单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11401 - 11420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11401 | 2024-08-04 |
SCSMD: Single Cell Consistent Clustering based on Spectral Matrix Decomposition
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae273
PMID:38855914
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研究论文 | 本文提出了一种基于谱矩阵分解的单细胞一致性聚类方法SCSMD | SCSMD融合了多种聚类方法的优势，以确定最佳聚类方案 | NA | 研究单细胞测序数据分析中的聚类问题 | 真实的scRNA-seq数据集，总共15个数据集 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | scRNA-seq | NA | 数据集 | 15个真实的scRNA-seq数据集 |
| 11402 | 2024-08-05 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
|
研究论文 | 该文章介绍了一种名为CACIMAR的工具，用于通过单细胞RNA测序数据进行跨物种分析 | CACIMAR提供了不同的保守评分来测量细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性，这是目前很少有方法能做到的 | 目前尚未提及任何限制 | 开发一种工具以识别跨物种的细胞身份、标记、调控和相互作用 | 研究对象包括小鼠、斑马鱼和小鸡的视网膜再生的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 转录组数据 | 公开可用的多个物种的单细胞RNA测序数据 |
| 11403 | 2024-08-04 |
High-density generation of spatial transcriptomics with STAGE
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae294
PMID:38647109
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研究论文 | 本文开发了一种名为STAGE的空间位置监督自编码生成器，用于生成高密度的空间转录组数据 | STAGE使用定制的自监督编码器学习基因表达的连续模式，从而能够生成高分辨率的基因表达，并提高空间转录组数据的质量 | 尚未提及关于STAGE的适用范围或者可能存在的局限性 | 研究旨在改善空间转录组技术中数据分辨率和质量的不足 | 研究对象是空间转录组数据集和基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 自编码生成器 | 自编码器 | 转录组数据 | 四个空间转录组数据集 |
| 11404 | 2024-08-04 |
Structural, Functional, and Genetic Changes Surrounding Electrodes Implanted in the Brain
2024-05-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00057
PMID:38630432
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研究论文 | 该文章研究植入电极周围的结构、功能和基因变化，旨在改善可植入神经技术的设计 | 创新点在于开发了新的'设备切片'技术，捕捉慢性植入电极与活体大鼠脑组织的相互作用，并揭示了电极周围组织重塑的新观察结果 | 尚需进一步的信息有效链接生物反应与设备设计的特定方面 | 探讨设备与组织整合的基本科学原理，以改善可植入神经技术的设计 | 研究植入电极周围细胞的结构、功能和基因变化 | 数字病理 | NA | 单细胞电生理学，双光子成像，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，细胞电生理数据 | 使用活体大鼠脑组织进行研究，具体样本大小未提供 |
| 11405 | 2024-08-04 |
Identification of prognostic risk model based on plasma cell markers in hepatocellular carcinoma through single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1363197
PMID:38859937
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研究论文 | 本研究基于浆细胞标志物建立了一个肝细胞癌的预后风险模型 | 揭示了肝细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的异质性，并基于浆细胞标志物构建了预后风险模型 | 该研究的局限性在于依赖于单一的数据集进行模型验证 | 旨在探讨肝细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的特征及其在治疗中的影响 | 肝细胞癌患者中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其亚型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自TCGA-LIHC和肝癌研究所（LCI）队列的数据 |
| 11406 | 2024-08-05 |
The lncRNA TPT1-AS1 promotes the survival of neuroendocrine prostate cancer cells by facilitating autophagy
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/IMBV8599
PMID:38859837
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研究论文 | 这篇文章揭示了lncRNA TPT1-AS1在神经内分泌前列腺癌细胞存活中的作用。 | 这项研究首次提出TPT1-AS1在神经内分泌细胞存活中的保护作用，而非促进神经内分泌分化。 | 本研究未能证明TPT1-AS1在LNCaP细胞中对神经内分泌分化的刺激作用。 | 研究lncRNA TPT1-AS1在前列腺癌发展过程中的角色和机制。 | 研究神经内分泌前列腺癌细胞及相关的lncRNA表达。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了LNCaP和C4-2B细胞模型进行实验 |
| 11407 | 2024-08-05 |
Panoramic analysis of cell death patterns reveals prognostic and immune profiles of head and neck squamous cell carcinoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/PMDA6193
PMID:38859838
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研究论文 | 本研究探讨了细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的预测作用和免疫特征 | 提出了细胞死亡指数(CDI)签名作为预测头颈部鳞状细胞癌预后的生物标志物，且发现CAAP1缺失可增强抗肿瘤免疫 | 目前缺乏关于头颈部鳞状细胞癌进展和治疗效果的可靠预测模型 | 探索细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本及其临床信息 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 利用TCGA和GEO数据库的信息进行大规模转录组和单细胞转录组分析 |
| 11408 | 2024-08-05 |
LAYN Serves as a Prognostic Biomarker and Downregulates Tumor-Infiltrating CD8+ T Cell Function in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S464806
PMID:38859944
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研究论文 | LAYN在肝细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次探讨了LAYN在肝细胞癌中与CD8+ T细胞功能障碍及临床预后之间的关系 | 尚未在临床试验中验证LAYN的治疗潜力 | 研究LAYN在肝细胞癌中的免疫功能和预后意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | IF，IHC，ELISA，流式细胞术，mRNA-seq | NA | 肿瘤样本 | 在研究中涉及新鲜样本的检测 |
| 11409 | 2024-08-05 |
Involvement of N4BP2L1, PLEKHA4, and BEGAIN genes in breast cancer and muscle cell development
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1295403
PMID:38859961
|
研究论文 | 本研究探讨了乳腺癌患者在胸大肌细胞中基因表达的变化 | 识别了三种之前未被表征的肿瘤抑制基因，并发现它们在乳腺肿瘤中的表达下调 | 样本量较小，仅涉及50名乳腺癌患者 | 探讨乳腺癌及其与肌肉发育相关的基因表达 | 主要研究对象是乳腺癌患者的正常肌肉细胞基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 50名乳腺癌患者 |
| 11410 | 2024-08-05 |
Lymph node stromal cell responses to perinatal T cell waves, a temporal atlas
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316957120
PMID:38079541
|
研究论文 | 这篇文章探讨了围产期T细胞在淋巴结中的独特环境及其演变。 | 文章创新性地利用单细胞RNA测序生成初期淋巴结生态的地图，并揭示了基质细胞和T细胞之间的相互作用。 | 没有提及本研究的具体局限性。 | 阐明围产期T细胞在淋巴结中如何生成和作用。 | 主要研究小鼠的围产期调节性T细胞及其在淋巴结中的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 未具体说明样本数量，但涉及小鼠的研究 |
| 11411 | 2024-08-04 |
The activation of SIRT1 by resveratrol reduces breast cancer metastasis to lung through inhibiting neutrophil extracellular traps
2023-12, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2023.2265585
PMID:37772906
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研究论文 | 这项研究探讨了白藜芦醇对乳腺癌转移到肺部的影响。 | 该研究首次将白藜芦醇与抑制中性粒细胞外陷阱的作用联系起来，展示了其对乳腺癌转移的治疗潜力。 | 该研究在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的生理条件。 | 研究白藜芦醇通过抑制中性粒细胞外陷阱来减少乳腺癌转移的机制。 | 主要研究对象为乳腺癌转移及中性粒细胞外陷阱。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 小鼠正位4T1乳腺癌模型 | 血清样本 | 小鼠乳腺癌模型中的样本数量未具体提到 |
| 11412 | 2024-08-05 |
Aerobic Exercise Alters the Melanoma Microenvironment and Modulates ERK5 S496 Phosphorylation
2023-09-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0465
PMID:37307577
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研究论文 | 本文展示了运动如何改变黑色素瘤微环境以及调节ERK5 S496磷酸化 | 揭示了运动导致的肿瘤微环境变化中的肿瘤特异性免疫反应差异以及ERK5信号通路的重要性 | 研究仅使用了小鼠模型，可能无法完全代表人类的反应 | 探讨运动如何影响黑色素瘤的微环境及其机制 | YUMMER 1.7 和 B16F10小鼠模型的黑色素瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | NA | 使用了YUMMER 1.7和B16F10小鼠模型 |
| 11413 | 2024-08-05 |
Deconstructing cold-induced brown adipocyte neogenesis in mice
2022-07-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80167
PMID:35848799
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研究论文 | 研究表明寒冷暴露会诱导小鼠经典肩胛间褐色脂肪组织中的新生现象 | 发现瘦素细胞不仅受β1-肾上腺素受体的调控，还受到成熟褐色脂肪细胞的信号的间接触发 | 目前尚不清楚招募免疫细胞的具体表型 | 探究寒冷诱导的褐色脂肪细胞新生机制 | 小鼠的褐色脂肪细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 生物组织 | 小鼠，具体样本数量未提及 |
| 11414 | 2024-08-04 |
Senescence-targeted MicroRNA/Organoid composite hydrogel repair cartilage defect and prevention joint degeneration via improved chondrocyte homeostasis
2024-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.05.036
PMID:38855061
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研究论文 | 本研究探讨了衰老标记物在骨关节炎患者软骨缺损修复中的作用 | 该研究开发了一种针对衰老的miR-24/SMSC类器官复合水凝胶，能够提高软骨修复效果并预防关节退化 | 该研究仅在动物模型中进行了评估，缺乏临床试验的数据支持 | 研究衰老标记物在骨关节炎患者软骨缺损中的作用，为软骨修复提供新视角 | 骨关节炎患者的软骨缺损样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 高通量miRNA测序和qRT-PCR | NA | 临床样本 | 来自骨关节炎CD患者的临床软骨样本 |
| 11415 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the aggressive landscape of high-grade serous carcinoma and therapeutic targets in tumor microenvironment
2024-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216928
PMID:38714290
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了高等级浆液性癌瘤的侵袭性特征和肿瘤微环境中的治疗靶点 | 首次识别出与预后不良相关的S100A9肿瘤细胞亚型，并验证了其标记基因对卵巢癌生长和侵袭的抑制作用 | 缺乏长期随访数据来评估治疗靶点在临床应用中的有效性 | 探索高等级浆液性癌瘤的侵袭机制并寻找新的治疗靶点 | 34例高等级浆液性癌瘤患者的肿瘤样本及其转移部位的109,573个细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 体内和体外模型 | 细胞数据 | 34个肿瘤样本 |
| 11416 | 2024-08-05 |
Preoperative neoadjuvant targeted therapy remodels intra-tumoral heterogeneity of clear-cell renal cell carcinoma and ferroptosis inhibition induces resistance progression
2024-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216963
PMID:38768682
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研究论文 | 本研究探讨了术前新辅助靶向治疗如何重塑透明细胞肾癌中的肿瘤内异质性，并且铁死亡抑制导致耐药进展 | 首次在整个新辅助管理中描述了肿瘤内异质性，并鉴定了铁死亡作为恶性细胞耐药的关键生物程序 | 研究局限于多中心队列样本，可能影响结果的普适性 | 探索新辅助治疗耐药的关键机制 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤样本及其耐药细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞系模型 | 肿瘤组织样本 | 多个中心的临床试验样本，包括TCGA, ICGC, Checkmate-025和IMmotion151 |
| 11417 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage
2024-Jun-11, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01265-6
PMID:38861152
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析，揭示了蛛网膜下腔出血后白 matter 修复的机理 | 首次识别出SAH模型小鼠中微胶质细胞和少突胶质细胞前体细胞之间的重要互作及其信号通路 | 主要集中在小鼠模型上，结果转化到人类的有效性尚需进一步验证 | 探究蛛网膜下腔出血后大脑细胞亚群在急性和亚急性阶段的作用 | 蛛网膜下腔出血模型小鼠及其大脑细胞亚群 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | SAH模型小鼠 |
| 11418 | 2024-08-05 |
Unveiling novel cell clusters and biomarkers in glioblastoma and its peritumoral microenvironment at the single-cell perspective
2024-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05313-5
PMID:38851695
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研究论文 | 该研究以单细胞视角描绘了胶质母细胞瘤及其肿瘤周围微环境的细胞景观 | 首次发现了胶质母细胞瘤中新的细胞亚群和生物标志物，并为精准治疗提供了理论依据 | 样本量较小，仅包含4名患者的8个组织样本，因此结果的普遍适用性可能受到限制 | 描绘胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境的细胞景观，以发现新的细胞亚型和生物标志物 | 4名胶质母细胞瘤患者的组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 8个组织样本，来自4名胶质母细胞瘤患者 |
| 11419 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals the effects of the FecB mutation on the transcriptome profile in ovine cumulus cells
2024-06-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64001-y
PMID:38849498
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研究论文 | 研究FecB突变对绵羊卵泡细胞转录组特征的影响 | 采用单细胞RNA测序技术揭示了不同FecB基因型的卵泡细胞在基因表达上的异质性 | 研究中未涉及其他可能影响卵泡细胞分化的遗传因素 | 探索FecB突变如何影响绵羊卵泡细胞的分化过程 | 来自不同FecB基因型的小尾寒羊的卵泡细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种FecB基因型的小尾寒羊卵泡细胞样本 |
| 11420 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594719
PMID:38826447
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研究论文 | 本研究详细描绘了小鼠卵巢中排卵的单细胞和时空特征 | 首次以单细胞分辨率描述排卵过程的精确时机，并揭示了卵巢细胞类型的时序转录状态和特定的定位特征 | 研究仅限于小鼠卵巢的排卵过程，尚未验证其他物种的适用性 | 研究排卵过程中的细胞动态变化和分子机制 | 小鼠卵巢中的细胞类型及其在排卵过程中的变化 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA数据 | 成对小鼠卵巢 |