单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28955 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-06-20 |
ECT2+ cell group acts as cancer stem cell in malignant pleomorphic adenoma
2025-Jun-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00974-x
PMID:40523903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了唾液腺多形性腺瘤癌(CXPA)的综合图谱，并鉴定出ECT2+细胞群作为CXPA中的癌症干细胞 | 首次在CXPA中鉴定出ECT2+细胞群作为癌症干细胞，并证实其与肿瘤侵袭性和预后的关联 | CXPA中癌症干细胞的研究仍处于初步阶段，需要进一步验证 | 探索CXPA的肿瘤异质性和癌症干细胞特征 | 唾液腺多形性腺瘤癌(CXPA)患者肿瘤组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | CXPA患者肿瘤组织样本和细胞系 |
| 182 | 2025-06-20 |
Single-cell transcriptomics analysis of the healing process of ligament rupture
2025-Jun-17, Bone & joint research
IF:4.7Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究韧带断裂修复过程中的细胞和遗传学特征 | 首次在韧带组织中明确识别出肌腱细胞和成纤维细胞，并发现人类前交叉韧带组织中的十种细胞群 | 样本量较小（仅6例），且仅针对前交叉韧带进行研究 | 探究韧带断裂修复和愈合过程中的细胞与遗传学机制 | 健康个体和韧带断裂患者的ACL组织 | 单细胞转录组学 | 韧带损伤 | scRNA-seq, 免疫组化 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6例（3例健康个体+3例患者）共83,195个细胞 |
| 183 | 2025-06-20 |
Single-cell dissection of prognostic architecture and immunotherap response in Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer
2025-Jun-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.99337
PMID:40525824
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示幽门螺杆菌感染相关胃癌的分子异质性及免疫治疗反应的关键细胞和分子通路 | 揭示了幽门螺杆菌感染相关胃癌中恶性上皮细胞、血管生成相关肿瘤相关巨噬细胞和炎症性癌症相关成纤维细胞的分子特征及其相互作用 | 样本量较小（仅24例），且未涉及其他类型胃癌的对比 | 解析幽门螺杆菌感染相关胃癌的分子特征及免疫治疗反应机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24例（9例当前感染患者，3例既往感染患者，6例未感染患者，6例健康对照） |
| 184 | 2025-06-20 |
Id2 levels determine the development of effector vs. exhausted tissue-resident memory CD8+ T cells during CNS chronic infection
2025-Jun-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115861
PMID:40531616
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research paper | 本研究探讨了转录调节因子Id2在慢性中枢神经系统感染期间对CD8+组织驻留记忆T细胞（Trms）效应与耗竭表型的影响 | 揭示了Id2水平在决定CD8+ Trms功能状态中的关键作用，并展示了Id2过表达如何抑制T细胞耗竭 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究慢性中枢神经系统感染期间CD8+ Trms异质性的分子机制 | 小鼠脑部CD8 T细胞 | 免疫学 | 慢性感染 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 185 | 2025-06-20 |
Multi-omics reveals the polyethylene terephthalate carcinogenicity: Cancer progression and immune microenvironment
2025-Jun-17, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118522
PMID:40532600
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研究论文 | 该研究通过多组学方法揭示了聚乙烯对苯二甲酸酯（PET）的致癌机制及其对癌症进展和免疫微环境的影响 | 整合网络毒理学、机器学习、分子对接模拟、单细胞RNA测序和空间转录组学等多种技术，首次系统性地研究了PET的致癌机制 | 研究主要基于计算模拟和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探究PET的致癌机制及其在肿瘤发生发展中的作用 | 聚乙烯对苯二甲酸酯（PET）及其与癌症相关的分子靶点 | 分子毒理学与癌症生物学 | 癌症 | 网络毒理学、机器学习、分子对接模拟、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法 | 多组学数据 | 涉及22个核心基因的泛癌表达谱分析 |
| 186 | 2025-06-20 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Jun-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
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研究论文 | 介绍了一种名为STAMP的新型单细胞转录组分析和多模态成像分析方法 | STAMP方法通过结合转录组学和蛋白质组学成像平台，消除了测序成本，支持多模态（RNA、蛋白质和H&E）分析，同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服单细胞RNA测序在可扩展性、高成本和细胞破坏方面的限制 | 外周血单个核细胞、细胞系和干细胞 | 单细胞组学 | NA | 转录组学和蛋白质组学成像 | NA | RNA、蛋白质和H&E图像数据 | 10,962,092个高质量细胞/核和6,030,429,954个转录本 |
| 187 | 2025-06-20 |
CRISPR for Cystic Fibrosis: advances and insights from a systematic review
2025-Jun-17, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021
PMID:40534129
|
systematic review | 本文系统回顾了基于CRISPR的基因编辑技术在囊性纤维化(CF)治疗中的应用和进展 | 通过跨研究比较分析了27篇研究文章，总结了针对CF致病变异的策略设计、靶细胞选择、编辑效率等技术细节，并强调了标准化报告编辑效率和功能恢复的重要性 | 需要进一步的单细胞RNA测序和体内研究以获得临床相关结论，某些CFTR基因区域的编辑仍存在技术困难 | 评估CRISPR基因编辑技术在囊性纤维化治疗中的应用效果和前景 | 囊性纤维化(CF)及其致病基因CFTR的突变 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR, 同源定向修复(HDR), 碱基编辑, 引物编辑 | NA | 研究文献数据 | 27篇研究文章 |
| 188 | 2025-06-20 |
Single-Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma In Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2025-Jun-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3023
PMID:40101158
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析导管原位癌（DCIS）的基因表达，揭示了其与浸润性乳腺癌（IBC）之间的复杂基因型-表型关系 | 首次在单细胞水平上分析了DCIS的基因表达和克隆异质性，并揭示了基底膜完整性丧失在癌症浸润过程中的关键作用 | 研究样本量有限，且主要关注雌激素受体状态的影响 | 探究DCIS向IBC转变的分子机制 | 导管原位癌（DCIS）病变组织和匹配的正常乳腺组织 | 癌症基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但包含DCIS病变和正常组织的临床标本 |
| 189 | 2025-06-20 |
A multi-type programmed cell death gene signature predicts survival and reveals therapeutic targets in osteosarcoma
2025-Jun-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02944-y
PMID:40522389
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research paper | 该研究通过整合多种程序性细胞死亡相关基因，构建了一个预测骨肉瘤生存和治疗靶点的基因特征模型 | 首次整合18种程序性细胞死亡相关基因构建骨肉瘤预后模型，并揭示了关键基因和通路 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发骨肉瘤预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 骨肉瘤患者及其相关基因表达数据 | digital pathology | osteosarcoma | 转录组数据分析，单细胞RNA-seq | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TARGET数据库的骨肉瘤患者数据 |
| 190 | 2025-06-20 |
Whole genome sequencing and single-cell transcriptomics identify KMT2D inactivation as a potential new driver for pituitary tumors: a case report
2025-Jun-16, BJC reports
DOI:10.1038/s44276-025-00155-0
PMID:40523964
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研究论文 | 通过全基因组测序和单细胞转录组学技术，发现KMT2D失活可能是垂体肿瘤的新驱动因素 | 首次发现组蛋白甲基转移酶KMT2D可能是垂体神经内分泌肿瘤（PitNETs）的新驱动基因，并揭示了该肿瘤与转移性癌症共享的驱动因素和表观遗传改变 | 仅基于一个病例报告，样本量较小，需要更大规模的研究验证 | 探索垂体神经内分泌肿瘤（PitNETs）的新驱动基因和分子特征 | 一名50多岁的混合型生长激素-泌乳素细胞瘤患者 | 基因组学 | 垂体肿瘤 | 全基因组测序（WGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全基因组DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、甲基化数据 | 1例患者（混合型生长激素-泌乳素细胞瘤） |
| 191 | 2025-06-20 |
Integrative analysis of bulk and single-cell gene expression profiles to identify bone marrow mesenchymal cell heterogeneity and prognostic significance in multiple myeloma
2025-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06637-6
PMID:40524208
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研究论文 | 通过整合大量和单细胞基因表达谱，识别骨髓间充质细胞的异质性及其在多发性骨髓瘤中的预后意义 | 发现了一种独特的HMGhMSC亚克隆，并构建了基于该亚群的预后模型 | NA | 研究多发性骨髓瘤中骨髓间充质干细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 健康供体和多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（10X）、批量转录组数据分析、Seurat、SCENIC、CellChat、COX和LASSO回归 | 预后模型 | 基因表达数据 | GSE4581和GSE136337数据集作为训练集和验证集 |
| 192 | 2025-06-20 |
Prognostic analysis of bladder cancer with neddylation-related genes
2025-Jun-16, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00463-y
PMID:40524221
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research paper | 本研究探讨了neddylation修饰在膀胱癌（BLCA）进展中的作用及其预后意义 | 通过WGCNA、LASSO和Cox回归分析，识别出6个与neddylation相关的关键基因（CUL1、PUM2、UBE2D3、HIF3A、COPS2和DDB1），并构建了具有良好诊断效率的预后模型 | 研究依赖于TCGA数据库的数据，未进行大规模独立队列验证 | 探索neddylation在膀胱癌进展中的作用及其预后意义 | 膀胱癌（BLCA）患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | WGCNA、LASSO回归、Cox回归分析、RT-qPCR、单细胞测序 | 预后模型 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的膀胱癌患者数据及临床样本 |
| 193 | 2025-06-20 |
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00672-1
PMID:40524231
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）中异质性免疫微环境的作用，并发现UQCRFS1基因促进肿瘤进展 | 揭示了TNBC中免疫微环境的异质性，鉴定了IL32high Treg对肿瘤逃逸的关键作用，并开发了基于五个关键基因的恶性细胞指数（MCI）模型 | 样本量较小（仅9名TNBC初治患者），需要在更大规模的队列中进行验证 | 解析TNBC中肿瘤免疫微环境的异质性及其与肿瘤进展的关系 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组、蛋白质组学、qRT-PCR、Western blotting | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 9名TNBC初治患者的单细胞RNA测序数据 |
| 194 | 2025-06-20 |
Pollutant Distribution in Vertebrates Across Scales: Organs, Cells, and Organelles
2025-Jun-16, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.126680
PMID:40532810
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综述 | 本文系统回顾了脊椎动物中环境污染物在器官、细胞和亚细胞水平的多尺度分布研究进展 | 强调了污染物生物转化带来的不确定性，并比较了纳米材料与传统污染物在分布特性上的差异 | 大多数研究集中在血液、肠道、肝脏和鳃/肺中污染物的细胞分布，亚细胞水平的研究较为有限 | 通过连接宏观积累与微观毒性机制，推进环境健康风险评估和靶向干预 | 脊椎动物中的环境污染物 | 环境健康 | NA | 单细胞测序等高分率技术 | NA | NA | NA |
| 195 | 2025-06-20 |
Spatial transcriptomics of Hirschsprung disease resection margins marks differential gene expression in myenteric plexus
2025-Jun-16, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.06.012
PMID:40532828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2025-06-20 |
Single-cell resolution uncovers neighboring cell subtypes that share steroidogenic capacity during fetal testis development
2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2501392122
PMID:40460128
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研究论文 | 利用单细胞技术揭示胎儿睾丸发育过程中类固醇生成能力的细胞亚型及其空间分布 | 通过单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序技术，首次揭示了胎儿Leydig细胞在类固醇生成中的异质性和空间分布变化 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他哺乳动物的验证 | 探究胎儿睾丸发育过程中单个和集体Leydig细胞对雄激素产生的贡献 | 小鼠胎儿睾丸中的Leydig细胞及其他间质细胞 | 发育生物学 | NA | sm-FISH, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 从小鼠胚胎期13天到围产期的睾丸样本 |
| 197 | 2025-06-20 |
Exploring the role of LFNG in hepatoblastoma using multiomics and raise a query in proof link
2025-Jun-09, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149604
PMID:40499700
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨LFNG在肝母细胞瘤中的作用，并验证其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次结合单细胞转录组数据揭示LFNG作为细胞间通讯靶点促进肝母细胞瘤发展的机制 | 研究仅基于两个数据集和HUH6细胞系，样本来源有限 | 鉴定肝母细胞瘤中异常表达的基因并探索影响肿瘤免疫微环境的细胞间通讯靶点 | 肝母细胞瘤组织及HUH6细胞系 | 肿瘤基因组学 | 肝母细胞瘤 | 多组学分析（包括GO/KEGG富集分析、PPI网络构建、单细胞转录组分析） | NA | 基因表达数据（来自GSE133039和GSE180664数据集） | 两个肝母细胞瘤数据集（具体样本量未明确说明）+ HUH6细胞系 |
| 198 | 2025-06-20 |
scMetaIntegrator: a meta-analysis approach to paired single-cell differential expression analysis
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657898
PMID:40501846
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研究论文 | 提出了一种新的元分析方法scMetaIntegrator，用于配对单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 该方法考虑了生物学重复和细胞变异性，解决了传统方法在配对scRNA-seq数据分析中的高假阳性率和假阴性率问题 | 未明确提及具体局限性 | 改进配对单细胞RNA测序数据的差异表达分析方法 | 配对单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 元分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 使用了真实和合成数据集（具体数量未提及） |
| 199 | 2025-06-20 |
Next generation genetic screens in kinetoplastids
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf515
PMID:40530689
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综述 | 本文综述了动质体寄生虫中的遗传筛选技术及其在编码和非编码基因组区域的应用 | 结合基于图像和单细胞测序技术的遗传筛选方法，为细胞功能和调控机制提供了前所未有的见解 | NA | 探讨遗传筛选技术在动质体寄生虫基因组研究中的应用及其潜力 | 动质体寄生虫的编码和非编码基因组区域 | 遗传学 | 寄生虫病 | CRISPR-Cas, 单细胞测序, 基于图像的筛选 | NA | 基因组数据, 图像数据 | NA |
| 200 | 2025-06-20 |
Prehabilitation during neoadjuvant chemotherapy results in an enhanced immune response in esophageal adenocarcinoma tumors: A randomized controlled trial
2025-Jun-03, Journal of sport and health science
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.jshs.2025.101063
PMID:40499717
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research paper | 该研究探讨了在新辅助化疗期间进行预康复运动训练对食管腺癌患者肿瘤免疫反应的影响 | 首次通过随机对照试验证明预康复运动训练能增强食管腺癌肿瘤中的免疫反应，特别是CD8+淋巴细胞和自然杀伤细胞的浸润 | 样本量较小（n=22），且未观察到临床结局（如生存率）的显著差异 | 评估预康复运动训练作为新辅助化疗期间免疫佐剂的潜在效果 | 局部晚期食管癌患者 | 肿瘤免疫学 | 食管腺癌 | 高分辨率多光谱免疫组化（mIHC）和NanoString空间转录组学 | NA | 组织样本和心肺功能数据 | 22名患者（预康复组11人，对照组11人） |