及具体局限性,但可能包括小鼠模型与人类的差异、样本量有限、机器学习模型的泛化性需进一步验证 阐明长链非编码RNA H19在原发性硬化性胆管炎进展中的细胞和分子机制,并开发基于机器学习的疾病预测模型 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除和双敲除小鼠的肝脏组织 机器学习, 数字病理学 胆汁淤积性肝病, 原发性硬化性胆管炎 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 机器学习预测模型 单核RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确提供具体样本数量,涉及四种基因型小鼠的肝脏组织 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 GeoMx空间转录组学平台 单核RNA测序和GeoMx空间转录组学分析
53 2026-06-03
Microenvironment T-Type calcium channels regulate neuronal and glial processes in tumor cells to promote glioblastoma growth
2026-May-29, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 该研究揭示了微环境T型钙通道(Cav3)通过调节神经元和胶质细胞过程促进胶质母细胞瘤(GBM)生长的机制 首次证明微环境Cav3.2在GBM进展中的关键作用,并通过单细胞RNA-seq揭示其调控神经元和胶质细胞生物过程的机制 未明确说明具体局限性,但可能涉及动物模型与人类疾病的差异、钙通道阻滞剂mibefradil的临床适用性等 阐明微环境T型钙通道在调节GBM生长中的作用 小鼠GBM肿瘤模型、Cav3.2基因敲除小鼠、GBM干细胞、神经元细胞 神经肿瘤学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据(单细胞转录组) 具体样本数量未说明,包括WT和Cav3.2 KO小鼠的肿瘤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2026-06-03
Decoding anemoside B4: Core mechanistic axes and an omics-to-atom paradigm
2026-May-29, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本文剖析了白头翁皂苷B4(AB4)的核心作用轴,并提出了一个从组学迈向原子的研究范式 识别出AB4多效性作用中的四个核心机制轴,并揭示其“情境依赖性矛盾”,提出整合单细胞/空间转录组学、细胞类型特异性化学蛋白质组学、冷冻电镜和CRISPR功能基因组学的“组学至原子”研究范式 传统基于整体组织分析存在“分辨率上限”,掩盖了细胞类型特异性相互作用组,AB4的精确分子机制仍不完整 揭示白头翁皂苷B4的分子机制并提出现代天然产物药理学研究新范式 白头翁皂苷B4(AB4)及其在炎症、肿瘤、病毒和代谢疾病中的作用机制 自然语言处理 溃疡性结肠炎 单细胞转录组学、空间转录组学、化学蛋白质组学、冷冻电镜、CRISPR功能基因组学 NA 文本 NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
55 2026-06-03
A temporal single-cell atlas of the retina uncovers the dynamic transcriptomic landscape of sodium iodate-induced retinopathy in mice
2026-May-29, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 通过时间序列单细胞RNA测序绘制小鼠碘酸钠诱导视网膜病变的动态转录组图谱 首次构建碘酸钠诱导视网膜病变的时间单细胞图谱,揭示Müller胶质细胞炎症反应亚群和感光细胞亚型差异易感性,提出早期小胶质细胞炎症与胶质-感光细胞互作导致选择性视杆细胞退化的概念模型 未明确说明 解析视网膜变性过程中细胞类型特异性轨迹和阶段依赖性相互作用 碘酸钠诱导氧化损伤后不同时间点的小鼠视网膜细胞 单细胞转录组学 视网膜变性 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠视网膜样本(具体数量未在标题和摘要中提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-06-03
Application of single-cell transcriptomic technology in cell fate determination of embryonic liver
2026-May-29, Histology and histopathology IF:2.5Q2
综述 综述单细胞转录组技术在胚胎肝脏细胞命运决定中的应用,整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合和类器官建模的最新进展 提出细胞图谱构建、细胞间通讯分析、空间验证和类器官功能建模形成迭代循环的新范式,推动从描述性编目向机制解析的转变 未明确说明本综述的局限 总结单细胞转录组学在解析胚胎肝脏发育中细胞命运决定机制的研究进展,为先天性肝病、肿瘤分层和再生医学提供概念和方法基础 人及小鼠胚胎肝脏中的肝母细胞、肝细胞、胆管细胞、肝胆双能祖细胞、内皮细胞和星状细胞等非实质细胞 机器学习和数字病理学 先天性肝病 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、类器官建模 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 人类和小鼠胚胎肝脏样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
57 2026-06-03
Flowerbed-Inspired Mg-Loaded Scaffold Accelerates Critical-Sized Bone-Defect Repair by Reprogramming the Microenvironment
2026-May-28, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 受花床启发,开发了一种载镁仿生复合支架,通过单细胞RNA测序揭示其通过招募CCN3间充质干细胞亚群和重编程微环境加速临界尺寸骨缺损修复的机制 首次模拟花床结构设计载镁海藻酸盐水凝胶嵌入TPMS多孔钛合金框架的仿生支架,并利用单细胞RNA测序发现Mg富集微环境招募的CCN3间充质干细胞亚群在早期成骨和免疫调节中的双重作用 未提及在大型动物模型中的长期稳定性和安全性评估,以及临床转化的潜在挑战 开发一种能模拟稳定成骨微环境、促进承重区临界尺寸骨缺损修复的仿生复合支架 临界尺寸骨缺损动物模型(大鼠颅骨缺损和比格犬股骨髁缺损)以及骨髓间充质干细胞 数字病理学 骨缺损 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大鼠及比格犬骨缺损模型样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
58 2026-06-03
GDF15 Reprograms the Microenvironment to Drive Liver Metastasis of Uveal Melanoma
2026-May-28, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示GDF15在葡萄膜黑色素瘤肝转移中重编程微环境的作用机制 首次发现GDF15通过BAP1基因沉默上调,并利用H3K27ac修饰促进肝星状细胞重编程,驱动血管生成和肿瘤生长 未提供明确的定量限制信息;可能需进一步验证抗GDF15抗体的体内治疗效果 探索葡萄膜黑色素瘤细胞与肝星状细胞相互作用促进肝转移的机制 葡萄膜黑色素瘤细胞、肝星状细胞、内皮细胞 单细胞转录组学 葡萄膜黑色素瘤肝转移 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
59 2026-06-03
Preservation and clonal behavior of extrachromosomal DNA in patient-derived xenograft models of childhood cancers
2026-May-28, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 研究患者来源异种移植模型在儿童癌症中保留额外染色体DNA及其克隆行为 首次系统评估PDX模型在保留肿瘤ecDNA景观方面的保真度,揭示ecDNA在PDX发展中的动态变化和克隆选择 未明确说明,但可能包括PDX模型与原发性肿瘤间ecDNA序列断点一致性可变及样本量限制 评估患者来源异种移植模型在代表原发性肿瘤额外染色体DNA方面的保真度 儿童实体肿瘤中的额外染色体DNA及其在PDX模型中的行为 数字病理学 儿童癌症 全基因组测序,RNA和ATAC单细胞测序 NA 基因组序列,单细胞多组学数据 338个PDX模型和127个对应原发性肿瘤 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA NA
60 2026-06-03
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-May-28, Neurotoxicology IF:3.4Q2
研究论文 使用加速卵巢衰竭小鼠模型,研究急性木材烟雾暴露与海马体细胞特异性转录组反应的关系 首次在卵巢功能完整的围绝经期激素状态模型中,结合空间转录组学技术,揭示木材烟雾暴露与卵巢激素下降对海马体细胞类型特异性转录组响应的相互作用 未提供具体局限性信息 探究围绝经期激素状态是否加剧急性木材烟雾暴露对海马体的影响,并揭示相关细胞机制 雌性C57BL/6小鼠的加速卵巢衰竭模型 数字病理学 神经退行性疾病 空间转录组学 NA 基因表达数据 每组4个海马体切片 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
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