单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-04-01
Spatial Transcriptomics of Early Tooth Morphogenesis in Formalin-fixed Paraffin-embedded Mouse Embryonic Tissue
2026-03-13, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文描述了一种适用于空间转录组学应用的、针对小鼠胚胎颅面组织的收集、固定和石蜡包埋的分步协议 开发了一种优化的方法,用于处理福尔马林固定石蜡包埋组织,以保持RNA完整性和组织形态,适用于高分辨率空间分析,并兼容测序和基于图像的空间转录组学平台 该方法主要针对小鼠胚胎组织,可能在其他物种或组织类型中需要进一步优化,且依赖于特定的空间转录组学平台 理解正常牙齿发育的调控机制,以及先天性牙齿疾病如牙齿发育不全、牙本质发育不全和釉质发育不全的病理基础 小鼠胚胎颅面组织,特别是早期牙齿形态发生过程中的细胞群 空间转录组学 先天性牙齿疾病 空间转录组学技术 NA 空间基因表达数据和组织图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
162 2026-04-01
Histological, ultrastructural, and single-cell profiling reveal immune-mediated remodeling in gallbladder inflammation
2026-Mar-05, Cell and tissue research IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过组织学、超微结构和单细胞分析,揭示了胆囊炎症中免疫介导的重塑过程 首次结合单细胞RNA测序与超微结构分析,定义了急性与慢性胆囊炎症中不同的免疫-基质程序 样本量相对较小(41例患者),且未探讨炎症状态的时间动态变化 阐明急性与慢性胆囊炎症的细胞和结构特征,并连接上皮、免疫和基质改变 胆囊组织及血液样本,来自41名患者(包括12例急性胆囊炎和29例慢性胆石症) 数字病理学 胆囊疾病 单细胞RNA测序,组织病理学,免疫组织化学,透射电子显微镜,靶向细胞因子表达分析 NA 单细胞转录组数据,组织图像,血液样本 41例患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
163 2026-04-01
Organization and evolution of sex-biased gene expression in Drosophila adult sexual circuits
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,探究了果蝇成年性行为电路中性别偏向基因表达的组织结构和进化模式 首次在细胞分辨率下,结合性别决定基因作为分子标记,系统分析了果蝇性行为电路的转录组景观和进化动态 研究主要基于转录组数据,未直接验证基因表达变化与行为表型的因果关系 探究性行为电路如何从共享发育蓝图进化以满足性别特异性适应需求 果蝇成年性行为电路中的细胞类型 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
164 2026-04-01
Functional Type I and Type II interferon crosstalk restricts progenitor exhausted CD8 T cells through spatial exclusion and checkpoint enforcement
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了在慢性病毒感染中,I型和II型干扰素通过空间排斥和检查点强化协同限制前体耗竭CD8 T细胞(Tpex)的机制 发现了一种先前未被识别的、空间编码的干扰素调控回路,该回路通过将Tpex隔离在富含PDL1的B细胞生态位并抑制T细胞来源的IFNγ来限制其扩增 研究主要基于慢性LCMV感染模型,在其他慢性感染或肿瘤环境中的普适性有待验证 探究I型和II型干扰素在慢性感染中如何协同调控CD8 T细胞的命运 慢性LCMV感染模型中的前体耗竭CD8 T细胞(Tpex)及其与免疫微环境的相互作用 免疫学 慢性病毒感染 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
165 2026-04-01
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Mar-02, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨卵巢激素缺乏如何通过转录组和代谢改变加剧木材烟雾诱导的免疫功能障碍 首次结合单细胞RNA测序和功能验证,揭示卵巢激素缺乏条件下木材烟雾对骨髓免疫细胞的独特影响,并发现免疫-代谢解耦的新机制 研究主要基于小鼠模型,未直接验证人类样本;单细胞分析仅聚焦卵巢切除背景,可能未全面涵盖所有交互作用 识别木材烟雾暴露下的易感因素,特别是卵巢激素缺乏对免疫系统的影响 卵巢切除小鼠的骨髓免疫细胞和骨髓来源巨噬细胞 单细胞组学 免疫功能障碍 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 卵巢切除和假手术小鼠的骨髓细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
166 2026-04-01
Oligodendrocyte Precursor Cells Shape Retinogeniculate Refinement Via a CHD8-Dependent Phagocytic Pathway
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究揭示了少突胶质前体细胞(OPCs)在视觉发育关键期通过CHD8依赖的吞噬通路清除多余突触,从而塑造视网膜膝状体精细化的机制 首次鉴定OPCs为视觉发育关键期的主要突触吞噬细胞,并发现CHD8通过直接调控吞噬相关基因转录驱动此过程,将自闭症高风险基因与突触修剪功能异常联系起来 研究主要聚焦于小鼠视觉系统发育特定窗口期,其机制在其它脑区或发育阶段的普适性仍需验证 识别视觉发育关键期负责突触清除的主要胶质吞噬细胞,并阐明其调控的分子机制 小鼠背外侧膝状体核(dLGN)的胶质细胞和突触 神经科学 自闭症 三维成像、单细胞测序、基因组占据分析、体内电生理学评估 条件性基因敲除小鼠模型 图像、转录组数据、电生理记录 NA NA 单细胞测序 NA NA
167 2026-04-01
Single-Cell Mitochondrial Lineage Tracing Decodes Fate Decision and Spatial Clonal Architecture in Human Hematopoietic Organoids
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一种利用单细胞RNA测序中的线粒体转录本自然突变作为内源性遗传条形码的方法,以追踪人类多能干细胞在早期胚胎发生中的造血谱系命运决定和空间克隆结构 首次将线粒体转录本中的自然体细胞突变重新用作内源性遗传条形码,结合合成谱系追踪和空间转录组学,构建了一个可扩展、非侵入性的多模态框架,用于重建高分辨率时空克隆动态并解码生态位驱动的命运决定 方法依赖于线粒体读段的富集和稳健的计算流程,可能对测序深度和数据分析有较高要求;在人类干细胞衍生模型中的应用,其向体内系统或更复杂组织的推广效果尚需进一步验证 解码人类造血类器官中的命运决定和空间克隆结构,以解析发育和疾病中的组织自组织机制 人类多能干细胞(hPSCs)及其在早期胚胎发生中产生的造血谱系细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 动态系统模型 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
168 2026-04-01
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Mar, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术,分析了骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性及分子机制,以识别潜在治疗靶点 结合单细胞RNA测序与分子对接方法,首次在单细胞水平对比骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群分布和基因表达差异,并探索天然化合物与DAP3蛋白的相互作用 研究基于公开数据集,可能受样本来源和技术限制;分子对接结果为计算模拟,需实验验证 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性、分子机制及潜在治疗靶点 骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群,包括神经元、软骨细胞和免疫细胞 生物信息学 骨关节炎, 软骨肉瘤 单细胞RNA测序, 分子对接 t-SNE, UMAP 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
169 2026-04-01
Novel association of NAV3 with dilated cardiomyopathy and its role in cardiac fibrosis
2026-Mar-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过基因组关联分析发现NAV3基因与扩张型心肌病相关,并利用单细胞RNA-seq和体外实验揭示了NAV3在TGF-β1诱导的心脏成纤维细胞活化和纤维化中的新功能机制 首次将NAV3基因与扩张型心肌病的心脏纤维化联系起来,并发现其通过非经典信号通路(独立于SMAD2/3)和细胞周期调控来促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;机制研究尚未完全阐明NAV3调控的具体下游信号通路 探究NAV3基因在心脏病理生理学中的功能作用,特别是在扩张型心肌病相关心脏纤维化中的作用机制 人类心脏成纤维细胞(原代心室成纤维细胞) 基因组学与细胞生物学 扩张型心肌病 GWAS, 单细胞RNA-seq, RNA测序, Western blot, siRNA敲低 NA 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 未明确样本数量(使用已发表的人类心脏单细胞RNA-seq数据和原代细胞) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
170 2026-04-01
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-Mar, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了HDAC抑制剂在EBV阳性B淋巴母细胞中诱导的病毒裂解异质性,定义了流产和耐药状态 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EBV裂解复制的异质性,并识别了NF-κB通路和CD137/CD137L信号轴在阻止成功裂解复制中的关键作用 研究仅基于四种EBV阳性细胞系,未在体内模型或临床样本中验证,且单细胞测序仅针对P3HR1-ZHT BL细胞系进行 探究HDAC抑制剂在EBV相关恶性肿瘤中诱导病毒裂解复制的机制,并识别影响治疗反应的宿主因素 四种EBV阳性细胞系:P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞样细胞系 单细胞组学 EBV相关恶性肿瘤 单细胞RNA测序,Cas9-RNP功能验证 NA 单细胞RNA测序数据 四种EBV阳性细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
171 2026-04-01
STGNET: extending panel coverage in imaging-based spatial transcriptomics using deep generative adversarial networks
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究提出了一种名为STGNET的深度学习框架,通过结合生成对抗网络和图神经网络来扩展成像空间转录组学的基因面板覆盖范围 首次将多阶段生成对抗网络与空间感知图卷积网络相结合,通过整合物理细胞邻近性和转录相似性来优化基因插补,从而突破现有成像空间转录组技术基因面板有限的瓶颈 方法性能依赖于单细胞RNA测序数据的质量,且在极稀疏或噪声较大的空间转录组数据中可能面临挑战 开发一种能够扩展成像空间转录组学基因覆盖范围的深度学习工具,以促进更全面的空间生物学发现 成像空间转录组数据 数字病理学 乳腺癌 成像空间转录组学,单细胞RNA测序 生成对抗网络,图卷积网络 空间基因表达数据 九个不同的空间转录组数据集 NA 成像空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
172 2026-04-01
A hybrid neighborhood enhanced contrastive learning and self-knowledge distillation method for scRNA-seq data clustering analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为scKD的新方法,该方法结合了混合邻域增强对比学习和自知识蒸馏策略,用于提高单细胞RNA测序数据的聚类分析性能 首次将混合邻域增强对比学习模型与自知识蒸馏策略相结合,用于单细胞RNA测序数据分析,能够同时准确识别主要细胞类型和稀有细胞亚型 未明确说明方法在特定生物环境或疾病类型中的适用性限制,也未讨论计算资源需求 提高单细胞RNA测序数据的聚类分析准确性,解决细胞异质性分析中的高维度、复杂性和噪声问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习, 知识蒸馏 基因表达数据 多个真实世界数据集(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
173 2026-04-01
Loss of miR-29a/b1 cluster reprograms the tumor microenvironment and contributes to immunosuppression in lung cancer
2026-Feb-25, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,miR-29a/b1簇的缺失通过调控Enpp2/ATX等靶基因重塑肺癌肿瘤微环境,导致免疫抑制并影响PD-1抑制剂疗效 首次在Kras/p53驱动的肺癌模型中,通过单细胞RNA测序揭示miR-29缺失通过上调ATX等靶基因导致肿瘤微环境纤维化和免疫抑制,从而介导PD-1抑制剂耐药 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据来自公共数据库的回顾性分析,需要进一步临床验证 探究肺癌对PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药的新靶点 Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型、抗PD-1耐药肿瘤、公共数据库中的肺腺癌患者RNA测序数据 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA测序 NA 基因表达数据 未明确样本数量,包括抗PD-1耐药和敏感的小鼠肺癌模型及公共数据库患者数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
174 2026-04-01
Integrating scRNA-seq and snRNA-seq with spatial transcriptomics to unlock the xylem puzzle
2026-Feb-23, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)与空间转录组学,重建了杨树木质部发育的完整轨迹 整合scRNA-seq和snRNA-seq数据,克服了scRNA-seq在捕获晚期木质部细胞方面的限制,首次全面解析了木质部发育的连续过程,包括次生细胞壁沉积和程序性细胞死亡等关键阶段 研究主要基于杨树,结果在其他木本植物中的普适性有待验证,且空间转录组学数据的整合深度可能有限 解析木质部发育的动态连续过程,特别是次生细胞壁沉积和程序性细胞死亡等关键阶段 杨树(Populus)茎发育中的木质部细胞 植物生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学、激光捕获显微切割(LCM)、基因本体分析 支持向量机(SVM) RNA测序数据、空间转录组数据、图像数据(木质素自发荧光) 未明确指定样本数量,但涉及杨树茎发育木质部的scRNA-seq和snRNA-seq数据集整合 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
175 2026-04-01
Multi-species integration, alignment and annotation of single-cell RNA-seq data with CAMEX
2026-Feb-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CAMEX的异构图神经网络工具,用于整合、比对和注释来自多个物种的单细胞RNA测序数据 CAMEX利用多对多同源关系进行跨物种整合,在多种跨物种基准数据集上优于现有方法,并能促进不同发育阶段物种的比对 NA 解决多物种单细胞RNA测序数据整合与注释的挑战 多个物种的单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 异构图神经网络 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
176 2026-04-01
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合组织病理学分析、空间转录组学和单核RNA测序,揭示了人类小脑中Bergmann胶质细胞(BG)的时空发育图谱 挑战了先前认为BG在妊娠晚期出现的观点,发现BG在11周后即出现,并揭示了人类特有的三层组织结构及BG的多阶段起源 研究主要基于发育中的人类小脑样本,可能未完全涵盖所有发育阶段或疾病状态 阐明人类小脑中Bergmann胶质细胞的发育时间线、分子特征和空间组织 人类小脑发育过程中的Bergmann胶质细胞、Purkinje细胞及其他胶质细胞 数字病理学 神经发育障碍 组织病理学分析、空间转录组学、单核RNA测序 NA 图像、转录组数据 涉及多个发育阶段的人类小脑样本,具体数量未明确说明 NA 空间转录组学、单核RNA测序 NA NA
177 2026-04-01
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合miRNA与转录组分析,揭示了膀胱癌中性别特异的分子差异及其对肿瘤生物学和预后的影响 首次结合bulk mRNA/miRNA表达、生存建模和单细胞转录组分析,系统识别了膀胱癌中性别特异的分子特征和调控网络,并强调了常染色体基因的转录后调控在性别差异中的主导作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性验证;单细胞分析样本量有限,可能影响细胞类型特异性结论的普适性 阐明膀胱癌性别差异的生物学机制,识别性别特异的分子特征和调控相互作用 人类膀胱癌组织样本,包括肿瘤和正常组织 生物信息学 膀胱癌 bulk mRNA测序, microRNA测序, 单细胞RNA测序 差异表达分析, 生存分析(Kaplan-Meier, Cox模型), 相关性分析 基因表达数据, 生存数据 数据来源于TCGA、GEO和GSA等公共数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
178 2026-01-23
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics IF:3.5Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
179 2026-04-01
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了卵巢激素缺乏如何加剧木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍,揭示了相关的转录组学和代谢改变机制 首次在卵巢激素缺乏背景下,结合单细胞RNA测序和功能验证,系统揭示了木材烟雾暴露对骨髓免疫细胞的特定影响,并发现了免疫-代谢解耦这一新机制 研究主要聚焦于卵巢切除小鼠模型,未涉及其他激素缺乏状态或人类样本;功能验证主要在骨髓来源巨噬细胞中进行,体内整体免疫表型验证有限 探究卵巢激素缺乏是否增加对木材烟雾诱导的免疫功能障碍的易感性,并阐明其分子机制 卵巢切除(OVX)小鼠和假手术(Sham)小鼠的骨髓免疫细胞及骨髓来源巨噬细胞 单细胞组学 免疫功能障碍 单细胞RNA测序,代谢功能测定,巨噬细胞极化分析 NA 单细胞转录组数据,功能测定数据 卵巢切除和假手术小鼠,暴露于过滤空气或木材烟雾 NA 单细胞RNA-seq NA NA
180 2026-04-01
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional profiles of endometrial epithelial remodeling and identifies candidate genes regulating glandular cell development in Chinese Meishan pigs
2026-Jan-08, Journal of animal science IF:2.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,构建了中国梅山猪发情周期中子宫内膜上皮细胞的转录组图谱,揭示了上皮细胞异质性、分化轨迹以及调控腺体细胞发育的关键候选基因 首次在梅山猪中构建了涵盖卵泡期和黄体期的子宫内膜上皮单细胞转录组图谱,鉴定了包括ALDH1A3+LGR5+干细胞和ALDH1A1+祖细胞在内的新亚群,并解析了腺体上皮形成的连续分化轨迹及其相关的转录调控和代谢程序 研究聚焦于中国梅山猪这一特定品种,其发现是否普遍适用于其他猪种或哺乳动物尚需验证;单细胞测序技术本身可能无法捕获所有低丰度转录本或罕见的细胞状态 阐明猪子宫内膜在上皮细胞重塑过程中的细胞异质性、分化轨迹以及调控腺体细胞发育的分子机制 中国梅山猪的子宫内膜上皮细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部