本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-12-06 |
Spatial omics: applications and utility in profiling the tumor microenvironment
2025-Dec-02, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-025-10304-z
PMID:41331191
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在生物医学研究中的应用,特别关注其在肿瘤微环境分析中的效用 | 空间组学技术能够保留组织空间结构,直接映射分子信息到组织学结构,为肿瘤微环境提供前所未有的详细表征 | NA | 概述空间组学技术现状及其在癌症研究中的应用,推动精准肿瘤学发展 | 肿瘤微环境,包括空间异质性、免疫细胞浸润模式及肿瘤进展与治疗抵抗机制 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因和蛋白表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2025-12-06 |
SPICEiST: subcellular RNA pattern enhances cell clustering of imaging-based spatial transcriptomics
2025-Dec-02, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00056-1
PMID:41331495
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SPICEiST的图自编码器框架,通过整合亚细胞转录分布模式和细胞级基因表达谱,以增强成像空间转录组学中的细胞聚类性能 | SPICEiST首次将亚细胞RNA分布模式与细胞级基因表达结合,用于提升成像空间转录组学的细胞聚类准确性,特别是在小基因面板情况下 | 研究主要针对癌症数据集,且在小基因面板(约300个基因)中效果更显著,对于大基因面板(超过一千个基因)的改进相对有限 | 旨在克服成像空间转录组学中因小基因面板和细胞分割挑战导致的细胞聚类限制 | 多个癌症数据集中的细胞,基于成像空间转录组学技术 | 空间转录组学 | 癌症 | 成像空间转录组学 | 图自编码器 | 图像和基因表达数据 | 多个癌症数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2025-12-06 |
Deciphering the liver's role in pancreatic cancer metastasis: pathways and therapeutic approaches
2025-Dec-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01202-2
PMID:41331510
|
综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌(PDAC)肝转移的机制,重点关注肝脏作为转移前微环境的作用,并探讨了相关的治疗策略 | 结合空间组学、单细胞测序等前沿技术,重新审视并批判性评估了Paget的‘种子与土壤’假说在PDAC肝转移微环境研究中的适用性 | 作为一篇综述文章,未提供新的原始实验数据,主要基于现有文献进行整合与分析 | 旨在深化对PDAC肝转移机制的理解,为开发靶向疗法和改善临床预后提供潜在方向 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肝转移灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间组织学图谱、单细胞测序、分子标记物鉴定 | NA | 组织图像、测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2025-12-06 |
Genome-wide identification of the PLD gene family and its response to multiple abiotic stresses in soybean (Glycine max)
2025-Dec-02, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-07713-1
PMID:41331918
|
研究论文 | 本研究对大豆中的磷脂酶D(PLD)基因家族进行了全基因组鉴定,并分析了其在多种非生物胁迫下的响应机制 | 首次在大豆中系统鉴定了25个GmPLD基因,包括两个新发现的φ亚型(GmPLDφ1/2),并通过单细胞RNA-seq揭示了其空间表达异质性,同时通过单倍型分析鉴定了与磷效率相关的优势单倍型 | 研究主要基于生物信息学分析和表达谱数据,功能验证实验相对有限,且对PLD基因在具体胁迫信号通路中的分子机制尚未深入探讨 | 系统解析大豆PLD基因家族的结构特征、表达模式及其在非生物胁迫响应中的功能 | 大豆(Glycine max)中的磷脂酶D(PLD)基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组鉴定、系统发育分析、表达谱分析、单细胞RNA-seq、单倍型分析、酶活性验证 | NA | 基因组序列数据、RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 基于大豆基因组数据,涉及25个GmPLD基因;表达分析涵盖多种组织和非生物胁迫条件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-12-06 |
LSECs promote MASH progression via IL-1R1-mediated chemokine production induced by macrophage-derived IL-1β
2025-Dec-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101698
PMID:41344438
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的IL-1β通过肝窦内皮细胞(LSECs)上的IL1R1受体诱导趋化因子产生,从而驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展的机制 | 首次明确了巨噬细胞-肝窦内皮细胞之间通过IL1B-IL1R1轴相互作用在MASH炎症和纤维化中的核心作用,并利用空间转录组学技术揭示了趋化因子富集的LSECs形成炎性-纤维化微生态位的空间特征 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类数据为回顾性分析,需要进一步在人类原代细胞和更大临床队列中验证 | 阐明IL-1β在MASH病理进展中的作用机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | THP-1巨噬细胞系、TMNK-1肝窦内皮细胞系、内皮细胞特异性Il1r1敲除小鼠、系统性Cxcl10敲除小鼠、MASLD患者肝组织样本、MASH相关HCC样本的非肿瘤区域 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA测序、空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未明确)、人类MASLD患者肝组织数据集、MASH相关HCC样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-12-06 |
Elucidating a Myofibroblast-Dominated Fibrotic Niche in Crohn's Disease-Associated Fibrostenosis through High-Resolution Spatial Transcriptomics
2025-Dec-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101701
PMID:41344440
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率空间转录组学揭示了克罗恩病相关纤维狭窄中一个以肌成纤维细胞为主的纤维化微环境,并明确了其细胞身份和起源 | 首次在克罗恩病纤维狭窄中应用高分辨率空间转录组学,系统性地识别了肌成纤维细胞的主导作用及其从黏膜肌层和血管平滑肌细胞的起源,并揭示了周细胞向肌成纤维细胞样表型的重编程过程 | 研究仅基于两个样本(一个非纤维化和一个纤维化)进行高分辨率空间转录组学分析,样本量较小,且为回顾性研究,可能限制结果的普适性 | 阐明克罗恩病相关纤维狭窄的细胞机制和分子基础,以识别潜在的治疗靶点 | 克罗恩病患者(包括非狭窄和狭窄病例)的肠道组织,以及正常对照组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 高分辨率空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,定量PCR | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 | 117例克罗恩病患者进行回顾性超声分析,25例正常、35例非狭窄克罗恩病、44例狭窄克罗恩病组织进行组织学分析,2例样本进行高分辨率空间转录组学,158例公共单细胞RNA测序数据集用于验证 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-12-06 |
Prehabilitation during neoadjuvant chemotherapy results in an enhanced immune response in esophageal adenocarcinoma tumors: A randomized controlled trial
2025-Dec, Journal of sport and health science
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.jshs.2025.101063
PMID:40499717
|
研究论文 | 本研究是一项随机对照试验,旨在探讨食管腺癌患者在新辅助化疗期间进行预康复运动训练是否能增强肿瘤的免疫反应 | 首次在食管腺癌患者中,通过随机对照试验设计,结合高分辨率多光谱免疫组化和空间转录组学技术,系统评估了预康复运动对肿瘤免疫微环境(特别是肿瘤浸润淋巴细胞和三级淋巴结构)的影响 | 样本量较小(n=22),且未观察到预康复组与对照组在生存率、治疗耐受性或肿瘤再分级等临床结局指标上存在显著差异 | 确定预康复运动训练是否能增加食管腺癌肿瘤中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 局部晚期食管腺癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 高分辨率多光谱免疫组化,空间转录组学 | NA | 图像,转录组数据 | 22名局部晚期食管癌患者(预康复组11人,对照组11人) | NanoString | 空间转录组学 | NA | NanoString空间转录组学技术用于分析福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤组织 |
| 128 | 2025-12-06 |
A dynamic model for Waddington's landscape accounting for cell-to-cell communication
2025-Dec, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2025.109537
PMID:40976482
|
研究论文 | 本研究提出了一个考虑细胞间通讯的细胞成熟与发育动态模型,作为Waddington景观的扩展 | 首次在Waddington景观框架中整合细胞间通讯机制,通过偏微分方程与常微分方程耦合系统描述细胞状态依赖的配体产生与群体动态 | 模型验证主要基于单细胞转录组数据,尚未在更多实验体系或体内环境中进行广泛验证 | 建立包含细胞间通讯的细胞发育数学模型,更准确描述生物恢复过程 | 细胞成熟与发育过程,重点关注肠道隐窝干细胞再生和免疫细胞对LSP刺激的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学分析 | 偏微分方程与常微分方程耦合系统 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-12-06 |
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-Dec, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.09.034
PMID:41033583
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠回肠的综合单细胞图谱,揭示了上皮细胞和免疫细胞的异质性、营养代谢程序以及上皮-免疫互作 | 首次整合了小鼠回肠的上皮和免疫细胞单细胞图谱,发现了肠上皮细胞亚群在维生素A、类胡萝卜素和维生素B12吸收中的特异性功能,以及非经典杯状细胞中Bco2和Il18的共表达与脂肪酸代谢和应激反应的关联 | 研究仅基于8周龄雄性C57BL/6J小鼠,样本来源和年龄性别有限,未涵盖疾病模型或人类样本 | 绘制回肠细胞异质性图谱,定义上皮分化、营养代谢程序以及与健康和疾病相关的上皮-免疫相互作用 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 32,076个回肠细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-12-06 |
Distinct senotypes in p16- and p21-positive cells across human and mouse aging tissues
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00601-2
PMID:41162753
|
研究论文 | 本研究通过分析人类和小鼠衰老组织的单细胞RNA测序数据,揭示了p21和p16阳性细胞在衰老过程中的异质性及其与衰老相关分泌表型(SASP)的关联 | 首次在体内系统比较了p21和p16作为衰老标志物的表达异质性,并发现它们在不同细胞类型和组织中缺乏共表达,且具有独立的轨迹动态 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 阐明p21和p16在细胞衰老过程中的个体角色及其与SASP的关系 | 人类和小鼠衰老组织中的细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA velocity分析、伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 多个数据集,涵盖人类和小鼠的多种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-12-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune response dynamics and infection mechanisms in PRRSV-infected porcine alveolar macrophages
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148719
PMID:41192717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞的免疫应答动态和感染机制 | 首次在单细胞水平上揭示了PRRSV感染过程中猪肺泡巨噬细胞的转录异质性,并发现了CD16受体在病毒进入中的作用以及SPP1蛋白的抗病毒功能 | 研究基于体外感染模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本规模未明确说明,可能影响统计效力 | 探究PRRSV感染过程中宿主细胞的免疫应答机制和病毒感染动力学 | PRRSV感染的猪肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-12-06 |
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-Dec, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01144-7
PMID:41203872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌的转录组差异,揭示了与脂肪生成、脂肪酸代谢和氧化磷酸化相关的基因上调 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面解析2型糖尿病冠状动脉微血管疾病的转录组特征,并识别出新的调控基因如Angplt4、Ephx2、Hmgcs2、Acot2、Pdk4和Ech1 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且样本规模有限,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探究2型糖尿病冠状动脉微血管疾病的转录组差异,识别潜在的治疗靶点 | 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和心肌组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2025-12-06 |
Endothelial septin 4 reduction contributes to lipopolysaccharide-induced acute lung injury by disrupting endothelial barrier integrity and promoting infiltration of ISG+ cells
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148790
PMID:41207585
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞特异性SEPT4在脂多糖诱导的急性肺损伤中的作用机制 | 首次揭示了SEPT4在内皮屏障完整性中的关键作用及其缺失如何通过促进ISG+细胞浸润加剧急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限;机制研究尚未完全阐明SEPT4调控细胞骨架的具体分子通路 | 阐明内皮特异性SEPTs在急性肺损伤中的功能和分子机制 | 小鼠肺组织、内皮细胞、成纤维细胞 | 分子病理学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq、条件性基因敲除、组织病理学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、组织切片图像、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了基因敲除小鼠模型和scRNA-seq数据分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-12-06 |
SIRT1 inhibits ferroptosis of granulosa cells in polycystic ovarian syndrome
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148931
PMID:41237881
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析与实验验证,探讨了铁死亡相关基因在PCOS中的作用,并发现SIRT1通过Nrf2去乙酰化抑制颗粒细胞铁死亡 | 首次将SIRT1与PCOS中的铁死亡联系起来,并通过scRNA-seq和分子对接揭示了SIRT1-Nrf2相互作用机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏大规模临床样本验证 | 探究铁死亡在PCOS发病机制中的作用,并寻找潜在治疗靶点 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | scRNA-seq, 分子对接, 免疫共沉淀 | 机器学习 | 基因表达数据 | 基于GEO数据集的PCOS与对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-12-06 |
ATP6V1E1 and NDUFB5 identified as potential biomarkers for Alzheimer's disease through integrative analysis
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148733
PMID:41242442
|
研究论文 | 本研究通过整合分析阿尔茨海默病(AD)患者颞叶和外周血样本的差异表达基因,识别出ATP6V1E1和NDUFB5作为关键基因和潜在的AD风险因素,并验证了其诊断性能及在AD小鼠模型中的表达下调与病理相关性 | 首次通过整合分析识别ATP6V1E1和NDUFB5作为AD的潜在生物标志物,并揭示其在微胶质细胞中的表达与线粒体复合物I和V-ATP酶亚基的系统性下调,提示线粒体和溶酶体系统协同功能障碍在AD发病机制中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的直接验证,且未深入探讨这些基因作为治疗靶点的具体机制 | 识别与氧化磷酸化(OXPHOS)相关的AD生物标志物,以用于早期干预 | 阿尔茨海默病(AD)患者样本(颞叶和外周血)及AD小鼠模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、多变量逻辑回归、LASSO回归 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | AD患者颞叶和外周血样本(具体数量未明确),两个独立队列验证,AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-12-06 |
Eosinophils enhance granuloma-mediated control of persistent Salmonella infection in mice
2025-Dec, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02187-1
PMID:41272146
|
研究论文 | 本文通过小鼠模型揭示了嗜酸性粒细胞在控制鼠伤寒沙门氏菌持续感染中的宿主保护作用 | 首次发现嗜酸性粒细胞通过CCL11依赖性招募和活化,在肉芽肿中调节巨噬细胞极化并限制沙门氏菌的利用 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究嗜酸性粒细胞在沙门氏菌持续感染控制中的作用机制 | 感染鼠伤寒沙门氏菌的小鼠模型,特别是肠系膜淋巴结中的肉芽肿 | 免疫学 | 沙门氏菌感染 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-12-06 |
SUV39H2 is a vulnerability in glioblastoma stem cells enhanced by co-targeting SUV39H1
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2568366
PMID:41047764
|
研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,并评估了同时靶向SUV39H2和SUV39H1对破坏干细胞维持的效果 | 发现SUV39H2是胶质母细胞瘤干细胞的新调控因子,且同时靶向SUV39H2和SUV39H1能更有效地破坏干细胞维持 | NA | 研究SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,并评估同时靶向SUV39H2和SUV39H1的治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, western blot | NA | RNA-seq数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-12-06 |
Human neural stem cell-derived exosomes promote functional recovery in subarachnoid hemorrhage via bdnf/trkb pathway activation and astrocyte modulation
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02155-0
PMID:41327445
|
研究论文 | 本研究探讨了人神经干细胞来源的外泌体通过激活BDNF/TRKB通路和调节星形胶质细胞,在蛛网膜下腔出血模型中促进功能恢复的神经保护作用 | 首次利用单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了hNSC-exo通过BDNF/TRKB信号通路激活和星形胶质细胞调节发挥神经保护作用的分子机制 | 研究基于大鼠模型,临床转化潜力需进一步验证;未详细探讨外泌体的具体成分及其递送效率 | 探究人神经干细胞来源的外泌体在蛛网膜下腔出血中的神经保护潜力及其分子机制 | 大鼠蛛网膜下腔出血模型、人神经干细胞来源的外泌体 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及大鼠模型和体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-12-06 |
Brain-derived neurotrophic factor supports pericyte and vascular homeostasis in the aging brain
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02181-y
PMID:41327464
|
研究论文 | 本研究揭示了脑源性神经营养因子(BDNF)通过激活Akt信号通路调节周细胞PDGFRβ表达,从而维持衰老大脑中周细胞和微血管稳态的机制 | 首次发现并证实了BDNF-TrkB信号通路在衰老大脑周细胞稳态和微血管完整性中的直接调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;对BDNF信号通路下游的具体分子机制探索尚不全面 | 探究BDNF在衰老大脑中维持周细胞和微血管稳态的调控机制 | 不同年龄段的C57BL/6J小鼠、条件性敲除Bdnf基因的C57BL/6小鼠、以及体外培养的周细胞系 | 神经生物学 | 衰老相关脑疾病 | 免疫染色、Western blot、流式细胞术、单细胞测序、转录组分析 | NA | 图像数据、蛋白质印迹数据、流式细胞数据、测序数据 | 使用不同年龄段的小鼠模型及体外培养的周细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-12-06 |
Integration of single-cell and RNA-seq analysis reveals sepsis heterogeneity and prognostic significance of FCGR3A+ Macrophage subtypes
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102352
PMID:41332909
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示了脓毒症免疫微环境异质性,并识别出FCGR3A+巨噬细胞亚型在预后中的关键作用 | 首次通过整合单细胞与批量转录组数据,系统分析了脓毒症的免疫微环境异质性,并发现FCGR3A+巨噬细胞亚型在预后中的核心作用 | 样本量相对有限,且未进行外部验证队列的独立验证 | 分析脓毒症的免疫微环境异质性并开发预后标志物 | 脓毒症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | scVI算法, BayesPrism分析, StepCox + Ridge模型 | RNA测序数据 | 53个单细胞RNA测序样本和479个脓毒症患者的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |