单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 19681 - 19700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19681 | 2024-08-05 |
Multiomics Integration at Single-Cell Resolution Using Bayesian Networks: A Case Study in Hepatocellular Carcinoma
2023-01, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1089/omi.2022.0170
PMID:36602810
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研究论文 | 本研究报告了在肝细胞癌病例中使用贝叶斯网络在单细胞分辨率下进行多组学数据整合 | 这是首次在单细胞分辨率下使用机器学习算法（贝叶斯网络）整合组学数据的研究 | 未在摘要中指出具体的限制 | 研究复杂疾病和综合生物学中的多组学数据整合 | 单细胞层次上的肝细胞癌多组学数据 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq和Reduced Representation Bisulfite Sequencing | 贝叶斯网络 | 基因组数据 | 涉及295个基因的模型 |
| 19682 | 2024-08-05 |
[Identification of novel regulators involved in AD pathogenesis using the CRISPR-Cas9 system]
2023, Nihon yakurigaku zasshi. Folia pharmacologica Japonica
DOI:10.1254/fpj.22081
PMID:36596482
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研究论文 | 本文通过CRISPR-Cas9系统识别了与阿尔茨海默病(Aβ)产生相关的新调节因子。 | 本研究首次识别了钙和整合素结合蛋白1（CIB1）作为Aβ产生的潜在负调节因子。 | 本研究主要集中在CIB1对Aβ产生的影响，未深入探讨其他可能的调节因子。 | 研究CIB1在阿尔茨海默病发病机制中的作用。 | 研究对象为与阿尔茨海默病相关的Aβ产生机制。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 人脑样本，早期阿尔茨海默病患者与健康对照组 |
| 19683 | 2024-08-05 |
Inhibition of miR338 rescues cleidocranial dysplasia in Runx2 mutant mice partially via the Hif1a-Vegfa axis
2023-01, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00914-w
PMID:36599929
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研究论文 | 这篇文章探讨了通过抑制miR338来拯救由于Runx2突变引起的颅骨发育不全。 | 这项研究首次揭示了miR338与Runx2之间的遗传相互作用，并提出miR338作为颅骨发育不全的潜在治疗靶点。 | 该研究的局限性在于主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性。 | 研究miR338在Runx2突变小鼠模型中对颅骨发育不全的潜在治疗效果。 | Runx2突变小鼠及其miR338的抑制。 | 数字病理学 | 颅骨发育不全 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | miR338;Runx2小鼠及其骨髓基质细胞 |
| 19684 | 2024-08-05 |
A beautiful, complex simplicity: the origins of nephron segmentation uncovered by single-cell sequencing of the pronephros
2023-01, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.09.013
PMID:36603975
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研究论文 | 本文探讨了通过单细胞测序揭示前肾分段的起源 | 使用单细胞测序展示了哺乳动物肾小管的非凡分段复杂性及其组织规划蓝图 | NA | 理解前肾的结构和功能，以洞察所有肾小管的基础蓝图 | 探讨前肾的结构与功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 19685 | 2024-08-08 |
Paeonol ameliorates endometrial hyperplasia in mice via inhibiting PI3K/AKT pathway-related ferroptosis
2023-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2022.154593
PMID:36610113
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研究论文 | 本研究探讨了芍药苷通过抑制PI3K/AKT信号通路相关铁死亡来减轻小鼠子宫内膜增生的分子机制 | 本研究首次揭示了芍药苷通过调节PI3K/AKT信号通路来抑制铁死亡，从而减轻子宫内膜增生的作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证其效果 | 探究芍药苷在保护子宫内膜增生中的分子机制 | 芍药苷对子宫内膜增生小鼠的影响及其分子机制 | NA | 妇科疾病 | CCK-8检测、H&E染色、网络药理学研究、单细胞转录组分析、MDA反应、IHC检测、Western blot、免疫荧光、RT-qPCR | NA | 细胞、组织 | 3名健康供体和3名子宫内膜增生患者的子宫组织 |
| 19686 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of the Prognostic Panel in Clear Cell Renal Cell Carcinoma Based on Resting Mast Cells for Prediction of Distant Metastasis and Immunotherapy Response
2023-01-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12010180
PMID:36611973
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研究论文 | 本研究旨在通过分析ccRCC中的静息肥大细胞（RMCs），构建一个预测远处转移和免疫治疗反应的预后标志物 | 本研究首次基于RMCs构建了一个三基因预后标志物，能够有效预测ccRCC患者的远处转移和免疫治疗反应 | NA | 识别影响ccRCC患者远处转移和预后的关键肿瘤浸润免疫细胞，并构建相关预后标志物以预测免疫治疗反应 | ccRCC患者的远处转移和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 19687 | 2024-08-08 |
The Enrichment of Specific Hair Follicle-Associated Cell Populations in Plucked Hairs Offers an Opportunity to Study Gene Expression Underlying Hair Traits
2022-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24010561
PMID:36614000
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研究论文 | 本研究通过比较马的拔毛和皮肤活检样本的RNA-seq结果，探讨了不同样本收集方法对特定细胞群基因表达的影响 | 首次比较了非侵入性的拔毛和侵入性的皮肤活检样本收集方法在细胞类型富集方面的差异 | NA | 探讨不同样本收集方法对特定细胞群基因表达的影响 | 马的拔毛和皮肤活检样本 | 基因表达研究 | NA | RNA-seq | NA | RNA | NA |
| 19688 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils the Dedifferentiation Mechanism of Lung Adenocarcinoma Stem Cells
2022-Dec-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24010482
PMID:36613925
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了肺腺癌干细胞的去分化机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术探索肺腺癌干细胞的转录组特征，并识别出与去分化相关的关键转录因子和特定标记物 | 研究仅基于PC-9细胞系，可能需要进一步在更多样品中验证结果 | 揭示肺腺癌干细胞的特性及其分子机制，为开发新的治疗策略提供见解 | 肺腺癌干细胞（LCSCs）及其去分化机制 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 7320个肺腺癌干细胞 |
| 19689 | 2024-08-08 |
Deciphering Tumour Microenvironment of Liver Cancer through Deconvolution of Bulk RNA-Seq Data with Single-Cell Atlas
2022-Dec-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15010153
PMID:36612149
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研究论文 | 本研究通过使用单细胞RNA测序图谱对批量RNA测序数据进行反卷积，解析了肝癌的肿瘤微环境 | 利用反卷积算法处理批量RNA测序数据，减少了对单细胞RNA测序数据集的需求，从而降低了成本 | NA | 旨在理解肝癌的肿瘤微环境，为精准治疗提供依据 | 肝癌的肿瘤微环境及其细胞组成 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Cibersortx | RNA测序数据 | 使用了八个RNA测序和一个微阵列数据集 |
| 19690 | 2024-08-08 |
SPOC domain-containing protein 1 regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cells through adenylate kinase 4
2022-Dec-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v14.i12.822
PMID:36619695
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research paper | 研究SPOC域包含蛋白1（SPOCD1）在人类精原干细胞（SSCs）增殖和凋亡中的作用及机制 | 首次揭示了SPOCD1通过调控腺苷酸激酶4（AK4）影响人类精原干细胞的增殖和凋亡 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探讨SPOCD1在人类精原干细胞增殖中的作用及其机制 | 人类精原干细胞（SSCs） | NA | male infertility | single-cell RNA sequencing (RNA-seq) | NA | RNA-seq data | 涉及非阻塞性无精症（NOA）患者的样本 |
| 19691 | 2024-08-08 |
Human Placental Endothelial Cell and Trophoblast Heterogeneity and Differentiation Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2022-12-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12010087
PMID:36611882
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了人类胎盘中内皮细胞和滋养层细胞的异质性和分化 | 本研究首次提供了妊娠6至16周人类胎盘的高分辨率分子图谱，揭示了胎盘细胞的复杂性及其在早期妊娠中的转录网络和信号传导 | NA | 深入理解胎盘行为并改善妊娠结局 | 人类胎盘中的内皮细胞和滋养层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自11名正常妊娠患者的胎盘绒毛组织 |
| 19692 | 2024-08-08 |
Transcriptomic Profiles of Normal Pituitary Cells and Pituitary Neuroendocrine Tumor Cells
2022-Dec-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15010110
PMID:36612109
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了正常垂体细胞和垂体神经内分泌肿瘤细胞的转录组特征 | 本文揭示了正常垂体发育过程中的转录因子表达模式，并比较了垂体神经内分泌肿瘤与正常垂体在转录因子表达上的异同 | NA | 旨在理解垂体神经内分泌肿瘤的综合多组学特征，以开发基于分子特征的治疗方法 | 正常垂体细胞和垂体神经内分泌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19693 | 2024-08-08 |
Breast cancer combined prognostic model based on lactate metabolism genes
2022-Dec-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000032485
PMID:36595824
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研究论文 | 研究乳酸代谢基因、乳酸代谢相关基因（LMRG）和免疫浸润细胞对乳腺癌预后的影响 | 提出了一个结合乳酸代谢相关基因和免疫浸润细胞的乳腺癌预后模型，该模型在多个验证队列中显示出0.7至0.8的曲线下面积，优于单一模型 | NA | 评估乳酸代谢相关基因和免疫浸润细胞在乳腺癌预后中的作用 | 乳酸代谢基因、乳酸代谢相关基因（LMRG）和免疫浸润细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、CIBERSORT方法 | cox回归、最小绝对选择算子 | 基因数据 | 使用GSE20685数据集作为外部验证队列 |
| 19694 | 2024-08-08 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation
2022-Dec-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000032558
PMID:36595859
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研究论文 | 本文构建了一个基于铁死亡相关长非编码RNA（lncRNAs）的膀胱癌（BC）预后风险模型，以指导临床预后并识别潜在的治疗靶点。 | 首次构建了基于铁死亡相关lncRNAs的膀胱癌预后风险模型，并通过单细胞转录组测序进行验证。 | 研究样本量较小，仅涉及4名患者，可能影响模型的泛化能力。 | 构建一个基于铁死亡相关lncRNAs的膀胱癌预后风险模型，以指导临床预后和识别潜在治疗靶点。 | 膀胱癌患者的预后风险评估及潜在治疗靶点的识别。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq | Cox回归和最小绝对收缩与选择算子回归分析 | 转录组数据 | 4名接受根治性膀胱切除术的膀胱癌患者样本 |
| 19695 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Interactions between Endometrial Stromal Cells, Epithelial Cells, and Lymphocytes during Mouse Embryo Implantation
2022-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24010213
PMID:36613656
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠胚胎植入过程中子宫内膜间质细胞、上皮细胞和淋巴细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞转录组学分析了小鼠胚胎植入阶段子宫内膜间质细胞的亚型及其在胚胎植入中的作用 | NA | 探究小鼠胚胎植入过程中子宫内膜间质细胞在调节接受性子宫内膜微环境中的作用 | 小鼠子宫内膜间质细胞、上皮细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 怀孕4.5天和5.5天的小鼠子宫植入和非植入部位的样本 |
| 19696 | 2024-08-08 |
Simulation-based inference of differentiation trajectories from RNA velocity fields
2022-12-19, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100359
PMID:36590685
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Cytopath的方法，利用单细胞RNA速度信息进行轨迹推断 | Cytopath通过定义马尔可夫链模型，模拟可能的分化轨迹并构建共识轨迹，能够重现研究中分化过程的拓扑和分子特征 | 文章未明确提及局限性 | 开发一种新的方法来推断细胞分化轨迹 | 单细胞RNA测序实验中的分化轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 马尔可夫链模型 | RNA速度数据 | 包括不同拓扑结构的分化轨迹，涉及单次快照和时间序列的单细胞RNA测序实验 |
| 19697 | 2024-08-08 |
In vitro-derived medium spiny neurons recapitulate human striatal development and complexity at single-cell resolution
2022-12-19, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100367
PMID:36590694
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研究论文 | 本文开发了一种协议，通过调节细胞接种密度和特定形态发生素的暴露，从人类多能干细胞（PSCs）中生成真实且功能性的D1和D2型纹状体中型棘神经元（MSNs），并在25天内实现高度可重复的神经分化。 | 该研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）展示了生成的细胞在细胞类型组成、基因表达和信号通路方面能够模拟自然发育过程中的细胞命运获取步骤，并通过调节中基质蛋白途径提高了MSNs的产量。 | NA | 旨在理解影响纹状体的疾病并为不同神经系统疾病提供细胞替代疗法。 | 人类纹状体中型棘神经元（MSNs）。 | 干细胞工程 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19698 | 2024-08-08 |
Processing and cryopreservation of human ureter tissues for single-cell and spatial transcriptomics assays
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101854
PMID:36595885
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研究论文 | 本文描述了一种优化的协议，用于从术后分离的输尿管组织中生成、冷冻保存和解冻单细胞悬液，以及用于10x Genomics Visium空间基因表达平台的冷冻保存人输尿管组织的优化协议 | 提供了用于单细胞RNA测序和空间转录组学的输尿管组织处理和冷冻保存的优化协议 | NA | 研究人输尿管组织的细胞异质性，使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术 | 人输尿管组织的细胞类型、信号网络和潜在的细胞间交叉对话 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19699 | 2024-08-08 |
Generation of iPSC-based human-mouse microglial brain chimeras to study senescence of human microglia
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101847
PMID:36595906
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研究论文 | 本文提供了一个逐步协议，用于生成基于人诱导多能干细胞（hiPSC）的微胶质鼠脑嵌合体，并详细说明了病理性tau的脑内注射和从嵌合鼠脑中磁性细胞分离人微胶质细胞以进行单细胞RNA测序的步骤 | 本文提供了一种新的方法，通过生成hiPSC-based微胶质鼠脑嵌合体，来研究人微胶质细胞的衰老过程，这在体内研究中提供了前所未有的机会 | NA | 研究人微胶质细胞的衰老过程 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）和微胶质鼠脑嵌合体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19700 | 2024-08-08 |
An optimized protocol to identify keratinocyte subpopulations in vitro by single-cell RNA sequencing analysis
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101906
PMID:36595953
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研究论文 | 本文描述了一种从新生儿包皮来源的正常人表皮角质形成细胞原代培养物中分离单细胞的优化方案，并使用单细胞RNA测序分析角质形成细胞亚群 | 该研究优化了细胞培养条件，以诱导角质形成细胞分化标记的表达，并使用了Fluidigm C1系统和Takara SMART-Seq v4 Ultra及Illumina Nextera XT试剂盒进行cDNA文库制备和RNA测序 | NA | 开发一种优化的单细胞RNA测序分析方法，用于识别体外培养的角质形成细胞亚群 | 正常人表皮角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生儿包皮来源的正常人表皮角质形成细胞 |