单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
11001 2024-08-04
Smooth muscle α-actin missense variant promotes atherosclerosis through modulation of intracellular cholesterol in smooth muscle cells
2023-08-01, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 该研究探讨了平滑肌α-肌动蛋白突变如何通过调节平滑肌细胞内胆固醇促进动脉粥样硬化 建立了一种新的机制,表明平滑肌特异性收缩蛋白中的致病性突变与动脉粥样硬化的易感性有关 研究未考虑其他可能影响动脉粥样硬化的环境因素 研究平滑肌α-肌动蛋白变异如何导致动脉粥样硬化 使用携带ACTA2变异的小鼠模型和体外提取的平滑肌细胞 数字病理学 心血管疾病 基因组学,单细胞转录组分析 NA 生物样本 Apoe-/-小鼠及其携带和不携带变异的平滑肌细胞
11002 2024-08-04
Integrated multi-omics analyses reveal homology-directed repair pathway as a unique dependency in near-haploid leukemia
2023-06-08, Blood cancer journal IF:12.9Q1
研究论文 本文揭示了近单倍体白血病依赖同源重组修复通路的独特性 首次系统性地揭示了近单倍体白血病中RAD51B作为关键基因的重要性 研究主要集中在细胞周期特定的基因表达,而对其他潜在机制的探讨有限 揭示近单倍体急性淋巴细胞白血病的独特生理特征及潜在易感性 近单倍体急性淋巴细胞白血病细胞及相关基因 数字病理学 急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 大量近单倍体急性淋巴细胞白血病患者样本
11003 2024-08-05
Upregulation of acid ceramidase contributes to tumor progression in tuberous sclerosis complex
2023-05-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了酸性神经酰胺酶在结节性硬化症中对肿瘤进展的贡献 研究首次揭示了TSC2缺失细胞中ASAH1上调与肿瘤形成相关的机制 仅在小鼠模型中进行实验,未在人类样本中验证结果 探讨ASAH1在结节性硬化症(TSC)和淋巴管平滑肌肉瘤(LAM)中的作用 研究对象为结节性硬化症相关突变细胞及其小鼠异种移植模型 数字病理学 结节性硬化症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了TSC2缺失的小鼠模型和人类细胞样本
11004 2024-08-05
Hermansky-Pudlak syndrome type 1 causes impaired anti-microbial immunity and inflammation due to dysregulated immunometabolism
2022-06, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究探讨了Hermansky-Pudlak综合症1型中免疫代谢失调对抗微生物免疫和炎症的影响 揭示了HPS1缺乏如何通过Rab32介导的mTOR信号通路改变代谢程序,并影响抗微生物反应 该研究的细胞机制和临床显著性仍需进一步验证 理解Hermansky-Pudlak综合症1型中炎症的细胞基础 研究HPS-1患者的外周血细胞和血清 数字病理学 炎症性肠病 大规模细胞测定、蛋白组学和转录组学分析 NA 血液样本、组织样本 HPS-1患者的外周血细胞和血清样本
11005 2024-08-05
STRT-seq-2i: dual-index 5' single cell and nucleus RNA-seq on an addressable microwell array
2017-11-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为STRT-seq-2i的新型单细胞RNA测序技术 STRT-seq-2i结合了可寻址的9600微孔阵列和高通量成像,具有竞争性成本的独特优势 该研究未提及对老龄化人脑样本的具体应用效果 研究旨在提高对单细胞RNA测序技术的高通量应用能力 研究对象包括新鲜的小鼠皮质细胞和冷冻的死后人类皮质核 数字病理学 NA RNA测序 NA 单细胞 RNA 数据 使用了新鲜小鼠皮质细胞和冷冻人类皮质核的样本
11006 2024-08-05
VISTA deficiency exerts anti-tumor effects in breast cancer through regulating macrophage polarization
2024-Jul-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1
research paper 本研究首次揭示了VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞的影响 揭示了VISTA通过STAT通路调节巨噬细胞极化,进而影响肿瘤生长 未涉及VISTA在其他类型肿瘤中的作用 探讨VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响 乳腺癌中的巨噬细胞 NA 乳腺癌 scRNA-seq NA NA 体内实验中使用了VISTA缺失小鼠
11007 2024-08-05
Immune Response following FLASH and Conventional Radiation in Diffuse Midline Glioma
2024-Jul-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
研究论文 本研究探讨了FLASH和常规放疗对弥漫性中线胶质瘤免疫微环境的影响 首次以单细胞分辨率描绘了CONV和FLASH对DMG免疫的变化 研究尚未探讨不同细胞类型和剂量率对免疫反应的更广泛影响 研究FLASH与常规放疗对弥漫性中线胶质瘤免疫微环境的影响 使用正交同种小鼠模型中的免疫细胞 数字病理学 弥漫性中线胶质瘤 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和流式细胞术 NA 免疫细胞数据 NA
11008 2024-08-04
Wnt Signaling Inhibition Prevents Postnatal Inflammation and Disease Progression in Mouse Congenital Myxomatous Valve Disease
2024-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨了Wnt信号通路抑制对小鼠先天性黏液性瓣膜疾病的后续炎症和疾病进展的影响 首次揭示了Wnt信号在MVD早期启动中的作用,并提出了Wnt信号作为早期治疗的潜在靶标 在MVD开始后2个月施用Wnt抑制剂未能阻止疾病进展,说明治疗时机的限制 研究Wnt信号在小鼠先天性黏液性瓣膜疾病中的作用及其治疗潜力 Fbn1C1039G/+基因变异的小鼠模型 数字病理学 心脏病 单细胞RNA测序 NA 组织样本 小鼠基因变异模型
11009 2024-08-07
Single-cell sequencing reveals alterations in the differentiation of bone marrow haematopoietic cells in patients with paroxysmal nocturnal haemoglobinuria
2024-Jul, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11010 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 研究样本数量较少,仅涉及四名患者和四名健康供体 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 数字病理学 不孕症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 八个卵母细胞样本(四个琼脂样透明带患者和四个健康供体)
11011 2024-08-07
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11012 2024-08-05
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系,并首次将其作为胶质瘤的标志物。 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 数字病理学 胶质瘤 基因集合富集分析(GSEA),单细胞转录组分析,空间转录组分析 NA 基因表达数据,甲基化数据 使用了多种数据集,包括TCGA、GTEx和CGGA
11013 2024-08-05
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites IF:3.4Q2
研究论文 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 研究主要依赖于动物模型,可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 数字病理学 膀胱癌 scRNA-seq, Mendelian随机化分析 BBN诱导的小鼠模型 生物标志物数据 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本
11014 2024-08-05
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 未提及研究的具体局限性 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 数字病理学 克罗恩病/类风湿关节炎 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 NA 文本 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本
11015 2024-08-04
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-Jun, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 这项研究揭示了GSK3β和UCHL3在卵巢癌中通过去 ubiquitination 维持 RIPK4 稳定性并增强肿瘤转移的重要作用 本研究首次揭示了GSK3β诱导的RIPK4磷酸化如何增强其与UCHL3的相互作用,从而提高RIPK4的去 ubiquitination 和稳定性 该研究主要集中于体外和体内模型,临床验证尚需进一步研究 研究 RIPK4 在卵巢癌发展中的作用及其调控机制 研究主要对象为卵巢癌组织及细胞,重点关注RIPK4、UCHL3和GSK3β的相互作用 数字病理学 卵巢癌 单细胞测序 NA 组织样本 NA
11016 2024-08-04
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 开发了一个基于单细胞转录组学的计算管道PERCEPTION,用于预测患者对治疗的反应和抵抗 提出了一种新的精准肿瘤治疗计划工具,能够基于单细胞转录组数据预测患者的治疗反应 尚未提及任何特定的局限性 提升个体癌症患者最佳治疗方案的制定 肿瘤患者的单细胞转录组数据 数字病理 肺癌 单细胞转录组学 未提供 转录组数据 在多发性骨髓瘤和乳腺癌的两个临床试验中使用了患者源的初级细胞
11017 2024-08-04
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-Jun, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了COVID-19对神经系统的损伤,并通过胶质瘤组织和胶质瘤类器官的分析提供了证据 首次揭示了胶质瘤组织对SARS-CoV-2的易感性以及其对COVID-19相关神经症状的代表性 缺乏对SARS-CoV-2入侵中枢神经系统精确机制的深入研究 研究COVID-19对神经系统的影响及其机制 胶质瘤患者的组织样本和胶质瘤类器官 数字病理学 NA 单细胞测序、空间转录组分析 NA 组织样本、类器官 胶质瘤患者的组织样本及其类器官数据
11018 2024-08-04
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用,可能未能全面反映整体免疫环境 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞RNA测序 NA 细胞样本 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合
11019 2024-08-04
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 此研究对外髓性多发性骨髓瘤(EMM)肿瘤进行了全面的下一代测序分析 首次揭示EMM的肿瘤微环境,识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 样本规模相对较小,仅有14个样本 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 数字病理学 肿瘤 下一代测序(NGS) NA 肿瘤样本 14个样本
11020 2024-08-05
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了渗透压胁迫对拟南芥根尖发育的影响,使用单细胞层面的转录调控网络分析 首次在单细胞层面重建了相应的转录调控网络,并捕捉到12,968个单细胞的基因和染色质可及性之间的联系 数据整合的准确性仍然是个挑战,尤其是在调查特定细胞类型的转录调控网络时 研究拟南芥在渗透压胁迫下的根尖发育机制 16,670个拟南芥根尖细胞核 数字病理学 NA scRNA-seq和scATAC-seq NA 单细胞基因表达和染色质可及性数据 16,670个根尖细胞核
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