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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-04-02
Network Hypoactivity in ALG13-CDG: Disrupted Developmental Pathways and E/I Imbalance as Early Drivers of Neurological Features in CDG
2026-01-14, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官,揭示了ALG13-CDG是一种大脑特异性低糖基化疾病,通过多组学与功能分析阐明了其导致皮质网络功能障碍的机制 首次通过人类皮质类器官模型揭示ALG13-CDG的大脑特异性糖基化缺陷机制,并整合多组学与电生理记录发现早期网络活动低下及兴奋/抑制失衡的发育时序异常 类器官模型虽能模拟早期发育,但无法完全再现成熟大脑的复杂结构与环路;研究样本量有限;机制验证仍需进一步体内实验 阐明ALG13-CDG疾病中ALG13功能缺失对大脑糖基化及神经发育的影响机制 ALG13-CDG患者来源的iPSC皮质类器官 神经发育疾病研究 先天性糖基化障碍(CDG) 单细胞RNA测序、蛋白质组学、糖蛋白质组学、N-聚糖成像、脂质组学、代谢组学、MEA电生理记录 人类皮质类器官模型 多组学数据(转录组、蛋白质组、糖基化组、脂质组、代谢组)及电生理信号 ALG13-CDG患者来源的iPSC皮质类器官(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 多组学分析 NA NA
82 2026-04-02
Single-cell transcriptome sequencing reveals hepatocyte heterogeneity in response to radiation-induced liver injury and regeneration
2026-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了辐射诱导肝损伤后肝细胞的异质性反应与再生机制 首次在辐射诱导肝损伤模型中,结合单细胞和单核RNA测序以及蛋白质组学分析,系统描绘了肝细胞亚群在空间和时间上的动态响应,并验证了人类肝组织中的保守通路激活 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨长期再生效果或临床转化潜力 阐明辐射诱导肝损伤的分子机制及肝细胞再生过程 大鼠肝细胞及人类肝组织 数字病理学 肝损伤 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 大鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
83 2026-04-02
GSK3β as a potential regulator in AML: A pan-cancer multi-omics analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,分析了GSK3α/β在31种癌症中的表达模式,揭示了其在肿瘤发生和免疫调节中的不同作用,并验证了GSK3β在AML中的关键调控功能 首次通过泛癌多组学分析揭示了GSK3α/β在不同癌症中的差异失调模式,并发现GSK3β在AML中作为高优先级治疗靶点的潜力 研究主要基于公共数据库和体外细胞系验证,缺乏体内实验和临床样本的直接验证 探究GSK3α/β在多种癌症中的表达模式、预后价值及免疫调节功能 31种癌症的多组学数据及AML细胞系(THP-1) 生物信息学 急性髓系白血病 多组学分析、单细胞RNA-seq、体外细胞实验 Cox回归分析 多组学数据、基因表达数据 TCGA、GTEx及单细胞RNA-seq数据库中的泛癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
84 2026-04-02
Integrated transcriptome and single-cell sequencing analysis identify blood-pancreas shared lncRNA biomarkers in new-onset T2DM
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合转录组测序和单细胞RNA测序,识别了初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 首次整合外周血转录组与胰岛单细胞测序数据,识别血液与胰腺共享的lncRNA作为T2DM早期系统性生物标志物 样本量相对较小,且为横断面研究,需进一步纵向验证 识别初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 初发2型糖尿病患者的外周血样本和胰岛组织 生物信息学 2型糖尿病 转录组测序, 单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析 RNA-seq数据 初始队列:8名T2DM患者和8名对照;单细胞队列:17名T2DM供体;验证队列:85名T2DM患者和85名对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
85 2026-04-02
Single-Cell/Nucleus RNA-Sequencing for Phytohormone Signaling in Plants
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本文详细介绍了单细胞/单核RNA测序技术在植物激素信号研究中的应用方法 利用scRNA-seq和snRNA-seq技术,在转录组水平实现细胞异质性的高分辨率映射,为植物激素信号研究提供了新方法 NA 研究植物激素信号传导的基因调控网络 植物细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
86 2026-04-02
Single-Cell Transcriptomics in Arabidopsis in Response to Salicylic Acid and Jasmonic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文提供了针对拟南芥水杨酸和茉莉酸响应的单细胞核RNA测序实验方案及生物信息学分析流程 开发了针对植物激素处理的单细胞核RNA测序端到端实验方案,并结合计算流程实现细胞类型分辨的激素免疫响应解析 NA 解析水杨酸和茉莉酸在植物免疫中的细胞类型特异性响应机制 拟南芥 单细胞转录组学 NA 单细胞核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
87 2026-04-02
Stereo-Seq Transcriptomics in Arabidopsis Leaves in Response to Salicylic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了一个完整的Stereo-seq工作流程,用于研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 首次将Stereo-seq技术应用于拟南芥叶片响应水杨酸的空间转录组研究,并提供了从样本制备到数据分析的完整工作流程 未明确说明样本数量,且工作流程可能受特定平台限制 研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 拟南芥叶片 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA STOmics, MGI 空间转录组学 STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片, DNBSEQ平台 STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片用于文库构建,DNBSEQ平台用于测序
88 2026-04-02
APOE and CCR2: Potential Macrophage-Specific Biomarkers in the Rheumatoid Arthritis Synovial Microenvironment Identified by Bioinformatics and Experimental Verification in Murine Models
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,在类风湿关节炎滑膜微环境中识别出APOE和CCR2作为潜在的巨噬细胞特异性生物标志物 结合批量与单细胞RNA-seq数据,识别出在滑膜巨噬细胞中特异性高表达并与炎症反应相关的枢纽基因APOE和CCR2,并通过实验验证了其表达调控 需要进一步研究以阐明APOE和CCR2在类风湿关节炎中的具体作用机制 识别类风湿关节炎中巨噬细胞特异性的枢纽基因并研究其生物学功能 类风湿关节炎患者的滑膜组织及小鼠RAW264.7细胞系 生物信息学 类风湿关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, ELISA, 免疫荧光染色 NA 基因表达数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
89 2026-04-02
Editorial: Unraveling breast cancer complexity: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
90 2026-04-02
Identification of a GPR182-postive stem cell population that drives polyp progression in familial adenomatous polyposis
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,识别了家族性腺瘤性息肉病中驱动息肉异质性的关键细胞亚群——GPR182阳性息肉干细胞 首次在家族性腺瘤性息肉病中鉴定出GPR182阳性息肉干细胞,并揭示其在驱动息肉异质性、免疫逃逸及预后和药物反应预测中的关键作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,缺乏前瞻性临床验证,且功能验证实验可能有限 解析家族性腺瘤性息肉病中息肉进展的异质性,以识别新的治疗靶点和生物标志物 家族性腺瘤性息肉病患者的单细胞和批量转录组数据 生物信息学 结直肠癌 单细胞测序,批量转录组测序 机器学习算法 基因表达数据 涉及多个公共数据集(GSE109308等),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
91 2026-04-02
Elevated growth differentiation factor-15 in sepsis: clinical associations and immune cell context
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了脓毒症患者血清中生长分化因子-15(GDF-15)水平的升高情况,及其与疾病严重程度、器官功能障碍和炎症活动的关联,并利用单细胞RNA测序数据分析了GDF15在免疫细胞中的表达模式 首次在脓毒症中结合临床血清GDF-15测量与公开的单细胞转录组数据,系统描述了GDF-15与疾病严重程度的关联及其在特定免疫细胞(浆细胞和单核细胞)中的表达富集,为理解其在危重疾病中的生物学背景提供了新见解 研究样本量较小(脓毒症患者n=19,健康对照n=23),为探索性观察研究,需要更大规模、特征明确的队列进行验证 阐明脓毒症中GDF-15的临床关联及其在免疫细胞中的表达背景,评估其作为反映系统生物应激的潜在生物标志物的价值 成人脓毒症患者和健康对照者的血清样本,以及公开的单细胞RNA测序数据集(GSE217906)中的免疫细胞 NA 脓毒症 酶联免疫吸附试验(ELISA),单细胞RNA测序数据分析 NA 血清蛋白浓度数据,单细胞转录组数据 临床队列:脓毒症患者19例,健康对照23例;生物信息学分析:公开数据集GSE217906 NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-04-02
Noninvasive assessment of core metastatic genes in lung adenocarcinoma: development of a predictive model integrating single-cell transcriptomics and radiomics
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和CT影像组学,识别了肺腺癌转移的关键分子驱动基因,并开发了一个非侵入性的影像预测模型 创新性地结合单细胞RNA测序和CT影像组学来识别肺腺癌转移的核心基因并构建预测模型,实现了分子表型与影像特征的关联 研究基于公共数据库数据,可能需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的泛化能力 开发一个非侵入性的预测模型,用于评估肺腺癌的转移潜能和预后 肺腺癌(LUAD)患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CT影像组学、免疫组织化学(IHC)、RT-qPCR LASSO回归、影像组学模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、CT影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
93 2026-04-02
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2025-Nov-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文系统性地比较了三种商业成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能 首次在包含多种肿瘤和正常组织的组织微阵列上,对10X Xenium、Vizgen MERSCOPE和Nanostring CosMx三种iST平台进行综合技术性能与生物性能基准测试 研究仅基于组织微阵列的连续切片,可能未完全反映实际临床应用中的组织异质性,且平台比较受限于匹配基因集 评估和比较不同成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能,为研究者在珍贵样本研究中提供方法选择指导 包含17种肿瘤和16种正常组织类型的组织微阵列的连续切片 空间转录组学 多种肿瘤 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 组织微阵列包含33种组织类型(17种肿瘤和16种正常) 10X Genomics, Vizgen, Nanostring 成像空间转录组学 10X Xenium, Vizgen MERSCOPE, Nanostring CosMx 商业成像空间转录组学平台应用于FFPE组织切片
94 2026-04-02
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析,探讨了乳酸化相关基因在新生大鼠缺氧缺血性脑损伤中的作用,并筛选出关键生物标志物GFAP和LCP1,验证了银杏内酯B和橘皮素的神经保护作用 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法,并研究了乳酸代谢相关基因的作用,为药物开发提供了新靶点和方向 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化需进一步验证 探究乳酸化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制,并寻找潜在治疗靶点 新生SD大鼠的脑组织 机器学习和多组学分析 新生儿缺氧缺血性脑损伤 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、分子对接 机器学习 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 SD大鼠模型,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-04-02
Engineering unnatural cells with a 21st amino acid as a living epigenetic sensor
2025-Oct-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了能够生物合成和遗传编码乙酰赖氨酸的自主细胞,作为活体表观遗传传感器,用于实时监测活体动物中的蛋白质翻译后修饰动态 利用遗传密码扩展技术,首次在活体动物中实现了基于21种氨基酸的工程化细胞作为非侵入性表观遗传传感器,用于实时跟踪去乙酰化酶活性和抑制剂效果 未明确说明传感器在复杂生物环境中的长期稳定性或潜在免疫反应,且可能仅限于乙酰化修饰的监测 开发非侵入性方法以实时监测活体动物中蛋白质翻译后修饰的动态变化 工程化的原核和真核细胞,以及活体动物模型 合成生物学 NA 遗传密码扩展技术 NA NA NA NA NA NA NA
96 2026-04-02
Concerted changes in Epithelium and Stroma: a multi-scale, multi-omics analysis of progression from Barrett's Esophagus to adenocarcinoma
2025-Oct-20, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了从巴雷特食管到食管腺癌进展过程中上皮与基质细胞的协同变化 首次整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学,系统描绘了从鳞状上皮到腺癌的多阶段进展特征 样本量相对有限(26例患者),且为观察性研究,需要更大队列验证 阐明巴雷特食管向食管腺癌进展的分子与细胞机制 食管组织样本(包括鳞状上皮、化生、异型增生和腺癌阶段) 数字病理学 食管腺癌 单细胞RNA测序、蛋白质组学、空间蛋白质组学、组织力学分析 多组学整合分析 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、空间蛋白表达数据、力学测量数据 107个样本来自26例患者(两个独立队列) NA 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 蛋白质组学 NA NA
97 2026-04-02
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文提出了一种多组学单细胞测序方法,用于精确评估CRISPR编辑后疾病相关等位基因的功能效应 开发了一种结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞测序方法,能够直接检测疾病等位基因的功能后果 未明确说明样本量或实验重复次数,可能受限于编辑效率和培养条件引起的非特异性转录变化 旨在克服CRISPR编辑中效率低、编辑结果异质性和非特异性转录变化的限制,以识别疾病相关非编码等位基因的因果变异和功能 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因以及多重编辑 单细胞多组学 自身免疫性疾病 CRISPR-Cas编辑,单细胞测序 NA 基因组DNA,转录组,蛋白质表达数据 NA NA 单细胞多组学测序 NA NA
98 2026-04-02
Robust and adaptive non-parametric tests for detecting general distributional shifts in gene expression
2025-Sep-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为QRscore的非参数框架,用于检测基因表达中的分布变化,包括均值偏移和方差偏移 QRscore通过从负二项分布和零膨胀负二项分布中推导模型信息权重,扩展了Mann-Whitney检验,能同时检测均值和方差偏移,具有高统计功效和错误发现率控制 NA 开发一种强大的非参数测试方法,用于检测基因表达中的一般分布偏移 基因表达数据,包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 生物信息学 NA RNA-seq 非参数框架(QRscore) 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-04-02
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-06-07, Biomolecules IF:4.8Q1
综述 本文综述了染色体灾难性事件(chromoanagenesis)在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等关键机制如何源于复制应激和DNA修复缺陷,并推动骨肉瘤的基因组不稳定性 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现,且基于染色体灾难性事件的临床转化策略尚处探索阶段 阐明染色体灾难性事件在骨肉瘤发生发展中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 骨肉瘤(儿童和青少年中最常见的恶性骨肿瘤)及其相关的基因组重排事件 基因组学 骨肉瘤 下一代测序(NGS)、光学基因组图谱、单细胞测序 NA 基因组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
100 2026-04-02
Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions
2025-02, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌(NSCLC)进展及治疗影响的分子、细胞和遗传机制,并探讨了针对老年患者的未来治疗策略 系统性地整合了免疫衰老在NSCLC中的作用机制,并重点探讨了如何利用单细胞测序、CRISPR-Cas9等新兴技术来理解并靶向免疫衰老,以优化老年患者的免疫治疗 本文是一篇综述性文章,未涉及原始实验数据或具体的临床研究,主要基于现有文献进行分析和展望 阐明免疫衰老如何影响NSCLC的进展和治疗反应,并探索改善老年NSCLC患者治疗效果的未来方向 非小细胞肺癌(NSCLC),重点关注老年患者群体及其衰老的免疫系统 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞测序,CRISPR-Cas9 NA NA NA NA NA NA NA
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