单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 19661 - 19680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19661 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomics Reveal the Importance of Distinct Epithelial Cell Populations in Ileal-specific, Treatment-naïve, and Treated Crohn's Disease Patients
2023-02-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izac264
PMID:36610699
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19662 | 2024-08-08 |
Efficient generation of lower induced motor neurons by coupling Ngn2 expression with developmental cues
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111896
PMID:36596304
|
研究论文 | 本研究通过结合转录因子Neurogenin2（Ngn2）的过表达与小分子模式化，将人类多能干细胞（hPSCs）分化为下位诱导运动神经元（liMoNes/liMNs） | 本研究创新性地结合了Ngn2的过表达与小分子模式化，实现了高效率和高重复性的下位诱导运动神经元生成 | NA | 推动对运动神经元生物学及其在疾病中功能障碍的认知 | 人类多能干细胞分化为下位诱导运动神经元 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 50个人类多能干细胞系 |
| 19663 | 2024-08-08 |
Diverse effector and regulatory functions of fibro/adipogenic progenitors during skeletal muscle fibrosis in muscular dystrophy
2023-Jan-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105775
PMID:36594034
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Duchenne肌营养不良症中骨骼肌纤维化的细胞机制，特别是纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）在其中的作用 | 首次揭示了FAPs在骨骼肌纤维化中的双重作用，既是细胞外基质（ECM）的主要来源，也是ECM调控基因的主要表达细胞 | 研究仅限于Duchenne肌营养不良症的疾病小鼠模型，未涉及其他模型或人类样本 | 探讨Duchenne肌营养不良症中骨骼肌纤维化的细胞机制 | 纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）及其在骨骼肌纤维化中的作用 | NA | 肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠膈肌和股四头肌的单细胞样本 |
| 19664 | 2024-08-05 |
Systematic benchmarking of statistical methods to assess differential expression of circular RNAs
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac612
PMID:36592056
|
研究论文 | 本文比较了38种用于评估环状RNA差异表达的统计方法。 | 首次系统性评估适用于环状RNA表达数据的不同差异表达方法的性能。 | 研究集中于特定的统计方法，未涵盖所有可能的方法或数据类型。 | 评估不同统计方法在环状RNA差异表达分析中的有效性。 | 环状RNA的表达数据，特别是RNA-seq数据。 | 生物统计学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的数据集数量和类型的具体信息未说明 |
| 19665 | 2024-08-08 |
scGMAAE: Gaussian mixture adversarial autoencoders for diversification analysis of scRNA-seq data
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac585
PMID:36592058
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scGMAAE的深度生成模型，用于单细胞RNA测序数据的多样化分析 | scGMAAE模型假设不同类型的细胞的低维嵌入遵循不同的正态分布，结合贝叶斯变分推断和对抗训练，提供了复杂数据的解释性潜在表示，并发现不同类型细胞的统计分布 | NA | 开发一种新的深度生成模型，以提高单细胞RNA测序数据分析的灵活性、可控性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | 大量单细胞RNA测序数据 |
| 19666 | 2024-08-08 |
CD8+ T cell-intrinsic IL-6 signaling promotes resistance to anti-PD-L1 immunotherapy
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100878
PMID:36599350
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研究论文 | 本文探讨了白细胞介素6（IL-6）在抗PD-L1免疫治疗中的作用，发现IL-6与atezolizumab治疗反应不佳相关，并提出联合阻断PD-L1和IL-6受体（IL6R）可增强抗肿瘤效果 | 首次揭示了IL-6在CD8+ T细胞中的内在信号传导对抗PD-L1免疫治疗抵抗性的影响，并提出联合治疗策略 | NA | 探讨IL-6在抗PD-L1免疫治疗中的作用及改善治疗效果的策略 | 晚期肾癌、乳腺癌和膀胱癌患者以及肿瘤模型中的CD8+ T细胞 | NA | 肾癌、乳腺癌、膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床试验涉及大量晚期肾癌、乳腺癌和膀胱癌患者，以及肿瘤模型中的小鼠 |
| 19667 | 2024-08-08 |
SPOCK1 and POSTN are valuable prognostic biomarkers and correlate with tumor immune infiltrates in colorectal cancer
2023-Jan-07, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-022-02621-2
PMID:36611136
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研究论文 | 本研究旨在基于基质和免疫评分筛选结直肠癌（CRC）中的有价值预后生物标志物，并探讨其与肿瘤免疫浸润的关系。 | 本研究首次发现SPOCK1和POSTN作为结直肠癌的关键预后基因，并揭示了它们与肿瘤浸润免疫细胞的关联。 | 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集，未来需通过更多临床样本验证这些生物标志物的预后价值。 | 筛选结直肠癌中的有价值预后生物标志物，并探讨其与肿瘤免疫浸润的关系。 | 结直肠癌（CRC）中的免疫细胞和基质细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | ESTIMATE算法, WGCNA, 单因素COX回归分析, scRNA-seq, TIMER, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA数据库中的CRC样本，具体数量未在摘要中明确。 |
| 19668 | 2024-08-05 |
A comprehensive single-cell map of T cell exhaustion-associated immune environments in human breast cancer
2023-01-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35238-w
PMID:36609566
|
research paper | 本研究系统地研究了人类乳腺癌中疲惫T细胞相关的免疫环境 | 通过单细胞转录组学和成像质谱细胞术的结合，揭示了乳腺癌中有无疲惫T细胞存在的免疫环境之间的基本差异 | 研究主要集中于乳腺癌的腔型亚型，可能不适用于所有乳腺癌类型 | 深入了解乳腺癌中疲惫T细胞的免疫环境 | 人类乳腺肿瘤样本中疲惫和非疲惫T细胞的免疫环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学，成像质谱细胞术 | NA | 样本 | 研究中涉及了在人类乳腺癌中多种免疫环境的单细胞样本 |
| 19669 | 2024-08-08 |
Enhanced angiogenic properties of umbilical cord blood primed by OP9 stromal cells ameliorates neurological deficits in cerebral infarction mouse model
2023-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-27424-7
PMID:36609640
|
研究论文 | 研究探讨了OP9基质细胞预处理的脐带血在脑梗死小鼠模型中的血管生成特性及其对神经功能缺陷的影响 | 开发了一种快速且可行的方法，通过使用OP9增强脐带血的M2型、组织保护和促血管生成特性 | NA | 研究OP9预处理的脐带血在脑梗死模型中的血管生成特性和对神经功能缺陷的影响 | 脐带血与OP9基质细胞的共培养及其在脑梗死小鼠模型中的应用 | NA | 脑梗死 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 19670 | 2024-08-05 |
Macrophage response mediated by extracellular matrix: recent progress
2023-01-05, Biomedical materials (Bristol, England)
DOI:10.1088/1748-605X/aca946
PMID:36595269
|
研究论文 | 本文探讨了ECM支架介导的巨噬细胞反应在组织再生中的作用 | 使用单细胞测序技术识别参与宿主对生物材料反应的不同巨噬细胞表型 | 传统的M1/M2命名法存在局限，尚未形成统一的标准 | 研究ECM支架如何与巨噬细胞相互作用以影响组织再生 | 探讨影响组织再生的高度异质性和可塑性巨噬细胞亚群 | 再生医学 | 组织缺损 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 19671 | 2024-08-05 |
Transcription factors: key regulatory targets of vascular smooth muscle cell in atherosclerosis
2023-01-05, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00586-2
PMID:36604627
|
综述 | 这篇文章重点讨论了转录因子在动脉粥样硬化中作为血管平滑肌细胞的关键调控靶点的作用 | 首次系统性地评估了转录因子如何通过多种保守的顺式调控元件和转录因子之间的复杂相互作用调节VSMC基因 | 对VSMCs的理解仍在不断发展，可能需要更多实验数据支持 | 探讨转录因子在血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的调控作用 | 血管平滑肌细胞及其与转录因子的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 体内单细胞测序技术与CreERT2-loxP系统 | NA | NA | NA |
| 19672 | 2024-08-08 |
Single-cell-led drug repurposing for Alzheimer's disease
2023-01-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-27420-x
PMID:36604493
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞的系统生物学流程，用于识别阿尔茨海默病的药物再利用候选物 | 利用单细胞RNA测序数据、全基因组关联研究结果和多种基因注释资源，构建了多细胞的阿尔茨海默病分子网络，以获得细胞特异性的疾病病理生理学见解 | NA | 旨在通过单细胞技术识别阿尔茨海默病的潜在药物再利用候选物 | 阿尔茨海默病患者的脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 分子网络 | 基因组数据 | NA |
| 19673 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of glial diversity in the human hippocampus across the postnatal lifespan
2023-Jan-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.12.007
PMID:36608676
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19674 | 2024-08-05 |
A universal sequencing read interpreter
2023-Jan-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add2793
PMID:36598975
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为INTERSTELLAR的工具，可以解码各种DNA测序读数并转换为其他结构的测序读数 | 提出了一个通用的框架，用于解读测序读数并提取其编码信息 | 未提及具体的局限性 | 开发一个可解释多种结构测序读数的工具 | 短读和长读的测序结果 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 测序读数 | 涉及多种短读和长读测序读取 |
| 19675 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling of the zebrafish inner ear reveals molecularly distinct hair cell and supporting cell subtypes
2023-01-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.82978
PMID:36598134
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对斑马鱼内耳从胚胎到成年的各个阶段进行了研究，揭示了不同类型的毛细胞和支持细胞的分子特征 | 首次在斑马鱼内耳中发现与哺乳动物耳蜗中条纹状和非条纹状毛细胞基因表达相似的两种毛细胞亚型，并验证了斑马鱼作为研究内耳特异性毛细胞功能和再生的相关模型 | NA | 探索斑马鱼内耳毛细胞和支持细胞的分子特征，以及它们与哺乳动物内耳细胞类型的相似性 | 斑马鱼内耳的毛细胞和支持细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从胚胎到成年的斑马鱼内耳样本 |
| 19676 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals diversity within mammalian spinal motor neurons
2023-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35574-x
PMID:36596814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了哺乳动物脊髓运动神经元的多样性 | 揭示了肢体神经元的多样神经肽代码，并发现了轴向运动神经元的三种分子独立亚型 | 研究主要集中在小鼠模型，可能在其他物种中存在差异 | 探讨脊髓运动神经元中的异质性 | 小鼠的脊髓运动神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19677 | 2024-08-05 |
Longitudinal liver sampling in patients with chronic hepatitis B starting antiviral therapy reveals hepatotoxic CD8+ T cells
2023-01-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI158903
PMID:36594467
|
研究论文 | 本研究揭示了在慢性乙型肝炎患者中，抗病毒治疗初期存在的肝脏毒性CD8+ T细胞 | 首次定义了人类肝脏中一种独特的、聚集性的CD8+ T细胞群体，并阐明了其在慢性乙型肝炎病理生成中的作用 | 该研究未能确定这种CD8+ T细胞群体在更广泛人群中的普遍性 | 探讨慢性乙型肝炎中免疫细胞的激活机制及其对肝损伤的影响 | 活跃肝损伤的慢性乙型肝炎患者 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 接受抗病毒治疗的慢性乙型肝炎患者（具体样本大小未说明） |
| 19678 | 2024-08-05 |
Molecular characterization of cell types in the squid Loligo vulgaris
2023-01-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80670
PMID:36594460
|
研究论文 | 本文结合单细胞转录组学和原位基因表达分析揭示了欧洲乌贼的细胞类型多样性 | 文章通过单细胞转录组学方法对乌贼细胞类型进行分子特征解析，首次揭示了乌贼特有的细胞类型 | 尽管有进展，但文章仍未揭示乌贼所有细胞类型的分子特征 | 探究头足类动物的细胞类型及其在神经系统中的作用 | 研究对象为欧洲乌贼的各种细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19679 | 2024-08-05 |
Topographically Distinguished Microbiome Taxonomy and Stress-Response Genes of Royal Belum Rainforest and Raja Muda Musa Peat Swamp Revealed through Metagenomic Inquisition
2023-Jan-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24010872
PMID:36614337
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析研究了皇家贝鲁姆热带雨林和拉贾穆达穆萨泥炭沼泽的微生物多样性和应激反应基因 | 该研究采用全基因组测序（WGS）方法探讨了不同土壤微生物群落的分类多样性与功能基因特征的关系 | 研究仅分析了来自两个地理位置的土壤样本，样本数较少，可能影响结论的普遍性 | 研究土壤系统中微生物群落的结构与功能潜力如何受到环境变化的影响 | 研究对象为来自两个不同原始森林的三种热带雨林土壤样本和三种泥炭沼泽土壤样本 | 数字病理学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 土壤样本 | 6个土壤样本（3个热带雨林土样和3个泥炭沼泽土样） |
| 19680 | 2024-08-08 |
Characterizing the tumor microenvironment at the single-cell level reveals a novel immune evasion mechanism in osteosarcoma
2023-Jan-03, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00237-6
PMID:36596773
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了骨肉瘤中免疫微环境的特征及其免疫逃逸机制 | 发现了调节性树突状细胞通过招募调节性T细胞形成免疫抑制微环境，以及CD24作为新的“不要吃我”信号参与骨肉瘤细胞的免疫逃逸 | NA | 揭示骨肉瘤中免疫微环境的特征及其免疫逃逸机制 | 骨肉瘤中的免疫细胞及其动态 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |