单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 19701 - 19720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19701 | 2024-08-08 |
An optimized protocol for the isolation of rare stromal cell populations from the mouse spleen
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101923
PMID:36595952
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的协议，用于从小鼠脾脏中分离和分析稀有的基质细胞群体，包括纤维母细胞网状细胞、血管周围细胞和胶质细胞 | 提出了一个优化的消化和富集步骤协议，适用于后续通过流式细胞术或单细胞RNA测序分析脾脏基质细胞 | NA | 开发和优化从小鼠脾脏中分离稀有基质细胞群体的方法 | 小鼠脾脏中的稀有基质细胞群体 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 19702 | 2024-08-08 |
Insights into osteoarthritis development from single-cell RNA sequencing of subchondral bone
2022-12, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2022-002617
PMID:36598005
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19703 | 2024-08-08 |
Macrophage GSK3β-deficiency inhibits the progression of hepatocellular carcinoma and enhances the sensitivity of anti-PD1 immunotherapy
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005655
PMID:36600662
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞中GSK3β缺乏对肝细胞癌进展的影响及其对PD-1免疫治疗的敏感性增强作用 | 首次揭示了巨噬细胞GSK3β缺乏通过抑制M2表型来抑制肝细胞癌的发展，并通过减少PD-L1泛素化来增强PD-1免疫治疗的敏感性 | NA | 研究GSK3β在肿瘤相关巨噬细胞中的生物学功能及其对肝细胞癌的影响 | GSK3β在肿瘤相关巨噬细胞中的作用及对肝细胞癌的影响 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 基因表达综合数据库(GEO)、免疫荧光、Western blot、共免疫沉淀、质谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠模型 |
| 19704 | 2024-08-08 |
scAVENGERS: a genotype-based deconvolution of individuals in multiplexed single-cell ATAC-seq data without reference genotypes
2022-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac095
PMID:36601579
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAVENGERS的新软件，用于基于基因型的单细胞ATAC-seq数据解卷积，无需参考基因型 | scAVENGERS通过调用更多个体特异性生殖系变异并使用优化的混合模型来解决scATAC-seq数据中每个变异较低的读取覆盖率问题 | NA | 开发一种新的软件工具，用于处理和分析单细胞ATAC-seq数据 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 混合模型 | 基因组数据 | 三个合成多重单细胞ATAC-seq数据集，包括外周血单个核细胞和前额叶皮质组织 |
| 19705 | 2024-08-08 |
scEMAIL: Universal and Source-free Annotation Method for scRNA-seq Data with Novel Cell-type Perception
2022-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.12.008
PMID:36608843
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研究论文 | 提出了一种名为scEMAIL的通用注释框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，能够在不访问源数据的情况下自动检测新型细胞类型 | 设计了一个新型细胞类型感知模块，通过专家集成系统、双峰性测试和自适应阈值来识别新型细胞类型，并使用局部亲和正则化来减轻批次效应 | 未提及具体限制 | 开发一种无需源数据即可自动注释和检测新型细胞类型的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 未提及具体样本量 |
| 19706 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Identifies Drug-Resistance Signature and Immunosuppressive Microenvironment in Metastatic Small Cell Lung Cancer (Advanced Genetics 2/03)
2022-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202270021
PMID:36618025
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了转移性小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | NA | 揭示小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19707 | 2024-08-08 |
Appropriate level of cuproptosis may be involved in alleviating pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1039510
PMID:36601107
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研究论文 | 本研究探讨了铜死亡与肺纤维化之间的关系，并发现适当的铜死亡水平可能有助于抑制肺纤维化 | 首次揭示铜死亡与纤维化之间的负相关关系 | NA | 探索铜死亡与肺纤维化之间的关系 | 人类和小鼠的肺纤维化单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的肺纤维化样本 |
| 19708 | 2024-08-08 |
Obeticholic acid and 5β-cholanic acid 3 exhibit anti-tumor effects on liver cancer through CXCL16/CXCR6 pathway
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1095915
PMID:36605219
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研究论文 | 本研究通过分析人肝细胞癌单细胞RNA测序数据，验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并探讨了obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用在此过程中的作用 | 首次在人体中验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并发现obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用具有显著的肿瘤抑制效果 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和动物模型，尚未在临床试验中得到验证 | 探讨CXCL16/CXCR6通路在肝细胞癌中的作用及潜在的免疫治疗策略 | 肝细胞癌及其相关细胞和分子机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 19709 | 2024-08-08 |
Necroptosis-related lncRNAs: Combination of bulk and single-cell sequencing reveals immune landscape alteration and a novel prognosis stratification approach in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1010976
PMID:36605426
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研究论文 | 本研究通过结合批量和单细胞测序技术，构建了一种基于坏死相关长非编码RNA风险评分（NecroLRS）和临床病理参数的预测模型，用于肺腺癌的预后分层和免疫微环境改变的研究 | 首次揭示了坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用，并提出了一种新的基于K-means聚类的分层算法，用于从单细胞角度解析坏死在肺腺癌预后中的机制 | NA | 探索坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用及其对免疫微环境的影响 | 肺腺癌患者的预后分层和免疫微环境改变 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 批量测序和单细胞测序 | K-means聚类 | RNA | 4个人类肺腺癌细胞系 |
| 19710 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals that SAA1+ epithelial cells promote distant metastasis of esophageal squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1099271
PMID:36605443
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）中SAA1+上皮细胞的新亚群，该亚群与ESCC的远处转移密切相关。 | 发现了ESCC中一种新的SAA1+恶性细胞亚群，该亚群具有高度侵袭性并关联ESCC的远处转移。 | NA | 探索ESCC肿瘤组织的异质性及寻找具有特殊生物学功能的ESCC新亚群。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的SAA1+上皮细胞。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | 预测模型 | 基因表达数据 | NA |
| 19711 | 2024-08-08 |
NR4A2 may be a potential diagnostic biomarker for myocardial infarction: A comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1061800
PMID:36618351
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了NR4A2作为心肌梗死潜在诊断生物标志物的可能性 | 首次通过免疫浸润分析和疾病本体富集分析，确定了NR4A2在心肌梗死诊断中的重要价值 | 仅使用了一个数据集进行模型准确性测试，可能需要更多数据集验证 | 旨在预测和验证心肌梗死诊断的关键基因 | 心肌梗死及其诊断生物标志物 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE66360数据集，包含335个差异表达基因 |
| 19712 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to dissect the immunological network of liver fibrosis in Schistosoma japonicum-infected mice
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.980872
PMID:36618421
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫机制 | 首次应用单细胞测序技术解析日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫网络 | 样本量较小，仅包括一只感染小鼠和一只正常小鼠 | 深入理解日本血吸虫感染导致的肝纤维化机制 | 日本血吸虫感染小鼠的肝纤维化过程 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1只感染小鼠和1只正常小鼠 |
| 19713 | 2024-08-08 |
Neurogenesis potential of oligodendrocyte precursor cells from oligospheres and injured spinal cord
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.1049562
PMID:36619671
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研究论文 | 本研究探讨了从寡球体和受损脊髓中提取的少突胶质前体细胞（OPCs）的神经发生潜力 | 首次发现OPCs参与寡球体的形成，并能进一步分化为类神经细胞，以及在寡球体分化过程中检测到少突胶质细胞和神经细胞的中间状态 | NA | 研究OPCs在受损髓鞘再生中的神经发生潜力及其机制 | 少突胶质前体细胞（OPCs）及其在脊髓损伤后的分化和神经发生潜力 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），生物信息学分析，免疫荧光染色，分子实验 | NA | RNA | 幼年和成年小鼠的脊髓损伤模型 |
| 19714 | 2024-08-05 |
The Utility of Spatial Transcriptomics for Solid Organ Transplantation
2023-07-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004466
PMID:36584371
|
综述 | 本文概述了空间转录组技术在器官移植中的应用和技术进步 | 强调了基于原位测序的空间转录组技术的最新进展及其在移植领域的应用 | 讨论了解释由该方法生成的大量数据时的重要注意事项和限制 | 探讨空间转录组在器官移植中的潜在作用 | 使用空间转录组技术的实验和分析流程 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因转录数据 | NA |
| 19715 | 2024-08-08 |
CD8+ T Cells Trigger Auricular Dermatitis and Blepharitis in Mice after Zika Virus Infection in the Absence of CD4+ T Cells
2023-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.11.020
PMID:36566875
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研究论文 | 本研究使用T细胞缺陷的小鼠模型，展示了在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后引发耳部皮炎和眼睑炎的作用 | 首次揭示了在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后引发病理反应的具体机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的病理作用 | 探讨在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的保护和病理作用 | CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的作用机制 | 免疫学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 19716 | 2024-08-08 |
Single-cell next-generation sequencing of circulating tumor cells in patients with neuroblastoma
2023-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15707
PMID:36571449
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研究论文 | 本研究通过单细胞下一代测序技术分析了神经母细胞瘤患者的循环肿瘤细胞（CTCs），以评估其在肿瘤生物学特征和转移机制中的应用 | 首次在单细胞水平上对神经母细胞瘤的CTCs进行下一代测序，揭示了CTCs中的基因表达模式和突变情况 | 样本量较小，仅包括10名初诊患者和4名复发患者 | 旨在通过单细胞测序技术揭示神经母细胞瘤的肿瘤生物学特征和转移机制 | 神经母细胞瘤患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞下一代测序 | NA | DNA和RNA | 10名初诊患者和4名复发患者的CTCs |
| 19717 | 2024-08-08 |
Inhibiting Cyclin B1-treated Pontine Infarction by Suppressing Proliferation of SPP1+ Microglia
2023-Apr, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-022-03183-w
PMID:36572839
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研究论文 | 本文通过建立大鼠急性脑桥梗死模型，利用单细胞RNA测序技术检测脑桥梗死后的细胞反应，并验证了一种针对微胶质细胞的治疗方法 | 首次发现并验证了SPP1+微胶质细胞在脑桥梗死中的作用，并使用Cucurbitacin E抑制其增殖以减轻神经功能缺损 | NA | 研究脑桥梗死的治疗方法 | 脑桥梗死及其相关微胶质细胞 | NA | 脑桥梗死 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 |
| 19718 | 2024-08-08 |
Molecular characterization of onychomatricoma: Spatial profiling reveals the role of onychofibroblasts in its pathogenesis
2023-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14736
PMID:36579368
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研究论文 | 本研究利用数字空间分析技术（DSP）和单细胞RNA测序，对指甲瘤（OM）的分子特征及其发病机制进行了深入研究 | 首次结合数字空间分析和单细胞RNA测序技术，揭示了指甲瘤中Wnt信号通路的激活及其在疾病发生中的关键作用 | 研究仅基于两个OM病例和正常对照指甲单位，样本量较小 | 探究指甲瘤的分子特征及其发病机制 | 指甲瘤（OM）及其正常对照指甲单位 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析（DSP）、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2例指甲瘤病例和正常对照指甲单位 |
| 19719 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial analyses reveal the association between gene expression of glutamine synthetase with the immunosuppressive phenotype of APOE+CTSZ+TAM in cancers
2023-04, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13373
PMID:36587392
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和单细胞通量估计分析，探讨了结直肠癌和肺癌缺氧肿瘤微环境中代谢与细胞功能之间的联系，特别是发现了一种具有免疫抑制特性的肿瘤相关巨噬细胞亚群APOE+CTSZ+TAM。 | 本研究首次揭示了APOE+CTSZ+TAM亚群在肿瘤样本中的高比例存在及其通过上调抗炎基因表达展现的免疫抑制特性，并发现了该亚群与调节性T细胞（Treg）之间的潜在相互作用。 | NA | 探讨肿瘤微环境中代谢与细胞功能之间的联系，特别是肿瘤相关巨噬细胞亚群的免疫抑制特性及其与调节性T细胞的相互作用。 | 结直肠癌和肺癌的肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞亚群APOE+CTSZ+TAM及其代谢特征。 | 数字病理学 | 结直肠癌，肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 结直肠癌和肺癌的肿瘤样本 |
| 19720 | 2024-08-08 |
Distinct fibroblast progenitor subpopulation expedites regenerative mucosal healing by immunomodulation
2023-03-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221350
PMID:36584405
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研究论文 | 本文识别了一种关键的成纤维细胞亚群——出生后配对相关同源盒-1+（Prx1+）细胞，这些细胞通过促进早期免疫反应加速黏膜愈合 | 首次发现Prx1+成纤维细胞在生理和损伤条件下表现出祖细胞特征，并能分化为具有免疫调节功能的SCA1+成纤维细胞，从而加速伤口愈合 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在人类中进一步验证 | 探究成纤维细胞亚群在黏膜愈合中的作用机制 | 成纤维细胞亚群Prx1+细胞及其在黏膜愈合中的作用 | NA | NA | 移植和遗传消融模型、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 小鼠模型 |