单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11381 - 11400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11381 | 2024-08-04 |
Investigating the basis of lineage decisions and developmental trajectories in the dorsal spinal cord through pseudotime analyses
2024-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202209
PMID:38804879
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研究论文 | 本研究通过伪时间分析探讨了背侧脊髓内神经元的谱系决策和发育轨迹 | 本研究结合小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内神经元单细胞RNA测序图谱和伪时间分析，提供了一种新的资源来研究背侧内神经元的命运特异性 | 本研究主要是基于小鼠模型，可能无法完全适用于其他物种 | 研究背侧内神经元的发育过程和基因表达时机 | 小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11382 | 2024-08-04 |
Clustering and visualization of single-cell RNA-seq data using path metrics
2024-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012014
PMID:38809943
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研究论文 | 本研究提出了一种新的单细胞RNA-seq数据分析框架，称为单细胞路径度量分析（scPMP），以改善聚类效果。 | 该文章的创新点在于提出了一种基于功率加权路径度量的新方法，能够更好地保持局部聚类结构和全局数据几何。 | 没有提到具体的研究限制 | 该研究旨在改善单细胞数据分析中的聚类质量和几何保真度。 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据，涉及组织和癌症组成的高分辨率表征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 路径度量结合多维缩放 | NA | NA |
| 11383 | 2024-08-05 |
Single-cell and single-nucleus RNA-sequencing from paired normal-adenocarcinoma lung samples provide both common and discordant biological insights
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011301
PMID:38814983
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研究论文 | 本文比较了配对正常-腺癌肺样本中单细胞RNA测序和单核RNA测序的生物学洞见 | 首次系统比较了scRNA-seq和snRNA-seq在正常和腺癌肺组织样本中的一致性和差异性 | 免疫细胞去除的额外操作影响了细胞活力，并放大了与应激反应相关的转录特征 | 探讨正常肺组织向腺癌组织转变的细胞过渡，以及不同RNA测序技术所捕获的生物信息 | 配对的正常及腺癌人类肺样本 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 细胞转录组 | 160,621个细胞/细胞核 |
| 11384 | 2024-08-05 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 该文章识别了新生儿肺发育过程中肌成纤维细胞分化程序 | 文章创新性地识别了不同于其他间质细胞类型的肌成纤维细胞分化程序 | 文章未提及具体的实验限制或局限性 | 研究新生儿肺中的间质细胞类型及其发育过程 | 研究对象为新生小鼠肺中的间质细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用Fgf18CreER谱系追踪小鼠线，有多个亚型细胞 |
| 11385 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序描述了肾淋巴内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 该研究首次描述了肾淋巴内皮细胞的异质性，并揭示了其在急性肾损伤中调节局部免疫反应的分子通路 | 由于肾中淋巴内皮细胞相对稀少，过去的测序工作未能充分表征这些细胞及其对急性肾损伤的响应 | 研究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的基因表达变化及其对未来肾脏健康的影响 | 小鼠的肾淋巴内皮细胞，特别是在静息和顺铂损伤后的状态 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 由多种小鼠肾淋巴内皮细胞群体组成 |
| 11386 | 2024-08-05 |
Long noncoding RNA Malat1 protects against osteoporosis and bone metastasis
2024-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46602-3
PMID:38493144
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研究论文 | 本研究发现长链非编码RNA Malat1在骨质疏松和骨转移中的保护作用 | 本研究首次揭示了MALAT1在骨吸收过程中的关键调控角色及其对骨质疏松和肿瘤骨转移的保护机制 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用性尚需进一步验证 | 探讨MALAT1在生理和病理过程中对骨质疏松及骨转移的影响 | 研究了MALAT1缺失对小鼠骨质疏松和黑色素瘤及乳腺肿瘤细胞骨转移的影响 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 临床骨样本 | NA |
| 11387 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Transcriptome of Bovine Milk Somatic Cells
2024-03-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15030349
PMID:38540408
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析牛奶中细胞，探讨乳腺的生物学特性 | 首次在单细胞水平上分析了高产乳牛的牛奶转录组 | 研究仅使用了两只荷斯坦奶牛的样本，结果的普遍适用性可能有限 | 探索牛奶产生过程中的细胞级机制 | 来自两只荷斯坦奶牛的乳液样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 2只牛的乳液样本，获得9313和14544个细胞 |
| 11388 | 2024-08-04 |
Commensal protist Tritrichomonas musculus exhibits a dynamic life cycle that induces extensive remodeling of the gut microbiota
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae023
PMID:38366179
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研究论文 | 本研究探讨了共生原生动物Tritrichomonas musculus与肠道细菌之间的动态关系及其对肠道微生物群的影响 | 首次揭示了Tritrichomonas musculus的不同生活阶段及其通过营养竞争对细菌的影响 | 研究主要在小鼠模型上进行，可能无法直接推广至其他物种 | 提高对共生原生动物与肠道细菌之间复杂关系的理解 | Tritrichomonas musculus及其与肠道细菌的相互作用 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 微生物组数据 | 健康和缺乏B细胞的小鼠 |
| 11389 | 2024-08-04 |
Magnetic Yeast Glucan Particles for Antibody-Free Separation of Viable Macrophages from Drosophila melanogaster
2024-01-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.3c01199
PMID:38048070
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研究论文 | 本文介绍了一种无标签和无抗体的分离小鼠巨噬细胞的新方法 | 通过喷雾干燥的方法，成功制备了具有较高铁氧体纳米颗粒含量的酵母葡聚糖颗粒，从而实现巨噬细胞的有效分离 | 目前仅针对果蝇的巨噬细胞，其对其他生物的适用性尚未验证 | 开发一种新方法，用于分离活体巨噬细胞以进行后续分析 | 以果蝇为研究对象，分离其体内的活体巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 喷雾干燥 | NA | NA | NA |
| 11390 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomic and immunological profiling reveals new diagnostic and prognostic models for cutaneous melanoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1389550
PMID:38863979
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研究论文 | 本研究结合转录组和免疫学分析，为皮肤黑色素瘤提供了新的诊断和预后模型 | 通过整合转录组数据和免疫学特征，识别了与SKCM相关的新模型基因，增强了对其分子机制的理解 | 该研究依赖于公开的数据库，可能存在数据异质性及样本选择偏倚 | 深入理解皮肤黑色素瘤的分子机制，并开发新的诊断和预后模型 | 利用TCGA和GEO数据库的转录组数据、突变和临床数据以及单细胞测序数据分析 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序、单细胞测序、LASSO机器学习算法 | NA | 基因表达数据 | SKCM队列中的多个样本，具体样本数量未提供 |
| 11391 | 2024-08-05 |
The dysadherin/FAK axis promotes individual cell migration in colon cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.86699
PMID:38725858
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研究论文 | 本研究探讨了dysadherin/FAK轴如何促进结肠癌细胞的迁移和侵袭 | 发现dysadherin通过FAK信号通路调节癌细胞迁移的分子机制 | 本研究主要基于细胞模型，临床相关性需要进一步验证 | 探讨dysadherin在结肠癌细胞迁移中的作用 | 结肠癌患者的细胞和肿瘤模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自结肠癌患者的单细胞数据 |
| 11392 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-sequencing and RNA-tomography of the avian embryo extending body axis
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1382960
PMID:38863942
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研究论文 | 本研究利用高通量测序方法生成小鸡胚胎的分子图谱。 | 该研究结合单细胞RNA测序和RNA成像技术，创建了胚胎躯干的高分辨率转录组图，揭示了与身体轴发育相关的分子通路。 | 缺乏对小鸡胚胎不同发育阶段的多样性探索，可能限制了结果的广泛适用性。 | 旨在通过建立小鸡胚胎发展的分子图谱，理解体轴发育过程中涉及的细胞谱系和基因表达。 | 研究对象为小鸡胚胎的不同细胞谱系，包括体节、神经管、神经脊、侧板中胚层等。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA成像 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11393 | 2024-08-05 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
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研究论文 | 本研究探讨了IL-17介导的细胞因子信号在视网膜色素上皮退化中的保护作用。 | 首次揭示了脉络膜γδ T细胞在视网膜色素上皮损伤后的保护性细胞因子信号机制。 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性。 | 探讨IL-17信号通路在视网膜色素上皮退化中的作用。 | 研究对象是小鼠脉络膜中的免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞免疫资料 | 小鼠模型 |
| 11394 | 2024-08-05 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
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研究论文 | 这篇文章研究了肝细胞癌患者的肿瘤微环境如何影响固有淋巴细胞（ILCs）。 | 文章揭示了肿瘤微环境中的细胞因子如何影响ILCs的组成和功能，并与患者的生存预后相关。 | 该研究主要基于肝细胞癌患者的样本，可能无法普遍适用于其他类型的肿瘤。 | 探讨肝细胞癌中局部细胞因子环境如何影响ILCs的变化。 | 研究的对象为来自48名肝细胞癌患者的ILCs，特别是肿瘤组织和非肿瘤组织中的ILCs。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 48名肝细胞癌患者 |
| 11395 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Unveils the Role of the Tumor Immune Microenvironment and Notch Signaling in Dormant Minimal Residual Disease
2022-Mar-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-1230
PMID:34965936
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研究论文 | 该研究揭示了肿瘤免疫微环境和Notch信号通路在休眠微小残留疾病中的角色 | 首次利用新的免疫竞争转基因模型研究休眠微小残留疾病，并发现Jagged-1/Notch信号通路在肿瘤发生中的多重调控作用 | 尚未完全阐明肿瘤休眠的复杂生态系统及其影响因素 | 探讨休眠的分子通路和微环境的作用，提供新的策略延长癌症休眠 | 休眠微小残留疾病及其相关的肿瘤细胞和免疫细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因模型 | RNA序列数据 | NA |
| 11396 | 2024-08-05 |
B-cells are abnormal in psychosocial stress and regulate meningeal myeloid cell activation
2021-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2021.08.002
PMID:34371135
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研究论文 | 该文章研究了心理社会压力下B细胞的异常表现及其对脑膜髓系细胞激活的调控作用 | 首次揭示了心理社会压力下B细胞的活化及其对脑膜免疫细胞功能的影响 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探究B细胞在心理社会压力下对脑功能的影响 | 小鼠模型中的B细胞和脑膜髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 11397 | 2024-08-05 |
Automated quality control and cell identification of droplet-based single-cell data using dropkick
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271908.120
PMID:33837131
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研究论文 | 开发了一种名为dropkick的全自动软件工具，用于单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞识别 | dropkick能够自动确定数据集特定的训练标签，并学习真实细胞和环境噪声的基因表示，从而提高细胞识别的准确性和效率 | 在特定情况下，dropkick的性能可能受到数据集的技术噪声和背景变化的影响 | 研究单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞筛选方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的真正细胞与非信息条形码的区分 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 弱监督模型 | 模拟和真实的单细胞RNA测序数据 | NA |
| 11398 | 2024-08-05 |
Single-cell analyzing of tumor microenvironment and cell adhesion between early and late-stage lung cancer
2024-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.04.013
PMID:38696904
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研究论文 | 本研究探讨了早期和晚期肺腺癌肿瘤微环境及细胞粘附的单细胞分析 | 提出了TNS1作为早期肺腺癌细胞免疫微环境中的粘附分子，并且可能成为新的预后标志物 | 对调控早期与晚期肺腺癌肿瘤迁移进展的具体因素的理解仍然不完全 | 研究肺腺癌中早期与晚期阶段细胞粘附和肿瘤微环境的差异 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的LUAD样本 |
| 11399 | 2024-08-04 |
A novel single-cell model reveals ferroptosis-associated biomarkers for individualized therapy and prognostic prediction in hepatocellular carcinoma
2024-Jun-10, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01931-z
PMID:38853238
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研究论文 | 本研究探讨了一种与铁死亡相关的单细胞预测模型，以改善肝细胞癌(HCC)的治疗反应和预后预测。 | 通过LASSO-Cox算法构建了一个包含10个与铁死亡相关的单细胞生物标志物的新模型，提供了个性化治疗和预后预测的新视角。 | 未明确提及研究的局限性 | 旨在提高肝细胞癌患者的治疗反应和预后预测准确性。 | 研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的单细胞生物标志物。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO-Cox模型 | 基因表达数据 | 涉及HCC细胞亚群体的单细胞样本 |
| 11400 | 2024-08-04 |
Deciphering the genetic code of neuronal type connectivity through bilinear modeling
2024-Jun-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91532
PMID:38857169
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研究论文 | 本研究提出了一种新的双线性建模方法，用于解码神经元类型之间的遗传连接方式 | 该模型首次将基因表达与连接组数据相结合，成功捕捉了神经元之间的遗传相互作用 | 样本数据有限，模型在特定类型神经元的连接解读中可能存在局限性 | 研究神经元类型之间的遗传连接及其对大脑功能的影响 | 利用小鼠视网膜神经元数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 双线性模型 | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经元数据集中包含的样本数量未具体说明 |