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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-11-10 |
An etiology-stratified single-cell atlas identifies FABP4 as a prognostic marker for MASLD-related HCC
2025-Nov-06, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.10.026
PMID:41205757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序构建了病因分层的肝细胞癌肿瘤微环境图谱,鉴定FABP4作为MASLD相关HCC的预后标志物 | 首次系统比较不同病因(HBV感染和MASLD)对HCC肿瘤微环境的影响,发现FABP4通过促进血管正常化增强CD8+ T细胞浸润的新机制 | 样本量相对有限(12例单细胞测序样本),需要更大规模研究验证 | 比较不同病因HCC的肿瘤微环境差异,鉴定病因特异性预后生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织,TCGA-LIHC数据库,免疫治疗HCC队列 | 单细胞基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学,体外和体内实验 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织切片图像 | 12例HCC患者的配对肿瘤和癌旁组织(单细胞测序),224例样本(免疫组化验证),TCGA-LIHC数据库和两个免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-11-10 |
Chronic Intermittent Cold Stress-induced lipophagy promotes foamy macrophage susceptibility to ferroptosis and exacerbates atherosclerosis
2025-Nov-06, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性间歇性冷应激通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡加剧动脉粥样硬化的分子机制 | 首次阐明冷应激通过糖皮质激素受体激活脂噬作用促进ALOX15介导的脂质过氧化,同时破坏P62-KEAP1相互作用抑制NRF2-GPX4通路,协同诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究冷应激是否通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡促进动脉粥样硬化进展 | 高脂饮食喂养的ApoE缺陷小鼠和体外培养的巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,电子显微镜,分子生物学技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织图像,分子相互作用数据 | ApoE缺陷小鼠模型及体外细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-11-10 |
Heterogeneous generation and expansion of epidermal-resident memory T cells in individuals allergic to nickel
2025-Nov-06, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf427
PMID:41206452
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研究论文 | 本研究探讨镍过敏个体反复接触镍后表皮驻留记忆T细胞的异质性生成和扩增机制 | 首次通过重复斑贴试验结合单细胞RNA测序揭示镍过敏个体表皮TRM细胞的克隆扩增和分化特征 | 样本量较小(12名参与者),且无法将特定T细胞亚型与临床反应严重程度相关联 | 研究反复镍暴露对镍过敏个体临床反应及表皮TRM细胞积累分化的影响 | 12名镍过敏参与者 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 12名镍过敏参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-11-10 |
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64750-y
PMID:41193429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术发现牛感染布氏锥虫时存在具有传播适应性的隐秘血液形式 | 在低寄生虫血症的牛感染中发现具有锥虫传播适应性的隐秘血液形式,挑战了基于啮齿动物模型的现有假设 | 研究主要基于实验室观察,需要进一步验证这些发现在自然传播环境中的重要性 | 研究布氏锥虫在自然宿主(牛)中的发育和传播机制 | 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的发育形式 | 寄生虫学 | 非洲动物锥虫病 | 单细胞RNA测序,显微镜观察 | NA | 转录组数据,显微镜图像 | 牛和鼠类感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-11-10 |
Research on the expression, prognostic value, and regulatory effects on immune microenvironment of NETO2 in oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15164-y
PMID:41193984
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研究论文 | 本研究探讨NETO2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 首次系统研究NETO2在OSCC中的表达特征,结合单细胞RNA测序分析其在免疫细胞中的表达模式,并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证部分有限,需要更多临床样本验证 | 阐明NETO2在口腔鳞状细胞癌中的生物学功能和临床意义 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析, 分子对接, 细胞功能实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-11-10 |
MaskGraphene: an advanced framework for interpretable joint representation for multi-slice, multi-condition spatial transcriptomics
2025-Nov-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03850-w
PMID:41194133
|
研究论文 | 提出MaskGraphene框架,通过图神经网络和自监督学习实现多切片空间转录组数据的可解释联合表征 | 结合掩码自监督学习、三元组损失和聚类级局部对齐,通过软链接和硬链接建立跨切片连接,生成具有高几何保真度的联合嵌入 | NA | 开发能够保持空间几何结构并校正批次效应的空间转录组数据整合方法 | 多切片、多条件的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-11-10 |
Ascorbic acid attenuates immunosenescence and cognitive decline via MYH9-Mediated CD8⁺ T cell differentiation
2025-Nov-05, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-025-00538-4
PMID:41194177
|
研究论文 | 本研究揭示抗坏血酸通过MYH9介导的CD8⁺ T细胞分化减轻免疫衰老并改善认知功能 | 首次发现抗坏血酸通过结合MYH9蛋白调节细胞骨架通路,特异性促进CD8⁺ T细胞分化,从而改善年龄相关的免疫衰老和认知衰退 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验验证;MYH9抑制实验使用blebbistatin可能存在脱靶效应 | 探究抗坏血酸在缓解免疫衰老和认知衰退中的作用机制 | 16月龄C57BL/6老年小鼠、造血干细胞、外周血单个核细胞、CD8⁺ T细胞 | 免疫学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外分化实验 | 动物模型 | 基因表达数据、细胞计数数据、行为学数据 | 老年C57BL/6小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-11-10 |
Prognostic evaluation and experimental validation of cuproptosis-related hub genes identified through weighted gene co-expression network analysis in uveal melanoma
2025-Nov-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03978-6
PMID:41194198
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别铜死亡相关基因,构建了能够准确预测葡萄膜黑色素瘤预后的CRG_score模型 | 首次在葡萄膜黑色素瘤中系统研究铜死亡相关基因,构建了具有高预测准确性的预后模型,并验证了铜死亡诱导剂对肿瘤细胞的抑制作用 | 研究样本量相对有限,需要更多临床样本验证模型的普适性 | 探索铜死亡相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后评估和治疗中的作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析,转录组相关性分析,差异分析,LASSO Cox回归,单细胞RNA测序,细胞实验 | CRG_score预后模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 221例葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-11-10 |
Integrating multi-omics and machine learning to decipher the role of GSTP1 in endocrine-disrupting chemical-induced prostate cancer pathogenesis
2025-Nov-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178335
PMID:41202964
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了GSTP1在内分泌干扰化学物诱导前列腺癌发病机制中的关键作用 | 首次系统整合多组学数据与机器学习框架识别EDC-PCa关联基因,并通过孟德尔随机化验证GSTP1的因果保护作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证;样本来源和数量有限 | 系统识别连接内分泌干扰化学物暴露与前列腺癌发病的关键基因 | 前列腺癌相关基因和内分泌干扰化学物相互作用 | 机器学习 | 前列腺癌 | 转录组分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 | 集成机器学习框架, glmBoost, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 四个转录组数据集(GSE32571, GSE71016, GSE46602, GSE200879) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-11-10 |
Oral Multi-Enzymatic Manganese-Carbon Dots Alleviate Sepsis-Associated Lung Injury via the Gut-Lung Axis
2025-Nov-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c10625
PMID:41128412
|
研究论文 | 本研究开发口服锰掺杂碳点通过调节肠道菌群稳态和靶向肠肺轴缓解脓毒症相关肺损伤 | 首次设计具有多酶模拟活性的锰掺杂碳点,通过肠肺轴机制调控巨噬细胞胞葬作用和抗炎极化 | 研究主要基于小鼠模型,人体应用效果尚需验证 | 探索通过肠肺轴干预脓毒症相关肺损伤的新策略 | 脓毒症相关肺损伤小鼠模型和巨噬细胞 | 生物医学工程 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学,粪便微生物移植 | NA | 基因组数据,代谢组数据,转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | NA |
| 191 | 2025-11-10 |
Lactylated histone H4K8 regulation of MFN2/Wnt signaling integrates glycolytic metabolism and Müller cell activation in the pathogenesis of glaucoma
2025-Nov-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107178
PMID:41197676
|
研究论文 | 本研究揭示组蛋白H4K8乳酸化通过调控MFN2/Wnt信号通路整合糖酵解代谢与Müller细胞活化在青光眼发病机制中的作用 | 首次发现乳酸化组蛋白H4K8通过表观遗传调控MFN2表达,将线粒体动力学与Wnt/β-catenin信号通路激活相耦合的新机制 | NA | 探索青光眼发病过程中代谢应激与表观遗传调控的分子机制 | 视网膜组织、Müller胶质细胞、视网膜神经节细胞、光感受器细胞 | 表观遗传学 | 青光眼 | CUT&Tag, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-11-10 |
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Nov-02, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124063
PMID:41187899
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 | 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序揭示免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本数量有限 | 阐明Ciao3基因在免疫激活和急性肺损伤中的作用机制 | Ciao3条件性敲除小鼠和携带CIAO3突变的纯合子患者 | 单细胞测序分析 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 条件性敲除小鼠和1名纯合子患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-11-10 |
Decoding melanoma's cellular mosaic to unlock immunotherapy potential
2025-Nov, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.01.009
PMID:40023663
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示皮肤黑色素瘤的细胞异质性及其对免疫治疗耐药机制的理解 | 将单细胞多组学技术应用于解析黑色素瘤的细胞异质性,类比庞贝城马赛克解读来阐释癌症研究的突破性视角 | NA | 探讨单细胞多组学技术对黑色素瘤生物学特性及免疫治疗耐药机制的研究进展 | 皮肤黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2025-11-10 |
S100A12 correlates with inflammatory and pain symptoms in patients with chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome
2025-Nov, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2025.105536
PMID:40914239
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研究论文 | 本研究探讨了警报素S100A12在慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征(CP/CPPS)中作为炎症和疼痛生物标志物的潜力 | 首次发现S100A12在CP/CPPS患者精浆和血清中显著升高,并证实其与炎症标志物和疼痛评分相关,诊断性能优于传统指标 | 回顾性病例对照研究设计,样本量相对较小(90例患者),需要更大规模前瞻性研究验证 | 寻找CP/CPPS的可靠生物标志物,理解炎症与神经性疼痛的机制联系 | 慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征患者 | 生物医学研究 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序,生物标志物分析,受试者工作特征分析 | 病例对照研究 | 生物样本数据,临床评分数据 | 90例CP/CPPS患者和90例年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-11-10 |
Transcriptomic profiling of mink spleen infected by Aleutian mink disease virus: Insight into immune response
2025-Nov, Research in veterinary science
IF:2.2Q1
DOI:10.1016/j.rvsc.2025.105842
PMID:41005216
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探究水貂感染阿留申水貂病毒后脾脏的免疫反应机制 | 首次系统揭示AMDV感染后水貂脾脏的转录组动态变化,识别出8个直接参与免疫反应的关键差异表达基因 | 研究仅关注脾脏组织,未涉及其他靶器官;采用传统RNA-seq而非单细胞测序技术 | 识别与宿主对阿留申病毒感染反应相关的基因和通路 | 阿留申病毒感染的黑色雄性水貂脾脏组织 | 转录组学 | 病毒性疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 12只AMDV阴性黑色雄性水貂(4组全同胞,每组3只) | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina TruSeq™ RNA kit, HiScanSQ | Illumina TruSeq™ RNA建库试剂盒,HiScanSQ测序仪,101 bp双端测序 |
| 196 | 2025-11-10 |
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013664
PMID:41183107
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研究论文 | 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架,用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 开发了基于异构图变换器的多组学整合方法,能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 | NA | 解析细胞分化过程中的基因调控机制 | 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 图变换器, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | 三个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-11-10 |
Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09644-1
PMID:41193844
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研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育的高分辨率转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 通过大规模单细胞测序数据重建了视觉皮层所有细胞类型的发育轨迹图,识别了细胞多样化的分子特征和基因调控网络 | 研究仅限于小鼠视觉皮层,未涉及其他脑区或物种 | 揭示哺乳动物皮层细胞类型多样化发育的分子机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,单核多组学测序 | 发育轨迹重建分析 | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单核多组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单核Multiome测序技术 |
| 198 | 2025-11-10 |
A comprehensive molecular atlas of the mesenchymal cell types in the mouse liver
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00580-9
PMID:40954217
|
研究论文 | 通过深度单细胞RNA测序构建了成年小鼠肝脏主要细胞类型的全面分子图谱 | 首次系统揭示肝脏内皮细胞和间充质细胞的多样性,发现门静脉区具有混合动静脉表型,识别出纤维化疾病中扩张的先前未知的被膜肝星状细胞群 | 研究仅限于小鼠模型,人类肝脏的适用性需要进一步验证 | 解析肝脏细胞分子结构,为肝病治疗提供理论基础 | 成年小鼠肝脏细胞 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-11-10 |
Cationic nanoparticle targets cGAS-STING axis to drive functional orofacial muscle regeneration
2025-Nov-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了阳离子纳米颗粒MSN-PEI用于清除细胞游离DNA,通过调控cGAS-STING轴促进口面部肌肉功能性再生 | 首次利用阳离子纳米颗粒靶向清除cfDNA调控肌肉再生微环境,揭示cfDNA通过TLR9和cGAS-STING信号通路影响巨噬细胞-肌肉卫星细胞交互作用的新机制 | 研究仅使用小鼠冷冻损伤模型,尚未在更大型动物或临床环境中验证 | 探究cfDNA清除如何促进口面部肌肉再生及影响微环境与肌肉卫星细胞的相互作用 | 小鼠口面部肌肉(咬肌)损伤模型 | 再生医学 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序,组织学分析,功能分析,分子分析,转录组分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据,功能测量数据 | 小鼠肌肉损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-11-10 |
Liver Macrophage Changes during Early Adaptation to Alcohol Exposure
2025-Oct-31, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.10.004
PMID:41177326
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和人类肝脏样本探讨酒精暴露早期对肝脏巨噬细胞(包括库普弗细胞和浸润巨噬细胞)表型变化的影响 | 首次系统比较酒精暴露早期库普弗细胞与浸润巨噬细胞的动态变化差异,并揭示库普弗细胞通过适应性变化维持肝脏稳态的新机制 | 研究主要关注早期酒精暴露效应,对长期酒精暴露的影响仍需进一步验证 | 探究酒精暴露早期对肝脏巨噬细胞亚群的影响及其在维持肝脏稳态中的作用 | 小鼠模型和人类肝脏组织样本 | 免疫学 | 酒精性肝病 | 流式细胞术、离体细胞培养、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织学数据 | 小鼠模型和人类尸检及移植肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |