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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4721 - 4740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4721 | 2025-10-06 |
A dynamic molecular landscape in colorectal cancer progression at single-cell resolution
2025-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06785-9
PMID:40597160
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌进展过程中的分子机制和细胞异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘结直肠癌进展的动态分子景观，重点关注配体-受体基因在细胞亚型区分中的作用 | 样本量相对有限（10个临床样本），需要更大规模验证 | 阐明结直肠癌发生发展的分子机制 | 结直肠临床样本（包括正常组织、息肉、腺瘤和癌组织） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 免疫组织化学, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 10个临床结直肠样本（代表不同病理阶段），外加独立验证队列和公共数据集（TCGA, GEO） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4722 | 2025-10-06 |
stGRL: spatial domain identification, denoising, and imputation algorithm for spatial transcriptome data based on multi-task graph contrastive representation learning
2025-Jul-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02290-z
PMID:40597202
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研究论文 | 提出一种基于多任务图对比表示学习的空间转录组数据分析算法stGRL，用于空间域识别、去噪和插补 | 开发了首个结合编码器-解码器架构与零膨胀负二项分布的多任务图神经网络模型，集成图对比表示学习增强节点嵌入一致性 | 未明确说明算法计算复杂度及对大规模数据集的处理效率 | 解决空间转录组数据高丢失率和噪声问题，提升下游分析性能 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,卵巢癌 | 空间转录组测序 | 图神经网络,编码器-解码器,对比学习 | 空间转录组数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4723 | 2025-10-06 |
A rare IDH-Mutant glioma case: insights from single-cell transcriptomic analysis of tumor recurrences
2025-Jul-01, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03913-z
PMID:40597255
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病例报告 | 通过单细胞转录组分析研究一例罕见IDH突变胶质瘤多灶性复发的细胞异质性和谱系关系 | 首次对IDH突变胶质瘤多灶性复发进行单细胞测序分析，揭示不同病灶间的细胞组成差异和隐藏谱系关系 | 单一样本病例研究，结果可能不具有普遍代表性 | 探究IDH突变胶质瘤多灶性复发的分子机制 | 36岁男性IDH突变少突胶质细胞瘤患者的多灶性复发肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者的2个复发肿瘤病灶 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4724 | 2025-10-06 |
Gremlin1 repression-mediated mitochondrial network hyperfunction contributes to TCE-induced zebrafish cardiac defects
2025-Jul-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02314-9
PMID:40597303
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研究论文 | 本研究揭示三氯乙烯通过抑制Gremlin1基因导致线粒体网络功能亢进，从而引起斑马鱼心脏发育缺陷的机制 | 首次发现Gremlin1基因在心脏发育中的关键作用，并阐明环境污染物通过调控该基因导致心脏缺陷的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，在人类中的直接相关性需要进一步验证 | 探究三氯乙烯诱导先天性心脏病的分子机制 | 斑马鱼胚胎和人类多能干细胞来源的心肌细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, CRISPR/dCas9基因编辑 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎和hPSC-CMs细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4725 | 2025-10-06 |
Multiple cell types guided by neurocytes orchestrate horn bud initiation in dairy goats
2025-Jul-01, Genetics, selection, evolution : GSE
DOI:10.1186/s12711-025-00981-3
PMID:40597626
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了奶山羊早期角芽发育过程中细胞异质性和命运轨迹 | 首次揭示了神经细胞引导下多种细胞类型协同调控山羊角芽起始的发育机制 | 研究仅聚焦于胚胎期角芽发育，未涉及出生后角形成过程 | 阐明奶山羊角芽起始的细胞和分子机制 | 奶山羊胚胎期角芽组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HE染色, 免疫组织化学 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 组织图像 | 奶山羊胚胎期角芽组织（E50, E60, E70阶段） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4726 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome of mouse hippocampus identifies neural precursor-like cells, and reveals IL15Rα knock out-mediated neuron remodeling
2025-Jul-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11785-6
PMID:40597645
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IL15Rα敲除对小鼠海马体细胞功能的影响，并鉴定出一种具有前体样属性的新型神经细胞 | 发现前体样神经元这一新型细胞类型，提出'极化评分'方法评估细胞聚集程度，揭示IL15Rα敲除通过影响神经元可塑性调节兴奋-抑制平衡 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；单细胞测序技术本身存在技术偏差 | 研究IL15Rα敲除对成年小鼠海马体细胞功能的影响 | 野生型和IL15Rα敲除小鼠的海马体组织 | 单细胞转录组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,399个单细胞转录组（来自WT和KO小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4727 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the role of SALL4 in cervical cancer development
2025-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14469-2
PMID:40597906
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨SALL4在宫颈癌发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞测序技术和体内外实验系统揭示SALL4在宫颈癌进展中的关键调控作用 | 研究主要基于HeLa细胞系，临床样本验证不足 | 探究SALL4在宫颈癌发展中的作用及其治疗靶点潜力 | 宫颈癌细胞系HeLa | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞测序，转录组分析，免疫荧光，体内外实验 | NA | 单细胞测序数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4728 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and time-series metabolite profiling reveal the spatiotemporal regulation of flavonoid biosynthesis genes and phytohormone homeostasis by PAP1 in Arabidopsis
2025-Jul-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02297-6
PMID:40598113
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和时序代谢物分析，揭示了PAP1在拟南芥中调控类黄酮生物合成基因和植物激素稳态的时空调控机制 | 首次结合单细胞转录组和时序代谢组学，在细胞类型特异性水平解析PAP1对类黄酮生物合成途径的时空调控网络 | 研究仅针对拟南芥模型植物，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 阐明PAP1转录因子在植物类黄酮生物合成和植物激素稳态中的细胞特异性调控机制 | 拟南芥野生型和pap1-D突变体叶片 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢物分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 拟南芥野生型和pap1-D突变体叶片样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 4729 | 2025-10-06 |
Mechanical force-induced oncostatin M secretion by Jun-positive neutrophils promotes craniofacial bone regeneration for midface hypoplasia treatment
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04458-4
PMID:40598376
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研究论文 | 本研究揭示了机械力通过Jun阳性中性粒细胞分泌制瘤素M促进颅面骨再生的新机制 | 首次发现Jun阳性中性粒细胞亚群在机械力诱导的骨再生中的关键作用，并阐明其通过分泌制瘤素M促进缝线来源干细胞成骨分化的机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证；未探讨其他细胞类型在骨再生中的潜在作用 | 探究经缝牵引成骨技术促进颅面骨再生的分子机制 | C57BL/6小鼠颧颌缝区域的中性粒细胞和缝线来源干细胞 | 骨再生生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序，细胞通讯分析，体外拉伸实验 | 小鼠TSDO模型，HL-60细胞分化模型 | 基因表达数据，细胞信号通路数据 | 4周龄C57BL/6小鼠和中性粒细胞缺失小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4730 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics and multi-omics reveal relapse and resistance mechanisms of EndMT-derived CAFs mediated by TNC and FLNC in glioblastoma
2025-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06743-5
PMID:40598496
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多组学分析揭示了胶质母细胞瘤中由TNC和FLNC介导的内皮-间质转化来源的癌症相关成纤维细胞的复发和耐药机制 | 首次发现TNC和FLNC通过介导内皮-间质转化促进CAFs形成，并证实天然产物安石榴苷可通过靶向TNC和FLNC逆转胶质母细胞瘤耐药性 | 研究样本量有限，机制研究主要基于体外共培养模型，需要更多临床样本验证 | 探索胶质母细胞瘤复发和耐药机制，特别是CAFs的来源和作用 | 胶质母细胞瘤组织样本、替莫唑胺敏感和耐药细胞、人脑血管内皮细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组测序,RNA-seq,无标记定量蛋白质组学,免疫组化染色 | NA | 空间转录组数据,RNA测序数据,蛋白质组数据,图像数据 | 包含原发性和复发性胶质瘤的组织芯片样本，体外共培养模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 4731 | 2025-10-06 |
Construction of a prostate adenocarcinoma molecular classification: integrating spatial transcriptomics with retrospective cohort validation
2025-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06661-6
PMID:40598508
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析构建了前列腺腺癌的分子分类系统，并在回顾性队列中验证其预后预测价值 | 整合空间转录组学与回顾性队列验证，首次基于恶性细胞分化相关预后基因构建前列腺腺癌分子分类系统 | 研究基于回顾性队列，需要前瞻性研究进一步验证 | 建立前列腺腺癌的精确分子分类系统以改善患者预后分层 | 前列腺腺癌患者组织样本和临床数据 | 数字病理 | 前列腺癌 | 空间转录组分析,免疫组化染色,单变量Cox回归,Kaplan-Meier分析 | ConsensusClusterPlus算法,Monocle 2分析 | 空间转录组数据,基因组数据,免疫组数据,临床随访数据 | TCGA-PRAD队列和回顾性队列患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4732 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of human lens epithelium: identification and functional insights into lens stem/progenitor cells
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04436-w
PMID:40598599
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了人类晶状体上皮细胞的转录组图谱，识别了晶状体干细胞/祖细胞并提供了功能见解 | 首次在人类晶状体上皮中识别出瞬时扩增细胞(TACs)和晶状体祖细胞样细胞(LPLCs)，确定了TOP2A作为TAC的生物标志物，揭示了PTN信号在晶状体稳态中的关键作用 | 样本量相对较小(8对样本)，仅包含人类供体样本，需要进一步的功能验证实验 | 识别和表征人类晶状体上皮中的干细胞/祖细胞亚群，理解晶状体细胞分化轨迹和衰老相关变化 | 人类供体晶状体上皮样本、人类晶状体、晶状体类器官、兔再生晶状体、小鼠晶状体和细胞系 | 单细胞生物学 | 白内障 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、轨迹推断、细胞间通讯分析、转录组测序、免疫荧光 | UMAP、CytoTRACE | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 8对人类供体晶状体上皮样本(4个非老年<65岁，4个老年>65岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4733 | 2025-10-06 |
Identification of Crucial Genes Associated With MYCN-Driven Neuroblastoma Based on Single-Cell Analysis and Machine Learning
2025-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71008
PMID:40600620
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习方法识别与MYCN驱动神经母细胞瘤相关的关键基因 | 结合单细胞转录组分析和随机生存森林机器学习方法识别预后相关基因，并揭示其在免疫微环境调控中的作用 | 样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需深入 | 阐明MYCN扩增神经母细胞瘤的分子机制并识别关键预后基因 | 神经母细胞瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | 随机生存森林(RSF)，列线图分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | GSE218450数据集中的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4734 | 2025-10-06 |
ShinySC: an R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2025-Jul-01, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2025.100885
PMID:40609640
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研究论文 | 开发了一个基于R/Shiny的桌面应用程序，用于简化单细胞RNA测序数据分析 | 整合了多种自动细胞类型注释方法（基于参考、基于标记和基于GPT），支持多种数据格式和并行比较功能 | 在标准64GB内存台式机上最多支持20万个细胞的分析，分析时长依赖具体任务和注释方法 | 为无编程经验的临床医生和研究人员提供易用的单细胞RNA测序分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 最多支持20万个细胞的数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 支持10x Genomics、BD Rhapsody、Seurat、Scanpy和CellView等多种数据格式 |
| 4735 | 2025-10-06 |
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70346
PMID:40613570
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研究论文 | 通过多组学分析揭示棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态变化及其治疗潜力 | 首次整合多组学数据识别SLE中棕榈酰化相关基因，并通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示免疫细胞动态及因果关系 | 需要进一步研究验证发现并探索临床意义 | 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,加权基因共表达网络分析,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | GSE61635数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4736 | 2025-10-06 |
Chromatin accessibility module identified by single-cell sequencing underlies the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i6.107329
PMID:40606924
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研究论文 | 通过单细胞测序识别染色质可及性模块，揭示其在肝细胞癌诊断和预后中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据解析HCC中多层染色质调控网络，发现DGAT1作为染色质可及性核心调控基因 | 样本来源有限，功能验证主要基于体外实验，需要更多临床样本验证 | 解析多层染色质调控如何维持致癌转录和肿瘤-基质相互作用 | 肝细胞癌样本 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | ArchR, 共可及性网络分析 | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | 多个队列（TCGA、肝癌研究所、GSE25907） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4737 | 2025-10-06 |
Elevated Stanniocalcin-1 Expression in Uveal Melanoma Predicts Poor Patient Prognosis
2025-Jun-26, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20526
PMID:40571316
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研究论文 | 本研究探讨了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与患者预后的关系 | 首次揭示了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的细胞来源 | 样本量较小（阶段IV仅4例），需要进一步实验验证机制 | 评估STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后意义和生物学作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者和肿瘤组织 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 阶段III 36例，阶段IV 4例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4738 | 2025-10-06 |
IL-1β signaling modulates T follicular helper and regulatory cells in human lymphoid tissues
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188724
PMID:40392614
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β信号通过调节人类淋巴组织中滤泡辅助T细胞和滤泡调节性T细胞的平衡影响自身免疫反应 | 首次在人类淋巴组织中证实IL-1β信号通过IL-1R1/IL-1R2受体比例调控Tfh/Tfr细胞分化和功能，发现具有Treg和GC-Tfh特征的独特活化Tfr亚群 | 研究主要基于体外实验和表型分析，需要进一步体内功能验证 | 阐明IL-1β信号在人类滤泡T细胞稳态调控中的作用机制 | 人类次级淋巴器官（扁桃体、脾脏和肠系膜淋巴结）中的Tfh和Tfr细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术、单细胞转录组学、体外培养 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 人类淋巴组织样本和自身免疫患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4739 | 2025-10-06 |
Type 2 diabetes alters quiescent pancreatic stellate cells to tumor-prone state
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187424
PMID:40548381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病如何改变静息胰腺星状细胞的亚群分布，促进胰腺导管腺癌发展 | 首次在单细胞水平鉴定出静息胰腺星状细胞中具有肿瘤免疫和血管生成促进功能的新亚群tapPafs，并发现2型糖尿病从癌前阶段就改变了这些亚群的比例 | 研究样本量相对较小，主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究2型糖尿病对静息胰腺星状细胞亚群的影响及其在胰腺癌发生中的作用 | 小鼠胰腺星状细胞和人类2型糖尿病患者的胰腺组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和db/db糖尿病小鼠的胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4740 | 2025-10-06 |
Multi-omics Analysis Reveals Molecular Subtype of Mitochondrial Oxidative Stress and Prognostic Model Development in Sepsis
2025-Jun-20, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL38957
PMID:40613299
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研究论文 | 通过多组学分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征并构建预后风险模型 | 首次结合WGCNA和差异表达分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证RNASE2的关键作用 | 数据来源于公共数据库，样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索脓毒症中线粒体氧化应激的分子亚型并开发预后模型 | 脓毒症患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, LASSO分析, Cox回归分析, ESTIMATE, ssGSEA | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库三个数据集(GSE54514, GSE65682, GSE95233)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |