单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11421 - 11440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11421 | 2024-08-05 |
B cell-mediated antigen presentation promotes adverse cardiac remodeling in chronic heart failure
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.08.593153
PMID:38766182
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研究论文 | 本文探讨脾脏B细胞通过MHC II介导的抗原呈现对慢性心力衰竭的影响 | 首次揭示了脾脏B细胞在慢性心力衰竭中通过MHC II介导的抗原呈现促进不良心脏重塑的机制 | 对特定免疫细胞在心脏重塑中的具体作用机制的理解仍然有限 | 研究脾脏B细胞在慢性心力衰竭中的作用 | 小鼠和人类心肌梗塞患者的脾脏B细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 细胞 | NA |
| 11422 | 2024-08-04 |
Stress-free single-cell transcriptomic profiling and functional genomics of murine eosinophils
2024-Jun, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00967-3
PMID:38504138
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研究论文 | 该文章涉及一种无压力的小鼠嗜酸性粒细胞的单细胞转录组分析和功能基因组学方法 | 开发了一种无压力的协议，能够高质量地捕获小鼠组织内嗜酸性粒细胞的单细胞RNA，并揭示了其在结肠炎中的不同肠道亚群及作用 | 需要较高的技术水平，虽然方法可被任何具备基础分子生物学和流式细胞术技能的研究人员使用，但仍需适应其他粒细胞 | 研究嗜酸性粒细胞的异质性及其在健康和疾病中的功能 | 小鼠嗜酸性粒细胞及其在不同组织中的亚群 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA捕获，CRISPR基因筛选 | NA | RNA数据 | 多种组织来源的嗜酸性粒细胞 |
| 11423 | 2024-08-05 |
Identification of a novel prognostic signature based on vitamin metabolism clustering-related genes in lung adenocarcinoma
2024-May-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-245
PMID:38854940
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研究论文 | 本研究建立了一个基于维生素代谢相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次探索了维生素代谢在肺腺癌中的作用，并建立了一个预后签名 | 未提及样本的多样性和验证该模型在其他人群中的效果 | 旨在识别与肺腺癌相关的维生素代谢差异表达基因 | 研究对象为肺腺癌患者及其维生素代谢模式 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LUAD、GSE68465和GSE72094的数据 |
| 11424 | 2024-08-05 |
Multifactoral immune modulation potentiates durable remission in multiple models of aggressive malignancy
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302675R
PMID:38738472
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研究论文 | 该文章报告了一种独特的免疫调节和细胞静止剂组合，可重塑肿瘤微环境并消除多种高级别肿瘤类型 | 通过多种机制靶向肿瘤，产生显著的协同抗肿瘤效果，这在单一免疫调节方法中未能实现 | 尚未测试所有可能的肿瘤类型，具体机制仍需进一步探讨 | 研究多重免疫调节如何提高对攻击性恶性肿瘤的持久缓解 | 特定的肿瘤模型，如TNBC、HNSCC和神经母细胞瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq分析 | NA | NA | 在测试中涉及的动物数量未明确说明 |
| 11425 | 2024-08-05 |
Contribution of crosstalk of mesothelial and tumoral epithelial cells in pleural metastasis of lung cancer
2024-May-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-118
PMID:38854934
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研究论文 | 本文探讨了胸膜转移中间皮细胞与肿瘤上皮细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序系统性调查了不同细胞类型及其在肺癌胸膜转移中的相互作用 | 缺乏对所有可能相关细胞类型全面的探讨和分析 | 研究中间皮细胞与恶性肿瘤细胞在肺癌胸膜转移中的相互作用及其机制 | 肺癌患者的中间皮细胞和肿瘤上皮细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括5个来自正常、非恶性疾病及肺癌患者的数据集 |
| 11426 | 2024-08-05 |
Prognostic impact and immunotherapeutic implications of NETosis-related prognostic model in clear cell renal cell carcinoma
2024-May-27, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05761-y
PMID:38801430
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研究论文 | 本文构建了一个与坏死性凋亡相关的预后模型，以探讨其在透明细胞肾细胞癌中的影响 | 提出了一个新的与坏死性凋亡相关的预后标识符，并探讨了其在免疫特征和肿瘤突变负担等方面的作用 | 研究的外部验证和算法应用的多样性可能影响结果的广泛适用性 | 研究坏死性凋亡对透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗的影响 | 透明细胞肾细胞癌患者及其相关细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 实时定量PCR（RT-qPCR）、单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了ccRCC组织样本和细胞系 |
| 11427 | 2024-08-05 |
Machine learning identifies the role of SMAD6 in the prognosis and drug susceptibility in bladder cancer
2024-May-20, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05798-z
PMID:38767747
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌的两种新亚型，并确定了SMAD6作为一个有前景的治疗靶点 | 首次识别SMAD6在膀胱癌预后和药物敏感性中的作用，并发现膀胱癌的两种新亚型 | 尚未在临床试验中验证SMAD6作为治疗靶点的实际效果 | 预测膀胱癌的预后并识别新疗法的精确治疗靶点 | TGF-β信号通路相关基因及其在膀胱癌样本中的表达 | 机器学习 | 膀胱癌 | 无监督聚类分析 | 机器学习分类器 | 转录组数据 | TCGA-BLCA样本 |
| 11428 | 2024-08-04 |
Characterizing dysregulations via cell-cell communications in Alzheimer's brains using single-cell transcriptomes
2024-May-13, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-024-00867-y
PMID:38741048
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通信的失调。 | 该研究通过单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病大脑中细胞间通信网络的特征和失调机制。 | 该研究主要集中于大脑前额叶区域，可能无法全面代表阿尔茨海默病的所有相关区域。 | 探讨在阿尔茨海默病和健康脑中细胞间通信的差异。 | 人类前额叶皮层的单细胞转录组数据。 | 数字病理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了大量公共的单核RNA测序数据 |
| 11429 | 2024-08-05 |
Bioinformatic Analysis of Gene Expression Related to Sialic Acid Biosynthesis in Patients With Medulloblastoma
2024-May, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59997
PMID:38854216
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨与小脑胶质瘤患者中唾液酸代谢相关的基因表达。 | 首次在小脑胶质瘤中揭示了唾液酸代谢相关基因的异常表达及其与整体生存率的关联。 | 本研究依赖于公开数据库，需进一步实验验证其结果。 | 探讨唾液酸相关基因在小脑胶质瘤患者中的表达及其对生存率的影响。 | 小脑胶质瘤患者的基因表达及其与唾液酸代谢的关系。 | 数字病理学 | 小脑胶质瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 文本 | 包含来自不同分子亚组的大量小脑胶质瘤样本 |
| 11430 | 2024-08-04 |
Energy competition remodels the metabolic glucose landscape of psoriatic epidermal cells
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93764
PMID:38855186
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研究论文 | 本文探讨了代谢竞争在银屑病皮肤表皮细胞增殖和分化中的作用 | 首次揭示了银屑病表皮细胞内的代谢竞争及其对细胞增殖和分化的影响 | 尚未完全阐明表皮细胞增殖的所有代谢适应机制 | 研究银屑病皮肤中表皮细胞的代谢适应和机制 | 银屑病皮肤中的表皮角质形成细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | RNA测序, 空间转录组学, 葡萄糖摄取实验 | 小鼠模型和炎症类器官模型 | 基因表达数据 | 使用多个小鼠模型和组学分析数据，样本数量未明确 |
| 11431 | 2024-08-05 |
Identification of a Prognostic Model Based on NK Cell-Related Genes in Multiple Myeloma Using Single-Cell and Transcriptomic Data Analysis
2024, Blood and lymphatic cancer : targets and therapy
DOI:10.2147/BLCTT.S461529
PMID:38854627
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研究论文 | 这项研究开发了一个基于NK细胞相关基因的预后模型，以评估多发性骨髓瘤患者的预后。 | 该研究首次利用单细胞和转录组数据分析提出了一种针对多发性骨髓瘤的新的预后模型。 | 样本量和特定临床特征的限制可能影响结果的普遍适用性。 | 研究NK细胞相关基因与多发性骨髓瘤临床因素的关系。 | 研究对象为健康供体和多发性骨髓瘤患者的外周血单核细胞中的NK细胞相关基因。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组数据分析和加权基因共表达网络分析（WGCNA） | Cox回归模型和LASSO回归分析 | 基因表达数据 | NA |
| 11432 | 2024-08-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-Dec-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
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研究论文 | 该研究探讨了DNA甲基化介导的Rbpjk抑制如何保护骨折不愈合患者免受全身性炎症的影响 | 发现Rbpjk是Dnmt3b的直接靶标，并阐明了NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症骨再生中的共同机制 | 未明确说明样本数量和临床相关性 | 研究全身性炎症对骨折愈合的影响及其机制 | 干细胞和前体细胞在骨折不愈合中的反应 | 数字病理学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因组数据 | NA |
| 11433 | 2024-08-05 |
Non-classical circulating monocytes expressing high levels of microsomal prostaglandin E2 synthase-1 tag an aberrant IFN-response in systemic sclerosis
2023-Nov, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103097
PMID:37633117
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研究论文 | 该研究探讨了在系统性硬化症中，外周血单核细胞的组成和活化异变 | 首次揭示了非经典单核细胞在系统性硬化症患者中的过度表达及其异常IFN反应 | 样本数量较小，仅包括8名系统性硬化症患者和8名对照组 | 了解CD14外周血单核细胞在系统性硬化症中的作用 | 系统性硬化症患者与健康对照患者的外周血单核细胞 | 数字病理 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组分析 (scRNA-seq) | NA | 血液样本 | 共16个样本，8名系统性硬化症患者和8名对照组 |
| 11434 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the nervous system at small and large scales with instant partitions
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.14.549051
PMID:37503160
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIPseq在神经科学中进行单细胞RNA测序的应用。 | 引入PIPseq方法，能够在不同规模和神经科学实验中收集和序列化单细胞基因表达变化。 | 样本输入大小和初始资本投入的限制可能会排除一些研究者的应用。 | 研究PIPseq在单细胞RNA测序中的有效性和应用。 | 涉及多种样本和实验，包括小鼠模型和非传统模型物种的基因表达分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数十个样本（每个样本1,000-100,000个细胞） |
| 11435 | 2024-08-05 |
Microglial sex differences in innate high anxiety and modulatory effects of minocycline
2024-Jul, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.03.035
PMID:38552926
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研究论文 | 研究了微胶质细胞在先天性高焦虑小鼠中性别差异以及美诺环素的调节作用 | 首次揭示了先天高焦虑小鼠中性别在微胶质细胞功能和表达上的显著差异 | 主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 分析微胶质细胞在性别差异影响下对先天高焦虑行为的作用 | 先天高焦虑（HAB）与正常焦虑（NAB）小鼠模型的微胶质细胞 | 神经科学 | 焦虑障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 包含不同性别的先天高焦虑和正常焦虑小鼠 |
| 11436 | 2024-08-04 |
S100A16 is a potential target for reshaping the tumor microenvironment in the hypoxic context of liver cancer
2024-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112076
PMID:38733818
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研究论文 | 本文研究了S100A16在肝癌肿瘤微环境中的作用，尤其是在缺氧条件下的表现 | 首次揭示了S100A16与肝癌缺氧微环境中免疫细胞浸润的显著关联 | 尚需进一步研究以明确S100A16在肝癌不同阶段的具体功能及机制 | 探讨S100A16在肝癌肿瘤微环境中，特别是在缺氧背景下的作用 | 肝癌肿瘤组织及其免疫细胞浸润的特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 武汉队列的样本 |
| 11437 | 2024-08-04 |
Identification of CXCL13 as a Promising Biomarker for Immune Checkpoint Blockade Therapy and PARP Inhibitor Therapy in Ovarian Cancer
2024-Jun-10, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01207-5
PMID:38856873
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研究论文 | 这篇文章探讨了CXCL13作为卵巢癌中免疫检查点抑制疗法和PARP抑制剂疗法的潜在生物标志物。 | CXCL13不仅反映了HRD状态，还提出了卵巢癌中ICB预测性生物标志物的新视角。 | 该研究可能受到样本选择和数据来源的限制，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究CXCL13在卵巢癌免疫检查点抑制疗法中的生物标志物作用。 | 卵巢癌患者的HRD肿瘤及相关免疫微环境。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 基因组测序、免疫组化、单细胞测序 | NA | 生物标志物数据、临床试验数据 | 通过公共数据库收集的数据，样本数量不详 |
| 11438 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals the role of YAP1 in prefrontal cortex microglia in depression
2024-Jun-07, BMC neurology
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12883-024-03685-1
PMID:38849737
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了YAP1在抑郁症前额叶皮层小胶质细胞中的致病机制 | 识别YAP1作为抑郁症发展中的关键分子，并提出其作为预测抑郁症发作的生物标志物的潜力 | NA | 探讨YAP1在抑郁症前额叶皮层小胶质细胞中的作用 | 正常和抑郁前额叶皮层组织的小胶质细胞 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据集以及临床样本 |
| 11439 | 2024-08-04 |
The curses of performing differential expression analysis using single-cell data
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596315
PMID:38853843
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞转录组学中进行差异表达分析的挑战与局限性 | 提出了一种新的范式来应对单细胞差异表达分析中的多个问题 | 现有工作流程在归一化、过多零值、供体效应和累积偏差等方面存在显著缺陷 | 研究单细胞转录组学中的差异表达分析的挑战 | 单细胞数据中的差异表达基因 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 11440 | 2024-08-05 |
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.595971
PMID:38853821
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研究论文 | 本研究探讨了先锋因子ETV2在血管内皮细胞谱系特化中的作用机制 | 文章创新性地揭示了ETV2在招募转录抑制因子REST以限制替代谱系承诺中的重要作用 | 本研究的局限性包括对ETV2调控机制的进一步验证仍然需要更多实验支持 | 研究ETV2驱动的细胞命运特化机制 | 研究人类诱导性多能干细胞衍生的中胚层祖细胞向内皮细胞的转化 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq) | NA | 基因组数据 | 参与研究的样本数量和类型尚未具体列出 |