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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11021 | 2024-08-05 |
Recapitulation of Perturbed Striatal Gene Expression Dynamics of Donors' Brains With Ventral Forebrain Organoids Derived From the Same Individuals With Schizophrenia
2024-Jun-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220723
PMID:37915216
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研究论文 | 本研究通过从精神分裂症患者及神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官探索与精神分裂症相关的纹状体发育变化 | 提出了一种从精神分裂症患者的诱导多能干细胞生成腹侧前脑类器官的方法,并揭示了精神分裂症患者细胞在发育轨迹上的差异 | 研究样本量较小,仅限于四名精神分裂症患者和四名神经正常对照者 | 探索与精神分裂症相关的纹状体神经发育改变 | 来自精神分裂症患者和神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 诱导多能干细胞(IPS细胞)差异化 | 腹侧前脑类器官(VFO) | 单细胞RNA测序 | 四名精神分裂症患者及四名神经正常对照者 |
11022 | 2024-08-05 |
Amelioration of NAFLD by sleeve gastrectomy-triggered hepatocyte regeneration in mice - experimental research
2024-Jun-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001387
PMID:38573134
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研究论文 | 本研究探讨了袖状胃切除对小鼠非酒精性脂肪肝病的改善及其机制 | 首次揭示了袖状胃切除通过促进肝细胞再生来改善非酒精性脂肪肝病的机制 | 本研究主要基于小鼠模型,缺乏在人体中的验证 | 了解袖状胃切除改善代谢性疾病的潜在机制 | 采用饮食诱导的肥胖小鼠作为研究对象 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 实时定量逆转录PCR, Olink蛋白质组学 | NA | 图像, 生物样本 | 饮食诱导的肥胖小鼠 |
11023 | 2024-08-05 |
A risk score based on polyamine metabolism and chemotherapy-related genes predicts prognosis and immune cells infiltration of lung adenocarcinoma
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18387
PMID:38924680
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研究论文 | 本文探讨了铂类治疗和多胺代谢相关基因是否能够预测肺腺癌的预后 | 建立了基于铂类治疗和多胺代谢的关键基因的风险评分模型,提供了新颖的预后预测角度 | 行政性缺乏大规模临床试验验证该风险评分模型的准确性 | 研究铂类治疗和多胺代谢基因在LUAD预后预测中的作用 | 与铂类治疗和多胺代谢相关的基因及其对免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA |
11024 | 2024-08-07 |
Using single-cell transcriptomics to predict which tumors will respond to targeted therapy
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00757-6
PMID:38684925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11025 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Technology in Ruminant Livestock: Challenges and Opportunities
2024-May-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46060316
PMID:38920988
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评论 | 该文综述了单细胞测序技术在反刍动物中的应用及其面临的挑战和机遇 | 探讨了反刍动物中特有的单细胞组学技术,以及对细胞和分子机制深入理解的潜力 | 面临精准标注独特细胞群体和细胞在组织内空间分辨率等挑战 | 旨在提高对健康和高产反刍动物所需特征的理解 | 关注牛、羊和山羊的细胞多样性及免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 已经探讨的动物种类包括牛、羊和山羊 |
11026 | 2024-08-05 |
CASi: A framework for cross-timepoint analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-05-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58566-x
PMID:38724550
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研究论文 | 本研究开发了CASi,一个用于多时间点单细胞RNA测序数据分析的综合框架 | 提出了一个新的框架,专门用于分析多时间点的单细胞RNA测序数据,并提供多种分析功能 | 尚未在其他类型的单细胞数据集上进行广泛验证 | 旨在改善多时间点的单细胞RNA测序数据分析 | 关注单细胞层面基因表达差异研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 通过综合模拟研究与真实的多时间点单细胞数据集进行验证 |
11027 | 2024-08-04 |
Dual-Targeting Nanovesicles Carrying CSF1/CD47 Identified from Single-Cell Transcriptomics of Innate Immune Cells in Heart Transplant for Alleviating Acute Rejection
2024-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302443
PMID:37962054
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研究论文 | 本文研究了双靶向纳米囊泡CSF1/CD47在心脏移植中的作用,以缓解急性排斥反应 | 提出了一种新型的CSF1/CD47双靶向纳米囊泡,通过调节Ly6G Ly6C抑制性巨噬细胞来减轻免疫排斥 | 研究主要集中在小鼠模型上,临床应用可能需要更多验证 | 探讨固有免疫细胞在心脏移植急性排斥反应中的动态变化和调控机制 | 研究了Ly6G Ly6C炎性巨噬细胞及其与中性粒细胞的相互信号传导 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
11028 | 2024-08-04 |
Immunotherapy-resistant acute lymphoblastic leukemia cells exhibit reduced CD19 and CD22 expression and BTK pathway dependency
2024-Feb-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175199
PMID:38376944
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研究论文 | 本文探讨了对CD19免疫疗法产生耐药性的急性淋巴细胞白血病细胞的特征,发现其CD19和CD22的表达减少,并依赖于BTK通路 | 本研究首次揭示了CD19免疫耐药细胞中CD19和CD22表达的联合丧失以及对BTK通路的依赖性 | 研究主要基于体外模型,临床样本数量相对较少 | 探讨CD19免疫疗法耐药性机制及其对细胞信号通路的影响 | 急性淋巴细胞白血病细胞及其耐药性相关特征 | 数字病理 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-Seq), 大质量细胞术 | NA | 细胞 | 来自多名(儿科和年轻成人)复发B细胞急性淋巴细胞白血病患者的样本 |
11029 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of a new transgenic t(8;21) preleukemia mouse model reveals regulatory networks promoting leukemic transformation
2024-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02063-z
PMID:37838757
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研究论文 | 本研究描述了一种新的转基因鼠模型,揭示了促使白血病转化的调控网络 | 开发了一种新的AE9a基因敲入小鼠模型,适合研究前白血病阶段的改变 | 可能在临床上的适用性仍需进一步验证 | 研究t(8;21)的前白血病机理及其调控网络 | 使用AE9a小鼠模型分析前白血病细胞群体及其转化 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | 使用AE9a小鼠模型观察多个细胞群体 |
11030 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis of the canine duodenum in chronic inflammatory enteropathy and health
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397590
PMID:38933260
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析慢性炎性肠病犬的十二指肠细胞多样性 | 揭示了犬类十二指肠黏膜的细胞异质性和潜在的分子机制 | 该研究样本量较小,仅涉及7只狗 | 研究慢性炎性肠病中犬类十二指肠的细胞组成及其影响 | 健康犬和患有慢性炎性肠病的犬 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 7个样本(3只健康犬和4只慢性炎性肠病犬) |
11031 | 2024-08-04 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-Dec-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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research paper | 该研究探讨了肺间质中mTORC1的过度活跃如何导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 本研究提出了肺间质细胞与内皮细胞之间的配体-受体间相互作用,强调了在LAM及其他mTORC1驱动疾病中改变的间质细胞与内皮细胞轴的重要性 | 当前研究的限制是未能探讨TSC2突变对内皮细胞的直接影响 | 研究LAM细胞如何与内皮细胞相互作用,以引发血管重塑 | 使用含有Tsc2基因缺失的mTORC1功能获得小鼠模型来研究肺间质细胞与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠模型 | 基因组数据 | 涉及1年的Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠 |
11032 | 2024-08-05 |
High-resolution transcriptomics informs glial pathology in human temporal lobe epilepsy
2022-10-23, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-022-01453-1
PMID:36274170
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研究论文 | 本研究验证了一种从人类大脑皮层中同时分离神经元、星形胶质细胞和少突胶质前体细胞的方法,并研究了与颞叶癫痫相关的转录组特征 | 首次揭示了颞叶癫痫中特异性混合胶质亚群的存在,并表明其表达反应性星形胶质细胞和少突胶质细胞的特征 | 样本数量较小,可能影响结果的广泛适用性 | 研究癫痫中的神经元和胶质细胞之间的复杂相互作用及其转录组特征 | 从癫痫手术样本中分离的神经元和胶质细胞群体 | 数字病理学 | 癫痫 | RNA-seq,单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 包含四个额外的人类TLE样本和对照样本 |
11033 | 2024-08-05 |
Degradation-resistant implanted biomaterials establish an immunosuppressive microenvironment that induces T cell exhaustion by recruiting myeloid cells
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.10.007
PMID:38933993
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研究论文 | 研究表明,耐降解的钛基植入材料通过招募髓系细胞建立免疫抑制微环境,从而诱导T细胞耗竭 | 首次揭示了钛基植入物如何通过招募髓系细胞形成免疫抑制微环境 | 对植入物周围免疫环境的影响机制尚需进一步探索 | 探索植入生物材料对局部免疫环境的影响 | 耐降解的钛基植入材料及其对周围免疫环境的影响 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
11034 | 2024-08-05 |
Multi-tissue scRNA-seq reveals immune cell landscape of turbot (Scophthalmus maximus)
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.12.015
PMID:38933994
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研究论文 | 本文开发了一个鲽鱼的动态细菌感染模型,并创建了鱼类免疫细胞景观。 | 首次系统性解析了鲽鱼中的免疫细胞亚群及其在细菌感染中的双重功能 | 主要集中于鲽鱼,结果可能不适用于其他鱼类 | 阐明骨鱼类免疫细胞的细致分布和功能 | 鲽鱼(Scophthalmus maximus) | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 表达谱数据 | NA |
11035 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of peanut-responsive T cells in patients with peanut allergy reveals heterogeneous effector TH2 subsets
2018-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2017.11.060
PMID:29408715
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研究论文 | 该研究系统性地表征了花生特异性T细胞在花生过敏患者外周血中的表型。 | 首次发现花生过敏患者中存在多种效应性TH2亚群,并识别出与调节性T细胞相关的CD154表达变化。 | 研究主要集中在特定患者人群,结果可能不适用于其他类型的过敏或不同的种族人群。 | 全面表征花生特异性T细胞在花生过敏患者中的作用及其表型变化。 | 花生过敏患者及健康对照者的外周血样本中的花生反应性T细胞。 | 数字病理学 | 花生过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本细胞 | 包括花生过敏患者、健康对照者及高阈值个体的多个样本 |
11036 | 2024-08-04 |
Polypeptide N-Acetylgalactosaminyl transferase 14 is a novel mediator in pancreatic β-cell function and growth
2024-Sep-15, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2024.112269
PMID:38763428
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研究论文 | 研究表明GALNT14在胰腺β细胞中高度表达,并调节其功能和生长 | 发现GALNT14是调节β细胞生物学的新型调节因子,为β细胞O-糖基化与糖尿病发展的关系提供了新的视角 | 研究主要集中在小鼠模型,尚未在其他物种中验证 | 探讨GALNT14在胰腺β细胞功能和生长中的作用 | 主要研究GALNT14在小鼠胰腺β细胞中的表达和功能 | 数字病理学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞测序 | 三个啮齿动物2型糖尿病模型的初级岛屿 |
11037 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease
2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00395-9
PMID:38914538
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研究论文 | 本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模 | 提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法,并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系 | 模型的验证主要依赖于小鼠实验,可能不完全适用于人类 | 旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态 | 研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 常微分方程(ODE) | 细胞计数数据和基因表达数据 | 涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据 |
11038 | 2024-08-04 |
Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research
2024-Jun-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02040-9
PMID:38902727
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研究论文 | 本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用 | 本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化,提供了比传统转录组更多的信息 | 目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战 | 探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向 | 癌症相关的转录组数据及其空间表达 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
11039 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model
2024-Jun-13, Kidney research and clinical practice
IF:2.9Q1
DOI:10.23876/j.krcp.23.317
PMID:38934039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了人类白细胞抗原(HLA)敏化过程中Th17通路的角色。 | 首次揭示了Th17细胞及其细胞因子在HLA敏化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全转化到人类生理 | 探究在人类白细胞抗原敏化中涉及的特定通路 | 使用HLA.A2转基因小鼠开发的异体敏化小鼠模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分别从ALLO和SYN生成9190和8890个单细胞转录组 |
11040 | 2024-08-05 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的动脉粥样硬化逆转的影响 | 本研究首次揭示了IL-1β在饮食诱导动脉粥样硬化中的重要作用和机制 | 研究仅在阿泡蛋白E缺失小鼠模型中进行,可能影响结果的普适性 | 研究饮食改变对动脉粥样硬化病变性质和稳定性的影响 | 使用Apoe-/-小鼠模型来观察饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 心血管病学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫染色,高分辨率共聚焦显微镜分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠18只 |