单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2026-09-10
Cellular Crosstalk Promotes Hepatic Progenitor Cell Proliferation and Stellate Cell Activation in 3D Co-culture
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 研究在3D共培养系统中,肝星状细胞与肝祖细胞的相互作用促进祖细胞增殖和星状细胞活化,模拟肝损伤后的细胞事件 建立了3D类器官共培养系统,实时观察细胞相互作用,并发现3D共培养中星状细胞激活与2D单培养不同,特定基因簇上调 摘要未提及局限性信息 探究肝祖细胞与肝星状细胞在3D共培养中的直接相互作用及其在肝损伤和纤维化中的相关性 小鼠肝星状细胞和肝祖细胞(未分化胆管细胞类器官)及人类肝脏外植体 细胞生物学 肝纤维化 3D类器官共培养, 荧光标记, 细胞分选, 空间转录组学 类器官共培养模型 基因表达数据 人类肝脏外植体 NA 空间转录组学 NA NA
122 2026-09-10
Periplakin Attenuates Liver Fibrosis via Reprogramming CD44Low Cells into CD44High Liver Progenitor Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 该研究揭示了周斑蛋白(PPL)通过将CD44Low细胞重编程为CD44High肝祖细胞来减轻肝纤维化的机制 首次发现PPL在肝纤维化中促进LPC扩增,并证明PPL+CD44Low细胞可重编程为PPL+CD44High LPC,从而减轻纤维化,提供了一种潜在的治疗策略 未提及具体局限性 探讨PPL对肝纤维化进程中肝祖细胞衍生和功能的影响及其治疗潜力 肝纤维化患者和小鼠模型中的肝组织及细胞(PPL+CD44Low和CD44High LPC) 数字病理学 肝纤维化 单细胞测序、腺病毒介导的基因过表达、细胞移植 NA 基因表达数据、图像 人类和小鼠肝纤维化模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
123 2026-09-10
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示IL-1β在致心律失常性心肌病进展中的作用,并验证抗IL-1β治疗的潜力。 首次结合snRNAseq和空间转录组学鉴定ACM疾病相关空间生态位,并证明IL-1β中和抗体在ACM小鼠模型中的治疗益处。 未提及明确的局限性。 阐明IL-1β在ACM疾病进展中的机制,并探索靶向IL-1β的治疗潜力。 ACM患者心肌样本和Dsg2突变小鼠。 数字病理学 致心律失常性心肌病 单核RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 ACM患者和对照供体的心肌样本,以及Dsg2突变小鼠 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
124 2026-09-10
Temporal Genomic Analysis of Homogeneous Tumor Models Reveals Key Regulators of Immune Evasion in Melanoma
2024-11-20, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过时间基因组分析同质肿瘤模型,揭示了黑色素瘤免疫逃逸的关键调控因子Mif 利用低肿瘤内异质性的同质肿瘤模型,结合单细胞RNA测序和体内CRISPR敲除筛选,首次发现Mif是免疫逃逸的关键调控因子 研究主要基于小鼠模型,且未深入探讨Mif调控免疫逃逸的具体分子机制 探究低肿瘤内异质性肿瘤中免疫逃逸的机制,并识别影响肿瘤侵袭性的关键免疫因素 小鼠黑色素瘤同质肿瘤模型中的单细胞克隆(被排斥与未被排斥的克隆) 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、体内CRISPR敲除筛选 NA 基因表达数据、免疫表型数据 小鼠肿瘤样本及黑色素瘤患者数据 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
125 2026-09-10
YAP1 Inhibition Induces Phenotype Switching of Cancer-Associated Fibroblasts to Tumor Suppressive in Prostate Cancer
2024-11-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了YAP1调控前列腺癌相关成纤维细胞表型转换的机制,并证明靶向YAP1可增强免疫检查点阻断疗法的疗效 首次发现YAP1通过抑制NF-κB p65核转位调控CAF表型转换,并证明选择性耗竭ECM-CAF中的YAP1可增强抗PD-1治疗效果 未提及 揭示调控CAF可塑性的机制,寻找策略使CAF从促肿瘤表型转换为抗肿瘤表型,以增强前列腺癌免疫治疗效果 前列腺癌相关成纤维细胞(CAF) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、RNA-seq、流式细胞术、类器官模型 NA 基因表达数据、图像、文本 四个前列腺癌单细胞RNA测序数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
126 2026-09-10
A Dual-Payload Antibody-Drug Conjugate Targeting CD276/B7-H3 Elicits Cytotoxicity and Immune Activation in Triple-Negative Breast Cancer
2024-11-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 开发了一种针对CD276/B7-H3的双载荷抗体-药物偶联物,在三阴性乳腺癌中引发细胞毒性和免疫激活 构建了一种同时携带传统细胞毒性载荷和免疫调节Toll样受体7/8激动剂的双载荷ADC(DualADC),实现化疗和免疫治疗的联合作用 摘要中未提及局限性 开发一种双载荷抗体-药物偶联物作为三阴性乳腺癌的化学免疫治疗策略 三阴性乳腺癌细胞和动物模型 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、多因子细胞因子分析、组织学分析 抗体-药物偶联物 图像、单细胞表达数据 动物研究(未提供具体数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
127 2026-09-10
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究整合高分辨率空间转录组学和进化谱系追踪技术,在小鼠肺腺癌模型中揭示了肿瘤生长、转移与微环境重塑的时空动态架构 首次将高分辨率空间转录组学与进化谱系追踪技术相结合,构建整合数据集,以解析肿瘤细胞状态和微环境结构的序贯变化如何协同促进肿瘤进展 摘要中未提及研究局限性 探究肿瘤扩张、可塑性和转移如何与微环境重塑共同演化,以阐明肿瘤进展的时空动态机制 小鼠肺腺癌模型中的肿瘤细胞及其微环境 空间转录组学 肺腺癌 空间转录组学、谱系追踪 NA 空间基因表达数据、谱系追踪数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
128 2026-09-10
Whole-genome sequences reveal zygotic composition in chimeric twins
2024-07-18, HGG advances
研究论文 本研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序,精确解析了嵌合体双胞胎的合子组成,揭示了血液组织中不对称的细胞贡献。 首次利用数百万基因组变异作为合子起源的标记,结合单细胞RNA测序,详细展示了嵌合体双胞胎在不同血细胞类型中的差异贡献,并发现口腔组织为纯合子状态。 样本仅包括一个三胞胎和一个双胞胎家庭,样本量小,可能限制结果的普适性。 阐明人类发育过程中孪生形成的细胞历史,特别是嵌合体个体中的遗传组成。 三胞胎和双胞胎家庭的成员,尤其是存在嵌合现象的个体。 基因组学 遗传病 全基因组测序、单细胞RNA测序 NA 基因组序列和单细胞转录组数据 两个家庭(一个三胞胎和一个双胞胎),具体个体数未提供。 NA 全基因组测序、单细胞RNA测序 NA NA
129 2026-09-10
RNA splicing analysis deciphers developmental hierarchies and reveals therapeutic targets in adult glioma
2024-04-25, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过计算分析揭示成人胶质瘤RNA可变剪接与神经发育层级关联,并验证其治疗靶点 利用计算方法和iPSC胶质瘤模型,首次揭示与神经发育层级相关的预后性剪接特征,并发现PTBP1作为关键调控因子,靶向PTBP1可抑制肿瘤生长并促进神经元标志物表达 摘要未明确说明局限性 探讨成人胶质瘤中RNA可变剪接的调控机制、生物学意义及治疗潜力 成人胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA测序数据、iPSC胶质瘤模型、胶质瘤干细胞样细胞 生物信息学、癌症生物学、分子生物学 成人胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, iPSC模型 计算分析模型 基因表达数据(bulk和单细胞RNA-seq)、细胞模型 成人胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据(具体数量未给出),iPSC胶质瘤模型,胶质瘤干细胞样细胞 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
130 2026-09-10
NR2E3 loss disrupts photoreceptor cell maturation and fate in human organoid models of retinal development
2024-04-23, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究利用人视网膜类器官模型,结合单细胞RNA测序等技术,探讨NR2E3基因缺失如何破坏光感受器细胞的成熟和命运决定 首次在人类视网膜类器官模型中揭示NR2E3缺失导致视杆细胞发育异常及视锥基因异位表达,并发现与啮齿动物模型的显著差异 未提及具体限制,但可能依赖于类器官模型,其与体内环境的差异需考虑 阐明人视网膜光感受器细胞发育的物种特异性机制,以及NR2E3在健康与疾病中的作用 人视网膜类器官,包括携带NR2E3致病基因变异的类器官及同源和无关对照组 单细胞转录组学, 发育生物学 遗传性视网膜营养不良 单细胞RNA测序, 多模态单细胞测序 类器官模型 单细胞RNA测序数据, 多模态单细胞数据 多个时间点的类器官样本,来自不同基因型组 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 和 多组学 平台
131 2026-09-10
The estrogen signaling pathway reprograms prostate cancer cell metabolism and supports proliferation and disease progression
2024-04-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究雌激素信号通路如何重编程前列腺癌细胞的代谢并促进肿瘤增殖和疾病进展 揭示了雌激素受体α(ERα)在前列腺癌中表达异质性,并首次证明其通过重编程癌细胞代谢支持增殖和疾病进展,且可作为治疗靶点 未提及具体局限性 探究ERα在前列腺癌中的功能,评估其临床相关性以及靶向雌激素信号通路治疗前列腺癌的潜力 人类前列腺癌组织样本、前列腺癌细胞系、患者来源类器官、正常前列腺组织模型 癌症生物学 前列腺癌 RNA-seq NA RNA测序数据,代谢组学数据,组织微阵列数据 两群人类前列腺癌组织微阵列队列,细胞系和小鼠模型,患者来源类器官 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
132 2026-09-10
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-04-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究利用遗传方法和单细胞RNA测序,在致心律失常性心肌病的临床前模型中揭示了NFκB信号通过CCR2+巨噬细胞驱动心肌损伤的机制 首次阐明心肌细胞中的NFκB信号通过动员CCR2+巨噬细胞导致心肌损伤和心律失常,并揭示了心脏肌细胞、炎症细胞和成纤维细胞之间的免疫损伤和调控串扰的复杂机制 未提及 研究NFκB信号在致心律失常性心肌病进展中对心肌细胞和巨噬细胞免疫信号的贡献 Dsg2mut/mut小鼠及来源于ACM患者的iPSC心肌细胞 生物信息学 致心律失常性心肌病 单细胞RNA测序, CITE-seq, 遗传方法 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量,涉及Dsg2mut/mut小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA NA
133 2026-09-10
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-03-26, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究通过多组学分析和实验验证,确定了OTUD4/CD73蛋白水解轴作为治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的靶点,并开发了新型抑制剂ST80以恢复抗肿瘤免疫。 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73,对抗TRIM21介导的泛素化,从而抑制肿瘤免疫反应;开发了特异性抑制剂ST80,能破坏CD73与OTUD4的蛋白水解相互作用,增敏抗PD-L1治疗。 未提及明显的局限性。 探究并靶向免疫抑制性乳腺癌中的OTUD4/CD73蛋白水解轴,以改善免疫治疗的效果。 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞。 数字病理学 三阴性乳腺癌 多组学分析、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 未具体说明样本数量 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium 空间转录组学用于分析恶性细胞和免疫细胞的相互作用
134 2026-09-10
Spatial transcriptomic profiling of isolated microregions in tissue sections utilizing laser-induced forward transfer
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 提出了一种基于激光诱导向前转移(LIFT)结合全长mRNA测序的方法(LIFT-seq),用于组织切片中分离微区域的空间转录组分析 LIFT-seq方法结合了激光诱导向前转移与全长mRNA测序,能够简单灵活地分离感兴趣微区域,可靠且灵敏地检测基因表达,并能在不同组织层中识别标记基因,为空间转录组分析提供了高效工具 摘要未提及明显局限性 开发一种简单灵活的空间转录组分析方法,以保留细胞位置信息进行基因表达谱分析 小鼠皮层和海马组织切片中的微区域 空间转录组学 不适用 LIFT-seq(激光诱导向前转移结合mRNA测序) 不适用 转录组数据 小鼠脑组织切片中的多个微区域 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
135 2026-09-10
Comprehensive analysis of PPP4C's impact on prognosis, immune microenvironment, and immunotherapy response in lung adenocarcinoma using single-cell sequencing and multi-omics
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序和多组学数据综合分析PPP4C在肺腺癌中的表达及其对预后、免疫微环境和免疫治疗反应的影响,并通过实验验证其功能。 首次全面分析PPP4C在肺腺癌中对免疫细胞浸润的影响,并利用单细胞测序和多组学数据构建包括PPP4C和免疫相关基因的预后模型,以预测患者生存和免疫治疗反应。 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏体内实验验证,且样本量有限,可能影响结论的普遍性。 探究PPP4C在肺腺癌中的表达及其对预后的影响,揭示其与免疫微环境的相互作用,并开发基于PPP4C的预后模型。 肺腺癌患者的肿瘤组织和细胞样本,涉及PPP4C表达及相关基因。 多组学分析、单细胞测序、基因表达分析 肺腺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化、Western blot、定量PCR、细胞增殖和迁移实验 Cox比例风险模型、加权基因共表达网络分析 RNA测序数据、单细胞数据、基因表达数据、蛋白质表达数据 研究中涉及的样本数量未在摘要中明确说明,可能包括公开数据集中的肺腺癌患者样本和实验细胞样本。 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
136 2026-09-10
Comprehensive integrated single-cell RNA sequencing analysis of brain metastasis and glioma microenvironment: Contrasting heterogeneity landscapes
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据,全面分析脑转移瘤与胶质瘤微环境的异质性,揭示不同来源脑转移的细胞组成差异。 首次综合比较了源自肺和乳腺的脑转移与胶质瘤在微环境中的异质性,识别出不同肿瘤类型特有的细胞亚群。 文章未提供具体限制信息。 探究脑恶性肿瘤(胶质瘤与不同来源脑转移)微环境的异质性,以指导治疗决策。 来自17名患者的90,168个细胞,包括胶质瘤、肺癌脑转移和乳腺癌脑转移样本。 单细胞转录组学 脑恶性肿瘤(胶质瘤、脑转移瘤) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 90,168个细胞,来自17名患者 NA 单细胞RNA测序 NA 数据来源于GEO数据库
137 2026-09-10
Interstitial macrophage phenotypes in Schistosoma-induced pulmonary hypertension
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过流式细胞术和单细胞RNA测序识别曼氏血吸虫诱导的肺动脉高压中三种间质巨噬细胞亚群,并揭示它们之间的相互作用及TSP-1表达模式。 首次在血吸虫诱导的肺动脉高压模型中详细表征了三种间质巨噬细胞亚群(CCR2+、MHCII+、FOLR2+)及其功能差异,揭示了常驻FOLR2+巨噬细胞通过表达CCL2招募单核细胞,而招募的CCR2+巨噬细胞高表达TSP-1的病理机制。 未提供具体局限性信息。 探究血吸虫诱导的肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的表型及功能,验证不同亚群在病理中的分工。 小鼠肺间质巨噬细胞亚群(包括FOLR2+和CCR2+亚群)及单核细胞招募因子和TSP-1的表达。 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序、流式细胞术 未提及 单细胞基因表达数据和流式细胞术数据 样本涉及野生型和报告小鼠,在未暴露和暴露后1、3、7天时收集肺和血液样本,具体数量未提供。 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
138 2026-09-10
A mitochondria-related genes associated neuroblastoma signature - based on bulk and single-cell transcriptome sequencing data analysis, and experimental validation
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于批量与单细胞转录组测序数据构建神经母细胞瘤线粒体相关基因预后标志,并通过实验验证FEN1的关键作用 首次构建了与线粒体相关的基因标签,该标签在预测神经母细胞瘤患者预后方面优于MYCN,并能表征肿瘤微环境、干细胞性和化疗敏感性 未提及 构建和验证与线粒体相关的基因标签,以预测神经母细胞瘤的预后,揭示FEN1在肿瘤细胞与微环境相互作用及发育轨迹中的关键功能 神经母细胞瘤患者样本及细胞系 生物信息学,肿瘤学 神经母细胞瘤 批量转录组测序,单细胞转录组测序 共识聚类,机器学习算法 基因表达数据 未具体说明,涉及神经母细胞瘤患者和细胞系 NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
139 2026-09-10
Identifying HIF1A and HGF as two hub genes in aortic dissection and function analysis by integrating RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data
2024, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 通过整合RNA测序和单细胞RNA测序数据,筛选并验证了主动脉夹层中的两个关键基因HIF1A和HGF,并分析了其潜在功能。 创新性地结合RNA-seq和scRNA-seq数据筛选出HIF1A和HGF为主动脉夹层的关键基因,并在单细胞水平揭示了它们在巨噬细胞和血管平滑肌细胞中的特异表达及调控网络。 研究基于公共数据集和动物模型,缺乏临床样本验证,且功能实验仅限于初步的mRNA表达检测,未深入探究蛋白水平和具体机制。 探索主动脉夹层的发病机制,为诊断和治疗提供参考。 主动脉夹层患者及BAPN诱导的小鼠模型主动脉组织样本和细胞。 基因组学、生物信息学 主动脉夹层 RNA-seq、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、ROC曲线分析、实时定量PCR NA RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、基因表达数据 涉及多个GEO数据集,包括GSE153434、GSE98770、GSE52093和GSE213740,以及BAPN处理的小鼠主动脉组织。 NA RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
140 2026-09-10
Itaconate-producing neutrophils regulate local and systemic inflammation following trauma
2023-10-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究通过代谢组学和单细胞RNA测序,发现创伤后肌腱损伤部位产生的衣康酸主要由成熟中性粒细胞分泌,并调节局部和全身炎症,外源性衣康酸具有治疗潜力 首次识别出成熟中性粒细胞而非巨噬细胞是创伤后衣康酸的主要生产者,并揭示其通过循环至骨髓调节造血和系统性炎症的新机制 未明确提及研究局限性 探究肌腱损伤修复过程中代谢谱的变化及其对愈合结果的影响,并评估衣康酸的免疫调节作用 肌腱损伤组织、中性粒细胞、骨髓造血祖细胞 数字病理学 肌腱损伤 单细胞RNA测序、代谢组学 不适用 单细胞转录组数据、代谢组数据 未明确提及样本数量 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
回到顶部