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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-04-01 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2026-Mar-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101560
PMID:41903535
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研究论文 | 本文探讨了Seurat和Scanpy软件包在单细胞RNA测序分析中的算法差异及其对结果的影响 | 揭示了Seurat和Scanpy在多个分析步骤中输出结果的显著差异，并量化了这些差异相当于减少5%的读取或20%的细胞分析带来的变异性 | 研究主要关注Seurat和Scanpy的比较，可能未涵盖所有单细胞分析工具，且差异的具体生物学含义需进一步验证 | 评估单细胞RNA测序分析中软件包选择和版本更新对结果可重复性的影响 | 单细胞RNA测序数据分析流程，包括过滤、高变基因选择、降维、聚类和差异表达分析 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-04-01 |
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Mar-26, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001053
PMID:41885952
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研究论文 | 本研究探讨了母体低蛋白饮食对胎儿肾脏发育的分子和细胞影响，揭示了其如何通过影响肾单位祖细胞的承诺和分支形态发生来减少肾单位数量 | 首次结合单细胞RNA测序和成像技术，全面解析低蛋白饮食对肾脏发育过程中细胞转录变化和形态缺陷的影响，特别是识别了肾单位祖细胞承诺受损的核心机制 | 研究基于动物模型，结果可能无法直接外推至人类；未探讨长期后遗症的分子基础 | 探究母体低蛋白饮食如何影响胎儿肾脏的分子和细胞发育过程，以理解肾单位数量减少的机制 | 胎儿肾脏发育过程中的细胞类型，特别是肾单位祖细胞和输尿管尖端细胞 | 发育生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序，断层扫描成像，共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2026-04-01 |
Smoothie: efficient inference and integration of spatial co-expression networks from denoised spatial transcriptomics data
2026-Mar-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09898-z
PMID:41888598
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的流程，用于通过高斯平滑去噪空间转录组学数据，并构建和整合全基因组共表达网络 | Smoothie利用隐式和显式并行化技术，能够扩展到超过1亿个空间解析点的数据集，具有快速运行时间和低内存使用，实现了高效的空间共表达网络推断与整合 | NA | 从高分辨率空间转录组学数据中提取深层生物学见解，包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构关联以及多样本比较 | 空间转录组学数据中的基因共表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 144 | 2026-04-01 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Mar-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101346
PMID:41895263
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研究论文 | 本研究评估了整合单细胞RNA测序和单核RNA测序数据集以改善批量RNA测序反卷积性能的策略 | 首次系统比较了多种整合方法（包括基于主成分的潜在偏移、条件与非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤）在提升snRNA-seq作为反卷积参考方面的效果，并发现跨模态DEG过滤和条件scVI能显著提高准确性 | 研究仅在四种组织中进行基准测试，可能未覆盖所有生物环境；且当匹配的scRNA-snRNA细胞类型不可用时，方法性能可能受限 | 改善批量RNA测序反卷积的准确性，通过整合单细胞和单核RNA测序数据集 | 四种组织中的单细胞和单核RNA测序数据，以及真实的脂肪组织批量RNA测序样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | scVI（单细胞变分推断） | RNA测序数据 | 四种组织的数据集和真实脂肪样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-04-01 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics analysis reveals MYCN-UBE2C-TFRC signaling endows ferroptosis resistance in neuroectodermal tumors
2026-Mar-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3233-3
PMID:41915328
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学分析，揭示了MYCN-UBE2C-TFRC信号轴赋予神经外胚层肿瘤铁死亡抵抗的机制 | 首次发现了MYCN通过调控UBE2C表达，进而介导TFRC的泛素化降解，从而减少铁流入并赋予肿瘤细胞铁死亡抵抗的新机制 | NA | 探究MYCN扩增肿瘤中铁死亡抵抗的分子机制 | 神经外胚层肿瘤 | 数字病理学 | 神经外胚层肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CUT&Tag, 深度覆盖质谱蛋白质组学 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 146 | 2026-04-01 |
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117053
PMID:41811846
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研究论文 | 本研究通过染色体报告系统探究细胞在受限条件下如何引发延迟但可遗传的染色体丢失，揭示了压缩对细胞分裂和染色体稳定性的影响 | 开发染色体报告系统（ChReporters）量化活细胞中罕见的可遗传染色体丢失，首次发现适度压缩可通过延长有丝分裂期诱导染色体错误分离，形成“有丝分裂记忆” | 研究主要关注短期压缩效应，长期遗传稳定性变化未充分探讨；体外压缩模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 探究机械压缩如何影响细胞染色体稳定性及其在癌症进化中的作用 | 活细胞（具体细胞类型未明确说明） | 细胞生物学 | 癌症（实体瘤） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-04-01 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0775
PMID:41874448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IN-DEPTH的空间多组学整合方法，结合SGCC框架，用于揭示肿瘤微环境中的空间重组机制 | 开发了IN-DEPTH工作流程，实现同一切片上的空间蛋白质组学和转录组学整合，避免了RNA信号损失，并提出了SGCC框架用于解析细胞群间的空间协调功能状态变化 | NA | 开发一种高效的空间多组学整合方法，以揭示肿瘤微环境中的空间组织机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）组织样本，包括EBV阳性和EBV阴性肿瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学，空间蛋白质组学，单细胞空间蛋白质组学成像 | NA | 图像，转录组数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 148 | 2026-04-01 |
Single cell RNA analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathway
2026-Mar-24, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0294
PMID:41877584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠骨肉瘤模型，揭示了Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的功能，并发现了新的靶向通路 | 首次在免疫活性小鼠骨肉瘤模型中应用单细胞RNA测序技术，系统分析了Skp2缺失对肿瘤异质性、微环境、免疫应答和转移的影响，并发现了潜在的逃逸机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类患者中的直接适用性需进一步验证；单细胞测序数据可能受技术偏差影响 | 探究Skp2在骨肉瘤发生发展中的作用机制，并寻找新的治疗靶点 | Osx-Cre条件性Rb1/Trp53敲除小鼠的原发性骨肉瘤肿瘤，以及Skp2敲除或Skp2-p27相互作用破坏的模型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质组学数据 | 小鼠骨肉瘤肿瘤样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-04-01 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-Cell Data Analysis
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514490
PMID:41869863
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研究论文 | 本文通过八个下游任务的综合实验，评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能，并提出了scEval框架用于评估训练过程 | 首次对十个单细胞基础模型进行系统性性能评估和比较，提出了scEval评估框架，并为单细胞基础模型的预训练和微调提供了指导方针 | 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法，这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞测序数据分析中的效用和性能 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型（包括scGPT, Geneformer, CellFM等） | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-04-01 |
CX3CL1-CX3CR1 signaling orchestrates malignant progression of prostate cancer through luminal progenitor-macrophage crosstalk
2026-Mar-23, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01179-5
PMID:41870750
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CL1-CX3CR1信号轴在前列腺癌恶性进展中，通过管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用，驱动免疫抑制和癌症干细胞样细胞扩增的关键机制 | 通过整合单细胞转录组学与基因工程小鼠模型，首次明确了CX3CL1-CX3CR1轴作为管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞间关键信号通路，在塑造促肿瘤免疫抑制微环境中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类前列腺癌中的完全转化性及临床适用性仍需进一步验证 | 识别驱动去势抵抗性前列腺癌进展和治疗抵抗的肿瘤微环境中关键细胞间信号轴 | 前列腺癌（特别是去势抵抗性前列腺癌）中的管腔祖细胞（luminal-2）和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤微环境与免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型，原位同种异体移植模型 | NA | 单细胞RNA测序数据，体内表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-04-01 |
Visinin-like protein 1 disrupts calcium homeostasis and promotes atrial fibrillation in human and rodent models
2026-Mar-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02615-6
PMID:41872178
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研究论文 | 本研究通过整合人类心房颤动患者和啮齿动物模型的转录组学与电生理学数据，揭示了视锥蛋白样蛋白1在破坏钙稳态和促进心房颤动中的关键作用，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次在心肌细胞中发现并证实VILIP-1通过依赖豆蔻酰化的运输机制增加钠钙交换体1的表面丰度，从而破坏钙稳态并诱发心房颤动，并发现两种FDA批准药物可通过靶向VILIP-1或其豆蔻酰化来减轻房颤易感性 | 研究主要基于动物模型和体外机制探索，在人类患者中的直接干预效果和长期安全性仍需进一步临床验证 | 探究视锥蛋白样蛋白1在心房颤动发生发展中的作用机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 人类心房颤动患者的心房组织、起搏诱导的大鼠心房颤动模型以及心房心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | bulk RNA测序、单细胞转录组学、电生理学分析 | NA | 转录组数据、电生理数据 | 人类AF患者和啮齿动物AF模型（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 152 | 2026-04-01 |
Single-cell spatial transcriptomic analysis of human skin anatomy
2026-Mar-23, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02552-8
PMID:41872488
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研究论文 | 本研究构建了成人正常皮肤的单细胞空间转录组图谱，揭示了皮肤细胞类型在全身各解剖部位的组织结构 | 首次构建了覆盖全身15个解剖部位、包含约120万个细胞的皮肤单细胞空间转录组图谱，定义了10个多细胞邻域结构，并发现了疾病中免疫改变的空间区室化特征 | 研究仅基于正常成人皮肤样本，未深入探讨发育或衰老过程中的变化；样本数量（114个）虽覆盖多个部位，但个体间变异可能未完全捕捉 | 解析人类皮肤在全身各解剖部位的细胞和分子空间组织结构 | 正常成人皮肤组织（来自15个不同解剖部位） | 空间转录组学 | 皮肤疾病（泛指） | 单细胞空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 约120万个细胞，来自114个样本，涵盖15个解剖部位 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2026-04-01 |
Chemokine-defined macrophage niches establish spatial organization of tumor immunity
2026-Mar-23, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02445-2
PMID:41872505
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研究论文 | 本文揭示了肺癌中组织驻留CD206+和CD206-间质巨噬细胞亚群与Ly6c2+Fn1+Vcan+招募巨噬细胞之间的分工，以及它们通过趋化因子表达调控肿瘤免疫的空间组织 | 首次在肺癌中系统划分巨噬细胞亚群的空间功能分工，并发现趋化因子表达的间质巨噬细胞亚群具有相反功能，同时识别了单核来源树突状细胞在肿瘤引流淋巴结中的免疫抑制角色 | 研究主要聚焦于肺癌模型，未在其他肿瘤类型中验证；空间转录组学分析可能受技术分辨率限制 | 探究巨噬细胞谱系和空间组织如何塑造抗肿瘤免疫 | 肺癌中的巨噬细胞亚群、单核来源树突状细胞及肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-04-01 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101337
PMID:41875869
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研究论文 | 本文比较了三种不同的脑组织单细胞核RNA测序核分离方法，评估其对核完整性和数据质量的影响 | 首次系统比较了三种机制不同的核分离策略（蔗糖梯度离心法、离心柱法和机器辅助平台）对脑组织snRNA-seq数据质量的影响，揭示了方法依赖性差异 | 研究仅针对脑组织，未涵盖其他组织类型；样本量可能有限；未评估长期保存样本的影响 | 评估不同核分离方法对单细胞核RNA测序数据质量和生物学解释的影响 | 脑组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及三种方法比较 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2026-04-01 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2026-Mar-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117144
PMID:41875135
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探索了1型糖尿病自然病程中胰腺和胰腺淋巴结的炎症反应特征 | 首次在人类1型糖尿病中，通过多细胞和亚细胞分辨率空间转录组学，揭示了胰腺淋巴结中淋巴毒素-β的显著上调及其在滤泡B细胞中的来源，以及胰岛炎病变中的表达模式 | 研究样本量有限，且依赖独立供体集进行验证，可能影响结果的普遍性 | 探索1型糖尿病自然病程中胰腺和胰腺淋巴结的炎症反应机制 | 无糖尿病个体、风险性自身抗体阳性个体和1型糖尿病供体的胰腺及胰腺淋巴结组织 | 空间转录组学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包括无糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病供体的胰腺及胰腺淋巴结组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 多细胞分辨率空间转录组学和亚细胞分辨率空间转录组学平台 |
| 156 | 2026-04-01 |
A cell atlas of multiple liver organoids and the fetal liver based on scRNA-seq
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114955
PMID:41736863
|
研究论文 | 本研究通过整合多个肝脏类器官和人类胎儿肝脏的单细胞RNA测序数据，构建了一个包含217,025个高质量细胞的统一肝脏类器官细胞图谱 | 首次构建了跨多个培养方案的肝脏类器官综合细胞图谱，并系统比较了类器官与胎儿组织之间的差异 | 类器官在造血谱系代表性方面存在不足 | 理解肝脏类器官生长过程中的细胞特征和调控网络，以促进肝脏发育和功能研究 | 肝脏类器官和人类胎儿肝脏 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 217,025个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-04-01 |
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Mar-20, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3776
PMID:41860764
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和单细胞转录组学，分析了宫颈癌在放化疗过程中的肿瘤细胞和免疫微环境变化，并探讨了MDM2抑制作为克服治疗抵抗的潜在策略 | 首次在宫颈癌中结合多队列纵向研究、RNA测序和单细胞转录组学，系统揭示了放化疗对肿瘤细胞和免疫微环境的动态重编程作用，并验证了MDM2抑制在增强放疗效果和重塑免疫景观中的新作用 | 研究主要基于临床前模型，尚未在大型临床试验中验证MDM2抑制与放化疗联合的疗效和安全性 | 探索宫颈癌放化疗过程中的细胞和分子变化机制，并寻找克服治疗抵抗的新靶点 | 人类宫颈肿瘤组织及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多队列纵向研究样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-04-01 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Mar-17, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
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综述 | 本文深入综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等关键机制 | 将表观遗传学定位为连接遗传风险、环境触发因素和治疗进展的桥梁，并探讨了靶向表观遗传调控因子和表观基因组编辑技术（如CRISPR融合系统）作为精准治疗策略的转化潜力 | 临床前模型的预测价值有限，且表观遗传谱存在可变性 | 探讨表观遗传和转录调控网络在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病的表观遗传调控机制，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA | NA | 银屑病 | 表观遗传学分析，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA研究 | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 159 | 2026-04-01 |
TNFRSF21 Orchestrates Epithelial Keratinization and Tight Junction Integrity in Periodontitis-Associated Oral Mucosal Repair
2026-Mar-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL48371
PMID:41914294
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研究论文 | 本研究探讨了TNFRSF21在牙周炎相关口腔黏膜修复中调控上皮角化和紧密连接完整性的关键作用 | 首次揭示TNFRSF21通过调控角蛋白表达和与APP相互作用，在牙周炎上皮修复中的核心调控机制 | 研究主要基于体外模型和小鼠实验，临床转化仍需进一步验证 | 阐明TNFRSF在牙周炎发病和进展中的作用，并探索上皮角化修复机制以开发临床治疗策略 | 牙周炎患者的牙龈组织、体外角化模型、小鼠皮肤伤口模型 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫共沉淀 | NA | RNA测序数据、蛋白质相互作用数据 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织、小鼠伤口模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-04-01 |
T cell development from expanded hematopoietic progenitors reveals initiation control by Lmo2 and Flt3L priming
2026-Mar-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adw7765
PMID:41824555
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研究论文 | 本研究通过优化血清自由扩增系统，探索了小鼠T细胞发育的最早阶段，揭示了Lmo2和Flt3L在T细胞程序启动中的调控作用 | 开发了一种血清自由扩增系统用于造血干细胞和祖细胞样细胞，结合单细胞RNA测序验证了其正常T细胞分化能力，并首次揭示了Lmo2作为祖细胞和白血病相关因子显著抑制T细胞程序启动 | 研究仅基于小鼠模型，分化速度较新鲜祖细胞慢，且仅测试了23个转录因子的功能 | 探究小鼠T细胞发育的最早阶段及其调控机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞样细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |