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当前共找到 42548 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-08-18
Binary-SPA: a reference-free method for cell annotation in high-resolution spatial transcriptomics
2026-Aug-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出了一种无需参考数据的空间转录组细胞注释方法Binary-SPA,通过两阶段策略实现高分辨率细胞类型注释。 Binary-SPA无需匹配的单细胞RNA测序参考数据,采用内部参考进行标签转移,提高了注释准确性和覆盖率,并在多种平台和组织类型中表现稳健。 未明确提及,但可能依赖于预定义的标记基因集,对标记基因选择敏感。 开发一种可靠且无需参考数据的空间转录组细胞注释方法,广泛适用于研究和临床样本。 高分辨率空间转录组数据,包括骨髓活检等复杂样本。 计算生物学 NA 空间转录组学 分类器和标签转移方法 空间转录组数据,蛋白表达数据(用于验证) 多种空间平台、组织类型和保存协议的样本,具体数量未说明 NA 空间转录组学 NA 多种空间平台,具体未指定
22 2026-08-18
Ascl1 Represses Müller Glial and Promotes Rod Photoreceptor Fate Through Repressing Notch Signaling in Late Retinal Progenitor Cells
2026-Aug-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨Ascl1转录因子在晚期视网膜祖细胞中抑制Müller胶质细胞和双极细胞命运、促进视杆光感受器命运的作用及其分子机制 首次整合RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq和ChIP-seq分析,揭示Ascl1通过结合并开放基因组区域,抑制Notch信号通路并激活神经发生基因,从而调控视网膜细胞命运决定 摘要未提及研究的局限性 利用晚期视网膜祖细胞作为模型,阐明Ascl1在视网膜发育和Müller胶质细胞重编程中的功能及分子机制 小鼠晚期视网膜祖细胞 分子生物学 视网膜疾病 RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 免疫荧光, 体内电穿孔 NA 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 小鼠视网膜样本(具体数量未提供) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq NA NA
23 2026-08-18
SSR4 Sustains Tertiary Lymphoid Structures by Regulation Quality Control of N-linked Glycosylation During B-cell Differentiation Into Plasmacyte in Colorectal Cancer
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过整合空间转录组和单细胞RNA测序,揭示了SSR4在结直肠癌中通过调节N-连接糖基化的质量控制来维持B细胞分化为浆细胞过程中的三级淋巴结构功能 首次发现SSR4作为TRAP复合体组分在B细胞分化中逐渐上调,并阐明其通过调控BAFFR的N-糖基化影响NF-κB信号通路,从而维持B细胞活化和TLS成熟,且SSR4过表达可增强抗体的ADCC和CDC效应 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类结直肠癌中的临床验证不足 探究结直肠癌中三级淋巴结构内B细胞分化和抗体产生的内在调控机制 结直肠癌组织中的B细胞,特别是三级淋巴结构内的B细胞 单细胞组学 结直肠癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型 小鼠模型(Apc小鼠)、CHO细胞系 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 结直肠癌患者及Apc小鼠模型 10x Genomics 空间转录组学、单细胞RNA测序 10x Visium、10x Chromium 用于空间转录组和单细胞RNA测序的10x平台
24 2026-08-18
SIRT6-Mediated Deacetylation of ATF3 Promotes Silica-Induced Lung Fibrosis by Enhancing its Nuclear Import via Binding to Importin α
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示SIRT6介导的ATF3去乙酰化通过增强其核输入促进矽肺纤维化的机制,并发现伊曲康唑作为潜在治疗药物。 首次阐明SIRT6介导的ATF3去乙酰化通过促进其核输入增强巨噬细胞衰老,并揭示importin α与HSP70竞争性结合ATF3的调控机制,同时发现小分子抑制剂伊曲康唑可靶向ATF3与importin α结合位点减轻肺纤维化。 研究主要基于细胞和小鼠模型,缺乏临床样本验证;且未探讨其他翻译后修饰对ATF3功能的影响。 探讨ATF3介导的巨噬细胞衰老在矽肺纤维化中的作用机制,并寻找潜在治疗靶点。 健康与矽肺小鼠和人类肺组织中的巨噬细胞及成纤维细胞 数字病理学 矽肺 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 健康与矽肺人及小鼠肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'转录组测序(推测,基于单细胞RNA-seq技术)
25 2026-08-18
Mesenchymal Stromal Cell-Mediated Intercellular Communication: Mapping the Interactome for Skeletal Muscle Homeostasis and Regeneration
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过系统级方法构建了骨骼肌中纤维脂肪生成祖细胞(FAPs)的相互作用组图谱,整合单细胞RNA测序数据和计算分析,识别并验证了FAP介导的信号通路,为理解间充质基质细胞在肌肉稳态和再生中的作用提供了数据资源 采用系统级方法整合独特的单细胞RNA测序图谱和先进计算分析,构建了静态和再生骨骼肌中的全面FAP相互作用组,揭示了跨多种骨骼肌细胞类型的新型信号网络,并通过FAP耗竭实验验证了关键通路的生物学相关性 摘要中未提及研究的局限性 构建骨骼肌中FAP介导的细胞间通讯相互作用组,以理解其在肌肉稳态和再生中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 骨骼肌中的间充质基质细胞(即纤维脂肪生成祖细胞,FAPs)及其与其他骨骼肌细胞类型的相互作用 单细胞转录组学、计算生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-08-18
Hyper-activated low-density neutrophil-derived NGAL predicts fatal SFTS: a multi-cohort and single-cell study
2026-Aug, Infection IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过多队列和单细胞分析,评估血清NGAL对发热伴血小板减少综合征患者死亡风险的预测能力,并揭示其细胞来源。 首次在单细胞水平揭示NGAL主要来源于与PBMC共纯化的低密度中性粒细胞,并发现这些细胞在非幸存者中高度富集且表现出过度炎症和干扰素刺激的转录特征。 研究的回顾性设计可能引入选择偏倚,且单细胞数据来自公共数据库,未能完全匹配临床队列。 评估血清NGAL对SFTS患者死亡风险的预测价值,并阐明其细胞来源。 215例SFTS患者(训练队列152例,外部验证队列63例)及公共scRNA-seq数据中的PBMC样本。 数字病理学 发热伴血小板减少综合征 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 临床数据和单细胞转录组数据 215例SFTS患者,其中训练队列152例,外部验证队列63例;另有公共scRNA-seq数据中的PBMC样本。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-08-18
d-serine as a metabolic immune checkpoint in the tumour microenvironment
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型和临床队列,发现d-丝氨酸作为代谢免疫检查点,促进肿瘤免疫逃逸并与免疫治疗耐药相关 首次发现d-丝氨酸在胃肠道癌症中作为免疫抑制代谢物,通过与SPP1相关的巨噬细胞信号和CD8+ T细胞抑制促进肿瘤进展 摘要未提及研究的局限性 确定d-氨基酸(特别是d-丝氨酸)如何塑造肿瘤免疫微环境并影响胃肠道癌症的临床结局 小鼠MC38肿瘤和原位胃癌类器官异种移植模型,以及胃肠道癌症患者(健康对照87例,胃癌患者三组共150例) 免疫学、肿瘤学 胃肠道癌症(胃癌) 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外巨噬细胞-T细胞共培养、微生物组操作 小鼠肿瘤模型、类器官异种移植模型 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、临床样本中d-氨基酸浓度数据 健康对照87例,胃癌患者三组(14例、108例、28例) NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-08-18
Leveraging the genetics of human face shape boosts the discovery of orofacial cleft risk loci
2026-Jul-22, HGG advances
研究论文 本研究利用面部形状的遗传信息,通过条件错误发现率方法增强了非综合征性口面裂风险位点的发现能力,并识别了多个新位点 首次将多效性信息的方法(cFDR-GWAS)应用于面部形状和口面裂的交叉分析,以提高风险位点的发现效率,并成功识别了多个新位点 样本量有限,且主要基于欧洲人群,可能限制结果的可推广性 利用面部形状和口面裂共享的遗传基础,增强口面裂风险位点的发现能力 正常面部形状和口面裂的遗传位点,包括21个显著位点和15个较宽松阈值下的位点 遗传学 口面裂 全基因组关联研究、条件错误发现率方法 统计模型(贝叶斯方法) 基因型数据、基因表达数据、空间转录组数据 面部形状GWAS(n=4,680和n=3,566),非综合征性唇裂伴或不伴腭裂GWAS(n=3,969),独立队列用于复制验证 NA 全基因组关联分析、空间转录组学 NA NA
29 2026-08-18
Human single-cell atlas of proliferative diabetic retinopathy reveals a SOX15-overexpressing stromal population driving retinal fibrosis through the endothelin-1 -EDNRB axis
2026-Jul-22, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建人类增殖性糖尿病视网膜病变的单细胞图谱,揭示SOX15过表达的基质细胞群通过内皮素-1-EDNRB轴驱动视网膜纤维化的新机制 首次构建人类PDR视网膜的单细胞转录组图谱,并发现SOX15-EDN1-EDNRB轴是驱动视网膜纤维化的新机制,为抗纤维化治疗提供新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体内的长期效应和临床转化仍需进一步验证 阐明PDR中视网膜纤维化的关键细胞机制,寻找有效的抗纤维化治疗策略 人类PDR视网膜组织、非糖尿病对照视网膜、小鼠模型及体外培养的成纤维细胞 单细胞转录组学 增殖性糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序、免疫荧光、条件性基因敲除、siRNA敲低、药物拮抗剂 scRNA-seq分析、条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、图像数据 PDR器官捐献者和非糖尿病对照的视网膜组织,具体数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-08-18
Dissecting human organ development using spatial technologies
2026-Jul-08, Developmental cell IF:10.7Q1
综述 综述空间技术如何通过分子谱分析揭示人类器官发育中的基因调控、细胞互作与组织结构,并探讨将空间谱分析与类器官结合的方法及未来方向 系统整合了空间多组学、类器官模型与机器学习,提出通过结合空间分析与可操控类器官系统来推进发育生物学的机制性和预测性研究 人类发育组织获取受限和伦理约束限制了实验验证及机制研究,类器官模型可能不能完全重现体内器官发育的复杂性 总结当前空间技术及其在人类器官发育研究中的应用,并突出类器官集成与未来整合策略以促进机制性和预测性发育生物学 人类胚胎和胎儿器官,以及干细胞衍生的类器官模型 空间转录组学 不适用 空间转录组学、空间表观基因组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间多组学 不适用 空间分子谱数据(转录、表观、蛋白质、代谢) 不适用 不适用 空间转录组学、空间表观基因组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间多组学 不适用 不适用
31 2026-08-18
Pulmonary mRNA-LNP vaccines for rapid and durable protection against bacterial infection
2026-Jul-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文报道了一种肺部mRNA-LNP疫苗,通过快速激活先天免疫和诱导适应性免疫,实现对细菌性肺部感染的快速和持久保护 首次设计了一种可电离脂质用于肺部mRNA-LNP疫苗,实现局部高表达,并通过双相免疫应答(早期抗原非依赖性清除和后期抗原特异性保护)弥合疫苗接种后的免疫空白期 研究仅在雌性小鼠模型中进行,尚未在人类或大型动物中验证,且未探讨长期安全性及对不同菌株的广谱性 开发一种针对肺部细菌感染的mRNA-LNP疫苗,以提供快速和持久的保护,并阐明其免疫机制 雌性小鼠,以及实验室和临床耐药性铜绿假单胞菌菌株 免疫学 肺部细菌感染 单细胞转录组学 NA 转录组数据 小鼠模型(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
32 2026-08-18
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analyses Identify a B Cell- and Plasma Cell-Associated Prognostic Signature and a Candidate Tumor-Suppressive Role for FUT8 in Ovarian Cancer
2026-07-08, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别卵巢癌中B细胞和浆细胞相关的预后特征,并探索FUT8基因的潜在肿瘤抑制作用 首次将单细胞和批量转录组数据整合,构建B细胞和浆细胞相关的预后模型,并揭示FUT8在卵巢癌中的潜在肿瘤抑制功能 需要进一步的实验研究来验证和阐明涉及的精确分子机制 探讨卵巢癌中糖基化相关调节因子在肿瘤微环境中的功能,特别是FUT8在卵巢癌发展中的潜在作用 卵巢癌组织和正常卵巢组织的单细胞转录组数据,以及来自TCGA和GSE63885的批量转录组数据 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR、CCK-8实验、流式细胞术 预后模型 单细胞转录组数据和批量转录组数据 12个卵巢癌和正常卵巢组织样本(GSE184880),TCGA队列和GSE63885队列 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
33 2026-08-18
Multiomics Insights Into the Role of Spondin-1 in the Pathogenesis and Prognosis of Atrial Fibrillation
2026-Jul-07, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 通过整合多组学方法,本研究识别出Spondin-1在心房颤动发病机制和预后中的潜在作用 采用多层遗传筛选结合孟德尔随机化和共定位分析,首次将SPON1确定为AF的候选靶点,并通过单核RNA测序、空间转录组学及实验验证进行深入表征 研究主要基于遗传关联和生物信息学分析,实验验证仅针对成纤维细胞表型,临床关联分析局限于UK Biobank队列,可能受未测量混杂因素影响 利用整合多组学方法识别心房颤动的新型蛋白靶点 心房颤动患者及UK Biobank队列中的个体,包括血浆蛋白水平、心脏磁共振表型和成纤维细胞 多组学、遗传学、转录组学 心房颤动 孟德尔随机化、共定位分析、单核RNA测序、空间转录组学 NA 遗传数据、转录组数据、蛋白组数据、临床表型数据 UK Biobank队列39,372名个体 10x Genomics 单核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 用于单核RNA测序和空间转录组学分析
34 2026-08-18
Inflammatory and Structural Endotypes of Human Atherosclerotic Plaque Revealed by Integrated Transcriptomic Analysis
2026-07-02, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示人类动脉粥样硬化斑块中与不稳定和稳定表型相关的炎症性和结构性内型 首次将批量转录组与单细胞转录组数据整合,将炎症和结构信号映射到特定细胞区室和调控网络,提出动脉粥样硬化斑块的炎症性和结构性内型框架 未明确提及局限性,但研究依赖于公开数据集,可能受样本异质性和批次效应影响 识别与稳定和不稳定动脉粥样硬化斑块表型相关的协调转录程序,并映射到具体细胞类型和调控网络 人类颈动脉斑块和冠状动脉粥样硬化病变 生物信息学、转录组学 动脉粥样硬化 批量RNA测序、单细胞RNA测序 limma、clusterProfiler、Seurat模块评分、decoupleR、DoRothEA 转录组数据(bulk RNA-seq和scRNA-seq) 来自GSE120521的稳定和不稳定人类颈动脉斑块样本,以及来自GSE131778的人类冠状动脉粥样硬化病变样本(具体数量未在摘要中提供) NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-08-18
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-07, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,识别出TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境,并与不良预后及免疫治疗反应相关 首次揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中的关键免疫抑制功能,并通过药理学抑制TREM1增强抗PD-1治疗效果 研究主要基于临床样本和临床前模型,需进一步验证TREM1靶向治疗在临床试验中的安全性和有效性 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群,并评估其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织中的中性粒细胞亚群及临床前模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫荧光染色 NA 图像,基因表达数据 包含肝细胞癌患者队列及临床前模型,具体样本数量未在摘要中提供 10x Genomics, Fluidigm 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 10x Chromium, CyTOF 10x Chromium用于单细胞RNA测序,流体igm CyTOF系统用于质谱流式细胞术分析
36 2026-08-18
IL15-mediated crosstalk between LSECs and CD8⁺ tissue-resident memory T cells drives alcohol-associated hepatitis
2026-Jul-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了酒精相关性肝炎中肝窦内皮细胞与CD8组织驻留记忆T细胞之间的IL15介导的相互作用,促进了T细胞活化及肝损伤 首次发现并验证了肝窦内皮细胞通过IL15信号通路放大AKT途径,促进CD8组织驻留记忆T细胞的持续存在和炎症活性,并提出了靶向IL15-LSEC-AKT轴的治疗策略 主要基于小鼠模型和体外实验,人类数据仅限于公共数据集的再分析和免疫组化验证,样本量有限,可能需要进一步临床试验确认 阐明酒精相关性肝炎中组织驻留记忆T细胞的功能及其与肝窦内皮细胞的相互作用机制 小鼠和人类的肝脏及血液免疫细胞,特别是CD8 T细胞亚群和肝窦内皮细胞 免疫学 酒精相关性肝炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化,体外共培养,流式细胞术 NA 基因表达数据,序列数据,图像数据 小鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
37 2026-08-18
The clinical promise of mass spectrometry-based single-cell proteomics: from bedside to bench
2026 Jul-Aug, Expert review of proteomics IF:3.8Q1
综述 本文综述了基于质谱的单细胞蛋白质组学在临床研究中的应用进展、挑战和前景,评估其从实验室到临床转化的潜力。 强调单细胞蛋白质组学从技术验证阶段向稳健、可重复的临床应用转变,并探讨其在解决临床相关问题和精准医学中的潜力。 单细胞蛋白质组学的细胞通量有限,样本大小确定困难,数据稀疏性高,质量控制和数据集整合面临挑战。 探讨单细胞蛋白质组学在临床样本分析中的应用价值,推动其在转化和精准医学中的发展。 临床相关样本中的单细胞蛋白质组学分析。 蛋白质组学 NA 质谱术 NA 蛋白质组数据 NA NA 质谱技术 NA NA
38 2026-08-18
Inflammaging: Experimental Insights and Translational Advances
2026-Jul, European journal of immunology IF:4.5Q2
综述 本文综述了炎症老化(Inflammaging)的机制基础、最新研究进展及其转化医学应用,涵盖细胞衰老、SASP、线粒体功能障碍等方面,并探讨了临床干预策略。 通过单细胞和空间转录组学揭示炎症老化的组织特异性和情境依赖性模式,并总结了抗衰老药物(senolytics)和衰老调节药物(senomorphics)等新型干预策略的临床前及早期临床试验结果。 炎症老化生物标志物开发不足,长期安全性评估缺乏,以及老龄化人群的异质性仍是挑战。 探讨炎症老化的机制及其作为延长健康寿命和减少慢性病负担的干预靶点的潜力。 衰老相关细胞、组织及炎症信号通路。 机器学习 老年疾病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
39 2026-08-18
EPHX2 Orchestrates Intestinal Epithelial Barrier Repair in Ulcerative Colitis: An Integrated Multi-Omics and Experimental Study
2026-07, Clinical and translational science
研究论文 本研究整合多组学数据与实验验证,发现EPHX2在溃疡性结肠炎中调控肠道上皮屏障修复的关键作用 结合GWAS-eQTL与单细胞转录组数据筛选出UC因果基因EPHX2,并通过结肠炎小鼠和体外炎症模型验证其功能,揭示其在黏膜愈合中的新机制 摘要未提及研究局限性 探究溃疡性结肠炎的遗传决定因素,特别是EPHX2在肠道上皮屏障修复中的作用 溃疡性结肠炎患者及结肠炎小鼠模型的肠道上皮细胞 基因组学 溃疡性结肠炎 GWAS-eQTL分析、单细胞转录组测序、基因集富集分析、功能实验 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、动物模型数据 摘要未提及具体样本量 NA 单细胞转录组测序 NA NA
40 2026-08-18
Hematopoietic mosaic chromosomal alterations are pleiotropic drivers of inflammaging, multimorbidity, and mortality
2026-Jul-01, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究基于英国生物库45万余人的数据,发现造血嵌合染色体改变是独立于CHIP的衰老相关疾病多病共存和死亡风险的驱动因素,并揭示了其在炎症老化中的作用 首次证明mCAs独立于CHIP增加多病共存和死亡风险,并发现mCA-CHIP共现具有协同效应,定义了高风险克隆状态;开发了基于细胞带水平的定位框架,并通过单细胞转录组和小鼠模型验证了MYC和S100A9作为效应基因,将大片段mCAs解析为具体疾病机制 未提及明确的局限性,但可能包括需要进一步验证因果关系和在不同人群中的普适性 探究mCAs是否独立于CHIP影响疾病和死亡风险,并将其大尺度基因组效应解析为可操作的靶点 英国生物库452,594名参与者的血液样本及相关的临床和遗传数据 基因组学 衰老相关疾病 全基因组基因分型、单细胞转录组、小鼠模型 NA 基因分型数据、单细胞转录组数据、表型数据 452,594名英国生物库参与者 NA 单细胞转录组 NA NA
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