单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 19741 - 19760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19741 | 2024-08-08 |
A novel molecular classification method for osteosarcoma based on tumor cell differentiation trajectories
2023-Jan-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00233-w
PMID:36588108
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，提出了一种新的骨肉瘤分子分类方法，通过分析肿瘤细胞的分化轨迹，将骨肉瘤样本分为三个亚型 | 首次使用单细胞RNA测序技术进行骨肉瘤的分子亚分类，并发现了三种分化轨迹，为精准治疗提供了新的参考 | 研究样本数量有限，需要进一步扩大样本量以验证分类模型的准确性和普适性 | 开发一种新的骨肉瘤分子分类方法，以提高治疗选择和癌症患者的反应率 | 骨肉瘤样本及其肿瘤细胞的分化轨迹 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 分析了六个传统骨肉瘤和九个松质骨样本，并通过IHC染色验证了138个骨肉瘤样本 |
| 19742 | 2024-08-05 |
T cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in lung adenocarcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2023-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106460
PMID:36565482
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞标记基因的表达特征，并基于这些基因构建了肺腺癌的预后风险模型 | 提出了基于T细胞标记基因的新的预后风险模型，能够提出LUAD患者的生存和治疗结果的预测 | 尚未提及模型的外部验证及在更大样本群体中的适用性 | 探索肺腺癌中T细胞标记基因的表达特征及其与免疫治疗反应的关系 | 涉及非小细胞肺癌患者的肺腺癌组织活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | 细胞数据 | 包含6个组织活检样本，32,108个细胞 |
| 19743 | 2024-08-05 |
Analysis of Spatial Molecular Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2914-7_20
PMID:36587134
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研究论文 | 本文探讨了支持肿瘤异质性和空间分子数据分析的方法 | 提出了一种深度学习管道，能够从整个病理图像中生成有限的空间转录组学数据，及一个用于量化空间肿瘤异质性的算法 | 样本大小和数据集的多样性未在摘要中明确说明 | 旨在分析癌症诊断和治疗中的空间肿瘤异质性 | 重点研究从H&E全切片图像中提取的分子特征和转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 图像 | NA |
| 19744 | 2024-08-08 |
Intratumor microbiome features reveal antitumor potentials of intrahepatic cholangiocarcinoma
2023 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2022.2156255
PMID:36563106
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研究论文 | 本研究旨在分析肝内胆管癌（ICC）组织中的细菌群落特征，并探索其抗肿瘤潜力 | 通过16S rRNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了肿瘤内微生物群的多样性和其在肿瘤微环境中的分布 | 研究样本量有限，且未详细说明所鉴定细菌的具体种类及其在抗肿瘤机制中的确切作用 | 研究肝内胆管癌组织中的微生物组特征及其抗肿瘤潜力 | 肝内胆管癌组织及其微生物群 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 微生物DNA, 组织样本 | 99个组织样本 |
| 19745 | 2024-08-08 |
Altered phenotypic and metabolic characteristics of FOXP3+CD3+CD56+ natural killer T (NKT)-like cells in human malignant pleural effusion
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2160558
PMID:36567801
|
研究论文 | 研究了人类恶性胸腔积液中FOXP3+CD3+CD56+自然杀伤T（NKT）样细胞的表型和代谢特征变化 | 首次揭示了FOXP3 NKT样细胞在人类恶性胸腔积液中的表型和代谢特征变化 | NA | 探讨恶性胸腔积液中NKT样细胞的表型和代谢特征变化 | FOXP3+CD3+CD56+自然杀伤T（NKT）样细胞 | 免疫学 | 恶性胸腔积液 | 流式细胞术，免疫荧光染色，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | NA |
| 19746 | 2024-08-08 |
BCG-activation of leukocytes is sufficient for the generation of donor-independent innate anti-tumor NK and γδ T-cells that can be further expanded in vitro
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2160094
PMID:36567803
|
研究论文 | 本文研究了BCG激活白细胞产生非供体依赖性的天然抗肿瘤NK和γδ T细胞，并能在体外进一步扩增 | 首次展示了BCG激活的γδ T细胞具有高IFNγ分泌特征和抗肿瘤功能，且能在体外扩增 | BCG单独不能刺激纯化的γδ T细胞的扩增 | 探讨BCG激活白细胞产生抗肿瘤细胞的机制及其在免疫治疗中的应用 | BCG激活的NK细胞和γδ T细胞 | 免疫学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, 流式细胞术, 功能性检测 | NA | 细胞 | 人类外周血单个核细胞 |
| 19747 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals resident progenitor and vascularization-associated cell subpopulations in rat annulus fibrosus
2023-Jan, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2022.11.004
PMID:36568849
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了大鼠纤维环中存在的干细胞前体和血管化相关细胞亚群 | 发现了两个新的功能性纤维环细胞亚群，具有干细胞特性和血管化诱导潜力 | NA | 鉴定纤维环中的功能性细胞亚群，包括干细胞前体和血管化相关细胞 | 大鼠和人类的纤维环细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠和人类的纤维环样本 |
| 19748 | 2024-08-08 |
SOX4 is a novel phenotypic regulator of endothelial cells in atherosclerosis revealed by single-cell analysis
2023-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2022.02.017
PMID:36585108
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了动脉粥样硬化中的内皮细胞转录组，揭示了SOX4作为内皮细胞功能障碍的新型表型调节因子 | 发现SOX4是内皮细胞在动脉粥样硬化中的新型表型调节因子，并揭示了高血脂相关细胞因子和振荡血流作为SOX4的内源性诱导因素 | NA | 探究动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组特征，识别内皮细胞功能障碍的新型调节因子，并提供动脉粥样硬化进展的机制性见解 | 动脉粥样硬化中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用西方饮食喂养的载脂蛋白E缺陷（ApoE-/-）小鼠的主动脉细胞，以及人冠状动脉和肾动脉的动脉粥样硬化组织 |
| 19749 | 2024-08-08 |
Multiplex immunofluorescence and single-cell transcriptomic profiling reveal the spatial cell interaction networks in the non-small cell lung cancer microenvironment
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1155
PMID:36588094
|
研究论文 | 本文通过多重免疫荧光技术和单细胞转录组测序，揭示了非小细胞肺癌微环境中细胞间的空间相互作用网络 | 首次利用多重免疫荧光技术同时检测多个标记物，并结合单细胞RNA测序技术，分析了肿瘤微环境中细胞的空间位置和相互作用 | 研究样本仅限于553例非小细胞肺癌病例，可能无法完全代表所有非小细胞肺癌患者的情况 | 研究非小细胞肺癌微环境中细胞的空间相互作用网络 | 非小细胞肺癌肿瘤切片中的细胞标记物和细胞间的空间关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫荧光技术，单细胞RNA测序 | StarDist深度学习模型 | 图像，转录组数据 | 553例非小细胞肺癌肿瘤切片，4例非小细胞肺癌单细胞RNA测序样本 |
| 19750 | 2024-08-08 |
Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols
2022-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09014-5
PMID:36581800
|
研究论文 | 本文评估了四种基于板的全长转录单细胞mRNA测序协议的性能 | 首次对四种不同板基单细胞RNA测序协议进行性能评估，特别是针对高基因检测灵敏度、样本间重复性和最小操作时间 | 仅评估了四种特定的板基单细胞RNA测序协议，未涉及其他类型的测序技术 | 评估不同单细胞mRNA测序协议在临床应用中的性能 | 四种基于板的单细胞RNA测序协议 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 19751 | 2024-08-08 |
Lack of evidence for increased transcriptional noise in aged tissues
2022-12-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80380
PMID:36576247
|
研究论文 | 本文通过开发新的计算工具和分析方法，研究了衰老组织中转录噪音的变化，并发现转录噪音的增加并非衰老的普遍特征 | 开发了新的计算工具和方法来量化衰老相关的转录噪音，并分析了细胞类型特异性的转录噪音变化 | 研究仅限于分析已有的单细胞RNA测序数据集，可能未能涵盖所有类型的组织和细胞 | 探究衰老组织中转录噪音的变化是否为衰老的基本特征 | 衰老组织中的转录噪音变化及细胞类型特异性的转录噪音变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 七个衰老数据集 |
| 19752 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing revealed the liver heterogeneity between egg-laying duck and ceased-laying duck
2022-Dec-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09089-0
PMID:36577943
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了产蛋期和停蛋期鸭肝脏细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了产蛋期和停蛋期鸭肝脏细胞的异质性，并发现了与产蛋和停蛋相关的特定基因表达模式 | NA | 探究产蛋期和停蛋期鸭肝脏的分子机制 | 产蛋期和停蛋期鸭的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20,000个单细胞 |
| 19753 | 2024-08-08 |
Dissecting the fate of Foxl2-expressing cells in fetal ovary using lineage tracing and single-cell transcriptomics
2022-Dec-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00492-1
PMID:36575161
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学分析了胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞的命运 | 首次揭示了Foxl2表达细胞在XX性腺中具有多能性，并且theca-interstitial细胞来源于不同的前体细胞 | NA | 研究胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞在性分化后的命运 | 胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19754 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies murine heart molecular features at embryonic and neonatal stages
2022-12-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35691-7
PMID:36575170
|
research paper | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了小鼠心脏在胚胎早期到新生儿晚期的转录特征 | 首次全面捕捉了小鼠心脏发育过程中各阶段的转录组变化，填补了以往研究的空白 | NA | 研究小鼠心脏在胚胎和新生儿阶段的分子特征 | 小鼠心脏的转录组特征 | digital pathology | NA | single-cell sequencing | NA | transcriptomic data | 涉及小鼠心脏从早期胚胎到晚期新生儿的多个阶段 |
| 19755 | 2024-08-08 |
Non-negative low-rank representation based on dictionary learning for single-cell RNA-sequencing data analysis
2022-Dec-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09027-0
PMID:36564711
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研究论文 | 本文提出了一种基于字典学习的非负低秩表示方法（DLNLRR），用于单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别 | DLNLRR方法能够在优化过程中更新字典，实现字典学习和低秩表示学习的同时进行，并且不依赖于谱聚类算法，可以直接基于低秩矩阵进行聚类 | NA | 有效且准确地从大量细胞混合物中识别细胞集群 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示 | 数据矩阵 | 大量真实单细胞数据集 |
| 19756 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and key signaling pathways associated with vascular remodeling and calcification in young and old primate aortas based on single-cell analysis
2022-12-23, Aging
DOI:10.18632/aging.204442
PMID:36566020
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析年轻和老年猴主动脉中血管内皮细胞和平滑肌细胞的异质性，并识别与血管重塑和钙化相关的关键信号通路 | 识别了与血管重塑和钙化相关的新型内皮细胞亚群，并分析了随年龄变化的细胞通讯及相关的信号通路 | NA | 旨在理解血管壁细胞异质性及细胞亚群间通讯变化在衰老过程中的作用，以预防与年龄相关的心血管疾病 | 年轻和老年猴的主动脉 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 年轻和老年猴的主动脉样本 |
| 19757 | 2024-08-08 |
Distance covariance entropy reveals primed states and bifurcation dynamics in single-cell RNA-Seq data
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105709
PMID:36578319
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DICE的计算方法，用于分析单细胞RNA-Seq数据中的表达协变熵模式，以揭示细胞命运转变中的启动状态和分支动态 | DICE方法能够仅使用单细胞RNA-Seq数据预测多能启动状态及其调控因子，并在后续验证中使用单细胞表观基因组数据 | NA | 研究细胞命运转变过程，特别是启动状态和分支动态 | 单细胞RNA-Seq数据中的细胞命运转变 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-Seq数据 | NA |
| 19758 | 2024-08-08 |
Downregulation of the Protein C Signaling System Is Associated with COVID-19 Hypercoagulability-A Single-Cell Transcriptomics Analysis
2022-12-09, Viruses
DOI:10.3390/v14122753
PMID:36560757
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了COVID-19患者肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮中蛋白C信号系统的表达变化，发现蛋白C及其下游信号级联成分在COVID-19患者中下调，可能与COVID-19的高凝状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析了COVID-19患者中蛋白C信号系统的表达变化，揭示了蛋白C在COVID-19高凝状态中的潜在机制作用。 | 研究样本仅来自COVID-19 Cell Atlas数据库，可能存在样本选择偏倚；未详细说明数据分析的具体方法和统计学意义。 | 探索COVID-19相关凝血病中蛋白C信号网络的潜在表达变化。 | COVID-19患者的肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 19759 | 2024-08-08 |
Isolation of Nuclei from Flash-frozen Liver Tissue for Single-cell Multiomics
2022-12-09, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64792
PMID:36571404
|
研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻保存的肝脏组织中分离细胞核的稳健且可重复的协议 | 该方法能够产生高质量的细胞核，适用于下游单细胞组学方法，如单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq）以及多模态组学（联合RNA-seq和ATAC-seq） | NA | 研究肝脏在健康和疾病状态下的单细胞分辨率特征 | 从健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物冷冻肝脏样本中分离的细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq） | NA | 细胞核 | 涉及健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物的冷冻肝脏样本 |
| 19760 | 2024-08-08 |
Improved Macrophage Enrichment from Mouse Skeletal Muscle
2022-Dec-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4561
PMID:36561115
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研究论文 | 本文详细描述了一种从年轻和老年小鼠骨骼肌中分离CD45/CD11b巨噬细胞富集细胞的优化方法 | 提出了一种新的方法来高效分离骨骼肌中的巨噬细胞，具有足够的纯度和产量，适用于各种下游分析 | NA | 研究骨骼肌中巨噬细胞的功能及其在骨骼肌老化中的作用 | 小鼠骨骼肌中的巨噬细胞 | NA | NA | 流式细胞术分析，荧光激活细胞分选(FACS)，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的骨骼肌巨噬细胞 |