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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-03
Olfactory epithelium regeneration and homeostasis: cellular and molecular mechanisms and novel methodological advances
2026-Jun-02, Cell regeneration (London, England)
综述 综述了嗅上皮再生与稳态维持的细胞和分子机制,以及新兴技术进展 整合最新单细胞转录组学、空间转录组学和类器官模型的研究成果,揭示了先前未知的细胞状态、分化路径和细胞间通讯 未提及具体局限性信息 总结支持嗅上皮再生的分子和细胞机制,突出推进理解该过程的新兴技术 嗅上皮中的水平基底细胞和球状基底细胞 数字病理学 嗅觉功能障碍 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型 NA 转录组数据、空间数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
22 2026-06-03
OGFRL1 Deficiency Causes Chronic Recurrent Multifocal Osteomyelitis Via Pathologic Osteoclastogenesis, With Therapeutic Response to Tumor Necrosis Factor Inhibitor
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究验证了OGFRL1功能缺失变异在慢性复发性多灶性骨髓炎(CRMO)患者中的作用,并探讨其致病机制 首次发现OGFRL1缺陷是CRMO的新病因,揭示OGFRL1在抑制炎症反应中的先前未被认识的作用 NA 验证OGFRL1功能缺失变异在CRMO发病中的作用并研究其机制 CRMO患者、Ogfrl1基因敲除小鼠 机器学习 慢性复发性多灶性骨髓炎 全外显子测序、Sanger测序、定量PCR、ELISA、流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因测序数据、基因表达数据 1例CRMO患者及健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-06-03
Vascular basement membrane laminins modulate functional zonation of cerebral microvessels
2026-Jun, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究血管基底膜层粘连蛋白对脑微血管区域功能分化的调节作用 首次揭示层粘连蛋白α4和α5缺失通过影响内皮细胞和周细胞代谢通路调控微血管功能性区域划分,并发现层粘连蛋白α5上调可补偿紧密连接蛋白表达并促进血管收缩性 未明确免疫浸润或连接缺陷在卒中恶化中的作用,主要归因于血管通透性增加及驻留髓系细胞激活 探究血管基底膜层粘连蛋白如何影响脑微血管的区域差异及其功能分化 层粘连蛋白α4和α5缺失小鼠及野生型对照的脑血管 数字病理学 卒中 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠脑血管样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-06-03
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2026-Jun-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究结合遗传和药理学急性肾损伤动物模型、组织工程、全局和磷酸化蛋白质组学以及空间转录组学,绘制了细胞外基质蛋白图谱,发现微纤维相关蛋白2(Mfap2)通过大肿瘤抑制激酶1介导的非经典Hippo通路驱动力学代谢信号,调控肾脏修复 首次揭示Mfap2作为成纤维细胞/周细胞来源的核心基质体成分,通过非经典Hippo通路(大肿瘤抑制激酶1)依赖方式调控雌激素受体2-3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶2回路,介导力学代谢信号促进肾小管酮生成和损伤修复 研究主要基于动物模型,Mfap2-雌激素受体2-3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶2通路在人类急性肾损伤中的验证和转化潜力尚需进一步评估 阐明细胞外基质在急性肾损伤修复中的力学调控机制,并探索潜在治疗靶点 急性肾损伤小鼠模型中的肾脏基质、成纤维细胞、周细胞和肾小管上皮细胞 数字病理学 急性肾损伤 空间转录组学、全局蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、数据非依赖性采集 NA 基因表达数据、蛋白质组数据、组织图像 多个急性肾损伤小鼠模型样本(具体数量未在摘要提供) NA 空间转录组学 NA NA
25 2026-06-03
Locus-Specific Human Endogenous Retrovirus ERVK18 Expression Indicates an Inflamed Microenvironment and Favorable Immunotherapy Outcome in Small Cell Lung Cancer
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究探讨了位点特异性人内源性逆转录病毒ERVK18在小细胞肺癌中的表达与炎症微环境及免疫治疗预后的关系 首次发现位点特异性ERVK18转录本而非整个HERV-K亚家族与SCLC免疫治疗获益相关,并确认其作为PD-L1抑制剂一线治疗的双重预后和预测生物标志物 未明确说明局限性,但可能包括样本量有限、回顾性研究设计等 评估ERVK18表达与SCLC炎症微环境和免疫治疗结局的关联,并验证其作为生物标志物的潜力 小细胞肺癌患者肿瘤组织样本及免疫治疗队列数据 数字病理学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化(PhenoCycler-Fusion) NA 基因表达数据、免疫组化图像、单细胞转录组数据 IMpower133队列271例,PKUPH队列40例,组织微阵列48例 10x Genomics, Akoya Biosciences 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重成像 10x Chromium, PhenoCycler-Fusion 10x Chromium单细胞3'测序,PhenoCycler-Fusion多重免疫组化系统
26 2026-06-03
CCL3+ Neutrophil Signature Predicts Response to Neoadjuvant Toripalimab plus Chemotherapy in Patients with Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A Phase II Trial
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和大量RNA测序,发现CCL3+中性粒细胞特征可作为预测下咽鳞状细胞癌患者对新辅助特瑞普利单抗联合化疗反应的生物标志物 首次提出Neu_CCL3基因特征作为预测下咽鳞状细胞癌新辅助免疫治疗反应的强独立生物标志物,其预测效能显著优于PD-L1 CPS评分 单中心、单臂II期试验设计;验证样本量有限(60例);机制验证仅通过免疫组化和测序,缺乏更深入的实验验证 寻找可预测下咽鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的生物标志物 可切除局部晚期下咽鳞状细胞癌患者 数字病理学 下咽鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 大量RNA测序, 免疫组织化学 基因表达数据 70例患者(其中13例进行单细胞RNA测序,60例进行验证) NA 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 NA NA
27 2026-06-03
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-Jun-01, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 揭示HNF1A缺陷通过影响GLI3加工促进十二指肠而非胰腺命运,导致体内肠道延长 发现Hnf1a与Hedgehog信号之间的新型自调节回路,并阐明其通过调控GLI3加工影响后前肠细胞谱系分离 未提及具体局限性 阐明Hedgehog信号在后前肠谱系分离中的分子机制 人诱导多能干细胞和小鼠转基因模型 机器学习 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 显微镜检查, 生理学分析, 遗传细胞示踪 NA 转录组数据, 图像 人诱导多能干细胞分化样本和小鼠转基因模型样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-06-03
Single-cell and haplotype-resolved transcriptomics reveal molecular signatures of orchid floral structures
2026-Jun-01, Molecular plant IF:17.1Q1
研究论文 通过单细胞和单倍型分辨率的转录组学揭示兰花花朵结构的分子特征 首次结合单细胞转录组和单倍型解析基因组,揭示兰花花朵特化的细胞和分子机制,特别是发现了亲本基因组通过细胞类型特异和等位基因特异表达影响种间杂交性状的新见解 研究仅针对特定兰花品种(Dendrobium Chao Praya Smile)的花蕾,可能无法完全代表所有兰科植物的多样性 揭示兰花花朵特化结构的细胞异质性和分子基础 Dendrobium Chao Praya Smile 兰花的花蕾 数字病理学 不适用 单细胞RNA测序,单倍型解析基因组测序 不适用 图像,文本 Dendrobium Chao Praya Smile 花蕾样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序平台
29 2026-06-03
Podoplanin-defined tumour plasticity and CCR7-mediated lymphatic metastasis in triple-negative breast cancer
2026-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 研究Podoplanin(PDPN)定义的三阴性乳腺癌肿瘤可塑性与CCR7介导的淋巴转移的关系 发现PDPN定义的肿瘤细胞间充质转变是CCR7驱动淋巴转移和肿瘤进展的必要条件,且缺氧可促进这一过程,揭示了肿瘤可塑性与CCR7在淋巴扩散中的协同作用 NA 探讨PDPN定义的肿瘤可塑性如何与CCR7相互作用促进三阴性乳腺癌淋巴转移 三阴性乳腺癌小鼠模型、细胞系及原发性肿瘤样本 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包括METABRIC乳腺癌队列及scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
30 2026-06-03
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Jun, The EMBO journal
研究论文 通过对245,878个人类胰岛细胞进行单细胞转录组分析,揭示了2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 在非糖尿病、前糖尿病和2型糖尿病状态下对大规模人类胰岛细胞进行单细胞转录组测序,并鉴定出14种细胞类型;通过数据整合发现511个差异表达基因,包括维生素A代谢相关基因,并与β细胞活力受损相关联 未明确说明 研究人类胰岛细胞在2型糖尿病状态下的细胞类型特异性改变及其基因表达缺陷 来自48名捐赠者的人类胰岛细胞,涵盖非糖尿病、前糖尿病和2型糖尿病状态 机器学习 2型糖尿病 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 48名捐赠者的245,878个胰岛细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-06-03
Accurate delineation of cellular niches via integrated spatial transcriptomics and histological imaging with SYMOL
2026-Jun-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出了 SYMOL 统一协同自监督多模态框架,整合空间转录组学与组织学成像,准确描绘细胞微环境 通过多种预训练视觉模型提取特征,协同聚合跨模态信息生成形态学感知嵌入,解决现有方法难以捕获组织学形态信息的问题 未提及具体限制,但可能依赖公开数据集,且在复杂神经解剖环境中需进一步验证 实现空间转录组学与组织图像的整合,提升细胞微环境识别和多模态表征学习能力 多个公开空间转录组数据集,包括多通道免疫组化(IHC)和苏木精-伊红(H&E)图像 数字病理学 肺癌 空间转录组学、组织学成像 自监督多模态框架(SYMOL) 图像、空间坐标、基因表达数据 多个公开空间转录组数据集,具体数量未明确 NA 空间转录组学、多通道IHC、H&E染色 NA NA
32 2026-06-03
Single-cell transcriptomic profiling of the splenic and peripheral immune landscape in rhesus macaques during CHIKV infection
2026-Jun, Journal of virus eradication IF:3.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示猕猴感染基孔肯雅病毒后脾脏和外周血的免疫细胞动态变化 首次在非人灵长类模型中系统描绘CHIKV急性期脾脏和外周血单核细胞的单细胞转录组景观,揭示了中性粒细胞介导的炎症、T/B细胞先天-适应性转化特征以及Th1/Th17极化等关键免疫机制 仅分析了感染后第7天的急性期数据,缺乏时间动态变化和慢性期比较;未进行功能验证实验 阐明CHIKV急性感染的细胞免疫机制和致病机理 感染CHIKV的猕猴脾脏和外周血单核细胞 数字病理学 基孔肯雅病毒感染 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、图像数据 猕猴样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-06-03
Orai1 Facilitates Angiogenesis After Myocardial Infarction Through Notch1 Signaling Pathway
2026-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 探究Orai1通过Notch1信号通路在心肌梗死后促进血管生成的作用机制 首次揭示Orai1依赖性钙内流在心肌梗死后血管生成中的新作用,并识别Orai1为心脏修复的潜在治疗靶点 NA 阐明Orai1在心肌梗死后血管生成中的分子机制 人脐静脉内皮细胞、小鼠心肌梗死模型、斑马鱼胚胎、ST段抬高型心肌梗死患者血清 心血管生物学 心肌梗死 单细胞RNA测序、蛋白质组学、转录组学、免疫染色 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据 人脐静脉内皮细胞、小鼠心脏组织、斑马鱼胚胎 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析小鼠心肌梗死后心脏单细胞转录组
34 2026-06-03
A spatially coordinated keratinocyte-fibroblast circuit recruits MMP9+ myeloid cells to drive type I interferon-driven inflammation in photosensitive autoimmunity
2026-Jun, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序、空间转录组学等技术,揭示MMP9+CD14+髓系细胞在光敏感性自身免疫病中的关键作用 首次鉴定MMP9+CD14+髓系细胞是紫外线B诱导皮肤炎症的核心介质,并阐明角质形成细胞-成纤维细胞回路通过趋化因子招募这些细胞,且靶向I型干扰素治疗可阻断该过程 未明确提及,但可能包括样本量有限、动物模型验证不足、长期临床效果未评估 阐明紫外线B暴露导致皮肤自身免疫性炎症的机制,特别是光敏感性的分子通路 红斑狼疮和皮肌炎患者的皮肤样本及体外模型中的细胞 数字病理学 红斑狼疮, 皮肌炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 体外建模 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 未明确提及,但包括患者皮肤活检样本及体外细胞培养 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
35 2026-06-03
Transcription factor 21 deletion from podocyte precursors as a model for congenital nephrotic syndrome
2026-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 通过从足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型,并利用单细胞RNA测序分析肾脏损伤机制 首次通过足细胞前体特异性删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型,并生成全肾脏单细胞转录组数据集,揭示肾小管间质对蛋白尿的早期反应 未明确说明局限性 研究先天性肾病综合征的肾脏损伤机制,特别是足细胞发育缺陷及肾小管间质对蛋白尿的反应 转录因子21条件性敲除小鼠的肾脏细胞 机器学习 先天性肾病综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 转录因子21敲除小鼠及对照小鼠的肾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-06-03
Epigenetic reprogramming of T cell metabolism restores function and enhances anti-tumor immunity in lung cancer
2026-Jun, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 该研究通过表观遗传药物筛选发现BET抑制剂通过激活多胺生物合成途径恢复T细胞效应功能并增强抗肿瘤免疫 首次揭示BET抑制剂通过表观遗传重编程T细胞代谢(多胺途径)来逆转T细胞耗竭的机制,并证实MYC-ODC轴在促进祖细胞样T细胞向终末耗竭T细胞转化中的关键作用 主要基于肺癌恶性胸腔积液样本和同基因小鼠模型,临床转化潜力需进一步验证 探索通过表观遗传药物逆转T细胞耗竭以增强癌症免疫治疗效果的新策略 肺癌患者恶性胸腔积液中的初始耗竭T细胞,以及同基因肺癌小鼠模型 机器学习 肺癌 ATAC-seq, 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学, 表观遗传药物筛选 NA 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞RNA数据 肺癌患者恶性胸腔积液样本(具体数量未提及),同基因肺癌小鼠模型 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, ATAC测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA-seq; Illumina NovaSeq用于ATAC-seq和转录组测序
37 2026-06-03
Reversible loss of hematopoietic stem cells transplant potency by chronic Salmonella infection
2026-Jun-01, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 慢性沙门氏菌感染可逆地损害造血干细胞的移植能力 首次发现慢性沙门氏菌感染会导致造血干细胞移植能力可逆性丧失,并证明抗生素治疗可恢复其功能 未详细说明慢性感染对造血干细胞长期功能的具体机制,以及抗生素治疗恢复功能的分子基础 研究慢性沙门氏菌感染对造血干细胞移植能力的影响 沙门氏菌感染小鼠模型的造血干细胞和祖细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠模型,感染后14天进行实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-06-03
Histology-informed spatial domain identification through multi-view graph convolutional networks
2026-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种名为STESH的空间转录组学聚类方法,通过多视图图卷积网络整合基因表达、空间位置和组织学信息以识别空间结构域 首次将多视图图卷积网络与解码器及注意力机制相结合,同时整合组织学特征、表达数据和空间信息进行空间结构域识别 未提及具体局限性 开发高效整合组织学、基因表达和空间信息的空间结构域识别方法 多种组织类型和技术平台的空间转录组学数据 机器学习 NA 空间转录组学 CNN, 图卷积网络, 多视图图卷积网络 基因表达数据, 空间位置数据, 组织学图像 多种组织类型样本 NA 空间转录组学 NA NA
39 2026-06-03
ScGDCF: Graphical Deep Clustering with Fused Common Information for Single-cell RNA-seq Data
2026-Jun-01, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出一种基于图深度聚类的融合常见信息方法scGDCF,用于单细胞RNA测序数据中细胞类型的无监督识别 创新性地引入对抗损失函数处理数据稀疏性,设计互信息提取算子融合特征与拓扑结构信息,并采用双自适应注意力机制处理不同邻居节点和信息源的贡献差异 文中未明确提及局限性 开发一种能有效融合特征和拓扑结构信息、适用于稀疏单细胞RNA测序数据的深度聚类方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图神经网络、生成对抗网络、注意力机制 基因表达数据 7个真实数据集和2个模拟数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-06-03
Challenges and progress in RNA velocity: Comparative analysis across multiple biological contexts
2026-Jun-01, PLoS computational biology IF:3.8Q1
research paper 对五种RNA velocity方法在多个数据集上的性能进行基准比较分析 建立了统一的比较流程,从局部一致性、方法一致性、驱动基因识别和测序深度鲁棒性四个维度系统评估RNA velocity方法性能 未提及具体局限性 比较分析不同RNA velocity方法在多样本背景下的性能差异 五种RNA velocity方法和三个数据集 machine learning NA RNA-seq, single-cell RNA-seq RNA velocity gene expression data 三个公开数据集 NA single-cell RNA-seq NA NA
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