单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35413 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-20 |
An innovative in vitro system unveils IGF1R signaling regulating Merkel cell generation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102756
PMID:41455470
|
研究论文 | 本研究开发了新型体外培养系统，包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人干细胞来源的皮肤类器官，以研究Merkel细胞的发育过程 | 首次建立了包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人干细胞来源皮肤类器官的新型培养系统，并发现PRC抑制剂能有效促进Merkel细胞生成，同时识别IGF1R和FGFR2信号通路在其中的调控作用 | NA | 研究Merkel细胞的发育机制及其调控信号通路 | Merkel细胞、小鼠触须外植体、小鼠皮肤类器官、人干细胞来源皮肤类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、药理学筛选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2026-01-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of neutrophils in intestinal ischemia-reperfusion injury in mice
2026-Jan-13, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124208
PMID:41539463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肠道缺血再灌注损伤中中性粒细胞的功能异质性及其通过ATF4介导的内质网应激通路驱动损伤的机制 | 首次在肠道缺血再灌注损伤中利用单细胞RNA测序技术鉴定出一个具有促炎特性的中性粒细胞亚群（C5），并阐明其通过ATF4介导的内质网应激通路加剧损伤的具体分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，结论在人体中的适用性有待验证；单细胞测序样本量相对有限；未深入探讨其他免疫细胞亚群的可能相互作用 | 阐明中性粒细胞在肠道缺血再灌注损伤中的具体作用机制和功能异质性 | C57BL/6小鼠的肠道组织 | 单细胞组学 | 肠道缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-01-20 |
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1238
PMID:41370097
|
研究论文 | 本文介绍了Expression Atlas在2026年的更新，作为一个支持FAIR原则的开放表达数据知识库，通过社区协作和集成扩展了内容与功能 | 引入了新的标记基因分析模块用于批量基线实验，更新工作流以提高可重复性，并整合了单细胞RNA-seq实验和外部社区数据集如Tabula Sapiens | 未明确提及具体的技术或数据局限性 | 构建和维护一个全面、开放、可互操作的基因和蛋白质表达数据资源，支持基础和转化研究 | 基因和蛋白质表达数据，涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 超过4500项研究，涉及67个物种，包括数百个单细胞RNA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2026-01-20 |
LOXL2⁺ cancer-associated fibroblasts shape WNT signaling to drive chemoresistance and poor outcomes in colorectal cancer: Insights from multi-omics and epidemiological analyses
2026-Jan-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101267
PMID:41496273
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与流行病学分析，揭示了LOXL2⁺癌症相关成纤维细胞通过激活WNT信号通路驱动结直肠癌化疗耐药和不良预后的机制 | 首次系统性地将LOXL2⁺ CAFs鉴定为结直肠癌化疗耐药的关键基质决定因素，并通过空间转录组学证实了其与WNT5A阳性癌细胞的物理相互作用 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要前瞻性临床研究进一步验证LOXL2作为生物标志物的临床效用 | 阐明癌症相关成纤维细胞亚型在结直肠癌进展和治疗反应中的分子机制及临床意义 | 结直肠癌患者组织样本、癌症相关成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、免疫荧光、功能实验 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、临床数据 | 多个结直肠癌队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-01-20 |
Integration of in situ hybridization and scRNA-seq data provides a 2D topographical map of the developing retina across species
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.04.697548
PMID:41509457
|
研究论文 | 本研究结合多重原位杂交和单细胞转录组数据，构建了发育中视网膜的二维拓扑图，揭示了跨物种的保守轴基程序和精细空间组织差异 | 首次整合原位杂交和scRNA-seq数据进行空间重建，实现跨物种的二维基因表达拓扑映射，为研究发育组织的空间逻辑提供了通用策略 | 研究主要聚焦于脊椎动物视网膜，可能不直接适用于其他组织类型；依赖实验基准进行数据锚定，可能引入技术偏差 | 探究脊椎动物视网膜的区域模式形成和空间组织逻辑，特别是高敏锐度区域（HAA）的发育机制 | 鸡、小鼠和人类的发育中视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，空间基因表达数据 | 涉及鸡、小鼠和人类多个物种的发育中视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2026-01-20 |
Synovial fibroblast responses to different types of injury resulting in cartilage repair or osteoarthritis
2026-Jan-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.12.023
PMID:41490604
|
研究论文 | 本研究通过整合分析小鼠关节损伤模型的单细胞RNA测序数据，比较了不同类型和持续时间关节损伤下滑膜成纤维细胞的响应差异 | 首次系统比较了关节表面损伤与创伤后骨关节炎模型中滑膜成纤维细胞的异质性响应，揭示了PSF细胞在损伤早期的主导作用及其多谱系潜能 | 研究基于已发表的scRNA-seq数据，可能受原始实验设计和技术差异的影响，且仅限小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究不同类型关节损伤下滑膜成纤维细胞的动态响应机制，以指导关节修复和骨关节炎研究 | 小鼠滑膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个已发表数据集，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-01-20 |
Differential molecular signatures in response to CD19-CAR T cell therapy compared with conventional pharmacotherapy in systemic lupus erythematosus
2026-Jan, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.2132
PMID:40701862
|
研究论文 | 本研究比较了CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮患者中诱导的分子特征差异 | 首次在SLE中系统比较了CD19-CAR T细胞疗法与传统药物（利妥昔单抗、贝利木单抗、环磷酰胺）诱导缓解的分子特征差异，揭示了CAR T疗法对补体激活、I型干扰素等关键免疫通路的更强抑制作用 | 样本量较小（CAR T组仅7例），观察时间点有限，主要基于转录组数据，缺乏功能验证 | 比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮中诱导的生物学特征和分子改变 | 系统性红斑狼疮患者 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，全血转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 7例接受CD19-CAR T治疗的SLE患者（治疗前后），30例传统药物治疗缓解的SLE患者，31例接受利妥昔单抗/贝利木单抗/环磷酰胺治疗的SLE患者（治疗前及6个月后） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-01-20 |
Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy
2026-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501497
PMID:40936355
|
研究论文 | 本文报道了一种利用单细胞RNA测序指导、定制设计和制备的仿生药物递送系统，用于急性肾损伤的精准靶向治疗 | 通过单细胞RNA测序识别急性肾损伤的关键细胞亚型（PTIs）及其靶向药物递送介质（VCAM1和ICAM1），并基于此定制设计仿生药物递送系统BRNCs@AMMOs | 研究主要聚焦于急性肾损伤模型，未涉及其他疾病或更广泛的体内验证 | 开发一种基于单细胞RNA测序的定制化仿生药物递送系统，以提高药物靶向效率 | 急性肾损伤（AKI）及其关键细胞亚型（肾小管上皮细胞亚型PTIs） | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-01-20 |
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2026-Jan, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00607-w
PMID:41193641
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了Notch信号通路在小鼠唾液腺类器官及多种腺体组织中驱动成体干细胞自我更新、迁移和组织再生的核心调控作用 | 首次在腺体类器官模型中系统整合单细胞RNA测序与批量ATAC/RNA测序，鉴定出Sox9/Itgb1/Cd44阳性细胞为具有迁移修复功能的原始成体干细胞群，并证实Notch信号在多种腺体组织再生中的保守调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和类器官系统，人体组织验证相对有限；辐射损伤模型可能无法完全模拟其他类型组织损伤的修复机制 | 探究腺体器官中罕见/静息态成体干细胞的调控机制及其在组织损伤修复中的作用 | 小鼠唾液腺类器官、小鼠唾液腺组织、小鼠及患者来源的唾液腺/乳腺/甲状腺类器官 | 单细胞组学 | 腺体组织损伤（辐射诱导） | 单细胞RNA测序、批量ATAC测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 未明确样本数量，包含多个时间点、损伤条件及不同腺体类型的类器官和组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-01-20 |
Technology-enabled integration of single-cell transcriptomics and microbiome data identifies RNA-targetable host-microbiota networks in colorectal adenoma
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100365
PMID:41241214
|
研究论文 | 本研究开发了一个可重复的计算流程，整合单细胞转录组学和微生物组数据，以识别结直肠腺瘤中可被RNA靶向的宿主-微生物网络 | 首次将单细胞RNA测序数据与平行微生物组数据集进行整合分析，并系统性地识别出可用于RNA治疗的靶点，为将转录组学转化为治疗手段提供了可重复的框架 | 研究依赖于公开数据集，可能受到原始实验设计和样本采集差异的影响；统计控制严格（FDR < 0.05）可能遗漏一些微弱的关联 | 识别结直肠腺瘤中可被RNA靶向的宿主-微生物相互作用网络，为开发精准干预措施提供基础 | 结直肠腺瘤患者 | 数字病理学 | 结直肠腺瘤 | 单细胞RNA测序，微生物组分析 | 整合分析流程（包括MaAsLin2、QIIME2/DADA2、Seurat/Harmony） | 单细胞RNA测序数据，微生物组测序数据 | 总计426,425个细胞（来自三个单细胞RNA测序数据集）和975个样本（来自三个平行微生物组数据集） | NA | 单细胞RNA-seq，微生物组测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-01-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals metabolic reprogramming and tumor microenvironment remodeling in aldosterone-producing adenoma
2026-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111164
PMID:41317749
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了醛固酮瘤（APA）中的代谢重编程和肿瘤微环境重塑 | 首次构建了APA的单细胞图谱，揭示了CAPS zona glomerulosa样细胞的代谢重编程特征、分化轨迹紊乱以及肿瘤微环境中免疫浸润和基质重塑的关键机制 | 样本量较小（仅3例APA患者和3例对照），且为单中心研究，需要更大规模队列验证 | 阐明醛固酮瘤的细胞异质性、肿瘤发生机制及潜在治疗靶点 | 肾上腺组织（来自APA患者和对照个体） | 数字病理学 | 肾上腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例APA患者和3例对照的肾上腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-01-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals a cellular atlas of the sheep testis
2026-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111159
PMID:41325971
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了绵羊睾丸的高分辨率细胞图谱，揭示了精子发生过程中的细胞异质性和分化轨迹 | 首次在绵羊中应用10x Genomics Chromium™ scRNA-seq技术，识别了六种体细胞亚型和五种生殖细胞亚型，并通过伪时间分析提出Leydig细胞和管周肌样细胞可能起源于共同的祖细胞谱系 | 研究仅基于三只6月龄性成熟绵羊的样本，样本量较小，且未涉及不同年龄或生理状态的比较 | 解析绵羊睾丸的细胞组成和精子发生过程 | 绵羊睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15,826个睾丸细胞，来自三只6月龄性成熟绵羊 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium™ scRNA-seq |
| 133 | 2026-01-20 |
Deciphering OCT4A-dose-dependent transcriptional profiles associated with tumorigenic potential in somatic cancer cells
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100381
PMID:41352420
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子OCT4A在不同蛋白丰度下调控体细胞癌细胞肿瘤发生潜力的下游基因特征 | 首次系统阐明了OCT4A蛋白水平依赖性的功能多效性及其在体细胞癌细胞中调控肿瘤发生潜力的分子特征 | 研究主要基于体外细胞系模型，体内验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 揭示OCT4A蛋白丰度依赖性调控体细胞癌细胞肿瘤发生潜力的下游基因网络特征 | 宫颈癌（HeLa）和肝癌（HepG2, Huh7）细胞系及体细胞癌组织 | 肿瘤生物学 | 宫颈癌, 肝癌 | CRISPR-Cas9基因敲除, 多西环素诱导表达系统, 单细胞测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, WGCNA, RT-qPCR | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, 预后模型 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 生存分析数据 | 三种癌细胞系（HeLa, HepG2, Huh7）及未明确数量的体细胞癌组织样本 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-01-20 |
Spatial transcriptomic modeling of vascular remodeling in aortic aneurysm using integrated single-cell RNA sequencing analysis
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100377
PMID:41360265
|
研究论文 | 本研究开发了一个整合单细胞RNA测序与伪空间转录组推断的计算工作流，以细胞分辨率模拟主动脉瘤中的血管重塑 | 利用公开的单细胞RNA测序数据，通过伪空间转录组推断技术，首次在细胞水平上揭示了主动脉瘤形成过程中血管平滑肌细胞表型调控的空间和转录动态 | 研究基于伪空间推断而非真实的原位空间转录组数据，结果需要免疫组化和真实空间转录组学实验验证 | 探究主动脉瘤形成过程中血管平滑肌细胞表型调控的空间和转录动态 | 正常和高脂饮食小鼠升主动脉中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Tangram, Monocle3 | 单细胞RNA测序数据 | 15,698个高质量细胞，来自正常和高脂饮食小鼠的升主动脉 | Broad Institute | 单细胞RNA-seq | SCP1361数据集 | 来自Broad Institute单细胞门户的公开数据集 |
| 135 | 2026-01-20 |
Sustained diabetes remission induced by FGF1 involves a shift in transcriptionally distinct AgRP neuron subpopulations
2026-Jan, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102300
PMID:41371441
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了FGF1诱导糖尿病持续缓解的机制，涉及AgRP神经元亚群的转录重编程 | 首次发现FGF1能诱导糖尿病状态下过度活跃的AgRP神经元亚群向野生型样静息状态转变，并揭示了空间定位特异的神经元-胶质细胞互作机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；机制研究主要基于转录组数据，需要进一步功能验证 | 探究FGF1诱导2型糖尿病持续缓解的神经机制 | 野生型和糖尿病（Lep）小鼠的下丘脑AgRP神经元 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 野生型和糖尿病小鼠在注射后第5天和第14天的下丘脑样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2026-01-20 |
17β-estradiol mediates sex-biased progesterone receptor expression via estrogen receptor α in chicken pituitary
2026-Jan, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106210
PMID:41380332
|
研究论文 | 本研究揭示了17β-雌二醇通过雌激素受体α介导鸡垂体中孕酮受体表达的性别偏倚机制 | 首次在鸡垂体中阐明了雌激素依赖的孕酮受体性别偏倚表达调控机制，涉及膜锚定ERα触发的快速非基因组通路和ERα相关的长效基因组作用 | 研究主要基于鸡模型，机制在其它鸟类或动物中的普适性有待验证 | 探究鸡垂体中孕酮受体性别偏倚表达的关键性腺类固醇及其调控机制 | 鸡垂体组织 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA-seq，体外实验，皮下注射 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2026-01-20 |
Multi-omics atlas of ovarian cellular and molecular responses to diabetes
2026-Jan, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102307
PMID:41397560
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和代谢组学，全面表征了糖尿病雌性小鼠卵巢的细胞景观、表观遗传改变和代谢重编程 | 首次在糖尿病背景下，利用多组学方法系统揭示了卵巢功能障碍的细胞和分子机制，特别是发现了颗粒细胞中关键基因表达下降与DNA甲基化增加的相关性 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且糖尿病模型的特定类型和病程可能影响结果的普适性 | 阐明糖尿病对卵巢功能的细胞和分子影响机制 | 糖尿病雌性小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 代谢数据 | 未明确指定样本数量，但基于糖尿病雌性小鼠卵巢 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-01-20 |
TOGAR: Token-gated generative refinement for high-fidelity spatial transcriptomics and robust spatial domain clustering
2026-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111179
PMID:41422986
|
研究论文 | 本文介绍了TOGAR模型，一种用于空间转录组学的令牌门控生成式精炼模型，旨在通过去噪、空间增强和聚类统一处理，提高数据保真度和空间域聚类鲁棒性 | TOGAR模型首次结合了图卷积网络损失和零膨胀负二项分布损失来减少噪声，并采用基于UGate的扩散骨干网络，集成令牌门控、门控线性注意力和旋转位置嵌入进行生成式空间精炼，同时通过相似性引导平均沿扩散轨迹提供稳定的点级估计 | NA | 提高空间转录组学数据的保真度，实现鲁棒的空间域聚类 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络, 扩散模型 | 基因表达数据 | 12个切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2026-01-20 |
Differentiation-induced reduction in functional diversity restricts the ability of cytomegalovirus-specific CD8 T cells to eliminate virus-infected cells
2026-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106107
PMID:41494240
|
研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了巨细胞病毒特异性CD8 T细胞分化程度与其功能多样性及清除病毒能力之间的关系 | 首次系统比较了高频率和低频率NLV-T细胞在分化表型、细胞因子分泌和清除病毒感染细胞能力方面的差异，并发现分化程度较低的细胞在HLA下调情况下仍能有效清除病毒 | 研究样本仅来自健康HCMV阳性供体，未涵盖免疫功能受损个体；实验主要在体外进行，体内验证有限 | 探究巨细胞病毒特异性CD8 T细胞分化状态如何影响其免疫控制能力 | 来自116名健康HCMV阳性供体的NLV-T细胞 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | 多色光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR谱分析 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据 | 116名健康HCMV阳性供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2026-01-20 |
Integrating multiple key molecules in uveal melanoma to uncover metastatic and immune microenvironment-related gene signatures
2026, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2026.01.02
PMID:41523997
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，在葡萄膜黑色素瘤中鉴定出与转移和预后相关的七个关键基因，并构建了一个用于生存预测的风险评分模型 | 整合了TCGA和GEO的转录组数据、单细胞RNA-seq数据以及体外细胞实验验证，构建了一个与转移和免疫微环境相关的七基因特征，并首次在单细胞水平揭示了这些基因在具有高转移潜能的肿瘤细胞亚群中的特异性表达 | 样本量相对较小（TCGA队列80例，GEO验证集13例，单细胞数据11个肿瘤），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性队列进行验证 | 鉴定葡萄膜黑色素瘤中与转移相关的预后基因，并构建一个稳健的分子特征用于患者生存预测 | 葡萄膜黑色素瘤患者（来自TCGA-UVM队列和GEO数据集）、葡萄膜黑色素瘤细胞系（92.1, OMM1, MEL270）以及成人视网膜色素上皮细胞（ARPE-19） | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序、微阵列、单细胞RNA-seq、qRT-PCR、Western blotting | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、体细胞突变数据、拷贝数变异数据 | TCGA队列80例患者，GEO数据集GSE73652中13例（8例非转移 vs 5例转移），单细胞数据集GSE139829中11个肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |