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当前共找到 40234 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-06-06 |
scMVAF: a multi-view adaptive fusion clustering approach for single-cell RNA-sequencing data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf169
PMID:42218719
|
research paper | 提出了一种名为scMVAF的多视图自适应融合聚类方法，用于分析单细胞RNA测序数据，通过生成多视图表征并融合特征来提升聚类性能 | 首次引入多视图框架并利用基于去噪零膨胀负二项模型的自动编码器来学习单细胞RNA-seq数据的嵌入表示，并通过多视图融合模块整合不同视图的信息以获取更判别的细胞嵌入 | 可能依赖于降采样特征生成视图的策略，对高维稀疏数据中的零计数处理仍有改进空间，且尚未在更大规模或更复杂的数据集上验证 | 开发一种能够更好地处理单细胞RNA-seq数据高维稀疏性和异质性的聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | machine learning | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器（基于去噪零膨胀负二项模型）, 多视图融合模块 | 基因表达数据 | 16个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 402 | 2026-06-06 |
USADAE: a deep learning approach to disentangle hidden covariates in RNA-seq data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag261
PMID:42218722
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研究论文 | 开发了一种基于对抗学习的自编码器框架USADAE，用于从RNA-seq数据中分离隐藏的协变量 | 首次提出无监督对抗解缠自编码器框架，专门用于分离RNA-seq数据中隐藏的混杂因素与生物学信号，突破了传统方法仅针对已知批次标签的局限 | 未提及具体局限性 | 开发一种深度学习方法，有效解缠RNA-seq数据中的隐藏混杂因素，提升差异表达和eQTL分析的下游校正能力 | RNA-seq数据中的生物学信号和隐藏协变量（如未测量的技术变异和生物-技术变量间的非线性交互作用） | 自然语言处理 | 癌症基因组学 | RNA-seq | 自编码器、对抗学习 | 基因表达数据 | 综合模拟和真实数据应用 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2026-06-06 |
Lense: optimizing data preprocessing in single-cell omics using large language models
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag288
PMID:42242684
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研究论文 | 介绍Lense，一种利用大语言模型自动优化单细胞组学数据预处理的方法 | 首次将大语言模型应用于单细胞组学数据预处理流程的自动优化，无需手动调参 | 未提及具体局限性 | 开发并验证一种基于语言模型的方法，自动选择最优预处理流程，提高单细胞组学分析的鲁棒性和效率 | 单细胞组学数据集，特别是新兴平台（如空间转录组学）的数据 | 机器学习 | NA | 单细胞组学，空间转录组学 | 大语言模型 (LLM) | 单细胞组学数据（低维表示可视化图） | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 404 | 2026-06-06 |
Beyond the Cell Atlas: Functional Communities as the Essential Pathologic Units Driving Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001023
PMID:41563353
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综述 | 本文提出‘功能社群’概念作为肾脏疾病的关键病理单元，并探讨其临床应用价值 | 首次系统性地提出‘功能社群’作为肾脏疾病的病理单元，整合空间和多组学技术解析细胞间相互作用 | 该框架仍处于概念阶段，面临技术挑战和临床转化的关键问题 | 提出基于功能社群的新型肾脏病理认知框架并指导下一代诊疗方案开发 | 肾小管损伤修复微环境、促纤维化微环境、免疫破坏微环境等三个典型病理社群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学、多组学技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 405 | 2026-06-06 |
Parasympathetic nerves in the kidney pelvis contribute to blood pressure regulation
2026-May, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.002
PMID:41565024
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研究论文 | 本研究证实肾盂存在副交感神经支配，并揭示迷走神经肾传入通路参与血压调节 | 首次通过多标记技术确认肾盂存在交感、副交感和感觉神经的多组分支配，并利用光纤光度法检测到肾神经释放乙酰胆碱，通过光遗传学激活证实迷走神经肾传入通路可降低血压 | 未提及具体限制 | 验证肾副交感神经的功能活性及其在血压调节中的生理作用 | 小鼠肾盂的神经支配、乙酰胆碱受体表达及血压调节机制 | 神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应、荧光原位杂交、光纤光度法、光遗传学 | NA | 基因表达数据、生理信号数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2026-06-06 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 首次纵向空间转录组分析揭示肺动脉高压患者肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次对同一肺动脉高压患者间隔13年的两次肺移植样本进行纵向空间转录组分析，揭示血管病变的时间动态，并识别出与严重重塑小肺动脉相关的115个基因重塑特征及25个核心基因特征 | 仅基于一名患者的两次移植样本，样本量极小，可能限制结论的普适性 | 探究肺动脉高压中肺动脉重塑的分子动态变化，识别可用于指导靶向治疗的基因特征 | 肺动脉高压患者肺移植组织中的小动脉（20-500 µm）和大动脉（>500 µm） | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 1名肺动脉高压患者，两次肺移植样本（间隔13年） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2026-06-06 |
CXCR2+ Neutrophils Drive Neutrophil Extracellular Traps Formation and Exacerbate Pulpitis in Rats: An In Vitro and In Vivo Laboratory Investigation
2026-May, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70098
PMID:41589026
|
研究论文 | 该研究通过转录组分析和单细胞RNA测序揭示了CXCR2+中性粒细胞在牙髓炎中驱动中性粒细胞胞外陷阱形成并加重炎症的机制，并评估了靶向CXCR2的治疗潜力 | 首次在牙髓炎中鉴定出CXCR2+中性粒细胞亚群作为促炎亚型，并阐明其通过巨噬细胞来源的CXCL8-CXCR2信号驱动NETs形成的机制，同时验证了CXCR2抑制剂作为免疫调节靶点的治疗潜力 | 未提及具体的局限性 | 表征牙髓炎中中性粒细胞胞外陷阱的特征及其调控机制，并评估靶向中性粒细胞亚群的治疗潜力 | 牙髓炎组织、HL-60来源的中性粒细胞、THP-1巨噬细胞、人牙髓细胞、Sprague-Dawley大鼠 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫荧光、微CT分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、组织样本数据 | 人类细胞系和大鼠模型（每组5只，7-8周龄雄性Sprague-Dawley大鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 分析GSE92681、GSE274562、GSE280528数据集 |
| 408 | 2026-06-06 |
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000940
PMID:41563399
|
研究论文 | 研究表明α-Klotho通过TNF-细胞凋亡抑制蛋白1信号通路在常染色体显性多囊肾病中促进细胞死亡并抑制炎症 | 首次阐明α-Klotho在ADPKD中通过与细胞凋亡抑制蛋白1相互作用并使其不稳定，调控TNF依赖性囊性细胞凋亡和炎症的新机制 | 未提及具体局限性 | 研究α-Klotho在常染色体显性多囊肾病中的作用及机制 | α-Klotho蛋白、Pkd1突变小鼠模型 | 机器学习 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Pkd1突变小鼠和转基因α-Klotho/Pkd1突变小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2026-06-06 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-May, Gene therapy
IF:4.6Q2
DOI:10.1038/s41434-026-00600-w
PMID:41813829
|
研究论文 | 结合空间转录组学和单核RNA测序，揭示rAAV2和rAAV9在雄性及雌性小鼠肝脏中的特异性转导特征 | 首次结合空间转录组学与单核RNA测序，在细胞及空间层面分析rAAV2和rAAV9载体对小鼠肝脏的转导效应、性别差异及肝区区域化影响，并发现新的转导相关因子 | 仅进行了概念验证研究，样本量有限，且结果基于小鼠模型，需进一步验证在人类肝组织中的适用性 | 探索不同血清型rAAV载体在小鼠肝脏中的转导模式、性别差异及肝区区域化对转录组的影响 | 雄性及雌性小鼠经rAAV2-CMV-EGFP或rAAV9-CMV-EGFP处理后的肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 来自雄性及雌性小鼠（rAAV2和rAAV9处理组各若干只）的肝脏组织样本 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-06-06 |
GPR183 contributes to renal macrophage infiltration and fibrosis in kidney injury
2026-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00037.2026
PMID:41954905
|
研究论文 | 探讨GPR183在肾损伤中促进巨噬细胞浸润和纤维化的作用 | 首次揭示GPR183作为氧化固醇受体在肾损伤中调控巨噬细胞表型及纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅通过公开单细胞测序分析，缺乏临床干预验证 | 探究GPR183在肾损伤中的免疫调节作用及其对肾纤维化的影响 | 小鼠肾损伤模型（腺嘌呤饮食诱导慢性肾病及叶酸诱导肾病）及人类慢性肾病患者单细胞数据 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及公开人类单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2026-06-06 |
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Apr-30, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557
PMID:42069175
|
研究论文 | 该研究揭示了BTN3A3通过维持线粒体稳态促进肝细胞癌干性和耐药性的新机制 | 首次发现BTN3A3在肝癌干性中的非免疫学角色，阐明其通过与TOMM22相互作用维持线粒体稳态来驱动干性和耐药性，并发现泛BTN3单克隆抗体5E08有治疗潜力 | 未提及明确局限性 | 探究线粒体功能与肝癌干性之间的精确机制，寻找新的治疗靶点 | 肝细胞癌及其干性相关机制 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 体内原位异种移植模型和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2026-06-06 |
Targeting PTDSS1 to modulate GSH synthesis triggers mitophagy and induces ferroptosis in esophageal squamous cell carcinoma cells
2026-Apr-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08702-4
PMID:42026035
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现PTDSS1高表达的恶性上皮亚群与铁死亡和线粒体自噬抵抗相关，并阐明PTDSS1调控谷胱甘肽合成并协调线粒体自噬的机制 | 首次揭示PTDSS1通过TRIM21与SLC3A2相互作用调控GSH合成，进而触发PINK1/Parkin线粒体自噬途径并诱导铁死亡的新机制 | NA | 探究PTDSS1在食管鳞状细胞癌中的调控机制及其治疗潜力 | 食管鳞状细胞癌细胞 | NA | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2026-06-06 |
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL
2026-Apr-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04066-2
PMID:42026624
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研究论文 | 提出一种名为SEAGALL的深度学习方法，结合几何正则化自编码器和可解释图注意力网络，量化分子特征对细胞表型的影响，并解析单细胞染色质状态和基因表达 | 创新性地将几何正则化自编码器与可解释图注意力网络结合，实现从高维单细胞数据中提取稳定且特异性的分子特征，超越传统的差异标记基因方法 | 未明确说明 | 开发能解释单细胞染色质状态和基因表达的深度学习方法，揭示驱动细胞身份的分子特征 | 单细胞测序数据中的分子特征（如染色质状态和基因表达）及其与细胞表型的关系 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 图注意力网络, 自编码器 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-06-06 |
Single-cell analysis highlights the role of CD4+ IFN-I-related T cells in Behcet's uveitis during Interferonα-2a therapy
2026-Apr-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00810-7
PMID:42021381
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research paper | 通过单细胞分析揭示IFNα-2a治疗过程中CD4+ IFN-I相关T细胞在贝赫切特病葡萄膜炎中的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示CD4+ IFN-I相关T细胞在贝赫切特病活动期减少及IFNα-2a治疗后的恢复机制，并阐明其通过LLT1-CD161相互作用抑制NK细胞炎症表型 | 未在摘要中明确提及研究局限性 | 研究IFNα-2a通过免疫细胞调节对贝赫切特病葡萄膜炎的治疗机制 | 贝赫切特病活动性葡萄膜炎患者、经IFNα-2a治疗4个月的患者、活动期贝赫切特病患者及健康对照者的外周血单核细胞和CD4+ T细胞 | machine learning | 贝赫切特病 | 单细胞RNA测序、bulk mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含活动期贝赫切特病葡萄膜炎患者、治疗4个月后患者、活动期患者及健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2026-06-06 |
Intratumoral Lactobacillus johnsonii Enhances Sensitivity to PD-1 Blockade by Inducing CD8+ T-cell Expansion in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0346
PMID:41570324
|
研究论文 | 该研究发现瘤内约翰逊乳杆菌通过诱导CD8+ T细胞扩增增强PD-1阻断疗法的敏感性，从而抑制肝细胞癌复发 | 首次揭示瘤内约翰逊乳杆菌及其代谢物烟酸通过NF-κB/NR4A2轴促进IFNγ+PD-1+CD8+ T细胞扩增，增强免疫治疗效果并抑制肝癌复发的新机制 | 未提及具体研究限制 | 探究肝癌复发机制并识别潜在治疗靶点，特别是瘤内微生物群在免疫治疗中的作用 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的微生物群、CD8+ T细胞及约翰逊乳杆菌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、体外功能实验 | NA | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 早期复发与未复发肝细胞癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-06-06 |
Chitinase-like proteins de-N-glycosylating CD36 modify cholesterol metabolism in atherosclerotic macrophages
2026-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71388-x
PMID:41951645
|
研究论文 | 发现几丁质酶样蛋白通过去糖基化CD36调节动脉粥样硬化巨噬细胞中的胆固醇代谢 | 首次揭示CLPs（CHIL3和CHI3L2）通过其糖苷酶活性去糖基化CD36，促进脂质摄取和动脉粥样硬化进程，并发现中和抗体可治疗该疾病 | NA | 研究CLPs对巨噬细胞胆固醇代谢和动脉粥样硬化的免疫调节作用 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2026-06-06 |
Alzheimer's disease risk protein SorLA regulates ER homeostasis and lipid metabolism in human microglia, with conserved effects in neurons
2026-04-06, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-03002-9
PMID:41942750
|
研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病风险蛋白SorLA在人小胶质细胞中调节内质网稳态和脂质代谢的作用，并发现其对神经元有保守效应 | 首次揭示SorLA在内质网相关功能中的新角色，超出其已知的内吞运输功能，并发现该通路在小胶质细胞和神经元中保守 | 暂未提及 | 阐明SorLA在小胶质细胞和神经元中维持细胞稳态的功能机制及其与阿尔茨海默病的关联 | 人类脑组织、快速尸检的原代小质细胞、CRISPR工程化人iPSC来源的小胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、脂质组学、蛋白质组学、CRISPR基因编辑 | NA | 测序数据、脂质组数据、蛋白质组数据 | 人类脑组织、快速尸检样本、iPSC衍生细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-06-06 |
ENPP1-Regulated Extracellular Purine Metabolism Drives Pancreatitis-Mediated Pancreatic Cancer
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.032
PMID:41553309
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示了ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢在胰腺炎驱动的胰腺癌发展中的关键作用 | 首次发现ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢在胰腺炎-癌症转化中起关键作用，并证实ENPP1可作为免疫治疗靶点 | 未明确说明局限性 | 探讨胰腺炎在胰腺导管腺癌发生发展中的作用机制 | 人类胰腺样本（慢性胰腺炎及胰腺炎相关胰腺癌）、小鼠模型（Ptf1aCre/+; LSL-KrasG12D/+及ENPP1基因敲除小鼠） | 机器学习 | 胰腺癌 | 多组学分析、单细胞测序 | 小鼠模型 | 转录组、蛋白质组、代谢组、单细胞测序数据 | 人类胰腺样本（慢性胰腺炎及胰腺炎相关胰腺癌）及小鼠胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of platelet-adherent circulating tumor cells using a microcavity-gel manipulation platform
2026-Apr, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.12.007
PMID:41558870
|
研究论文 | 利用微腔-凝胶操控平台对血小板黏附的循环肿瘤细胞进行单细胞转录组分析 | 结合微腔阵列和凝胶基细胞操控技术，实现无标记的循环肿瘤细胞回收，并揭示血小板驱动的上皮-间质转化激活机制 | 未提及明确局限性 | 探索转移性胰腺癌中循环肿瘤细胞的分子特征及血小板在其生物学中的作用 | 转移性胰腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自转移性胰腺癌患者的循环肿瘤细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | 微腔阵列-凝胶操控平台 | 微腔阵列结合凝胶基细胞操控技术用于无标记细胞回收 |
| 420 | 2026-06-06 |
Decoding plant cell heterogeneity and dynamics across responses, development, to evolution with single-cell technologies
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102854
PMID:41570605
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研究论文 | 利用单细胞技术解码植物细胞在响应、发育和进化中的异质性与动态变化 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学及活体成像，揭示植物细胞身份动态变化的连续谱 | 跨物种比对中基因组重复导致的直系同源问题仍需更优的计算策略 | 阐明植物细胞身份的动态性、环境依赖性及连续光谱特征 | 植物组织（如维管组织、叶肉）中的单细胞及其发育轨迹 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间转录组学、活体成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、活体成像数据 | 未具体说明 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |