单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11321 - 11340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11321 | 2024-08-05 |
Creeping fat exhibits distinct Inflammation-specific adipogenic preadipocytes in Crohn's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198905
PMID:38111581
|
研究论文 | 本研究分析了克罗恩病患者中的爬行脂肪及其与炎症特异性脂肪前体细胞的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了爬行脂肪中与炎症和纤维化相关的脂肪前体细胞的特征 | 尚未完全理解爬行脂肪在克罗恩病纤维化发展中的潜在机制 | 分析克罗恩病中爬行脂肪的转录组特征，探索与纤维化和炎症的关系 | 研究了克罗恩病患者的爬行脂肪及其相关的预脂肪细胞群体 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11322 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
|
研究论文 | 本研究揭示了在PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 通过单细胞测序与工程细胞结合，本研究首次揭示了PRC2缺失导致的肿瘤细胞转录程序改变与干细胞特征的关系 | 本研究未涉及PRC2缺失在其他类型肿瘤中的影响 | 阐明PRC2缺失的肿瘤发生机制 | 针对PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤细胞进行研究 | 数字病理学 | 恶性周围神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 11323 | 2024-08-05 |
Systematic pan-cancer analysis identifies APOC1 as an immunological biomarker which regulates macrophage polarization and promotes tumor metastasis
2022-09, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106376
PMID:35914680
|
研究论文 | 本文通过系统的全癌症分析发现APOC1是一个免疫生物标志物，调节巨噬细胞极化并促进肿瘤转移 | 阐明了APOC1在肿瘤免疫中的作用及其在肾细胞癌中异常表达的机制 | 研究主要集中于肾细胞癌，缺乏对其他癌种中APOC1作用的深入探讨 | 探讨APOC1在肿瘤免疫中的角色及其对巨噬细胞极化的影响 | APOC1在不同癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织和血清样本 | 涉及多种癌症的系统分析和肾细胞癌患者的样本 |
| 11324 | 2024-08-05 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
|
研究论文 | 本研究构建了CD4 T细胞的参考图，以描述急性和慢性病毒感染期间亚型特异性的适应性变化 | 首次提供了针对病毒的CD4 T细胞转录状态适应性的深入理解，并建立了新的计算资源用于CD4 T细胞分析 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类病毒感染的情况 | 阐明CD4 T细胞在急性和慢性病毒感染中的转录状态适应 | 小鼠模型中的CD4 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 多个个体的病毒特异性CD4 T细胞 |
| 11325 | 2024-08-05 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序探讨了局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞中的炎症特征 | 首次利用尿液单细胞RNA测序识别出与局灶性节段性肾小管硬化症相关的单核细胞亚群和足细胞表达特征 | 研究仅基于12名FSGS患者的尿液样本，样本量可能不足以绘制全貌 | 探究局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞的疾病相关分子特征 | 分析来自12名局灶性节段性肾小管硬化症患者的尿液样本 | 数字病理 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液细胞 | 收集了来自12名FSGS患者的17个尿液样本，捕获为23个尿液细胞样本 |
| 11326 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of Antigen-Specific CD8+ T Cells Using Surface-Trapped TNF-α and Single-Cell Sequencing
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100535
PMID:34810222
|
研究论文 | 本研究介绍了一种快速识别和表征抗原特异性CD8 T细胞的新系统 | 该系统利用表面捕获的TNF-α和单细胞测序的重大进展，构建了几乎无限的实验试剂 | 实验方法依然受到初级细胞数量的限制，且MHC结合肽/TCR相互作用的高度变异性仍然是挑战 | 研究抗原特异性CD8 T细胞的识别和表征，促进疾病研究和治疗开发 | 来自猕猴和HIV感染供体的抗原特异性CD8 T细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 来自猕猴的CMV特异性CD8 T细胞和HIV感染供体的样本 |
| 11327 | 2024-08-05 |
TNF plays a crucial role in inflammation by signaling via T cell TNFR2
2021-12-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109972118
PMID:34873037
|
研究论文 | 这篇文章探讨了TNF在炎症中的关键角色及其通过T细胞TNFR2信号传导的机制 | 该研究首次阐明了TNF不仅作为效应因子，还作为炎症Th分化的启动因子 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病状态中验证 | 研究TNF在调节炎症和Th细胞分化中的作用 | 小鼠CD4 T细胞及其在实验性自体免疫性脑脊髓炎中的表现 | 免疫学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CD4 T细胞和来自多发性硬化患者的脑脊液浸润CD4 T细胞 |
| 11328 | 2024-08-05 |
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease
2021-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009912
PMID:34784346
|
研究论文 | 该研究探讨了α1-抗胰蛋白酶在慢性阻塞性肺病（COPD）中的表达与选择性聚腺苷酸化之间的关系 | 本研究揭示了影响SERPINA1 mRNA翻译的多种RNA结合蛋白，并确定了QKI作为一种调节剂的作用 | 本研究的局限性在于只在特定样本中进行观察，无法广泛推广这些发现 | 研究α1-抗胰蛋白酶在非缺乏个体中的作用及其在COPD中的调控机制 | 该研究对象包括82例COPD患者和64名对照组，以及独立验证的376例COPD患者和267名对照组 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq | NA | RNA | 82例COPD患者和64名对照组，及独立研究中的376例COPD患者和267名对照组 |
| 11329 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
|
研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 |
| 11330 | 2024-08-05 |
Improved integration of single-cell transcriptome and surface protein expression by LinQ-View
2021-08-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100056
PMID:35475142
|
研究论文 | 提出了一种名为LinQ-View的工具包，用于单细胞数据的多模态可视化和分析 | LinQ-View能够整合转录组和细胞表面蛋白表达数据，提供量化的群体纯度评估指标 | 目前数据的应用主要集中在CITE-seq数据上，可能限制了其广泛适用性 | 研究单细胞转录组与表面蛋白表达的集成分析 | 针对受SARS-CoV-2感染患者的单细胞转录组和蛋白表达数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组与蛋白表达数据 | 多个公共CITE-seq数据集 |
| 11331 | 2024-08-05 |
Distinct populations of antigen-specific tissue-resident CD8+ T cells in human cervix mucosa
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149950
PMID:34156975
|
研究论文 | 研究了人类宫颈黏膜中抗原特异性组织驻留CD8+ T细胞的不同群体 | 首次通过单细胞RNA测序定义了人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的表型和TCR克隆型 | 缺乏广泛关于人类FRT中T细胞受体库的全面知识 | 研究人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的特征及其与特定病毒抗原的关系 | 主要研究人类宫颈黏膜中的CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 性传播感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HSV-2血清阳性个体中的Cervical CD8+ TRM克隆型，具体数量未提供 |
| 11332 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
|
研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征，可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 |
| 11333 | 2024-08-05 |
Profiling B cell immunodominance after SARS-CoV-2 infection reveals antibody evolution to non-neutralizing viral targets
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.001
PMID:34022127
|
研究论文 | 这篇文章解析了SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变，揭示了抗体对非中和病毒靶点的进化 | 首次通过单细胞测序分析COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性B细胞，并揭示了抗体对非中和内源性抗原的适应性 | 研究样本仅限于38名COVID-19患者，可能限制了结果的普适性 | 了解SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变及其对二次暴露时抗体的重要性 | 研究对象为38名COVID-19患者的记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 38名COVID-19患者 |
| 11334 | 2024-08-05 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
|
研究论文 | 本研究显示，MHC类II的泛素化通过March-I调节树突状细胞的功能和生存 | 揭示了MHC类II的泛素化在树突状细胞功能中的重要性，并发现其缺失会影响到T细胞的激活能力 | 研究主要集中在小鼠模型中，未探讨人类树突状细胞的类似机制 | 探索MHC类II泛素化对树突状细胞及其激活CD4 T细胞能力的影响 | MHC类II泛素化缺失的小鼠树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠树突状细胞 |
| 11335 | 2024-08-05 |
Glycolytic metabolism of pathogenic T cells enables early detection of GVHD by 13C-MRI
2021-01-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020005770
PMID:32785680
|
研究论文 | 本研究探讨了糖酵解代谢在早期检测移植物抗宿主病(GVHD)中的应用 | 提出了一种利用磁共振成像技术检测活化CD4+ T细胞糖酵解代谢，以实现GVHD的非侵入性早期检测的方法 | 该研究的IV型数据尚不完善，缺乏足够临床研究验证所述结果的有效性 | 旨在通过代谢成像技术，提供一种非侵入性方式早期检测GVHD | 主要研究活化的CD4+ T细胞与糖酵解过程在GVHD发病机制中的作用 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 超极化13C-丙酮酸磁共振成像 | 动物模型 | 代谢成像数据和转录组数据 | 在小鼠模型中进行，临床样本数据来源于接受AHSCT的患者 |
| 11336 | 2024-08-05 |
The NF-κB regulator Bcl-3 restricts terminal differentiation and promotes memory cell formation of CD8+ T cells during viral infection
2021-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009249
PMID:33508001
|
研究论文 | 本研究记录了Bcl-3在CD8+ T细胞分化中的细胞自主作用 | 首次明确了Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中对记忆细胞和终末效应细胞平衡的自主决定作用 | 尚未清晰定义Bcl-3在各免疫细胞类型中的直接作用 | 探讨Bcl-3在病毒感染中CD8+ T细胞的分化角色 | Bcl-3缺失的CD8+ T细胞在病毒感染过程中的分化 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | 使用了Bcl3-/-小鼠的CD8+ T细胞进行分析 |
| 11337 | 2024-08-05 |
Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report
2020-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0733-7
PMID:31959990
|
案例报告 | 该文章通过单细胞转录组分析指导靶向治疗药物诱导的超敏反应综合症的案例 | 提出通过单细胞RNA测序识别JAK-STAT信号通路作为潜在靶点，实现个性化治疗 | 临床应用的限制和对复杂人类病理生理理解的不充分 | 探讨药物诱导的超敏反应综合症的治疗策略 | 一名难治性药物诱导的超敏反应综合症患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和皮肤样本 | 一名患者的样本 |
| 11338 | 2024-08-05 |
Clonal kinetics and single-cell transcriptional profiling of CAR-T cells in patients undergoing CD19 CAR-T immunotherapy
2020-01-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13880-1
PMID:31924795
|
研究论文 | 本文探讨了在接受CD19 CAR-T免疫治疗的患者中，CAR-T细胞的克隆动力学和转录组特征 | 本研究揭示了CAR-T细胞在输注后如何受到转录程序的调控，特别关注了细胞的克隆多样性及其对抗肿瘤反应的影响 | 尽管发现了克隆动力学的不同模式，但整合位点并未被确认作为克隆动力学的主要驱动因素 | 研究CAR-T细胞在输注后行为的转录程序及其克隆动力学 | 研究重点是CD8 CAR-T细胞，包括输注产品和患者的血液样本 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | TCRB测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 研究涉及的样本包括输注产品和接受治疗患者的血液样本 |
| 11339 | 2024-08-05 |
Single-Cell Applications of Next-Generation Sequencing
2019-10-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a026898
PMID:30617056
|
研究论文 | 本文提供了单细胞测序的概述，并探讨了其在基础和临床研究中的应用 | 介绍了下一代测序技术在单细胞生物学中的新前沿 | 未提及具体的技术限制 | 提供单细胞测序的高级概述 | 单细胞及其在组织、微生物生态系统和癌症中的功能共存 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序 | NA | RNA和DNA | 数百到数百万个细胞 |
| 11340 | 2024-08-05 |
A component overlapping attribute clustering (COAC) algorithm for single-cell RNA sequencing data analysis and potential pathobiological implications
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006772
PMID:30779739
|
研究论文 | 本研究开发了COAC算法用于分析单细胞RNA测序数据及其潜在的病理生物学意义 | 提出了一个新的COAC算法，能够从大规模单细胞RNA测序数据中执行局部基因共表达网络分析 | 尽管COAC算法显示出高准确率，但仍然依赖于数据的质量和完整性，限制了其在其他类型数据中的应用 | 研究旨在通过分析单细胞RNA测序数据识别功能基因集合及其调控网络与人类疾病之间的联系 | 研究对象为来自黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 来自多名黑色素瘤患者的单细胞RNA测序资料 |