单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11061 - 11080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11061 | 2024-08-04 |
Caveats in Interpretation of Molecular Diagnostics in Heart Allografts
2024-Jul-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004895
PMID:38294835
|
评论 | 对心脏移植物分子诊断的解读中的注意事项进行了批判性审查 | 探讨了分子诊断在区分心脏移植物损伤和拒绝反应中的局限性，并提出改进的方法 | 分子诊断结果与组织病理诊断的符合度低，仅为40%，且生成的分类存在重叠问题 | 评估分子诊断在心脏移植物活检中的应用局限性 | 心脏移植后的活检样本 | NA | 心脏病 | 分子诊断 | 生物信息学原型分析 | 生物医学数据 | 1到2个活检样本 |
| 11062 | 2024-08-05 |
Crosstalk among proximal tubular cells, macrophages, and fibroblasts in acute kidney injury: single-cell profiling from the perspective of ferroptosis
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01072-z
PMID:38753279
|
研究论文 | 本文研究了近端小管细胞、巨噬细胞和成纤维细胞在急性肾损伤中的相互作用，尤其关注铁死亡的视角 | 文章首次揭示了急性肾损伤中细胞之间的相互作用及其与铁死亡的关系 | 尚未详细探讨急性肾损伤中铁死亡的具体机制 | 探讨急性肾损伤中细胞的相互作用及其对铁死亡的影响 | 近端小管细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 急性肾损伤小鼠和人类样本 |
| 11063 | 2024-08-05 |
Vanin-2 is expressed in peripheral blood T cells and upregulated in SLE patients
2024-Jun-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae145
PMID:38920355
|
研究论文 | 该研究探讨了Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的表达及其在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的上调情况 | 发现Vanin-2在T细胞中的独特表达，并与SLE患者T细胞功能变化相关 | 研究中未探讨其他vanin家族成员在T细胞中的作用 | 阐明Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的重要性 | 外周血T淋巴细胞及其在SLE患者中的表达 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，西方印迹 | NA | NA | NA |
| 11064 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of spermatogenesis in obstructive azoospermia and Sertoli cell-only patients
2024-Jun-25, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcae009
PMID:38192002
|
研究论文 | 本研究展示了阻塞性无精症和仅有塞尔托利细胞患者中生精过程的长读转录组特征 | 首次利用PacBio长读测序揭示了人类生精过程中的新转录本和新基因 | 研究样本量较小，仅限于患者的睾丸活检样本 | 揭示阻塞性无精症患者中生精的转录组特征 | 阻塞性无精症和非阻塞性无精症患者的睾丸细胞 | 数字病理学 | 生育不孕 | PacBio长读单细胞测序 | NA | 转录组数据 | OA患者3个样本，NOA患者3个样本 |
| 11065 | 2024-08-05 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
|
研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞转录复杂性指标(SCTC)，用于更准确地推断单细胞的发育潜力。 | 引入了经济复杂性理论的见解，以改进对单细胞发育潜力的测量，比现有指标SCTD更精确。 | 在某些情况下，G表达并不会单调减少，这可能影响现有发育潜力估计的准确性。 | 研究单细胞分析中发育潜力的推断及伪时间重建方法。 | 关注单细胞转录组数据，这些数据能够提供细胞的发育潜力信息。 | 数字病理 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA |
| 11066 | 2024-08-05 |
GRACE: Unveiling Gene Regulatory Networks With Causal Mechanistic Graph Neural Networks in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2024-Jun-19, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3412753
PMID:38896510
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的基于图的因果自编码框架GRACE，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 将结构因果模型与图神经网络结合，以促进基因间因果关系的推理和基因调控网络的推断 | 未提及具体的局限性 | 重建基因调控网络以揭示细胞命运发展和异质性 | 利用单细胞RNA测序数据进行基因调控网络推断 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 在七个基准上进行广泛评估，应用于人外周血单核细胞样本 |
| 11067 | 2024-08-05 |
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011
PMID:38599212
|
研究论文 | 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮Norrin/β-连环蛋白信号通路来调控视网膜血管生成和血-retinal屏障的成熟 | 研究首次表明谷氨酸能活动在视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟中扮演重要角色 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探讨谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟 | 小鼠视网膜中的神经元和血管内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和药理学激活 | NA | 基因组数据和功能验证结果 | 使用了若干小鼠视网膜样本 |
| 11068 | 2024-08-05 |
MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing
2024-Jun-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06775-7
PMID:38866777
|
研究论文 | 本研究揭示了MAL2如何通过EGFR/SREBP-1通路重编程肝内胆管癌中的脂质代谢 | 发现MAL2在肝内胆管癌中的特异富集及其通过EGFR稳定膜定位来促进脂质积累的机制 | 本研究的局限性在于未能完全阐明MAL2与EGFR之间的所有可能交互作用 | 研究MAL2在肝内胆管癌中的作用及其机制 | 研究对象为肝内胆管癌细胞及其相关的细胞系和类器官 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | scRNA-seq，转录组学和代谢组学分析 | NA | NA | 涉及的样本数量及类型未明确说明 |
| 11069 | 2024-08-05 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
|
研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸乙酰转移酶14在TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿纤维化中的作用 | 揭示了KAT14通过与血清反应因子SRF的合作，促进组蛋白H4乙酰化并增加ECM生成的机制 | 尚未深入探讨KAT14在其他类型内膜异位症中的作用及其潜在临床应用 | 研究TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿相关纤维化的分子机制 | 研究对象为卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类内膜间质细胞 | 数字病理学 | 卵巢内膜囊肿 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本，细胞系 | 涉及卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类间质细胞 |
| 11070 | 2024-08-05 |
Fibroblast Diversity and Epigenetic Regulation in Cardiac Fibrosis
2024-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116004
PMID:38892192
|
综述 | 本文探讨了心脏纤维化中成纤维细胞的多样性和表观遗传调控机制 | 强调了表观遗传调控在心脏纤维化发病机制中的关键作用，尤其是针对DNA甲基转移酶和组蛋白去乙酰化酶的靶向治疗潜力 | 研究主要集中在分子和细胞机制的探索上，具体的临床验证和应用尚需进一步研究 | 旨在阐明心脏纤维化中成纤维细胞的多样性及其激活过程的调控机制 | 研究对象为心脏成纤维细胞及其在心脏纤维化中的作用 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 11071 | 2024-08-04 |
Ablation of Vitamin D Signaling in Cardiomyocytes Leads to Functional Impairment and Stimulation of Pro-Inflammatory and Pro-Fibrotic Gene Regulatory Networks in a Left Ventricular Hypertrophy Model in Mice
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115929
PMID:38892126
|
研究论文 | 本研究 aimed to clarify vitamin D 信号在左心室肥厚和功能障碍发展中的角色 | 本研究首次显示在小鼠心肌细胞中去除维生素 D 受体会导致心脏功能损害及促炎和促纤维化基因网络的刺激 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能难以直接推广到人类 | 阐明维生素 D 信号在左心室肥厚和功能障碍中的作用 | 主要研究对象为小鼠，包括野生型小鼠和心肌细胞特异性 VDR 敲除小鼠 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 横向主动脉缩窄术（TAC） | NA | 心脏组织切片转录组数据 | 4 个月大的雄性小鼠，包括多种基因型 |
| 11072 | 2024-08-05 |
Based on scRNA-seq and bulk RNA-seq to establish tumor immune microenvironment-associated signature of skin melanoma and predict immunotherapy response
2024-May-25, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-024-03080-3
PMID:38795156
|
研究论文 | 本研究基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据建立了与皮肤黑色素瘤相关的肿瘤免疫微环境标志，并预测了免疫治疗反应 | 通过对SKCM的scRNA-seq数据分析，识别出五个肿瘤免疫微环境相关基因，并构建了TIMAS用于预测免疫治疗结果 | 研究未提及样本规模及其可能影响结果的局限性 | 探索与皮肤黑色素瘤相关的肿瘤微环境的预后指标以提高免疫治疗的有效性 | 分析皮肤黑色素瘤患者的肿瘤免疫微环境及其基因表达 | 数字病理学 | 皮肤癌 | scRNA-seq 和 bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11073 | 2024-08-04 |
Differential gene expression analysis of spatial transcriptomic experiments using spatial mixed models
2024-05-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61758-0
PMID:38744956
|
研究论文 | 本文探讨了使用空间混合模型进行空间转录组实验的差异基因表达分析 | 使用线性混合模型与空间相关结构来有效处理数据中的空间自相关性，降低了第一类错误率 | 没有提到具体的局限性 | 研究如何有效分析空间转录组数据中的差异基因表达 | 空间转录组数据中的细胞和组织领域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 线性混合模型 | 基因数据 | NA |
| 11074 | 2024-08-05 |
CD276 regulates the immune escape of esophageal squamous cell carcinoma through CXCL1-CXCR2 induced NETs
2024-May-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008662
PMID:38724465
|
研究论文 | 本研究揭示了CD276在食管鳞状细胞癌中的免疫逃逸机制 | 首次阐明了CD276通过CXCL1-CXCR2信号通路调节NET形成及自然杀伤细胞的作用 | 本研究主要基于小鼠模型的实验结果，缺乏临床试验数据支持 | 探讨CD276在食管鳞状细胞癌中的功能及其调节免疫监视机制 | 研究对象为食管鳞状细胞癌患者的组织样本及相应的小鼠模型 | 数字病理 | 食管癌 | 免疫组化(IHC), 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本, 细胞数据 | 多名食管鳞状细胞癌患者的组织及实验小鼠 |
| 11075 | 2024-08-04 |
Single-cell landscape of idiopathic multicentric Castleman disease in identical twins
2024-May-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021992
PMID:38170173
|
研究论文 | 该文章呈现了在同卵双胞胎中发生的特异性多中心卡斯尔曼病的罕见案例，并研究了受影响的淋巴器官和宿主循环中的免疫环境 | 通过同卵双胞胎模型提供了IL-6信号潜在来源细胞的证据，并描述了独特的单核细胞宿主免疫反应表型 | 未提及该研究的具体限制 | 研究特发性多中心卡斯尔曼病的免疫环境 | 同卵双胞胎中的特发性多中心卡斯尔曼病患者 | 数字病理学 | 特发性多中心卡斯尔曼病 | 空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 单细胞测序数据 | 同卵双胞胎的单核细胞 |
| 11076 | 2024-08-05 |
Suppression of Type I Interferon Signaling in Myeloid Cells by Autoantibodies in Severe COVID-19 Patients
2024-Apr-22, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-024-01708-7
PMID:38647550
|
研究论文 | 本文研究了自身抗体对一型干扰素信号传导的抑制作用，以及其在重症COVID-19患者中的机制 | 首次揭示了重症COVID-19患者中一型干扰素自身抗体如何通过阻止干扰素与其受体结合来抑制信号传导 | 研究中缺乏对自身抗体对临床特征的具体影响的深入分析 | 探索自身抗体对一型干扰素在COVID-19加重中的作用机制 | 重症和危重症COVID-19患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 血浆样本 | 123名COVID-19患者的血浆 |
| 11077 | 2024-08-04 |
CellsFromSpace: a fast, accurate, and reference-free tool to deconvolve and annotate spatially distributed omics data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae081
PMID:38915885
|
研究论文 | 提出了一种名为CellsFromSpace的新分析框架，用于分析空间转录组数据 | CellsFromSpace无需依赖单细胞参考数据集，通过独立成分分析(ICA)有效分析多种技术的空间转录组数据 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在提高空间转录组学数据的分析准确性和效率 | 空间转录组学数据和不同类型细胞的分析 | 数字病理学 | NA | 独立成分分析(ICA) | NA | 空间转录组数据 | 使用真实样本进行验证，具体样本数量未提及 |
| 11078 | 2024-08-05 |
Glyoxalase 1: Emerging biomarker and therapeutic target in cervical cancer progression
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299345
PMID:38870176
|
研究论文 | 本研究探讨了甘油醛酶-1（GLO1）在宫颈癌进展中的关键角色，提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 本研究首次系统性地评估了GLO1在宫颈癌中的表达模式及其对细胞存活和迁移的影响 | 本研究的样本量有限，进一步的研究需要更大规模的临床数据支持 | 探讨GLO1在宫颈癌进展中的作用，以期为个性化治疗方案提供依据 | 研究对象为58名宫颈癌患者的样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化 | NA | 组织样本 | 58个宫颈癌患者的样本 |
| 11079 | 2024-08-05 |
ALOX5 acts as a key role in regulating the immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma, recruiting tumor-associated macrophages through PI3K pathway
2023-12-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04804-1
PMID:38124204
|
研究论文 | 研究ALOX5在调控肝内胆管癌免疫微环境中的关键作用 | 揭示了ALOX5通过其代谢产物LTB4招募M2型巨噬细胞的机制 | 未明确提出在临床应用中的具体限制 | 探讨ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞的潜在机制及其靶向治疗的转化效果 | ALOX5及其代谢产物与肝内胆管癌中肿瘤相关巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，多重免疫荧光分析 | NA | 组织样本，细胞培养模型 | 在小鼠异种移植肿瘤实验中使用的样本数量未详细说明 |
| 11080 | 2024-08-04 |
Research progress on the application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2023-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00216-9
PMID:37550409
|
综述 | 该文章总结了单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病领域的应用进展 | 提供了对单细胞RNA测序技术的发展和在自身免疫疾病研究中的应用的系统性回顾 | 尚未完全理解自身免疫疾病的病因和发病机制 | 提供对自身免疫疾病发病机制、诊断和治疗的理解参考 | 自身免疫疾病 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |