单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4781	2025-01-19	Transcriptional characterisation of human lung cells identifies novel mesenchymal lineage markers 2020-01, The European respiratory journal DOI:10.1183/13993003.00746-2019 PMID:31619469	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了人类胎儿肺组织中的多种间充质细胞系，并提供了新的间充质细胞系标记物	鉴定了人类胎儿肺组织中的多种间充质细胞系，并提供了新的间充质细胞系标记物，特别是与气道和血管平滑肌细胞相关的标记物	研究仅限于胎儿肺组织，未涉及成人肺组织或其他物种	研究人类肺组织中间充质细胞的多样性和特异性	人类胎儿肺组织	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序、免疫组织化学、原位杂交	NA	RNA测序数据	胎儿人类肺组织样本
4782	2025-01-18	Tumor editing suppresses innate and adaptive antitumor immunity and is reversed by inhibiting DNA methylation 2024-Oct, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-01932-8 PMID:39169233	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了乳腺癌基因工程小鼠模型中的基因编辑现象，揭示了肿瘤如何通过编辑基因表达来逃避免疫监视，并探讨了抑制DNA甲基化如何逆转这一过程	首次在全基因组范围内研究了早期肿瘤发生过程中的基因编辑现象，并发现抑制DNA甲基化可以逆转肿瘤对免疫基因的抑制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类肿瘤中进行验证	探讨肿瘤如何通过基因编辑逃避免疫监视，并寻找逆转这一过程的方法	乳腺癌基因工程小鼠模型中的肿瘤细胞	肿瘤免疫学	乳腺癌	单细胞RNA测序	基因工程小鼠模型（GEMM）	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但涉及乳腺癌和黑色素瘤的植入肿瘤
4783	2025-01-18	Macrophages preserve endothelial cell specialization in the adrenal gland to modulate aldosterone secretion and blood pressure 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114395 PMID:38941187	研究论文	本文探讨了巨噬细胞在肾上腺中如何通过维持毛细血管的特殊化来调节醛固酮分泌和血压	揭示了巨噬细胞通过VEGF-A信号维持肾上腺毛细血管的特殊化，进而调节醛固酮分泌和血压的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证有限	研究巨噬细胞在肾上腺功能和血压调节中的作用	肾上腺中的巨噬细胞和毛细血管	生物医学	高血压	单细胞转录组学、功能表型分析	小鼠模型	基因表达数据、生理数据	小鼠模型和人类醛固酮产生腺瘤样本
4784	2025-01-18	Insulin and leptin oscillations license food-entrained browning and metabolic flexibility 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114390 PMID:38900636	研究论文	本文探讨了定时喂食如何通过胰岛素和瘦素的振荡促进皮下白色脂肪组织（sWAT）的褐变和代谢灵活性	揭示了定时喂食通过胰岛素和瘦素的振荡调控sWAT褐变和能量消耗的机制，并发现神经支配在此过程中的必要性	研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证	探究定时喂食如何通过激素振荡调控脂肪组织褐变和代谢灵活性	皮下白色脂肪组织（sWAT）和棕色脂肪组织（BAT）	代谢研究	代谢疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术	NA	基因表达数据和细胞表型数据	NA
4785	2025-01-16	The role of CD101 and Tim3 in the immune microenvironment of gastric cancer and their potential as prognostic biomarkers 2025-Jan-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113835 PMID:39700955	研究论文	本研究探讨了CD101和Tim3在胃癌免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物的潜力	通过多组学方法揭示了CD101- Tim3+ CD8+ T细胞和CD101+ Tim3+ CD8+ T细胞的差异表达基因，并构建了基于14个预后基因的风险评分模型	研究中未明确提及样本的具体数量，可能影响结果的普遍性	阐明胃癌的分子机制，探索新的生物标志物和治疗策略	胃癌患者的CD101- Tim3+ CD8+ T细胞和CD101+ Tim3+ CD8+ T细胞	生物信息学	胃癌	转录组测序、单细胞RNA测序、细胞通讯分析、富集分析	风险评分模型	基因表达数据	NA
4786	2025-01-16	c-JUN interacts with HDAC1 as a potential combinatorial therapeutic target in acute myeloid leukemia 2025-Jan-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113927 PMID:39721452	研究论文	本文通过多组学分析探讨了HDAC1在急性髓性白血病（AML）中的致癌作用，并验证了c-JUN与HDAC1的潜在调控关系	首次在单细胞水平上识别了AML中HSC-Prog的特定基因特征，并通过实验验证了c-JUN与HDAC1的相互作用及其在AML治疗中的潜在应用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性	探索AML的潜在治疗靶点和有效治疗策略	急性髓性白血病（AML）患者和小鼠模型	生物医学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、Western blotting、共免疫沉淀（Co-IP）、流式细胞术、活体成像（IVIS、iSMAART）	小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质相互作用数据	AML患者样本和小鼠模型
4787	2025-01-16	Elucidating cardiomyocyte heterogeneity and maturation dynamics through integrated single-cell and spatial transcriptomics 2025-Jan-17, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111596 PMID:39811652	研究论文	本研究利用单细胞和空间转录组学技术分析了新生小鼠心脏细胞，绘制了详细的心肌细胞亚群转录图谱，揭示了心肌细胞成熟状态的连续性和空间分布	通过单细胞和空间转录组学技术，首次详细描绘了心肌细胞的异质性和成熟动态，识别了关键的过渡性心肌细胞亚群，为心脏再生治疗提供了新的靶点	研究仅限于新生小鼠心脏，未涉及成年或其他物种的心脏细胞	阐明心肌细胞的异质性和成熟动态，以促进心脏再生医学研究	新生小鼠心脏的心肌细胞	生物信息学	心血管疾病	单细胞转录组学, 空间转录组学	NA	转录组数据	新生小鼠心脏细胞
4788	2025-01-16	Predictive value of dendritic cell-related genes for prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma 2025-Jan-14, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-025-03642-z PMID:39810206	研究论文	本研究通过筛选树突状细胞相关基因，构建了一个预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应的预后标志物	创新性地建立了基于深度学习的预测模型DCRGS，用于预测肺腺癌患者的预后，并展示了其在临床管理中的潜在应用	研究依赖于特定数据集，可能需要在更广泛的患者群体中进行验证	预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应	肺腺癌患者	数字病理	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序、实时定量PCR（q-PCR）	深度学习模型	RNA测序数据、临床样本数据	未明确提及具体样本数量
4789	2025-01-16	Prospects of neutrophilic implications against pathobiology of chronic obstructive pulmonary disease: Pharmacological insights and technological advances 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113634 PMID:39577220	review	本文探讨了中性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的关键作用，强调了针对中性粒细胞的新型治疗方法的紧迫性，并探讨了利用单细胞RNA测序技术进一步研究中性粒细胞及相关风险基因作为COPD治疗潜在生物标志物的可能性	强调了针对中性粒细胞的新型治疗方法的紧迫性，并探讨了利用单细胞RNA测序技术研究中性粒细胞及相关风险基因作为COPD治疗潜在生物标志物的可能性	NA	探讨中性粒细胞在COPD中的作用，并探索新的治疗方法	中性粒细胞及其在COPD中的生物学活动	digital pathology	lung cancer	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
4790	2025-01-16	Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta 2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2413191121 PMID:39793067	研究论文	本研究探讨了温度对红耳滑龟生殖细胞分化和减数分裂进程的直接影响，独立于性腺的性别决定	揭示了温度对生殖细胞性分化的直接影响，独立于性腺体细胞的性别决定，这在温度依赖性性别决定（TSD）物种中是一个新的发现	研究仅限于红耳滑龟这一TSD模型物种，可能不适用于其他物种	研究温度对生殖细胞分化和性别身份的直接影响	红耳滑龟的生殖细胞	生殖生物学	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	NA
4791	2025-01-16	Qingfei Yin alleviates Streptococcus pneumoniae pneumonia by promoting complete autophagy to suppress necroptosis 2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156280 PMID:39637472	研究论文	本研究探讨了清肺饮（QFY）通过促进完全自噬来抑制坏死性凋亡，从而缓解肺炎链球菌引起的肺炎的机制	首次揭示了清肺饮通过下调p62表达促进完全自噬，进而缓解肺炎链球菌诱导的肺上皮细胞坏死性凋亡的分子机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人体中进行验证	探索清肺饮治疗肺炎链球菌肺炎的机制	肺炎链球菌引起的肺炎	生物医学	肺炎	单细胞转录组学、HE染色、免疫荧光、AO染色、PI染色、Western blot分析	小鼠肺炎模型、TC-1细胞模型	基因表达数据、细胞图像数据	113,353个细胞
4792	2025-01-14	Major cell types in the coronary thrombosis of acute myocardial infarction patients revealed by scRNA-seq 2025-Jan, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70181 PMID:39804415	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4793	2025-01-16	Advances in modeling cellular state dynamics: integrating omics data and predictive techniques 2025, Animal cells and systems IF:2.5Q1 DOI:10.1080/19768354.2024.2449518 PMID:39807350	综述	本文综述了当前用于建模细胞状态动态的方法，包括从动态或静态生物分子网络模型到深度学习模型的技术	强调了这些方法如何与转录组学和单细胞RNA测序等多种组学数据结合，以捕捉和预测细胞行为和转变	讨论了这些方法在可扩展性和分辨率要求方面的局限性，这些要求根据研究生物系统的复杂性和大小而变化	旨在指导未来研究开发更强大和可解释的模型，以理解和操纵各种生物背景下的细胞状态动态，最终推进治疗策略和精准医学	细胞状态动态	机器学习	NA	转录组学, 单细胞RNA测序	深度学习模型	组学数据	NA
4794	2025-01-16	Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with Germline FANCD2 Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing 2024-Dec-14, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1 DOI:10.3390/jcm13247621 PMID:39768544	研究论文	本文报告了一例携带FANCD2基因种系突变的胰腺神经内分泌肿瘤患者，并利用单细胞RNA测序技术对肿瘤进行了分析	首次在胰腺神经内分泌肿瘤患者中报告了FANCD2基因种系突变，并应用单细胞RNA测序技术进行肿瘤分析	样本量较小，仅为单一病例报告	探讨胰腺神经内分泌肿瘤的分子特征和预后标志物	胰腺神经内分泌肿瘤患者	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	1例患者
4795	2025-01-16	Harnessing Single-Cell and Spatial Transcriptomics for Crop Improvement 2024-Dec-11, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants13243476 PMID:39771174	综述	本文综述了单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用及其最新进展	结合单细胞和空间转录组技术，揭示了作物组织中细胞群体的异质性及其对环境刺激的响应，为作物遗传改良和育种策略提供了新的视角	未提及具体的技术局限或挑战	探讨单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用及其潜力	作物生物学中的细胞群体及其基因表达	作物科学	NA	单细胞转录组技术、空间转录组技术	NA	转录组数据	NA
4796	2025-01-16	Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine 2024-Dec-05, The Journal of physiology DOI:10.1113/JP287463 PMID:39639676	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，对人类小肠类器官衍生的肠内分泌细胞（EECs）进行了图谱绘制，揭示了不同EEC群体的差异表达激素、营养感应机制、转录因子和外泌机制	首次通过CRISPR-Cas9技术标记并纯化人类十二指肠和回肠类器官中的肠内分泌细胞，利用单细胞RNA测序技术详细分析了这些细胞的基因表达特征	研究主要依赖于类器官模型，可能无法完全模拟体内环境	绘制人类肠内分泌细胞的单细胞转录组图谱，以促进针对肠内分泌轴的药物开发	人类十二指肠和回肠类器官衍生的肠内分泌细胞	单细胞转录组学	糖尿病、肥胖症、肠道疾病	单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9、流式细胞术	NA	RNA测序数据	人类十二指肠和回肠类器官
4797	2025-01-16	Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis 2024-Dec, Experimental hematology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655 PMID:39393608	综述	本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用，特别是选择性剪接在造血干细胞维持、分化及血液系统疾病中的重要性	强调了选择性剪接事件及其调节因子在造血过程中的关键作用，并探讨了剪接因子突变如何导致血液系统恶性肿瘤	NA	更新关于选择性剪接在造血及其相关疾病中的最新技术和研究进展	造血干细胞、造血祖细胞、功能性血细胞及血液系统恶性肿瘤	分子生物学	血液系统恶性肿瘤	多色流式细胞分选、批量测序、单细胞测序	NA	NA	NA
4798	2025-01-16	Highlighting roles of autophagy in human diseases: a perspective from single-cell RNA sequencing analyses 2024-Dec, Drug discovery today IF:6.5Q1 DOI:10.1016/j.drudis.2024.104224 PMID:39521332	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在自噬研究中的最新进展，并强调了其在多种疾病分子特征描述中的潜力	利用单细胞RNA测序技术，从单细胞分辨率层面研究自噬在多种生理和病理环境中的作用，为自噬在疾病中的复杂角色提供了新的视角	自噬在癌症和其他疾病中的作用仍然复杂且未完全理解，需要进一步研究	促进对自噬在人类疾病中作用的全面理解，以开发新的治疗方法和药物	自噬在癌症和其他疾病中的作用	自然语言处理	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
4799	2025-01-16	The Functional Role and Prognostic Significance of TIM-3 Expression on NK Cells in the Diagnostic Bone Marrows in Acute Myeloid Leukemia 2024-Nov-27, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12122717 PMID:39767624	研究论文	本研究探讨了TIM-3在急性髓性白血病（AML）患者骨髓中自然杀伤（NK）细胞上的功能作用和预后意义	首次系统评估了TIM-3在AML患者NK细胞上的表达与其细胞毒性和杀伤能力的关系，并探讨了其预后意义	TIM-3表达水平与NK细胞杀伤活性无直接关系，且TIM-3高表达并非独立的预后因素	评估TIM-3在AML患者NK细胞上的表达对其细胞毒性和杀伤能力的影响，并探讨其预后意义	AML患者和健康捐赠者的骨髓NK细胞	免疫学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序（scRNAseq）、多参数流式细胞术（MFC）	NA	RNA测序数据、流式细胞术数据	105名新诊断的AML成年患者和7名健康捐赠者
4800	2025-01-16	Circulating Adenoid Cystic Carcinoma associated MYB transcripts enable rapid and sensitive detection of metastatic disease in blood liquid biopsies 2024-Oct-17, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.10.15.24315549 PMID:39484279	研究论文	本文开发了一种基于qPCR的检测方法，通过监测血液中MYB转录本的水平来检测腺样囊性癌（ACC）的转移	利用肿瘤特异性MYB表达作为生物标志物，开发了一种敏感、经济且微创的诊断测试，用于早期检测ACC的转移	样本量较小，尤其是转移性ACC组仅有5例样本，可能影响结果的普遍性	开发一种通过血液液体活检检测腺样囊性癌转移的方法	腺样囊性癌（ACC）患者	数字病理学	头颈部癌症	定量聚合酶链反应（qPCR），单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	血液样本	共49例样本，包括23例无ACC病史或证据的样本，15例过去有ACC病史且无疾病证据超过三年的样本，6例局部ACC样本，5例转移性ACC样本