单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11101 - 11120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11101 | 2024-08-05 |
A body-brain circuit that regulates body inflammatory responses
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07469-y
PMID:38692285
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研究论文 | 该文章展示了一个调节身体炎症反应的身体-大脑回路 | 本研究首次揭示了外周免疫损伤如何激活身体-大脑轴以调节免疫反应 | 尚未探讨该回路在所有免疫疾病中的普遍适用性 | 研究身体-大脑轴在调节免疫反应中的作用 | 主要研究外周免疫刺激下的身体-大脑回路及其对炎症反应的影响 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 功能成像数据 | NA |
| 11102 | 2024-08-07 |
Uncovering intestinal macrophages through the integration of single-cell and spatial transcriptomics
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00242-7
PMID:38142267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11103 | 2024-08-04 |
Comparative single-cell transcriptomic profile of hybrid immunity induced by adenovirus vector-based COVID-19 vaccines
2024-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00270-x
PMID:38570727
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研究论文 | 本研究比较了不同COVID-19疫苗诱导的混合免疫的单细胞转录组特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析探讨了不同COVID-19疫苗对B细胞和T细胞亚群的影响 | 样本量相对较小，仅在五个不同组别中进行比较 | 研究不同COVID-19疫苗诱导的免疫应答特征 | 来自疫苗接种者和COVID-19恢复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 五个不同组别的外周血单核细胞 |
| 11104 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals transcriptional and cell subpopulation differences between human and pig immune cells
2024-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01456-9
PMID:37979077
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人类与猪免疫细胞之间的转录和细胞亚群差异 | 首次研究了人类和猪免疫细胞亚群之间的基因转录谱差异 | 样本量较小，仅包含两只猪和两位健康人类PBMCs | 评估猪和人类之间基因转录的相似性和差异 | 研究对象为猪和人类的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 10×基因组单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2只猪和2位健康人类的PBMC |
| 11105 | 2024-08-04 |
From patient tissue correlates to molecular mechanisms of cancer immune evasion: the emerging role of CD58 and PD-L1 co-regulation via CMTM6
2024-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00224-9
PMID:38082156
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研究论文 | 本文探讨了CD58和PD-L1的共同调节在癌症免疫逃逸中的作用 | 揭示了CD58损失导致免疫逃逸的机制，并发现CMTM6在CD58和PD-L1的双重调节中的关键作用 | 仅在黑色素瘤患者样本中进行研究，可能不适用于所有类型癌症 | 研究癌细胞内在的免疫逃逸机制 | 黑色素瘤患者的组织样本和衍生的共同培养模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 共同培养模型 | 组织样本 | 患者样本与肿瘤浸润性淋巴细胞的联合样本 |
| 11106 | 2024-08-04 |
DDIT3 is associated with breast cancer prognosis and immune microenvironment: an integrative bioinformatic and immunohistochemical analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96491
PMID:38911383
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研究论文 | 本研究探讨了DDIT3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 采用新型多组学整合策略，揭示DDIT3与乳腺癌差预后的关联及其在肿瘤微环境中的空间表达模式 | 尚未明确DDIT3在乳腺癌进展中的具体作用 | 研究DDIT3在乳腺癌中的作用及其在免疫微环境中的角色 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的DDIT3表现 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序、单细胞测序、空间转录组学、免疫组化 | NA | NA | 涉及乳腺癌患者多组学数据 |
| 11107 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Investigations Illuminate Theragnostic value and Immune Landscape of Mitochondrial Dynamin-Like GTPase in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96100
PMID:38911373
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体动态蛋白OPA1/3在乳腺癌中的治疗诊断价值及其免疫微环境 | 揭示了OPA1/3在乳腺癌肿瘤发生和进展中的复杂角色及其作为潜在生物标志物的价值 | 未提及具体的实验设计与样本处理的局限性 | 研究OPA1/3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 乳腺癌中线粒体蛋白OPA1/3的表达和功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、药物基因组学 | NA | 数据集、临床样本 | 涉及来自多个数据库的乳腺癌样本 |
| 11108 | 2024-08-04 |
Experimental Validation and Multi-omics Analysis Identified ARPC1A as a Novel Oncogene and Potential Therapeutic Target in Glioblastoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94552
PMID:38911374
|
研究论文 | 这项研究探讨了ARPC1A在胶质母细胞瘤中的生物学作用及其作为新的肿瘤基因和潜在治疗靶点的可能性 | 确立了ARPC1A在多种癌症中的预后价值并揭示其在胶质母细胞瘤耐药性中的调节机制 | 文章未详细探讨ARPC1A在其他癌症中的作用机制 | 研究ARPC1A在胼胶质瘤和其他多种癌症中的作用及机制 | 研究对象为ARPC1A在多种癌症中的表达、突变及其免疫微环境作用 | 数字病理 | NA | 基因组分析，基因集富集分析(GSEA)，单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 在多种癌症组织中分析了ARPC1A的表达与突变 |
| 11109 | 2024-08-04 |
Transcriptional and functional remodeling of lung-resident T cells and macrophages by Simian varicella virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408212
PMID:38887303
|
研究论文 | 这篇文章探讨了猿水痘病毒感染如何重塑肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组和功能 | 提出了SVV感染后肺部细胞转录组的变化以及适应性反应的见解 | 未明确阐述SVV与人类VZV感染的所有潜在差异 | 研究SVV感染对肺部免疫反应的影响 | 肺部常驻T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 猕猴实验模型 | 转录组数据 | 未提供样本量信息 |
| 11110 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of the clinical significance and molecular mechanism of T-box transcription factor 3 in osteosarcoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96168
PMID:38911382
|
研究论文 | 该文章研究了TBX3在骨肉瘤中的临床意义和分子机制 | 文章首次揭示TBX3在骨肉瘤进展中的潜在作用及其作为生物标志物的可能性 | 研究采用的数据来自微阵列和RNA-seq，可能存在数据偏差的风险 | 研究TBX3在骨肉瘤中的作用及其临床重要性 | 重点研究TBX3在不同骨肉瘤阶段的表达以及与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11111 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell transcriptomics and epigenetic analysis reveals enhancer-controlled TIMP1 as a regulator of ferroptosis in colorectal cancer
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01474-7
PMID:38032469
|
研究论文 | 本研究探讨了增强子控制的基因在结直肠癌中对铁死亡的调控作用和机制。 | 发现TIMP1作为铁死亡调控因子通过增强子与转录因子SPI1结合而上调，提供了结直肠癌治疗的新分子靶点。 | 研究仅基于特定数据集的单细胞RNA测序和ChIP-seq数据，可能局限于这些特定样本的普适性。 | 研究增强子控制的基因在结直肠癌铁死亡中的作用和机制。 | 结直肠癌（CRC）中不同细胞群体及其与铁死亡的相关性。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 从GSE200997和GSE166254数据集中涉及的结直肠癌和正常结肠组织样本 |
| 11112 | 2024-08-04 |
The Fibroblast Landscape in Stomach Carcinogenesis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.001
PMID:38342299
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评论 | 本文总结和讨论了近年来关于人类胃中成纤维细胞组分从正常到化生、异型增生和癌症的研究。 | 本文创新点在于强调了成纤维细胞群体在胃癌发生过程中的异质性和可塑性，尤其是在化生和异型增生中的变化。 | 本文为综述，可能未包含某些最新的研究进展。 | 研究胃癌发生过程中成纤维细胞的组分和特征。 | 研究对象为人类胃中不同阶段（正常、化生、异型增生和癌症）的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11113 | 2024-08-04 |
Multi-omic profiling of breast tumor microenvironment uncovers a role of mitochondrial calcium gatekeepers
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95979
PMID:38911376
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研究论文 | 本研究旨在阐明线粒体钙摄取1/2（MiCU1/2）在乳腺癌中的作用 | 采用针对整个肿瘤组织、单细胞和空间转录组分析的新型网络应用，发掘MiCU1/2与肿瘤免疫微环境之间的关联 | NA | 探讨MiCU1/2作为乳腺癌的独立诊断生物标志物及其预后预测的潜力 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 涉及乳腺癌患者的肿瘤样本 |
| 11114 | 2024-08-05 |
Mussel inspired 3D elastomer enabled rapid calvarial bone regeneration through recruiting more osteoprogenitors from the dura mater
2024, Regenerative biomaterials
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/rb/rbae059
PMID:38911700
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研究论文 | 该研究开发了一种3D弹性体，促进了颅骨缺损的再生。 | 首次揭示了硬脑膜细胞与巨噬细胞之间的相互作用对颅骨全层修复的关键作用。 | 研究中未提及样本数量和临床试验情况，可能影响结果的广泛适用性。 | 探索新材料在颅骨再生中的应用及其机制。 | 主要研究硬脑膜细胞和巨噬细胞在颅骨愈合中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D弹性体 | 生物材料实验数据 | 8mm颅骨缺损模型 |
| 11115 | 2024-08-05 |
A review on gene regulatory network reconstruction algorithms based on single cell RNA sequencing
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01473-8
PMID:38032470
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综述 | 本文综述了15种基于单细胞RNA测序的基因调控网络重建工具及其优缺点 | 强调了单细胞RNA测序技术的进步如何促进了基因调控网络的重建 | 未能提供对所有GRN重建工具的深入验证 | 介绍不同的基因调控网络重建工具及其在单细胞RNA测序中的应用 | 15种基因调控网络重建工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11116 | 2024-08-05 |
Demultiplexing of single-cell RNA-sequencing data using interindividual variation in gene expression
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae085
PMID:38911824
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研究论文 | 本文描述了一种新颖的计算方法表达意识解混（EAD），用于利用个体间基因表达的差异性进行单细胞RNA测序的数据解混。 | 提出了表达意识解混（EAD），该方法无额外实验步骤地利用个体间差异的共表达模式进行解混。 | 在文章中没有提到具体的局限性。 | 研究如何利用个体间基因表达变异提高单细胞RNA测序的解混精度。 | 研究对象包括六只同种系近交小鼠的样本及来自脓毒症和健康个体的样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 样本数据 | 使用了30个来自脓毒症和健康个体的样本 |
| 11117 | 2024-08-05 |
Development and validation of matrix metalloproteinase for predicting prognosis and tumour microenvironment immune profiles in uterine corpus endometrial carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.91277
PMID:38911387
|
研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶（MMP）在预测子宫体癌患者预后和肿瘤微环境免疫特征中的应用 | 文章创新性在于构建了MMP评分系统，能够有效预测子宫内膜癌患者的预后与肿瘤微环境的免疫细胞浸润 | 尽管低MMP评分组患者预后较差，但对免疫治疗的反应更好，这一结论需要更深入的临床验证 | 研究的目的是评估MMP表达模式对子宫内膜癌预后的影响 | 研究对象为子宫内膜癌患者及其MMP相关的表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 子宫癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA） | 基因表达数据 | NA |
| 11118 | 2024-08-05 |
Identification Of Endothelial Cell Immune-related Gene Signature for Lung Adenocarcinoma by Integrated Analysis of Single-cell and Bulk RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94501
PMID:38911372
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研究论文 | 本研究旨在探讨内皮细胞免疫相关基因在肺腺癌（LUAD）中的预后价值，并提供进一步见解 | 通过整合单细胞和大规模RNA测序数据，构建了新的预后模型和预后标志，发展了针对LUAD患者的个性化治疗方向 | 研究的模型和标志还需要在更广泛的人群中进一步验证 | 研究内皮细胞免疫相关基因在肺腺癌中的作用及其预后价值 | 肺腺癌患者及其相关的内皮细胞免疫相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和大规模RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 分析了来自GEO数据库的单细胞RNA测序样本和来自TCGA的批量RNA测序数据 |
| 11119 | 2024-08-05 |
Ligament injury in adult zebrafish triggers ECM remodeling and cell dedifferentiation for scar-free regeneration
2023-Sep-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00329-9
PMID:37726321
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研究论文 | 这项研究揭示了成年斑马鱼韧带在损伤后的无疤痕再生能力 | 建立了一个新的成年无疤痕韧带再生模型，强调了免疫和间充质细胞相互作用在细胞外基质重塑中的作用 | 尚未明确不同免疫细胞在再生过程中的具体功能 | 研究成年斑马鱼韧带受伤后的再生机制 | 成年斑马鱼的韧带组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | 斑马鱼数目未具体提及 |
| 11120 | 2024-08-04 |
Identification of ulcerative colitis-specific immune cell signatures from public single-cell RNA-seq data
2023-07, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01390-w
PMID:37133723
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研究论文 | 本研究利用公共单细胞RNA-seq数据研究溃疡性结肠炎的组织微环境 | 研究揭示了溃疡性结肠炎特异性的免疫细胞标志，并探讨了不同免疫细胞间的相互作用 | 未提及所有数据集的细胞类型注释，可能影响细胞群体的选择 | 研究溃疡性结肠炎的组织微环境及其免疫细胞机制 | 溃疡性结肠炎患者的免疫细胞亚群 | 数字病理 | 肠道炎症 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本量未具体说明 |