单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11121	2024-08-05	Peripheral Ischemia Imprints Epigenetic Changes in Hematopoietic Stem Cells to Propagate Inflammation and Atherosclerosis 2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318956 PMID:36891902	研究论文	本研究探讨了外周缺血对造血干细胞的表观遗传变化及其在炎症和动脉粥样硬化中的作用	揭示了外周缺血后HSPC的迁移和增殖增加，并确认了IL-3Rb和IL-1R1在炎症和动脉粥样硬化加剧中的关键作用	未详细阐明外周动脉疾病患者炎症加剧的具体机制	研究外周缺血如何影响造血干细胞及其在慢性炎症和动脉粥样硬化中的潜在作用	使用外周动脉疾病患者的外周血和不同饮食条件下的啮齿类动物	数字病理学	动脉粥样硬化	RNA测序，流式细胞术	Apoe-/-小鼠，C57BL/6J小鼠	血液样本，骨髓样本	外周动脉疾病患者的样本和数个小鼠模型
11122	2024-08-04	Investigating the Role of Ferroptosis-Related Genes in Ovarian Aging and the Potential for Nutritional Intervention 2023-05-25, Nutrients IF:4.8Q1 DOI:10.3390/nu15112461 PMID:37299424	研究论文	本研究探讨了铁死亡相关基因对卵巢衰老的影响及营养干预的潜力	首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序研究铁死亡与卵巢衰老的关系	缺乏广泛的样本数据支持和长期效果评估	探讨铁死亡相关基因在卵巢衰老中的作用及营养补充的效果	75名卵巢衰老不足患者	数字病理学	NA	空间转录组学, 单细胞RNA测序	NA	组织样本	75名患者
11123	2024-08-05	Reconstructing codependent cellular cross-talk in lung adenocarcinoma using REMI 2022-Mar-18, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abi4757 PMID:35302849	研究论文	本研究提出REMI，一个图形算法，通过考虑配体-受体依赖性来重建肺腺癌中的细胞交互作用	提出了一种新型算法REMI，能够处理高维小样本数据集并考虑配体-受体交互之间的依赖性	当前方法依赖于小样本数据，可能在推广性和准确性上存在限制	研究细胞交互作用在肺腺癌中的重建，以识别与临床相关的交互	关注人类肺腺癌（LUAD）的配体-受体交互作用及其在肿瘤-基质-免疫亚群中的前景特征	计算机视觉	肺癌	RNA测序	图算法	转录组数据	使用了来自流式分选的RNA测序数据集和单细胞转录组数据
11124	2024-08-05	Sensory Neuron Diversity in the Inner Ear Is Shaped by Activity 2018-08-23, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2018.07.007 PMID:30078709	研究论文	这篇文章探讨了内耳感觉神经元的多样性及其被活动影响的机制	通过单细胞RNA测序，提出了一种小鼠I型螺旋神经节神经元的分子分类，并揭示了其在听觉处理中意想不到的活跃角色	研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于其他物种	研究I型螺旋神经节神经元的特征与多样性的起源	小鼠的类型I螺旋神经节神经元	数字病理学	先天性耳聋	单细胞RNA测序	NA	分子数据	小鼠模型的多种类型I螺旋神经节神经元
11125	2024-08-05	A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes 2018-08, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-018-0393-7 PMID:30069044	研究论文	本文研究了小鼠气管上皮的细胞组成和层次结构，识别了稀有的Foxi1肺离子细胞等细胞类型	提出了'脉冲-seq'技术，结合单细胞RNA测序和谱系追踪，揭示了气道细胞的新陈代谢模式	研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全代表人类气道病理	探讨哮喘和囊性纤维化中气道上皮的细胞组成及其在疾病中的作用	对小鼠气管上皮细胞进行单细胞RNA测序和谱系追踪	数字病理学	囊性纤维化	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞数据	NA
11126	2024-08-05	Single-cell analysis of early progenitor cells that build coronary arteries 2018-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-018-0288-7 PMID:29973725	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和小鼠遗传学展示了发育心脏中的静脉细胞如何经过早期细胞命运转换，形成构建冠状动脉的前动脉细胞群。	揭示了静脉细胞如何在发育过程中转变为前动脉细胞，并阐明了COUP-TF2对这一过程的抑制作用	未提及特定的限制性因素	研究冠状动脉的发育机制与静脉细胞的转变	静脉细胞和前动脉细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	小鼠模型	NA	NA
11127	2024-08-05	High-Throughput Screening Enhances Kidney Organoid Differentiation from Human Pluripotent Stem Cells and Enables Automated Multidimensional Phenotyping 2018-Jun-01, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2018.04.022 PMID:29779890	研究论文	本文提出了一种全自动化的高通量筛选平台，用于增强人类肾脏类器官的分化和表型分析	开发了一个完全自动化且兼容高通量筛选的系统，能够在21天内实现从培养到分析的全流程自动化	未提及任何特定的限制	研究人类肾脏类器官的分化和多维表型筛选	人类诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官	数字病理学	肾囊性疾病	单细胞RNA测序	NA	图像	NA
11128	2024-08-05	Melatonin improves mouse oocyte quality from 2-ethylhexyl diphenyl phosphate-induced toxicity by enhancing mitochondrial function 2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116559 PMID:38865937	研究论文	本研究探讨了2-乙基己基二苯酸酯对小鼠卵母细胞质量的影响，并评估了褪黑激素的保护作用	揭示了2-乙基己基二苯磷酸酯在小鼠卵母细胞上的毒性机制，并显示褪黑激素能够部分恢复卵母细胞的成熟能力	该研究主要针对小鼠卵母细胞，可能无法直接推广到其他物种或临床应用	研究2-乙基己基二苯磷酸酯对小鼠卵母细胞的影响及其潜在修复机制	小鼠卵母细胞及其在体外培养中的成熟情况	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	NA	NA
11129	2024-08-04	Targeting ESE3/EHF With Nifurtimox Inhibits CXCR2+ Neutrophil Infiltration and Overcomes Pancreatic Cancer Resistance to Chemotherapy and Immunotherapy 2024-Jul, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2024.02.046 PMID:38492894	研究论文	本研究探讨了EHF在胰腺癌化疗和免疫治疗中的作用，以及Nifurtimox的治疗潜力	提出了EHF在CXCR2+中性粒细胞招募中的重要作用，及其对化疗和免疫治疗敏感性的影响	未提及具体的临床试验结果或长期效果评估	识别新的靶点和化合物以克服胰腺癌的治疗抵抗	采用小鼠模型及基因组和单细胞分析研究CXCR2+中性粒细胞招募	数字病理学	胰腺癌	基因组单核苷酸多态性测序、单细胞RNA测序、空间转录组学	KPC小鼠、Ehf敲除小鼠及人源化小鼠	基因组数据、细胞分型数据	多种小鼠模型，具体样本数量未披露
11130	2024-08-04	Radiofrequency radiation reshapes tumor immune microenvironment into antitumor phenotype in pulmonary metastatic melanoma by inducing active transformation of tumor-infiltrating CD8+ T and NK cells 2024-Jul, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41401-024-01260-5 PMID:38538718	研究论文	这篇文章研究了射频辐射如何重塑肺部转移性黑色素瘤的肿瘤免疫微环境	该研究首次表明非侵入性射频辐射通过活化肿瘤浸润CD8+ T细胞和NK细胞，诱导抗肿瘤表型的重塑	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨非侵入性射频辐射对肿瘤进展和肿瘤免疫微环境表型的影响	建立了肺部转移性黑色素瘤的小鼠模型，以研究肿瘤浸润免疫细胞	数字病理学	肺部转移性黑色素瘤	RNA-seq	NA	RNA数据	B16F10细胞注射的小鼠模型
11131	2024-08-05	Microcirculatory disturbance in acute liver injury is triggered by IFNγ-CD40 axis 2024-Jun-21, Journal of inflammation (London, England) DOI:10.1186/s12950-024-00387-w PMID:38907339	研究论文	文章分析了急性肝损伤中IFNγ-CD40轴引发的微循环障碍的分子机制	首次揭示了IFNγ-CD40轴在急性肝损伤微循环障碍中的关键作用	研究仅限于单中心的回顾性分析，结果可能有限于特定人群和模型	探讨急性肝损伤的发病机制及其与微循环障碍的关系	急性肝损伤患者和小鼠模型	数字病理学	肝病	单细胞RNA测序	Con A诱导的小鼠模型	血液样本、肝脏组织	120名急性肝损伤患者
11132	2024-08-05	Identifying Novel Proteins for Chronic Pain: Integration of Human Brain Proteomes and Genome-Wide Association Data 2024-Jun-21, The journal of pain IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jpain.2024.104610 PMID:38909833	研究论文	本文旨在通过整合人脑蛋白组数据和全基因组关联数据来识别慢性疼痛的新蛋白质	提出了一种整合蛋白组和基因组数据的方法，以识别调节慢性疼痛风险的关键基因	研究可能受到样本选择和数据整合方法的限制	探讨遗传变异如何影响慢性疼痛的易感性	重点研究通过调节脑蛋白表达来影响慢性疼痛风险的关键基因	数字病理学	慢性疼痛	基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序	整合蛋白组与基因组的数据分析	蛋白质组数据，转录组数据	387,649（GWAS数据），376和152（发现和确认的蛋白质组数据）
11133	2024-08-05	Single-cell analysis of a progressive Rosai-Dorfman disease affecting the cerebral parenchyma: a case report 2024-05-20, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01794-z PMID:38769536	case report	报告了一例影响大脑实质的渐进性Rosai-Dorfman疾病的单细胞分析	首次通过单细胞RNA测序探讨神经性RDD的可能致病机制	该案例是基于单个患者，结果可能缺乏普遍性	探讨神经性Rosai-Dorfman疾病的致病机制	一例致命和皮质类固醇抗药性的神经性RDD病例	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	组织活检样本	1个患者的活检样本
11134	2024-08-04	SCIMAP: A Python Toolkit for Integrated Spatial Analysis of Multiplexed Imaging Data 2024-May-03, ArXiv PMID:38745703	研究论文	SCIMAP是一个专为多重成像数据的集成空间分析而设计的Python工具包	开发了一个针对多重成像数据复杂性的专用工具包，提供高效的数据预处理、分析和可视化功能	目前尚缺乏专门针对多重成像数据的现成软件工具	旨在满足对多重成像数据复杂性的分析和视觉化需求	主要研究多达10^7个细胞及其表现出的空间关系	数字病理学	NA	NA	NA	图像	多达10^7个细胞，测量多达100种生物分子
11135	2024-08-05	Single-Cell Transcriptomic Analysis of Epstein-Barr Virus-Associated Hemophagocytic Lymphohistiocytosis 2024-Apr-20, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1 DOI:10.1007/s10875-024-01701-0 PMID:38642164	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序表征EBV-HLH的免疫特征并与EBV-IM进行比较	首次详细探讨了IFNγ及其他细胞因子在EBV-HLH中的作用	样本数量较少，仅包括三名EBV-HLH患者	研究EBV感染引发的EBV-HLH的免疫反应特点	三名背景不同的EBV-HLH儿童患者及两名EBV-IM患者	数字病理学	EB病毒相关淋巴组织细胞增生症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	五名患者，包括三名EBV-HLH患者和两名EBV-IM患者
11136	2024-08-04	SCIMAP: A Python Toolkit for Integrated Spatial Analysis of Multiplexed Imaging Data 2024, Journal of open source software DOI:10.21105/joss.06604 PMID:38873023	研究论文	本文介绍了SCIMAP，一个用于多重成像数据的集成空间分析的Python工具包	SCIMAP专门为多重成像数据的复杂性量身定制，提供了图像可视化与数据分析之间的无缝集成	目前尚未提及SCIMAP在特定研究领域的局限性	研究多重成像数据的空间关系及其统计显著性	主要研究不同细胞之间的空间关系	数字病理学	NA	NA	NA	成像数据	涉及10个或更多细胞，测量多达100种生物分子
11137	2024-08-04	Absence of Slc39a14/Zip14 in mouse pancreatic beta cells results in hyperinsulinemia 2024-01-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism DOI:10.1152/ajpendo.00117.2023 PMID:38019082	研究论文	本研究探讨了SLC39A14/ZIP14在小鼠胰腺β细胞中在胰岛素分泌中的作用	揭示了ZIP14在胰腺β细胞内的锌转运与葡萄糖刺激下的胰岛素分泌之间的关系，提供了对2型糖尿病治疗的新见解	尚未充分研究ZIP14在β细胞中的具体功能，以及其在磁共振成像中的应用	探索ZIP14介导的细胞内锌转运在葡萄糖刺激的胰岛素分泌及代谢反应中的作用	小鼠胰腺β细胞特定的ZIP14敲除模型	数字病理学	2型糖尿病	单细胞RNA测序	KO模型	体内，体外和外切除实验数据	使用了β-KO小鼠及分离的胰岛
11138	2024-08-05	Cardiac Development at a Single-Cell Resolution 2024, Advances in experimental medicine and biology DOI:10.1007/978-3-031-44087-8_14 PMID:38884716	研究论文	这篇文章探讨了单细胞分辨率下哺乳动物心脏发育的复杂过程	文章介绍了单细胞RNA测序技术为了解心脏发育中的异质细胞群体提供了新工具，揭示了心脏前体细胞的新型群体和基因调控网络	文章未提及研究的特定样本数量及其潜在局限性	揭示人类和小鼠心脏发育中的空间时间转录组特征	哺乳动物心脏的发育及其相关的细胞群体	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
11139	2024-08-04	Spatial transcriptomics analysis identifies a unique tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease 2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.18.572266 PMID:38187574	研究论文	本研究描述了在黑色素瘤脑膜下疾病中脑膜间质的肿瘤促进功能	首次揭示了脑膜间质在黑色素瘤LMD中的肿瘤促进作用及其机制	仅针对特定肿瘤微环境进行研究，结果可能不适用于其它类型的转移性肿瘤	研究黑色素瘤脑膜下疾病的肿瘤微环境与肿瘤细胞之间的相互作用	侧重于黑色素瘤LMD的脑膜组织及对应的外脑转移位点	数字病理学	黑色素瘤	空间转录组分析	NA	组织样本	NA
11140	2024-08-04	Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics 2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.07.566033 PMID:37986917	研究论文	该文章探讨了青少年皮肌炎的免疫失调特征	首次通过单细胞基因组学揭示了青少年皮肌炎中免疫系统的协调失调	对疾病机制的理解仍然不完全，治疗选择有限	旨在理解青少年皮肌炎的免疫失调及其与疾病活动的关系	研究对象为不同疾病活动阶段的青少年皮肌炎患者的外周血	数字病理学	青少年皮肌炎	单细胞转录组学	NA	外周血单核细胞的转录组数据	NA