单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
19641	2024-08-08	Single-cell transcriptome analysis reveals functional changes in tumour-infiltrating B lymphocytes after chemotherapy in oesophageal squamous cell carcinoma 2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.1181 PMID:36650114	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）的功能变化。	首次详细描述了化疗前后TIL-Bs的功能异质性，并发现化疗后TIL-Bs的某些功能如共刺激和CD40信号传导得到增强。	研究样本量有限，且仅限于食管鳞状细胞癌，可能限制了结果的普遍性。	旨在研究食管鳞状细胞癌中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞的功能异质性。	食管鳞状细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其在化疗前后的功能变化。	数字病理学	食管癌	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	共分析了23个样本，涉及81,246个细胞。
19642	2024-08-08	Integrative multi-omic analysis of radiation-induced skin injury reveals the alteration of fatty acid metabolism in early response of ionizing radiation 2022-Dec, Journal of dermatological science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.01.001 PMID:36639278	研究论文	本研究通过综合多组学分析，探讨了电离辐射诱导的皮肤损伤早期反应中的分子事件及其机制	首次揭示了电离辐射早期反应中皮肤脂肪酸代谢的改变，并详细研究了ACADVL在脂肪酸代谢中的重要作用	NA	研究电离辐射对皮肤组织的早期分子反应及其机制	小鼠、大鼠的皮肤组织以及人类角质形成细胞和皮肤成纤维细胞	代谢组学	辐射损伤	液相色谱-质谱联用(LC-MS)、mRNA测序(mRNA-Seq)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	代谢物、基因表达数据	涉及小鼠、大鼠、猴子以及人类样本
19643	2024-08-08	Single-cell transcriptomics and network pharmacology reveal therapeutic targets of Jianpi Yiqi Bugan Yishen decoction in immune cell subsets of children with myasthenia gravis 2022-Dec, Translational pediatrics IF:1.5Q2 DOI:10.21037/tp-22-593 PMID:36643680	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和网络药理学方法，揭示了健脾益气补肝益肾汤在治疗儿童重症肌无力中的作用机制及其活性成分和潜在治疗靶点	本研究首次结合单细胞转录组学和网络药理学方法，探讨了健脾益气补肝益肾汤在儿童重症肌无力治疗中的作用机制和潜在靶点	NA	探索健脾益气补肝益肾汤治疗儿童重症肌无力的作用机制，并评估其活性成分和潜在治疗靶点	儿童重症肌无力的免疫细胞亚群及健脾益气补肝益肾汤的作用机制	数字病理学	神经肌肉疾病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	20只Lewis大鼠
19644	2024-08-08	Correlation between oncogene integrator complex subunit 7 and a poor prognosis in lung adenocarcinoma 2022-Dec, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3 DOI:10.21037/jtd-22-1533 PMID:36647477	research paper	研究整合子复合体亚单位7（INTS7）在肺腺癌（LUAD）中的临床意义及其对细胞行为的影响	首次探讨了INTS7在肺腺癌中的表达与患者预后的关系，并验证了INTS7作为治疗靶点和预后标志物的潜力	研究主要基于公开数据集和细胞实验，未来需要更多临床样本验证	探讨INTS7在肺腺癌中的临床意义及其对细胞行为的影响	肺腺癌组织、细胞系及患者预后	digital pathology	lung cancer	单细胞测序	NA	RNA	包括33种癌症类型的数据集及肺腺癌细胞系
19645	2024-08-08	Tumor-infiltrating lymphocyte: features and prognosis of lymphocytes infiltration on colorectal cancer 2022-06, Bioengineered IF:4.2Q2 DOI:10.1080/21655979.2022.2162660 PMID:36633318	研究论文	本研究旨在探讨结直肠癌中肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的特征及其对预后的影响	首次综合多个队列数据库，详细描述了TILs在结直肠癌中的特征、比例及预后价值	NA	研究TILs在结直肠癌中的特征及其对预后的影响	结直肠癌中的肿瘤浸润淋巴细胞	数字病理学	结直肠癌	scRNA-seq	NA	基因表达数据	涉及四个基因表达综合系列（GSE）的结直肠癌队列
19646	2024-08-08	Single-cell transcriptome reveals diversity of Müller cells with different metabolic-mitochondrial signatures in normal and degenerated macula 2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2022.1079498 PMID:36620436	研究论文	本研究通过整合早期年龄相关性黄斑变性（AMD）患者和健康捐赠者的单细胞转录组数据，揭示了具有不同代谢-线粒体特征的穆勒细胞亚群	本研究首次展示了早期AMD中穆勒细胞亚群的变化主要是亚群丰度的改变，而非新亚群的产生，并通过转录因子富集分析强调了代谢-线粒体状态的关键调节因子	NA	揭示早期年龄相关性黄斑变性中穆勒细胞的新特征及其与视网膜神经胶质化的关联	穆勒细胞在正常和退化黄斑中的多样性及其代谢-线粒体特征	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	单细胞转录组	NA	转录组数据	早期AMD患者和健康捐赠者的样本
19647	2024-08-08	Single-cell RNA-Seq identifies factors necessary for the regenerative phenotype of prostate luminal epithelial progenitors 2022, American journal of clinical and experimental urology IF:1.5Q3 PMID:36636696	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，确认了激素完整和去势小鼠前列腺中管腔前体细胞群的身份，并识别了维持前列腺器官样再生表型所需的因素。	首次使用单细胞RNA测序技术确认前列腺管腔前体细胞群的身份，并识别了维持其再生表型所需的关键因素。	研究主要集中在小鼠和人类的前列腺器官样上，未来需进一步验证这些因素在体内环境中的作用。	定义正常的前列腺前体细胞表型，并发现可能导致可药物化靶点的因果网络，以对抗前列腺增生疾病。	前列腺管腔上皮前体细胞及其再生表型。	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	包括激素完整和去势的小鼠前列腺及人类前列腺器官样。
19648	2024-08-05	Shared developmental pathways of the placenta and fetal heart 2023-09-26, Placenta IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.placenta.2022.12.006 PMID:36604258	综述	本文回顾了先天性心脏缺陷与胎盘功能障碍之间的临床、结构和分子关系	探讨了胎盘在先天性心脏缺陷发病机制中的特定病因角色	小鼠和大鼠模型在评估心脏与胎盘关系方面存在显著限制	研究先天性心脏缺陷与胎盘功能障碍的关系	先天性心脏缺陷（CHD）和胎盘发育	数字病理学	先天性心脏缺陷	单细胞测序	小鼠和大鼠模型	临床和分子数据	NA
19649	2024-08-08	Selective Clearance of Senescent Chondrocytes in Osteoarthritis by Targeting Excitatory Amino Acid Transporter Protein 1 to Induce Ferroptosis 2023-08, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1 DOI:10.1089/ars.2022.0141 PMID:36601724	研究论文	本研究旨在探索衰老软骨细胞对铁死亡（一种铁依赖性的非凋亡细胞死亡形式）的抵抗机制。通过代谢组学和单细胞RNA测序，发现铁死亡代谢的过度激活是衰老软骨细胞的显著代谢特征之一。衰老软骨细胞通过过度表达膜蛋白EAAT1来提高细胞内谷氨酸水平并激活谷胱甘肽系统，从而抵抗铁死亡。使用EAAT1的特异性抑制剂UCPH-101和siRNA-EAAT1可以显著增加衰老软骨细胞对铁死亡的敏感性，并诱导细胞死亡，而对正常细胞无明显影响。通过关节内注射UCPH-101，可以选择性地抑制EAAT1，清除软骨中的衰老软骨细胞，改善软骨稳态，并显著延缓骨关节炎的进展。	本研究揭示了衰老软骨细胞通过过度表达EAAT1来抵抗铁死亡的机制，并发现EAAT1是骨关节炎抗衰老治疗的有效且特异性靶点。	NA	探索衰老软骨细胞对铁死亡的抵抗机制，并寻找骨关节炎的潜在治疗靶点。	衰老软骨细胞及其在骨关节炎中的作用。	NA	骨关节炎	代谢组学，单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
19650	2024-08-05	Loss of CDKN2A Cooperates with WWTR1(TAZ)-CAMTA1 Gene Fusion to Promote Tumor Progression in Epithelioid Hemangioendothelioma 2023-07-05, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2497 PMID:36598859	研究论文	本研究评估了CDKN2A缺失在上皮样血管内皮瘤肿瘤发生中的影响	首次生成了上皮样血管内皮瘤的细胞系，并展示其对TC癌蛋白的依赖性	仅在小鼠模型中进行研究，可能不完全代表人类疾病	探讨CDKN2A缺失如何促进上皮样血管内皮瘤的肿瘤发生	上皮样血管内皮瘤及其相关细胞系	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	肿瘤细胞系	使用小鼠模型建立的上皮样血管内皮瘤肿瘤细胞系
19651	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing reveals changes in glioma-associated macrophage polarization and cellular states of malignant gliomas with high AQP4 expression 2023-05, Cancer gene therapy IF:4.8Q1 DOI:10.1038/s41417-022-00582-y PMID:36599974	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了高表达AQP4的恶性胶质瘤样本中的细胞状态和胶质瘤相关巨噬细胞极化情况	首次揭示了AQP4高表达与恶性胶质瘤中免疫相关基因的过度表达以及肿瘤相关巨噬细胞向M2型极化的关联	NA	探讨AQP4表达水平与恶性胶质瘤细胞状态及肿瘤微环境之间的关系	恶性胶质瘤样本中的细胞状态和胶质瘤相关巨噬细胞极化	数字病理学	脑瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	53059个细胞来自13个恶性胶质瘤样本
19652	2024-08-05	USP48 Stabilizes Gasdermin E to Promote Pyroptosis in Cancer 2023-04-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1812 PMID:36607699	研究论文	该研究揭示了USP48通过稳定gasdermin E（GSDME）促进癌症中的细胞焦亡	文章首次确定了USP48作为细胞焦亡的调节因子，并探索了其机制	未对USP48在其他类型癌症中的作用进行广泛验证	揭示在癌症中调节细胞焦亡的机制和途径	主要关注USP48及其与gasdermin E的相互作用	数字病理	癌症	CRISPR-Cas9筛选和单细胞测序	小鼠模型	临床组织样本和细胞数据	NA
19653	2024-08-08	Integrative Single-Cell Analysis Reveals Transcriptional and Epigenetic Regulatory Features of Clear Cell Renal Cell Carcinoma 2023-03-02, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2224 PMID:36607615	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）分析了19例透明细胞肾细胞癌（ccRCC）样本，揭示了ccRCC的转录和表观遗传调控特征	本研究首次综合分析了ccRCC的单细胞转录组和染色质可及性图谱，并鉴定了两种长链非编码RNA（RP11-661C8.2和CTB-164N12.1），这些RNA促进了ccRCC的侵袭和迁移	NA	深入理解透明细胞肾细胞癌的功能状态和调控动态	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的转录和表观遗传调控特征	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）	NA	基因表达数据，染色质可及性数据	19例透明细胞肾细胞癌样本
19654	2024-08-05	Comparing RNA-sequencing datasets from astrocytes, oligodendrocytes, and microglia in multiple sclerosis identifies novel dysregulated genes relevant to inflammation and myelination 2023-03, WIREs mechanisms of disease IF:4.6Q2 DOI:10.1002/wsbm.1594 PMID:36600404	研究论文	本研究整合了多项RNA测序研究，以识别和回顾与多发性硬化症中神经系统胶质细胞相关的差异调控基因及通路的新的模式	本研究通过整合多个RNA测序数据集，识别与炎症和髓鞘形成相关的新型失调基因	缺乏对个别研究结果之间的报道和对比	该研究旨在调查多发性硬化症中神经系统特定胶质细胞中的基因表达变化	研究对象包括来自动物模型及初级患者组织的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞	分子生物学	多发性硬化症	RNA测序	NA	转录组数据	NA
19655	2024-08-05	COVID-19 and non-alcoholic fatty liver disease: Biological insights from multi-omics data 2023-03, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1 DOI:10.1111/liv.15509 PMID:36593576	研究论文	通过整合多组学数据，我们探讨了COVID-19与非酒精性脂肪肝病（NAFLD）之间的共同病理生理机制	本研究通过功能富集分析揭示了COVID-19与NAFLD之间共享的生物疾病机制，特别关注性别特异性的途径	该研究可能未涵盖所有潜在的遗传和代谢因素，导致生物机制的理解不够全面	研究COVID-19与非酒精性脂肪肝病的共同病理机制及其在性别方面的差异	重点研究COVID-19感染和NAFLD在生物学过程中的共同遗传风险因素	数字病理学	非酒精性脂肪肝病	多组学数据整合	单细胞转录组学	基因组学和代谢组学数据	健康和COVID-19组织标本中的肝细胞和Kupffer细胞
19656	2024-08-08	Cell diversity and immune infiltration in the parathyroid tumour microenvironment 2023-03-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2 DOI:10.1530/ERC-22-0325 PMID:36602147	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了甲状旁腺腺瘤组织中的细胞多样性和免疫浸润情况	首次详细描述了甲状旁腺腺瘤中的八种主要细胞类型及其亚群，并揭示了肿瘤内分泌细胞的静息状态、免疫抑制微环境以及炎症相关的肿瘤相关成纤维细胞	NA	探究甲状旁腺肿瘤微环境中的细胞多样性和免疫浸润特征	甲状旁腺腺瘤组织中的细胞和免疫细胞	数字病理学	甲状旁腺疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	27,251个细胞来自4个甲状旁腺腺瘤组织样本
19657	2024-08-05	Single-cell transcriptomics dissects epithelial heterogeneity in HPV+ cervical adenocarcinoma 2023-02, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.28480 PMID:36609919	研究论文	本文通过单细胞转录组测序揭示了HPV阳性宫颈腺癌中上皮细胞的异质性	首次系统分析了HPV阳性宫颈腺癌中上皮细胞的内部和肿瘤间异质性	研究仅涉及3个患者的样本，可能限制了结果的推广性	探究HPV阳性宫颈腺癌中上皮细胞的异质性，以推动个体化治疗	HPV阳性宫颈腺癌患者的上皮细胞	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	19,229个上皮细胞，来自3名患者的3个肿瘤样本
19658	2024-08-05	The functional implication of ATF6α in castration-resistant prostate cancer cells 2023-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202201347R PMID:36607288	研究论文	本文报告了ATF6α与去势耐药性前列腺癌细胞存活的关系	发现ATF6α在去势耐药性前列腺癌中的重要功能及其与癌症进展的相关性	ATF6α抑制剂的特异性和有效性仍需进一步改进和评估	研究ATF6α在去势耐药性前列腺癌中的功能及其潜在的治疗靶点	去势耐药性前列腺癌细胞及其相关的分子通路	数字病理学	前列腺癌	RNA-seq	NA	基因表达数据	人类CRPC肿瘤的bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集
19659	2024-08-05	USP51/ZEB1/ACTA2 axis promotes mesenchymal phenotype in gastric cancer and is associated with low cohesion characteristics 2023-02, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2022.106644 PMID:36603607	研究论文	本研究探讨了USP51/ZEB1/ACTA2轴在促进胃癌转移中的作用	揭示了USP51通过维持ZEB1表达促进ACTA2转录，从而激活胃癌细胞的间质表型，推动肿瘤转移的关键机制	PC-GC的分子机制尚未完全理解，研究范围可能有限	研究USP51/ZEB1/ACTA2轴在胃癌转移中的作用	胃癌细胞及相关的单细胞群体	数字病理学	胃癌	单细胞测序和转录组分析	NA	组织样本	NA
19660	2024-08-08	A single-cell map of peripheral alterations after FMT treatment in patients with systemic lupus erythematosus 2023-02, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.jaut.2022.102989 PMID:36610264	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了系统性红斑狼疮患者在接受粪便微生物移植治疗前后外周血单个核细胞的变化	首次揭示了粪便微生物移植治疗后系统性红斑狼疮患者外周T淋巴细胞和NK细胞的变化，并发现了与治疗效果相关的基因表达模式	样本量较小，仅包括13名患者，可能影响结果的普遍性	探讨粪便微生物移植对系统性红斑狼疮患者外周免疫细胞的潜在影响	系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞	数字病理学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	30份外周血单个核细胞样本来自13名系统性红斑狼疮患者