单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-10	BCAP31 promotes colorectal cancer metastasis via oxidative phosphorylation-dependent macrophage immunosuppression: A single-cell transcriptomic study 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.002 PMID:40769312	研究论文	通过单细胞转录组研究揭示BCAP31通过氧化磷酸化依赖的巨噬细胞免疫抑制促进结直肠癌转移	首次发现BCAP31作为关键风险基因通过线粒体-免疫串扰机制驱动免疫抑制，并建立10基因巨噬细胞相关预后特征	NA	探究结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞驱动的免疫抑制机制	结直肠癌组织样本及肿瘤微环境中的免疫细胞	生物信息学	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化分析	NA	单细胞转录组数据	NA
2	2025-09-10	Hyperactivation of the m6A demethylase FTO to down-regulate SLC7A11/xCT-mediated redox homeostasis and epigenetic remodeling in facial infiltrating lipomatosis 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.001 PMID:40769313	研究论文	本研究揭示了m6A去甲基化酶FTO通过下调SLC7A11破坏氧化还原稳态和表观遗传重编程，从而驱动面部浸润性脂肪瘤病（FIL）发生的分子机制	首次发现FTO通过m6A依赖性方式抑制SLC7A11表达，破坏GSH/GSSG氧化还原平衡，并通过SIRT6-H3K9ac表观遗传重编程促进脂肪生成的新机制	研究主要基于细胞和动物模型，临床转化仍需进一步验证	探究面部浸润性脂肪瘤病（FIL）的分子发病机制和治疗靶点	FIL脂肪组织、脂肪干细胞和祖细胞（ASPCs）以及小鼠异种移植模型	分子生物学	面部浸润性脂肪瘤病	Western blotting, qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序, MeRIP-seq, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验, ATAC-seq, ChIP-qPCR, 酶活性检测	NA	分子生物学数据、测序数据、蛋白质表达数据	FIL患者组织和细胞样本，以及小鼠模型
3	2025-09-10	Transcriptional profiling uncovers microglial HIF-1α signaling as a therapeutic target of radiation-induced brain injury 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.014 PMID:40784586	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示颅脑辐射后小胶质细胞HIF-1α信号通路的特异性激活，并证明其作为辐射性脑损伤治疗靶点的潜力	首次在单细胞水平发现辐射特异性激活小胶质细胞HIF-1α信号通路，且该现象无法通过传统批量分析检测	研究基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；HIF-1α抑制仅带来认知功能部分恢复	探究辐射性脑损伤的细胞分子机制并寻找治疗靶点	小鼠模型中的小胶质细胞和海马体相关认知功能	神经科学	脑部疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），药理学抑制	NA	转录组数据	小鼠实验模型（具体数量未明确说明）
4	2025-09-10	Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer 2025-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887 PMID:40582491	研究论文	通过多组学分析揭示多胺代谢在胰腺癌进展中的作用，并鉴定NT5E/CD73为关键调控基因	首次对胰腺癌中多胺代谢进行系统性多组学整合分析，开发基于多胺代谢的预后模型（PMscore），并发现NT5E在代谢重编程和免疫调控中的双重功能	NA	探究多胺代谢在胰腺导管腺癌（PDAC）中的全面作用及临床意义	胰腺导管腺癌（PDAC）患者样本及肿瘤微环境	多组学分析	胰腺癌	批量转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、主成分分析、随机森林算法	预后模型（PMscore）	转录组数据、单细胞数据	NA
5	2025-09-10	CEMIP2 sensitizes PDAC to chemotherapy through extracellular matrix remodeling by hyaluronan degradation 2025-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217898 PMID:40623543	研究论文	本文揭示了CEMIP2通过降解透明质酸重塑细胞外基质，增强胰腺导管腺癌对化疗的敏感性	首次阐明CEMIP2通过HA降解机制调节肿瘤微环境，发现其与CAF亚群和免疫细胞的功能状态调控相关	机制研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩展	探究CEMIP2在PDAC化疗耐药性中的分子机制和治疗潜力	胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和小鼠模型	肿瘤生物学	胰腺癌	scRNA-seq, CyTOF, 蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据	临床PDAC标本和小鼠模型，具体样本量未明确说明
6	2025-09-10	The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis 2025-Oct, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2025.05.015 PMID:40389038	研究论文	本研究通过大鼠脓毒性腹膜炎模型，揭示内脏大神经消融通过选择性调节中性粒细胞亚群平衡显著增强细菌清除能力	首次证明内脏大神经特异性调控中性粒细胞（而非巨噬细胞）的激活状态，并发现其通过改变杀菌性中性粒细胞与静止亚群的比例影响免疫应答	研究局限于大鼠模型，尚未在人类中验证；神经消融的长期效应未评估	阐明交感神经内脏大神经在感染过程中对免疫调节和细菌清除的具体作用机制	大肠杆菌诱导脓毒性腹膜炎的SD大鼠模型	免疫学	脓毒症	流式细胞术、单细胞RNA测序、蛋白质标记检测	NA	基因表达数据、蛋白质数据、细胞计数数据	大鼠模型（具体数量未明确说明），包含假手术对照组和神经消融实验组
7	2025-09-10	Multimodal associations between brain morphology, immune-inflammatory markers, spatial transcriptomics, and behavioural symptoms in autism spectrum disorder 2025-Oct, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2025.07.021 PMID:40721173	研究论文	本研究探讨自闭症谱系障碍中攻击行为与神经炎症、脑结构差异及基因表达模式的关联	首次结合空间转录组学与多模态神经生物学数据，揭示攻击行为与前额-边缘-纹状体网络失衡及神经炎症的复杂相互作用	样本量较小（n=42），仅包含男性参与者，且神经影像数据仅来自攻击组子集（n=13）	识别自闭症谱系障碍中攻击行为的神经生物学机制并为治疗策略提供依据	42名11-38岁男性自闭症谱系障碍患者（分攻击组与非攻击组）	神经科学	自闭症谱系障碍	多重检测分析、MRI、变形基形态测量法（DBM）、空间转录组学	NA	行为问卷数据、血浆生物标志物数据、神经影像数据、基因表达数据	42名男性ASD患者（21名攻击组/21名非攻击组），其中13名攻击组参与者接受MRI扫描
8	2025-09-10	Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes 2025-Sep-19, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.113269 PMID:40894860	研究论文	通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量，揭示人类乳腺细胞中母乳寡糖的生物合成程序	首次在单细胞水平识别上皮细胞亚群中HMO合成基因的差异表达模式，并提名与HMO浓度相关的候选基因及潜在调控转录因子	研究基于相关性分析，需要后续功能实验验证候选基因的具体作用机制	解析人类哺乳期乳腺中母乳寡糖的复杂生物合成途径	人类乳腺上皮细胞（泌乳细胞）	生物信息学	NA	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	基因表达数据、浓度测量数据	未明确说明样本数量的人类乳腺scRNA-seq数据集
9	2025-09-10	Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression 2025-Sep-18, Zoological research IF:4.0Q1 DOI:10.24272/j.issn.2095-8137.2025.019 PMID:40923305	研究论文	本研究通过多组学方法揭示HSF5在调控染色质组织和转录重编程中的关键作用，以驱动粗线期进展	首次发现HSF5可能通过与USP7形成复合物抑制减数分裂性染色体上的H2AK119ub修饰，并揭示其在XY小体形成和转录调控网络中的新功能	HSF5与USP7相互作用的分子机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证	阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I中调控染色质动态和转录重编程的分子通路	小鼠精母细胞（特别是粗线期精母细胞）	分子生物学	男性不育症	ATAC-seq, 单细胞RNA测序, 多组学分析	NA	基因组测序数据, 转录组数据, 表观遗传数据	HSF5缺失小鼠模型的精母细胞样本
10	2025-09-10	Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy 2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2424487122 PMID:40920930	研究论文	本研究结合单细胞转录组和遗传谱系追踪技术，揭示了增殖性玻璃体视网膜病变中纤维化形成的细胞来源和分子机制	首次整合单细胞转录组学与遗传谱系追踪技术，系统描绘RPE细胞在PVR中的命运转变过程，并鉴定TSP-1为关键驱动基因	NA	解析增殖性玻璃体视网膜病变中纤维化形成的细胞机制和潜在治疗靶点	视网膜色素上皮细胞、免疫细胞、Müller细胞	单细胞组学	眼科疾病	单细胞转录组测序、遗传谱系追踪	NA	单细胞转录组数据	NA
11	2025-09-10	Dynamic and precise electromagnetic levitation of single cells 2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2512246122 PMID:40920932	研究论文	介绍了一种名为Electro-LEV的新型平台，用于在三维微流体环境中动态精确操控单细胞电磁悬浮	整合电磁与磁悬浮原理，实现单细胞在3D环境中的动态位置控制，并能区分单细胞与细胞簇的悬浮行为差异	NA	开发高精度细胞操控技术，提升细胞分选纯度和效率	单细胞和细胞簇	生物医学工程	NA	电磁悬浮技术	NA	物理位置数据	多种颗粒和细胞类型（具体数量未明确说明）
12	2025-09-10	Sorting nexin 3 promotes ischemic retinopathy through RIP1- and RIP3-mediated myeloid cell necroptosis and mitochondrial fission 2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2426578122 PMID:40924459	研究论文	本研究揭示排序连接蛋白3（SNX3）通过RIP1/RIP3介导的髓系细胞坏死性凋亡和线粒体分裂促进缺血性视网膜病变的分子机制	首次发现SNX3在髓系细胞中通过稳定RIP1/3复合物调控坏死性凋亡通路，并鉴定出靶向SNX3的小分子抑制剂W1122	研究主要基于小鼠氧诱导视网膜病变模型，人类临床相关性需进一步验证	探究免疫细胞介导的视网膜血管生成的分子机制	小鼠视网膜髓系细胞（小胶质细胞/巨噬细胞）	分子病理学	缺血性视网膜病变	单细胞RNA测序，免疫染色，GST pull-down，免疫共沉淀	NA	基因表达数据，蛋白质相互作用数据	氧诱导视网膜病变（OIR）小鼠模型
13	2025-09-10	Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways 2025-Sep-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125 PMID:40664071	研究论文	本研究揭示了丙烯酰胺通过小胶质细胞介导的非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突变性，涉及Tnfaip2/TNF-α和氧化应激通路	首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞分泌因子（而非直接神经毒性）驱动轴突变性，并鉴定Tnfaip2为关键介质	NA	探究环境毒物丙烯酰胺诱导认知功能障碍的分子机制	小鼠模型、BV2小胶质细胞系、1C11神经元系	神经毒理学	神经退行性疾病	RNA-seq（bulk和单细胞）、条件培养基实验、基因敲除	NA	转录组数据、细胞实验数据	NA
14	2025-09-10	Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis 2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202501619R PMID:40923938	研究论文	本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素radezolid通过抑制线粒体蛋白合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制	首次发现radezolid通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化，并证实其在牙周炎治疗中的新治疗策略	研究主要基于细胞模型和大鼠模型，尚未进行人体临床试验	研究radezolid抑制破骨细胞分化及治疗牙周炎的潜力	破骨细胞（RAW264.7和骨髓来源巨噬细胞）及牙周炎大鼠模型	生物医学研究	牙周炎	scRNA-seq，流式细胞术，电子显微镜	NA	基因表达数据，细胞图像，动物模型数据	健康个体和严重慢性牙周炎患者的牙周组织（具体数量未说明），细胞系和大鼠模型
15	2025-09-10	CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions 2025-Sep-09, Infection and immunity IF:2.9Q2 DOI:10.1128/iai.00510-24 PMID:40757822	综述	本文综述了基于CRISPR的遗传工具在宿主-微生物互作研究中的应用与进展	系统整合CRISPR筛选、靶向基因组编辑和记录系统，结合单细胞RNA测序等新兴技术研究宿主-微生物互作机制	当前工具存在技术局限性，未来需要开发更先进的遗传工具包	研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康与疾病中的作用	宿主细胞和微生物细胞	NA	NA	CRISPR, 单细胞RNA测序	NA	遗传数据	NA
16	2025-09-10	Restoring mitochondrial quantity and quality to reverse the Warburg effect and drive neuroblastoma differentiation 2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2502483122 PMID:40911595	研究论文	本研究通过恢复线粒体功能诱导神经母细胞瘤分化并抑制增殖	首次联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂协同恢复肿瘤线粒体质量与数量，并证实其驱动分化的机制依赖于电子传递链功能	研究主要基于神经母细胞瘤模型，其他肿瘤类型的普适性仍需验证	探索通过恢复线粒体功能诱导肿瘤分化的治疗策略	神经母细胞瘤细胞系及原位移植瘤模型	肿瘤代谢研究	神经母细胞瘤	U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪、单细胞RNA测序、线粒体DNA缺失细胞模型	NA	代谢组数据、基因表达数据、体内成像数据	原位移植瘤模型（具体数量未明确说明）
17	2025-09-10	p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia 2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.182880 PMID:40763040	研究论文	本研究揭示p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真度的关键作用	发现p53通过调控过渡性内皮细胞状态参与毛细血管修复，并首次在人类BPD合并肺动脉高压病例中验证该基因特征的保守性	NA	探究p53在新生儿高氧所致肺损伤修复过程中的分子机制及其与支气管肺发育不良（BPD）的关系	新生儿高氧损伤模型中的肺毛细血管内皮细胞亚群	分子病理学	支气管肺发育不良	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	NA
18	2025-09-10	Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization 2025-Sep-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology DOI:10.1007/s00210-025-04580-3 PMID:40921808	研究论文	本研究通过整合批量与单细胞RNA测序及孟德尔随机化方法，识别牙周炎潜在治疗靶点基因	首次结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学整合分析，发现CXCR4等4个牙周炎关键枢纽基因	基于公共数据库的回顾性分析，需实验验证	识别牙周炎的分子机制和潜在治疗靶点	牙周炎患者基因表达数据	生物信息学	牙周病	RNA-seq, scRNA-seq, Mendelian randomization, eQTL分析	LASSO, 随机森林	基因表达数据	3个独立GEO数据集（具体样本量未说明）
19	2025-09-10	Intestinal epithelial Ceacam1 deficiency prevents steroid-refractory acute gut graft-versus-host disease 2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.186984 PMID:40923321	研究论文	本研究通过多组学技术发现肠道上皮细胞CEACAM1缺失可有效预防类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病	首次揭示肠道上皮细胞CEACAM1在SR-Gut-aGVHD中的关键作用机制，并证明其缺失可通过调节免疫细胞亚群和肠道菌群来预防疾病	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果仍需进一步验证	探究肠道上皮细胞CEACAM1在类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病发病机制中的作用	小鼠模型和人类样本中的肠道上皮细胞及免疫细胞	免疫学	移植物抗宿主病	成像质谱流式细胞术(IMC)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、ATAC测序、高维流式细胞术	NA	多组学数据（转录组、表观基因组、蛋白质组）	小鼠模型和人类SR-Gut-aGVHD样本
20	2025-09-10	Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma 2025-Sep-09, Neurological research IF:1.7Q4 DOI:10.1080/01616412.2025.2556255 PMID:40923898	研究论文	本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了FANCC基因在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用	首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子，发现其通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展	NA	全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制，以确定新的治疗靶点	低级别胶质瘤(LGG)患者样本	数字病理	脑肿瘤	单细胞转录组学、空间转录组学、GSEA分析	NA	转录组数据、空间分布数据	NA